最新微生物遗传与育种精美课件PPT课件.ppt
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1、微生物遗传与育种精美课件微生物遗传与育种精美课件第第 一一 节节微生物遗传的物质基础微生物遗传的物质基础病毒重建实验病毒重建实验nH.Fraenkel-Conrat,1956n实验材料实验材料n烟草花叶病毒(烟草花叶病毒(TMV)n霍氏车前花叶病毒(霍氏车前花叶病毒(HRV)n处理处理n在一定浓度的苯酚溶液中振荡,分离蛋白质外在一定浓度的苯酚溶液中振荡,分离蛋白质外壳与壳与RNA核心核心2、DNA的结构的结构nDNA的结构的结构n基本单位是脱氧核苷基本单位是脱氧核苷酸酸n反向平行、右手螺旋反向平行、右手螺旋n碱基碱基A、T、C、G有有序排列序排列n碱基之间由氢键连接碱基之间由氢键连接3、DNA
2、的复制的复制n半保留复制半保留复制n复制起点、复制方向、复制单位复制起点、复制方向、复制单位nDNA的半不连续复制的半不连续复制3 5 3 5 解链方向解链方向35335领头链领头链(leading strand)随从链随从链(lagging strand)n复制的几种主要方式复制的几种主要方式n型复制型复制nD环复制环复制n线粒体线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)的复制的复制形式。形式。复制中的放射自显影图象复制中的放射自显影图象dNTPDNA-pol 3-OH5-P5 5 5 3 3 3 3 5滚环复制滚环复制5 5 3 3 5 4、生物染色体、病毒遗传物质、生
3、物染色体、病毒遗传物质n原核生物的染色体原核生物的染色体n核区,无核膜包裹,核区,无核膜包裹,DNA裸露,不与蛋白形成裸露,不与蛋白形成复合体复合体n染色体组成:染色体组成:DNA、RNA、蛋白质、蛋白质n往往往往只有一条只有一条染色体,大多数以染色体,大多数以双链双链、共价闭、共价闭合的合的环状环状形式存在形式存在n真核生物的染色体真核生物的染色体n核膜包裹,线性核膜包裹,线性DNA与与组蛋白组蛋白结合形成染色体结合形成染色体n染色体不止一个,每个染色体中含有染色体不止一个,每个染色体中含有1个线性个线性DNA分子分子n细胞分裂中期呈棍棒状,静止期为颗粒状细胞分裂中期呈棍棒状,静止期为颗粒状
4、n染色体基本组成单位:核小体染色体基本组成单位:核小体n两种生物染色体两种生物染色体DNA复制区别复制区别n复制子大小、数量上差异复制子大小、数量上差异n复制起点、复制速度、方向上差异复制起点、复制速度、方向上差异第第 二二 节节微生物的基因和基因组微生物的基因和基因组Microbial Gene and Genome一、基因概念和微生物的基因结构一、基因概念和微生物的基因结构n概念概念n一段具有特定功能和结构的连续的一段具有特定功能和结构的连续的DNA片断,片断,是编码蛋白质或是编码蛋白质或RNA分子遗传信息的基本遗传分子遗传信息的基本遗传单位。单位。n原核生物基因的结构原核生物基因的结构n
5、真核生物基因的结构真核生物基因的结构n一般无操纵子结构一般无操纵子结构n存在大量不编码序列和重复序列存在大量不编码序列和重复序列n转录和转译在细胞中有空间间隔转录和转译在细胞中有空间间隔n基因被许多无编码功能的基因被许多无编码功能的内含子内含子阻隔,使编码阻隔,使编码序列变成了不连续的序列变成了不连续的外显子外显子。二、基因组二、基因组n基因组(基因组(genome)n单倍体细胞中所含的全套遗传物质单倍体细胞中所含的全套遗传物质n大多数细菌和噬菌体基因组是指单个染色体大多数细菌和噬菌体基因组是指单个染色体上所含的上所含的全部基因全部基因n二倍体真核生物基因组是指单倍体细胞核内二倍体真核生物基因
6、组是指单倍体细胞核内整套整套染色体所含的染色体所含的DNA分子及其所携带的分子及其所携带的全全部部基因基因原核生物与真核生物基因组比较原核生物与真核生物基因组比较比较项目比较项目原核生物原核生物真核生物真核生物基因组大小基因组大小小小大大复制起始点数目复制起始点数目一般一般1个个多个多个染色体数目染色体数目一般一般1个个多个多个染色体组形状染色体组形状环状环状线状线状染色体与组蛋白结合染色体与组蛋白结合无无有稳定的结合有稳定的结合核小体核小体无无有有基因连续性基因连续性强强差(被许多内含子分隔)差(被许多内含子分隔)重复序列重复序列少少多多不编码序列不编码序列少少多多操纵子结构操纵子结构普遍存
