氨基酸、蛋自质及核酸.ppt
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1、有机化学有机化学有机化学有机化学 第十五章 氨基酸、蛋白质及核酸1有机化学 第二十章 蛋白质和核酸 蛋白质存在于一切细胞中。蛋白质存在于一切细胞中。它们是构成人体和动植物组织的它们是构成人体和动植物组织的基本材料,肌肉、毛发、皮肤。指甲、腥、神经、激素、抗体、基本材料,肌肉、毛发、皮肤。指甲、腥、神经、激素、抗体、血清、血红蛋白、酶等都是由不同蛋白质组成的。蛋白质在有机血清、血红蛋白、酶等都是由不同蛋白质组成的。蛋白质在有机体中承担着多种生物功能,它们能供给机体营养,输送氧气,控体中承担着多种生物功能,它们能供给机体营养,输送氧气,控制代谢过程,防御疾病、传递遗传信息,负责机械运动,执行保制代
2、谢过程,防御疾病、传递遗传信息,负责机械运动,执行保护机能,等等。可以说,护机能,等等。可以说,蛋白质是生命的物质基础蛋白质是生命的物质基础,是参与体内,是参与体内各种生物化学变化最重要的组分。生命的基本特征就是蛋白质的各种生物化学变化最重要的组分。生命的基本特征就是蛋白质的不断自我更新。不断自我更新。第十五章 氨基酸、氨基酸、蛋白质及核酸 从化学上看,从化学上看,蛋白质是氨基酸的高聚物蛋白质是氨基酸的高聚物;氨基酸是构成蛋白;氨基酸是构成蛋白质的质的“基石基石”,因此要讨论蛋白质的结构和性质,首先要了解氨,因此要讨论蛋白质的结构和性质,首先要了解氨基酸。基酸。2有机化学 第二十章 蛋白质和核
3、酸*蛋白质存在一切细胞中。*蛋白质在有机体中承担着多种生物功能。*蛋白质是生命的物质基础。*生命活动的基本特征就是蛋白质的不断自我更新(新陈代谢)。*从化学上看,蛋白质是氨基酸的高聚物:氨基酸是构成蛋白质的基石。3有机化学 第二十章 蛋白质和核酸第一节 氨基酸概述(Amino acids)一、氨基酸的分类、命名和结构1、结构、结构R C COOHNH2H-氨基酸 分子中既含有氨基(NH2),又含有羧基(COOH)的化合物叫氨基酸氨基酸。各种氨基酸的差别主要在于R基团的不同,而R的结构是多种多样的。氨基酸氨基酸4有机化学 第二十章 蛋白质和核酸2、命名 -氨基酸的命名一般采用俗名,即根据其来源或
4、性质命名。每种氨基酸都有缩写符号(即英文名称的头一个字母)和中英文代号。甘氨酸 Gly G 甘赖氨酸 Lys K 赖 氨基酸 符号 字母代号 汉文代号5有机化学 第二十章 蛋白质和核酸3、分类、分类*根据氨基和羧基的数目中性氨基酸:氨基数目=羧基数目碱性氨基酸:氨基数目羧基数目酸性氨基酸:氨基数目 羧基数目*根据烃基的类型脂芳族氨基酸:并氨酸、缬氨酸等。芳香族氨基酸:苯丙氨酸、酪氨酸等。杂环族氨基酸:色氨酸、脯氨酸等。6有机化学 第二十章 蛋白质和核酸二、氨基酸的构型二、氨基酸的构型 天然氨基酸,除甘氨酸外,-C原子都有手性,因此具有旋光性,且都是L 构型。CHOHHOCH3COOHHHOCH
5、3COOHHH2NCH3L 甘油醛L 乳酸L 丙 氨酸 -氨基酸的构型是与由L 甘油醛导出的L 乳酸相联系而确定的,即将-氨基酸看成是L 乳酸中的羟基被氨基取代的产物。其它含有一个以上手性碳原子的氨基酸的构型,均取决于-C原子:如果某氨基酸的-C原子的构性与L 丙 氨酸相当,这个氨基酸就是L 型。7有机化学 第二十章 蛋白质和核酸 第二节第二节 氨基酸的来源及制法氨基酸的来源及制法蛋白质H2OH+多肽二肽-氨基酸 将混合物用各种分离手段(如色层分离法、离子交换法、电泳法等)进行分离,即可分别得到各种氨基酸。由蛋白质的水解制备氨基酸是从1820年开始的,这是一个最古老的方法。味精早期就是由小麦蛋
