生物化学复习2.ppt
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1、n生物化学复习2n Still waters run deep.流静水深流静水深,人静心深人静心深 nWhere there is life,there is hope。有生命必有希望。有生命必有希望生命物质代谢分为生命物质代谢分为分解分解和和合成合成,同时与同时与能量能量代谢相伴随;代谢相伴随;是通过所谓的是通过所谓的代谢途径代谢途径进行的;进行的;是通过生命物质是通过生命物质各自各自的新陈代谢和的新陈代谢和共同协作共同协作完成的。完成的。生命物质代谢的特点生命物质代谢的特点 一、代谢途径及其特点一、代谢途径及其特点完成某一代谢过程的一组相互衔接的酶促反应称为代谢途径。完成某一代谢过程的一组
2、相互衔接的酶促反应称为代谢途径。1.代谢途径是不可逆的。代谢途径是不可逆的。2.代谢途径的形式多样(线状、环状、分支状)。代谢途径的形式多样(线状、环状、分支状)。3.代谢途径有确定的细胞定位代谢途径有确定的细胞定位,特别在真核生物是高,特别在真核生物是高度分室,有的代谢途径涉及多个区域。度分室,有的代谢途径涉及多个区域。糖异生:线粒体、细胞液(多数)、内质网(最后一步)糖异生:线粒体、细胞液(多数)、内质网(最后一步)尿素循环:肝细胞线粒体和细胞液尿素循环:肝细胞线粒体和细胞液ATPPi葡萄糖葡萄糖6-6-磷酸葡萄糖磷酸葡萄糖细细胞胞液液内内质质网网代谢途径有确定的细胞定位代谢途径有确定的细
3、胞定位,有利于调控;防止错有利于调控;防止错误反应的发生;减少无效循环误反应的发生;减少无效循环一、代谢途径及其特点一、代谢途径及其特点1.代谢途径是不可逆的。代谢途径是不可逆的。2.代谢途径的形式是多样的。代谢途径的形式是多样的。3.代谢途径有确定的细胞定位代谢途径有确定的细胞定位,特别在真核生物是高度分室,特别在真核生物是高度分室,有的代谢途径涉及多个区域。有的代谢途径涉及多个区域。4.代谢途径之间相互沟通(有枢纽)。代谢途径之间相互沟通(有枢纽)。5.代谢途径之间有能量关联。代谢途径之间有能量关联。6.各种生物在基本代谢途径上高度保守。各种生物在基本代谢途径上高度保守。7.代谢途径的流量
4、可调控,至少有一个限速步骤代谢途径的流量可调控,至少有一个限速步骤,往往通过关,往往通过关键酶来实现调控。键酶来实现调控。二、生命物质代谢的活化二、生命物质代谢的活化1.糖糖 (1)降解:)降解:磷酸化磷酸化 (2)合成:)合成:UDPG(ADPG、GDPG)2.甘油三酯甘油三酯 (1)磷酸甘油)磷酸甘油 (2)脂酰)脂酰CoA3.磷脂磷脂 (1)CDP-X (2)CDP-甘油二酯甘油二酯 (3)磷酸甘油)磷酸甘油4.Pr合成合成 aa活化活化:氨酰氨酰-AMP生物大分子的分解有三个阶段:生物大分子的分解有三个阶段:1.1.复杂大分子降解产生构件分子复杂大分子降解产生构件分子2.2.构件分子氧
5、化分解产生乙酰辅酶构件分子氧化分解产生乙酰辅酶A A等等3.3.最终的共同代谢途径。最终的共同代谢途径。TCA TCA、呼吸链、氧化磷酸化、呼吸链、氧化磷酸化放能很少放能很少放能(约三分之一)放能(约三分之一)释放大量能量释放大量能量三、分解代谢的特点三、分解代谢的特点(一)阶段性和趋同性(一)阶段性和趋同性(二)降解产生构件分子的方式(二)降解产生构件分子的方式q水解水解q磷酸解磷酸解q硫解硫解q焦磷酸解焦磷酸解三、分解代谢的特点三、分解代谢的特点(一)阶段性和趋同性(一)阶段性和趋同性(三)构件分子进一步分解的特点(三)构件分子进一步分解的特点1.产物为简单无机物产物为简单无机物2.种属不
