蛋白质生物合成.ppt
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1、目录目录蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成(翻译翻译)第十五章第十五章Protein Biosynthesis(Translation)目录目录 遗传密码遗传密码三联子三联子 tRNAtRNA的结构、功能与种类的结构、功能与种类 核糖体的结构与功能核糖体的结构与功能 蛋白质合成的过程蛋白质合成的过程 蛋白质的运转机制蛋白质的运转机制Contents本章内容本章内容目录目录生物信息的传递生物信息的传递 从从mRNAmRNA到蛋白质到蛋白质目录目录 翻译:翻译:指将指将mRNAmRNA链上的核甘酸从一链上的核甘酸从一个特定的起始位点开始,按每三个个特定的起始位点开始,按每三个核甘酸代表一个氨基酸的原
2、则,依核甘酸代表一个氨基酸的原则,依次合成一条多肽链的过程。次合成一条多肽链的过程。目录目录第一节第一节蛋白质的合成体系蛋白质的合成体系目录目录20种氨基酸种氨基酸(AA)作为原料作为原料20多种酶及众多蛋白因子,如多种酶及众多蛋白因子,如IF、eIF ATP、GTP、无机离子、无机离子参与蛋白质生物合成的物质参与蛋白质生物合成的物质l 三种三种RNAmRNA(messenger RNA,信使信使RNA)rRNA(ribosomal RNA,核糖体核糖体RNA)tRNA(transfer RNA,转移转移RNA)目录目录蛋白质合成的场所(工厂)是蛋白质合成的场所(工厂)是核糖体;核糖体;运输氨
3、基酸到模板上的是运输氨基酸到模板上的是tRNA适配器;适配器;模板是模板是mRNA;氨氨基基酸酸变变为为活活化化态态与与tRNA共共价价结结合合形形成成氨氨酰酰tRNA,催催化化这这个个过过程程的的酶酶叫叫氨氨酰酰tRNA合成酶合成酶。目录目录一、一、mRNA及遗传密码及遗传密码mRNA是蛋白质生物合成过是蛋白质生物合成过程中直接指令氨基酸掺入的程中直接指令氨基酸掺入的模板模板,是遗传信息的载体。,是遗传信息的载体。(一)(一)mRNA目录目录(二)遗传密码(二)遗传密码三联体密码三联体密码在在mRNA的的开放阅读框架区开放阅读框架区,以每,以每3个相邻的核苷酸为一组,代表一种氨个相邻的核苷酸
4、为一组,代表一种氨基酸基酸(或其他信息或其他信息),这种三联体形式,这种三联体形式的核苷酸序列称为的核苷酸序列称为密码子密码子。1、密码子(、密码子(codon)目录目录2、三联体密码的破译、三联体密码的破译mRNA5 AUCGACCUGAGC3420()mRNA5 AUCGACCUGAGC342=1620()mRNA5AUCGACCUGAGC343=6420()核甘酸序列核甘酸序列氨基酸序列氨基酸序列目录目录 (1)以均聚物为模板指导多肽的合成)以均聚物为模板指导多肽的合成 1961 Nirenberg 和和 Matthaei poly U-编码编码 Phe poly C-编码编码 Pro
5、poly A-编码编码 Lys 三联体密码破译的实验依据三联体密码破译的实验依据目录目录 人工合成多种三核苷酸(人工合成多种三核苷酸(UUU、UCU、UGU等)做为模板等)做为模板 与含核糖体、与含核糖体、20种种 AA-tRNA和适当离子强度和适当离子强度的反应液保温的反应液保温 利用结合核糖体的利用结合核糖体的AA-tRNA能被吸附的性质,能被吸附的性质,可与未结合的可与未结合的tRNA分开分开 分析留在滤膜上的核糖体中的分析留在滤膜上的核糖体中的AA-tRNA和其相和其相应的模板,即可确定编码特定氨基酸的密码子应的模板,即可确定编码特定氨基酸的密码子 三联体密码破译的实验依据三联体密码破
