生物反应工程生物工程反应.ppt
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1、生物工程反应姜梅第第3章章微生物反应动力学微生物反应动力学本章的重点本章的重点本章的重点本章的重点细胞反应过程计量学有关概念及计算;细胞反应过程计量学有关概念及计算;细胞反应过程计量学有关概念及计算;细胞反应过程计量学有关概念及计算;MonodMonod方程的意义及计算;方程的意义及计算;方程的意义及计算;方程的意义及计算;本章的难点:本章的难点:本章的难点:本章的难点:MonodMonod与与与与米氏方程相同点与不同点;米氏方程相同点与不同点;米氏方程相同点与不同点;米氏方程相同点与不同点;基质消耗动力学。基质消耗动力学。基质消耗动力学。基质消耗动力学。微生物培养的特点微生物培养的特点A.优
2、点优点:n微生物常能分泌或诱导分泌有用的生物化学物质,容易筛选出分泌型突变株,微生物的生长速率快,微生物的代谢产物的产率较高等。n微生物反应是生物化学反应,通常是在常温,常压下进行,并且同一设备可生产多种产物;n原料来源丰富;n易于生产复杂的高分子化合物和旋光性物质;n除产生反应产物外,菌体自身也可是产物,可能成为富含维生素,蛋白质和酶等的有用产物;n通过菌种改良,有可能使同一生产设备的生产能力大大提高。B.缺点缺点n底物不可能全部转化成目的产物,副副产产物物的的产产生生不不可可避避免免。这样,目的产物的提取与精制就很困难,这正是造成目前发酵行业下游操作落后的原因之一。n微生物反应是利用活的生
3、物体进行目的产物生产的反应,因此,产物的获得除受环境因素影响外,也受细胞内因素的影响,并且微生物菌体易发生遗传变异,因此,实际控制相当困难控制相当困难。n原料是农副产品,所以受价格变动影响大。n生产前的准备工作(开发新菌种,扩大培养等)量大,且花费高,相对化学反应器而言,反反应应器器效效率率低低。对于好氧反应,因为要通氧,故增加了费用,且氧的利用率不高。n具有较高的BOD值,需进行处理。细胞反应过程计量学细胞反应过程计量学含细胞的体系作为暗箱含细胞的体系作为暗箱3.1.1微生物反应过程的质量平衡n假设:A.物质平均分子式:CHCHX XO OY YN NZ ZB.基质:有机碳源:CHCHm m
4、O On n无机氮源:NHNH3 3C.产物:完全反应:COCO2 2、H H2 2O O不完全反应(厌氧或兼氧):CHCHU UO OV VN NW W(胞外)D.电子受体分子态氧(O O2 2)E:细胞的一碳反应摩尔质量定义为含有1mol碳原子的细胞质量。n n方程:方程:碳源+氧+氮源=菌体+有机化合物+CO2+H2OCHCHm mO On n+aO+aO2 2+bNH+bNH3 3=cCH=cCHXO OYN NZ+dCH+dCHUO OVN NW +eH2O+fCO2n n原则:原则:A.A.平均分子式:平均分子式:B.B.元素:元素:C C、N N、H H、O O平衡平衡C.C.呼
5、吸商呼吸商:原则原则D.还原度:(胞外产物的反应,质子-电子平衡)该组分中每1mol碳原子的有效电子数当量数。有效电子数:有效电子数:有效电子数:有效电子数:1mol碳源完全氧化时,所需氧的摩尔数的4倍,如:C C6 6O O1212H H6 6 的摩尔数的摩尔数64=2464=24(6mol O6mol O2 2)a.C=4,H=1,N=-3,O=-2,P=5,S=6O O2 2=-4b.NHb.NH3 3、H2O、CO2为为零零.CHCHm mO On n+aO+aO2 2+bNH+bNH3 3=cCH=cCHxO Oy yN Nz z+dCH+dCHU UO OV VN NW W+eH2
