第1章-蛋白质的结构与功能优秀PPT.ppt
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1、目目 录录目目 录录目目目目 录录录录第一章第一章 蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能其次章其次章 核酸的结构与功能核酸的结构与功能第三章第三章 糖复合物糖复合物第四章第四章 酶和维生素酶和维生素第五章第五章 糖代谢糖代谢第六章第六章 生物氧化生物氧化第七章第七章 脂类代谢脂类代谢第八章第八章 氨基酸代谢氨基酸代谢第九章第九章 核苷酸代谢核苷酸代谢第十章第十章 物质代谢的联系与调整物质代谢的联系与调整第十一章第十一章 血液生物化学血液生物化学第十二章第十二章 肝胆生物化学肝胆生物化学第十三章第十三章 DNA的生物合成的生物合成第十四章第十四章 RNA的生物合成的生物合成第十五章第十五章 蛋白
2、质生物合成蛋白质生物合成第十六章第十六章 基因表达调控基因表达调控第十七章第十七章 细胞信息转导细胞信息转导第十八章第十八章 细胞增殖、分化与调亡细胞增殖、分化与调亡的分子基础的分子基础第十九章第十九章 分子生物学常用技术分子生物学常用技术其次十章其次十章 基因工程基因工程其次十一章其次十一章 基因诊断与基因治疗基因诊断与基因治疗其次十三章其次十三章 基因组学与后基因组基因组学与后基因组学学目目 录录蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能第第 一一 章章Structure and Function of Protein目目 录录一、什么是蛋白质一、什么是蛋白质?蛋蛋白白质质(protein)是是
3、由由很很多多氨氨基基酸酸(amino acids)通通过过肽肽键键(peptide bond)相连形成的高分子含氮化合物。相连形成的高分子含氮化合物。Introduction目目 录录二、蛋白质的生物学重要性二、蛋白质的生物学重要性1.蛋白质是生物体重要组成成分蛋白质是生物体重要组成成分分分布布广广:全全部部器器官官、组组织织都都含含有有蛋蛋白白质质;细胞的各个部分都含有蛋白质。细胞的各个部分都含有蛋白质。含含量量高高:蛋蛋白白质质是是细细胞胞内内最最丰丰富富的的有有机机分分子子,占占人人体体干干重重的的45,某某些些组组织织含含量量更更高高,例例如如脾脾、肺肺及及横横纹纹肌肌等等高高达达80
4、。三聚氰胺三聚氰胺目目 录录1 1)作为生物催化剂(酶)作为生物催化剂(酶)2 2)代谢调整作用(凝血因子等)代谢调整作用(凝血因子等)3 3)免疫爱护作用(抗体)免疫爱护作用(抗体)4 4)物质的转运和存储(激素)物质的转运和存储(激素)5 5)运动与支持作用(胶原)运动与支持作用(胶原)6 6)参与细胞间信息传递(转录因子)参与细胞间信息传递(转录因子)2.蛋白质具有重要的生物学功能蛋白质具有重要的生物学功能3.氧化供能氧化供能 酶的作用下氧化生成酶的作用下氧化生成ATP目目 录录蛋蛋 白白 质质 的的 分分 子子 组组 成成The Molecular Component of Prote
5、in第第 一一 节节目目 录录 组成蛋白质的元素组成蛋白质的元素主要有主要有C、H、O、N和和S。有些蛋白质含有少量有些蛋白质含有少量磷磷或金属元素或金属元素铁、铜、铁、铜、锌、锰、钴、钼锌、锰、钴、钼,个别蛋白质还含有,个别蛋白质还含有碘碘。酪蛋白(含酪蛋白(含P 0.08),血红蛋白(,血红蛋白(Fe),),血蓝蛋白(血蓝蛋白(Cu),锌指蛋白、唾液蛋白(),锌指蛋白、唾液蛋白(Zn),精氨酸酶(,精氨酸酶(Mn)。)。目目 录录 各种蛋白质的含氮量很接近,平均为各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16。由由于于体体内内的的含含氮氮物物质质以以蛋蛋白白质质为为主主,因因此此,只只要要测测定定生
