《群体遗传学》课件.ppt
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1、Population geneticsChapter 9群 体 遗 传 学遗传教研室:刘红英遗传教研室:刘红英1 1研究群体的遗传结构及研究群体的遗传结构及其变化规律的学科。其变化规律的学科。群体群体population群体遗传学群体遗传学群体遗传学群体遗传学population geneticspopulation genetics生物学:同一物种的生物学:同一物种的所有成员;所有成员;遗传学:是一群可以遗传学:是一群可以相互交配相互交配的个体。的个体。基因频率、基因型频率基因频率、基因型频率2 2Outline第第1节:节:基因频率和基因型频率基因频率和基因型频率第第2节:节:群体遗传平衡
2、定律群体遗传平衡定律第第3节:节:近婚系数近婚系数3 3第1节基因频率和基因型频率v概念概念v计算方法计算方法4 4概概 念念基因频率基因频率gene frequency:群体中群体中某一基因在其等位基某一基因在其等位基因总数中所占的比例。因总数中所占的比例。A基因在群体中有基因在群体中有8个,群体中基因总数为个,群体中基因总数为100,A的基因频率为的基因频率为8%。5 5基因型频率基因型频率genotypic frequency:群群体中某一基因型个体体中某一基因型个体占该群体中个体总数占该群体中个体总数的比例。的比例。调查的调查的100人中,白化病患者人中,白化病患者20人,所以隐性人,
3、所以隐性纯合子基因型频率为纯合子基因型频率为20%。back6 6计算方法计算方法一对等位基因一对等位基因A、a形成形成3种基因型:种基因型:AA、Aa、aa。基因型频率为:。基因型频率为:fAA,fAa,faa。7 7例例 1调查调查1000人群体的人群体的PTC尝味能力,结果尝味能力,结果TT、Tt、tt三种基因型人数分别为三种基因型人数分别为480、420、100,求,求T、t的基因频率。的基因频率。fTTfTt ftt fT=fTT+1/2fTtft=ftt+1/2fTt 8 8例例 2调查调查837人群体的人群体的MN血型遗传,结果血型遗传,结果M型、型、MN型、型、N型人数分别为型
4、人数分别为261、431、145,求,求LM、LN的基因频率。的基因频率。fMMfMN fNN fM=fMM+1/2fMNfN=fNN+1/2fMN 9 9公式什么情况下可以用?公式什么情况下可以用?必须已知必须已知3种种基因型频率基因型频率!如果如果A、a有显有显隐区分呢?隐区分呢?back用遗传平衡定用遗传平衡定律计算!律计算!1010第2节 群体遗传平衡定律v定律的内容定律的内容v定律的应用定律的应用v影响平衡的因素影响平衡的因素1111平衡定律的内容平衡定律的内容1212提出问题提出问题一对等位基因一对等位基因A和和a,组合成三种基因型,其中组合成三种基因型,其中AA和和Aa A的性状
5、,的性状,aa a的性状,即的性状,即A可以把可以把a的性状掩盖起来。的性状掩盖起来。显示显示显示显示若群体容量充分大,若群体容量充分大,a的的频率又很低,频率又很低,a基因是否基因是否会逐渐消失?会逐渐消失?13132.得出结论得出结论 -Hardy-Weinberg定律定律HardyWeinberg1908用数学方法用数学方法1909用统计方法用统计方法相同结论相同结论1414一个群体一个群体如果如果能够满足:能够满足:群体无限大;群体无限大;随机随机婚配;婚配;没有突变;没有突变;没有自然选择;没有自然选择;没有大没有大规模人群迁移,规模人群迁移,那么那么群体中的基因频率和基因型群体中的
