生物化学-蛋白质.ppt
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1、第三章第三章 蛋白质(氨基酸)蛋白质(氨基酸)l第一节第一节 蛋白质通论蛋白质通论l第二节第二节 蛋白质组成蛋白质组成l第四章第四章 蛋白质结构蛋白质结构l第四节第四节 几种重要的蛋白质类型几种重要的蛋白质类型 l第五章第五章 蛋白质的性质蛋白质的性质l第六节第六节 蛋白质的结构和功能的关系蛋白质的结构和功能的关系蛋白质化学蛋白质化学蛋白质存在于所有蛋白质存在于所有的生物细胞中,是的生物细胞中,是构成生物体最基本构成生物体最基本的结构物质和功能的结构物质和功能物质。物质。蛋白质是生命活动蛋白质是生命活动的物质基础,它参的物质基础,它参与了几乎所有的生与了几乎所有的生命活动过程命活动过程。第一第
2、一节 蛋白蛋白质通通论 一、蛋白质化学研究史一、蛋白质化学研究史一、蛋白质化学研究史一、蛋白质化学研究史18381838年年 MullerMuller研究了血清、蛋清、蚕丝等物质的元素组成后研究了血清、蛋清、蚕丝等物质的元素组成后,发现它发现它 们均可以用们均可以用C C4040H H6262N N1010O O1212 来表示来表示,命名为命名为Protein(Protein(意为意为to to take the first place),take the first place),并发展成并发展成 基团基团 学说学说 1919世纪末世纪末 从蛋白质水解产物分离得到了从蛋白质水解产物分离得到
3、了1313种氨基酸种氨基酸,基团学说消声匿迹基团学说消声匿迹19021902年年 FischerFischer同同HofmeisteHofmeiste时提出肽键理论时提出肽键理论19241924年年 Svedberg Svedberg 发明超离心机发明超离心机19301930年年代代 BergmannBergmann合成出只含合成出只含L L型氨基酸的多肽型氨基酸的多肽19501950年年 PaulingPauling提出蛋白质的二级结构的基本单位:提出蛋白质的二级结构的基本单位:-螺旋和螺旋和-折叠折叠19531953年年 SangerSanger确定了牛胰岛素的一级结构确定了牛胰岛素的一级
4、结构19581958年年 Perutz&KendrewPerutz&Kendrew用用X X光衍射法确定了肌红蛋白的立体结构光衍射法确定了肌红蛋白的立体结构19611961年年 AnfinsenAnfinsen证明蛋白质的一级结构决定其立体结构证明蛋白质的一级结构决定其立体结构19801980年年代代 蛋白质工程的兴起蛋白质工程的兴起19971997年年 蛋白组研究的概念蛋白组研究的概念19991999年年 蛋白质芯片技术出现蛋白质芯片技术出现二、二、蛋白质的分类蛋白质的分类l1 1、依据蛋白质的外形分类、依据蛋白质的外形分类l按照蛋白质的外形可分为球状蛋白质和纤维状蛋白质。l球状蛋白质:球状
5、蛋白质:globular proteinglobular protein外形接近球形或椭圆形,溶解性较好,能形成结晶,大多数蛋白质属于这一类。l纤维状蛋白质纤维状蛋白质:fibrous proteinfibrous protein分子类似纤维或细棒。它又可分为可溶性纤维可溶性纤维状蛋白质和不溶性纤维状蛋白质状蛋白质和不溶性纤维状蛋白质。2 2、依据蛋白质的组成分类、依据蛋白质的组成分类l按照蛋白质的组成,可以分为按照蛋白质的组成,可以分为:l简单蛋白简单蛋白(simple protein)(simple protein)l结合蛋白结合蛋白(conjugated protein)(conjuga
