沈阳药科大学生物化学课件——第3章 酶.ppt
《沈阳药科大学生物化学课件——第3章 酶.ppt》由会员分享,可在线阅读,更多相关《沈阳药科大学生物化学课件——第3章 酶.ppt(89页珍藏版)》请在淘文阁 - 分享文档赚钱的网站上搜索。
1、目目 录录Enzyme第第 三三 章章 酶酶目目 录录酶的概念酶的概念n n目前将生物催化剂分为两类目前将生物催化剂分为两类目前将生物催化剂分为两类目前将生物催化剂分为两类酶酶酶酶 、核酶(核酶(核酶(核酶(脱氧核酶)脱氧核酶)脱氧核酶)脱氧核酶)n酶是一类由活细胞产生的,酶是一类由活细胞产生的,对其特异底物对其特异底物具有高效催化作用的具有高效催化作用的蛋白质。蛋白质。目目 录录酶学研究简史酶学研究简史n n公元前两千多年,我国已有酿酒记载。公元前两千多年,我国已有酿酒记载。公元前两千多年,我国已有酿酒记载。公元前两千多年,我国已有酿酒记载。n n一一一一百百百百余余余余年年年年前前前前,P
2、asteurPasteur认认认认为为为为发发发发酵酵酵酵是是是是酵酵酵酵母母母母细细细细胞胞胞胞生生生生命命命命活活活活动动动动的的的的结果。结果。结果。结果。n n18771877年,年,年,年,KuhneKuhne首次提出首次提出首次提出首次提出EnzymeEnzyme一词。一词。一词。一词。n n18971897年年年年,BuchnerBuchner兄兄兄兄弟弟弟弟用用用用不不不不含含含含细细细细胞胞胞胞的的的的酵酵酵酵母母母母提提提提取取取取液液液液,实实实实现现现现了发酵。了发酵。了发酵。了发酵。n n19261926年,年,年,年,SumnerSumner首次从刀豆中提纯出脲酶结
3、晶。首次从刀豆中提纯出脲酶结晶。首次从刀豆中提纯出脲酶结晶。首次从刀豆中提纯出脲酶结晶。n n19821982年年年年,CechCech首首首首次次次次发发发发现现现现RNARNA也也也也具具具具有有有有酶酶酶酶的的的的催催催催化化化化活活活活性性性性,提提提提出出出出核酶核酶核酶核酶(ribozymeribozyme)的概念。的概念。的概念。的概念。n n19951995年年年年,Jack Jack W.SzostakW.Szostak研研研研究究究究室室室室首首首首先先先先报报报报道道道道了了了了具具具具有有有有DNADNA连连连连接酶活性接酶活性接酶活性接酶活性DNADNA片段,称为片段
4、,称为片段,称为片段,称为脱氧核酶脱氧核酶脱氧核酶脱氧核酶(deoxyribozymedeoxyribozyme)。目目 录录第一节第一节酶的分子结构与功能酶的分子结构与功能The Molecular Structure and Function of Enzyme 目目 录录酶的不同形式酶的不同形式n n单体酶单体酶单体酶单体酶(monomericmonomeric enzyme)enzyme):仅具有三级结仅具有三级结仅具有三级结仅具有三级结构的酶。构的酶。构的酶。构的酶。n n寡聚酶寡聚酶寡聚酶寡聚酶(oligomericoligomeric enzyme)enzyme):由多个相同或不
5、由多个相同或不由多个相同或不由多个相同或不同亚基以非共价键连接组成的酶。同亚基以非共价键连接组成的酶。同亚基以非共价键连接组成的酶。同亚基以非共价键连接组成的酶。n n多酶体系多酶体系多酶体系多酶体系(multienzymemultienzyme system)system):由几种不同由几种不同由几种不同由几种不同功能的酶彼此聚合形成的多酶复合物。功能的酶彼此聚合形成的多酶复合物。功能的酶彼此聚合形成的多酶复合物。功能的酶彼此聚合形成的多酶复合物。n n多功能酶多功能酶多功能酶多功能酶(multifunctional enzyme)(multifunctional enzyme)或串联酶或串
6、联酶或串联酶或串联酶(tandem enzyme)(tandem enzyme):一些多酶体系在进化过程一些多酶体系在进化过程一些多酶体系在进化过程一些多酶体系在进化过程中由于基因的融合,多种不同催化功能存在中由于基因的融合,多种不同催化功能存在中由于基因的融合,多种不同催化功能存在中由于基因的融合,多种不同催化功能存在于一条多肽链中,这类酶称为多功能酶。于一条多肽链中,这类酶称为多功能酶。于一条多肽链中,这类酶称为多功能酶。于一条多肽链中,这类酶称为多功能酶。目目 录录一、一、酶的分子组成酶的分子组成蛋白质部分:酶蛋白蛋白质部分:酶蛋白 (apoenzyme)辅助因子辅助因子(cofacto
