医学统计学课件--生存分析第十七章.ppt
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1、医学统计学课件-生存分析第十七章 Still waters run deep.流静水深流静水深,人静心深人静心深 Where there is life,there is hope。有生命必有希望。有生命必有希望本章内容本章内容第一节第一节 生存分析的基本概念生存分析的基本概念第二节第二节 生存率的估计与生存曲线生存率的估计与生存曲线*第三节第三节 生存曲线的生存曲线的Log-rank检验检验第四节第四节 COX比例风险回归模型比例风险回归模型*第五节第五节 寿命表寿命表(不讲不讲)*要求掌握概念、方法、用途。要求掌握概念、方法、用途。11/7/20222医学统计学概概 述述临临床床上上疗疗效
2、效、预预后后的的评评价价常常用用疾疾病病的的结结局局指指标标:如如有有效效率率、治治愈愈率率、死死亡亡率率比比较较。对对于于短短期期内内能能明明确确治治疗疗效效果果的的疾疾病病是是适适用用的的。但但对对于于远远期疗效,上述指标的评价不全面。期疗效,上述指标的评价不全面。11/7/20223医学统计学例例 某病的疗效比较某病的疗效比较 治愈率治愈率(%)平均治愈时间平均治愈时间(月月)甲药甲药 80 20 乙药乙药 81 12 疗疗效效除除了了应应评评价价“结结局局”的的好好坏坏,结结局局所所经历时间长短也是评价疗效重要的指标。经历时间长短也是评价疗效重要的指标。11/7/20224医学统计学例
3、例2:两种方法对疾病的疗效两种方法对疾病的疗效方法方法 治疗人数治疗人数 生存人数生存人数 生存率生存率%甲方法甲方法 100 20 20乙方法乙方法 100 50 50经经2检验检验 p0.05,乙法预后优于甲法。,乙法预后优于甲法。假定:假定:1.观察期间疾病的死亡率不随时间变化。观察期间疾病的死亡率不随时间变化。2.研究对象观察时间长度相等。研究对象观察时间长度相等。11/7/20225医学统计学随访研究随访研究随访研究随访研究(follow-up study)是医学中常用前是医学中常用前瞻性研究瞻性研究.例例:两种方法肾移植病人术后肾的生存时间两种方法肾移植病人术后肾的生存时间和结局和
4、结局(生存率生存率)比较比较.例例:不同方法对某病人不同方法对某病人(癌症、反复发作疾病)癌症、反复发作疾病)生存时间生存时间(缓解时间缓解时间)与结局与结局(生存率生存率)比较比较.该类数据通过随访得到,称为随访资料。该类数据通过随访得到,称为随访资料。11/7/20226医学统计学随访研究资料随访研究资料 当研究事件(当研究事件(y)的结局是两分类数据)的结局是两分类数据(发发生,不发生生,不发生),并且结局与时间(,并且结局与时间(t)有关,)有关,如同时收集事件发生的时间(如同时收集事件发生的时间(t),该类数据),该类数据称为随访资料,分析该数据的统计方法用生称为随访资料,分析该数据
5、的统计方法用生存分析。存分析。生生存存分分析析是是将将“结结局局”与与“时时间间”两两个个因因素素结合一起研究的统计分析方法。结合一起研究的统计分析方法。11/7/20227医学统计学一、随访数据概念一、随访数据概念 1.分析的变量(分析的变量(y)1)结局事件:结局事件:指结局出现的特征,如疾病的死指结局出现的特征,如疾病的死亡、复发、发生亡、复发、发生(y=1或或0)。2)时间间隔变量)时间间隔变量 记为(记为(t)t=结局事件出现日期结局事件出现日期 事件的起始日期事件的起始日期 (起始日期可规定(起始日期可规定:如诊断、用药、手术日期等)如诊断、用药、手术日期等),t的单位:可用年、月
6、、周表示的单位:可用年、月、周表示 第一节第一节 生存分析的基本概念生存分析的基本概念11/7/20228医学统计学2.截尾数据截尾数据 观察过程中个体因其他原因未观察到明确的观察过程中个体因其他原因未观察到明确的结局,结局,称为截尾称为截尾或删失数据或删失数据(censored data)。)。截尾截尾原因有:原因有:失访,失访,退出研究,如其他原因死亡。退出研究,如其他原因死亡。研究研究时间结束,未出现结局事件。时间结束,未出现结局事件。截尾值截尾值(censored value):):时间(时间(t)=截尾截尾事件日期事件日期 起始事件日期起始事件日期记为记为t+。(例:。(例:10+月
7、)月)11/7/20229医学统计学3.生存数据的特点生存数据的特点1)完完全全数数据据:研研究究对对象象在在规规定定研研究究期期间间提提供供确确切的切的“时间和结局时间和结局”。2)截尾数据)截尾数据(t+):截尾数据虽然提供的信息不:截尾数据虽然提供的信息不完全,但提供了部分信息,如完全,但提供了部分信息,如 t=10+年年9年。年。3)生存数据的结果变量()生存数据的结果变量(Y)有两个:)有两个:时间(时间(t)值)值,t0 结局状态(结局状态(y)=“如死亡或截尾值如死亡或截尾值”11/7/202210医学统计学二二 资料的收集资料的收集(一)随访研究设计(一)随访研究设计1.明确研