6、ted protein)(1 1)、)、简单蛋白简单蛋白l 又称为单纯蛋白质;又称为单纯蛋白质;这类蛋白质只含由这类蛋白质只含由-氨基酸组氨基酸组成的肽链成的肽链,不含其它成分。,不含其它成分。lA A、清蛋白和球蛋白:、清蛋白和球蛋白:albumin and globulin广泛存在于广泛存在于动物组织中。清蛋白易溶于水,球蛋白微溶于水,易动物组织中。清蛋白易溶于水,球蛋白微溶于水,易溶于稀酸中。溶于稀酸中。lB B、谷蛋白、谷蛋白(glutelin)和醇溶谷蛋白和醇溶谷蛋白(prolamin):植物:植物蛋白,不溶于水,易溶于稀酸、稀碱中,后者可溶于蛋白,不溶于水,易溶于稀酸、稀碱中,后者
7、可溶于70708080乙醇中。乙醇中。lC C、精蛋白和组蛋白:碱性蛋白质,存在与细胞核中。、精蛋白和组蛋白:碱性蛋白质,存在与细胞核中。lD D、硬蛋白:存在于各种软骨、腱、毛、发、丝等组织、硬蛋白:存在于各种软骨、腱、毛、发、丝等组织中,分为角蛋白、胶原蛋白、弹性蛋白和丝蛋白。中,分为角蛋白、胶原蛋白、弹性蛋白和丝蛋白。(2 2)、)、结合蛋白结合蛋白l由简单蛋白与其它非蛋白成分结合而成,由简单蛋白与其它非蛋白成分结合而成,lA A、色蛋白、色蛋白:由简单蛋白与色素物质结合而成:由简单蛋白与色素物质结合而成。如血红蛋白、叶绿蛋白和细胞色素等。lB B、糖蛋白、糖蛋白:由简单蛋白与糖类物质组
8、成:由简单蛋白与糖类物质组成。如细胞膜中的糖蛋白等。lC C、脂蛋白、脂蛋白:由简单蛋白与脂类结合而成:由简单蛋白与脂类结合而成。如血清-,-脂蛋白等。lD D、核蛋白、核蛋白:由简单蛋白与核酸结合而成。:由简单蛋白与核酸结合而成。如细胞核中的核糖核蛋白等。lE、金属蛋白、金属蛋白由蛋白质和金属组成,如:铁硫蛋白、细胞色素等。lF、磷蛋白、磷蛋白由磷酸和蛋白质组成。如:胃蛋白酶、酪蛋白等。(2 2)、)、结合蛋白结合蛋白 三、三、蛋白质的功能蛋白质的功能1、催化功能、催化功能 酶酶 (淀粉酶)(淀粉酶)2、调节功能、调节功能 激素(胰岛素)激素(胰岛素)3、运动功能、运动功能 肌球蛋白肌球蛋白
9、4、运输功能、运输功能 血红蛋白血红蛋白5、防御功能、防御功能 免疫球蛋白免疫球蛋白6、营养功能、营养功能 酪蛋白酪蛋白7、结构成分、结构成分 胶原蛋白胶原蛋白 8、支架作用、支架作用 微管蛋白微管蛋白9、异常功能、异常功能 甜蛋白(应乐果蛋白)甜蛋白(应乐果蛋白)返回第二节、蛋白质的组成一、元素组成一、元素组成l大量元素大量元素lC 5055%lH 6-8%lO 20-23%lN 15-18%lS 0-4%l微量元素lFeCuMnlZnCoMglI二、二、蛋白质的构蛋白质的构件单位件单位-氨基酸氨基酸l 除除甘甘氨氨酸酸和和脯脯氨氨酸酸外外,其其他他均均具具有有如如下下结结构构通式。通式。各
10、种氨基酸的区别在于侧链各种氨基酸的区别在于侧链R R基的不同。基的不同。2020种基种基本氨基酸按本氨基酸按R R的极性可分为非极性氨基酸、极性的极性可分为非极性氨基酸、极性性氨基酸、酸性氨基酸和碱性氨基酸。性氨基酸、酸性氨基酸和碱性氨基酸。-氨基酸氨基酸可变部可变部分分不变部不变部分分(一)、(一)、(一)、(一)、氨基酸的结构氨基酸的结构甘氨酸甘氨酸 Glycine 脂肪族氨基酸脂肪族氨基酸氨基酸的结构氨基酸的结构脂肪族氨基酸脂肪族氨基酸甘氨酸甘氨酸 Glycine 丙氨酸丙氨酸 Alanine氨基酸的结构氨基酸的结构甘氨酸甘氨酸 Glycine 丙氨酸丙氨酸 Alanine缬氨酸缬氨酸