7、r)金属离子金属离子小分子有机化合物小分子有机化合物全酶全酶(holoenzyme)n n结合酶结合酶结合酶结合酶 (conjugated enzyme)(conjugated enzyme)n n单纯酶单纯酶单纯酶单纯酶 (simple enzyme)目目 录录*各部分在催化反应中的作用各部分在催化反应中的作用qq酶蛋白酶蛋白酶蛋白酶蛋白决定反应的特异性决定反应的特异性决定反应的特异性决定反应的特异性qq辅助因子辅助因子辅助因子辅助因子决定反应的种类与性质决定反应的种类与性质决定反应的种类与性质决定反应的种类与性质金属酶金属酶(metalloenzyme)金属离子与酶结合紧密,提取过程中不易
8、丢金属离子与酶结合紧密,提取过程中不易丢失。失。金属激活酶金属激活酶(metal-activated enzyme)金属离子为酶的活性所必需,但与酶的结合金属离子为酶的活性所必需,但与酶的结合不甚紧密。不甚紧密。目目 录录金属离子的作用金属离子的作用稳定酶的构象;稳定酶的构象;参与催化反应,传递电子;参与催化反应,传递电子;在酶与底物间起桥梁作用;在酶与底物间起桥梁作用;中和阴离子,降低反应中的静电斥力等。中和阴离子,降低反应中的静电斥力等。小分子有机化合物小分子有机化合物的作用的作用在反应中起运载体的作用,传递电子、在反应中起运载体的作用,传递电子、质子或其它基团。质子或其它基团。目目 录录
9、小分子有机化合物在催化中的作用小分子有机化合物在催化中的作用 目目 录录辅助因子分类辅助因子分类(按其(按其与酶蛋白结合的紧密程度与酶蛋白结合的紧密程度)辅酶辅酶(coenzyme):与酶蛋白结合与酶蛋白结合疏松,可用疏松,可用透析或超滤的透析或超滤的方法除去。方法除去。辅基辅基(prosthetic group):与酶蛋白结合与酶蛋白结合紧密,不能用紧密,不能用透析或超透析或超滤的方法除去滤的方法除去。二、酶的活性中心二、酶的活性中心必需基团必需基团(essential group)酶分子中氨基酸残酶分子中氨基酸残基侧链的化学基团中基侧链的化学基团中,一些与酶活性密切相关一些与酶活性密切相关
10、的化学基团的化学基团。目目 录录目目 录录或称活性部位或称活性部位(active site),指必需基指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合并将底物间结构的区域,能与底物特异结合并将底物转化为产物。转化为产物。酶的活性中心酶的活性中心(active center)目目 录录活性中心内的必需基团活性中心内的必需基团活性中心内的必需基团活性中心内的必需基团结合基团结合基团(binding group)与底物相结合与底物相结合与底物相结合与底物相结合催化基团催化基团(catalytic group)催化底物转变成产物催化底物
11、转变成产物 位于活性中心以外,维持酶活性中心应有位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空间构象所必需。的空间构象所必需。活性中心外的必需基团活性中心外的必需基团底底 物物 活性中心以外活性中心以外的必需基团的必需基团结合基团结合基团催化基团催化基团 活性中心活性中心 目目 录录目目 录录溶菌酶的活性溶菌酶的活性中心中心*谷谷氨氨酸酸35和和天天冬冬氨氨酸酸52是是催催化化基团;基团;*色色氨氨酸酸62和和63、天天冬冬氨氨酸酸101和和色色氨氨酸酸108是是结结合基团;合基团;*AF为为底底物物多多糖糖链链的的糖糖基基,位位于于酶酶的的活活性性中中心心形成的裂隙中。形成的裂隙中。目目 录录第二
12、节第二节 酶促反应的特点与机理酶促反应的特点与机理The Characteristic and Mechanism of Enzyme-Catalyzed Reaction 目目 录录uu酶与一般催化剂的共同点酶与一般催化剂的共同点在反应前后没有质和量的变化;在反应前后没有质和量的变化;在反应前后没有质和量的变化;在反应前后没有质和量的变化;只能催化热力学允许的化学反应;只能催化热力学允许的化学反应;只能催化热力学允许的化学反应;只能催化热力学允许的化学反应;只能加速可逆反应的进程,而不改变只能加速可逆反应的进程,而不改变只能加速可逆反应的进程,而不改变只能加速可逆反应的进程,而不改变反应的平
