微生物与植物.ppt
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1、微生物与植物 Still waters run deep.流静水深流静水深,人静心深人静心深 Where there is life,there is hope。有生命必有希望。有生命必有希望综述内容综述内容v引言引言v植物在生态系统养分循环过程中的作用研究进展植物在生态系统养分循环过程中的作用研究进展v地下微生物在生态系统养分循环过程中的作用研地下微生物在生态系统养分循环过程中的作用研究进展究进展v土壤微生物多样性及其作用研究进展土壤微生物多样性及其作用研究进展v植物、微生物对养分循环调控机制的研究进展植物、微生物对养分循环调控机制的研究进展v展望及试验设计展望及试验设计引言引言 陆地生态系
2、统的植物、微生物是相互联系的。作陆地生态系统的植物、微生物是相互联系的。作为陆地生态系统中的重要组成部分为陆地生态系统中的重要组成部分,它们之间的相互作它们之间的相互作用是生态系统地上、地下结合的重要纽带用是生态系统地上、地下结合的重要纽带,传统研究往传统研究往往过多地关注地上生物群落往过多地关注地上生物群落,而忽略了地下生物群落在而忽略了地下生物群落在陆地生态系统中的重要作用陆地生态系统中的重要作用,地下生物群落及其生态过地下生物群落及其生态过程一直被认为是程一直被认为是“黑匣子黑匣子”,因而地下生物群落成为生因而地下生物群落成为生态系统功能研究中最不确定的部分。态系统功能研究中最不确定的部
3、分。近近20年来分子生物学方法和技术应用于土壤微生年来分子生物学方法和技术应用于土壤微生物群落调查与功能评价方面取得了很大进展,越来越物群落调查与功能评价方面取得了很大进展,越来越多的研究关注于地上、地下生态过程之间的作用与反多的研究关注于地上、地下生态过程之间的作用与反馈,因此馈,因此,揭示二者在养分循环中的调控机制可以使我揭示二者在养分循环中的调控机制可以使我们深入理解生态系统稳定性维持的内在机制们深入理解生态系统稳定性维持的内在机制。一一 植物在生态系统养分循环过程中的作植物在生态系统养分循环过程中的作用研究进展用研究进展1 植物在生态系统中的作用植物在生态系统中的作用 绿色植物是生态系
4、统的核心绿色植物是生态系统的核心,在陆地生态在陆地生态系统中扮演重要的角色,是维持生态平衡的系统中扮演重要的角色,是维持生态平衡的支柱支柱,是陆地生态系统的重要组成部分,是物是陆地生态系统的重要组成部分,是物质循环与能量流动的中枢。主要体现在植物质循环与能量流动的中枢。主要体现在植物对碳、氮等营养元素的吸收、积累以及养分对碳、氮等营养元素的吸收、积累以及养分归还等方面。归还等方面。在森林和其他陆地植被为土壤微生物提供了碳在森林和其他陆地植被为土壤微生物提供了碳源,森林和其他陆地植被可用来吸收部分温室气体源,森林和其他陆地植被可用来吸收部分温室气体,缓解气候变化缓解气候变化,在碳、氮养分循环中发
5、挥着重要作在碳、氮养分循环中发挥着重要作用用,这些作用这些作用作为生产者的植物为土壤微生物提供作为生产者的植物为土壤微生物提供了碳源。植物进行光合作用吸收了碳源。植物进行光合作用吸收CO2、贮存碳素的、贮存碳素的同时同时,从土壤中吸收适量的可利用从土壤中吸收适量的可利用N构成生物有机体构成生物有机体,在有机体和土壤间维持一定的比例关系在有机体和土壤间维持一定的比例关系,即即C/N比。比。C/N比在很大程度上控制着植物碳生产以及植物向比在很大程度上控制着植物碳生产以及植物向土壤归还有机物质等土壤归还有机物质等C、N循环的关键过程循环的关键过程,并影响并影响着植物体内养分的积累与分配着植物体内养分
