《蛋白质的化学》课件.ppt
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1、第四章第四章蛋白质的化学蛋白质的化学 预习重点:预习重点:1.1.蛋白质的功能蛋白质的功能 2.2.氨基酸组成、分类、两性解离氨基酸组成、分类、两性解离 3.3.氨基酸的分离分析氨基酸的分离分析 4.4.蛋白质的一级结构、肽键和肽链蛋白质的一级结构、肽键和肽链 5.5.维持蛋白质构象的化学键维持蛋白质构象的化学键 6.6.蛋白质的二级结构蛋白质的二级结构 7.7.蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能 学习难点学习难点 :1.1.谷胱甘肽谷胱甘肽 2.2.蛋白质一级结构的测定蛋白质一级结构的测定 3.3.基序、三级结构、四级结构基序、三级结构、四级结构 4.4.蛋白质合成基本原理蛋白质合成基本原
2、理 5.5.蛋白质的性质蛋白质的性质 6.6.蛋白质分离纯化蛋白质分离纯化 7.7.蛋白质纯度鉴定蛋白质纯度鉴定第一节第一节蛋白质是生命的物质基础蛋白质是生命的物质基础一、蛋白质是构成生物体的基本成分一、蛋白质是构成生物体的基本成分二、蛋白质具有多样性的生物学功能二、蛋白质具有多样性的生物学功能生物催化作用(酶)生物催化作用(酶)代谢调节作用(激素)代谢调节作用(激素)免疫保护作用免疫保护作用(抗体)(抗体)转运和贮存作用(血红蛋白转运和贮存作用(血红蛋白)运动与支持作用(肌动蛋白、胶原蛋白)运动与支持作用(肌动蛋白、胶原蛋白)控制生长和分化作用(核蛋白)控制生长和分化作用(核蛋白)接受和传递
3、信息作用(受体蛋白)接受和传递信息作用(受体蛋白)生物膜的功能生物膜的功能第二节第二节蛋白质的化学组成蛋白质的化学组成 各种蛋白质的含氮量很接近,平均为各种蛋白质的含氮量很接近,平均为1616。100克样品中克样品中蛋白质的含量蛋白质的含量(g%)=每克样品含氮每克样品含氮克数克数 6.25100 凯氏定氮法测定蛋白质含量:定氮仪定氮仪一.蛋白质的元素组成:二、蛋白质结构的基本单位二、蛋白质结构的基本单位氨基酸氨基酸组成蛋白质的氨基酸共有组成蛋白质的氨基酸共有2020种,称为种,称为基本氨基酸基本氨基酸。(一)基本氨基酸(一)基本氨基酸的结构通式的结构通式CHCOOHRH2N不同的不同的-氨基
4、酸,其氨基酸,其R 侧链侧链不同不同除甘氨酸、脯氨酸外,基本氨基酸皆为除甘氨酸、脯氨酸外,基本氨基酸皆为L-L-氨基酸氨基酸。2020种氨基酸的分类:根据种氨基酸的分类:根据R R基不同,分为基不同,分为4 4类类甘氨酸甘氨酸 glycine Gly G 5.97丙氨酸丙氨酸 alanine Ala A 6.00缬氨酸缬氨酸 valine Val V 5.96亮氨酸亮氨酸 leucine Leu L 5.98异亮氨酸异亮氨酸 isoleucine Ile I 6.02苯丙氨酸苯丙氨酸 phenylalanine Phe P 5.48脯氨酸脯氨酸 proline Pro P 6.301、非极性疏
5、水性氨基酸、非极性疏水性氨基酸2色氨酸色氨酸 tryptophan Try W 5.89丝氨酸丝氨酸 serine Ser S 5.68酪氨酸酪氨酸 tyrosine Try Y 5.66 半胱氨酸半胱氨酸 cysteine Cys C 5.07 蛋氨酸蛋氨酸 methionine Met M 5.74天冬酰胺天冬酰胺 asparagine Asn N 5.41 谷氨酰胺谷氨酰胺 glutamine Gln Q 5.65 苏氨酸苏氨酸 threonine Thr T 5.60 2、极性中性氨基酸、极性中性氨基酸天冬氨酸天冬氨酸 aspartic acid Asp D 2.97谷氨酸谷氨酸 gl
