发育生物学教案.pdf
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1、教学日志教学日志章节名称授课时间绪 论学时数教学进度学生考勤应到:实到:请假:旷课:课程类型理论课讨论课习题课实验课 上机课技能课其他教学方法多媒体授课1.了解发育生物学的研究对象、任务及其与其他学科的关系目的要求2.掌握动物发育的主要特征和基本规律3.掌握发育生物学模式生物的种类及其特点4.了解发育生物学的发展简史和发育生物学研究技术重点难点思考题作业教学后记重点:动物发育的主要特征和基本规律、发育生物学模式生物难点:动物发育的主要特征和基本规律作业批改及实验记录说明:说明:1 1、每次授课前后,任课教师应及时填写。、每次授课前后,任课教师应及时填写。2 2、授课时间:指授课日期和节次;教学
2、进度:指是否符合教学进度简表、授课时间:指授课日期和节次;教学进度:指是否符合教学进度简表绪绪 论论第一节第一节发育生物学的研究对象、任务及其与其他学科的关系发育生物学的研究对象、任务及其与其他学科的关系一、发育生物学是一门研究生物体从精子和卵子发生、受精、发育、生长到衰老、死亡规律的科学。二、发育生物学主要研究生物个体发育(多细胞生物题从生殖细胞的发生、受精、胚胎发育、生长、衰老和死亡)和生物系统发生中生命发展的机制。三、发育生物学的主要任务是研究生物体发育遗传程序及其调控机制。四、发展基础:胚胎学、遗传学、细胞生物学第二节第二节动物发育的主要特征和基本规律动物发育的主要特征和基本规律一、多
3、细胞有机体的发育有两个主要的功能1.产生细胞的多样性并使各种细胞在本世代有机体中有严格的时间和空间的次序性,保证世代的交替和生命的连续2.通过繁殖产生新一代的个体,使世代延续二、动物发生过程三、动物发育的主要特征和基本规律第三节第三节发育生物学的发展简史发育生物学的发展简史一、后成论和先成论二、细胞理论对胚胎发育和遗传概念的影响三、发育的嵌合型和调整型四、诱导的发现五、遗传学、分子生物学与发育生物学的结合第四节第四节发育生物学模式生物发育生物学模式生物一、脊椎动物模式生物:非洲爪蟾、斑马鱼、鸡、小鼠二、无脊椎动物模式生物:果蝇、线虫三、发育生物学模式植物:拟南芥第五节第五节发育生物学研究技术发
4、育生物学研究技术一、常用发育生物学研究技术(一)显微镜技术(二)组织切片技术(三)分子生物学技术(四)原位杂交技术(五)显微注射(六)报道基因技术(七)细胞标记技术二、发育遗传学技术(一)正向遗传学技术1.大规模诱变筛选技术2.插入诱变筛选3.突变基因的克隆(二)反向遗传学技术1.基因敲除技术2.条件基因敲除技术3.RNA 干扰技术4.吗啉代寡聚核苷酸5.显性抑制6.转基因技术7.基因捕获8.果蝇中的克隆化分析教学日志教学日志章节名称授课时间第一章 细胞命运的决定学时数教学进度学生考勤应到:实到:请假:旷课:课程类型理论课讨论课习题课实验课 上机课技能课其他教学方法多媒体授课目的要求重点难点思
5、考题作业教学后记1.掌握细胞形态发生决定子、定型、分化的概念2.了解胚胎细胞相互作用的概念重点:细胞形态发生决定子、细胞定型、细胞分化难点:胚胎细胞相互作用作业批改及实验记录说明:说明:1 1、每次授课前后,任课教师应及时填写。、每次授课前后,任课教师应及时填写。2 2、授课时间:指授课日期和节次;教学进度:指是否符合教学进度简表、授课时间:指授课日期和节次;教学进度:指是否符合教学进度简表第一章第一章细胞命运的决定细胞命运的决定第一节第一节细胞命运通过形态发生决定子自主特化细胞命运通过形态发生决定子自主特化一、细胞定型和细胞分化1.细胞分化:从单个全能的受精卵产生各种类型的细胞的发育过程。2
