动物遗传学-数量遗传学基础.ppt
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1、第七章第七章 数量遗传学基础数量遗传学基础 第一节第一节 数量性状的遗传特征数量性状的遗传特征动物的遗传性状,可分为三大类:质量性状动物的遗传性状,可分为三大类:质量性状(Qualitativetrait)、数量性状(数量性状(Quantitativetrait)和阈性状()和阈性状(Thresholdtrait)。)。质量性状质量性状:是指那些在类型间有明显界限,变异呈不连续的:是指那些在类型间有明显界限,变异呈不连续的性状。例如,牛的无角与有角,鸡的芦花毛色与非芦花毛色,性状。例如,牛的无角与有角,鸡的芦花毛色与非芦花毛色,等等。等等。这些性状由一对或少数几对基因控制,它不易受环境这些性状
2、由一对或少数几对基因控制,它不易受环境条件的影响,相对性状间大多有显隐性的区别,它的遗传表条件的影响,相对性状间大多有显隐性的区别,它的遗传表现完全服从于三大遗传定律。现完全服从于三大遗传定律。1 1 遗传性状的分类遗传性状的分类数量性状:是指那些在类型间没有明显界限,具有连续性数量性状:是指那些在类型间没有明显界限,具有连续性变异的性状,如产奶量、产卵量、产毛量、日增重、饲料变异的性状,如产奶量、产卵量、产毛量、日增重、饲料利用率等。利用率等。阈性状:是指由微效多基因控制的,呈现不连续变异的性阈性状:是指由微效多基因控制的,呈现不连续变异的性状。这类性状具有潜在的连续分布遗传基础,但其表型特
3、状。这类性状具有潜在的连续分布遗传基础,但其表型特征却能够明显的区分,例如,产子数,成活或死亡,精子征却能够明显的区分,例如,产子数,成活或死亡,精子形态正常或畸形,这类性状的基因效应是累积的,只有达形态正常或畸形,这类性状的基因效应是累积的,只有达到阈值水平才能表现出来。到阈值水平才能表现出来。然然而而,将将生生物物性性状状分分成成这这三三类类也也不不是是绝绝对对的的,“量量变变是是质质变变的的基基础础”,一一些些表表面面上上看看起起来来是是质质量量性性状状,如如黑黑毛毛色色,但但如如果果分分析析其其中中的的色色素素含含量量,在在个个体体间间也也表表现现出出量量的的变变异异;有有的的度度量量
4、性性状状,如如牛牛的的双双肌肌,有有时时可可以以区区分分为为正正常常和和双双肌肌两两类类,可可以以视视为为质质量量性性状状;有有的的性性状状可可以以计计数数,如如母母猪猪的的个个体体产产仔仔数数是是整整数数,表现为不连续变异,而几胎的平均产仔数却表现为连续变异。表现为不连续变异,而几胎的平均产仔数却表现为连续变异。在孟德尔遗传规律被重新发现后的二十世纪初,在孟德尔遗传规律被重新发现后的二十世纪初,形成了以形成了以BatesonBateson和和DevriesDevries为首的为首的MendelMendel学派以及以学派以及以PearsonPearson和和WeldonWeldon为首的为首的
5、GaltonGalton学派。学派。2.2.数量性状数量性状 在遗传和进化问题上,在遗传和进化问题上,MendelMendel学派认为不连续性学派认为不连续性变异是重要因素,孟德尔原理可以普遍用于遗传变异变异是重要因素,孟德尔原理可以普遍用于遗传变异的研究,而连续性变异之所以不符合这些规律是因为的研究,而连续性变异之所以不符合这些规律是因为它是不能遗传的;而它是不能遗传的;而GaltonGalton学派则认为连续性变异是学派则认为连续性变异是可遗传的,是进化的重要因素,在研究上必须采用统可遗传的,是进化的重要因素,在研究上必须采用统计学的方法,而计学的方法,而MendelMendel法则对于连