11、Valine脂肪族氨基酸脂肪族氨基酸氨基酸的结构氨基酸的结构甘氨酸甘氨酸 Glycine 丙氨酸丙氨酸 Alanine缬氨酸缬氨酸 Valine亮氨酸亮氨酸 Leucine脂肪族氨基酸脂肪族氨基酸氨基酸的结构氨基酸的结构甘氨酸甘氨酸 Glycine 丙氨酸丙氨酸 Alanine缬氨酸缬氨酸 Valine亮氨酸亮氨酸 Leucine异亮氨酸异亮氨酸 Ileucine脂肪族氨基酸脂肪族氨基酸氨基酸的结构氨基酸的结构甘氨酸甘氨酸 Glycine 丙氨酸丙氨酸 Alanine缬氨酸缬氨酸 Valine亮氨酸亮氨酸 Leucine异亮氨酸异亮氨酸 Ileucine脯氨酸脯氨酸 Proline亚氨基酸亚氨
12、基酸氨基酸的结构氨基酸的结构甘氨酸甘氨酸 Glycine 丙氨酸丙氨酸 Alanine缬氨酸缬氨酸 Valine亮氨酸亮氨酸 Leucine异亮氨酸异亮氨酸 Ileucine脯氨酸脯氨酸 Proline甲硫氨酸甲硫氨酸 Methionine含硫氨基酸含硫氨基酸氨基酸的结构氨基酸的结构甘氨酸甘氨酸 Glycine 丙氨酸丙氨酸 Alanine缬氨酸缬氨酸 Valine亮氨酸亮氨酸 Leucine异亮氨酸异亮氨酸 Ileucine脯氨酸脯氨酸 Proline甲硫氨酸甲硫氨酸 Methionine半胱氨酸半胱氨酸 Cysteine 含硫氨基酸含硫氨基酸氨基酸的结氨基酸的结芳香族氨基酸芳香族氨基酸苯丙
13、氨酸苯丙氨酸Phenylalanine氨基酸的结构氨基酸的结构芳香族氨基酸芳香族氨基酸苯丙氨酸苯丙氨酸Phenylalanine酪氨酸酪氨酸Tyrosine氨基酸的结构氨基酸的结构芳香族氨基酸芳香族氨基酸苯丙氨酸苯丙氨酸Phenylalanine酪氨酸酪氨酸Tyrosine色氨酸色氨酸 Trytophan氨基酸的结构氨基酸的结构碱性氨基酸碱性氨基酸精氨酸精氨酸 Arginine氨基酸的结构氨基酸的结构碱性氨基酸碱性氨基酸精氨酸精氨酸 Arginine赖氨酸赖氨酸 Lysine氨基酸的结构氨基酸的结构碱性氨基酸碱性氨基酸精氨酸精氨酸 Arginine赖氨酸赖氨酸 Lysine组氨酸组氨酸 His
14、tidine氨基酸的结构氨基酸的结构天冬氨酸天冬氨酸 Aspartate 酸性氨基酸酸性氨基酸氨基酸的结构氨基酸的结构天冬氨酸天冬氨酸 Aspartate 谷氨酸谷氨酸 Glutamate酸性氨基酸酸性氨基酸氨基酸的结构氨基酸的结构丝氨酸丝氨酸 Serine 含羟基氨基酸含羟基氨基酸氨基酸的结构氨基酸的结构丝氨酸丝氨酸 Serine 苏氨酸苏氨酸 Threonine含羟基氨基酸含羟基氨基酸氨基酸的结构氨基酸的结构天冬酰胺天冬酰胺 Asparagine含酰胺氨基酸含酰胺氨基酸氨基酸的结构氨基酸的结构天冬酰胺天冬酰胺 Asparagine谷酰胺谷酰胺 Glutamine含酰胺氨基酸含酰胺氨基酸(二
15、)、(二)、几种重要的不常见氨基酸几种重要的不常见氨基酸l在在少少数数蛋蛋白白质质中中分分离离出出一一些些不不常常见见的的氨氨基基酸酸,通通常常称称为不常见蛋白质氨基酸。为不常见蛋白质氨基酸。l这些氨基酸都是由相应的基本氨基酸衍生而来的。这些氨基酸都是由相应的基本氨基酸衍生而来的。l其其中中重重要要的的有有4-4-羟羟基基脯脯氨氨酸酸、5-5-羟羟基基赖赖氨氨酸酸、N-N-甲甲基基赖赖氨氨酸酸、和和3,5-3,5-二二碘碘酪酪氨氨酸酸等等。这这些些不不常常见见蛋蛋白白质质氨氨基酸的结构如下。基酸的结构如下。(三三)非非蛋蛋白白天天然然氨氨基基酸酸l高丝氨酸l高半胱氨酸l瓜氨酸l鸟氨酸(五)(五