6、生物物样样品品中中的的含含氮氮量量,就就可可以以依依据据以以下公式推算出蛋白质的大致含量:下公式推算出蛋白质的大致含量:100克样品中蛋白质的含量克样品中蛋白质的含量(g%)=每克样品含氮克数每克样品含氮克数 6.251001/16%蛋白质元素组成的特点蛋白质元素组成的特点目目 录录一、氨基酸一、氨基酸 组成蛋白质的基本单位组成蛋白质的基本单位存存在在自自然然界界中中的的氨氨基基酸酸有有300余余种种,但但组组成成人人体体蛋蛋白白质质的的氨氨基基酸酸仅仅有有20种种(编编码码氨氨基基酸酸),且且均均属属 L-氨氨基基酸酸(甘氨酸除外)。(甘氨酸除外)。目目 录录H甘氨酸甘氨酸CH3丙氨酸丙氨酸
7、L-L-氨基酸的通式氨基酸的通式R目目 录录1.非极性疏水性氨基酸非极性疏水性氨基酸2.极性中性氨基酸极性中性氨基酸3.酸性氨基酸酸性氨基酸4.碱性氨基酸碱性氨基酸(一)氨基酸的分类(一)氨基酸的分类*20*20种氨基酸的英文名称、缩写符号及分类如下种氨基酸的英文名称、缩写符号及分类如下:目目 录录甘氨酸甘氨酸 glycine Gly G 5.97丙氨酸丙氨酸 alanine Ala A 6.00缬氨酸缬氨酸 valine Val V 5.96亮氨酸亮氨酸 leucine Leu L 5.98 异亮氨酸异亮氨酸 isoleucine Ile I 6.02 苯丙氨酸苯丙氨酸 phenylalan
8、ine Phe F 5.48脯氨酸脯氨酸 proline Pro P 6.301.非极性疏水性氨基酸非极性疏水性氨基酸目目 录录目目 录录非极性疏水性氨基酸的特点非极性疏水性氨基酸的特点:这类氨基酸在水中的溶解度小,当这类氨基酸在水中的溶解度小,当R基趋于增基趋于增大时,其疏水作用也增加。大时,其疏水作用也增加。疏水作用强的氨基酸常处于蛋白质结构的内部,疏水作用强的氨基酸常处于蛋白质结构的内部,或在生物膜的疏水环境之中。或在生物膜的疏水环境之中。目目 录录色氨酸色氨酸 tryptophan Try W 5.89丝氨酸丝氨酸 serine Ser S 5.68酪氨酸酪氨酸 tyrosine Tr
9、y Y 5.66 半胱氨酸半胱氨酸 cysteine Cys C 5.07 蛋氨酸蛋氨酸 methionine Met M 5.74天冬酰胺天冬酰胺 asparagine Asn N 5.41 谷氨酰胺谷氨酰胺 glutamine Gln Q 5.65 苏氨酸苏氨酸 threonine Thr T 5.602.极性中性氨基酸极性中性氨基酸目目 录录目目 录录极性中性氨基酸的特点:极性中性氨基酸的特点:R基团上有基团上有OH、SH或酰胺基等极性基团,或酰胺基等极性基团,在中性水溶液中不解离,但有亲水性,易溶于在中性水溶液中不解离,但有亲水性,易溶于水。水。目目 录录天冬氨酸天冬氨酸 aspart
10、ic acid Asp D 2.97谷氨酸谷氨酸 glutamic acid Glu E 3.22赖氨酸赖氨酸 lysine Lys K 9.74精氨酸精氨酸 arginine Arg R 10.76组氨酸组氨酸 histidine His H 7.593.酸性氨基酸酸性氨基酸4.碱性氨基酸碱性氨基酸目目 录录目目 录录几种特殊氨基酸几种特殊氨基酸 脯氨酸脯氨酸(亚氨基酸)(亚氨基酸)目目 录录 半胱氨酸半胱氨酸 +胱氨酸胱氨酸二硫键二硫键-HH目目 录录非蛋白质氨基酸非蛋白质氨基酸 特点:不参与蛋白质的合成,出现在代谢过程中。如氨基丁酸、鸟氨酸、瓜氨酸等。目目 录录(二)氨基酸的理化性质(二