6、续性变异不适用。法则对于连续性变异不适用。这场争论直到这场争论直到1909年才结束。该年约翰逊年才结束。该年约翰逊(JohannsenWL)发表了发表了“纯系学说纯系学说(Purelinetheory)”,尼尔逊,尼尔逊.埃埃尔尔(Nilsson-EhleH)提出提出“多基因假说多基因假说(polygenehypothesisormultiple-factorhypothesis)”;这两个理;这两个理论的建立,标志着数量遗传学的诞生。论的建立,标志着数量遗传学的诞生。Johannsen W.L.Johannsen W.L.从十九个菜豆从十九个菜豆(Phaseolus Vulgaris)(Ph
7、aseolus Vulgaris)为为材料,研究呈连续性变异的种子重量这性状的遗传。材料,研究呈连续性变异的种子重量这性状的遗传。1 1 经过经过1010代的自交繁殖,这代的自交繁殖,这1919个纯系的平均种子重量为个纯系的平均种子重量为35.0-35.0-,各纯系平均种子重量能稳定遗传,不同纯系间的差,各纯系平均种子重量能稳定遗传,不同纯系间的差 异是由基因不同造成的异是由基因不同造成的,在混杂的群体内选择是有效的;在混杂的群体内选择是有效的;2 2 同一个纯系,甚至是同一个植株所结种子,重量差异更大,变同一个纯系,甚至是同一个植株所结种子,重量差异更大,变 化范围化范围20-70mg20-
8、70mg,但这种差异在相继世代是不能遗传的,纯系,但这种差异在相继世代是不能遗传的,纯系 内的差异是由于环境条件造成的,在纯系内选择是无效的。内的差异是由于环境条件造成的,在纯系内选择是无效的。例如,在他的第例如,在他的第1515个纯系中选出重量为个纯系中选出重量为20mg20mg和和60mg60mg的种子种植,的种子种植,其后代平均种子重量分别为其后代平均种子重量分别为46.9mg46.9mg和和45.6mg45.6mg,均接近该纯系群体,均接近该纯系群体的平均种子重量的平均种子重量45.0mg45.0mg。JohannsenW.L.的的“纯系学说纯系学说”对遗传学的贡献为如下对遗传学的贡献
9、为如下三点:三点:确认了数量性状是可以真实遗传的;确认了数量性状是可以真实遗传的;分清了可遗传的变异和不可遗传的变异。分清了可遗传的变异和不可遗传的变异。分清了基因型分清了基因型(genotype)和表现型和表现型(phenotype)的概的概念。基因型并不等于表现型,而是念。基因型并不等于表现型,而是P=G+E。他发现数量性状同时受遗传和非遗传因素的控制,他发现数量性状同时受遗传和非遗传因素的控制,基基因型的不连续的效应可以为环境效应所修饰而在表型因型的不连续的效应可以为环境效应所修饰而在表型上表现为连续变异。上表现为连续变异。P:红粒红粒白粒白粒红粒红粒白粒白粒红粒红粒白粒白粒F1:红粒红
10、粒粉红粒粉红粒粉红粒粉红粒F2:红粒:白粒红粒:白粒红粒:白粒红粒:白粒红粒:白粒红粒:白粒3/4:1/415/16:1/1663/64:1/64瑞典遗传学家尼尔逊瑞典遗传学家尼尔逊.埃尔埃尔(Nilsson-Ehle H.)(Nilsson-Ehle H.)对小麦和燕麦的籽对小麦和燕麦的籽粒颜色的遗传进行了研究,提出粒颜色的遗传进行了研究,提出“多基因假说多基因假说”。他发现在若干。他发现在若干个红色籽粒与白色籽粒的杂交组合中出现了如下几种情况:个红色籽粒与白色籽粒的杂交组合中出现了如下几种情况:红粒:中等红粒红粒:中等红粒=1/4:2/4深红粒:次深红粒:中等红粒:淡红粒深红粒:次深红粒:
