蛋白质化学蛋白质结构和功能关系PPT课件.ppt
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1、关于蛋白质化学蛋白质结构与功能的关系第一张,PPT共七十六页,创作于2022年6月第二章 蛋白质protein第二张,PPT共七十六页,创作于2022年6月第五节第五节蛋白质结构与功能的关系蛋白质结构与功能的关系(The Relation of Structure and Function of Protein)第三张,PPT共七十六页,创作于2022年6月(一)一级结构是空间构象的基础(一)一级结构是空间构象的基础 一、蛋白质一级结构与功能的关系一、蛋白质一级结构与功能的关系 牛胰核糖核酸牛胰核糖核酸酶的一级结构酶的一级结构二二硫硫键键第四张,PPT共七十六页,创作于2022年6月 天然状态
2、,天然状态,有催化活性有催化活性 尿素、尿素、-巯基乙醇巯基乙醇 去除尿素、去除尿素、-巯基乙醇巯基乙醇非折叠状态,无活性非折叠状态,无活性第五张,PPT共七十六页,创作于2022年6月v多肽链中氨基酸的排列顺序决定了肽链多肽链中氨基酸的排列顺序决定了肽链的折叠和卷曲方式的折叠和卷曲方式部分氨基酸残基在蛋白质空间结构中处于部分氨基酸残基在蛋白质空间结构中处于关键位置关键位置第六张,PPT共七十六页,创作于2022年6月1、种属差异、种属差异同源蛋白同源蛋白(homologous protein)在不同生物体中行使相同或相似功能的在不同生物体中行使相同或相似功能的蛋白质。蛋白质。同源蛋白质的氨基
3、酸顺序具有同源蛋白质的氨基酸顺序具有明显的相似性即为序列同源。明显的相似性即为序列同源。(二)一级结构与功能的关系(二)一级结构与功能的关系 第七张,PPT共七十六页,创作于2022年6月如不同哺乳动物的胰岛素如不同哺乳动物的胰岛素分子结构都由分子结构都由A A和和B B两条链组两条链组成,且二硫键的配对和空间构象极其相似。一级结构成,且二硫键的配对和空间构象极其相似。一级结构也相似,仅有个别氨基酸有差异,因此它们都执行着也相似,仅有个别氨基酸有差异,因此它们都执行着相同的相同的调节糖代谢调节糖代谢的生理功能。的生理功能。同源蛋白的一级结构中有许多位置的氨基酸对所有种属同源蛋白的一级结构中有许
4、多位置的氨基酸对所有种属来说都是相同的,称为来说都是相同的,称为不变残基不变残基(invariant residue)。其他位置的氨基酸差异较大,称为。其他位置的氨基酸差异较大,称为可变残基可变残基(variable residue)。第八张,PPT共七十六页,创作于2022年6月哺乳动物胰岛素氨基酸序列差异哺乳动物胰岛素氨基酸序列差异胰岛素胰岛素人人猪猪狗狗兔兔牛牛羊羊马马 氨基酸残基序列号氨基酸残基序列号A5ThrThrThrThrAlaAlaThrA6Ser SerSerGlyGlySerSerA10 Ile Ile Ile IleValValIleB30ThrAlaAlaSerAlaA
5、laAla第九张,PPT共七十六页,创作于2022年6月 是一种与血红素辅基共价结合的单链蛋白,存是一种与血红素辅基共价结合的单链蛋白,存在于真核生物线粒体中。相对分子量约为在于真核生物线粒体中。相对分子量约为13,00013,000,含有含有104104个氨基酸残基。近个氨基酸残基。近100100个种属的细胞色素个种属的细胞色素c c氨氨基酸顺序已被测定。基酸顺序已被测定。肽链中肽链中2828个位置的氨基酸个位置的氨基酸对所对所有已测试的种属都相同的,有已测试的种属都相同的,表明,这些残基是规表明,这些残基是规定细胞色素定细胞色素c c功能所必需的。功能所必需的。细胞色素细胞色素c(cyto