6、.细胞定型:细胞在分化之前,将发生一些隐避的变化,使细胞朝特定的方向发展。细胞定型分为特化特化和决定决定两个时相。特化的细胞或组织的发育命运是可逆的可逆的,而决定的细胞或组织的发育命运是不可逆的不可逆的。胚胎细胞定型主要有两种方式:胞质隔离和胚胎诱导。3.自主特化和有条件特化(渐进特化、依赖型特化)。4.胚胎发育主要有两种方式:自主型发育(镶嵌型发育)和调整型发育。海鞘、环节动物、软体动物和线虫等属于典型的镶嵌型发育,而海胆、两栖纲、鱼类等属于典型的调整型发育。二、形态发生决定子形态发生决定子也称为成形素或胞质决定子,广泛存在于各种动物的卵子细胞质中。三、胞质定域胞质定域:形态发生决定子在卵细
7、胞质中呈一定形式分布,受精时发生运动,被分隔到一定区域,并在卵裂时分配到特定的裂球中,决定裂球的发育命运。又称为胞质隔离、胞质区域化、胞质重排。(一)、海鞘1.肌质和肌细胞的特化2.内胚层、表皮和前后轴的决定(二)、软体动物(三)、线虫1.生殖细胞的特化生殖质:胞质中所含的能决定生殖细胞形成的物质。2.咽部原始细胞命运的决定(四)、昆虫1.极质和生殖细胞的特化2.果蝇晚期发育中细胞不对称分裂四、形态发生决定子的性质(一)、海鞘形态发生决定子海鞘胚胎中可能含有两类形态发生决定子:一类是可以激活某些基因转录的物质,另一类可能是RNA。(二)、果蝇极质:果蝇卵子极粒主要有蛋白质和 RNA 组成。第二
8、节第二节细胞命运通过相互作用渐进特化细胞命运通过相互作用渐进特化一、种质学说二、Wilhelm Roux:镶嵌型发育1.镶嵌型发育:Roux 认为,蛙胚是由能自我分化的各部分组织在一起形成的镶嵌体,每一部分的发育命运是不能改变的,因为每一个细胞接受一组特定的核决定子,并依据所接受的核决定子分化成相应的组织。2.Hans Driesch:调整型发育3.Sven Horstadius 双梯度模型:在海胆胚胎发育中存在两个彼此相对的梯度:植物极化梯度和动物极化梯度。植物极化梯度在植物级活性最大,动物级化梯度在动物级活性最大。海胆胚胎的正常发育依赖于动物极化梯度和植物极化梯度两者之间的平衡,而不依赖于
9、它们的绝对强度大小。两个梯度之间的不同组合建立起各种中间状态。只要两个梯度强度是平衡的,胚胎就能正常发育。三、两栖类发育调控(一)、胚胎细胞的渐进决定(二)、初级胚胎诱导1.诱导:胚胎一个区域对另一个区域发生影响,并使后者沿着一条新途径分化的作用。2.初级胚胎诱导:动物胚胎发育过程中存在许多诱导作用,其中脊索中胚层诱导外胚层分化成神经组织,这一关键的胚胎诱导作用称为初级胚胎诱导。教学日志教学日志章节名称授课时间第二章细胞分化的分子机制-转录和转录前的调控学时数教学进度学生考勤应到:实到:请假:旷课:课程类型理论课讨论课习题课实验课 上机课技能课其他教学方法多媒体授课1.掌握基因组相同的概念、基
10、因差异表达的机理目的要求2.掌握染色质结构对基因活性的调控机理3.掌握基因表达的时间和空间特异性、发育中基因转录水平的调节机制。重点:1.基因组相同的概念、基因差异表达的机理重点难点2.染色质结构对基因活性的调控机理3.基因表达的时间和空间特异性、发育中基因转录水平的调节机制难点:基因表达的时间和空间特异性、发育中基因转录水平的调节机制思考题作业教学后记作业批改及实验记录说明:说明:1 1、每次授课前后,任课教师应及时填写。、每次授课前后,任课教师应及时填写。2 2、授课时间:指授课日期和节次;教学进度:指是否符合教学进度简表、授课时间:指授课日期和节次;教学进度:指是否符合教学进度简表第二章
