《核酸类药物的分析》PPT课件.ppt
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1、第九章第九章 核酸类药物的分析核酸类药物的分析基本要求基本要求掌握:掌握:核酸的结构和分类;嘌呤类药物核酸的结构和分类;嘌呤类药物和嘧啶类药物鉴别、检查、含量测定的和嘧啶类药物鉴别、检查、含量测定的原理原理熟悉:熟悉:核酸的理化性质;反义寡核苷酸核酸的理化性质;反义寡核苷酸药物鉴别、检查、含量测定的原理药物鉴别、检查、含量测定的原理第一节第一节概述概述结构和分类结构和分类理化性质理化性质什么是核酸?什么是核酸?1869年核酸最早分离自外科绷带脓细胞的年核酸最早分离自外科绷带脓细胞的细胞核细胞核,当时发现这种物质含磷量之高超过当时发现的任何当时发现这种物质含磷量之高超过当时发现的任何一种有机物,
2、并且一种有机物,并且含有很强的酸性含有很强的酸性,故得名核酸。,故得名核酸。19091909年其组成被研究清楚,年其组成被研究清楚,19441944年生物功能初步澄年生物功能初步澄清,在清,在X X射线衍射技术支持下射线衍射技术支持下19531953年结构澄清。年结构澄清。核酸是脱氧核糖核酸(核酸是脱氧核糖核酸(DNADNA)与核糖核酸()与核糖核酸(RNARNA)的)的通称通称。核酸核酸核苷酸核苷酸磷酸磷酸核苷核苷戊糖戊糖碱基碱基水水解解一、结构和分类一、结构和分类核核 酸酸代表戊糖戊糖戊糖戊糖,对DNA而言为脱氧核糖脱氧核糖脱氧核糖脱氧核糖,对RNA而言为核糖核糖核糖核糖;代表碱基碱基碱基
3、碱基 代表磷酸基磷酸基磷酸基磷酸基核苷酸核苷酸核苷酸核苷酸核苷酸核苷酸磷酸碱基戊糖HH2 2OOHH2 2OO碱基碱基碱基碱基磷酸磷酸磷酸磷酸戊糖戊糖戊糖戊糖糖苷键糖苷键糖苷键糖苷键酯键酯键酯键酯键核苷酸核苷酸碱基连接(糖苷键)碱基连接(糖苷键)酯酯酯酯键键(对(对DNA为为H)1122334455戊糖戊糖核糖(in RNA)2脱氧核糖(in DNA)核苷核苷DNA&RNA碱基碱基RNARNADNADNA嘧啶环嘧啶环嘧啶环嘧啶环嘌呤环嘌呤环嘌呤环嘌呤环尿嘧啶尿嘧啶尿嘧啶尿嘧啶 U U胸腺嘧啶胸腺嘧啶胸腺嘧啶胸腺嘧啶 T T胞嘧啶胞嘧啶胞嘧啶胞嘧啶 C C鸟嘌呤鸟嘌呤鸟嘌呤鸟嘌呤 GG腺嘌呤腺嘌
4、呤腺嘌呤腺嘌呤 A A类别类别DNARNA基本单位基本单位脱氧核糖核苷酸脱氧核糖核苷酸核糖核苷酸核糖核苷酸核苷酸核苷酸腺嘌呤脱氧核苷酸腺嘌呤脱氧核苷酸 鸟嘌呤脱氧核苷酸鸟嘌呤脱氧核苷酸 胞嘧啶脱氧核苷酸胞嘧啶脱氧核苷酸 胸腺嘧啶脱氧核苷酸胸腺嘧啶脱氧核苷酸 腺嘌呤核苷酸腺嘌呤核苷酸 鸟嘌呤核苷酸鸟嘌呤核苷酸 胞嘧啶核苷酸胞嘧啶核苷酸 尿嘧啶核苷酸尿嘧啶核苷酸碱基碱基腺嘌呤(腺嘌呤(A)鸟嘌呤(鸟嘌呤(G)胞嘧啶(胞嘧啶(C)胸腺嘧啶(胸腺嘧啶(T)腺嘌呤(腺嘌呤(A)鸟嘌呤(鸟嘌呤(G)胞嘧啶(胞嘧啶(C)尿嘧啶(尿嘧啶(U)五碳糖五碳糖脱氧核糖脱氧核糖 核糖核糖酸酸磷酸磷酸 磷酸磷酸 稀有碱
