中山医科大学医学文献检索学教研室ppt课件.ppt
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1、中山医科大学医学文献检索学教研室ppt课件 Still waters run deep.流静水深流静水深,人静心深人静心深 Where there is life,there is hope。有生命必有希望。有生命必有希望信息检索 信息加工(存储)-信息检索 计算机信息检索就是将大量的文献资料或数据进行加工整理,按一定格式存贮在机读载体上,建成机读数据库,利用计算机对机读型数据库进行检索的信息检索方式。信息组织的方法即信息加工、标引等(主题词、分类.)-提高查全率、查准率 对于信息用户来讲,计算机检索也就是利用电子计算机对机读型的数据库进行检索。我们这次课向大家介绍二类:国际联机检索光盘检索国
2、际联机检索 p191一、国际联机检索定义 国际联机检索是指商业性的计算机数据库检索服务机构(亦称联机卖主)通过国际(卫星)通讯网络,为世界各地的用户终端提供人机对话式的检索的服务方式。*国际联机检索定义 国际联机检索是指用户利用终端设备,通过国际(卫星)通讯网络,与世界上任何国家的大型计算机检索系统的主机联结,从而检索世界各国存储在计算机数据库中的信息资料。二、国际联机检索实现方法通过通过INTERNETINTERNET实现国际联机检索实现国际联机检索三、国际联机检索系统概况MEDLARS、DIALOG、BRS、ORBIT、ESA-IRS、STNP192目前比较适合于医学高等院校使用的国际联机
3、检索系统主要有两个:、医学文献分析与检索系统 (Medical Literature Analysis and Retrieval System,MEDLARS)、DIALOG系统MEDLARS系统是美国国立医学图书馆研制、发行的当今世界上最具权威性的医学文献数据库检索系统。目前拥有40多个数据库,收录自1965年以来生物医学书刊中近1300万条书目和文献题录,内容涉及生物医学的各个领域,约有4万多个国内外联机用户以及包括中国 在 内 的 16个 国 际 检 索 中 心。P242(PRE、OLD)MEDLINE、CANCERLIT、HSTAR、TOXLINE.Dialog系统是由Dialog公
4、司研制、发行的当前世界上最大的一个联机检索系统,拥有自然科学、经济、社会科学等方面的文档(数据库)近400个,文献记录总数达亿篇,占世界计算机文献存储量的50%以上。P193 BA、CA、EM.四、国际联机检索系统的服务 方式、联机追溯检索(Retrospective Search,RS)、定题情报检索(SDI)、联机订购原文五、国际联机检索的优缺点优点:检索速度快,效率高;检索范围广泛、全面;检索途径多,方便、灵活;检索内容新,实时性强;检索辅助功能完善(人机对话、检索结果输出方式灵活,输出格式多样等)。缺点:检索费用高;对检索系统及其文档(数据库)的收录、标引、特点等问题较难了解、熟悉;检
5、索技术和技巧不易掌握。P254 AU P255 PRT P257 MeSH 光盘检索 P199一、光盘定义 光盘:即高密度光盘(Compact Disc)是近代发展起来不同于磁性载体的光学存储介质,用聚焦的氢离子激光束处理记录介质的方法存储和再生信息,又称激光光盘。光盘存储技术研究始于60年代,真正获得发展在70年代。1972年用聚焦的氢离子激光束在记录介质上烧蚀微孔的方法录制电视节目,用氢氖激光扫描信息轨道,按反射强度的变化再现已录的信息。1978年激光电视唱片正式在市场出售。1982年出现了记录带有声音的静止图象的光盘,1984年日本研制出可反复擦写的光盘。目前,借助于各种软、硬件,光盘已
6、可以达到数据、图象、声音的综合处理。二、光盘的种类光盘按功能可分为三类:只读式光盘(Compact Disc-Read Only Memory,CD-ROM)写读光盘(Write Once Read Memory,WORM)可擦写光盘(Optical Random Access Memory,ORAM)只读式光盘是第一代光盘,信息一旦录入,用户无法改变盘片上的内容,也无法录入自己的信息。这种光盘目前技术上最 成 熟,应 用 也 最 广 泛。写读光盘是第二代光盘,不仅可以读出已录入的信息,而且可在空白的盘片空间追加录入新的信息,但与只读光盘一样,信 息 一 旦 录 入,则 不 能 改 变。可擦写
