真核细胞基因组结构和功能.ppt
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1、关于真核细胞基因组结构与功能第一张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月染色体的结构bb染色体研究的历史背景染色体研究的历史背景bb染色体的化学组成染色体的化学组成bb核小体的结构核小体的结构第二张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月染色体研究的历史背景:染色体研究的历史背景:bb1865年,年,Mendel(奥地利)(奥地利)历时八年,完成历时八年,完成了植株(豌豆)杂交试验,在此基础上总结出了植株(豌豆)杂交试验,在此基础上总结出二个著名遗传学定律:二个著名遗传学定律:分离定律分离定律分离定律分离定律 独立分配定律独立分配定律独立分配定律独立分配定律bb“遗传因子遗传因子”(ge
2、neticfactor)是)是Mendel定定律的基本思路,每一植株的各种相对性状都律的基本思路,每一植株的各种相对性状都来源两个相同的来源两个相同的“遗传因子遗传因子”,它们有显性,它们有显性和隐性之分,和隐性之分,“遗传因子遗传因子”含义是指决定含义是指决定遗传性状的基本遗传单位遗传性状的基本遗传单位第三张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月遗传因子遗传因子第四张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月染色体染色体bb存在于细胞核中,经适当染色后可见由存在于细胞核中,经适当染色后可见由细丝状颗粒物质所组成,一般在细胞分细丝状颗粒物质所组成,一般在细胞分裂时才能看到裂时才能看到bb在
3、不同物种的细胞中,它们的数目不一在不同物种的细胞中,它们的数目不一样,但总是以二条成对的同源样,但总是以二条成对的同源(homologous)染色体的形式存在,且)染色体的形式存在,且数目恒定数目恒定第五张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月细胞周期细胞周期(cellcycle)细细细细 胞胞胞胞 产产产产 生生生生 到到到到 分分分分 裂裂裂裂 成成成成 子子子子 细细细细 胞胞胞胞 之之之之 间间间间 的的的的 过过过过 程程程程 大大肠肠杆杆菌菌约约每每30分分钟钟分分裂裂一一次次,其其中中大大约约29分分钟钟花花在在复复制制DNA果果蝇蝇的的胚胚胎胎细细胞胞周周期期只只有有8分分
4、钟钟大大部部分分成成长长中中的的动动植植物物细细胞胞要要花花10-20个个小小时时才才分分裂裂完完毕毕第六张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月染色体是遗传的物质基础染色体是遗传的物质基础体细胞增殖体细胞增殖有丝分裂(有丝分裂(mitosis)方式)方式染色体对自身复制染色体对自身复制姐妹染色体(姐妹染色体(sisterchromatid)姐妹染色体一分为二进入子细胞姐妹染色体一分为二进入子细胞第七张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月细胞分裂第八张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月染色体是遗传的物质基础染色体是遗传的物质基础生殖细胞增殖生殖细胞增殖减数分裂(减数分裂(me
5、iosis)方式)方式同源染色体分别进入新的子代细胞而产同源染色体分别进入新的子代细胞而产生生殖细胞生生殖细胞配子(精子或卵子),配配子(精子或卵子),配子只含有体细胞一半的染色体数子只含有体细胞一半的染色体数配子结合成合子后又恢复到体细胞的染配子结合成合子后又恢复到体细胞的染色体数,一个来自父本,一个来自母本色体数,一个来自父本,一个来自母本第九张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月减数分裂第十张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月染色体与染色体与“遗传因子遗传因子”极其相似极其相似bb二者均成对存在,且其中的每个成员分别来自二者均成对存在,且其中的每个成员分别来自父、母亲代父、
6、母亲代bb产生配子时,配子只含产生配子时,配子只含“遗传因子遗传因子”(等位(等位基因)中的一个或染色体对中的一条基因)中的一个或染色体对中的一条bb非等位基因及非同源染色体均可自由组合到非等位基因及非同源染色体均可自由组合到配子中配子中bb在上述基础上,在上述基础上,Sutton和和Boveri(1902-1903)提出了)提出了染色体遗传学染色体遗传学认为:染色体是认为:染色体是“遗传因子遗传因子”的携带者的携带者第十一张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月基因连锁和交换规律基因连锁和交换规律bbMorgan:发现了伴性基因,总结出了遗传:发现了伴性基因,总结出了遗传学上著名的基因连