6、译的实验依据(2)核糖体结合技术:)核糖体结合技术:目录目录以随机共聚物指导多肽的合成:以随机共聚物指导多肽的合成:以随机共聚物以随机共聚物A、C为模板,任意排列可出现为模板,任意排列可出现8种三聚体,获得六种氨基种三聚体,获得六种氨基酸组成的多肽。酸组成的多肽。以特定的共聚物为模板指导多肽的合成:以特定的共聚物为模板指导多肽的合成:以多聚二核以多聚二核苷酸作模板可合成由苷酸作模板可合成由2个氨基酸组成的多肽,如个氨基酸组成的多肽,如PolyUG模板,合成产物为模板,合成产物为Lys和和Val;以多聚三核苷;以多聚三核苷酸作为模板,可得三种氨基酸组成的多肽。酸作为模板,可得三种氨基酸组成的多肽
7、。三联体密码破译的实验依据三联体密码破译的实验依据(3)化学法和酶法相结合:)化学法和酶法相结合:目录目录遗遗传传密密码码表表1965年年完成完成目录目录终止密码终止密码(termination codon):UAA、UAG、UGA 3个不编码个不编码aa的,为终止密码,不能被的,为终止密码,不能被tRNA阅读,阅读,只被肽链释放因子识别。只被肽链释放因子识别。起始密码起始密码(initiation codon):AUG 编码编码甲硫氨酸(原核为甲酰甲硫氨酸),甲硫氨酸(原核为甲酰甲硫氨酸),为起始为起始密码,密码,常用。常用。少数原核生物是少数原核生物是GUG(缬氨酸):极少用。(缬氨酸):
8、极少用。3、起始密码子和终止密码子、起始密码子和终止密码子目录目录4、开放读码框架、开放读码框架(open reading frame,ORF)mRNA链上,从链上,从5至至3,以,以AUG为起点,每三个碱基为起点,每三个碱基作为一个密码子连续阅读,直至出现终止密码子,作为一个密码子连续阅读,直至出现终止密码子,AUG至终止密码子之间称为至终止密码子之间称为ORF。AUG ACA UGC UAU GGU AAU UAA AUG CUC AAG UAA U 目录目录5、遗传密码的特点、遗传密码的特点(1)方向性)方向性(directional)翻译时遗传密码的阅读方向翻译时遗传密码的阅读方向是是
9、53,即读,即读码从码从mRNA的起始密码子的起始密码子AUG开始,按开始,按53的方向逐一阅读,直至终止密码子。的方向逐一阅读,直至终止密码子。NC肽链延伸方向肽链延伸方向53读码方向读码方向目录目录(2)连续性连续性(non-punctuated)密码是无标点和不重叠的。密码是无标点和不重叠的。编码蛋白质氨基酸编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密码连续阅读,密码子及密码子序列的各个三联体密码连续阅读,密码子及密码子的各碱基之间既无间隔也无交叉。通常从一个正确的各碱基之间既无间隔也无交叉。通常从一个正确起点(起点(AUG)开始,)开始,3个一组,一个不漏的读下去个一组,一个不漏的读下去至终止密
10、码。至终止密码。5.5.A U GA U G G C AG C A G U AG U A C A UC A U U A AU A A 3 3AlaValHisMet终止密码终止密码目录目录目录目录基因损伤引起基因损伤引起mRNA阅读框架内的碱基发生阅读框架内的碱基发生插入或缺失插入或缺失,可能导致,可能导致框移突变框移突变(frameshift mutation)。缬缬 脯脯 苏苏 天冬天冬缬缬 丙丙 酪酪 甘甘缬缬 丙丙 丝丝 精精目录目录(3)简并性简并性(degenerate)一一种种AA可可具具有有2个个或或2个个以以上上的的密密码码子子为为其其编编码码。这一特性称为这一特性称为遗传密