7、光盘是第三代光盘,同磁盘一样,可以删除、改写已录入的信息,也可以在盘片空间允许的情况下录入新的信息。光盘-光盘驱动器三、光盘的结构 光盘由三层构成:即盘基、记录层、防护层。盘基由有机玻璃、聚酯树酯等材料制作。记录层是光盘的核心,由碲合金或碲与氧化碲混合记录薄膜等材料组成。防护层由塑料、有机玻璃等材料构成,用以保护盘面上信息。盘片记录层上有稳定间距(1.6微米)的螺旋线(信息轨道),存储信息时,激光束聚焦在记录层的螺旋线上,使其局部升温,形成凹坑,一连串的凹坑形成信息微痕。螺旋线上没有经过激光刻蚀的平面和经过刻蚀的凹坑对应于计算机二进制编码的和,从而实现信息的记录。读取信息时,光盘驱动器中很细的
8、激光束沿盘面的螺旋线轨道扫描,轨道的平面和凹坑部分反射到探测装置上,经光电转换成为计算机可识别的二进制信号,完成信息的读取和检索。四、光盘的特点1.存储容量大;2.稳定性与数据保存性好,坚固耐用;3.保存时间长;光盘信息的读取采用非接触式激光扫描,多次读取不会象磁盘、磁带那样磨损盘面,且数据信息为物理性存储,不受电磁场、光照、气温、湿度等的影响、此外,由于盘面上有保护层,密封性好,不受尘土、手印等的损害。4.结构小巧,性能价格比高。五、光盘检索系统 p203(一)光盘检索系统定义及构成 光盘检索系统即利用光盘驱动器和光盘数据库及其检索软件,结合计算机建立起来的信息检索系统。光盘检索系统的构成包
9、括硬件和软件两部分。(二)光盘检索系统特点光盘存储容量大。使用方便,不须通讯联系,不受时间限制。操作技能易掌握。价格低,使用寿命长,用户易接受。机房无特别要求,投资少。信息获得比国际联机慢,(回溯检索须多次换盘)。(三)数据库的定义 p184 计算机把大量的数据项有机地集中起来存放在数据文件中,构成一个存放数据的整体,即数据库。记录记录 各项数据以构成一张横竖对齐的二维表格形式存放于数据文件中,一个以二维表格形式存放在磁盘上的数据文件称为数据库文件(库文件)。字段字段 所谓数据库,是由一个或有联系的多个数据库文件组成的集合。此类数据库是以数据项之间的二维关系来处理数据的,也称为关系型数据库。(
10、四)检索策略的制订(四)检索策略的制订 p190分析检索课题所包含的概念分析检索课题所包含的概念对每个概念进行检索对每个概念进行检索用逻辑运算式表达课题的检索要求用逻辑运算式表达课题的检索要求涉及的问题:逻辑运算、概念的检索涉及的问题:逻辑运算、概念的检索例:有关例:有关PCR诊断病毒性肝炎的文献诊断病毒性肝炎的文献(五)计算机检索的运算符 1、逻辑运算符逻辑与逻辑或逻辑非P188病毒性肝炎病毒性肝炎 AND 聚合酶链反应聚合酶链反应鼻咽肿瘤鼻咽肿瘤 OR 肺肿瘤肺肿瘤肝炎肝炎 NOT 病毒性肝炎病毒性肝炎肝炎肝炎 AND NOT 病毒性肝炎病毒性肝炎2、位置算符、Liver near can
11、cerhepatitis with treatment(hepatitis-diagnosis)(liver cancer-treatment)3、字段限定符、字段限定符in 对某一指定数据项进行检索对某一指定数据项进行检索 如:如:hepatitis in TI=用于限定性字段的检索用于限定性字段的检索 如:如:LA=ENGLISH4、通配符、通配符 *代替任意一个或多个字符代替任意一个或多个字符 如:如:postoperati*in AB5、范围运算、范围运算=,=如:如:PY=1997;PY1996;PY=1994(六)关键词与主题词(六)关键词与主题词 MeSH词表词表p23主题词主题
12、词以以规规范范化化的的词词汇汇来来表表达达文文献献内内容容的的主主题题,这种词汇叫主题词这种词汇叫主题词(叙词叙词)。医学主题词表医学主题词表美美国国国国立立医医学学图图书书馆馆邀邀请请专专家家、学学者者汇汇集集约约16,00016,000多多个个医医学学主主题题词词并并加加以以整整理理,使使之之规规范范化化,编编制制成成的的一一个个表表,即即医医学学主主题题词词表表(Medical(Medical Subject Subject HeadingsHeadings,简称,简称Mesh)Mesh)。MeSH MeSH 附附有有各各种种参参照照和和注注释释,它它是是对对生生物医学文献进行标引和检索