6、chrome c,Cyt.c)第十张,PPT共七十六页,创作于2022年6月生物名称生物名称与人不同的氨与人不同的氨基酸参加数目基酸参加数目生物名称生物名称与人不同的氨与人不同的氨基酸参加数目基酸参加数目黑猩猩黑猩猩0响尾蛇响尾蛇14恒河猴恒河猴1海海龟龟15兔兔9金金枪鱼枪鱼21袋鼠袋鼠10角角鲛鲛23牛、猪、羊牛、猪、羊10小小蝇蝇25狗狗11蛾蛾31驴驴11小麦小麦35马马12粗糙粗糙链孢链孢菌菌43鸡鸡、火、火鸡鸡13酵母菌酵母菌44不同生物与人细胞色素不同生物与人细胞色素c的氨基酸数目比较的氨基酸数目比较第十一张,PPT共七十六页,创作于2022年6月 狗狗人人猴猴 马马骡骡 鲸鲸
7、兔兔猪猪袋鼠袋鼠企鹅企鹅鸡鸡 鸭鸭响尾蛇响尾蛇龟龟苍蝇苍蝇 蛾蛾脉孢菌属脉孢菌属念珠菌属念珠菌属面包酵母菌面包酵母菌小麦小麦牛牛 蛙蛙金枪鱼金枪鱼动动 物物爬行动物爬行动物两栖动物两栖动物鱼鱼哺乳动物哺乳动物鸟鸟昆昆 虫虫植植 物物脊椎动物脊椎动物从细胞色素从细胞色素C的一级结构看生物进化的一级结构看生物进化生物进化生物进化第十二张,PPT共七十六页,创作于2022年6月2、一级结构改变引起分子病、一级结构改变引起分子病 例:镰刀形红细胞贫血例:镰刀形红细胞贫血N-val his leu thr pro glu glu C(146)HbS 肽链肽链HbA 肽肽 链链N-val his leu
8、thr pro val glu C(146)基因突变导致蛋白质一级结构的突变,导致蛋基因突变导致蛋白质一级结构的突变,导致蛋白质生物功能的下降或丧失,白质生物功能的下降或丧失,这种由蛋白质分子发这种由蛋白质分子发生变异所导致的疾病,生变异所导致的疾病,称为称为“分子病分子病(molecular disease)”。第十三张,PPT共七十六页,创作于2022年6月 最早从分子水平证最早从分子水平证明的先天性遗传病明的先天性遗传病镰刀形红细胞贫血症镰刀形红细胞贫血症(sickle-cell anemia)。镰刀形红细胞镰刀形红细胞正常血细胞正常血细胞hemoglobin 6:GAA(Glu)-GT
9、A(Val)第十四张,PPT共七十六页,创作于2022年6月3、蛋白质前体的激活、蛋白质前体的激活 一些蛋白质或酶在细胞一些蛋白质或酶在细胞中首先合成的是其前体中首先合成的是其前体,在成为有功能的蛋白质或在成为有功能的蛋白质或酶之前需要激活酶之前需要激活.例如例如,胰岛素胰岛素(insulin).的的前体是胰岛素原前体是胰岛素原(proinsulin),要在切除要在切除C肽肽之后才转变为活性的胰岛之后才转变为活性的胰岛素素胰岛素原的一级结构胰岛素原的一级结构第十六张,PPT共七十六页,创作于2022年6月一级结构差异越小,功能相关性越大。一级结构差异越小,功能相关性越大。一级结构上的细微变化可
10、直接影响其功能一级结构上的细微变化可直接影响其功能第十七张,PPT共七十六页,创作于2022年6月(一)血红蛋白与肌红蛋白的结构(一)血红蛋白与肌红蛋白的结构 二、蛋白质空间结构与功能的关系二、蛋白质空间结构与功能的关系 第十八张,PPT共七十六页,创作于2022年6月1 1、血红素、血红素 肌红蛋白肌红蛋白(myoglobin,Mb)与血与血红蛋白都是含有红蛋白都是含有血红素血红素辅基的蛋辅基的蛋白质。血红素是铁卟啉化合物,白质。血红素是铁卟啉化合物,由由4个甲炔基相连成为一个环形,个甲炔基相连成为一个环形,Fe2+居于环中。居于环中。铁离子有铁离子有6个配位个配位键,其中键,其中4个与吡咯