11、中等红粒:淡红粒=1/16:4/16:6/16:4/16极深红粒极深红粒:暗红粒暗红粒:深红粒深红粒:次深红粒次深红粒:中等红粒中等红粒:淡红粒淡红粒=1/64:6/64:15/64:20/64:15/64:6/64于是他得出结论:于是他得出结论:在小麦和燕麦中,存在着在小麦和燕麦中,存在着三种种类不同但作用相似的因子三种种类不同但作用相似的因子与与种皮颜色有关,三种因子中的任何一种在单独分离时都可以产生种皮颜色有关,三种因子中的任何一种在单独分离时都可以产生3 3:1 1的分离比率,而三种因子同时分离时就产生的分离比率,而三种因子同时分离时就产生6363:1 1的分离比的分离比率。三个因子是
12、相互独立的,服从率。三个因子是相互独立的,服从MendelMendel遗传法则。遗传法则。如果用如果用R R表示红粒有效基因,用表示红粒有效基因,用r r表示其等位基因(无色或白色),表示其等位基因(无色或白色),当某性状是由一对等位基因决定时,当某性状是由一对等位基因决定时,F F1 1产生的雄配子中带产生的雄配子中带R R和和r r基基因的各占因的各占50%50%,即,即(1/2R+1/2 r)(1/2R+1/2 r);F F1 1产生的雌配子中带产生的雌配子中带R R和和r r基因基因的也是各占的也是各占50%50%,即,即(1/2R+1/2r)(1/2R+1/2r)。于是,当雌雄配子受
13、精结合。于是,当雌雄配子受精结合后,得后,得F F2 2的表现型频率为的表现型频率为 (1/2R+1/2r1/2R+1/2r)2 2,因此,当某性状是由因此,当某性状是由n n对独立基因决定时,则对独立基因决定时,则F F2 2的表现型频率为:的表现型频率为:(1/2R+1/2r)2n当当n=2n=2时,代入上式并展开即得:时,代入上式并展开即得:(1/2 R+1/2 r1/2 R+1/2 r)2222=1/16RRRR+4/16 RRRr+6/16RRrr+4/16Rrrr+1/16rrrr=1/16RRRR+4/16 RRRr+6/16RRrr+4/16Rrrr+1/16rrrr 或表示为
14、或表示为 (1/2R+1/2r1/2R+1/2r)2222=1/16=1/16(4R4R)+4/16+4/16(3R3R)+6/16+6/16(2R2R)+4/16+4/16(1R1R)+1/16+1/16(0R0R)同理,当同理,当n=3时,代入上式并展开即得:时,代入上式并展开即得:(1/2R+1/2r)32=1/64(6R)+6/64(5R)+15/64(4R)+20/64(3R)+15/64(2R)+6/64(1R)+1/64(0R)红色的深浅程度的差异与所具有的决定红色的因子数目有关,红色的深浅程度的差异与所具有的决定红色的因子数目有关,而与因子的种类无关。而与因子的种类无关。也即决
15、定红色的因子的效应是迭加的,也即决定红色的因子的效应是迭加的,每个因子的效应较小,相互间无显隐性关系。每个因子的效应较小,相互间无显隐性关系。多基因假说的要点是:多基因假说的要点是:1.数量性状是许多微效多基因(数量性状是许多微效多基因(Minoreffectpolygenes)的联)的联合效应造成的合效应造成的,它们的效应相等可累加,所以微效基因又称加性它们的效应相等可累加,所以微效基因又称加性基因基因(Additivegene)。2.微效基因之间大多数缺乏显隐性(微效基因之间大多数缺乏显隐性(Dominant-recessiveeffect)。虽然可用大小写字母表示等位基因,但大写基因并)