6、基因频率和基因型频率在一代一代的繁殖传代中保持不变。频率在一代一代的繁殖传代中保持不变。a基因不会消失,且频率也不会发生变化!基因不会消失,且频率也不会发生变化!遗遗 传传 平平衡衡 定定 律律1515如何记忆遗传平衡定律?1个条件个条件理想群体理想群体1个结论个结论基因频率、基因型频率基因频率、基因型频率世代保持不变世代保持不变结构不变结构不变1616一对等位基因的一对等位基因的Hardy-Weinberg 定律的推证定律的推证 1717推证的内容推证的内容有显隐区分的一对等位基因有显隐区分的一对等位基因(A、a),在世代传,在世代传递时递时基因频率基因频率(fA、fa)和和基因型频率基因型
7、频率(fAA、fAa、faa)变不变?变不变?1818第第1代:代:调查基因型频率、计调查基因型频率、计算基因频率。算基因频率。推证的步骤推证的步骤第第2代:代:计算基因频率及基因计算基因频率及基因型频率。型频率。1919第1代:调查基因型频率、计算基因频率fAA,fAa,faa a 的频率为的频率为q A 的频率为的频率为 pback2020第2代:计算基因及基因型频率 精子精子卵子卵子A(p)a(q)A(p)AA(p2)Aa(pq)a(q)Aa(pq)aa(q2)AA的频率:的频率:p2Aa的频率:的频率:2pqaa的频率:的频率:q22121A的频率的频率(p)a的频率的频率(q)第第2
8、代的基因型频率代的基因型频率(fAA、fAa、faa)为为p2,2pq,q2 p22pqp2pqp(pq)pq22pqq2pqq(pq)q基因频率基因频率(fA、fa)和基因型频率和基因型频率(fAA、fAa、faa)不 变Hardy-Weinberg定律成立定律成立2222一对等位基因一对等位基因A和和a,频率分别为频率分别为p和和q,当群体,当群体达到平衡时,会有如下结果:达到平衡时,会有如下结果:fAA:fAa:faa=p2:2pq:q2基因频率之和(基因频率之和(p+q)1基因型频率之和(基因型频率之和(p2+2pq+q2)11.平衡群体有何结果?平衡群体有何结果?2.满足何条件为平衡
9、群体?满足何条件为平衡群体?结结 论论2323基因频率和基因型频率满足以下关系的群体基因频率和基因型频率满足以下关系的群体是一个遗传平衡群体。是一个遗传平衡群体。fAAp2fAa2pqfaaq22424Exercises25251.一个一个100人的群体,人的群体,AA有有60人,人,Aa有有20人,人,aa有有20人,该群体是否是一个遗传平衡群体?人,该群体是否是一个遗传平衡群体?思路思路计算计算p,q值值利用已知条件利用已知条件判断一个群体是否为平衡群体,即是要判断一个群体是否为平衡群体,即是要判断该群体的三种基因型之比是否满足判断该群体的三种基因型之比是否满足p2:2pq:q22626已
10、知:已知:求基因频率求基因频率(gene frequency)60100 fAA=20100fAa=20100faa=2727求遗传平衡群体的基因型频率求遗传平衡群体的基因型频率 fAA=p2=(0.7)2 fAa faa=q2=(0.3)2待测人群的基因型频率待测人群的基因型频率为为0.6,0.2,0.2待测人群不是一个遗传平衡群体待测人群不是一个遗传平衡群体2828已知:已知:,Dd,求基因频率求基因频率p、q。2.某群体的一对等位基因某群体的一对等位基因Dd组成的基因型频率分组成的基因型频率分别为,别为,Dd,dd,问该群体是否是一个遗传平,问该群体是否是一个遗传平衡群体?衡群体?292
