细菌的分类与命名精品文稿.ppt

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1、细菌的分类与命名细菌的分类与命名第1页，本讲稿共17页微生物分类鉴定目的 分类是人类认识微生物，进而利用和分类是人类认识微生物，进而利用和改造微生物的一种手段，微生物工作者只改造微生物的一种手段，微生物工作者只有在掌握了分类学知识的基础上，才能对有在掌握了分类学知识的基础上，才能对纷繁的微生物类群有一清晰的轮廊，了解纷繁的微生物类群有一清晰的轮廊，了解其亲缘关系与演化关系，为人类开发利用其亲缘关系与演化关系，为人类开发利用微生物资源提供依据微生物资源提供依据第2页，本讲稿共17页第一节 微 生 物 分 类 学微生物分类学微生物分类学微生物分类学微生物分类学(Taxonomy)(Taxonomy

2、)(Taxonomy)(Taxonomy)是一门按微生物类群的亲缘关是一门按微生物类群的亲缘关是一门按微生物类群的亲缘关是一门按微生物类群的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群（TaxonTaxonTaxonTaxon）的科学）的科学）的科学）的科学 分类学的任务分类学的任务分类学的任务分类学的任务 分类（分类（分类（分类（ClassificationClassificationClassificationClassification）：是指根据相似

3、性或亲缘）：是指根据相似性或亲缘）：是指根据相似性或亲缘）：是指根据相似性或亲缘关系，将一个有机体放在一个单元中关系，将一个有机体放在一个单元中关系，将一个有机体放在一个单元中关系，将一个有机体放在一个单元中 命名（命名（命名（命名（NomenclatureNomenclatureNomenclatureNomenclature）：是按照国际命名法规给予有）：是按照国际命名法规给予有）：是按照国际命名法规给予有）：是按照国际命名法规给予有机体一个科学的名称机体一个科学的名称机体一个科学的名称机体一个科学的名称 鉴定（鉴定（鉴定（鉴定（IdentificationIdentificationId

4、entificationIdentification）：是指确定一个新分离物）：是指确定一个新分离物）：是指确定一个新分离物）：是指确定一个新分离物是否归属于某个已命名的分类单元的过程。是否归属于某个已命名的分类单元的过程。是否归属于某个已命名的分类单元的过程。是否归属于某个已命名的分类单元的过程。第3页，本讲稿共17页一、微生物的分类单位n n界（界（界（界（KingdomKingdom）门门（Phylum or DivisionPhylum or Division）纲纲（ClassClass）目（目（目（目（OrderOrder）科（科（科（科（FamilyFamily）属（属（属（属（G

5、enusGenus）种（种（种（种（SpeciesSpecies）n n 种是最基本的分类单位。种是最基本的分类单位。种是最基本的分类单位。种是最基本的分类单位。但分类单元之间科加入但分类单元之间科加入但分类单元之间科加入但分类单元之间科加入亚门、亚纲、亚目、亚科等次要分类单位。种以下亚门、亚纲、亚目、亚科等次要分类单位。种以下亚门、亚纲、亚目、亚科等次要分类单位。种以下亚门、亚纲、亚目、亚科等次要分类单位。种以下又可分为亚种、变种、型、菌株等又可分为亚种、变种、型、菌株等又可分为亚种、变种、型、菌株等又可分为亚种、变种、型、菌株等 第4页，本讲稿共17页微生物种与亚种的概念n n种种种种(S

6、pecies)(Species)(Species)(Species)凡是于典型培养菌紧密相同的其他培凡是于典型培养菌紧密相同的其他培凡是于典型培养菌紧密相同的其他培凡是于典型培养菌紧密相同的其他培养菌同统一起来，区分为细菌的一个种（养菌同统一起来，区分为细菌的一个种（养菌同统一起来，区分为细菌的一个种（养菌同统一起来，区分为细菌的一个种（SpeciesSpeciesSpeciesSpecies），），），），即是以某个即是以某个即是以某个即是以某个“典型菌株典型菌株典型菌株典型菌株”为代表、十分类似的菌株的为代表、十分类似的菌株的为代表、十分类似的菌株的为代表、十分类似的菌株的总称。总称。总称