13、衡点。反应的平衡点。反应的平衡点。反应的平衡点。目目 录录(一)(一)(一)(一)酶促反应具有极高的效率酶促反应具有极高的效率酶促反应具有极高的效率酶促反应具有极高的效率 一、一、酶促反应的特点酶促反应的特点酶酶的的催催化化效效率率通通常常比比非非催催化化反反应应高高1081020倍倍,比一般催化剂高比一般催化剂高1071013倍。倍。酶的催化不需要较高的反应温度。酶的催化不需要较高的反应温度。酶酶和和一一般般催催化化剂剂加加速速反反应应的的机机理理都都是是降降低低反反应应的的活活化化能能(activation energy)。酶酶比比一一般般催催化化剂剂更更有有效地降低反应的活化能。效地降低
14、反应的活化能。目目 录录反应总能量改变反应总能量改变 非催化反应活化能非催化反应活化能 酶促反应酶促反应 活化能活化能 一般催化剂催一般催化剂催化反应的活化能化反应的活化能 能能量量反反 应应 过过 程程 底物底物 产物产物 酶促反应活化能的改变酶促反应活化能的改变 活化能活化能:底物分子从初态转变到活化态所需的能量底物分子从初态转变到活化态所需的能量。目目 录录根据酶对其底物结构选择的严格程度不同,根据酶对其底物结构选择的严格程度不同,酶的特异性可大致分为以下酶的特异性可大致分为以下3 3种类型:种类型:n n绝对特异性绝对特异性绝对特异性绝对特异性(absolute specificity
15、)(absolute specificity):只能作用于只能作用于只能作用于只能作用于特定结构的底物,进行一种专一的反应,生特定结构的底物,进行一种专一的反应,生特定结构的底物,进行一种专一的反应,生特定结构的底物,进行一种专一的反应,生成一种特定结构的产物成一种特定结构的产物成一种特定结构的产物成一种特定结构的产物 。n n相对特异性相对特异性相对特异性相对特异性(relative specificity)(relative specificity):作用于一类作用于一类作用于一类作用于一类化合物或一种化学键。化合物或一种化学键。化合物或一种化学键。化合物或一种化学键。n n立体结构特异性
16、立体结构特异性立体结构特异性立体结构特异性(stereostereo specificityspecificity):作用于立作用于立作用于立作用于立体异构体中的一种。体异构体中的一种。体异构体中的一种。体异构体中的一种。目目 录录(三)(三)酶促反应的可调节性酶促反应的可调节性对酶生成与降解量的调节对酶生成与降解量的调节酶催化效力的调节酶催化效力的调节通过改变底物浓度对酶进行调节等通过改变底物浓度对酶进行调节等酶促反应受多种因素的调控,以适应机体对酶促反应受多种因素的调控,以适应机体对不断变化的内外环境和生命活动的需要。其中包不断变化的内外环境和生命活动的需要。其中包括三方面的调节。括三方面
17、的调节。目目 录录二、酶促反应的机理二、酶促反应的机理(一)酶(一)酶-底物复合物的形成与诱导契合假说底物复合物的形成与诱导契合假说*诱导契合假说诱导契合假说(induced-fit hypothesis)酶底物复合物酶底物复合物 E+SE+PES 酶与底物相互接近时,其结构相互诱导、酶与底物相互接近时,其结构相互诱导、相互变形和相互适应,进而相互结合。这一过相互变形和相互适应,进而相互结合。这一过程称为酶程称为酶-底物结合的诱导契合假说底物结合的诱导契合假说 。目目 录录目目 录录酶酶酶酶 的的的的 诱诱诱诱 导导导导 契契契契 合合合合 动动动动 画画画画羧羧肽肽酶酶的的诱诱导导契契合合模
18、模式式 底物底物目目 录录目目 录录(二)酶促反应的机理(二)酶促反应的机理1.邻近效应邻近效应(proximity effect)与定向排列与定向排列(orientation arrange)2.多元催化多元催化(multielement catalysis)3.表面效应表面效应(surface effect)目目 录录第三节第三节酶促反应动力学酶促反应动力学Kinetics of Enzyme-Catalyzed Reaction 目目 录录qq概念概念概念概念研究各种因素对研究各种因素对研究各种因素对研究各种因素对酶促反应速度酶促反应速度酶促反应速度酶促反应速度的影响,并的影响,并的影响
19、,并的影响,并加以定量的阐述。加以定量的阐述。加以定量的阐述。加以定量的阐述。qq影响因素包括有影响因素包括有影响因素包括有影响因素包括有酶浓度、底物浓度、酶浓度、底物浓度、酶浓度、底物浓度、酶浓度、底物浓度、pHpH、温度、温度、温度、温度、抑制剂、激活剂等。抑制剂、激活剂等。抑制剂、激活剂等。抑制剂、激活剂等。研究一种因素的影响时,其余各因素均恒定。研究一种因素的影响时,其余各因素均恒定。目目 录录一、底物浓度对反应速度的影响一、底物浓度对反应速度的影响I.I.单底物、单产物反应单底物、单产物反应单底物、单产物反应单底物、单产物反应II.II.酶酶酶酶促促促促反反反反应应应应速速速速度度度