6、的积累与分配(Luo et al.,2004)植物丰富的物种多样性可以引起作为地下植物丰富的物种多样性可以引起作为地下生物资源的凋落物质量和类型的多样性生物资源的凋落物质量和类型的多样性,植物、植物、土壤和微生物相互作用土壤和微生物相互作用,构成了一个植物构成了一个植物-土壤土壤-微生物的有机整体。植物通过其凋落物和分泌微生物的有机整体。植物通过其凋落物和分泌物为土壤微生物提供营养,导致植物和微生物物为土壤微生物提供营养,导致植物和微生物之间的协同进化,促进土壤微生物的多样性,之间的协同进化,促进土壤微生物的多样性,植物对有限土壤资源的竞争是影响植物群落物植物对有限土壤资源的竞争是影响植物群落
7、物种组成、结构和功能的关键因素。同时,土壤种组成、结构和功能的关键因素。同时,土壤环境的维持依赖于植被系统的协同作用。环境的维持依赖于植被系统的协同作用。(毕江涛,贺达汉,2009)地上部分丰富的物种多样性可以引起作为地下生物资源的凋落物质量和类型的多样性(贺金生,2004)二二 地下微生物在生态系统养分循环过程中的地下微生物在生态系统养分循环过程中的 作用研究进展作用研究进展 地下生物群落成为生态系统功能研究中最不确定地下生物群落成为生态系统功能研究中最不确定的部分的部分(Reynolds et al,2003)。近。近2020年来分子生物年来分子生物学方法和技术应用于土壤微生物群落调查与功
8、能评学方法和技术应用于土壤微生物群落调查与功能评价方面取得了很大进展。价方面取得了很大进展。土壤中生活着丰富的微生物类群土壤中生活着丰富的微生物类群,是一个重要的是一个重要的地下生物宝库。土壤微生物是土壤中的主要分解者地下生物宝库。土壤微生物是土壤中的主要分解者,对环境起着天然的对环境起着天然的“过滤过滤”和和“净化净化”作用作用,在自然在自然生态系统的功能发挥和维持能力方面极其重要。土生态系统的功能发挥和维持能力方面极其重要。土壤微生物作为活的有机体,随着基因组时代的盛兴壤微生物作为活的有机体,随着基因组时代的盛兴和后基因组时代和后基因组时代(功能基因组功能基因组)的到来,为阐明全球的到来,
9、为阐明全球变化背景下的植被变化背景下的植被-土壤土壤-微生物之间的响应和适应微生物之间的响应和适应机制开辟了广阔的前景。机制开辟了广阔的前景。(毕江涛,2009)土壤微生物是土壤中一切肉眼看不见或看不清土壤微生物是土壤中一切肉眼看不见或看不清楚的微小生物的总称楚的微小生物的总称,通常意义上应当包括古菌、通常意义上应当包括古菌、细菌、放线菌、真菌、病毒、原生动物和显微藻细菌、放线菌、真菌、病毒、原生动物和显微藻类等。类等。土壤微生物群落是个非常特别的生物学群体土壤微生物群落是个非常特别的生物学群体,其重要的生理功能已引起学者们的足够重视。在其重要的生理功能已引起学者们的足够重视。在生态系统中土壤
10、微生物有机体组成了一个强大的生态系统中土壤微生物有机体组成了一个强大的动力资源库动力资源库,在植物残体降解、腐殖质形成及养在植物残体降解、腐殖质形成及养分转化与循环中扮演着十分重要的角色。分转化与循环中扮演着十分重要的角色。(A C Kennydy and K L Smith,1995 )微生物是生态系统中重要的分解者。它们分解生物圈内动植物和微生物的残体,还有各种复杂的有机物质,能够吸收某些分解产物,最终将有机物分解成简单的无机物,这些无机物又可以被初级生产者利用,再次参与物质循环,特别是腐殖质和蜡质有微生物才能分解。1 土壤微生物对有机物的分解作用土壤微生物对有机物的分解作用2 土壤微生物
