第三章基因工程载体PPT讲稿.ppt
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1、第三章基因工程载体第1页,共129页,编辑于2022年,星期二基因克隆载体基因克隆载体n n要让一个从甲生物细胞内取出来的基因在乙生要让一个从甲生物细胞内取出来的基因在乙生物体内进行表达,首先得将这个基因送到乙生物体内进行表达,首先得将这个基因送到乙生物的细胞内去。能将外源基因送入细胞的工具物的细胞内去。能将外源基因送入细胞的工具就是就是运载体。n n基因克隆载体基因克隆载体(DNA克隆载体克隆载体):通过不同途径:通过不同途径能将承载的外源能将承载的外源DNA片段片段(基因基因)带入受体细胞,带入受体细胞,并在其中得以维持的并在其中得以维持的DNA分子。分子。第2页,共129页,编辑于202
2、2年,星期二载体的功能及特征载体的功能及特征一、发展概况一、发展概况一、发展概况一、发展概况 1.1.第一阶段(第一阶段(第一阶段(第一阶段(19771977年前):年前):年前):年前):天然质粒和重组质粒的利用,如天然质粒和重组质粒的利用,如天然质粒和重组质粒的利用,如天然质粒和重组质粒的利用,如pSC101,pSC101,colE1,pCR,pBR313colE1,pCR,pBR313和和和和pBR322(1977,Bolivaretal)pBR322(1977,Bolivaretal)2.2.第二阶段:第二阶段:第二阶段:第二阶段:增大载体容量(降低载体长度),建立多克隆位点区和增大载
3、体容量(降低载体长度),建立多克隆位点区和增大载体容量(降低载体长度),建立多克隆位点区和增大载体容量(降低载体长度),建立多克隆位点区和新的遗传标记基因。如新的遗传标记基因。如新的遗传标记基因。如新的遗传标记基因。如pUCpUC系列载体。系列载体。系列载体。系列载体。3.3.第三阶段:第三阶段:第三阶段:第三阶段:进一步完善载体功能以满足基因工程克隆中的不同要求,进一步完善载体功能以满足基因工程克隆中的不同要求,进一步完善载体功能以满足基因工程克隆中的不同要求,进一步完善载体功能以满足基因工程克隆中的不同要求,如如如如M13mpM13mp系列载体,含系列载体,含系列载体,含系列载体,含T3T
4、3,T7T7,sp6sp6启动子载体,表达型载体启动子载体,表达型载体启动子载体,表达型载体启动子载体,表达型载体及各种探针型载体。及各种探针型载体。及各种探针型载体。及各种探针型载体。第3页,共129页,编辑于2022年,星期二载体的功能载体的功能n n运送外源基因高效转入受体细胞运送外源基因高效转入受体细胞运送外源基因高效转入受体细胞运送外源基因高效转入受体细胞n n为外源基因提供复制能力或整合能力为外源基因提供复制能力或整合能力n n为外源基因的扩增或表达提供必要的条件为外源基因的扩增或表达提供必要的条件为外源基因的扩增或表达提供必要的条件为外源基因的扩增或表达提供必要的条件第4页,共1
5、29页,编辑于2022年,星期二载体应具备的条件载体应具备的条件n n在克隆载体在克隆载体在克隆载体在克隆载体DNADNA分子合适的位置有一至多个克隆分子合适的位置有一至多个克隆分子合适的位置有一至多个克隆分子合适的位置有一至多个克隆位点,供外源位点,供外源位点,供外源位点,供外源DNADNA片段组入克隆载体片段组入克隆载体片段组入克隆载体片段组入克隆载体DNADNA分子。分子。分子。分子。n n至少有一个复制起点,因而至少可在一种至少有一个复制起点,因而至少可在一种至少有一个复制起点,因而至少可在一种至少有一个复制起点,因而至少可在一种生物体中自主复制。生物体中自主复制。生物体中自主复制。生
6、物体中自主复制。n n至少应有一个遗传标记基因,以指示载体或重至少应有一个遗传标记基因,以指示载体或重至少应有一个遗传标记基因,以指示载体或重至少应有一个遗传标记基因,以指示载体或重组组组组DNADNA分子是否进入宿主细胞。分子是否进入宿主细胞。分子是否进入宿主细胞。分子是否进入宿主细胞。n n克隆载体必须是安全的。克隆载体必须是安全的。克隆载体必须是安全的。克隆载体必须是安全的。第5页,共129页,编辑于2022年,星期二第6页,共129页,编辑于2022年,星期二第一节第一节 质粒克隆载体质粒克隆载体第7页,共129页,编辑于2022年,星期二一、一、质粒的一般生物学特性质粒的一般生物学特