16、。虽然可用大小写字母表示等位基因,但大写基因并不掩盖小写基因的表现,大写只代表表示增效,小写表示减效。不掩盖小写基因的表现,大写只代表表示增效,小写表示减效。3.控制数量性状的微效基因(Minor effect polygenes)与控制质量性状的宏效基因(Major gene)都处于细胞核的染色体上,多基因的遗传行为同样符合遗传基本规律,具有复制、分离和重组、连锁和交换的特性。4.由于微效基因的效应微小,多基因(Polygenes)并不能予以个别辨认,只能按性状的表现在一起研究,对所涉及的基因对数做粗略的估计。但是屠代(Thoday)对果蝇刚毛数的研究证明,有时多基因也可予以个别辨认,识别数
17、量性状的主效基因(Major effect genes)。2.1 2.1 数量性状的一般特征数量性状的一般特征数量性状的一个重要特征是其度量值表现为一个正态分布,这数量性状的一个重要特征是其度量值表现为一个正态分布,这就是说属于中间程度的个体较多,而趋向两极的个体愈来愈少就是说属于中间程度的个体较多,而趋向两极的个体愈来愈少 ,很难分划成少数几个界限明显的类型。,很难分划成少数几个界限明显的类型。3 3 数量性状表型值的剖分数量性状表型值的剖分由于由于D D和和I I带有一定的随机性,一般将它们与环境偏带有一定的随机性,一般将它们与环境偏差合并,统称为剩余效应。差合并,统称为剩余效应。第二节第
18、二节 通径理论通径理论自然界任何两个或多个事物之间的关系不外乎两种情况:一自然界任何两个或多个事物之间的关系不外乎两种情况:一种是平行关系;另一种是因果关系。种是平行关系;另一种是因果关系。所谓平行关系是指事物间不分因果,只是互为因果或两者具所谓平行关系是指事物间不分因果,只是互为因果或两者具有共同原因以致相互关联。有共同原因以致相互关联。例如:猪的瘦肉率部分决定于臀肉率,部分决定于腰肉率。例如:猪的瘦肉率部分决定于臀肉率,部分决定于腰肉率。臀肉率与腰肉率有一定关系,但在它们之间很难确定哪个是臀肉率与腰肉率有一定关系,但在它们之间很难确定哪个是“因因”,哪个是,哪个是“果果”。1.1.概念概念
19、命题命题1当一个结果的两原因互不相关时,两原因对此结果的各当一个结果的两原因互不相关时,两原因对此结果的各决定系数之和等于决定系数之和等于1,各原因到此结果的通径系数等于该原因,各原因到此结果的通径系数等于该原因与此结果间的相关系数。与此结果间的相关系数。6 若X与Y相互独立,则命题命题2当一个结果的两原因间有相关时,各原因对结果的决定当一个结果的两原因间有相关时,各原因对结果的决定系数之和加上相关的原因共同对结果的决定系数等于系数之和加上相关的原因共同对结果的决定系数等于1;各原因;各原因与结果的相关系数等于原因到结果的通径系数加上另一原因到与结果的相关系数等于原因到结果的通径系数加上另一原
20、因到结果的通径系数与原因间相关系数的乘积。结果的通径系数与原因间相关系数的乘积。8 D(X+Y)=D(X)+D(Y)+2Cov(X,Y)命题命题3两个原因共同对结果的决定系数等于两原因的相关系数两个原因共同对结果的决定系数等于两原因的相关系数与各原因到结果的通径与各原因到结果的通径系数的乘积的两倍。系数的乘积的两倍。命题命题4当结果的直接原因间无相关,间接原因间也无相关时,当结果的直接原因间无相关,间接原因间也无相关时,间接原因到结果的通径系数等于该间接原因到结果的通径链的间接原因到结果的通径系数等于该间接原因到结果的通径链的所有组成的全部系数之乘积;通过一个直接原因,而作用于结所有组成的全部