11、在物质循环中的作用土壤微生物在物质循环中的作用 土壤中有机物的分解、腐殖质的形成、养分土壤中有机物的分解、腐殖质的形成、养分转化等各种生化过程,都是在微生物的参与下转化等各种生化过程,都是在微生物的参与下完成的,所以土壤微生物衡量土壤肥力水平和完成的,所以土壤微生物衡量土壤肥力水平和土壤养分资源生物有效性的重要活指标,土壤土壤养分资源生物有效性的重要活指标,土壤微生物分解有机质、释放有效物质供植物利用微生物分解有机质、释放有效物质供植物利用的同时的同时,一部分被同化一部分被同化,形成微生物自身细胞形成微生物自身细胞,死死亡后以容易矿化的形式释放并返回给土壤亡后以容易矿化的形式释放并返回给土壤,
12、供植供植物利用物利用,作为土壤有效养分库的土壤微生物对植作为土壤有效养分库的土壤微生物对植物的生长具有重要意义物的生长具有重要意义。3改善土壤结构改善土壤结构 土壤结构改善可以改进土壤通气状况、水分土壤结构改善可以改进土壤通气状况、水分渗透能力渗透能力,进而可以促进植物生长。土壤微生物进而可以促进植物生长。土壤微生物通过自身繁殖促进食菌性土壤动物的生长通过自身繁殖促进食菌性土壤动物的生长,与土与土壤中腐生性无脊椎动物蚯蚓、蚂蚁、蜗牛等共同壤中腐生性无脊椎动物蚯蚓、蚂蚁、蜗牛等共同促进土壤通透性增大、团粒结构形成。团聚体是促进土壤通透性增大、团粒结构形成。团聚体是由粘粒、粉粒、砂粒组成的大的暂时
13、性团体结构由粘粒、粉粒、砂粒组成的大的暂时性团体结构,它的稳定性随土地管理措施、气候条件、微生物它的稳定性随土地管理措施、气候条件、微生物活性和其它因素而不同。活性和其它因素而不同。三三 土壤微生物多样性及其作用研究进展土壤微生物多样性及其作用研究进展1 1 土壤微生物多样性的概念土壤微生物多样性的概念 土壤微生物多样性指生命体在遗传、种类和土壤微生物多样性指生命体在遗传、种类和生态系统层次上的变化生态系统层次上的变化。通常以土壤生物区系的。通常以土壤生物区系的变化和生物化学过程间的相互作用关系来反映。变化和生物化学过程间的相互作用关系来反映。土壤微生物多样性包括在栖息地中微生物分类群土壤微生
14、物多样性包括在栖息地中微生物分类群的多样性和微生物分类群内的遗传多样性,以及的多样性和微生物分类群内的遗传多样性,以及包括群落结构的变异、相互作用的复杂性、营养包括群落结构的变异、相互作用的复杂性、营养水平(水平(tropic level)和共位群()和共位群(quild)数量(功)数量(功能多样性)在内的生态多样性。能多样性)在内的生态多样性。土壤微生物多样土壤微生物多样性多以土壤生物区系的变化和生物化学过程间的性多以土壤生物区系的变化和生物化学过程间的相互关系为指示,目前土壤微生物多样性研究主相互关系为指示,目前土壤微生物多样性研究主要从物种多样性、功能多样性和遗传多样性三个要从物种多样性
15、、功能多样性和遗传多样性三个层面展开。层面展开。争论!争论!DeLong认为生物多样性应从物种多样性、遗传认为生物多样性应从物种多样性、遗传(基基因因)多样性和生态系统多样性三个层次上综合表述。马多样性和生态系统多样性三个层次上综合表述。马克平等认为生物多样性可分为物种多样性、基因多样性、克平等认为生物多样性可分为物种多样性、基因多样性、生态系统多样性和景观多样性四个层次。生态系统多样性和景观多样性四个层次。Solbrig对微对微生物群落多样性进行剖析后提出生物群落多样性进行剖析后提出3个组成要素个组成要素:物种多样物种多样性、遗传多样性和功能多样性。而性、遗传多样性和功能多样性。而Watve