11、码的简并性。遗传密码的简并性。除除Trp和和Met仅有仅有1个密码子外,其余个密码子外,其余AA均有均有2个个或多个密码子为其编码。为同一种或多个密码子为其编码。为同一种AA编码的各密码编码的各密码子称为子称为同义密码子同义密码子。如:如:UUA、UUG、CUU、CUC、CUA、CUG都编码都编码Leu意义:意义:DNA碱基有较大变化时,仍保持多肽碱基有较大变化时,仍保持多肽链中链中AA顺序不变。顺序不变。减少有害突变,保证了物种的稳定性减少有害突变,保证了物种的稳定性。目录目录各种氨基酸的密码子数目各种氨基酸的密码子数目目录目录(4)通用性)通用性(universal)从简单的病毒到高等的人
12、类,几乎使用同一套从简单的病毒到高等的人类,几乎使用同一套遗传密码,因此,遗传密码表中的这套遗传密码,因此,遗传密码表中的这套“通用密码通用密码”基本上适用于生物界的所有物种,基本上适用于生物界的所有物种,具有通用性。具有通用性。密码的通用性进一步证明各种生物进化自同一密码的通用性进一步证明各种生物进化自同一祖先。祖先。但但在在1979年发现线粒体的遗传密码与通用密码年发现线粒体的遗传密码与通用密码表有区别,表有区别,1980年又发现不同生物的线粒体密码也年又发现不同生物的线粒体密码也不尽相同。植物细胞的叶绿体密码也不尽相同,不尽相同。植物细胞的叶绿体密码也不尽相同,可可见遗传密码并非绝对通用
13、。见遗传密码并非绝对通用。目录目录生物生物密码子密码子线粒体线粒体DNADNA编码编码的氨基酸的氨基酸核核DNADNA编码的氨编码的氨基酸基酸所有所有UGAUGA色氨酸色氨酸终止子终止子酵母酵母CUACUA苏氨酸苏氨酸亮氨酸亮氨酸果蝇果蝇AGAAGA丝氨酸丝氨酸精氨酸精氨酸哺乳类哺乳类AGA/GAGA/G终止子终止子精氨酸精氨酸哺乳类哺乳类AUAAUA甲硫氨酸甲硫氨酸异亮氨酸异亮氨酸线粒体与核线粒体与核DNADNA密码子使用情况的比较密码子使用情况的比较目录目录 密码子的专一性主要由前密码子的专一性主要由前2个碱基决定,。个碱基决定,。第三位碱基的改变不重要:第三位碱基的改变不重要:如:如:H
14、is:CAU、CAC;第;第3位均为嘧啶;位均为嘧啶;Glu:CAA、CAG;第;第3位均为嘌呤。位均为嘌呤。意义:意义:降低了由于第降低了由于第3个碱基发生突变造成个碱基发生突变造成 的误差。的误差。反密码子与密码子之间的配对有时并不严格反密码子与密码子之间的配对有时并不严格遵守常见的碱基配对规律,这种现象称为摆动配遵守常见的碱基配对规律,这种现象称为摆动配对对(wobble base pairing)。(5)摆动性)摆动性(wobble)目录目录U3 2 11 2 3摆摆动动配配对对目录目录二、二、rRNA及核糖体及核糖体核糖体是蛋白质合成的工厂(场所)核糖体是蛋白质合成的工厂(场所)核糖