20、度一一一一般般般般在在在在规规规规定定定定的的的的反反反反应应应应条条条条件件件件下下下下,用用用用单单单单位位位位时时时时间间间间内内内内底底底底物物物物的的的的消消消消耗耗耗耗量量量量和和和和产产产产物物物物的的的的生生生生成成成成量量量量来来来来表示表示表示表示III.III.反反反反应应应应速速速速度度度度取取取取其其其其初初初初速速速速度度度度,即即即即底底底底物物物物的的的的消消消消耗耗耗耗量量量量很很很很小小小小(一般在(一般在(一般在(一般在5 5 以内)时的反应速度以内)时的反应速度以内)时的反应速度以内)时的反应速度IV.IV.底物浓度远远大于酶浓度底物浓度远远大于酶浓度底
21、物浓度远远大于酶浓度底物浓度远远大于酶浓度研究前提研究前提v 在其他因素不变的情况下,底物浓度对反应在其他因素不变的情况下,底物浓度对反应速度的影响呈速度的影响呈矩形双曲线关系矩形双曲线关系。当底物浓度较低时当底物浓度较低时反应速度与底物浓度成正比;反反应速度与底物浓度成正比;反应为一级反应。应为一级反应。SSV VVmaxVmax目目 录录随着底物浓度的增高随着底物浓度的增高反应速度不再成正比例加速;反应反应速度不再成正比例加速;反应为混合级反应。为混合级反应。SSV VVmaxVmax目目 录录当底物浓度高达一定程度当底物浓度高达一定程度反应速度不再增加,达最大速度;反应速度不再增加,达最
22、大速度;反应为零级反应反应为零级反应SSV VVmaxVmax目目 录录目目 录录(一)米曼氏方程式(一)米曼氏方程式中间产物中间产物中间产物中间产物 酶促反应模式酶促反应模式中间产物学说中间产物学说E+S k1k2k3ESE+P目目 录录19131913年年年年MichaelisMichaelis和和和和MentenMenten提提提提出出出出反反反反应应应应速速速速度度度度与与与与底底底底物物物物浓浓浓浓度度度度关关关关系系系系的的的的数数数数学学学学方方方方程程程程式式式式,即即即即米米米米曼曼曼曼氏氏氏氏方方方方程程程程式,简称米氏方程式式,简称米氏方程式式,简称米氏方程式式,简称米氏
23、方程式(MichaelisMichaelis equation)equation)。S:底物浓度底物浓度V:不同不同S时的反应速度时的反应速度Vmax:最大反应速度最大反应速度(maximum velocity)m:米氏常数米氏常数(Michaelis constant)VmaxS Km+S 目目 录录米曼氏方程式推导基于两个假设:米曼氏方程式推导基于两个假设:E与与S形成形成ES复合物的反应是快速平衡反应,而复合物的反应是快速平衡反应,而ES分解为分解为E及及P的反应为慢反应,反应速度取决于的反应为慢反应,反应速度取决于慢反应即慢反应即 Vk3ES。(1)S的总浓度远远大于的总浓度远远大于E
24、的总浓度,因此在反应的初始的总浓度,因此在反应的初始阶段,阶段,S的浓度可认为不变即的浓度可认为不变即SSt。目目 录录推导过程推导过程n n稳态:稳态:稳态:稳态:是指是指是指是指ESES的生成速度与分解速度相等,即的生成速度与分解速度相等,即的生成速度与分解速度相等,即的生成速度与分解速度相等,即 ESES恒定。恒定。恒定。恒定。KK1 1(E(Et t ES)SES)SKK2 2 ES+KES+K3 3 ESESK2+K3 Km(米氏常数)米氏常数)K1令:令:则则(2)(2)变为变为:(EtES)S Km ES(2)(EtES)SK2+K3ES K1整理得:整理得:目目 录录当底物浓度
25、很高,将酶的活性中心全部饱和时,当底物浓度很高,将酶的活性中心全部饱和时,即即EtES,反应达最大速度反应达最大速度VmaxK3ESK3Et (5)ES EtSKm+S(3)整理得整理得:将将(5)(5)代入代入(4)(4)得米氏方程式:得米氏方程式:VmaxS Km+S V 将将(3)(3)代入代入(1)(1)得得K3EtS Km+S(4)V目目 录录当反应速度为最大反应速度一半时当反应速度为最大反应速度一半时当反应速度为最大反应速度一半时当反应速度为最大反应速度一半时v Km值的推导值的推导KmS Km值等于酶促反应速度为最大反应速度一半值等于酶促反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度,单
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 沈阳药科大学生物化学课件第3章 沈阳 药科 大学 生物化学 课件
限制150内