6、O+fCO2细胞X:rX=4+x-2y-3z基质S:rS=4+m-2n产物P:rP=4+u-2v-3w质量平衡:rS-4a=crX+drPa=2.394b=0.085c=0.564d=1.436e=2.6341例2推断分子式细胞反应过程的得率系数细胞反应过程的得率系数得得得得率率率率系系系系数数数数:对对对对碳碳碳碳源源源源等等等等物物物物质质质质生生生生成成成成细细细细胞胞胞胞或或或或其其其其他他他他产产产产物物物物的的的的潜潜潜潜力力力力进进进进行行行行定定定定量量量量评评评评价价价价。最最最最常常常常用用用用的的的的几几几几种种种种得得得得率率率率系系系系数数数数有有有有下述几种下述几种
7、下述几种下述几种:n细胞得率或生长得率细胞得率或生长得率YX/Sn对元素的细胞得率对元素的细胞得率YC、YX/On对能量的细胞得率对能量的细胞得率Y-ave、YKJ、YATP细胞得率或生长得率YX/SnYX/S(细胞/基质:g/g、g/mol)n微分细胞得率同一菌种,同一培养基,好氧培养的YX/S比厌氧培的大得多;同一菌株在基本、合成和复合培养基中培养所得YX/S的大小顺序为复合培养基、合成培养基和基本培养基。不同碳源培养基,YX/S不同几种微生物的菌体得率宏观得率与理论得率宏观得率与理论得率n当细胞生长的同时,还伴有其他反应如代谢产物的生成时,则所消耗的基质一部分用于细胞的 生 长,一 部
8、分 用 于 生 成 代 谢 产 物。S=SG(生长)+SR(产物)n宏观得率宏观得率n理论得率理论得率nY*X/SYX/S对元素的细胞得率对元素的细胞得率YC、YX/On nYC碳同化细胞的过程的转化效率。碳同化细胞的过程的转化效率。YC小于1,为XC、SC单位质量细胞和单位基质中所含的碳元素量n nYX/O例3求例题2中酵母细胞(CHNO)的YX/S和YX/O。解:由细胞得率定于及例解:由细胞得率定于及例2,有,有对能量的细胞得率对能量的细胞得率Y-ave、YKJ、YATPnY-ave:基质完全氧化失去:基质完全氧化失去1 mol有效电子时有效电子时的细胞得率。(的细胞得率。(g/g、g/m
9、ol)nYATP:消耗:消耗1 molATP所获的干菌体克数。所获的干菌体克数。(g/mol)nYKJ:1KJ基质燃烧热产生细胞干重得率基质燃烧热产生细胞干重得率.(g/KJ)YKJ=Y-ave部分菌体得率与产物得率例4例43.2细胞生长的非结构动力学细胞生长的非结构动力学细胞反应过程主要特征细胞反应过程主要特征n细胞是反应过程的主体细胞是反应过程的主体n细胞反应过程的本质是复杂的酶催化反应细胞反应过程的本质是复杂的酶催化反应体系体系n细胞反应与酶催化反应也有着明显的不同细胞反应与酶催化反应也有着明显的不同 酶本身不能进行再生产酶本身不能进行再生产;细胞自己能进行再生细胞自己能进行再生产产 ;
10、在细胞反应过程中细胞的形态、组成、活在细胞反应过程中细胞的形态、组成、活性都处在一动态变化过程性都处在一动态变化过程。环境对细胞生长的影响n细胞种类和来源n外环境营养物质的种类和浓度环境的pH、温度、剪切力等温度温度pH细菌:霉菌和酵母:4-6n渗透压好盐细菌:30%NaCl耐糖酵母:70%蔗糖溶液n溶解氧(solvedoxygen,DO)n光光氧型微生物、藻类和植物细胞n剪切力综合因素3.2.3细胞生长动力学的描述方法细胞生长动力学的描述方法A.A.理想的微生物生长模型应具备下列理想的微生物生长模型应具备下列理想的微生物生长模型应具备下列理想的微生物生长模型应具备下列4 4个条个条个条个条件