15、体核糖体是由是由rRNA和多种蛋白质结合而成的一种和多种蛋白质结合而成的一种大的核糖核蛋白颗粒,蛋白质肽键的合成就是大的核糖核蛋白颗粒,蛋白质肽键的合成就是在这种核糖体上进行的。在这种核糖体上进行的。1、组成:、组成:约约65%的的rRNA,约约35%的蛋白质。的蛋白质。(一)核糖体的组成和结构:(一)核糖体的组成和结构:目录目录2 2、结构:、结构:球形颗粒,由球形颗粒,由大小两个亚基大小两个亚基组成。组成。目录目录核核蛋蛋白白体体的的组组成成目录目录(二)核糖体的功能(二)核糖体的功能1、16SrRNA对对识别识别mRNA上肽链上肽链起始位起始位点点起重要作用。起重要作用。2、参与肽链的、
16、参与肽链的启动、启动、延长、终止、移动延长、终止、移动等等核糖体大亚基核糖体大亚基X-衍射图衍射图目录目录3 3、功能位点:、功能位点:1)mRNA结合位点:结合位点:在大小亚基的结合面上,为蛋白质合成之处。在大小亚基的结合面上,为蛋白质合成之处。2)P位点:位点:肽酰基位点,大部分位于小亚基上,小肽酰基位点,大部分位于小亚基上,小部分位于大亚基上,结合部分位于大亚基上,结合起始起始-tRNA和肽酰基和肽酰基-tRNA。3)A位点:位点:氨酰基位点,位于大亚基上,结合氨酰基位点,位于大亚基上,结合氨酰氨酰-tRNA。4)E位点:位点:专供专供tRNA离开。离开。目录目录原核生物翻译过程中核蛋白
17、体结构模式原核生物翻译过程中核蛋白体结构模式A位:位:氨基酰位氨基酰位(aminoacyl site)P位位:肽酰位:肽酰位(peptidyl site)E位:位:排出位排出位(exit site)目录目录反密码子环反密码子环氨基酸臂氨基酸臂三、三、tRNA氨基酸转运工具氨基酸转运工具tRNA的二的二级结构:级结构:三三叶草结构叶草结构DHU环环TC环环目录目录与蛋白质合成有关的位点与蛋白质合成有关的位点(1)3末端的末端的CCA序列:序列:为为aa接受位点,活化接受位点,活化aa的的羧基羧基共价结合到共价结合到3末端末端A的的-OH上,形成上,形成氨酰氨酰tRNA。(2)反密码子位点:)反密
18、码子位点:由反密码子环下方的由反密码子环下方的3个碱基个碱基组成,与组成,与mRNA上密码子的碱基互补。上密码子的碱基互补。(3)DHU环:环:识别氨酰识别氨酰-tRNA合成酶的位点。合成酶的位点。(4)TC环:环:核糖体识别位点。核糖体识别位点。目录目录tRNA的反密码子与的反密码子与mRNA上的密码子配对上的密码子配对A U C目录目录蛋白质的生物合成过程蛋白质的生物合成过程第二节第二节目录目录(1 1)氨基酸的活化(激活)氨基酸的活化(激活)(2 2)活化氨基酸的转运)活化氨基酸的转运(3 3)肽链合成的起始)肽链合成的起始(4 4)肽链合成的延长)肽链合成的延长(5 5)肽链合成的终止
19、与释放)肽链合成的终止与释放蛋白质的生物合成分五个阶段蛋白质的生物合成分五个阶段目录目录n反应过程反应过程氨基酸氨基酸+tRNA氨酰氨酰-tRNAATP AMPPPi氨酰氨酰-tRNA合成酶合成酶n 活化场所(部位):细胞质(胞液)活化场所(部位):细胞质(胞液)n 总反应式如下:总反应式如下:一、一、氨基酸的活化与转运氨基酸的活化与转运目录目录氨基酸氨基酸 ATP 氨酰氨酰-AMP PPi 第一步反应第一步反应活化活化氨酰-tRNA合成酶氨酰-tRNA合成酶目录目录第二步反应第二步反应转运转运氨基酰氨基酰-AMP tRNA氨基酰氨基酰-tRNA AMP氨酰-tRNA合成酶目录目录氨酰氨酰-t
