(22.2)--冠状病毒--微课--WSW—V2.pdf

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1、Medical Microbiology 冠状病毒（Coronavirus,CoV)教学大纲 掌握内容掌握内容 冠状病毒生物学性状 SARS-CoV-2(2019-nCoV)、SARS-CoV致病性及防治原则 了解内容了解内容 冠状病毒的流行情况 冠状病毒科冠状病毒属 Coronavirinae（亚科）Torovirinae Genera:six Alphacoronavirus 229E，NL63 Betacoronavirus OC43,HKU1,SARS-CoV,MERS-CoV,SARS-CoV-2 Gammacoronavirus Deltacoronavirus Bafinivir

2、us Torovirus Pathogen Disease SARS-CoV-2,2019-nCoV COVID-19 Severe Acute Respiratory Syndrome CoV SARS Middle East Respiratory Syndrome CoV MERS 形态 球形，120160nm 图1.冠状病毒病毒形态与结构 生物学性状 结构 核衣壳 包膜 刺突 基质蛋白 M 核酸：线性+ssRNA；2732kb，有帽有polyA尾 核蛋白（N）：磷酸化蛋白 S 糖蛋白 Pol-S-E-M-N-3 冠状病毒的基因分类特点 SARS-CoV-2 RBD与受体ACE2结合 A

3、CE2不肠道内一个氨基酸转运蛋白B0AT1结合形成优质稳定复合物，ACE2以二聚体形式存在，有开放和关闭两种构像变化，两种形式均含有不冠状病毒结合的界面。The ACE2-bound and ACE2-free SARS-CoV spikes Song W,et al.2018,Plos Pathogen Pre-to post-fusion transition of the S glycoprotein of SARS-CoV 病毒复制周期 受体（receptor）ACE2：SRAS-CoV；SARS-CoV-2 CD26：MERS-CoV 体外分离培养 SARS-CoV-2感染96个小时

4、左右即可在人呼吸道上皮细胞内发现 在Vero E6和Huh7细胞系中分离培养需约6天 抵抗力 病毒对紫外线和热敏感 56 30分钟、乙醚、75乙醇、含氯消毒剂、过氧乙酸和氯仿等脂溶剂均可有效灭活病毒 氯己定丌能有效灭活病毒 生物学性状 中华人民共和国传染病防治法乙类传染病，按甲类管理 传染源 感染者包括患者和无症状感染者 传播途径 呼吸道飞沫、接触、气溶胶、消化道？易感人群 所有人群普遍易感 感染特征 高感染性、家族聚集、医院感染 SARS-CoV-2 流行病学特点 2019-nCoV 早期传播的动态分析 Li Qun et al,2020,NEJM Globally 77 794 confi

5、rmed China 76 392 confirmed 2348 deaths Outside of China 1402 confirmed 28 countries 11 deaths To 2020-02-22 https:/www.who.int/docs/default-source/coronaviruse COVID-19 流行病学 SARS 流行病学 2002-2003，8098人感染，774人死亡，病死率为9.6%左右，26国家 https:/www.who.int/csr/resources/publications/WHO_CDS_CSR_ARO_2004_1.pdf M

6、ERS 流行病学 2012年9月至2020年1月末，2519人倍感染，866人死亡，死亡率34.3%，27个国家。其中包括沙特阿拉伯的2121感染者、788死亡病例。https:/www.who.int/emergencies/mers-cov/en/宿主 SARS-CoV-2 蝙蝠？穿山甲？蛇？SARS-CoV 蝙蝠？果子狸？MERS-CoV 蝙蝠？骆驼 致病性 储存宿主 中间宿主 SARS-CoV-2 致病性 普通冠状病毒：1530%普通感冒 SARS-CoV-2 SARS-CoV MERS-CoV 发热38、干咳、肺炎、偶有肠道症状（10-20%）死亡多由于细胞因子风暴所致呼吸窘迫综合征

7、、呼吸衰竭 及多器官衰竭 COVID-2019 临床特点 潜伏期1-14天，多为3-7天，偶见潜伏期超过14天的 以发热、乏力、干咳为主要表现；少数病例伴有鼻塞、流涕、咽痛和腹泻等症状；偶见无症状感染者 多以发热起病，中低热者比例较高；持续高热者病情重 部分重症患者病程中可为中低热，甚至无明显发热 COVID-2019 临床特点 重症患者 多在一周后（极期多在9-12天）出现呼吸困难和/或低氧血症 可能快速进展为急性呼吸窘迫综合征、脓毒症休克、难以纠正的代谢性酸中毒和出凝血功能障碍 轻型患者 仅表现为低热、轻微乏力等，无肺炎表现，多数患者预后良好，少数患者病情危重 老年人和有慢性基础疾病者预后