7、。总称。1987198719871987年，国际细菌分类委员会颁布，年，国际细菌分类委员会颁布，年，国际细菌分类委员会颁布，年，国际细菌分类委员会颁布，DNADNADNADNA同源同源同源同源 70%70%70%70%，而且其，而且其，而且其，而且其T T T Tm m m m5555o o o oC C C C的菌群为一个种的菌群为一个种的菌群为一个种的菌群为一个种 n n亚种（亚种（亚种（亚种（Subspecies)Subspecies)Subspecies)Subspecies)在种内，有些菌株在遗传学上关系在种内，有些菌株在遗传学上关系在种内，有些菌株在遗传学上关系在种内，有些菌株在遗

8、传学上关系密切，而且在表型上仅存在较小的某些差异，在种内分密切，而且在表型上仅存在较小的某些差异，在种内分密切，而且在表型上仅存在较小的某些差异，在种内分密切，而且在表型上仅存在较小的某些差异，在种内分成成成成2 2 2 2个或个或个或个或2 2 2 2个以上的分类单位，即为亚种个以上的分类单位，即为亚种个以上的分类单位，即为亚种个以上的分类单位，即为亚种第5页，本讲稿共17页微生物亚种以下的变型分类亚种以下亚种以下亚种以下亚种以下 生物变型生物变型生物变型生物变型表示特殊的生化或生理特征表示特殊的生化或生理特征表示特殊的生化或生理特征表示特殊的生化或生理特征 血清变型血清变型血清变型血清变型

9、表示抗原结构不同表示抗原结构不同表示抗原结构不同表示抗原结构不同 致病变型致病变型致病变型致病变型表示某些寄主的专一致病性表示某些寄主的专一致病性表示某些寄主的专一致病性表示某些寄主的专一致病性 噬菌变型噬菌变型噬菌变型噬菌变型表示对噬菌体的特异性反应表示对噬菌体的特异性反应表示对噬菌体的特异性反应表示对噬菌体的特异性反应 形态变型形态变型形态变型形态变型表示特殊的形态特征表示特殊的形态特征表示特殊的形态特征表示特殊的形态特征 第6页，本讲稿共17页微 生 物 的 菌 株n n菌株菌株菌株菌株(Strain)(Strain)或称品系或称品系或称品系或称品系 是指同种微生物不同来源的是指同种微生

10、物不同来源的是指同种微生物不同来源的是指同种微生物不同来源的纯纯培养物即培养物即培养物即培养物即单单个分离物的个分离物的个分离物的个分离物的纯纯培养后代，常以数字、字培养后代，常以数字、字培养后代，常以数字、字培养后代，常以数字、字母、人命或地名等表示母、人命或地名等表示母、人命或地名等表示母、人命或地名等表示 n n分离物是指已分离得到但分离物是指已分离得到但分离物是指已分离得到但分离物是指已分离得到但为经鉴为经鉴定的定的定的定的纯纯培养物的后代培养物的后代培养物的后代培养物的后代即即即即为为分离物分离物分离物分离物 n n群群群群(Group)(Group)为为工作方便而将近似的种或介于种

11、工作方便而将近似的种或介于种工作方便而将近似的种或介于种工作方便而将近似的种或介于种间间的的的的菌株按其形菌株按其形菌株按其形菌株按其形态态或或或或结结合生理生化、生合生理生化、生合生理生化、生合生理生化、生态态特征特征特征特征归为归为若干若干若干若干类类群。群。群。群。如放如放如放如放线线菌中的菌中的菌中的菌中的链链霉菌属内的种霉菌属内的种霉菌属内的种霉菌属内的种归为归为1 1第7页，本讲稿共17页二、微 生 物 的 命 名n n微生物的命名按国微生物的命名按国微生物的命名按国微生物的命名按国际际命名法命名，即命名法命名，即命名法命名，即命名法命名，即LinnaLinna所所所所创创立的立的