7、性n n发现:细菌,偶见于链霉菌和酵母n n独立于染色体之外进行复制和遗传,又依赖于宿主编码的酶和蛋白质来进行复制和转录。n n比病毒还简单的亚细胞结构,一旦离开寄主细胞则无法繁殖。第8页,共129页,编辑于2022年,星期二一、质粒的一般生物学特性一、质粒的一般生物学特性n n质粒质粒质粒质粒是细菌染色体外能够自主复制的环是细菌染色体外能够自主复制的环是细菌染色体外能够自主复制的环是细菌染色体外能够自主复制的环形双链的形双链的形双链的形双链的DNADNA分子分子分子分子n n在宿主细胞内,质粒一般以超螺旋共价闭合在宿主细胞内,质粒一般以超螺旋共价闭合在宿主细胞内,质粒一般以超螺旋共价闭合在宿
8、主细胞内,质粒一般以超螺旋共价闭合环环环环DNADNA分子(分子(分子(分子(ccc-DNAccc-DNA)的形式存在。)的形式存在。)的形式存在。)的形式存在。n n在体外理化因子作用下,质粒可以成为在体外理化因子作用下,质粒可以成为在体外理化因子作用下,质粒可以成为在体外理化因子作用下,质粒可以成为开环开环开环开环DNADNA分子(分子(分子(分子(oc-DNAoc-DNA)或线形)或线形)或线形)或线形DNADNA分子(分子(分子(分子(l-DNAl-DNA)。)。)。)。n n在变性条件下,质粒可成为单链在变性条件下,质粒可成为单链在变性条件下,质粒可成为单链在变性条件下,质粒可成为单
9、链DNADNA分子分子分子分子(ss-DNAss-DNA)。)。)。)。n n质粒质粒质粒质粒DNADNA分子大小分子大小分子大小分子大小1-100Kb1-100Kb以上以上以上以上。第9页,共129页,编辑于2022年,星期二质粒质粒DNA的复制的复制n n质粒能利用寄主细胞的质粒能利用寄主细胞的质粒能利用寄主细胞的质粒能利用寄主细胞的DNADNADNADNA复制系统进行自主复制复制系统进行自主复制复制系统进行自主复制复制系统进行自主复制n n复制方向性:纯单向性(复制方向性:纯单向性(复制方向性:纯单向性(复制方向性:纯单向性(ColEIColEIColEIColEI);纯双向性();纯双
10、向性();纯双向性();纯双向性(F F F F质粒);既质粒);既质粒);既质粒);既有单向又有双向性(有单向又有双向性(有单向又有双向性(有单向又有双向性(R6KR6KR6KR6K)。)。)。)。n n根据在每个细胞中的分子数(拷贝数)多寡,质粒可分为两大根据在每个细胞中的分子数(拷贝数)多寡,质粒可分为两大根据在每个细胞中的分子数(拷贝数)多寡,质粒可分为两大根据在每个细胞中的分子数(拷贝数)多寡,质粒可分为两大复制类型:复制类型:复制类型:复制类型:严紧型复制控制的质粒严紧型复制控制的质粒严紧型复制控制的质粒严紧型复制控制的质粒11数个数个数个数个 拷贝拷贝拷贝拷贝stringentp
11、lasmidstringentplasmid 松弛型复制控制的质粒松弛型复制控制的质粒松弛型复制控制的质粒松弛型复制控制的质粒1010个个个个 拷贝以上拷贝以上拷贝以上拷贝以上stringentplasmidstringentplasmid第10页,共129页,编辑于2022年,星期二质粒的自主复制性:拷贝数的控制机制质粒的自主复制性:拷贝数的控制机制质粒的自主复制性:拷贝数的控制机制质粒的自主复制性:拷贝数的控制机制 质粒质粒质粒质粒DNADNA复制启动控制复制启动控制复制启动控制复制启动控制n n控制复制引物与模板的结合控制复制引物与模板的结合控制复制引物与模板的结合控制复制引物与模板的结
12、合oriori E.coli E.coli E.coli ColE1ColE1ColE1 plasmidplasmidplasmid复制方向复制方向复制方向复制方向复制方向复制方向roprop(+)RopRopRNA IIRNA IIRNA IIRNA IRNA IRNA I333555555333第11页,共129页,编辑于2022年,星期二质粒的自主复制性:拷贝数的控制机制质粒的自主复制性:拷贝数的控制机制质粒的自主复制性:拷贝数的控制机制质粒的自主复制性:拷贝数的控制机制 质粒质粒质粒质粒DNADNA复制启动控制复制启动控制复制启动控制复制启动控制n n控制复制起始因子与复制起始位点(控