6、白质面筋水解得到。胱氨酸,半胱氨酸是由头发水解制得的。一、蛋自质水解 蛋白质在酸、碱或酶的作用下水解,最后生成的是-氨基酸氨基酸 的混合物:氨基酸的制备主要有蛋白质的水解、发酵法,酶法及有机合成法四条途径8有机化学 第二十章 蛋白质和核酸 蛋白质水解法的缺点是分离比较困难,因为水解时所得到的总是各种氨基酸的混合物。二、微生物发酵法二、微生物发酵法 该法是以糖质原料(如淀粉、果糖、蔗糖)或以石油及其制品(如石蜡油、煤油、乙醇、醋酸)为主要碳源,在其它氮、磷、钾等物质存在下,经过微生物发酵而生成氨基酸。从1957年开始用该法生产谷氨酸(味精)。微生物发酵法的原料价廉,在大多数情况下,由于细菌的特异
7、作用,能直接得到L 型氨基酸,无需再进行外旋体的拆分。三、酶法三、酶法 在酶的作用下,可将一定原料转化成L 氨基酸。酶法的特点是酶的催化性很强,生产过程简单,产率高,副产物少,周期短,成本低。L-丙氨酸、L-赖氨酸、L-天门冬氨酸、L-色氨酸、L-鸟氨酸等是用酶法生产的。9有机化学 第二十章 蛋白质和核酸四、合成法四、合成法 为了经济、大量地生产氨基酸,还需要用化学合成法。其主要方法有以下三种:R CH=OHCNR CH OHCNNH3R CH NH2CN 醛与HCN、NH3反应生成氰胺,后者水解即得到氨基酸氨基酸,该法称为斯垂克合成。(1)由醛或酮制备斯垂克(Strecker)合成(氰胺水解
8、)R CH-COOHNH2H2OOHH+10有机化学 第二十章 蛋白质和核酸R CH-COOHNH2R CH-COOHX+NH3(2)-卤代酸的氨解 此法有仲、叔胺的副产物,如用盖布瑞尔(Gabriel)法代替,则能得到较纯的-氨基酸。OONO CH COOHR RNKO+X CH COOR R邻苯二甲酰亚胺钾-卤代酸酯COOHCOOH+NH2CHCOOHR+ROHH2O11有机化学 第二十章 蛋白质和核酸(3)由丙二酸酯合成)由丙二酸酯合成 以丙二酸酯为基本原料,可以合成多种结构的氨基酸,该法的应用范围非常广泛。CH2(COOC2H5)2CCl4Br2BrCH(COOC2H5)2NKOOC2
9、H5ONaRXNOOC(COOC2H5)2ROHH2OH+R CHCOOH NH2NOOCH(COOC2H5)2中间产物 现介绍邻苯二甲酰亚胺丙二酸酯法:12有机化学 第二十章 蛋白质和核酸 RX除为一般的伯卤外,还可以为ClCH2COOC2H5,ClCH2CH2SCH3等多种卤代物,从而生成各种结构的氨基酸。13有机化学 第二十章 蛋白质和核酸 最后要指出的是,用一般合成方法所生成的氨基酸都是外消旋体,只有经过拆分才能得到L或D构型的氨基酸。氨基酸的不对称合成近年来发展很快,例如应用膦铑络合催化剂,光学产率可达到95以上。14有机化学 第二十章 蛋白质和核酸 (6)斯密特(Schmidt)反
10、应 斯密特反应是以叠氮酸为试剂,将羧某转化成氨基。例如:15有机化学 第二十章 蛋白质和核酸【课堂练习】一、用适当原料,以丙二酸酯法合成:(1)天门冬氨酸;(2)亮氨酸;(3)脯氨酸;(4)色氨酸。二、用两种方法合成:NH3COO-+16有机化学 第二十章 蛋白质和核酸(1)天门冬氨酸;一、HOOC-CH2-CH-COOHNH2-氨基丁二酸CH2(COOC2H5)2CCl4Br2BrCH(COOC2H5)2NKOONOOCH(COOC2H5)2中间产物C2H5ONaClCH2COOC2H5NOOC(COOC2H5)2CH2COOC2H5OHH2OH+HOOC-CH2-CH-COOHNH217有