6、同,分解的终产物可能不同种属不同,分解的终产物可能不同 qaa中中N的最终代谢物的最终代谢物q 嘌呤碱的最终代谢物嘌呤碱的最终代谢物3.C骨架的彻底分解经过骨架的彻底分解经过TCA和氧化磷酸化完成和氧化磷酸化完成四、合成代谢的特点四、合成代谢的特点(一)阶段性和趋异性(一)阶段性和趋异性 生物分子结构的多层次性决定了合成代谢的阶段性。生物分子结构的多层次性决定了合成代谢的阶段性。(二)营养依赖性(必需)(二)营养依赖性(必需)(三)需要能量推动(三)需要能量推动 直接来自直接来自NADPH和和NTP。能量主要用于。能量主要用于活化前体活化前体或构件分或构件分子,以及用于还原步骤等。子,以及用于
7、还原步骤等。(四)信息来源(四)信息来源1.模板指导组装模板指导组装 2.酶促组装酶促组装:有些构件序列简单均一的大分子,其信息指有些构件序列简单均一的大分子,其信息指令来自酶分子,不需要模板。如令来自酶分子,不需要模板。如糖原糖原、肽聚糖、一些小、肽聚糖、一些小肽等,在专一的酶指导和催化下合成。肽等,在专一的酶指导和催化下合成。n不定向代谢:细胞内某些具有双功能的代谢途径,不定向代谢:细胞内某些具有双功能的代谢途径,既可参与分解代谢,又可参与合成代谢。既可参与分解代谢,又可参与合成代谢。Ile Met Val ThrAsp Phe Tyr 五、学习重点和方法五、学习重点和方法(一)基本途径、
8、生理意义和能量变化(一)基本途径、生理意义和能量变化(二)关键酶及其主要调节方式(二)关键酶及其主要调节方式(三)各物质代谢间相互联系(三)各物质代谢间相互联系(四)框架一定要清楚(四)框架一定要清楚n物质代谢中,分解代谢和合成代谢不是简单的逆过程,物质代谢中,分解代谢和合成代谢不是简单的逆过程,其意义何在?举例说明。其意义何在?举例说明。2006中山大学中山大学 第四章第四章 糖糖 代代 谢谢Metabolism of Carbohydrate一、糖代谢总论一、糖代谢总论 二、糖酵解及厌氧发酵二、糖酵解及厌氧发酵三、葡萄糖的有氧分解代谢三、葡萄糖的有氧分解代谢四、糖异生四、糖异生五、多糖、寡
9、聚糖的酶促降解和合成五、多糖、寡聚糖的酶促降解和合成1.葡萄糖在糖代谢中的中心地位葡萄糖在糖代谢中的中心地位(一)糖分解代谢的特点(一)糖分解代谢的特点一、糖代谢总论一、糖代谢总论(二)糖合成代谢的特点(二)糖合成代谢的特点1.绿色植物和光合细菌绿色植物和光合细菌2.动物的糖异生通过多种途径动物的糖异生通过多种途径2.2.碳链断裂的方式碳链断裂的方式3.3.受氧气供应的影响受氧气供应的影响,有有3 3条主要途径条主要途径4.4.活化方式活化方式5.5.终产物终产物1.葡萄糖在糖代谢中的中心地位葡萄糖在糖代谢中的中心地位n寡糖、淀粉和糖原经消化主要转变为寡糖、淀粉和糖原经消化主要转变为G等等EM
10、P中代谢物分解中代谢物分解n果糖果糖n半乳糖半乳糖 Gal-1-PUT(一)糖分解代谢的特点(一)糖分解代谢的特点一、糖代谢总论一、糖代谢总论(1)肌肉)肌肉(2)肝脏)肝脏 果糖激酶和醛缩酶果糖激酶和醛缩酶B醛缩酶醛缩酶B醛缩酶醛缩酶B果糖激酶果糖激酶果糖激酶果糖激酶甘油醛激酶甘油醛激酶Gal-1-PUT半乳糖和果糖的代谢半乳糖和果糖的代谢1.葡萄糖在糖代谢中的中心地位葡萄糖在糖代谢中的中心地位n寡糖、淀粉和糖原经消化主要转变为寡糖、淀粉和糖原经消化主要转变为G等等EMP中代谢物分解中代谢物分解n果糖果糖(1)肌肉)肌肉(2)肝脏)肝脏 果糖激酶和醛缩酶果糖激酶和醛缩酶B果糖不耐症:肝中缺乏