11、9求遗传平衡群体的基因型频率求遗传平衡群体的基因型频率 fAA=p2=(0.4)2 fAa faa=p2=(0.6)2待测人群的基因型频率待测人群的基因型频率为为0.16,0.48,0.36待测人群是一个遗传平衡群体待测人群是一个遗传平衡群体3030如果群体不平衡,用什么方法可以如果群体不平衡,用什么方法可以达到平衡呢?达到平衡呢?随 机婚 配3131 60100 fAA=20100fAa=20100faa=p=fAq=fa 精子精子A(p=0.7)a(q=0.3)卵卵子子A(p=0.7)AA(0.49)Aa(0.21)a(q=0.3)Aa(0.21)Aa(0.09)Aa(0.09)亲代亲代亲
12、代亲代子一代子一代back3232平衡定律的应用平衡定律的应用计算计算基因频率基因频率ARADXDXR复等位基因复等位基因3333AR 11000000半乳糖血症为半乳糖血症为AR遗传,发病率遗传,发病率x ,求,求致病基因频率和各基因型频率。致病基因频率和各基因型频率。3434求隐性致病基因求隐性致病基因a频率频率:a的频率用的频率用q表示,表示,q=q2x 11000000q X 110000000.001 1(10)6q2fA=p1q1计计 算算 方方 法法3535计算基因型频率计算基因型频率fAA=p22faa=q22 fAa=2pq2qbackz当常隐遗传病发病率较低时,当常隐遗传病
13、发病率较低时,携带者频率为携带者频率为致病基因频率的致病基因频率的2倍;倍;z群体中,常隐遗传病发病率低,但是群体中,常隐遗传病发病率低,但是携带者携带者频率并不低。频率并不低。3636视网膜母细胞瘤为视网膜母细胞瘤为AD遗传,群体发病率遗传,群体发病率x ,求致病基因频率。,求致病基因频率。110000AD3737计计 算算 方方 法法AD遗传病患者绝大遗传病患者绝大多数为杂合子,因此多数为杂合子,因此发病率发病率x2pq。q1p=x=1/10000=1/20000back3838遗传性肾炎为遗传性肾炎为XD遗传,男性发病率遗传,男性发病率x ,求致病基因频率和女性发病率。,求致病基因频率和
14、女性发病率。110000XD3939计计 算算 方方 法法XD遗传病男患者遗传病男患者发病率发病率=基因型频基因型频率率=基因频率基因频率。p=x=1/10000女性发病率?女性发病率?4040女性发病率女性发病率XAXaXAXAp22pq男女发病率之比男女发病率之比:pp2+2pqpp(p+2q)1p+2q12-p12110000150002back4141血友病血友病A为为XR遗传,男性发病率遗传,男性发病率x810-4,求致病基因频率和女性发病率。,求致病基因频率和女性发病率。XR4242计计 算算 方方 法法XR遗传病男患者遗传病男患者发病率发病率=基因型频基因型频率率=基因频率。基因
15、频率。q=x=810-4女性发病率?女性发病率?4343女性发病率女性发病率XaXaq2q26410-8back4444调查一个调查一个200000人的群体的人的群体的ABO血型分布,血型分布,A型型83400人,人,B型型17200人,人,O型型93400人,人,AB型型6000人,求人,求IA、IB、i的基因频率的基因频率。复等位基因复等位基因4545计计 算算 方方 法法人类的人类的ABO血型,受到血型,受到IA、IB、i三个复等三个复等位基因控制,基因定位在位基因控制,基因定位在9q34。用。用p、q、r代表三个基因的频率。用代表三个基因的频率。用 、代代表表4种血型的表型频率。种血型
16、的表型频率。4646IA(p)IB(q)i(r)IA(p)IAIA(p2)IAIB(pq)IAi(pr)IB(q)IAIB(pq)IBIB(q2)IBi(qr)i(r)IAi(pr)IBi(qr)Ii(r2)精子精子卵子卵子子一代子一代ABOAB=p2+2pr=q2+2qr=r2=2pq4747i=4848back4949突变突变选择选择非随机婚配非随机婚配群体非无限大群体非无限大迁移迁移从从理想群体理想群体出发,研究出发,研究各因素的影各因素的影响。响。影响遗传平衡的因素影响遗传平衡的因素理想群体理想群体不存在!不存在!研研 究究方方 法法5050只有突变,没有其只有突变,没有其他影响因素。