8、究对象的起始事件时间,如手术日期等。明确研究对象的起始事件时间,如手术日期等。2.明确结局事件:如死亡或复发。明确结局事件:如死亡或复发。3.明确研究跨度时间:如明确研究跨度时间:如2000年至年至2005年结束。年结束。4.记录个体影响结果(记录个体影响结果(y)的其他自变量。)的其他自变量。11/7/202211医学统计学例:例:收集生存数据和影响预后的因素收集生存数据和影响预后的因素。某病不同药后随访记录(天)某病不同药后随访记录(天)预后因素预后因素 随访记录随访记录病例病例 性别性别 处理处理 开始开始 终止终止 是否是否 生存生存 号号 组组 日期日期 日期日期 死亡死亡 时间时间
9、1 1 A药药 98/07/12 98/11/29 1 1402 2 B药药 98/07/01 98/12/29 1 1603 1 A药药 98/08/22 98/11/29 0 99 4 2 B药药 98/10/20 98/11/25 车祸死亡车祸死亡 36 011/7/202212医学统计学(二)随访的方式(二)随访的方式1.全部观察对象同时接受不同处理(起点相同)全部观察对象同时接受不同处理(起点相同)随访方式:多见于动物实验(见图随访方式:多见于动物实验(见图17-1,a)2.观察对象在不同时间接受处理因素(起点不同)观察对象在不同时间接受处理因素(起点不同)随访方式:临床试验研究(见
10、图随访方式:临床试验研究(见图17-1,b)11/7/202213医学统计学起始事件时间起始事件时间如给药如给药0研究结研究结束时间束时间tOO为死亡为死亡O 为截尾为截尾动物实验随访数据(图动物实验随访数据(图17-1,a)11/7/202214医学统计学90年年91年年92年年93年(研究结年(研究结束)束)死亡死亡失访失访死亡死亡一批病人不同时间进入研究的随访资料一批病人不同时间进入研究的随访资料起点起点存活存活起点起点起点起点起点起点起点起点存活存活11/7/202215医学统计学资料整理和记录资料整理和记录某人研究手术方法治疗某人研究手术方法治疗23位肾上腺肿瘤病人的位肾上腺肿瘤病人
11、的生存时间(月)如下:生存时间(月)如下:1,3,5(3),),6(3),),7,8,10(2),),14+,17,19+,20+,22+,26+,31+,34,34+,44,59注注:()括号内的数为相同时间点的人数括号内的数为相同时间点的人数数据另一种记录数据另一种记录:对象编号对象编号 生存时间生存时间(t)结局状态结局状态(0为截尾为截尾值值)1 1 1 2 14 011/7/202216医学统计学(三)生存分析主要研究的内容(三)生存分析主要研究的内容1.统计描述:统计描述:计算不同时间点(计算不同时间点(t)的生存率,)的生存率,描述生存过程。描述生存过程。2.统计推断:统计推断:
12、检验不同处理方式的生存过程检验不同处理方式的生存过程有无统计差别有无统计差别.3.自变量(自变量(x)对生存时间()对生存时间(t)的关系)的关系:影:影响生存时间的危险因素分析响生存时间的危险因素分析.11/7/202217医学统计学第二节第二节 生存率的估计与生存曲线生存率的估计与生存曲线(一)描述生存资料的几个指标(一)描述生存资料的几个指标1.不同时间点生存率不同时间点生存率 2.生存曲线生存曲线3.中位生存时间中位生存时间11/7/202218医学统计学几个率概念几个率概念死亡率、死亡概率、生存概率、生存率死亡率、死亡概率、生存概率、生存率死亡率:表示在单位时间(年)内死亡发生死亡率
13、:表示在单位时间(年)内死亡发生的频率(年平均死亡水平)。的频率(年平均死亡水平)。11/7/202219医学统计学 死亡概率(死亡概率(F):在某时间段):在某时间段(t)开始存活的个体,开始存活的个体,死于死于(t+t)该时段内的可能性。该时段内的可能性。生存概率(生存概率(pi=1-F):):指某时间段开始存活的个体到该时间段结束指某时间段开始存活的个体到该时间段结束时仍存活的概率。时仍存活的概率。(17-1)死亡概率、生存概率死亡概率、生存概率11/7/202220医学统计学生存率(生存率(survival rate)称为生存函数称为生存函数 记为记为S(t)S(t):指观察对象从:指
14、观察对象从起始事件起始事件(如手术时间(如手术时间为为0点)点)开始开始,到,到t时刻仍存活的概率。常用时刻仍存活的概率。常用n年年生存率表示。生存率表示。时间时间ti,i=1,2,3n假设数据是完全数据,计算见例假设数据是完全数据,计算见例11/7/202221医学统计学例例:某病病人术后生存率某病病人术后生存率 生存生存 期初期初 死亡死亡 生存生存 死亡死亡 生存生存 生存率生存率 人数人数 人数人数 人数人数 概率概率 概率概率 0,1 100 10 90 0.1 0.9 0.901,2 90 10 80 0.11 0.89 0.802,3 80 20 60 0.25 0.75 0.6