11、第二章细胞分化的分子机制细胞分化的分子机制-转录和转录前的调控转录和转录前的调控1.在多细胞生物体内,每一个细胞有一定的性状,即细胞特定基因型在一定条件下的表现,也称为细胞表型。2.根据细胞表型可将细胞分为 3 类:全能细胞、多潜能细胞、分化细胞。3.细胞分化是基因差异性表达的结果,差异性基因表达产生的原因主要来自两个方面:一是细胞内环境的差异影响核基因的表达;二是细胞外环境的影响。4.基因差异表达的调控机制主要是在以下几个水平完成:一是差异基因转录;二是核 RNA 的选择性加工;三是mRNA 的选择性翻译;四是差别蛋白质加工。第一节第一节基因组相同和基因差异表达基因组相同和基因差异表达一、有
12、机体不同组织细胞基因组相同的证据1.遗传学证据2.胚胎学证据3.分子生物学证据二、核潜能的限定1.在发育中核潜能被限定2.细胞核具有潜在全能性的研究三、基因组相同的例外 基因组的改变1.染色质消减:马蛔虫、瘿蝇2.基因重排:B 淋巴细胞发育过程中免疫球蛋白轻链基因重排3.基因扩增:非洲爪蟾卵母细胞核糖体 RNA 的基因扩增第二节第二节染色体水平基因活性的调控染色体水平基因活性的调控一、染色质染色质根据在细胞分裂间期折叠压缩的状况分为异染色质和常染色质。1.X 染色体失活2.水蜡虫的染色体失活二、选择性基因转录的染色质变化1.染色体疏松区2.灯刷染色体第三节第三节转录水平的调控转录水平的调控一、
13、基因表达的时间和空间特异性1.基因表达的时间特异性是指有些特异性基因,只有在发育的某一个特定时期或某些时期才具有活性,而在其他时期则是无功能的基因。2.基因表达的空间特异性主要指基因表达的组织细胞特异性。二、发育中基因转录水平的调节和变化(一)、卵清蛋白基因的转(二)、珠蛋白基因的转录(三)、转录调控蛋白对 5S 核糖体 RNA 基因表达的转录1.中心启动子元件2.TF a 的转录调节(四)、转录调控的“开关基因”三、差异基因转录的调控机制(一)、外显子和内显子(二)、启动子和增强子1.启动子的结构和功能2.与启动子结合的反式作用因子3.增强子的结构和功能(三)、转录因子转录因子是基因调控的反
14、式作用因子,是能与启动子和增加子结合的蛋白质。转录因子既含有特异性 DNA 结合域,又含有能与启动子或增强子结合并刺激基因转录的结构域,可分为通用转录因子和特殊转录因子。1.同源异型框蛋白2.POU 蛋白(四)、激素应答成分(五)、免疫球蛋白轻链基因的转录调控1.免疫球蛋白基因2.抗体轻链基因的产生3.抗体重链基因的产生4.免疫球蛋白基因的顺式调节5.免疫球蛋白基因表达的反式调节(六)、转录因子活性的调节1.转录调节:如果转录因子是调节特定基因表达的蛋白质,这些转录因子可以通过其他转录因子调节蛋白质的合成。2.蛋白质的修饰和 RNA 剪接教学日志教学日志章节名称授课时间第三章细胞分化的分子机制
15、-转录后的调控学时数教学进度学生考勤应到:实到:请假:旷课:课程类型理论课讨论课习题课实验课 上机课技能课其他教学方法多媒体授课1.掌握 RNA 加工对基因转录的调控作用目的要求2.理解翻译和翻译后水平的基因表达调控机制重点难点思考题作业教学后记重点:RNA 加工对基因转录的调控作用难点:翻译和翻译后水平的基因表达调控机制作业批改及实验记录说明:说明:1 1、每次授课前后,任课教师应及时填写。、每次授课前后,任课教师应及时填写。2 2、授课时间:指授课日期和节次;教学进度:指是否符合教学进度简表、授课时间:指授课日期和节次;教学进度:指是否符合教学进度简表第三章第三章细胞分化的分子机制细胞分化