11、环的个与吡咯环的N配位结配位结合,合,1个配位键和肌红蛋白的个配位键和肌红蛋白的93位组氨酸残基结合,氧则与位组氨酸残基结合,氧则与Fe2+形成第形成第6个配位键,接近第个配位键,接近第64位位(E7)组氨酸组氨酸。第十九张,PPT共七十六页,创作于2022年6月肌红蛋白(肌红蛋白(myoglobin,Mb)肌红蛋白是一个肌红蛋白是一个只有三级结构只有三级结构的蛋白质,有的蛋白质,有8段段-螺旋结构,螺旋结构,分别成为分别成为A B C D E F G H肽段。肽段。整条多肽链折叠成紧密球状分整条多肽链折叠成紧密球状分子,氨基酸残基上的疏水侧链子,氨基酸残基上的疏水侧链大都在分子内部,富极性及
12、电大都在分子内部,富极性及电荷的则在分子表面,因此水溶荷的则在分子表面,因此水溶性较好。性较好。Mb分子内部有个袋形分子内部有个袋形空穴,血红素居于其中。空穴,血红素居于其中。第二十张,PPT共七十六页,创作于2022年6月血红蛋白(血红蛋白(hemoglobin,Hb)血红蛋白具有四个亚基组成血红蛋白具有四个亚基组成的四级结构,每个亚基中间有一的四级结构,每个亚基中间有一个疏水局部,可携带一个血红素个疏水局部,可携带一个血红素并携带一分子氧,并携带一分子氧,因此因此1分子分子Hb共结合四分子氧共结合四分子氧。Hb各亚基各亚基的三级结构与的三级结构与Mb极为相似。极为相似。Hb亚基之间通过八对
13、盐键,使亚基之间通过八对盐键,使四个亚基紧密结合而形成亲水的四个亚基紧密结合而形成亲水的球状蛋白。球状蛋白。第二十一张,PPT共七十六页,创作于2022年6月Hb与与Mb一一样样能能可可逆逆地地与与O2结结合合,Hb与与O2结结合合后后称称为为氧氧合合Hb。氧氧合合Hb占占总总Hb的的百百分分数数(称称百百分分饱饱和和度度)随随O2浓浓度度变变化化而而改变。改变。2、血红蛋白的构象变化与结合氧、血红蛋白的构象变化与结合氧 第二十二张,PPT共七十六页,创作于2022年6月*协同效应协同效应(cooperativity)一个寡聚体蛋白质的一个亚基与其配体结合后,一个寡聚体蛋白质的一个亚基与其配体
14、结合后,能影响此寡聚体中另一个亚基与配体结合能力的现象,能影响此寡聚体中另一个亚基与配体结合能力的现象,称为称为协同效应协同效应。如果是促进作用则称为如果是促进作用则称为正协同效应正协同效应 (positive cooperativity)如果是抑制作用则称为如果是抑制作用则称为负协同效应负协同效应 (negative cooperativity)第二十三张,PPT共七十六页,创作于2022年6月抗体抗体生物体内最奇妙的分子生物体内最奇妙的分子无限的多样性(无限的多样性(diversity)功能与结构的双重性功能与结构的双重性 可变区可变区抗原结合抗原结合 恒定区恒定区生物学效应功能生物学效应
15、功能(二)免疫球蛋白的结构与功能(二)免疫球蛋白的结构与功能第二十四张,PPT共七十六页,创作于2022年6月(1)抗体的基本结构)抗体的基本结构Ig分子基本结构分子基本结构是由四个肽链组是由四个肽链组成的。成的。包括二条较小的包括二条较小的轻链和二条较大轻链和二条较大的重链。的重链。轻链与重链之间轻链与重链之间是由二硫键连接是由二硫键连接形成形成Ig分子单体。分子单体。第二十五张,PPT共七十六页,创作于2022年6月(1)抗体的基本结构)抗体的基本结构第二十六张,PPT共七十六页,创作于2022年6月(2)可变区和恒定区)可变区和恒定区可变区可变区和抗原识别有关,决定抗体识别的特异性,和抗