8、较差 儿童病例症状相对较轻 发病一周内密切观察病情，尽早发现重症病例 COVID-2019 临床特点 各年龄组确证病例重症、危重症比例 来自首都医科大学 李兴旺教授 COVID-2019 肺部影像学 早期呈现多发小斑片影及间质改变，以肺外带明显。进而发展为双肺多发磨玻璃影、浸润影，严重者可出现肺实变，胸腔积液少见 Chen N.et al,2020,Lancet;Wang D,et al,2020 JAMA SARS-CoV-2 实验室检查 发病早期外周血白细胞总数正常或减低，淋巴细胞计数减少 部分患者可出现肝酶、乳酸脱氢酶（LDH）、肌酶和肌红蛋白增高（多为一过性）；部分危重者可见肌钙蛋白增

9、高 多数患者C反应蛋白（CRP）和血沉升高，降钙素原正常 严重者 D-二聚体升高、外周血淋巴细胞进行性减少 SARS-CoV-2 微生物学诊断 RT-qPCR 检测出SARS-CoV-2 核酸 标本 在鼻咽拭子、痰、下呼吸道分泌物、血液、粪便等 痰阳性率高于咽拭子 确诊病例 呼吸道标本或血液标本实时荧光RT-PCR检测新型冠状病毒核酸阳性 呼吸道标本或血液标本病毒基因测序，不已知的新型冠状病毒高度同源 SARS-CoV-2 微生物学诊断 实时荧光RT-PCR方法，新型冠状病毒核酸检测引物和探针序列 靶基因 引物 序列 ORF1ab F CCCTGTGGGTTTTACACTTAA R ACGAT

10、TGTGCATCAGCTGA 荧光探针（P）5-FAM-CCGTCTGCGGTATGTGGAAAGGTTATGG-BHQ1-3 核壳蛋白 N F GGGGAACTTCTCCTGCTAGAAT R CAGACATTTTGCTCTCAAGCTG 荧光探针（P）5-FAM-TTGCTGCTGCTTGACAGATT-TAMRA-3 结果判断 阴性：无Ct值或Ct为40；阳性：Ct值37，可报告为阳性；可疑：Ct值在37-40之间，建议重复实验，若重做结果Ct值40，扩增曲线有明显起峰，该样本判断为阳性，否则为阴性 http:/ 中国疾控中心病毒病研究所 SARS-CoV-2 微生物学诊断 https:

11、/www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/uscdcrt-pcr-panel-primer-probes.pdf?sfvrsn=fa29cb4b_2 USCDC 20200128 预 防 疫苗正在研制中 灭活病毒疫苗？减毒活疫苗：鼻腔喷雾？病毒亚单位疫苗：S 蛋白？doi.org/10.1172/jci.insight.123158 研究显示SARS-CoV全长S蛋白 免疫动物后再攻毒，会出现严重 肺部炎症反应 SARS-CoV-2?治 疗 治疗药物 核苷类似物：利巴韦林；瑞德西韦（RdRp）?蛋白酶抑制剂：柯立芝（洛匹那韦+利托那韦复方）；达

12、芦那韦？融合抑制剂：阿比朵尔 干扰素 抗炎用药：氯喹、磷酸氯喹 抑制细胞因子风暴：IL6R抗体-托珠单抗?中药汤剂？对症治疗，防止细菌性并发症（吸氧、呼吸机、ECMO）SARS CoV 的起源：哪种动物?致病机制:毒力?机体免疫力？抗病毒治疗：对症治疗 预防和是否会再来？2003 SRAS留给我们的问题 SARS-CoV-2 COVID-19 思考与反思 找出病原体，一个月内 找出中间宿主？控制疫情：传染源检测及隔离、切断传播途径、保护易感人群 感染者的治疗：对症治疗、新药筛选及应用 预防性疫苗？课埻小结 掌握内容 冠状病毒生物学性状 2019-nCoV、SARS-CoV致病性及防治原则 了解内容 冠状病毒的流行情况 教学效果自检 SARS-CoV-2的受体是 A.CD26 B.唾液酸 C.ACE2 D.ACE E.CD4 答案：C Thanks