6、utamic acid Glu E 3.22赖氨酸赖氨酸 lysine Lys K 9.74精氨酸精氨酸 arginine Arg R 10.76组氨酸组氨酸 histidine His H 7.593、酸性氨基酸、酸性氨基酸4、碱性氨基酸碱性氨基酸(三)、氨基酸的化学化学性质 两性解离与等电点两性解离与等电点 紫外吸收性质紫外吸收性质 茚三酮反应茚三酮反应.两性解离氨基酸在水溶液和晶体状态主要以氨基酸在水溶液和晶体状态主要以兼性离子兼性离子形式存在形式存在CHRCOOH3N+等电点的定义:等电点的定义:当溶液处于某一当溶液处于某一pHpH值时,值时,氨基酸分子中所含的氨基酸分子中所含的-NH
7、-NH3 3+和和-COO-COO-数目正数目正好相等,净电荷为好相等,净电荷为0 0。这一。这一pHpH值即为氨基值即为氨基酸的等电点,简称酸的等电点,简称pIpI。每种氨基酸都有特定的等电点。在等电点时,每种氨基酸都有特定的等电点。在等电点时,氨基酸的溶解度最小。氨基酸的溶解度最小。等电点COOCHH3N+R+OH+H+COOCHH2NR+OH+H+在酸性溶液中在酸性溶液中(pH pI)在水溶液中在水溶液中(pH=pI)在碱性溶液中在碱性溶液中(pHpI)COOHCHH2NR溶液溶液pHpH影响氨基酸的羧基与氨基的解离程度影响氨基酸的羧基与氨基的解离程度COOCHH3N+CH3 K1COO
8、HCHH3N+CH3COOH2NCH3 K2Ala+Ala AlaHCCOOHC HH3N+CH2COOHCOOCHH3N+CH2COOHCOOCHH2NCH2COOAsp+Asp Asp Asp=K1 K2 K3CCCH2COON+3HOOH举例:.紫外吸收在紫外区在紫外区酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有吸光能力。有吸光能力。苯丙氨酸的苯丙氨酸的 maxmax259nm259nm酪氨酸的酪氨酸的 maxmax278nm278nm色氨酸的色氨酸的 maxmax279nm279nm蛋白质中含有这些芳香族氨基酸,所以也有紫外吸收能力。一般用紫外分光光度计在280nmnm波长下测定
9、最波长下测定最大光吸收,而测定蛋白质的含量。大光吸收,而测定蛋白质的含量。.茚三酮的反应茚三酮的反应A.A.该反应非常灵敏,该反应非常灵敏,测定范围:测定范围:0.5500.550g/ml g/ml B.B.氨基酸与茚三酮,生成的蓝紫色化合物,氨基酸与茚三酮,生成的蓝紫色化合物,在在570nm570nm测定吸光值测定吸光值C.C.脯氨酸、羟脯氨酸与茚三酮生成黄色物质,在脯氨酸、羟脯氨酸与茚三酮生成黄色物质,在440nm440nm处测吸光值处测吸光值应用:应用:A.A.氨基酸定量分析(纸层析法或者薄膜层析法分离)氨基酸定量分析(纸层析法或者薄膜层析法分离)B.B.氨基酸自动分析仪氨基酸自动分析仪
10、氨基酸的分离与分析 自动氨基酸分析仪自动氨基酸分析仪1.1.蛋白质完全酸水解蛋白质完全酸水解2.2.水解液于水解液于PH 2PH 2上样于钠型阳离子交换柱上样于钠型阳离子交换柱3.3.用柠檬酸钠溶液洗脱用柠檬酸钠溶液洗脱4.4.用柠檬酸钠溶液洗脱用柠檬酸钠溶液洗脱5.5.分析洗脱谱上各峰的位置和面积,与标分析洗脱谱上各峰的位置和面积,与标准氨基酸图谱比较分析准氨基酸图谱比较分析 P66P66第三节第三节蛋白质的分子结构蛋白质的分子结构一级结构一级结构(决定空间结构):(决定空间结构):又叫又叫共价结构或基本共价结构或基本结构,指蛋白质中不同氨基酸的种类、数量和排列顺序。结构,指蛋白质中不同氨基