16、原识别有关,决定抗体识别的特异性,而而恒定区恒定区和效应功能相关。和效应功能相关。此外在此外在Y形分子伸出的两臂和主干之间还有个可弯曲的形分子伸出的两臂和主干之间还有个可弯曲的铰链区铰链区(hinge R),能改变两个结合抗原的,能改变两个结合抗原的Y形臂之间形臂之间的距离。的距离。两臂之间的角度可有自两臂之间的角度可有自0到到90的变化,这样有利于两的变化,这样有利于两臂同时结合位于抗原上分布于不同位置的表位。臂同时结合位于抗原上分布于不同位置的表位。第二十七张,PPT共七十六页,创作于2022年6月铰链区第二十八张,PPT共七十六页,创作于2022年6月Ig的铰链区及其功能第二十九张,PP
17、T共七十六页,创作于2022年6月(三)蛋白质构象改变与疾病(三)蛋白质构象改变与疾病 蛋蛋白白质质构构象象疾疾病病:若若蛋蛋白白质质的的折折叠叠发发生生错错误误,尽尽管管其其一一级级结结构构不不变变,但但蛋蛋白白质质的的构构象象发发生生改改变变,仍仍可可影影响响其其功功能能,严重时可导致疾病发生。严重时可导致疾病发生。第三十张,PPT共七十六页,创作于2022年6月蛋白质构象改变导致疾病的机理:蛋白质构象改变导致疾病的机理:有些蛋白有些蛋白质错误折叠后相互聚集,常形成抗蛋白水解酶的质错误折叠后相互聚集,常形成抗蛋白水解酶的淀粉样纤维沉淀,产生毒性而致病,表现为蛋白淀粉样纤维沉淀,产生毒性而致
18、病,表现为蛋白质淀粉样纤维沉淀的病理改变。质淀粉样纤维沉淀的病理改变。这类疾病包括:这类疾病包括:人纹状体脊髓变性病、老年痴人纹状体脊髓变性病、老年痴呆症、亨停顿舞蹈病、疯牛病等。呆症、亨停顿舞蹈病、疯牛病等。第三十一张,PPT共七十六页,创作于2022年6月疯牛病中的蛋白质构象改变疯牛病中的蛋白质构象改变疯牛病是由朊病毒蛋白疯牛病是由朊病毒蛋白(prion protein,PrP)引引起的一组人和动物神经退行性病变。起的一组人和动物神经退行性病变。正常的正常的PrP富含富含-螺旋,称为螺旋,称为PrPc。PrPc在某种未知蛋白质的作用下可转变成全为在某种未知蛋白质的作用下可转变成全为-折叠的
19、折叠的PrPsc,从而致病。,从而致病。PrPc-螺旋螺旋PrPsc-折叠折叠正常正常疯牛病疯牛病第三十二张,PPT共七十六页,创作于2022年6月第六节第六节蛋白质的性质与分离、分析技术蛋白质的性质与分离、分析技术第三十三张,PPT共七十六页,创作于2022年6月一、蛋白质的性质一、蛋白质的性质相对分子质量很大,一般介于相对分子质量很大,一般介于10 000-1 000 000道尔顿道尔顿之间,也有更大的。之间,也有更大的。测定分子量的方法很多:测定分子量的方法很多:渗透压法、超离心法、凝胶渗透压法、超离心法、凝胶过滤法、聚丙烯酰胺凝胶电泳等。过滤法、聚丙烯酰胺凝胶电泳等。(一)蛋白质相对分
20、子质量(一)蛋白质相对分子质量第三十四张,PPT共七十六页,创作于2022年6月(二)蛋白质的两性性质及等电点(二)蛋白质的两性性质及等电点蛋蛋白白质质分分子子除除两两端端的的氨氨基基和和羧羧基基可可解解离离外外,氨氨基基酸酸残残基基侧侧链链中中某某些些基基团团,在在一一定定的的溶溶液液pHpH条条件件下下都都可可解离成带负电荷或正电荷的基团。解离成带负电荷或正电荷的基团。蛋白质的等电点蛋白质的等电点(isoelectric point,pI)当当蛋蛋白白质质溶溶液液处处于于某某一一pH时时,蛋蛋白白质质解解离离成成正正、负负离离子子的的趋趋势势相相等等,即即成成为为兼兼性性离离子子,净净电电