11、:件:件:件:n要明确建立模型的目的。n明确地给出建立模型的假定条件,这样才能明确模型的适用范网。n希望所含有的参数,能够通过实验逐个确定。n模型应尽可能简单。B.模型分类模型分类n结构模型和非结构模型是否考虑细胞组成变化(均衡生长)n确定论和概率论是否考虑细胞群体中的个体变化与细胞的浓度有关n分立模型和非分立模型是否考虑细胞群体个体差异最理想情况:不考虑细胞内部结构;各种细胞均一;细胞群体做为一种溶质A细胞之间无差异,是均一的,细胞内有多个组分存在B不考虑细胞内部结构;各种细胞不均一C实际情况:细胞内多组分;细胞之间不均一D均衡生长均衡生长非结构模型结构模型平均细胞的近似平均细胞的近似C.C
12、.反应速率反应速率细细胞胞的的生生长长、基基质质的的消消耗耗和和产产物生生成成的变化情况,要描述这种变化,采用绝绝对对速速率率和和比比速速率率两种定义方法。n绝绝对对速速率率(又又简简称称为为速速率率):表表示示为为单单位位时时间间、单位反应体积某一组分的变化量。单位反应体积某一组分的变化量。n比比速速率率:单单位位浓浓度度细细胞胞(或或单单位位质质量量)为为基基准准而而表示的各个组分变化速率表示的各个组分变化速率D.倍增时间td与关系倍增时间与世代时间不同例以乙醇为惟一碳源进行产气气杆菌培养,菌使浓度X03,培养至,菌体浓度为3,如果不考虑延迟期,比生长速率一定,求倍增时间td无抑制的细胞生
13、长动力学无抑制的细胞生长动力学A.Monod方方程程:细细胞胞的的生生长长为为均均衡衡式式生生长长,细细胞胞的的比比生生长长速速率率与与限限制制性性基基质质浓浓度度的的存存在在着着关关系。系。a.假设:假设:细细胞胞的的生生长长为为均均衡衡式式生生长长,细细胞胞生生长长的的唯唯一一变量是细胞的浓度;变量是细胞的浓度;培培养养基基中中只只有有一一种种基基质质是是生生长长限限制制性性基基质质,而其他组分为过量,不影响细胞的生长;而其他组分为过量,不影响细胞的生长;细细胞胞的的生生长长视视为为简简单单的的单单一一反反应应,细细胞胞得得率率为一常数。为一常数。方程方程Ks饱和常数(g/L)比生长速率是
14、最大比生长速率是一半时的限制性基质的浓度。max微生物的最大比生长速率(s-1)方程适用范围:方程适用范围:适用于细胞生长较慢和细胞密度较低的环境适用于细胞生长较慢和细胞密度较低的环境。如如果果基基质质消消耗耗速速率率过过快快,则则极极有有可可能能产产生生有有害害的的副副产产物物;在在细细胞胞浓浓度度很很高高时时,则则有有害害的的副副产产物物可可能能更更多多。因因此此,人人们们又又提提出出另另外外一一些些无无抑抑制制的的细细胞胞生生长长动动力力学学。式中Cs0基质初始浓度;Kso无因次初始饱和常数。其他方程若干常见微生物max与Ks值微生物限制性底物max/h-1Ks/(mg/L)大肠杆菌37
15、)葡萄糖0.8-1.42-4大肠杆菌37)甘油0.872大肠杆菌37)乳糖0.820酿酒酵母30)葡萄糖0.5-0.625热带假丝酵母葡萄糖0.525-75产气可雷伯氏菌甘油0.859产气气杆菌葡萄糖1.221-10与S关系与S关系d与S关系当限制性基质浓度很低时,SKs时,=max,若继续提高基质浓度,细胞生长速率基本不变。此时细胞比生长速率与基质浓度无关,为零级动力学特点。c.当S处于上述两种情况之间,则与Cs关系符合Monod方程关系。rX例例乙醇为唯一碳源进行面包生产,获得如下数乙醇为唯一碳源进行面包生产,获得如下数据:据:求求和和Ks。SS(g/Lg/L)0.400.400.330.