11、)氨基酸的理化性质1.两性解离及等电点两性解离及等电点氨基酸是两性电解质,其解离程度取决氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于所处溶液的酸碱度。于所处溶液的酸碱度。等电点等电点(isoelectric point,pI)在在某某一一pH的的溶溶液液中中,氨氨基基酸酸解解离离成成阳阳离离子子和和阴阴离离子子的的趋趋势势及及程程度度相相等等,成成为为兼兼性性离离子子,呈呈电电中中性性。此此时时溶溶液液的的pH值值称为该氨基酸的称为该氨基酸的等电点等电点。目目 录录 pH=pI+OH-pHpI+H+OH-+H+pHpI氨基酸的兼性离子氨基酸的兼性离子 阳离子阳离子阴离子阴离子pI2(pK1pK2)1目
12、目 录录2.紫外吸取紫外吸取 色氨酸、酪氨酸的色氨酸、酪氨酸的最大吸取峰在最大吸取峰在 275280 nm 旁边。旁边。大大多多数数蛋蛋白白质质含含有有这这两两种种氨氨基基酸酸残残基基,所所以以 测测 定定 蛋蛋 白白 质质 溶溶 液液280nm的的光光吸吸取取值值是是分分析析溶溶液液中中蛋蛋白白质质含含量量的的快速简便的方法。快速简便的方法。芳香族氨基酸的紫外吸取芳香族氨基酸的紫外吸取目目 录录3.茚三酮反应茚三酮反应 氨氨基基酸酸与与茚茚三三酮酮水水合合物物共共热热,茚茚三三酮酮被被还还原原,还还原原产产物物与与氨氨基基酸酸加加热热分分解解产产生生的的氨氨结结合合,再再与与另另一一分分子子
13、茚茚三三酮酮缩缩合合生生成成蓝蓝紫紫色色化化合合物物,其其最最大大吸吸取取峰峰在在570 nm处处。由由于于此此吸吸取取峰峰值值与与氨氨基基酸酸的的含含量量存存在在正正比比关系,因此可作为氨基酸定量分析方法。关系,因此可作为氨基酸定量分析方法。目目 录录二、肽键与肽二、肽键与肽*肽肽键键(peptide bond)是是由由一一个个氨氨基基酸酸的的-羧羧基基与与另另一一个个氨氨基基酸酸的的-氨氨基基脱脱水水缩缩合而形成的酰胺键。合而形成的酰胺键。(一)肽键和肽(一)肽键和肽(peptide)的结构的结构目目 录录+-HOH甘氨酰甘氨酸甘氨酰甘氨酸肽键 肽链中的氨基酸肽链中的氨基酸分子因为脱水缩分
14、子因为脱水缩合而基团不全,合而基团不全,被称为被称为氨基酸残氨基酸残基基(residue)。目目 录录*肽肽是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。*两分子氨基酸缩合形成两分子氨基酸缩合形成二肽二肽,三分子氨基酸,三分子氨基酸缩合则形成缩合则形成三肽三肽*肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团不全,被称为不全,被称为氨基酸残基氨基酸残基(residue)。*由由十个十个以内氨基酸相连而成的肽称为以内氨基酸相连而成的肽称为寡肽寡肽(oligopeptide),由更多的氨基酸相连形成的肽由更多的氨基酸相连形成的肽称称多肽多肽(p
15、olypeptide)。目目 录录N 末端:多肽链中有自由氨基的一端末端:多肽链中有自由氨基的一端C 末端:多肽链中有自由羧基的一端末端:多肽链中有自由羧基的一端书写时从书写时从N端在左,端在左,C端在右,氨基酸依次编号从端在右,氨基酸依次编号从N端起先。端起先。多肽链有两端多肽链有两端*多多肽肽链链(polypeptide chain)是是指指很很多多氨氨基基酸酸之间以肽键连接而成的一种结构。之间以肽键连接而成的一种结构。主链主链结构结构NCCNC C.连接于连接于C C上的各种残基统称为上的各种残基统称为侧链侧链。目目 录录N末端末端C末端末端牛核糖核酸酶牛核糖核酸酶目目 录录(二)(二)