21、荷荷为零,此时溶液的为零,此时溶液的pH称为称为蛋白质的等电点。蛋白质的等电点。第三十五张,PPT共七十六页,创作于2022年6月 各各种种蛋蛋白白质质有有特特定定的的等等电电点点,和和它它所所含含的的氨氨基基酸酸种种类类和数量有关。和数量有关。例:含有碱性氨基酸较多,则例:含有碱性氨基酸较多,则pI偏碱(偏大)偏碱(偏大)含有酸性氨基酸较多,则含有酸性氨基酸较多,则pI偏酸(偏小);偏酸(偏小);含含有有酸酸、碱碱氨氨基基酸酸数数目目相相近近时时,pI为为中中性性偏偏酸酸,约约为为5.0左右。左右。pHpI,蛋蛋白白质质带带负负电电,体体内内蛋蛋白白质质的的pI大大多多为为5.0左右,故生理
22、条件下一般以左右,故生理条件下一般以负离子负离子形式存在。形式存在。第三十六张,PPT共七十六页,创作于2022年6月蛋白质蛋白质 酸性氨基酸数酸性氨基酸数 碱性氨基酸数碱性氨基酸数 pIpI胃蛋白酶胃蛋白酶 37 6 1.037 6 1.0胰岛素胰岛素 4 4 5.354 4 5.35RNARNA酶酶 10 18 7.8 10 18 7.8细胞色素细胞色素c 12 25 9.8c 12 25 9.810.810.8等电点时,蛋白质以两性离子存在,最不稳定,等电点时,蛋白质以两性离子存在,最不稳定,溶解度溶解度最小,易沉淀析出最小,易沉淀析出(用于蛋白质的分离提纯);蛋白质的(用于蛋白质的分离
23、提纯);蛋白质的粘度、渗透压、膨胀性以及导电能力均最小。粘度、渗透压、膨胀性以及导电能力均最小。第三十七张,PPT共七十六页,创作于2022年6月(三)蛋白质的变性与复性(三)蛋白质的变性与复性 *蛋白质的变性蛋白质的变性(denaturation)在某些物理和化学因素作用下,其特定的在某些物理和化学因素作用下,其特定的空空间构象被破坏间构象被破坏(即有序的空间结构变成无序的空(即有序的空间结构变成无序的空间结构),从而导致其间结构),从而导致其理化性质改变和生物活性理化性质改变和生物活性的丧失的丧失。第三十八张,PPT共七十六页,创作于2022年6月造成变性的因素造成变性的因素物理因素:物理
24、因素:加热、紫外线、加热、紫外线、X线、超声波线、超声波化学因素:化学因素:乙醇等有机溶剂、强酸、强乙醇等有机溶剂、强酸、强 碱、重金属离子及生物碱试剂等碱、重金属离子及生物碱试剂等。变性的本质变性的本质 破坏非共价键和二硫键,破坏非共价键和二硫键,不改变蛋白不改变蛋白质的一级结构。质的一级结构。第三十九张,PPT共七十六页,创作于2022年6月变性特征:变性特征:生物活性丧失;生物活性丧失;理化性质改变:理化性质改变:溶解度降低、球状蛋白质的不对称溶解度降低、球状蛋白质的不对称性增加、粘度增加、扩散系数降低,某些蛋白质不能够性增加、粘度增加、扩散系数降低,某些蛋白质不能够再形成结晶再形成结晶
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- 蛋白质 化学 结构 功能 关系 PPT 课件
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