16、的分子机制-转录后的调控转录后的调控第一节第一节RNARNA 加工水平的调控加工水平的调控一、mRNA 前体与 mRNA1.异质性核 RNA2.细胞核 RNA 和 mRNA 的复杂性3.前体 RNA 的加工对早期发育的调控4.细胞核中未加工 mRNA 前体存在的证据二、RNA 加工水平的调控(一)、淋巴细胞的差别 RNA 加工使同一基因合成不同的蛋白质(二)、相同基因在不同发育时期或不同组织细胞中合成不同的蛋白质(三)、选择性 RNA 加工与性别决定(四)、RNA3末端的决定1.顺式作用元件2.反式作用元件(五)、mRNA 向核外的运输第二节第二节翻译和翻译后的调控翻译和翻译后的调控一、翻译水
17、平的调控(一)、翻译过程(二)、mRNA 寿命的不同对蛋白质合成的调控不同基因的mRNA的半衰期不同,主要受其3UTR控制。短寿命mRNA的3UTR通常含有一个或多个 AU 富集区,其作用是促进 Poly(A)降解。(三)、激素对特定 mRNA 稳定性的影响二、早期发育中母体效应因子的影响(一)、早期发育母体效应因子调控的证据1.蜗牛的卵裂方向由母体效应因子决定2.海胆杂交后代的初级中胚层细胞平均数由母体效应因子决定3.去核实验(二)、贮藏性 mRNA 的发现:Brachet 等(1963)和 Denny、Tyfer(1964)最早发现卵母细胞通过贮藏性 mRNA 调控早期发育,但只能发育到囊
18、胚期。(三)、卵母细胞贮藏性 mRNA 性质和位置1.卵母细胞贮藏性 mRNA 的种类2.贮藏性 mRNA 的定位三、翻译和翻译后的调控的机制(一)、卵母细胞翻译调控的假说1.掩蔽母源性 mRNA 假说2.poly(A)“尾巴”假说或多聚腺苷酸化假说(二)、关于早期发育的几点启示(三)、胚胎基因组的激活(四)、血红蛋白翻译水平的控制(五)、翻译水平控制的广泛性(六)、RNA 编辑(七)、翻译后的调控教学日志教学日志章节名称授课时间第四章发育中的信号传导学时数教学进度学生考勤应到:实到:请假:旷课:课程类型理论课讨论课习题课实验课 上机课技能课其他教学方法多媒体授课1.掌握参与早期胚胎发育的信号
19、途径种类目的要求重点难点思考题作业教学后记2.了解各种信号途径调节过程重点:参与早期胚胎发育的信号调节途径难点:参与早期胚胎发育的信号调节过程作业批改及实验记录说明:说明:1 1、每次授课前后,任课教师应及时填写。、每次授课前后,任课教师应及时填写。2 2、授课时间:指授课日期和节次;教学进度:指是否符合教学进度简表、授课时间:指授课日期和节次;教学进度:指是否符合教学进度简表第四章第四章发育中的信号传导发育中的信号传导1.细胞通讯在胚胎发育中起着关键作用。2.信号传导是细胞通讯的主要形式,即由信号细胞产生信号分子,诱导靶细胞发生某种反应。3.靶细胞通常通过特异性受体识别细胞外信号分子,并把细
20、胞外信号转变为细胞内信号,引起细胞发生反应,这一过程称为信号传导。第一节第一节参与早期胚胎发育的信号调节途径参与早期胚胎发育的信号调节途径一、TGF 信号途径1.TGF即转化生长因子,是一类分泌性的信号分子。2.TGF超家族因子包括 30 多个成员,可分为 TGF、BMP、Activin 等亚类。3.TGF家族因子在早期发育中起关键作用,如TGF1,2,3,5 参与了细胞外基质形成和细胞分裂的调节;BMP 因子在脊椎动物及果蝇的胚胎背-腹轴式形成过程中具有重要作用;Nodal(属于 BMP 因子亚类)在脊椎动物胚胎中胚层的图式形成及左-右轴的建立过程中起着关键作用。二、Wnt 信号途径1.Wn