12、立的立的“双名法双名法双名法双名法”每一种微生物都用属与种命名，由每一种微生物都用属与种命名，由每一种微生物都用属与种命名，由每一种微生物都用属与种命名，由2 2个拉丁个拉丁个拉丁个拉丁词词或希腊或希腊或希腊或希腊词词或拉丁化了的其他文字或拉丁化了的其他文字或拉丁化了的其他文字或拉丁化了的其他文字组组成。属名和种成。属名和种成。属名和种成。属名和种名用斜体表达名用斜体表达名用斜体表达名用斜体表达 属名在前，用拉丁名属名在前，用拉丁名属名在前，用拉丁名属名在前，用拉丁名词词表示微生物表示微生物表示微生物表示微生物的构造、形的构造、形的构造、形的构造、形态态、某科学家名字等，描述微生物的主、某科学

13、家名字等，描述微生物的主、某科学家名字等，描述微生物的主、某科学家名字等，描述微生物的主要特征。第一字母大写要特征。第一字母大写要特征。第一字母大写要特征。第一字母大写 种名在后，第一字母小写。种名在后，第一字母小写。种名在后，第一字母小写。种名在后，第一字母小写。用拉丁形容用拉丁形容用拉丁形容用拉丁形容词词表示，描述微生物的色素、形状、来表示，描述微生物的色素、形状、来表示，描述微生物的色素、形状、来表示，描述微生物的色素、形状、来源、病名、地名、某科学家的名字等等源、病名、地名、某科学家的名字等等源、病名、地名、某科学家的名字等等源、病名、地名、某科学家的名字等等 在种名后，在种名后，在种

14、名后，在种名后，附上命名者的姓和命名年份附上命名者的姓和命名年份附上命名者的姓和命名年份附上命名者的姓和命名年份第8页，本讲稿共17页第二节 原核微生物分类系统n n一、原核微生物伯杰氏分一、原核微生物伯杰氏分类类系系统统 伯杰氏伯杰氏细菌菌鉴定手册定手册 伯杰氏系伯杰氏系统细菌学手册菌学手册第9页，本讲稿共17页细 菌 分 类 系 统n n最有代表性和最有影响的最有代表性和最有影响的细菌分菌分类系系统 伯杰氏伯杰氏细菌菌鉴定手册定手册（Bergeys Manual of DeterminativeBacteriology)1923年年,1925年年,1930年年,1934年年,1939年年,

15、1948年年,1957年年,1974年分年分别出版了第一至出版了第一至第八版，第八版，1994年出了第九版年出了第九版 以形以形态、生理、生理生化、生化、G+C mol%、生、生态分布等特征分布等特征为主主第10页，本讲稿共17页微生物的分类技术水平n n微生物分微生物分类中使用的技中使用的技术水平水平 n n 细胞形胞形态水平水平 n n 细胞胞组分水平分水平 n n 蛋白蛋白质水平水平 n n 基因基因组水平水平 第11页，本讲稿共17页伯杰氏系统细菌学手册n nBergeys Manual of Systematic Bacteriology)second edition 2001 以以

16、生理生化、生理生化、G+C mol%、系、系统发育地位等育地位等为主主体体现了了现代分子生物学的研究成代分子生物学的研究成果果 尚未出尚未出齐第12页，本讲稿共17页细菌的分类细菌的分类一、细菌在生物中分类地位一、细菌在生物中分类地位目前公认目前公认“四界分类系统四界分类系统”动物界动物界 植物界植物界 原核生物：细菌、放线菌、螺旋体、原核生物：细菌、放线菌、螺旋体、生物生物 原生生物界原生生物界 霉形体、立克次氏体、衣原体霉形体、立克次氏体、衣原体 真核生物：真菌、藻类、原虫真核生物：真菌、藻类、原虫 病毒界：病毒病毒界：病毒第13页，本讲稿共17页二、细菌分类的特征二、细菌分类的特征1 1