16、330.180.180.100.100.0710.0710.0490.0490.0380.0380.0200.0200.0140.014(h(h-1-1)0.1610.1610.1690.1690.1690.1690.1490.1490.1330.1330.1350.1350.1120.1120.09090.09090.07350.0735解:由图可知:=0.18(h=0.18(h-1-1)3 3)例例采用合成培养基,在采用合成培养基,在1m3生物反应器中进行大肠杆生物反应器中进行大肠杆菌分批培养,菌体的生长变化利用菌分批培养,菌体的生长变化利用Monod方程描述,已方程描述,已知知max-1
17、,3,基质初使浓度,基质初使浓度50kg/m3,菌体菌体X0=0.1kg/m3,YX/S=0.6kg/kg,(以细胞(以细胞/基质),求当基质),求当80%的基质已的基质已反应时所需时间。反应时所需时间。解:当80%的基质反应时,S=50(1-80%)=10kg/m33则(1)YX/S恒定,生成菌体量(S0-S)YX/S=400.6=24(kg)当t=t0,t=t时,菌体量有增至24kg,对(1)积分b.Monod与米氏方程的比较:与米氏方程的比较:n相同:形似;在一定条件下使用。Monod方程往往必须在具体条件下进行适当修正。n不同:Monod方程经验表达式;而米氏方程数学推导式。细胞利用营
18、养成分的过程与单一酶促反应过程不同,因前者与细胞的生理、营养、代谢有关。不同:酶在反应完成后,其数量保持不变(假定不失活),但微生物反应完成后细胞量却发生变化(自催化反应)。米氏方程是反应速率与底物浓度之间的对应关系,而Monod方程表明了比生长速率与限制性基质浓度之间的对应关系。比生长速率不直接参与反应,是一系列生化反应的间接结果。如果在细胞生长中蛋白质合成是限制因素,则两式趋于近似。米氏常数的大小,表明了酶对底物亲和力的强弱,Ks的大小则表明细胞对限制性基质的依赖性的大小。逻辑方程:式中(1-x)综合描述了因营养物质匮乏和有毒代谢物积累等各种限制和抑制细胞生长的因素。适用于营养成分复杂、生
19、长限制因素不清楚的情形。在生态学和间歇发酵动力学广泛应用。其他不同方程所获得的菌体浓度与时间的变化关系基质消耗动力学基质消耗表达方法A.基质消耗速率仅用于维持细胞生长n基质消耗速率n基质比消耗速率B.基质消耗速率用于维持细胞生长和维持代谢的消耗n基质消耗速率n基质比消耗速率-=g()C.基质消耗速率用于产物的消耗a.与能量偶联同Bb.与能量间接偶联n基质消耗速率n基质比消耗速率与能量关系氧的消耗速率A.消耗速率仅用于生长B.消耗速率用于生长和代谢关系代谢产物的生成动力学n模型类型:相关、部分相关、非相关相关模型:n产物是细胞能量的代谢的结果nrP=Yp/xrx=-YP/SXn乙醇、葡萄糖酸、乳
20、酸n曲线:变化趋于同步,rP,max,max同步模型类型:相关、部分相关、非相关变化曲线部分相关模型n产物是能量代谢的间接结果;nrP=rX+x,=+n柠檬酸、氨基酸n曲线:,非相关模型n产物的生成与细胞的生长无直接关系nrP=x,=n抗菌素、微生物毒素n曲线例证明下列反应速率动力学为=+的形式。相对分子质量:1804644各物质中的含碳量:vs=0.40vp=0.52vCO2=0.27CO2的生成量为不考虑有其他产物生成时,反应系统的碳平衡式为(-)=vs(vs为单位质量菌体中的含碳量,为常数)(-)=vs又有其中m维持常数YG无维持代谢的细胞最大得率,常数因此,故证明乙醇发酵反应速率动力学