11、果糖不耐症:肝中缺乏B型醛缩酶。积累型醛缩酶。积累F-1-P,肝脏无机,肝脏无机Pi大量大量消耗,使消耗,使ATP浓度下降,浓度下降,EMP加速加速,产生大量乳酸,甚至危及产生大量乳酸,甚至危及生命。生命。3-磷酸甘油醛磷酸甘油醛甘油醛激酶甘油醛激酶n半乳糖半乳糖半乳糖血症:半乳糖血症:常染色体隐性遗传,缺乏常染色体隐性遗传,缺乏半乳糖半乳糖-1-磷酸尿苷酰磷酸尿苷酰转移酶转移酶,不能将,不能将Gal-1-P转变为转变为UDPGal。而。而Gal-1-P对细对细胞有害,侵害肝、肾、脑、晶状体,一周后肝肿大、黄疸、胞有害,侵害肝、肾、脑、晶状体,一周后肝肿大、黄疸、腹水、白内障,数月后智力发育障
12、碍,若出生后不喂乳及腹水、白内障,数月后智力发育障碍,若出生后不喂乳及乳制品则可正常发育。乳制品则可正常发育。2.2.碳链断裂的方式碳链断裂的方式3.3.受氧气供应的影响受氧气供应的影响,有有3 3条主要途径条主要途径 (1 1)无氧:)无氧:EMP PPPEMP PPP (2 2)有氧:)有氧:EMP TCA PPPEMP TCA PPP4.4.活化方式活化方式5.5.终产物终产物6C 26C 2(3C3C)2 2(2C2C)CO2CO22CO2CO2 2COCO2 2裂合裂合脱羧脱羧脱羧脱羧磷酸化和酰基化磷酸化和酰基化1.绿色植物和光合细菌绿色植物和光合细菌2.动物的糖异生通过多种途径动物
13、的糖异生通过多种途径(二)糖合成代谢的特点(二)糖合成代谢的特点1.绿色植物和光合细菌绿色植物和光合细菌2.动物的糖异生通过多种途径动物的糖异生通过多种途径(一)糖酵解(途径)(一)糖酵解(途径)也称作也称作Embden-Meyethof-ParnasEmbden-Meyethof-Parnas途径。途径。(二)发酵(二)发酵二、糖酵解及发酵二、糖酵解及发酵n二者的异同二者的异同底物、产物、还原型辅酶和条件底物、产物、还原型辅酶和条件发酵:复杂的有机化合物在微生物的作用下分解发酵:复杂的有机化合物在微生物的作用下分解成比较简单的物质成比较简单的物质(一)糖酵解(一)糖酵解(途径)途径)n为什么
14、砷酸盐是糖酵解的毒物?为什么砷酸盐是糖酵解的毒物?n巴斯德效应巴斯德效应n将将G 的的C-1 用用14C 标记,并将其与糖酵解有关的酶和辅酶一标记,并将其与糖酵解有关的酶和辅酶一起温育。在产物起温育。在产物Pyr上上14C 位于几号位?位于几号位?n若以若以14C 标记标记G 的的C-3,作为酵母的底物,经充分发酵后,作为酵母的底物,经充分发酵后 14C将在何处发现?将在何处发现?nG的哪位碳原子被的哪位碳原子被14C 标记可以得到第三位碳原子被标记的标记可以得到第三位碳原子被标记的乳酸。乳酸。2007 南京大学南京大学(一)糖酵解(一)糖酵解(途径)途径)n糖酵解是将糖酵解是将G Pyr并伴
15、随并伴随ATP生成的一系列反应,是生生成的一系列反应,是生物体内普遍存在的物体内普遍存在的G降解的途径。降解的途径。1.EMP的反应历程的反应历程2.调节酶调节酶3.3-磷酸甘油醛脱氢酶作用机制磷酸甘油醛脱氢酶作用机制4.G-6-P的去路的去路ATP ADPATPADP葡萄糖激葡萄糖激酶磷酸果糖激磷酸果糖激酶异构异构酶第一阶段:葡萄糖的磷酸化第一阶段:葡萄糖的磷酸化1.EMP的反应历程的反应历程己糖激己糖激酶第二第二阶段:段:磷酸己糖的裂解磷酸己糖的裂解醛缩酶异构异构酶第三第三阶段:段:PEP、Pyr和和ATP的生成的生成NAD+NADH+H+PiADP ATPH2OMg或或MnATP ADP