7、锁(学上著名的基因连锁(linkage)和交换)和交换(crossing-over)规律)规律bb通过测定连锁的回交试验,证实了基因在染通过测定连锁的回交试验,证实了基因在染色体上呈线性排列的事实色体上呈线性排列的事实bb产生了遗传学上最早的产生了遗传学上最早的基因定位线性遗传基因定位线性遗传图图第十二张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月Homologouschiasma第十三张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月第十四张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月Conversion and Crossover第十五张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月第十六张,PPT共一
8、百零五页,创作于2022年6月染色体的主要化学成分染色体的主要化学成分bbDNAbb蛋白质蛋白质bbRNAbb生化研究表明:上述三类组成染色体的化学成生化研究表明:上述三类组成染色体的化学成分中,蛋白质含量约为分中,蛋白质含量约为DNA的二倍,根据组的二倍,根据组成蛋白质的氨基酸特点分为组蛋白和非组成蛋白质的氨基酸特点分为组蛋白和非组蛋白两类。蛋白两类。RNA含量很少,还不到含量很少,还不到DNA量量的的10%第十七张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月组蛋白(组蛋白(histoneshistones)染色体中的碱性蛋白质染色体中的碱性蛋白质bb特点:富含二种碱性氨基酸(赖氨酸和特点:富
9、含二种碱性氨基酸(赖氨酸和精氨酸)精氨酸)bb根据这两种氨基酸在蛋白质分子中的相根据这两种氨基酸在蛋白质分子中的相对比例将组蛋白分为五种小类型对比例将组蛋白分为五种小类型第十八张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月五种组蛋白比较五种组蛋白比较第十九张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月组蛋白组蛋白bb组蛋白的等电点(组蛋白的等电点(pI)在)在7.5-10.5之间,所含之间,所含的强极性氨基酸使组蛋白带上大量电荷,的强极性氨基酸使组蛋白带上大量电荷,成为组蛋白与成为组蛋白与DNA结合及蛋白质之间的相互结合及蛋白质之间的相互作用的主要化学力之一作用的主要化学力之一bb根据所含碱性氨基
10、酸的相对比例划分为三种根据所含碱性氨基酸的相对比例划分为三种类型:富精氨酸组蛋白(类型:富精氨酸组蛋白(H3和和H4),稍富),稍富赖氨酸组蛋白(赖氨酸组蛋白(H2A和和H2B)及极富赖氨酸)及极富赖氨酸组蛋白(组蛋白(H1)第二十张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月组蛋白组蛋白bb五种组蛋白的氨基酸全顺序均已确定。五种组蛋白的氨基酸全顺序均已确定。H3和和H4的序列在各种属之间极少有差的序列在各种属之间极少有差异,这种生物进化上的高度保守性预异,这种生物进化上的高度保守性预示着其功能的重要性。其它三种组蛋示着其功能的重要性。其它三种组蛋白在不同种属之间存在着较大的差异白在不同种属之间
11、存在着较大的差异bb组蛋白对染色体中组蛋白对染色体中DNA的包装有十分的包装有十分重要的作用重要的作用第二十一张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月组蛋白组蛋白第二十二张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月非组蛋白非组蛋白(non-histone proteinnon-histone protein,NHPNHP)bb染色体中组蛋白以外的其它蛋白质染色体中组蛋白以外的其它蛋白质bb是一大类种类繁杂的各种蛋白质的总是一大类种类繁杂的各种蛋白质的总称称bb估计总数在估计总数在300-600之间之间bb分子量范围为分子量范围为7-80kDbb等电点为等电点为3.9-9.2第二十三张,PP
12、T共一百零五页,创作于2022年6月非组蛋白功能非组蛋白功能1.参与并调控基因表达参与并调控基因表达 参与基因复制、转录及核酸修饰的酶参与基因复制、转录及核酸修饰的酶参与基因复制、转录及核酸修饰的酶参与基因复制、转录及核酸修饰的酶类(如各种类(如各种类(如各种类(如各种 DNADNA和和和和 RNARNA聚合酶等)聚合酶等)聚合酶等)聚合酶等)就是一类重要的非组蛋白就是一类重要的非组蛋白就是一类重要的非组蛋白就是一类重要的非组蛋白 参与转录调控的蛋白质参与转录调控的蛋白质参与转录调控的蛋白质参与转录调控的蛋白质2.维持染色体的高级结构维持染色体的高级结构 非组蛋白中的核基质蛋白对于维持染非组蛋