5、基稀有碱基嘌呤次黄嘌呤、1-甲基次黄嘌呤、N2、N2-二甲基鸟嘌呤。嘧啶5-甲基胞嘧啶、5-羟甲基胞嘧啶、二氢尿嘧啶、4-巯尿嘧啶都是基本碱基的化学修饰型。鸟嘌呤鸟嘌呤次黄嘌呤次黄嘌呤1-甲基次黄嘌呤甲基次黄嘌呤二、理化性质二、理化性质(一)两性性质:(一)两性性质:磷酸基;碱基(通常:酸性)磷酸基;碱基(通常:酸性)pHpH影响碱基间氢键稳定:影响碱基间氢键稳定:(二)水解性:(二)水解性:微溶于水,不溶于一般的有机溶剂微溶于水,不溶于一般的有机溶剂(三)(三)UVUV:max=260nm max=260nm 蛋白质蛋白质280nm280nm A A260260/A/A280 280 纯纯D
6、NADNA 纯纯RNARNA应达到应达到 混有杂蛋白混有杂蛋白 比值降低比值降低(四)变性和复性(四)变性和复性1.1.变性:变性:在某些理化因素影响下,在某些理化因素影响下,DNADNA双螺旋区的双螺旋区的氢键断裂和碱基堆积力破坏,有规律的双螺旋结氢键断裂和碱基堆积力破坏,有规律的双螺旋结构变成单链无规律的构变成单链无规律的“线团线团”,但不发生共价键,但不发生共价键的断裂,这过程称之。的断裂,这过程称之。变性原因:高温(一般变性原因:高温(一般7575)、强氧化剂、强)、强氧化剂、强酸、碱、尿素等;酸、碱、尿素等;机理:机理:双链间氢键断开,成为两条单链(双链间氢键断开,成为两条单链(DN
7、ADNA双双螺旋二级结构的破坏,生物活性的丧失)螺旋二级结构的破坏,生物活性的丧失)特征性特征性Tm-DNATm-DNA的变性温度的变性温度 829582952.复性复性一定条件下,去除变性因素后,核酸一定条件下,去除变性因素后,核酸恢复二级结构及生物活恢复二级结构及生物活性的现象性的现象;通常使用;通常使用热复性热复性热复性热复性。(退火)。(退火)高温变性高温变性缓缓慢慢冷冷却却热复性热复性急急速速冷冷却却复性失败复性失败热复性在基因测序中被广泛应用热复性在基因测序中被广泛应用热复性在基因测序中被广泛应用热复性在基因测序中被广泛应用(五)颜色反应(五)颜色反应苔黑酚反应苔黑酚反应:RNAR
8、NA中核糖中核糖+浓浓HClHCl(浓(浓H H2 2SOSO4 4)糠醛糠醛+苔黑酚苔黑酚深绿色化合物深绿色化合物(max=670nm max=670nm)二苯胺反应二苯胺反应:DNADNA中脱氧核糖中脱氧核糖+浓浓H H2 2SOSO4 4 5-5-羟基羟基-4-4-羰基戊醛羰基戊醛+二苯胺二苯胺蓝色蓝色化合物(化合物(max=595nm max=595nm)水解后磷酸:水解后磷酸:磷酸磷酸+钼酸钼酸磷钼酸磷钼酸+还原剂(维生素还原剂(维生素C C、氯化亚锡等)、氯化亚锡等)钼钼蓝(蓝(max=660nm max=660nm)Fe3+脱水脱水第二节第二节嘌呤类核苷酸药物分析嘌呤类核苷酸药物