16、 PyrPEP丙丙酮酸激酸激酶脱脱氢酶激激酶变位位酶烯醇化醇化酶*nG 的的C-6 用用14C 标记?将标记?将G 的的C-3 用用14C 标记?标记?*n将将G 的的C-1 用用14C 标记,并将其与糖酵解有关的酶和辅酶一标记,并将其与糖酵解有关的酶和辅酶一起温育。起温育。14C位于位于Pyr上几号位?上几号位?若发酵产生乙醇和二氧化碳,将在何处发现若发酵产生乙醇和二氧化碳,将在何处发现14C?n产生能量产生能量ATP某些细胞唯一途径或缺氧时合成某些细胞唯一途径或缺氧时合成ATP的主要途径,如:剧烈运动的肌肉的主要途径,如:剧烈运动的肌肉细胞;成熟红细胞;神经、白细胞、骨髓等代谢极为活跃,即
17、使不缺细胞;成熟红细胞;神经、白细胞、骨髓等代谢极为活跃,即使不缺氧也常有糖酵解提供部分能量氧也常有糖酵解提供部分能量。n中间物质作为其它物质合成的原料中间物质作为其它物质合成的原料如磷酸二羟丙酮、如磷酸二羟丙酮、G-6-P等等n是有氧和无氧代谢的共同途径是有氧和无氧代谢的共同途径2.2.要点要点1231233.EMP生物学意义生物学意义4.调节酶调节酶C骨架骨架最强别构激活剂最强别构激活剂能量能量HKPFKPK为什么选择为什么选择了了PFK GK(己糖激酶(己糖激酶IV)HK分布分布 肝和胰腺肝和胰腺-细胞细胞 广泛广泛专一性专一性 葡萄糖葡萄糖 己糖己糖Km值值 高(高(12 mmol/L
18、)低(低(10 mol/L)G-6-P抑制抑制 无,但无,但长链脂酰长链脂酰CoA 有抑制作用有抑制作用 有别构抑制作用,并有别构抑制作用,并 受激素调节,胰岛素受激素调节,胰岛素 可诱导该酶基因转录,可诱导该酶基因转录,促进其合成。促进其合成。(1)HK或葡萄糖激酶(或葡萄糖激酶(GK):):HK和和GK的动力学作图的动力学作图Km值比较:值比较:GK的的Km值大得多,即值大得多,即在很高的在很高的G浓度时浓度时才起作用。才起作用。平时细胞内葡萄糖浓度为平时细胞内葡萄糖浓度为5mmol/L,HK的酶促反应已达的酶促反应已达最大速度,而最大速度,而GK并不活跃。并不活跃。由由Km值看值看GK的
19、生理作用:的生理作用:只有在饭后,大量消化吸收的只有在饭后,大量消化吸收的G进入肝脏后,进入肝脏后,GK的酶的酶促反应才加强,并进而合成成糖原储存于肝中,在维促反应才加强,并进而合成成糖原储存于肝中,在维持血糖浓度恒定的过程中发挥了重要作用。持血糖浓度恒定的过程中发挥了重要作用。当且仅当当且仅当 G浓度高时浓度高时 G G-6-P G-1-P UDPG 肝糖原肝糖原(2)果糖)果糖-6-磷酸激酶磷酸激酶关键的调控酶关键的调控酶n别构调节别构调节n共价修饰调节(激素也参与调控)共价修饰调节(激素也参与调控)别构调节别构调节别构抑制剂别构抑制剂:ATP(能量能量)、柠檬酸柠檬酸(碳骨架)、质子(碳
20、骨架)、质子别构激活剂别构激活剂:AMP、ADP、F-6-P、2,6-FBPF-6-PF-1,6-BPPFK-1AMP、ADP、F-2,6-BPATP、柠檬酸、柠檬酸(2)果糖)果糖-6-磷酸激酶磷酸激酶关键的调控酶关键的调控酶nATPATP是是S S,浓度低时,浓度低时n别构抑制剂,浓度低高时。降低别构抑制剂,浓度低高时。降低PFKPFK和和 F-6-PF-6-P的亲和力。的亲和力。nATP在反应中的作用在反应中的作用磷酸果糖激酶亚基的结构磷酸果糖激酶亚基的结构白色为白色为ATP,红色为果糖,红色为果糖-6-磷酸磷酸n巴斯德效应如何解释巴斯德效应如何解释?说明说明EMP、TCA和氧化磷酸化之