15、0 11/7/202222医学统计学生存时间数据分析时整理示意图生存时间数据分析时整理示意图 死亡死亡 0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 年“t”表示从研究起点到结局出现时表示从研究起点到结局出现时间间t失访失访失访失访死亡死亡死亡死亡死亡死亡11/7/202223医学统计学生存率生存率S(t)的概率乘法估计的概率乘法估计 S(t)也称累计生存概率,)也称累计生存概率,t 时刻存活是时刻存活是t 时刻之前一直生存的累积。时刻之前一直生存的累积。概率乘法原理计算概率乘法原理计算(359页页)Pi 为某时间区间(为某时间区间(ti)的生存概率。假定个)的生存概率。假定个体在各
16、时段生存是独立。体在各时段生存是独立。(公式(公式17-2)11/7/202224医学统计学2.生存曲线生存曲线:(:(survival curve)指各时点(指各时点(t)为横轴)为横轴,生存率生存率S(t)为纵轴为纵轴,连接一起的曲线图。描述生存率在各时点连接一起的曲线图。描述生存率在各时点(t)的变化过程。的变化过程。3.半数生存期半数生存期(中位数生存时间)(中位数生存时间)即生存率为即生存率为0.5时对应的时间(时对应的时间(t),描述一),描述一组数据平均生存时间。组数据平均生存时间。注:生存时间(注:生存时间(t)是正偏态分布。)是正偏态分布。11/7/202225医学统计学甲手
17、术甲手术乙手术乙手术图图17-2 两种手术治疗方式术后病人生存曲线的比较两种手术治疗方式术后病人生存曲线的比较月月11/7/202226医学统计学(二)生存率估计的统计方法(二)生存率估计的统计方法(非参数方法)(非参数方法)1.小样本数据生存率计算小样本数据生存率计算*。用用 kaplan-Meier的乘积极限法(的乘积极限法(product-limit method,PL法)法)方法:方法:1)将生存时间)将生存时间t由小到大排列。截尾值排在完由小到大排列。截尾值排在完全数据后,例:全数据后,例:20,20+2)列出)列出t时刻死亡数(时刻死亡数(d)3)生存率估计用概率乘法原理生存率估计
18、用概率乘法原理例:例:17-1和表和表17-111/7/202227医学统计学例例17-1:某手术方法(甲法)治疗:某手术方法(甲法)治疗23例肾例肾上腺肿瘤病人后生存情况(讲义上腺肿瘤病人后生存情况(讲义358页)页)生存时间(生存时间(t,月),其中,月),其中“+”者为截尾数据者为截尾数据 1,3,5(3),),6(3),),7,8,10(2),14+,17,19+,20+,22+,26+,31+,34,34+,44,59计算生存率计算生存率s(t)和生存曲线)和生存曲线11/7/202228医学统计学表表17-1 甲种手术后病人生存率的计算方法甲种手术后病人生存率的计算方法时间时间(月
19、月)死亡死亡 期初期初 死亡死亡 生存生存 生存率生存率ti 人数人数 人数人数 概率概率 概率概率 1 1 23 0.043 0.957 0.9573 1 22 0.045 0.955 0.9145 3 21 0.143 0.857 0.7836 3 18 0.167 0.833 0.6527 1 15 0.067 0.933 0.6098 1 14 0.071 0.929 0.56510 2 13 0.154 0.846 0.47814+0 11 0.000 1.000 0.47811/7/202229医学统计学表表17-1资料甲手术描述指标资料甲手术描述指标(SPSS 软件软件)Surv
20、ival Standard 95%Confidence Survival Standard 95%Confidence Time error Interval Time error IntervalMean:24.23 4.99 (14.44,34.01)Mean:24.23 4.99 (14.44,34.01)Median:10.00 6.96 (.00,23.63)Median:10.00 6.96 (.00,23.63)表表17-2资料乙手术描述指标资料乙手术描述指标 Survival Standard 95%Confidence Survival Standard 95%Confide
21、nce Time Err Interval Time Err Interval Mean 7.80 1.18 (5.50,10.10)Mean 7.80 1.18 (5.50,10.10)Median 6.00 2.98 (0.16,11.84)Median 6.00 2.98 (0.16,11.84)11/7/202230医学统计学2.大样本资料的生存分析方法大样本资料的生存分析方法寿命表法寿命表法(Life-table method)表表17-3 2418例男性心绞痛病人生存率情况例男性心绞痛病人生存率情况术后术后 死亡死亡 截尾截尾 期初期初 校正校正 生存生存 生存率生存率年数年数 人
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- 医学 统计学 课件 生存 分析 第十七
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