16、等则认为等则认为,微微生物多样性可细致划分为生活环境多样性、生长繁殖速生物多样性可细致划分为生活环境多样性、生长繁殖速度多样性、营养和代谢类型多样性、生活方式多样性、度多样性、营养和代谢类型多样性、生活方式多样性、基因多样性和微生物资源开发利用多样性等。但不论如基因多样性和微生物资源开发利用多样性等。但不论如何划分何划分,如果将土壤微生物的多样性与整个生态系统联如果将土壤微生物的多样性与整个生态系统联系起来系起来,都可以从物种多样性、遗传多样性、生态特征都可以从物种多样性、遗传多样性、生态特征多样性和功能多样性多样性和功能多样性4个方面全面的概括土壤微生物多个方面全面的概括土壤微生物多样性的基
17、本特征。样性的基本特征。(DeLong EF.1996;马克平,钱迎倩.1994;Solbrig OT.1991;Watve MG,Gangal RM.1996)存在问题?存在问题?大量微生物的不可培养性是传统微生物生态学在大量微生物的不可培养性是传统微生物生态学在揭示自然界微生物群落结构、生态功能及其相互关揭示自然界微生物群落结构、生态功能及其相互关系研究中的最大障碍系研究中的最大障碍 但随着分子生物学的理论与技但随着分子生物学的理论与技术在微生物生态学研究中的不断渗透术在微生物生态学研究中的不断渗透,土壤微生物多土壤微生物多样性的研究有了新的突破样性的研究有了新的突破,其结果更趋于真实其结
18、果更趋于真实,大量大量未被认知的微生物新物种及其新功能得到鉴定和应未被认知的微生物新物种及其新功能得到鉴定和应用。当前对土壤微生物多样性的研究稍然较集中于用。当前对土壤微生物多样性的研究稍然较集中于其物种和生态特征其物种和生态特征,而对土壤微生物功能多样性而对土壤微生物功能多样性,对对土壤微生物不同种群之间的关系土壤微生物不同种群之间的关系,以及土壤微生物如以及土壤微生物如何影响生态进程、维持和稳定生态系统的研究还不何影响生态进程、维持和稳定生态系统的研究还不够深入。够深入。(土壤微生物多样性及其环境影响因子研究进展 张 薇等2005)2 2 土壤微生物研究进展土壤微生物研究进展 对土壤微生物
19、群落结构的研究日益增多,研究的方法也在不断改进,目前的研究方法大致可分为四类:1 传统的微生物培养法传统的微生物培养法 2 生物标记法生物标记法 3 BIOLOG鉴定系统鉴定系统 4 分子生物学法分子生物学法(1)传统的微生物培养法)传统的微生物培养法 传统的微生物培养法就是根据目标微生物选择相应的培养基,然后通过各种微生物的生理生化特征及外观形态等方面进行分析鉴定。这种方法对于衡量小群体多样性方面不失为一种快速的方法(Kennedy andsmith,1995)。但无法全面反映微生物生长的自然条件,常常造成某些微生物的富集生长.因此传统的研究方法只能反映极少数微生物的信息,所测结果误差较大,
20、埋没了大量极有应用价值的微生物资源.另外,由于缺乏对微生物真正生存环境的认识,所以迄今为止,只有1%的土壤微生物能够被培养,而大多数只能存在而无法被培养。因此这种传统的研究方法只能作为一种辅助手段,并且只有与其他先进方法结合起来才能较为客观而全面的反映微生物群落结构的真实信息。(2)生物标记法)生物标记法 由于以往的生物化学只是对微生物群落中的部分群落进行测量,所得数据也无法对微生物群落进行分析.近20年来微生物学者们潜心研究并确立了另一种可靠估价微生物生物量及群落结构的方法-生物标记物法.生物标记物法的优点是既不需要把微生物的细胞从环境样品中分离,又能克服由于微生物培养而导致不同微生物种群可