11、酸的种类、数量和排列顺序。(构象)空间结构(构象)空间结构二级结构二级结构三级结构三级结构四级结构四级结构基序基序结构域结构域(决定功能)(决定功能)+-HOHNH2-CH-C-N-CH-COOHR2HR1ONH2-CH-CR1OOH NH-CH-CR2OOHH肽键由一分子氨基酸的由一分子氨基酸的羧基基和另一和另一分子氨基酸分子氨基酸氨基氨基缩合脱水而成合脱水而成。概念:概念:肽、肽、二肽、二肽、寡肽、寡肽、多肽、多肽、多肽多肽链链H2NCN CCOOHRnHHCOR3NHCHCCR1H OOR2NHCHR4NHCH-CON-N-末端末端C-末端末端氨基酸残基氨基酸残基氨基酸残基氨基酸残基:多
12、肽链中的氨基酸参与肽链的形成,已非原来完整多肽链中的氨基酸参与肽链的形成,已非原来完整的分子,称为氨基酸残基。的分子,称为氨基酸残基。共价主链共价主链:多肽链中的骨干是由氨基酸的羧基与氨基形成的肽链:多肽链中的骨干是由氨基酸的羧基与氨基形成的肽链部分规则的重复排列而成,称为共价主链。部分规则的重复排列而成,称为共价主链。侧链侧链:多肽链中:多肽链中R基部分,称为侧链。基部分,称为侧链。方向性方向性:书写方式:书写方式:N端写在左边,端写在左边,C端写在右边端写在右边命名:命名:从从N端到端到C端端CNN 末端末端:多肽链中有:多肽链中有自由氨基自由氨基的一端的一端C 末端末端:多肽链中有:多肽
13、链中有自由羧基自由羧基的一端的一端H2NCH2COOHCNHCCCH3OOOHNCH2CHH丙氨酸丙氨酸丝氨酸丝氨酸甘氨酸甘氨酸一级结构中化学键:一级结构中化学键:肽键(主要)、肽键(主要)、二硫键(少量)二硫键(少量)二硫键:二硫键:由两分子半胱氨酸残基的巯基脱氢而成,存在于肽链内或肽链间由两分子半胱氨酸残基的巯基脱氢而成,存在于肽链内或肽链间 牛核糖核酸酶牛核糖核酸酶C C末端末端N N末末端端GSHGSH过氧过氧化物酶化物酶H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSHGSH还原酶还原酶NADPH+H+NADP+生物活性肽生物活性肽 1.谷胱甘肽谷胱甘肽(GSH)体内许多激素属寡肽或多肽
14、体内许多激素属寡肽或多肽2.多肽类激素多肽类激素 二二.蛋白质的一级结构测定蛋白质的一级结构测定1.1.氨基酸组成的分析氨基酸组成的分析蛋白质样品的纯化蛋白质样品的纯化蛋白质样品的纯化蛋白质样品的纯化蛋白质分子中多肽链数目的测定蛋白质分子中多肽链数目的测定蛋白质分子中多肽链数目的测定蛋白质分子中多肽链数目的测定 氨基酸组成的分析:氨基酸组成的分析:氨基酸组成的分析:氨基酸组成的分析:氨基酸自动分析仪氨基酸自动分析仪氨基酸自动分析仪氨基酸自动分析仪 含多个亚基的蛋白质,先纯化为单含多个亚基的蛋白质,先纯化为单含多个亚基的蛋白质,先纯化为单含多个亚基的蛋白质,先纯化为单 个亚基,再测定每个亚基氨基
15、酸组成个亚基,再测定每个亚基氨基酸组成个亚基,再测定每个亚基氨基酸组成个亚基,再测定每个亚基氨基酸组成 分析肽链的分析肽链的N-N-末端氨基酸末端氨基酸分析肽链的分析肽链的C-C-末端氨基酸末端氨基酸N N末端氨基酸分析末端氨基酸分析A.A.二硝基氟苯(二硝基氟苯(DNFBDNFB)法:)法:P70P70B.B.二甲氨基萘磺酰氯法(二甲氨基萘磺酰氯法(DNS-ClDNS-Cl)灵敏度:灵敏度:1 1 1010-9-9molmol。C.C.EdmanEdman法(苯异硫氰酸,法(苯异硫氰酸,PITCPITC法法):P71P71,蛋白质自动分析仪,蛋白质自动分析仪 D.D.氨肽酶法:氨肽酶法:肽链