13、的依据。物医学文献进行标引和检索的依据。医学主题词表的作用医学主题词表的作用 在在标标引引人人员员将将情情报报输输入入检检索索系系统统以以及及检检索索者者(用用户户)利利用用系系统统内内情情报报这这两两个个过过程程中中,以以主主题题词词作作为为标标准准用用语语,使使标标引引和和检检索索之之间间用用语语一一致致,达达到到最最佳佳检检索索效效果果。在在手手工工和和联联机机检检索索前前,查查阅阅医医学学主主题题词词表表是是制制定定检检索索策策略略的的重要依据。重要依据。cancer、carcinoma、tumor、neoplasms医学主题词表主要包括下面三部分医学主题词表主要包括下面三部分 主题词
14、变更表主题词变更表 、年新增主题词、年新增主题词、年删去主题词、年删去主题词、年累积新增主题词、年累积新增主题词 字顺表字顺表(Alphabetic List)(Alphabetic List)字字顺顺表表将将主主题题词词、次次要要主主题题词词(非非主主题题词词)、款目词、款目词(非主题词非主题词)按字顺统一排列。按字顺统一排列。范范畴畴表表(Categories(Categories and and Subcategories)Subcategories)选择规范化主题词要注意的几个问题选择规范化主题词要注意的几个问题1.1.对对于于自自然然医医学学语语汇汇中中同同义义词词、近近义义词词、学
15、学名名与与俗名的处理俗名的处理例:例:Cancer *Neoplasms (Cancer *Neoplasms (近义词近义词)German Meales *Rubella (German Meales *Rubella (同义词同义词)Vitaman C *Ascorbic Acid(Vitaman C *Ascorbic Acid(学、俗名学、俗名)Apoplexy *Cerbrovascular Disorders(Apoplexy *Cerbrovascular Disorders(同义词同义词)Deoxyribonucleic Acid *DNA (Deoxyribonucleic
16、Acid *DNA (繁、简称繁、简称)有有“*”者为者为IMIM规范化主题词。规范化主题词。2.2.倒置主题词倒置主题词倒置主题词就是把复合主题词中被修倒置主题词就是把复合主题词中被修饰的名词作为标目,放前面。定语放在名饰的名词作为标目,放前面。定语放在名词之后,并用逗号分开。这样,可使医学词之后,并用逗号分开。这样,可使医学概念相近的族性词汇集中在同一主题下,概念相近的族性词汇集中在同一主题下,便于检索。便于检索。例:例:SHOCK,CARDIOGENIC (SHOCK,CARDIOGENIC (心源性休克心源性休克)SHOCK,HEMORRHAGICSHOCK,HEMORRHAGIC(出
17、血性休克出血性休克)SHOCK,SEPTICSHOCK,SEPTIC(败血性休克败血性休克)SHOCK,SORGICALSHOCK,SORGICAL(外科性休克外科性休克)SHOCK,TRAUMATICSHOCK,TRAUMATIC(创伤性休克创伤性休克)例中的复合主题词经倒置后,各种有关例中的复合主题词经倒置后,各种有关休克的文献都集中在休克的文献都集中在SHOCKSHOCK这个主题词下。这个主题词下。3.3.主题词与副主题词的组配使用主题词与副主题词的组配使用为了使主题词的专指性更强,主题词要与副主为了使主题词的专指性更强,主题词要与副主题词组配使用。题词组配使用。副主题词又称限定词副主题
18、词又称限定词(Qualifiers)(Qualifiers),用它将某,用它将某一主题词的概念进行复分,使主题词具有更高的专一主题词的概念进行复分,使主题词具有更高的专指性。指性。在一个主题词下面往往收录了许多篇文献,为在一个主题词下面往往收录了许多篇文献,为了让读者不必花太多时间从关到尾一题不漏地看所了让读者不必花太多时间从关到尾一题不漏地看所有题录,就在每一个主题词下面又用若干副主题词,有题录,就在每一个主题词下面又用若干副主题词,以便把内容相近的文献集中到相应的副主题词下面,以便把内容相近的文献集中到相应的副主题词下面,让读者有目的地选择查阅。让读者有目的地选择查阅。1989-1990年
19、年IM使用的副主题词是使用的副主题词是77个,个,1991-1994年是年是80个。个。副主题词副主题词(Subheadings)(Subheadings)脑肿瘤的外科手术脑肿瘤的外科手术 Brain Neoplasms/Surgery Brain Neoplasms/Surgery心血管疾病的死亡率心血管疾病的死亡率 Cardiovascular Disease/Cardiovascular Disease/MortalityMortality风湿热的病因学风湿热的病因学 Rheumatic Fever/Etiology Rheumatic Fever/Etiology病毒性肝炎引起的肝癌的