21、能发生的选择性生长所造成的麻烦12.目前用生物标记物来定量描述土壤微生物群落结构是较为常用的方法之一.常使用的生物标记物有磷壁酸、酯类多糖类A脂肪酸等.蔡燕飞等利用脂肪酸甲酯法研究生态有机肥对番茄青枯病的抑制及土壤微生物的影响,结果表明能够通过脂肪酸的研究调查微生物群落结构的变化。事实证明利用脂肪酸的组成模式当作土壤微生物的指纹在横向上估价土壤微生物的群落结构和多样性是可行的。(3)BIOLOG鉴定系统鉴定系统 BIOLOG系统是Garland和Miss1991年建立起来的一套用于研究土壤微生物群落结构和功能多样性的方法.这种方法是根据微生物对单一碳源底物的利用能力的差异,当接种菌悬液时,其中
22、的一些孔中的营养物质被利用,使孔中的氧化反应指示剂四氯唑紫呈现不同程度的紫色,从而构成了该微生物的特定指纹.经过BIOLOG系统配套软件分析,并与标准菌种的数据库比较之后,该菌株的分类地位便被确认出来.这种方法成功的运用在区分作物的土壤微生物区系方面.作物方面的影响可能与植物根系分泌物有关,分泌物质导致了某些底物利用率能力的差异.杨永华等利用BIOLOG微平板研究农药污染群落的影响,获得了较好的效果.由于可以快速、简便地获得大量土壤微生物群落结构和功能多样性方面的信息,仍被认为是一种较好的方法。(4)分子生物学法)分子生物学法 现代分子生物技术的发展使生物学的研究更加现代分子生物技术的发展使生
23、物学的研究更加深入深入,并逐步成为揭示生命科学规律的有效手段并逐步成为揭示生命科学规律的有效手段.自自从第一次从土壤中提取细菌从第一次从土壤中提取细菌DNADNA以来以来,在土壤微生物在土壤微生物群落功能评价和方法研究上取得了很大进展群落功能评价和方法研究上取得了很大进展.利用利用分子技术分析核酸使人们逐渐认识到微生物多样性分子技术分析核酸使人们逐渐认识到微生物多样性的复杂性的复杂性.土壤微生物在基因水平上的多样性可以土壤微生物在基因水平上的多样性可以通过微生物中通过微生物中DNADNA组成的复杂性表现出来迄今为止组成的复杂性表现出来迄今为止,对于土壤微生物这一特殊功能群体的研究还不十分对于土
24、壤微生物这一特殊功能群体的研究还不十分清楚清楚.利用分子生物技术进行土壤微生物多样性的利用分子生物技术进行土壤微生物多样性的评估弥补了传统培养中微生物多样性信息丢失及种评估弥补了传统培养中微生物多样性信息丢失及种群构成发生变化的弊端群构成发生变化的弊端,能够更真实可靠地反映土能够更真实可靠地反映土壤微生物的原始组成情况壤微生物的原始组成情况.因此因此,用分子生物学手段用分子生物学手段进一步对林区土壤微生物活性及多样性研究是很有进一步对林区土壤微生物活性及多样性研究是很有意义的。意义的。对土壤微生物的对土壤微生物的4类研究方法即类研究方法即:传统微生物培养法、传统微生物培养法、微生物标记物法、微
25、生物标记物法、BIOLOG GN微平板法和微生物分子微平板法和微生物分子生物技术方法及其应用特点进行了简要的评述和分析生物技术方法及其应用特点进行了简要的评述和分析,旨在通过比较寻求能够揭示土壤微生物群落结构的最佳旨在通过比较寻求能够揭示土壤微生物群落结构的最佳方法。分子生物技术方法与传统研究方法等相结合将是方法。分子生物技术方法与传统研究方法等相结合将是大力推动土壤微生物研究的有效方式大力推动土壤微生物研究的有效方式 分子生物技术的发展使我们逐渐打开了土壤这个分子生物技术的发展使我们逐渐打开了土壤这个“黑匣子黑匣子”。利用这些新技术可以对土壤微生物多样性进。利用这些新技术可以对土壤微生物多样
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