13、白中的核基质蛋白对于维持染非组蛋白中的核基质蛋白对于维持染非组蛋白中的核基质蛋白对于维持染色体的高级结构是必不可少的。色体的高级结构是必不可少的。色体的高级结构是必不可少的。色体的高级结构是必不可少的。第二十四张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月染色体的包装染色体的包装第二十五张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月核小体(核小体(nucleosomenucleosome)1974年,年,Kornberg发现核小体发现核小体核小体是所有真核生物染色体的核小体是所有真核生物染色体的基本结构单位基本结构单位第二十六张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月核小体的研究(一)核小体的研
14、究(一)bb电镜观察电镜观察破裂的间期细胞流出的染色质,破裂的间期细胞流出的染色质,可见染色质纤维呈非连续性颗粒状,就可见染色质纤维呈非连续性颗粒状,就像一条细线上串联着许多有一定间隔的像一条细线上串联着许多有一定间隔的小珠状颗粒(核小体)小珠状颗粒(核小体)bb用小球菌用小球菌核酸酶处理核酸酶处理提取的染色质,可得到提取的染色质,可得到单个的核小体颗粒单个的核小体颗粒bb对染色质进行酶解处理,通过对染色质进行酶解处理,通过凝胶电泳鉴凝胶电泳鉴定定,发现:产物是一系列不同长度的,发现:产物是一系列不同长度的DNA片片段,且这些片段之间有一个段,且这些片段之间有一个200bp左右的左右的“阶差阶
15、差”第二十七张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月核小体的研究(二)核小体的研究(二)bb对核小体多聚体的研究,获得的结果是:相邻对核小体多聚体的研究,获得的结果是:相邻多聚体之间的多聚体之间的DNA“阶差阶差”等于核小体单体等于核小体单体中的中的DNA长度(长度(200bp左右),且左右),且多聚体多聚体分子量总是单体分子量的整倍数分子量总是单体分子量的整倍数bb以密度梯度离心法制备核小体单体,对其中以密度梯度离心法制备核小体单体,对其中的蛋白质进行化学分析得知,每一个单体中的蛋白质进行化学分析得知,每一个单体中含有含有H2A、H2B、H3和和H4各二分子(它们构各二分子(它们构成一个
16、八聚体),成一个八聚体),H1一分子一分子第二十八张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月第二十九张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月核小体是染色体的基本结构单位核小体是染色体的基本结构单位1.1.核小体重复单位核小体重复单位所有真核生物中具有普所有真核生物中具有普遍意义的染色体基本结构遍意义的染色体基本结构2.2.不同生物(或同种生物的不同细胞)的核不同生物(或同种生物的不同细胞)的核小体,其小体,其DNA片段长度的有所差别片段长度的有所差别3.3.一种细胞通常有特定的平均值,一般为一种细胞通常有特定的平均值,一般为180-200bp4.4.每一核小体所含的每一核小体所含的DNA
17、与组蛋白的量大与组蛋白的量大致相等致相等第三十张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月核小体结构的研究(一)核小体结构的研究(一)核酸酶酶解实验结果:核酸酶酶解实验结果:核小体由核心颗粒(核小体由核心颗粒(coreparticle)和连接区)和连接区DNA(linkerDNA)二部分组成)二部分组成bb核小体单体被小球菌核酸酶处理后,随着核小体单体被小球菌核酸酶处理后,随着时间延长,其降解产物(时间延长,其降解产物(DNA片段)会逐片段)会逐渐缩短,从渐缩短,从200bp降至降至146bp至此变为很至此变为很难进一步降解的稳定状态难进一步降解的稳定状态第三十一张,PPT共一百零五页,创作于
18、2022年6月核小体结构的研究(二)核小体结构的研究(二)bb对此稳定降解产物进行分析,证明它是由对此稳定降解产物进行分析,证明它是由146bp的的DNA片段和片段和H2A、H2B、H3和和H4各二各二分子组成,这种结构称为核心颗粒(分子组成,这种结构称为核心颗粒(coreparticle)bbH1总是随着核心颗粒的形成而消失,通常总是随着核心颗粒的形成而消失,通常是在是在DNA被降解至被降解至160bp以后,提取物中以后,提取物中H1丢失,提示丢失,提示H1位于位于“裸露裸露”DNA与核心颗粒与核心颗粒的毗邻区的毗邻区第三十二张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月核小体结构的研究(三)
19、核小体结构的研究(三)bb核心颗粒外,核心颗粒外,“裸露裸露”的的DNA长度为长度为60bp左右,称为连接区左右,称为连接区DNA(linkerDNA)bb连接区连接区DNA的长度在不同物种差异较大,其的长度在不同物种差异较大,其范围在范围在10-140bp第三十三张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月核小体结构的研究(四)核小体结构的研究(四)bb生物物理的有关研究说明:生物物理的有关研究说明:DNA盘绕在组盘绕在组蛋白八聚体的周围,呈很有规律的螺旋状蛋白八聚体的周围,呈很有规律的螺旋状bb根据上述结果,我们对核小体的结构可作这根据上述结果,我们对核小体的结构可作这样的描述:样的描述:
20、染色质中的染色质中的染色质中的染色质中的DNADNA双螺旋链,等距离缠绕组蛋白双螺旋链,等距离缠绕组蛋白双螺旋链,等距离缠绕组蛋白双螺旋链,等距离缠绕组蛋白八聚体形成众多核心颗粒,各颗粒之间为带有八聚体形成众多核心颗粒,各颗粒之间为带有八聚体形成众多核心颗粒,各颗粒之间为带有八聚体形成众多核心颗粒,各颗粒之间为带有HH1 1组蛋白的连接区组蛋白的连接区组蛋白的连接区组蛋白的连接区DNADNA。bb组成染色质的重复结构单位就是核小体组成染色质的重复结构单位就是核小体第三十四张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月核小体结构(一)核小体结构(一)1.核心颗粒外观呈椭圆形,轴比为核心颗粒外观呈椭
21、圆形,轴比为0.5,颗粒直径,颗粒直径11nm,高,高5.5nm,绕颗粒的绕颗粒的DNA长度为长度为50nm(146bp),连接区),连接区DNA长度为长度为20nm(约(约60bp)第三十五张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月核小体结构(二)核小体结构(二)2.(H2AH2BH3H4)2构成的致密八构成的致密八聚体位于颗粒中央,外绕聚体位于颗粒中央,外绕1.75圈左走向圈左走向的的DNA链,每圈约链,每圈约85bpDNA,螺旋间,螺旋间距为距为2.8nm,组蛋白主要为,组蛋白主要为-螺旋,处螺旋,处于于DNA双螺旋的大沟中,靠静电引力与双螺旋的大沟中,靠静电引力与DNA保持稳定结合。
22、由于空间构象的关保持稳定结合。由于空间构象的关系,缠绕在蛋白八聚体上的系,缠绕在蛋白八聚体上的DNA链并非链并非所有部分都与组蛋白结合所有部分都与组蛋白结合第三十六张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月核小体结构(三)核小体结构(三)3.相邻核心颗粒由连接区相邻核心颗粒由连接区DNA连接,其连接,其伸展长度约伸展长度约20nm(据认为天然状况下(据认为天然状况下由于核小体是紧挨着的,这一空间距离由于核小体是紧挨着的,这一空间距离可能并不存在)。可能并不存在)。H1组蛋白结合在靠核组蛋白结合在靠核心颗粒的连接区心颗粒的连接区DNA上上第三十七张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月染色
23、体的包装染色体的包装超螺旋结构超螺旋结构bb核小体:染色体核小体:染色体DNA的一级包装的一级包装bb由直径由直径2nm的的DNA双螺旋链绕组蛋白形成直双螺旋链绕组蛋白形成直径径11nm的核小体的核小体“串珠串珠”结构,若以每结构,若以每碱基对沿螺旋中轴上升距离为碱基对沿螺旋中轴上升距离为0.34nm计,计,200bpDNA(一个核小体的(一个核小体的DNA片段)片段)的伸展长度为的伸展长度为68nm,形成核小体后仅为,形成核小体后仅为11nm(核小体直径),其长度压缩了(核小体直径),其长度压缩了6-7倍倍第三十八张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月染色体的包装染色体的包装超螺旋结构
24、超螺旋结构bb螺线管纤维(螺线管纤维(solenoidalfiber):染色体):染色体DNA二级包装二级包装bb由由6个核小体盘绕形成一种中空螺线管,其个核小体盘绕形成一种中空螺线管,其外径为外径为30nm,因此,螺线管的形成使,因此,螺线管的形成使DNA一级包装又压缩小一级包装又压缩小6倍倍bb若以充分伸展的若以充分伸展的DNA双螺旋论,每个螺线双螺旋论,每个螺线管包含了管包含了408nm(668nm)长度的)长度的DNA链,链,而每圈螺线管的长度几乎等于核小体直径,而每圈螺线管的长度几乎等于核小体直径,即即11nm,故染色体的二级包装相当于将,故染色体的二级包装相当于将DNA长度压缩了近
25、长度压缩了近40倍倍第三十九张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月染色体的包装染色体的包装超螺旋结构超螺旋结构bb环状螺线管:染色体环状螺线管:染色体DNA的三级的包的三级的包装装bb电镜显示,由螺线管纤维缠绕在一个电镜显示,由螺线管纤维缠绕在一个由某些非组蛋白构成的中心轴由某些非组蛋白构成的中心轴(centralaxis)骨架上形成的。这显然)骨架上形成的。这显然使螺线管纤维得到了较大程度的压缩使螺线管纤维得到了较大程度的压缩第四十张,PPT共一百零五页,创作于2022年6月染色体的包装染色体的包装超螺旋结构超螺旋结构bb三级包装后,三级包装后,DNA链被压缩的程度仍链被压缩的程度仍远
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