11、机化学 第二十章 蛋白质和核酸(2)亮氨酸(CH3)2CHCH2CH-COOHNH2-甲基-氨基戊酸CH2(COOC2H5)2CCl4Br2BrCH(COOC2H5)2NKOONOOCH(COOC2H5)2中间产物C2H5ONa(CH3)2CHCH2ClNOOC(COOC2H5)2CH2CH(CH3)2OHH2OH+(CH3)2CHCH2CH-COOHNH218有机化学 第二十章 蛋白质和核酸(3)脯氨酸-四氢吡咯酸CH2(COOC2H5)2CCl4Br2BrCH(COOC2H5)2NKOONOOCH(COOC2H5)2中间产物C2H5ONaBrCH2CH2CH2BrNOOC(COOC2H5)
12、2 CH2CH2CH2BrOHH2OH+19有机化学 第二十章 蛋白质和核酸(4)色氨酸-氨基-(3-吲哚)丙酸NOOCH(COOC2H5)2中间产物CH2(COOC2H5)2CCl4Br2BrCH(COOC2H5)2NKOOC2H5ONaNOOC(COOC2H5)2OHH2OH+CH2RNHCH2ClTM20有机化学 第二十章 蛋白质和核酸二、用两种方法合成:NH3COO-+21有机化学 第二十章 蛋白质和核酸二、-卤代酸氨解-卤代酸与过量的NH3作用,容易生成-氨基酸。例如:CH3CHCOOH +2NH3ClCH3CHCOOH +2NH4ClNH2三、盖布瑞尔合成法 与合成纯的伯胺方法类似
13、(见第十二章第五节),可以用-卤代酸酯合成-氨基酸。22有机化学 第二十章 蛋白质和核酸四、斯特雷克合成法 由醛与氨及氢氰酸,或与氰化铵作用制得-氨基睛,后者水解即得-氨基酸,这个反应称为斯特雷克(Strccker合成法。反应机理大致如下:23有机化学 第二十章 蛋白质和核酸24有机化学 第二十章 蛋白质和核酸第三节 氨基酸的性质 -氨基酸都为无色晶体,易溶于水,而难溶于乙醚、苯等有机溶剂中,它们具有较高的熔点,且大多数在熔化时会发生分解。除甘氨酸外,其它天然氨基酸都有旋光性。氨基酸是含有氨基和羧基的双官能团化合物,所以它们既具有羧酸的性质,又具有胺类的性质,同时还具有这两种官能团相互影响而赋
14、于它们的某些特性。一、氨基酸的两性和等电点 氨基酸中有两性基团,既能和酸反应,也能和碱反应,它是两性化合物两性化合物。实际上杂氨基酸分子内,氨基与羧基作用生成一个两性离子,氨基酸的晶体就是以两性离子的形式存在的,这种两性离子是分子内的氨基与羧基成盐的结果,故称为内盐内盐。1)两性25有机化学 第二十章 蛋白质和核酸R CH COOH NH2R CH COO NH3+-内盐(亦称为偶极离子)氨基酸具有高熔点和水溶性,就是其内盐性质的表现。在水溶液中,氨基酸的两性离子存在下列平衡:R CH COOH NH3R CH COO NH3+R CH COO NH2OH-OH-H+H+-+阳离子两性离子阴离
15、子(氨基酸正离子)(氨基酸负离子)26有机化学 第二十章 蛋白质和核酸2)等电点丙氨酸在纯水溶液中可形成入下的平衡:OH +CH3CHCOOHCH3CHCOO CH3CHCOO +H3O-NH3+NH3+NH2正离子两性离子负离子-+H2OH2O 在这里,酸性基团NH3+和碱性基团COO的相对强度不完全等同,即前者的给质子能力大于后者接受质子的能力(即羧基COOH的酸性大于氨基NH2的碱性),所以丙氨酸的两性离子容易从NH3+给出质子形成较多的负离子。在平衡体系中,负离子数目多于正离子,使丙氨酸带有一定数量的净负电荷,其溶液略显酸性(PH值略小于7)。氨基酸中羧基的解离能力要大于氨基接受质于的