13、制复制起始因子与复制起始位点(控制复制起始因子与复制起始位点(控制复制起始因子与复制起始位点(oriori)的结合)的结合PcoPcoPcop p pcopcopcopP/OrepP/OrepP/Oreprererep p poriorioriCopCopCopRepRepRep第12页,共129页,编辑于2022年,星期二第13页,共129页,编辑于2022年,星期二质粒的不亲和性质粒的不亲和性n n有时也称为不相容性,是指在没有选择压力的情况下,两有时也称为不相容性,是指在没有选择压力的情况下,两种亲缘关系密切的不同质粒,不能够在同一个寄主细胞系种亲缘关系密切的不同质粒,不能够在同一个寄主
14、细胞系中稳定地共存的现象。在细胞的增殖构成中,其中必然有中稳定地共存的现象。在细胞的增殖构成中,其中必然有一种会被逐渐地排斥(稀释)掉。这样的两种质粒称为不一种会被逐渐地排斥(稀释)掉。这样的两种质粒称为不亲和质粒。亲和质粒。n n以大肠杆菌的质粒为例:以大肠杆菌的质粒为例:以大肠杆菌的质粒为例:以大肠杆菌的质粒为例:ColE1ColE1、pMB1pMB1拥有相似的复制子结构,彼此不相容拥有相似的复制子结构,彼此不相容拥有相似的复制子结构,彼此不相容拥有相似的复制子结构,彼此不相容 pSC101pSC101、F F、RP4RP4拥有相似的复制子结构,彼此不相容拥有相似的复制子结构,彼此不相容拥
15、有相似的复制子结构,彼此不相容拥有相似的复制子结构,彼此不相容 p15Ap15A及其衍生质粒拥有相似的复制子结构,彼此不相容及其衍生质粒拥有相似的复制子结构,彼此不相容及其衍生质粒拥有相似的复制子结构,彼此不相容及其衍生质粒拥有相似的复制子结构,彼此不相容第14页,共129页,编辑于2022年,星期二第15页,共129页,编辑于2022年,星期二质粒迁移n n革兰氏阴性菌的质粒可分成两大类:革兰氏阴性菌的质粒可分成两大类:革兰氏阴性菌的质粒可分成两大类:革兰氏阴性菌的质粒可分成两大类:接合型质粒接合型质粒接合型质粒接合型质粒能在天然条件下自发地从一个细胞转移到另一个细胞能在天然条件下自发地从一
16、个细胞转移到另一个细胞能在天然条件下自发地从一个细胞转移到另一个细胞能在天然条件下自发地从一个细胞转移到另一个细胞(接合作用),如(接合作用),如(接合作用),如(接合作用),如F F、ColCol、RR质粒等质粒等质粒等质粒等 非接合型质粒非接合型质粒非接合型质粒非接合型质粒不能在天然条件下独立地发生接合作用如不能在天然条件下独立地发生接合作用如不能在天然条件下独立地发生接合作用如不能在天然条件下独立地发生接合作用如ColCol、RR的其它的其它的其它的其它成员成员成员成员n n值得注意的是,某些非接合型质粒(值得注意的是,某些非接合型质粒(ColE1)在接合型质)在接合型质粒的存在和协助下
17、,也能发生粒的存在和协助下,也能发生DNA转移,这个过程由转移,这个过程由bom 和和和和mob mob 基因决定基因决定基因决定基因决定第16页,共129页,编辑于2022年,星期二携带特殊的遗传标记携带特殊的遗传标记n n野生型的质粒野生型的质粒野生型的质粒野生型的质粒DNADNA上往往携带一个或多个遗传标记基因,上往往携带一个或多个遗传标记基因,上往往携带一个或多个遗传标记基因,上往往携带一个或多个遗传标记基因,这使得寄主生物产生正常生长非必需的附加性状,包括:这使得寄主生物产生正常生长非必需的附加性状,包括:这使得寄主生物产生正常生长非必需的附加性状,包括:这使得寄主生物产生正常生长非
18、必需的附加性状,包括:物质抗性物质抗性物质抗性物质抗性抗生素、重金属离子、毒性阴离子、有机物抗生素、重金属离子、毒性阴离子、有机物抗生素、重金属离子、毒性阴离子、有机物抗生素、重金属离子、毒性阴离子、有机物 物质合成物质合成物质合成物质合成抗生素、细菌毒素、有机碱抗生素、细菌毒素、有机碱抗生素、细菌毒素、有机碱抗生素、细菌毒素、有机碱n n这些标记基因对这些标记基因对DNA重组分子的筛选具有重要意义重组分子的筛选具有重要意义第17页,共129页,编辑于2022年,星期二质粒载体质粒载体第18页,共129页,编辑于2022年,星期二第19页,共129页,编辑于2022年,星期二二、构建质粒克隆载
19、体的基本策略n n1 1、能在转化的受体细胞中进行有效的复制,并有较多的拷、能在转化的受体细胞中进行有效的复制,并有较多的拷贝。贝。n n2 2、含有尽可能多的克隆位点。、含有尽可能多的克隆位点。n n3、含有供选择克隆子的标记基因。n n4 4、构建的质粒克隆载体、构建的质粒克隆载体DNADNA分子尽可能小。分子尽可能小。n n5 5、根据特殊需要,使构建的质粒克隆载体中组装各种、根据特殊需要,使构建的质粒克隆载体中组装各种“元件元件”(小(小DNADNA片断),构建成不同用途的质粒克隆载体。片断),构建成不同用途的质粒克隆载体。第20页,共129页,编辑于2022年,星期二三、质粒克隆载体