9、分析l嘌呤碱(腺嘌呤、鸟嘌呤)嘌呤碱(腺嘌呤、鸟嘌呤)l戊糖戊糖l磷酸磷酸一、鉴别一、鉴别戊糖鉴别戊糖鉴别嘌呤鉴别嘌呤鉴别磷酸鉴别磷酸鉴别特征吸收光谱特征吸收光谱熔点测定熔点测定(一)戊糖的鉴别(一)戊糖的鉴别苔黑酚反应苔黑酚反应(地衣酚反应)(地衣酚反应)-凡核糖均有此反应凡核糖均有此反应试剂:浓盐酸,苔黑酚试剂,三氯化铁(催化剂试剂:浓盐酸,苔黑酚试剂,三氯化铁(催化剂)现象:鲜绿色现象:鲜绿色二苯胺反应二苯胺反应DNA试剂:浓硫酸,二苯胺试剂:浓硫酸,二苯胺现象:蓝色现象:蓝色与间苯三酚反应(核苷酸中的戊糖)与间苯三酚反应(核苷酸中的戊糖)现象:玫瑰红色现象:玫瑰红色(二)嘌呤的鉴别(二
10、)嘌呤的鉴别+氨制硝酸银氨制硝酸银白色白色红棕色(遇光)红棕色(遇光)(嘌呤碱基的特殊鉴别反应)(嘌呤碱基的特殊鉴别反应)(三)磷酸的鉴别(三)磷酸的鉴别有机磷有机磷无机磷无机磷+钼酸钼酸磷钼酸磷钼酸+还原剂还原剂钼蓝钼蓝(四)特征吸收光谱(四)特征吸收光谱lUV:嘌呤环,嘧啶环lIR(五)熔点测定(五)熔点测定二、检查二、检查一般检查一般检查酸度,水分,无机盐,有机物,溶液的颜色和澄清度酸度,水分,无机盐,有机物,溶液的颜色和澄清度蛋白质检查蛋白质检查磺基水杨酸溶液磺基水杨酸溶液有关物质有关物质纸色谱,薄层色谱,电泳,荧光检查纸色谱,薄层色谱,电泳,荧光检查三、含量测定三、含量测定紫外紫外-
11、可见分光光度法可见分光光度法现在国家已经批准的现在国家已经批准的嘌呤类核苷酸药物嘌呤类核苷酸药物一般都用一般都用此法测定含量此法测定含量HPLC四、实例分析四、实例分析肌苷肌苷ATP(一)肌苷的质量分析(一)肌苷的质量分析1.结构:结构:C10H12N4O5本品为本品为9-D-9-D-核糖次黄嘌呤。按干燥品计算,含核糖次黄嘌呤。按干燥品计算,含C C1010H1H12 2N N4 4O O5 5应为。应为。2.性状:性状:本品为白色结晶性粉末;无臭,味微苦。本品为白色结晶性粉末;无臭,味微苦。本品在水中略溶,在氯仿或乙醇中不溶,在稀盐本品在水中略溶,在氯仿或乙醇中不溶,在稀盐酸和氢氧化钠溶液中
12、易溶。酸和氢氧化钠溶液中易溶。3.鉴别鉴别取取供试品溶液适量供试品溶液适量,加等体积的加等体积的3,5-3,5-二羟基二羟基甲苯溶液甲苯溶液(取取3 3,5-5-二羟基甲苯与三氯化铁各二羟基甲苯与三氯化铁各,加盐酸使成加盐酸使成100ml)100ml),混匀,在水浴中加热约,混匀,在水浴中加热约1010分钟,即显分钟,即显绿色。绿色。-苔黑酚反应苔黑酚反应取本品取本品1 1水溶液,加氨制硝酸银试液数滴,水溶液,加氨制硝酸银试液数滴,即产生即产生白色胶状白色胶状沉淀。沉淀。-嘌呤碱基嘌呤碱基 取含量测定项下的溶液取含量测定项下的溶液,照分光光度法测定,照分光光度法测定,在在248nm248nm的
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