7、在普遍存在一般没有一般没有转录、转译部位转录、转译部位同在细胞质中进行同在细胞质中进行在核中转录、在细胞质中转译在核中转录、在细胞质中转译第第 三三 节节质粒和转座子质粒和转座子Plasmid and Transposon一、质粒概述一、质粒概述n质粒(质粒(plasmid)n存在于各种微生物细胞中、独立于染色体外、存在于各种微生物细胞中、独立于染色体外、能进行自主复制的遗传因子。能进行自主复制的遗传因子。n特点特点n可自我复制、稳定遗传;非必需;可转移;可可自我复制、稳定遗传;非必需;可转移;可整合;可重组;可消除整合;可重组;可消除n质粒的大小和复制质粒的大小和复制二、质粒的分子结构二、质
8、粒的分子结构nSC构型构型nOC构型构型nL构型构型质粒的分离和鉴定质粒的分离和鉴定n分离的步骤分离的步骤n细胞培养细胞培养n细胞裂解细胞裂解n蛋白质和蛋白质和RNA的去除的去除n质粒质粒DNA与染色体与染色体DNA的分离(关键步骤)的分离(关键步骤)n质粒的鉴定质粒的鉴定n电镜电镜n琼脂糖凝胶电泳确定分子量琼脂糖凝胶电泳确定分子量n聚丙烯酰胺凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳n密度梯度离心密度梯度离心n质粒的限制性酶切图谱质粒的限制性酶切图谱三、质粒的主要类型三、质粒的主要类型n据质粒所编码的功能和赋予宿主的表型效应据质粒所编码的功能和赋予宿主的表型效应分类分类n致育因子(致育因子(Fertilit
9、y factor,F F因子因子)n抗性因子(抗性因子(Resistance factor,R R因子因子)n产细菌素的质粒(产细菌素的质粒(Bacteriocin production plasmid)n毒性质粒(毒性质粒(virulence plasmid)n代谢质粒(代谢质粒(Metabolic plasmid)n隐秘质粒(隐秘质粒(cryptic plasmid)R100质粒(89kb)可使宿主对 下列药物及重金属具有抗性:汞离子(mer)磺胺(sul)链霉素(str)梭链孢酸(fus)氯霉素(cam)四环素(tet)R100质粒的遗传图谱质粒的遗传图谱四、转座子的类型和分子结构四、转
10、座子的类型和分子结构n转座因子(转座因子(transposable element)的概念)的概念n可在可在DNA链上改变自身位置的一段链上改变自身位置的一段DNA序列。序列。n转座因子的共同特征转座因子的共同特征n插入寄主插入寄主DNA后,导致基因失活;后,导致基因失活;n转座以后,原来的转座子依然保持在原位,而在转座以后,原来的转座子依然保持在原位,而在靶序列上复制了一个转座子;靶序列上复制了一个转座子;n插入时在靶插入时在靶DNA位点产生一个短的正向重复序位点产生一个短的正向重复序列。列。n根据转座机理不根据转座机理不同分类同分类n转座子转座子n反转座子反转座子n原核生物中的转原核生物中
11、的转座因子类型座因子类型n插入(插入(IS)序列)序列n转座子转座子(Tn)n某些温和噬菌体某些温和噬菌体n插入序列(插入序列(insertion sequence,IS)n特点特点n在在IS两端含有长为两端含有长为10-40bp反向重复序列(反向重复序列(IR)。)。n大多大多IS都含有一个都含有一个引起转座的转座酶基因。引起转座的转座酶基因。n在在IS插入时,在靶插入时,在靶DNA位点产生一个长度位点产生一个长度3-9bp正向重正向重复序列,分布在复序列,分布在IS两侧两侧。n分布在细菌染色体、质粒、某些噬菌体分布在细菌染色体、质粒、某些噬菌体DNA上上n转座子转座子(Tn)n除了与转座作