21、系数之乘积;通过一个直接原因,而作用于结果的全部间接原因,它们对结果的决定系数之和等于该直接原果的全部间接原因,它们对结果的决定系数之和等于该直接原因对结果的决定系数;间接原因到结果的相关系数就等于通径因对结果的决定系数;间接原因到结果的相关系数就等于通径系数。系数。命题命题5(1)两个结果具有一个共同原因,每个结果的诸原因间两个结果具有一个共同原因,每个结果的诸原因间无相关时,该两结果间的相关系数就等于此共同原因分别到两无相关时,该两结果间的相关系数就等于此共同原因分别到两结果的通径系数之乘积。结果的通径系数之乘积。(2)具有两个以上的共同原因时,两具有两个以上的共同原因时,两结果的相关系数
22、就等于各个共同原因分别到两结果的通径系数结果的相关系数就等于各个共同原因分别到两结果的通径系数的乘积之和。的乘积之和。命题命题6两个结果的原因间有相关时,两结果间相关系数等于相两个结果的原因间有相关时,两结果间相关系数等于相关的原因分别到此两结果的通径系数和原因间相关系数之乘积。关的原因分别到此两结果的通径系数和原因间相关系数之乘积。命题命题7任何两个变数间的相关系数等于连接它们的所有通径链的任何两个变数间的相关系数等于连接它们的所有通径链的系数之和,而各通径链的系数就等于组成该通径链的全部通径和系数之和,而各通径链的系数就等于组成该通径链的全部通径和相关线的系数之乘积。相关线的系数之乘积。命
23、题命题8从每个结果出发又回到本身的所有通径链的系数之和从每个结果出发又回到本身的所有通径链的系数之和等于等于1。通径链的追溯原则是:通径链的追溯原则是:通径系数运算的关键是正确找出变量间的全部通径链。通径系数运算的关键是正确找出变量间的全部通径链。1注意通径方向,只能注意通径方向,只能“先退后进先退后进”,不能,不能“先进后退先进后退”,并且,并且可以连续后退或连续前进。可以连续后退或连续前进。2在一条通径链内只能改变一次方向。在一条通径链内只能改变一次方向。第七章第七章 数量遗传学基础数量遗传学基础(二二)遗遗传传力力、遗遗传传相相关关和和重重复复力力是是定定量量描描述述数数量量性性状状遗遗
24、传传规规律律的的三三个个最最基基本本且且重重要要的的遗遗传传参参数数(geneticparameter),通通常常称称作作三三大大遗遗传传参参数数。无无论论在在估估计计个个体体育育种种值值,还还是是制制定定育育种种规划,三大遗传参数均起着重要的作用。规划,三大遗传参数均起着重要的作用。数量性状表型值是由个体的遗传和环境效应共同数量性状表型值是由个体的遗传和环境效应共同作用的结果,其中遗传效应中由于基因作用的不同可作用的结果,其中遗传效应中由于基因作用的不同可以产生以产生3 3种不同的效应,即基因的加性效应种不同的效应,即基因的加性效应(A)(A)、显性、显性效应效应(D)(D)和上位效应和上位
25、效应(I)(I)。虽然显性和上位效应也是基。虽然显性和上位效应也是基因作用的结果,但在遗传给下一代时,由于基因的分因作用的结果,但在遗传给下一代时,由于基因的分离和自由重组,它们是不能确实遗传给下一代的,在离和自由重组,它们是不能确实遗传给下一代的,在育种过程中不能被固定,难以实现育种改良的目的。育种过程中不能被固定,难以实现育种改良的目的。只有基因的加性效应部分才是能够确实遗传给下一代只有基因的加性效应部分才是能够确实遗传给下一代的的个体育种值个体育种值 将控制一个数量性状的所有基因座上基因将控制一个数量性状的所有基因座上基因的加性效应总和称为基因的加性效应值,它可的加性效应总和称为基因的加
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