16、)氨基酸的物理性质氨基酸的物理性质 1、一般物理性质一般物理性质l 无色晶体,熔点较高(无色晶体,熔点较高(200200一一300300),水中溶解度各不同,取决于侧链。,水中溶解度各不同,取决于侧链。l 在紫外有特征吸收的仅三个芳香族的在紫外有特征吸收的仅三个芳香族的氨基酸氨基酸TrpTrp、TyrTyr、Phe,Phe,利用这一特点,利用这一特点,可以通过测定可以通过测定280nm280nm处的紫外吸收值的方处的紫外吸收值的方法对蛋白溶液进行定量。法对蛋白溶液进行定量。TrpTrp,TyrTyr和和PhePhe的紫外吸收的紫外吸收2、氨基酸的旋光性、氨基酸的旋光性l除甘氨酸外,氨基酸均含有
17、一个手性除甘氨酸外,氨基酸均含有一个手性-碳原子,因此都具有旋光性碳原子,因此都具有旋光性。l比旋光度是氨基酸的重要物理常数之比旋光度是氨基酸的重要物理常数之一,是鉴别各种氨基酸的重要依据一,是鉴别各种氨基酸的重要依据 3 3、氨基酸的构型、氨基酸的构型L L型氨基酸型氨基酸 与与 D D型氨基酸型氨基酸L-amino acidD-amino acidL和D型氨基酸4、两性解离及等电点、两性解离及等电点(1 1)氨基酸的离解性质氨基酸的离解性质 氨基酸在结晶形态或在水溶液中,并不氨基酸在结晶形态或在水溶液中,并不是以游离的羧基或氨基形式存在,而是是以游离的羧基或氨基形式存在,而是离解成两性离子
18、。在两性离子中,氨基离解成两性离子。在两性离子中,氨基是以质子化是以质子化(-NH(-NH3 3+)形式存在,羧基是以形式存在,羧基是以离解状态离解状态(-COO(-COO-)存在存在l在在不不同同的的pHpH条条件件下下,两两性性离离子子的的状状态态也也随之发生变化。随之发生变化。PH1710净电荷+10-1正离子两性离子负离子等电点PI(2)、)、氨基酸的等电点氨基酸的等电点l 当当溶溶液液浓浓度度为为某某一一pHpH值值时时,氨氨基基酸酸分分子子中中所所含含的的-NHNH3 3+和和-COO-COO-数数目目正正好好相相等等,净净电电荷荷为为0 0。这这一一pHpH值值即即为为氨氨基基酸
19、酸的的等等电电点点,简简称称p pI I。在在等等电电点点时时,氨氨基基酸酸既既不不向正极也不向负极移动,即氨基酸处于两性离子状态。向正极也不向负极移动,即氨基酸处于两性离子状态。l 等电点的计算等电点的计算 l 侧侧链链不不含含离离解解基基团团的的中中性性氨氨基基酸酸,其其等等电电点点是是它它的的p pK K1 1和和p pK K2 2的的算算术术平平均均值值:p pI I =(p(pK K1 1 +p pK K2 2)/2)/2 l 同同样样,对对于于侧侧链链含含有有可可解解离离基基团团的的氨氨基基酸酸,其其p pI I值也决定于两性离子两边的值也决定于两性离子两边的p pK K值的算术平
20、均值。值的算术平均值。l 酸性氨基酸:酸性氨基酸:p pI I=(p=(pK K1 1+p+pK KR-COOR-COO-)/2)/2 l 硷性氨基酸:硷性氨基酸:p pI I=(p=(pK K2 2+p+pK KR-NH2 R-NH2)/2)/2(六)氨基酸的化学性质氨基酸的化学性质1-氨基参与的反应氨基参与的反应(1 1 1 1)与与与与甲甲甲甲醛醛醛醛发发发发生生生生羟羟羟羟甲甲甲甲基基基基化化化化反反反反应应应应用途用途:可以用来直接测定氨基酸的浓度。可以用来直接测定氨基酸的浓度。(六)氨基酸的化学性质氨基酸的化学性质1-氨基参与的反应氨基参与的反应(2 2)与与与与亚亚亚亚硝硝硝硝酸