16、几种生物活性肽(神经传导、代谢调几种生物活性肽(神经传导、代谢调整)整)1.谷胱甘肽谷胱甘肽(glutathione,GSH)目目 录录GSH过氧过氧化物酶化物酶H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSH还原酶还原酶NADPH+H+NADP+GSH的巯基具有还原性,是体内重要的还原剂,爱护蛋白的巯基具有还原性,是体内重要的还原剂,爱护蛋白质或酶分子中巯基免遭氧化,使蛋白质或酶处于活性状态。质或酶分子中巯基免遭氧化,使蛋白质或酶处于活性状态。GSH的巯基还有嗜核特性,的巯基还有嗜核特性,能与外源的嗜电子毒物如致癌能与外源的嗜电子毒物如致癌剂或药物等结合,从而阻断这些化合物与剂或药物等结合,从
17、而阻断这些化合物与DNA、RNA或蛋白或蛋白质结合,以爱护机体免遭毒物损害。质结合,以爱护机体免遭毒物损害。(氧化型(氧化型GSH)目目 录录 体内很多激素属寡肽或多肽 神经肽神经肽(neuropeptide)如脑啡肽(如脑啡肽(5肽)、肽)、内啡肽(内啡肽(31肽)、强啡肽(肽)、强啡肽(17 肽)肽)、孤啡肽(、孤啡肽(17肽)、肽)、P物质(物质(10肽)、神经肽肽)、神经肽Y等等2.多肽类激素及神经肽多肽类激素及神经肽催产素(催产素(9 9肽)肽)加压素(加压素(9 9肽)肽)促肾上腺皮质激素(促肾上腺皮质激素(3939)促甲状腺素释放激素(促甲状腺素释放激素(3 3)目目 录录3.3
18、.其他其他 有些抗生素也属于肽类或肽的衍生物,例如有些抗生素也属于肽类或肽的衍生物,例如短杆菌肽短杆菌肽S(gramicidin S)、多粘菌素)、多粘菌素E(polymyxin E)和放线菌素)和放线菌素D(actinomycin D)等。某些蕈产生()等。某些蕈产生(mushrooms)的剧毒毒素)的剧毒毒素也是肽类化合物,例如也是肽类化合物,例如-鹅膏蕈碱(鹅膏蕈碱(-amanitin),它能与真核生物的,它能与真核生物的RNA聚合酶聚合酶II坚坚固结合而抑制酶的活性。固结合而抑制酶的活性。目目 录录三、蛋白质的分类三、蛋白质的分类 *依据蛋白质组成成分依据蛋白质组成成分 单纯蛋白质单纯
19、蛋白质(核糖核酸酶、清蛋白、球蛋白、肌动蛋白)(核糖核酸酶、清蛋白、球蛋白、肌动蛋白)结合蛋白质结合蛋白质=蛋白质部分蛋白质部分+非蛋白质部分非蛋白质部分单纯蛋白质又依据理化性质及来源分为清蛋白(白蛋白)、单纯蛋白质又依据理化性质及来源分为清蛋白(白蛋白)、球蛋白、谷蛋白、醇溶谷蛋白、精蛋白、组蛋白、硬蛋白。球蛋白、谷蛋白、醇溶谷蛋白、精蛋白、组蛋白、硬蛋白。结合蛋白质结合蛋白质的辅基有:色素化合物、寡糖、脂类、磷酸、金的辅基有:色素化合物、寡糖、脂类、磷酸、金属离子、核酸。属离子、核酸。结合蛋白结合蛋白按其辅基的不同又分为核蛋白、脂蛋白、糖蛋白、按其辅基的不同又分为核蛋白、脂蛋白、糖蛋白、磷
20、蛋白、金属蛋白、色蛋白。磷蛋白、金属蛋白、色蛋白。类类目目 录录*依据蛋白质结构和溶解度分为:依据蛋白质结构和溶解度分为:纤维状蛋白(如胶原蛋白、弹性蛋白等,主纤维状蛋白(如胶原蛋白、弹性蛋白等,主要作为细胞坚实的支架或连接各细胞、组织要作为细胞坚实的支架或连接各细胞、组织或器官。)或器官。)球状蛋白(大多具有生理活性,如酶、转运球状蛋白(大多具有生理活性,如酶、转运蛋白、蛋白类激素、免疫球蛋白及补体等)蛋白、蛋白类激素、免疫球蛋白及补体等)膜蛋白(如酶、膜蛋白(如酶、7 7次跨膜的次跨膜的G G蛋白偶联受体、蛋白偶联受体、离子通道受体、激素受体等,是膜功能的主离子通道受体、激素受体等,是膜功