21、t基因家族编码一类分泌性的信号因子,在早期胚胎发育中具有重要功能,根据其活性的差异,可将 Wnt 蛋白分为两大类:Wnt-1/wg 类和 Wnt-5a 类。2.Wnt-1/wg 类基因在爪蟾胚胎中异位表达时可以诱导次级体轴的形成并能够转化 C57MG 乳腺上皮细胞。3.Wnt-5a 类成员不具有次级体轴诱导的能力,但可以降低细胞的黏着性,改变细胞的运动状态。三、Hedgehog 信号途径1.Hedgehog(Hh)家族蛋白是一类分泌性的信号分子,在动物发育过程中具有重要作用。2.果蝇的 Hedgehog 信号途径在体节形成中起着重要作用。3.脊椎动物的 Sonic Hedgehog(Shh)参
22、与了神经系统的背-腹轴图式形成及肢的发育,Indian Hedgehog(Ihh)参与了骨骼的发育。四、Notch 信号途径1.Notch 信号途径在神经细胞分化、脊椎动物体节的发育等过程中具有重要作用。2.Notch 信号只能作用于相邻细胞之间。3.Notch 信号的传递是通过膜内蛋白水解机制进行的。4.从 Notch 受体的合成、加工到最后的信号传递先后经历了 3 次蛋白水解。五、酪氨酸激酶受体途径1.大多数生长因子的细胞表面受体属于酪氨酸激酶受体(RTK)家族,包括表皮生长因子(EGF)、成纤维细胞生长因子(FGF)、神经细胞生长因子(NGF)、血小板源生长因子(PDGF)、血管内皮细胞
23、生长因子(VEGF)、胰岛素、胰岛素样生长因子(IGF)、Ephrin 等。2.RTK属于单跨膜蛋白,其共同特征是细胞内部部分带有酪氨酸激酶结构域,具有酪氨酸激酶活性。不同生长因子受体在结构上也有所差异。3.RTK主要激活 MAPK(丝裂原激活的蛋白激酶)信号传递途径。六、JAK-STAT信号途径JAK-STAT信号途径在血细胞及骨骼的生长与分化等过程中具有重要作用。七、视黄酸途径1.视黄酸又称维甲酸或维生素 A 酸,是维生素 A 的衍生物,是一类小分子脂溶性信号分子,可以自由通过细胞膜和核膜。视黄酸受体主要存在于细胞核中,可以分为两大类,即视黄酸受体(RAR)和视黄素 X 受体(RXR)。2
24、.视黄酸在脊椎动物神经系统前-后轴的图式形成及肢的再生过程具有重要作用。第二节第二节信号活性的调控与相互关联信号活性的调控与相互关联一、信号活性的调控1.对配体活性的调节2.对受体活性的调节3.对信号途径中转录效应因子活性的调节4.信号活性的负反馈调节二、信号途径的关联与整合1.不同信号传递途径的相互关联2.信号途径特异性的调控1)只有当信号途径转录效应因子与组织特异性转录因子同时结合到靶基因的增强子元件时,其靶基因的转录才会被激活。2)组织特异性转录因子决定靶基因表达的组织特异性,而当信号途径的活性决定靶基因表达的区域特异性,这些组织特异性转录因子被称为主控基因或选择基因。3.不同信号途径在
25、靶基因增强子水平的整合三、形态发生原1.形态发生梯度模型:某些因子沿体轴的分布呈现一个浓度梯度,这些因子在每一局部的水平决定着这一个区域的命运或反应。2.形态发生原:由于这一过程的最终结果往往是由局部细胞形成某种形态结构,具有这种性质的因子称为形态发生原。3.在多细胞体系中,这种浓度梯度的形成可能有几种方式:一是通过扩散作用;二是通过信号因子抑制因子的区域性表达,差异性的抑制相应因子的信号活性,从而使得该信号因子的有效活性形成一个梯度;三是通过 mRNA 降解作用。教学日志教学日志章节名称授课时间第五章 受精的机制学时数教学进度学生考勤应到:实到:请假:旷课:课程类型理论课讨论课习题课实验课
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- 发育 生物学 教案
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