21、符合=+的形式,其中、为常数。其中,m、YG、vx为常量,则上式可写为=+的形式。模型3.5细胞死亡动力学细胞死亡动力学n营养细胞对数死亡动力学VD积分kd是温度函数,kd芽孢死亡动力学n菌体循序死亡模型(非对数)RSD积分krks3.5.2灭菌原理n微生物灭菌的原理来源于细胞死亡动力学,对于不同的细胞其死亡难易程度不同。一般来说营养细胞容易被杀死,而芽孢则因有致密的外皮和干燥的内含物,难以致死。因此,在设计灭菌操作时,总以芽孢为灭菌对象,只要杀死了芽孢,其他杂菌也一定能杀灭。同时要考虑灭菌的同时,减少培养基有效成分的损失。由于温度变化对营养成分破坏的影响,明显小于芽孢的热死亡,因此,多采用高
22、温、瞬时的灭菌方法。n通常认为细胞浓度10-4个/ml为无菌。灭菌原理n根据动力学分析。微生物受热死亡时的活化能一般比营养成受热分解的活化能大得多,因此,当温度升高时,微生物的死亡速率的增加要比营养成分破坏速率的增加大得多。受热物质E(J/mol)维生素B12维生素B1盐酸盐嗜热脂肪芽孢杆菌孢子肉毒梭菌孢子枯草杆菌孢子9623292048283257343088317984灭菌温度(C)达到灭菌程度的时间(min)维生素B1的损失(%)100110120130140150843757.60.8510.1070.01599.9989271031例例为了发酵,采用蒸汽对分批发酵罐中液体培养基进行为
23、了发酵,采用蒸汽对分批发酵罐中液体培养基进行灭菌,已知其含有杂菌的初始浓度为灭菌,已知其含有杂菌的初始浓度为108个杂菌个杂菌/L。细胞死细胞死亡速率可用一级动力学表示。根据要求,最终可以接受的亡速率可用一级动力学表示。根据要求,最终可以接受的含杂菌浓度为含杂菌浓度为10-3个杂菌个杂菌/L。现假定该杂菌为嗜热脂肪芽。现假定该杂菌为嗜热脂肪芽孢杆菌,已知其热死活化能为孢杆菌,已知其热死活化能为283kJ/mol,阿累尼乌斯常数阿累尼乌斯常数为为10s-1。若处理的培养基为。若处理的培养基为1m3,试求分别在,试求分别在80、121和和140进行灭菌时,各需要多长时间?进行灭菌时,各需要多长时间
24、?解:由题意可得:第4章微生物反应器操作n微生物反应器 一般由反应器、空气系统、检测系统、阀门、管道和附属设备组成。实罐灭菌时,蒸汽可从进气口、排料口和取样口进入,从其它口排出,即所谓“三进四出”或“三进五出”物流物流:空气蒸汽水物料(补料)检测:检测:pHT溶氧消泡气生式发酵罐n由喷嘴、升管和降管组成,利用喷嘴功能和流体在发酵罐的重度造成循环流动来实现发酵液的搅拌混合和溶氧(图3)41微生物反应器操作基础n按是否供养,分厌氧和好氧。好氧分为(1)液体表面培养(如使用浅盘);(2)通风固态发酵;(3)通氧深层培n操作方式而言,深层培养可分为:(1)分批式操作。(2)反复分批式操作(3)半分批式
25、操作(4)反复半分批式操(5)连续式操作4.2分批操作分批操作n简单的过程,培养基中接入菌种以后,没有物简单的过程,培养基中接入菌种以后,没有物料的加入和取出,除了空气的通入和排气。料的加入和取出,除了空气的通入和排气。整个过程中菌的浓度、营养成分的浓度和产整个过程中菌的浓度、营养成分的浓度和产物浓度等参数都随时间变化物浓度等参数都随时间变化对于初级代谢产物,在对数生长期初期就对于初级代谢产物,在对数生长期初期就开始合成并积累,而次级代谢产物则在对开始合成并积累,而次级代谢产物则在对数生长期后期和稳定期大量合成。数生长期后期和稳定期大量合成。分批操作的优缺点分批操作的优缺点优点优点 操作简单,
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