12、用有关的基因外,还含有抗性基除了与转座作用有关的基因外,还含有抗性基因(对抗生素、某些毒物)、乳糖发酵基因等因(对抗生素、某些毒物)、乳糖发酵基因等几个至十几个基因。几个至十几个基因。nIS与与Tn有两个共同特征有两个共同特征n都携带有编码转座酶的基因,该酶为转座所必需;都携带有编码转座酶的基因,该酶为转座所必需;n两端都有反向末端重复序列,只是长度不同。两端都有反向末端重复序列,只是长度不同。nIS与与Tn主要区别主要区别nTn携带有与转座无关的抗性基因或其它特性基因携带有与转座无关的抗性基因或其它特性基因n细菌抗药性转座子的两种类型细菌抗药性转座子的两种类型n复合转座子复合转座子n由两个完
13、全相同或类似的插入序列由两个完全相同或类似的插入序列IS和某种抗药性和某种抗药性基因组成的复合因子。基因组成的复合因子。n复杂转座子复杂转座子n两端具有两端具有IR或或DR,而不是,而不是IS,中部的编码区不仅编,中部的编码区不仅编码抗性标记,还编码转座酶和解离酶。码抗性标记,还编码转座酶和解离酶。n两个两个IR中任一个缺乏都会阻遏转座中任一个缺乏都会阻遏转座n特殊病毒(特殊病毒(Mu噬菌体)噬菌体)n与其他温和性噬菌体的差别:其基因组不论在与其他温和性噬菌体的差别:其基因组不论在进入裂解周期或处于溶源状态都可随机整合到进入裂解周期或处于溶源状态都可随机整合到宿主染色体的任何位置,且游离的和已
14、整合的宿主染色体的任何位置,且游离的和已整合的基因次序是相同的。基因次序是相同的。n没有固定的整合位置没有固定的整合位置n转座子的遗传转座子的遗传效应效应n遗传效应遗传效应n插入突变插入突变nDNA重排重排n极性效应极性效应第第 四四 节节基因突变与遗传育种基因突变与遗传育种一、基因突变一、基因突变n突变的概念突变的概念n变异的一种,指生物体内遗传物质的分子结构变异的一种,指生物体内遗传物质的分子结构或数量突然发生的可遗传性变化。突变率常在或数量突然发生的可遗传性变化。突变率常在10-810-9范围内。范围内。n按突变涉及的范围分按突变涉及的范围分n基因突变基因突变n染色体畸变染色体畸变基因突
15、变的类型基因突变的类型n从突变的效应来分从突变的效应来分 原序列原序列 5-AUG CCU UCA AGA UGU GGG Met Pro Ser Arg Cys Gly(1)同义突变同义突变 5-AUG CCU UCA AGA UGU GGA Met Pro Ser Arg Cys Gly(2)错义突变错义突变 5-AUG CCU UCA GGA UGU GGA Met Pro Ser Gly Cys Gly(3)无义突变无义突变 5-AUG CCU UCA AGA UGA GGA Met Pro Ser Argn按突变所带来的表型改变分按突变所带来的表型改变分n形态突变型形态突变型 n因突
16、变而产生的个体形态或菌落形态的变异因突变而产生的个体形态或菌落形态的变异n生化突变型生化突变型n营养缺陷型营养缺陷型n抗性突变型抗性突变型n致死突变型致死突变型n条件致死突变型条件致死突变型n突变后在某种条件下可正常生长、繁殖并实现其表突变后在某种条件下可正常生长、繁殖并实现其表型,而在另一条件下却无法生长繁殖的突变型型,而在另一条件下却无法生长繁殖的突变型突变的机制突变的机制突变突变自发突变自发突变染色体畸变:缺失、添加、易位、倒位染色体畸变:缺失、添加、易位、倒位诱变诱变移码突变(缺失移码突变(缺失 添加)添加)点突变点突变碱基置换(转换碱基置换(转换 颠换)颠换)二、突变与育种二、突变与
17、育种n自发突变与自然选育自发突变与自然选育1、自发突变的特点、自发突变的特点n自发性自发性 n突变的结果与原因之间的不对应性突变的结果与原因之间的不对应性n稀有性稀有性 10-910-6n诱变性诱变性n独立性独立性:一个基因的突变对其它基因突变物影:一个基因的突变对其它基因突变物影响,同时发生响,同时发生2个突变的几率很低。个突变的几率很低。n稳定性稳定性n可逆性可逆性2、自然选育、自然选育n目的目的n纯化与复壮菌种,保持稳定的生产性能纯化与复壮菌种,保持稳定的生产性能n步骤步骤n通过表现形态来淘汰不良菌株通过表现形态来淘汰不良菌株初筛初筛n通过目的代谢产物产量考察通过目的代谢产物产量考察复筛