17、他影响因素。突变突变5151突变的概念突变的概念Mutation:基因的一基因的一种形式变化为另一种形式变化为另一种等位形式。种等位形式。基因突变率:基因突变率:基因基因由一种形式变为另由一种形式变为另一种形式的概率。一种形式的概率。10-410-6配子配子/代。代。Aa5252计算计算一对等位基因一对等位基因A、a,频率分别为,频率分别为p、q。Aa突变率突变率突变率突变率每一代由每一代由A变成变成a的数量为的数量为p;每一代由每一代由a变成变成A的数量为的数量为q;5353pq,则,则a;pq,则,则A;当群体平衡时:当群体平衡时:p=q(1-q)=q5454仅有突变发生仅有突变发生时,群
18、体平衡时的时,群体平衡时的基因频率仅由突变率基因频率仅由突变率u和和v决定。决定。例如例如PTC尝味能力尝味能力T、t基因基因u为为6010-6,v为为4010-4,求群体平衡时,求群体平衡时t的频率。的频率。5555back必须已知突变率必须已知突变率u和和v!通过通过“选择选择”作作用用5656只有选择,没有其只有选择,没有其他影响因素。他影响因素。选择选择计算计算突变率突变率5757v选择的概念选择的概念v选择对显性基因的作用选择对显性基因的作用v选择对隐性基因的作用选择对隐性基因的作用v选择对选择对X连锁隐性基因的作用连锁隐性基因的作用v选择对选择对X连锁显性基因的作用连锁显性基因的作
19、用v选择与平衡多态选择与平衡多态Outline 5858Selection:适者生适者生存,不适者被淘存,不适者被淘汰。汰。有利的基因频率有利的基因频率上升上升不利的基因频率不利的基因频率下降下降结果结果用什么来代表用什么来代表某个体某个体适合还是不适合还是不适合生存的程度呢?适合生存的程度呢?选择选择的概念的概念5959Fitness:某一基因型某一基因型适合生存适合生存的程度。的程度。适合度无具体指标无具体指标平均生活力平均生活力平均繁殖力平均繁殖力相对生育率相对生育率6060相对生育率relative fertility,f:某某一基因型与其他基因一基因型与其他基因型相比能够存活并留型相
20、比能够存活并留下子裔的下子裔的相对相对能力。能力。某基因型的生育率某基因型的生育率正常基因型生育率正常基因型生育率6161丹麦丹麦108名名软骨发育不全性侏儒软骨发育不全性侏儒共生育共生育27个孩个孩子。其子。其457名正常同胞共生育名正常同胞共生育582个孩子。则个孩子。则软软骨发育不全性侏儒骨发育不全性侏儒的相对生育率表示为:的相对生育率表示为:Example 27 108582 457f=0.196存活?存活?淘汰?淘汰?用什么表示呢?用什么表示呢?6262选择系数selective coefficient,s:指在选择的作用下适指在选择的作用下适合度合度降低的程度降低的程度,或反,或反
21、映某一基因型在群体中映某一基因型在群体中不利于生存不利于生存的程度。的程度。s1f上例的选择系数是:上例的选择系数是:s1f116363选择选择显性基因显性基因A:致病基因,频率为:致病基因,频率为pa:正常基因,频率为:正常基因,频率为qs:选择系数:选择系数选择对选择对3种基因型种基因型的作用一样吗?的作用一样吗?AA,Aa基因型要受基因型要受到选择,到选择,aa基因型基因型不受影响!不受影响!计算计算突变率突变率6464A:致病基因,频率为:致病基因,频率为pa:正常基因,频率为:正常基因,频率为qs:选择系数:选择系数每一代被选择淘每一代被选择淘汰的基因频率?汰的基因频率?sp6565
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