16、能力。27有机化学 第二十章 蛋白质和核酸 如果在丙氨酸水溶液的平衡体系中外加酸,则可抑制负如果在丙氨酸水溶液的平衡体系中外加酸,则可抑制负离子的生成,而使正离子的数量增加(平衡向左移动)。当离子的生成,而使正离子的数量增加(平衡向左移动)。当加入适量的酸时,可以使正,负离子相等,丙氨酸的净电荷加入适量的酸时,可以使正,负离子相等,丙氨酸的净电荷等于零。等于零。将将此此溶液置于电场中,氨基酸不向电场的任何一极移动,溶液置于电场中,氨基酸不向电场的任何一极移动,即处于电中性(等电)状态。这个净电荷为零的氨基酸所在即处于电中性(等电)状态。这个净电荷为零的氨基酸所在的溶液的的溶液的PH值就称为该氨
17、基酸的值就称为该氨基酸的等电点等电点(Isoelectric point),通常以通常以IP 表示。表示。必须注意,氨基酸在纯水中的电离一般都不是它的等电点,必须注意,氨基酸在纯水中的电离一般都不是它的等电点,要达到等电点必须加入酸或碱来调节。由于各种氨基酸中的羧要达到等电点必须加入酸或碱来调节。由于各种氨基酸中的羧基和氨基的相对强度和数目不同,所以各种氨基酸的等电点也基和氨基的相对强度和数目不同,所以各种氨基酸的等电点也不同。不同。中性氨基酸中性氨基酸 IP=5.56.3酸性氨基酸酸性氨基酸 IP=2.8 3.2碱性氨基酸碱性氨基酸 IP=7.6 10.6 28有机化学 第二十章 蛋白质和核
18、酸 氨基酸的等电点并非是它的中性点。在等电点时,两性离子的浓度最大,溶解度最小。根据等电点可以鉴定氨基酸,而用调节等电点的方法可以分离氨基酸的混合物。常用的方法有两种,一是利用其在等电点时的溶解度最小,可以某氨基酸从混合溶液中沉淀出来;二是利用在同一pH下不同的氨基酸所带电荷的不同而进行分离。例如,在pH6时,甘氨酸、丙氨酸等主要以两性离子形式存在,而天门冬氨酸、谷氨酸等则主要是以负离子形式存在。若将此混合液通过阳离子交换树脂的层析柱,这时天门冬氨酸、谷氨酸等就和树脂的阳离子交换而留在柱中,再根据它们的IP值,选用不同的pH缓冲溶液将后者洗脱出来。29有机化学 第二十章 蛋白质和核酸【课堂练习
19、】一、写出下列氨基酸在给定PH值的离子结构:(1)半胱氨酸(PH4.80)(2)精氨酸(PH10.95)(1)HSCH2-CHCOOH+NH3(2)H2N C NHCH2CH2CH2CHCOO-NH2NH二、下列氨基酸在PH6时,置于电场中,推测其移动方向。(1)缬氨酸 (2)谷氨酸 (3)赖氨酸 (1)不动(2)正极(3)负极30有机化学 第二十章 蛋白质和核酸二、氨基酸受热后的消除反应氨基酸的热反应与相应的羟基酸极为相似:(A)-氨基酸加热生成交酰氨或肽CH3CHCO OHNHHHNHCHCH3HO OCCH3CHCO NHNHCHCH3 OC交酰胺(二酮吡嗪)31有机化学 第二十章 蛋白
20、质和核酸H2N CH CO OH R+H NH CH COOH RH2N CH CO R NH CH COOH R二肽(B)-氨基酸加热生成,-不饱和酸:RCH CH-COOHNH2HRCH=CHCOOH,-不饱和酸32有机化学 第二十章 蛋白质和核酸(C)-氨基酸氨基酸加热生成内酰胺加热生成内酰胺:R CHCHCH2COOHNH2RCHCH2NHCH2C=O内酰胺33有机化学 第二十章 蛋白质和核酸三、与水合茚三酮的显色反应 -氨基酸与水合茚三酮在碱性溶液中加热,发生氧化、脱氨、脱羧作用,最终生成蓝紫色物质。这是检验氨基酸的灵敏方法。(脯氨酸或羟脯氨酸显黄色)值得注意的是,脯氨酸不能发生茚三