16、外切酶,从多肽链的肽链外切酶,从多肽链的N-N-端逐个水解氨基酸。端逐个水解氨基酸。A A.肼解法肼解法:C C末端氨基酸分析末端氨基酸分析B.B.羧肽酶法:羧肽酶法:肽链外切酶,从多肽链的肽链外切酶,从多肽链的C-C-端逐个水解氨基酸。端逐个水解氨基酸。大分子多肽氨基酸顺序的确定:裂解大分子多肽氨基酸顺序的确定:裂解A.A.化学裂解法:化学裂解法:溴化氰裂解法;羟胺溴化氰裂解法;羟胺NHNH2 2OHOH裂解法裂解法 B.B.酶裂法酶裂法:胰蛋白酶,胃蛋白酶等胰蛋白酶,胃蛋白酶等确定肽段在多肽链中的次序确定肽段在多肽链中的次序:重叠法:重叠法 P72P72 利利利利用用用用两两两两套套套套或
17、或或或多多多多套套套套肽肽肽肽段段段段的的的的氨氨氨氨基基基基酸酸酸酸顺顺顺顺序序序序彼彼彼彼此此此此间间间间的的的的交错重叠,拼凑出整条多肽链的氨基酸顺序。交错重叠,拼凑出整条多肽链的氨基酸顺序。交错重叠,拼凑出整条多肽链的氨基酸顺序。交错重叠,拼凑出整条多肽链的氨基酸顺序。16161616肽,端肽,端肽,端肽,端H H H H 端端端端 法裂解:法裂解:法裂解:法裂解:ONS PS EOVE RLA HOWTONS PS EOVE RLA HOWTONS PS EOVE RLA HOWTONS PS EOVE RLA HOWT 法裂解:法裂解:法裂解:法裂解:SEO WTON VERL A
18、PS HOSEO WTON VERL APS HOSEO WTON VERL APS HOSEO WTON VERL APS HO 重叠法重叠法重叠法重叠法确定序列:确定序列:确定序列:确定序列:HOWTONSEOVERLAPSHOWTONSEOVERLAPSHOWTONSEOVERLAPSHOWTONSEOVERLAPS核糖体核糖体蛋白质链蛋白质链5.5.核酸推导法核酸推导法SSNH-OoCCSSOH-OCH2NH3+COO-疏水键疏水键二硫键二硫键盐键盐键侧链氢键侧链氢键氢键氢键1.1.氢键氢键:由连接在一个电负性大的原子上的氢与另一电负性大的原子相互作用形成;多肽链主链骨架上羰基氧原子与
19、亚氨基的氢原子间形成氢键维持二级结构的主要次级键;侧链间或主链间所生成的氢键是维持三、四级结构的主要化学键之一。2.2.疏水键疏水键:两个非极性基团因避开水相而聚集在一起的两个非极性基团因避开水相而聚集在一起的作用力,维持蛋白质三、四级结构的主要次级键。作用力,维持蛋白质三、四级结构的主要次级键。盐键:盐键:蛋白质蛋白质分子中分子中带正电带正电荷集团荷集团和负电和负电荷基团荷基团之间静之间静电吸引电吸引所形成所形成的化学的化学键。键。(二)蛋白质的二级结构(二)蛋白质的二级结构多肽主链原子的局部空间排列。多肽主链原子的局部空间排列。即即多肽链的主链骨架中若多肽链的主链骨架中若干干肽单位肽单位,
20、各自沿一定的轴盘旋或折叠,并以,各自沿一定的轴盘旋或折叠,并以氢键氢键为主要为主要次级键形成有规则的构象。次级键形成有规则的构象。肽单位:肽键与相邻肽单位:肽键与相邻的两个的两个碳原子所碳原子所组组成的基成的基团团,又称,又称肽肽平平面。面。CCN COH肽键具有部分双键性质,不能自由旋转;肽键具有部分双键性质,不能自由旋转;肽单位是刚性平面结构,肽单位的肽单位是刚性平面结构,肽单位的6个原子都个原子都位于同一平面上;位于同一平面上;肽单位的特点:肽单位的特点:-螺旋结构螺旋结构-折叠折叠结构结构 -折角折角蛋白质二级结构构象的种类:蛋白质二级结构构象的种类:角蛋白中的角蛋白中的-螺旋和二硫键
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