21、间协调控制和氧化磷酸化之间协调控制n在厌氧条件下在厌氧条件下,向高速发酵的培养基中通入氧气向高速发酵的培养基中通入氧气,则葡萄糖消耗减少则葡萄糖消耗减少,抑制发酵产物积累的现象称为抑制发酵产物积累的现象称为巴斯德效应。巴斯德效应。n在好氧条件下,糖代谢进入在好氧条件下,糖代谢进入TCA循环,产生柠循环,产生柠檬酸,并通过氧化磷酸化生成大量的檬酸,并通过氧化磷酸化生成大量的ATP,细胞,细胞内大量积累内大量积累ATP,柠檬酸生成增加。,柠檬酸生成增加。ATP和柠檬和柠檬酸抑制酸抑制PFK的活性,从而使整个的活性,从而使整个EMP降低。降低。F-2,6-BPF-2,6-BP是别构激活剂是别构激活剂
22、,增加增加PFKPFK和和 F-6-PF-6-P的亲和力。的亲和力。nF-2,6-BP的别构激活作用的别构激活作用F-2,6-BP可降低可降低ATP的抑制程度(增加与的抑制程度(增加与S的亲和力)的亲和力)F-6-PF-2,6-BPPFK2PFK2ATPATPADPADPAMPAMP柠檬酸柠檬酸+-2,6-FBP2,6-FBP的生成、分解及其调节的生成、分解及其调节生成和分解由一个双功能酶催化生成和分解由一个双功能酶催化果糖二磷酸酶果糖二磷酸酶-2-2PiPiH H2 2O OPFK-2PFK-2的结构的结构双功能酶双功能酶Regulatory domainKinase domainPhosp
23、hatase domain+H3NCOO-ATPPi6-6-磷酸果糖激酶磷酸果糖激酶-2/-2/果糖双果糖双磷酸酶磷酸酶-2-2 Pi(磷酸酶(磷酸酶)胰高血糖素胰高血糖素胰岛素胰岛素-_ _+ADP依赖依赖cAMP蛋蛋白激酶白激酶磷蛋白磷酸磷蛋白磷酸酶酶-2A(2C)Ser326-6-磷酸果糖激酶磷酸果糖激酶-2/-2/果糖双果糖双磷酸酶磷酸酶-2-2Ser32(激酶(激酶 )共价修饰调节共价修饰调节ATP6-6-磷酸果糖激酶磷酸果糖激酶-2/-2/果糖双果糖双磷酸酶磷酸酶-2-2 Pi(磷酸酶(磷酸酶)胰高血糖素胰高血糖素胰岛素胰岛素-_ _+ADP依赖依赖cAMP蛋蛋白激酶白激酶Ser3
24、26-6-磷酸果糖激酶磷酸果糖激酶-2/-2/果糖双果糖双磷酸酶磷酸酶-2-2Ser32(激酶(激酶 )G缺乏时,胰高血糖素启动缺乏时,胰高血糖素启动cAMP介导的级联效应,引起该酶介导的级联效应,引起该酶磷酸化,使得磷酸化,使得FBP2 激活而激活而PFK2受抑制。受抑制。G升高时,胰岛素抑制升高时,胰岛素抑制cAMP介导的级联效应,使该酶去磷酸介导的级联效应,使该酶去磷酸化,使得化,使得PFK2 激活而激活而FBP2受抑制。受抑制。(3)丙酮酸激酶()丙酮酸激酶(PK)PEP Pyr (共同代谢中间物)(共同代谢中间物)n别构调节别构调节 1,6-FBP激活,激活,ATP抑制,抑制,Ala
25、抑制抑制n共价修饰共价修饰 磷酸化失活磷酸化失活丙酮酸激酶催化活性控制关系图丙酮酸激酶催化活性控制关系图磷酸化的丙酮酸激酶磷酸化的丙酮酸激酶(低活性)(低活性)去磷酸化的丙酮酸激酶去磷酸化的丙酮酸激酶(高活性)(高活性)H2OPiATPADPATP丙氨酸丙氨酸果糖果糖-1,6-二磷酸二磷酸+低血糖低血糖Pi+nHK、PFK和和Pyr三个酶活性如何协调?三个酶活性如何协调?5.3-磷酸甘油醛脱氢酶的作用机制磷酸甘油醛脱氢酶的作用机制n若厌氧生物若厌氧生物3-磷酸甘油醛脱氢酶突变,会对其产生什么磷酸甘油醛脱氢酶突变,会对其产生什么影响?影响?5.3-磷酸甘油醛脱氢酶的作用机制磷酸甘油醛脱氢酶的作用
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