21、能的主要体现者。依据膜蛋白与脂分子的结合方式要体现者。依据膜蛋白与脂分子的结合方式分为整合蛋白、外周蛋白和膜锚定蛋白。)分为整合蛋白、外周蛋白和膜锚定蛋白。)*依据蛋白质的功能分为:依据蛋白质的功能分为:活性蛋白(多为球状蛋白,有识别功能。)活性蛋白(多为球状蛋白,有识别功能。)非活性蛋白(其爱护和支持作用的纤维状蛋白)非活性蛋白(其爱护和支持作用的纤维状蛋白)目目 录录蛋蛋 白白 质质 的的 分分 子子 结结 构构The Molecular Structure of Protein 第第 二二 节节目目 录录蛋白质的分子结构包括蛋白质的分子结构包括 一级结构一级结构(primary stru
22、cture)二级结构二级结构(secondary structure)三级结构三级结构(tertiary structure)四级结构四级结构(quaternary structure)高级结构高级结构(空间构象)(空间构象)目目 录录定义定义蛋白质的一级结构指多肽链中氨基酸的排列依次。蛋白质的一级结构指多肽链中氨基酸的排列依次。这种依次由基因的碱基序列所确定。这种依次由基因的碱基序列所确定。一、蛋白质的一级结构一、蛋白质的一级结构主要的化学键主要的化学键肽键,有些蛋白质还包括二硫键。肽键,有些蛋白质还包括二硫键。一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。一级结构是蛋白质空间构象和特异生
23、物学功能的基础。目目 录录多肽链一级结构测定的基本原则:多肽链一级结构测定的基本原则:Edman降解法;逆转录聚合酶链反应(降解法;逆转录聚合酶链反应(RTPCR)目目 录录二、蛋白质的二级结构二、蛋白质的二级结构蛋蛋白白质质分分子子中中某某一一段段肽肽链链的的局局部部空空间间结结构构,即即该该段段肽肽链链主主链链骨骨架架原原子子的的相相对对空空间位置间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。定义定义 主要的化学键主要的化学键:氢键氢键 目目 录录(一)肽单元(一)肽单元参参与与肽肽键键的的6个个原原子子C 1、C、O、N、H、C 2位位于于同同一一平平面面,C 1和
24、和C 2在在平平面面上上所所处处的的位位置置为为反反式式(trans)构构型型,此此同同一一平平面面上上的的6个个原原子子构构成成了了所所谓的肽单元谓的肽单元(peptide unit)。目目 录录 蛋白质二级结构的主要形式蛋白质二级结构的主要形式 -螺旋螺旋 (-helix)-折叠折叠 (-pleated sheet)-转角转角 (-turn)无规卷曲无规卷曲 (random coil)(二)(二)-螺旋螺旋目目 录录右手螺旋右手螺旋 目目 录录(三)(三)-折叠折叠 相邻两个肽单元折叠成相邻两个肽单元折叠成110o角,两个氨基酸残基占据角,两个氨基酸残基占据0.7nm的长度,形成一个重复单
25、元。的长度,形成一个重复单元。目目 录录(四)(四)-转角和无规卷曲转角和无规卷曲-转角:转角:肽段出现肽段出现180180回折时的结构。回折时的结构。无规卷曲无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。分肽链结构。其次个氨基酸残基其次个氨基酸残基常为脯氨酸。常为脯氨酸。目目 录录(五)模体(五)模体在很多蛋白质分子中,可发觉二个或在很多蛋白质分子中,可发觉二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象,被称为接近,形成一个特殊的空间构象,被称为模体或模序模体或模序(motif),也有人称其为超二级
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