18、复筛n进行遗传基因型纯度试验进行遗传基因型纯度试验n传代稳定性试验传代稳定性试验n诱发突变与诱变育种诱发突变与诱变育种n概念概念n诱发突变诱发突变指人为地运用物理、化学或生物的方法处指人为地运用物理、化学或生物的方法处理微生物,使其遗传物质发生变异,从而达到改变理微生物,使其遗传物质发生变异,从而达到改变其表型的目的。其表型的目的。n诱变育种诱变育种指人为地、有意识地将对象生物置于诱变指人为地、有意识地将对象生物置于诱变因子中,使该生物发生突变,从这些突变体中筛选因子中,使该生物发生突变,从这些突变体中筛选具有优良性状突变株的过程。具有优良性状突变株的过程。n常用的诱变剂常用的诱变剂n物理诱变
19、剂、化学诱变剂、生物诱变剂物理诱变剂、化学诱变剂、生物诱变剂n诱变处理的基本方法诱变处理的基本方法n诱变剂的选择诱变剂的选择n了解诱变剂的性质、作用机理、使用方法了解诱变剂的性质、作用机理、使用方法n充分利用复合处理的协同效应充分利用复合处理的协同效应n一次复合因子处理后需经多次分离纯化。一次复合因子处理后需经多次分离纯化。n剂量的选择剂量的选择n一般诱变效应随剂量增高而增高,达到一定剂量后,一般诱变效应随剂量增高而增高,达到一定剂量后,再增大剂量诱变率反而下降。再增大剂量诱变率反而下降。n诱变剂量确定与出发菌株特性、诱变剂性质、实际诱变剂量确定与出发菌株特性、诱变剂性质、实际效果有关。效果有
20、关。n增效剂增效剂n影响诱变效果的因素影响诱变效果的因素n出发菌株出发菌株n出发菌株的生理状态出发菌株的生理状态n细菌细菌对数生长期对数生长期n真菌、放线菌真菌、放线菌幼年孢子幼年孢子n外部环境外部环境n诱变方法诱变方法n物理诱变物理诱变n化学诱变化学诱变n合适的诱变因素剂量合适的诱变因素剂量n微生物的诱变育种的步骤和方法微生物的诱变育种的步骤和方法n优良突变菌种的筛选优良突变菌种的筛选n初筛以量为主,复筛以质为主初筛以量为主,复筛以质为主n直接摇瓶筛选法直接摇瓶筛选法n数据直观可靠,与生产接近,但工作量大数据直观可靠,与生产接近,但工作量大n一般都应进行单菌分离一般都应进行单菌分离n注意及时
21、保藏注意及时保藏 n营养缺陷型菌株筛选营养缺陷型菌株筛选n与筛选营养缺陷型突变株有关的培养基与筛选营养缺陷型突变株有关的培养基n基本培养基(基本培养基(MM,minimal medium)“”n仅能满足某微生物的野生型菌株生长需要的最低成分组仅能满足某微生物的野生型菌株生长需要的最低成分组合培养基。合培养基。n完全培养基(完全培养基(CM,complete medium)“”n满足一切营养缺陷型菌株营养需要的组合培养基。满足一切营养缺陷型菌株营养需要的组合培养基。n补充培养基(补充培养基(SM,supplemental medium)n只能满足相应的营养缺陷型生长需要的组合培养基。补只能满足相
22、应的营养缺陷型生长需要的组合培养基。补充培养基的符号可根据加入的是充培养基的符号可根据加入的是A或或B等代谢物而分别等代谢物而分别用用A或或B等来表示。等来表示。n营养缺陷型菌株筛选方法营养缺陷型菌株筛选方法获得野生型菌株获得野生型菌株诱变剂处理诱变剂处理淘汰野生型淘汰野生型检检出营养缺陷型出营养缺陷型鉴定缺陷型鉴定缺陷型n中间培养:完全培养基或补充培养基中间培养:完全培养基或补充培养基n淘汰野生型菌株淘汰野生型菌株n抗生素法、菌丝过滤法、差别杀菌法、饥饿法抗生素法、菌丝过滤法、差别杀菌法、饥饿法n营养缺陷型检出营养缺陷型检出n夹层培养法、限量补充培养法、逐个检出法、影印夹层培养法、限量补充培
23、养法、逐个检出法、影印接种法接种法夹层培养法夹层培养法影印接种法影印接种法n确定生长谱确定生长谱三、基因重组和微生物育种三、基因重组和微生物育种n基因重组(基因重组(gene recombination)n两个独立基因组内的遗传基因通过一定的途径两个独立基因组内的遗传基因通过一定的途径转移到一起,经过遗传分子间的重新组合,形转移到一起,经过遗传分子间的重新组合,形成新遗传基因组的过程。成新遗传基因组的过程。n核酸分子水平核酸分子水平上的杂交上的杂交n重组可使生物体在未发生突变的情况下,产生重组可使生物体在未发生突变的情况下,产生新遗传型的个体。新遗传型的个体。n基因重组的方式基因重组的方式n原
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