20、的构建n n质粒克隆载体的设计和构建过程的原则选择合适的出发质粒(亲本质粒)。正确获得构建质粒克隆载体的元件。组装合适的选择标记基因。选用合适的启动子。在能达到预期目的的前提下,构建质粒克隆载体的构建过程力求简单。第21页,共129页,编辑于2022年,星期二大肠杆菌质粒克隆载体pBR322及其衍生质粒克隆载体的构建n npBR322pBR322的构建是质粒载体构建的的构建是质粒载体构建的一个典范。一个典范。n npBR322pBR322的亲本质粒的亲本质粒 pSF2124pSF2124,含有,含有AmpAmp抗性基因抗性基因 pMB1pMB1,含有松弛型,含有松弛型ColE1ColE1的复制
21、起点的复制起点(oriori)Psc101Psc101,含有,含有TetTet抗性基因抗性基因第22页,共129页,编辑于2022年,星期二大肠杆菌质粒克隆载体pBR322及其衍生质粒克隆载体的构建n n1、在菌体内将R1drd19质粒(沙门氏菌中R1质粒的一种变异体)的易位子Tn3(携带有Amp抗性基因)易位到pMB1质粒上,构成一个较大的质粒pMB3(13.3Kb)。pMB3 AATT黏性末端环化 导入大肠杆菌 pMB8(2.6Kb)EcoRI*第23页,共129页,编辑于2022年,星期二n n2、从质粒pSC101获得四环素抗性基因(Tetr)。n n获得pMB9(5.3Kb)第24页
22、,共129页,编辑于2022年,星期二n n3、向pMB9引入Amp抗性基因。n npSF2124的Tn3体内易位至pMB9获得pBR312(10.2Kb,具有Amp抗性基因和Tet抗性基因)n npBR312 pBR313(8.8Kb,除去 Amp抗性基因中的BamHI位点)EcoRI*第25页,共129页,编辑于2022年,星期二n n4、pBR313pBR322(4.3Kb)pBR320(2.8Kb)pBR318(6.3Kb)去除两个PstIEcoRII片断去掉酶切酶切体外重组第26页,共129页,编辑于2022年,星期二第27页,共129页,编辑于2022年,星期二四、常用质粒载体类型
23、n n1、克隆质粒载体n n2、表达质粒载体n n3、多功能质粒载体n n4、穿梭质粒载体第28页,共129页,编辑于2022年,星期二1、克隆质粒载体n n克隆质粒载体是指专用于基因或DNA片断无性繁殖的质粒载体。pBR322质粒pUC系列的质粒载体第29页,共129页,编辑于2022年,星期二pBR322质粒n n 具有较小的分子量,大小具有较小的分子量,大小4363bp4363bp 可以克隆大到可以克隆大到6Kb6Kb的外源的外源DNADNA片断片断n n具有两种选择标记,即Ampr和Tetr。n n具有多种限制性核酸内切酶的单一酶切位点具有多种限制性核酸内切酶的单一酶切位点 AmpAm
24、p抗性基因内可被抗性基因内可被Pst I,Pvu I,Sac IPst I,Pvu I,Sac I切开,切开,TetTet抗性基因可被抗性基因可被BamH I,BamH I,Hind IIIHind III切开,通过插入失活筛选重组子。切开,通过插入失活筛选重组子。n n在宿主细胞内具有较高的拷贝数。一般一个细胞内可达到一般一个细胞内可达到1515个,而在蛋白质合成抑制剂存在条件下,个,而在蛋白质合成抑制剂存在条件下,可达到可达到1000-30001000-3000拷贝,如氯霉素。拷贝,如氯霉素。第30页,共129页,编辑于2022年,星期二CAP protein binding site-5
25、91-554(compl.strand);mRNA(LacZ)starts at nt position 507(compl.strand);lac repressor binding site-507-487(compl.strand).第31页,共129页,编辑于2022年,星期二pBR322插入失活效应第32页,共129页,编辑于2022年,星期二筛筛选选重重组组子子的的示示意意图图第33页,共129页,编辑于2022年,星期二 BamHI片段片段(Tcr)pBR322PstI(Apr)片段片段 重组分子重组分子I 重组分子重组分子(Aps Tcr)(Apr Tcs)PstI片段片段 外
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