21、酮反应。伯胺、氨,铵盐等能发生茚三酮反应,故鉴别一个-氨基酸时,要排除伯胺、氨和铵盐的干扰。34有机化学 第二十章 蛋白质和核酸四、与亚硝酸的反应 氨基酸与HNq作用,生成羟基酸,同时放出N2,反应迅速且定量完成。根据所放出N2的体积,可以算出试样中氨基的含量,这个方法叫做范斯莱克(Van一S1yke)法。RCH2CHCOOH +HNO2NH2RCH2CHCOOH +N2 +H2OOH35有机化学 第二十章 蛋白质和核酸五、氨基酸的反应五、氨基酸的反应(1)羧基的反应)羧基的反应R CHCOOHNH2R CHCOONH2OH-(成盐)-R CHCOClNH2PCl5(生成酰氯)R CHCOOC
22、H2C6H5NH2C6H5CH2OH(酯化)H+R CHCONHRNH2(生成酰氨)RNH2R CHCH2OHNH2(还原)LiAlH4R CH2NH2(脱羧)36有机化学 第二十章 蛋白质和核酸(2)氨基的反应)氨基的反应R CHCOOHNH2R CHCOOHNH3+(成盐)H+R CHCOOHOH(与亚硝酸反应)PCl5R CHCOOHN(CH2OH)2(与甲醛反应)HCHOR CHCOOHNHCOCH3(酰化)(CH3CO)2OR CHCOOHNHR(烃基化)RCl(氧化)H2O2R CHCOOHNHR CHCOOHOH2O37有机化学 第二十章 蛋白质和核酸 肽第四节 肽、肽键与命名
23、一分子-氨基酸的氨基和另一分子-氨基酸的羧基之间缩水所生成的酰胺化合物称为肽。肽peptide,此名词来自于希腊语“消化”,因为肽首先是由部分消化的蛋白质得到的。肽分子中的酰胺键称为肽键(peptide linkages)。H2N CH CO OH R+H NH CH COOH RH2N CH CO R NH CH COOH R二肽肽键38有机化学 第二十章 蛋白质和核酸 由二个或三个氨基酸形成的肽叫二肽或三肽。由多个氨基酸形成的肽称为多肽。在肽分子中每个氨基酸结构部分称为氨基酸单位(残基)。在蛋白质分子中,氨基酸也是通过肽键连接起来的。实际上,蛋白质就是分子量很大(约亿万以上)的多肽。所以了
24、解多肽的结构和性质是研究蛋白质的重要基础。开链状的肽总有两个末端。含游离氨基的一端称为N-端,通常写在左边;含游离羧基的一端称为C-端,写在右边。肽的命名是从N-端开始,由左至右依次将每个氨基酸单位写成“某氨酰”,最后一个氨基酸单位的羧基是完整的,写为“某氨酸”。第五节第五节 多肽多肽39有机化学 第二十章 蛋白质和核酸H2N CH CONH CH2 CONH CH COOH CH3CH2C6H5丙氨酰 甘氨酰 苯丙氨酸简称:丙 甘 苯丙(Ala Gly Phe)一、多肽结构的测定和端基分析 要测定一个多肽的结构,首先要知道这个多肽分子是由哪些氨基酸组成的,然后再确定这些氨基酸在多肽分子中的排
25、列顺序。将多肽在酸性溶液中进行水解,可以得到各种氨基酸的混合物,再用色谱法分离并确定它是由哪几种氨基酸组成以及它们的相对含量,然后根据测定的多肽的分子量,就能算出这个多肽中所含的各种氨基酸的数目。至于这些氨基酸在多肽分子中的排列次序,则是通过端基分析的方法,并配合部分水解法加以确定。40有机化学 第二十章 蛋白质和核酸 确定多肽的结构,应从两方面着手。首先测定组成多肽的氨基酸种类和数目;然后测定这些氨基酸在肽链中排列的顺序。确定多肽的结构是一项非常复杂而细致的工作。英国化学家桑格(F.Sanger)化了十年的时间,在1955年首次测定出牛胰岛素的氨基酸顺序,于1958年获得诺贝尔化学奖。桑格的
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