21、酸酸酸反反反反应应应应用途用途:范斯来克法定量测定氨基酸的基本反应范斯来克法定量测定氨基酸的基本反应。(六)氨基酸的化学性质氨基酸的化学性质1-氨基参与的反应氨基参与的反应(3)酰化反应用途用途:用于保护氨基以及肽链的氨基端测定等用于保护氨基以及肽链的氨基端测定等。(六)、氨基酸的化学性质氨基酸的化学性质1-氨基参与的反应氨基参与的反应(4 4)烃烃基基化化反反应应用途用途:是鉴定多肽是鉴定多肽N-N-端氨基酸的重要方法端氨基酸的重要方法。(六)、氨基酸的化学性质氨基酸的化学性质1-氨基参与的反应氨基参与的反应(5 5)生生成成西西佛佛碱碱的的反反应应用途用途:是多种酶促反应的中间过程。(六)
22、、氨基酸的化学性质氨基酸的化学性质1-氨基参与的反应氨基参与的反应(6 6)脱脱氨氨基基和和转转氨氨基基反反应应用途用途:酶催化的反应。酶催化的反应。(六)、氨基酸的化学性质氨基酸的化学性质 氨基酸与碱作用生成相应的盐。氨基酸的碱金属盐能溶于水,而重金属盐则不溶于水。2-羧基参与的反应(1 1)成成盐盐反反应应用途用途:识别溶液食品等里有无重金属的存在(六)、氨基酸的化学性质氨基酸的化学性质1 11-氨基参与的反应氨基参与的反应(2 2)形形成成酯酯的的反反应应用途用途:是合成氨基酸酰基衍生物的重要中间体是合成氨基酸酰基衍生物的重要中间体。2-羧基参与的反应(六)、氨基酸的化学性质氨基酸的化学
23、性质1 1(3 3)形形成成酰酰卤卤的的反反应应用途用途:这是使氨基酸羧基活化的一个重要反应这是使氨基酸羧基活化的一个重要反应。2-羧基参与的反应(六)、氨基酸的化学性质氨基酸的化学性质(4 4)叠叠叠叠氮氮氮氮化化化化反反反反应应应应用途用途:常作为多肽合成活性中间体。常作为多肽合成活性中间体。2-羧基参与的反应(六)、氨基酸的化学性质氨基酸的化学性质1 1(5 5)脱脱脱脱羧羧羧羧反反反反应应应应用途用途:酶催化的反应酶催化的反应。2-羧基参与的反应(六)、氨基酸的化学性质氨基酸的化学性质1 1(1 1)与与茚茚三三酮酮反反应应用途用途:常用于氨基酸的定性或定量分析。常用于氨基酸的定性或定
24、量分析。3-氨基和羧基共同参与的反应茚三茚三酮酮水合茚三酮水合茚三酮(六)、氨基酸的化学性质氨基酸的化学性质1 1(2 2 2 2)成成成成肽肽肽肽反反反反应应应应用途用途:是多肽和蛋白质生物合成的基本反应。是多肽和蛋白质生物合成的基本反应。3-氨基和羧基共同参与的反应4侧侧链链基基团团的的化化学学性性质质(1)(1)巯基(巯基(-SH-SH)的性质的性质1作用:作用:这些反应可用于巯基的保护这些反应可用于巯基的保护。4侧侧链链基基团团的的化化学学性性质质(1)(1)巯基(巯基(-SH-SH)的性质的性质作用:作用:与金属离子的螯合性质可用于体内解毒与金属离子的螯合性质可用于体内解毒。4侧侧链
25、链基基团团的的化化学学性性质质(1)(1)巯基(巯基(-SH-SH)的性质)的性质作用:作用:可用于可用于比色法定量测定半胱氨酸的含量。硝基苯甲酸二硫化合物硝基苯甲酸二硫化合物(DTNB(DTNB)4侧侧链链基基团团的的化化学学性性质质(1)(1)巯基(巯基(-SH-SH)的性质)的性质作用:作用:氧化还原反应可使蛋白质分子中二硫键形成或端裂氧化还原反应可使蛋白质分子中二硫键形成或端裂。胱氨酸胱氨酸4侧侧链链基基团团的的化化学学性性质质(2)羟基的性质羟基的性质1作用:可用于修饰蛋白质。作用:可用于修饰蛋白质。二异丙基氟磷酸二异丙基氟磷酸酯酯4侧侧链链基基团团的的化化学学性性质质(3)咪唑基的
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- 生物化学 蛋白质
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