20、RNA合成酶的特点合成酶的特点 a、专一性:、专一性:对氨基酸有极高的专一性对氨基酸有极高的专一性,每种氨基酸都有专一,每种氨基酸都有专一 的酶,只作用于的酶,只作用于L-氨基酸,不作用于氨基酸,不作用于D-氨基酸。氨基酸。对对tRNA 具有极高专一性。具有极高专一性。b、校正作用:、校正作用:氨酰氨酰-tRNA合成酶的水解部位可以合成酶的水解部位可以 水解错误活化的氨基酸。水解错误活化的氨基酸。目录目录n氨基酰氨基酰-tRNA的表示方法的表示方法丙氨酰丙氨酰-tRNA:Ala-tRNAAla精氨酰精氨酰-tRNA:Arg-tRNAArg甲硫氨酰甲硫氨酰-tRNA:Met-tRNAMet各种氨
21、基酸和对应的各种氨基酸和对应的tRNA结合后形成的结合后形成的氨酰氨酰-tRNA表示为:表示为:氨基酸的三字母缩写氨基酸的三字母缩写-tRNA氨基酸的三字母缩写氨基酸的三字母缩写 例如:例如:目录目录起始氨基酸起始氨基酸原核原核:甲酰甲硫氨酸甲酰甲硫氨酸(fMet)真核真核:甲硫氨酸甲硫氨酸(Met)(一)起始氨酰(一)起始氨酰-tRNA二、肽链合成的起始二、肽链合成的起始原核:原核:fMet-tRNAifMet 真核:真核:Met-tRNAiMet 起始氨酰起始氨酰-tRNA目录目录具具有有起起始始功功能能的的tRNAfMet与与甲甲硫硫氨氨酸酸结结合合后后,甲甲硫硫氨氨酸酸很很快快被被甲甲
22、酰酰化化为为N-甲甲酰酰甲甲硫硫氨氨酸酸(N-formyl methionine,fMet),于于是是形形成成N-甲甲酰酰甲甲硫硫氨氨酰酰-tRNA(fMet-tRNAifMet),可可以以在在mRNA的的起起始始密密码码子子AUG处处就就位位,参参与与形形成成翻翻译译起起始始复复合合物物。起起始始密密码码子子只只能辨认能辨认fMet-tRNAifMet。起始氨酰起始氨酰-tRNA:fMet-tRNAifMet 二、肽链合成的起始二、肽链合成的起始目录目录fMet-tRNAifMet的的生生成成是是一一碳碳化化合合物物转转移移和和利利用用的的过过程程之之一一,反反应应由由转转甲甲酰酰基基酶酶催
23、催化化,甲甲酰酰基基从从N10-甲酰四氢叶酸甲酰四氢叶酸转移到甲硫氨酸的转移到甲硫氨酸的-氨基上。氨基上。Met-tRNAifMetN10-甲酰甲酰FH4 甲酰化酶甲酰化酶fMet-tRNAifMetFH4 Met-tRNAifMet的的Met的的-NH2被甲酰化被甲酰化该酶特异性强,该酶特异性强,不能催化不能催化Met或或Met-tRNAMet起始氨基酸的甲酰化起始氨基酸的甲酰化目录目录tRNAMet和和甲甲硫硫氨氨酸酸结结合合后后生生成成Met-tRNAMet,必必要要时时进进入入核核蛋蛋白白体体,为为延延长长中中的的肽链添加甲硫氨酸。肽链添加甲硫氨酸。(二)参与肽链延长的(二)参与肽链延
24、长的甲硫氨酰甲硫氨酰-tRNA:真核、原核相同:真核、原核相同:Met-tRNAMet目录目录u 核糖体核糖体30S和和50S亚基亚基u 带有起始密码子带有起始密码子AUG的的mRNAu fMet-tRNAifMetu 起起始始因因子子(initiation factor,IF):IF1、IF2、IF3uGTP,Mg2+起始过程所需要的因子起始过程所需要的因子目录目录IF-3IF-11、核蛋白体大小亚基分离、核蛋白体大小亚基分离目录目录IF-3IF-12、mRNA在小亚基定位结合在小亚基定位结合A U G53mRNA 形成形成mRNA-30S-IF1-IF3 复合物复合物,并使,并使30S小亚
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- 关 键 词:
- 蛋白质 生物 合成
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