17、形形态态学学特特性性：形形状状、大大小小，排排列列、结结构构、染染色色特特性性，有有无细胞壁无细胞壁2 2培养特性：培养基上的表现，菌落特征培养特性：培养基上的表现，菌落特征3 3生活方式：自主生活，共生，寄生生活方式：自主生活，共生，寄生4 4生生理理生生化化特特征征：化化学学组组成成，营营养养类类型型，营营养养需需要要，繁殖方式，生长条件，代谢途径，代谢产物。繁殖方式，生长条件，代谢途径，代谢产物。5 5抗原构造：抗原构造：O O、K K、H H6 6对噬菌体的敏感性对噬菌体的敏感性7 7对抗生素及其他化学物质的敏感性对抗生素及其他化学物质的敏感性8 8病原性病原性第14页，本讲稿共17页

18、9 9遗传学特征遗传学特征转转化化和和转转导导试试验验。与与细细菌菌之之间间亲亲缘缘关关系系密密切切相相关关，发发生生在亲缘关系相近的细菌种类在亲缘关系相近的细菌种类G+C%G+C%。G+CG+C含含量量对对一一个个种种一一般般是是恒恒定定的的，但但G+CG+C相相同同并并不一定是同一种。不一定是同一种。DNA-DNADNA-DNA杂合试验。将待检菌的杂合试验。将待检菌的DNADNA变性，其双链解为变性，其双链解为单链，而后与标记的参考菌株单链单链，而后与标记的参考菌株单链DNADNA或或rRNArRNA杂交，形成杂交，形成杂交杂交DNA-DNADNA-DNA或或DNA-rRNADNA-rRN

19、A，两种细菌，两种细菌DNADNA中共同的核苷酸序中共同的核苷酸序列愈多，杂交互补区间愈多，二者同源性愈高，亲缘关列愈多，杂交互补区间愈多，二者同源性愈高，亲缘关系就愈近。系就愈近。第15页，本讲稿共17页第三节第三节 细菌的命名细菌的命名采用林奈氏双名法：采用林奈氏双名法：1 1将将一一个个细细菌菌定定一一个个学学名名，用用属属名名和和种种名名表表示示，属属名名在在前前，用用拉拉丁丁文文或或拉拉丁丁化化的的名名词词表表示示，且且第第一一个个字字母母要要大大写写，种种名名在在后后，用用拉拉丁丁文文或或拉拉丁丁化化的的形形容容词词或或名名词词所所有有格格表表示示，第第一一个个字字母母小小写。中文

20、译名与此相反，种名在前，属名在后。写。中文译名与此相反，种名在前，属名在后。2 2在种名之后附以命名人的姓氏及命名年代。在种名之后附以命名人的姓氏及命名年代。第16页，本讲稿共17页3 3 3 3转属：一种生物原为某人定为某属，后来又被旁人改为转属：一种生物原为某人定为某属，后来又被旁人改为转属：一种生物原为某人定为某属，后来又被旁人改为转属：一种生物原为某人定为某属，后来又被旁人改为别属，这时将原命名人的姓氏置于括弧之内放在学名之后，别属，这时将原命名人的姓氏置于括弧之内放在学名之后，别属，这时将原命名人的姓氏置于括弧之内放在学名之后，别属，这时将原命名人的姓氏置于括弧之内放在学名之后，再在

21、括弧之后，附以改定人的姓氏和年代。再在括弧之后，附以改定人的姓氏和年代。再在括弧之后，附以改定人的姓氏和年代。再在括弧之后，附以改定人的姓氏和年代。Salmonella choleraesSalmonella choleraesuisuis (Smith)Weldin,1927 (Smith)Weldin,1927沙氏菌沙氏菌沙氏菌沙氏菌 猪霍乱猪霍乱猪霍乱猪霍乱 （猪）（猪）（猪）（猪）(原命名人原命名人原命名人原命名人)()(新命名人新命名人新命名人新命名人 )年年年年代代代代（属名）（属名）（属名）（属名）（种名）（种名）（种名）（种名）翻译：猪霍乱沙门氏菌。翻译：猪霍乱沙门氏菌。翻译：猪霍乱沙门氏菌。翻译：猪霍乱沙门氏菌。第17页，本讲稿共17页