20、治疗病毒性肝炎引起的肝癌的治疗肝炎,病毒性,人肝炎,病毒性,人肝肿瘤肝肿瘤治疗治疗肝炎,病毒性,人肝炎,病毒性,人/原发性原发性肝肿瘤肝肿瘤/治疗治疗肝肿瘤肝肿瘤/继发性继发性 并非每一个副主题词都能与任何一个并非每一个副主题词都能与任何一个主题词组配。使用每个副主题词应根据主题词组配。使用每个副主题词应根据MeSHMeSH树形结构标明的范畴恰当地与主题词树形结构标明的范畴恰当地与主题词组配。如:组配。如:Diagnosis(CDiagnosis(C,F3)F3),是指,是指DiagnosisDiagnosis只限于只限于与与C C类类(疾病类疾病类),F3F3类类(行为与精神疾病行为与精神疾
21、病)组组配。配。如词表没有合适的副主题词,则不要如词表没有合适的副主题词,则不要擅自增加或随意勉强搭配。这时,可不用擅自增加或随意勉强搭配。这时,可不用副主题词副主题词(或选用一个等义主题词或选用一个等义主题词)。范畴表范畴表(Categories and Subcategories)(Categories and Subcategories)范范畴畴表表又又称称树树形形结结构构(Tree(Tree Structure)Structure)。此此表表是是将将字字顺顺表表中中的的主主题题词词(主主要要叙叙词词)、次次要要叙叙词词按按其其学学科科性性质质、词词义义范范围围的的上上下下类类属属及及派
22、派生生关关系系,分分别别划划为为1515大大类类。依依次次用用A-NA-N,Z Z代代表表。在在1515个个类类目目中中,有有9 9类类又又分分若若干干子子类类目目,加加用用数数字字代代表表,子子类类目目共共有有101101个个。子子类类目目下下面面又又分分若若干干更更小小的的类类目目,这这就就是是通通常常供供检检索索使使用用的的主主题题词词,共共一一万万六六千千多多个个,都都按按其其医医学学概概念念的的性性质质分分别别列列入入各各自自所所属属的的类目之下。类目之下。GASTROINTESTINAL NEOPLASMS GASTROINTESTINAL NEOPLASMS 胃肠肿瘤胃肠肿瘤 I
23、NTESTINAL NEOPLASMS INTESTINAL NEOPLASMS 肠肿瘤肠肿瘤 CECAL NEOPLASMS CECAL NEOPLASMS 盲肠肿瘤盲肠肿瘤 APPENDICEAL NEOPLASMS APPENDICEAL NEOPLASMS 阑尾肿瘤阑尾肿瘤 COLONIC NEOPLASMS COLONIC NEOPLASMS 结肠肿瘤结肠肿瘤 COLONIC POLYPS COLONIC POLYPS 结肠息肉结肠息肉 .DUODENAL NEOPLASMS DUODENAL NEOPLASMS 十二指肠肿瘤十二指肠肿瘤 ILEAL NEOPLASMS ILEAL
24、NEOPLASMS 回肠肿瘤回肠肿瘤 .字顺表与树形结构字顺表与树形结构(范畴表范畴表)在在功能上的关系及如何利用功能上的关系及如何利用 查查全全率率与与查查准准率率是是文文献献检检索索的的两两大大要要素素,这这两两者者关关系系到到词词表表的的科科学学设设计计。医医学学主主题题词词表表通通过过“字字顺顺表表”反反映映主主题题词词之之间间的的横横向向关关系系,通通过过“树树状状结结构构”揭揭示示词词与与词词之之间间的的纵纵向向隶隶属属关关系系。两两个个表表相相互互配配合合,形形成成一一个个功功能能完完善善的的检检索索体体系系,以以满满足足检检索索者者对对文文献献查查准准与与查查全全要要求。求。主
25、题词标引原则主题词标引原则 p281、一般原则、一般原则(1)客观性原则)客观性原则(文献内容的实质)文献内容的实质)*卡那霉素对链球菌代谢的作用卡那霉素对链球菌代谢的作用 -卡那霉素治疗链球菌感染的疗效分析卡那霉素治疗链球菌感染的疗效分析卡那霉素卡那霉素/药理学、链球菌属药理学、链球菌属/代谢、链球菌代谢、链球菌属属/药物作用、(卡那霉素药物作用、(卡那霉素/治疗应用、肺炎治疗应用、肺炎球菌感染球菌感染/药物疗法)药物疗法)(2)准确性原则)准确性原则 准确准确提炼提炼主题(隐含的主题)主题(隐含的主题)急性心肌梗塞用链激酶等治疗后美托洛急性心肌梗塞用链激酶等治疗后美托洛尔作用尔作用-心肌梗
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