医学分子生物学实验技术知识讲解.ppt
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1、医学分子生物学实验技术 Still waters run deep.流静水深流静水深,人静心深人静心深 Where there is life,there is hope。有生命必有希望。有生命必有希望第一章蛋白质的分离纯化生命大分子物质的特点:1、生命大分子是动物、植物和微生物在进行新陈代谢时所产生的活性物质2、生命大分子的特殊性和复杂性3、生命大分子都是由简单的小分子构成的物4、具有特殊的结构和功能5、生命大分子不稳定11/14/20222材料的选择与处理材料的选择有效成分:欲纯化的某种单一的生命大分子物质。相对于有效成分以外的物质称杂质。材料来源动物植物 根、茎、叶微生物组织、器官血液、
2、分泌物11/14/20223选材原则:含有效成分丰富、稳定性好;来源丰富、保持新鲜;材料适合加工提取;具有经济利用价值。组织差异性时间差异性生理状态差异性研究对象的选择11/14/20224蛋白质在组织或细胞中一般都是以复杂的混合形式存在,每种类型的细胞都含有上千种不同的蛋白质。蛋白质的分离(separation,isolation)和纯化(purification)工作是生物化学中一项艰巨而繁重的任务。11/14/20225蛋白质纯化的总目标总目标是增加制品的纯度(purity)或比活(specific activity),以增加单位蛋白质重量中所要蛋白质的含量或生物活性(比活常以活力单位数
3、毫克蛋白质表示)。分离纯化某一特定蛋白质的一般程序可以分为前处理前处理、粗分级粗分级分离和细分级细分级分离3步11/14/20226(1)前处理前处理(pretreatment)分离纯化某一蛋白质,首先要求把蛋白质从原来的组织或细胞中以溶解的状态释放出来,并保持原来的天然状态,不丢失生物活性。动物材料应先剔除结缔组织和脂肪组织。11/14/20227种子材料应先去壳甚至去种皮以免受杂质的污染,油料种子最好先用低沸点的有机溶剂如乙醚等脱脂。然后根据不同的情况,选择适当的方法,将组织和细胞破碎。11/14/20228机械破碎法捣碎法研磨法匀浆法物理破碎法温度差破碎法压力差破碎法超声破碎法化学破碎法
4、 利用化学渗透的方法,通过有机溶剂、抗生素、表面活性剂、金属熬合剂、变性剂等,使细胞膜破碎的方法。酶促破碎法 利用酶的活性破坏细胞膜的化学结构使细胞膜破碎的方法。11/14/20229如果所要的蛋白质主要集中在某一细胞组分,如细胞核、染色体、核糖体或可溶性的细胞质等,则可利用差速离心方法将它们分开在不同离心力场下沉降的细胞器11/14/202210如果碰上所要蛋白质是与细胞膜或膜质细胞器结合的,则必须利用超声波或去污剂使膜结构解聚,然后用适当的介质提取。11/14/202211(2)粗分级分离粗分级分离(rough fractionation)当蛋白质提取液(有时还杂有核酸、多糖之类)获得后,
5、选用一套适当的方法,将所要的蛋白质与其他杂蛋白分离开来。一般这一步的分级分离用盐析、等电点沉淀和有机溶剂分级分离等方法。这些方法的特点是简便、处理量大,既能除去大量杂质(包括脱盐),又能浓缩蛋白质溶液。有些蛋白质提取液体积较大,又不适于用沉淀或盐析法浓缩,则可采用超过滤、凝胶过滤、冷冻真空干燥或其他方法(如聚乙二醇浓缩法)进行浓缩。11/14/202212(3)细分级分离细分级分离(fine fractionation)进一步纯化,一般使用层析法包括凝胶过滤,离子交换层析,吸附层析以及亲和层析等。必要时还可选择电泳法,包括区带电泳、等电聚焦等作为最后的纯化步骤。用于细分级分离的方法一般规模较小
6、,但分辨率很高。11/14/202213(4)结晶结晶 结晶过程本身也伴随着一定程度的纯化,蛋白质纯度愈高,溶液愈浓就愈容易结晶。尽管结晶并不能保证蛋白质一定是均一的,但只有某种蛋白质在溶液中数量上占优势时才能形成结晶。由于结晶中从未发现过变性蛋白质,因此蛋白质的结晶不仅是纯度的一个标志,也是断定制品处于天然状态的有力指标。结晶也是进行X射线晶体学分析所要求的,结晶的最佳条件是使溶液略处于过饱和状态,此时较易得到结晶。接入晶种常能加速结晶过程。11/14/202214第二节 确立测定方法寻找哪些生物材料中含有有效成分监测有效成分提纯程度光谱法吸收光谱荧光光谱浊度分析电化学法生物活性检测法免疫分
7、析法11/14/202215吸收光谱根据有效成分的颜色、对紫外吸收能力进行测定;利用有效成分与生色基团所进行的特殊的呈色反应进行测定。荧光法:利用有效成分所进行的特殊的化学反应并偶联NAD或NADP的还原反应产生NADH或NADPH。还原型尼克酰胺发荧光。也可利用NAD和NADP的光谱变化进行测定11/14/20221611/14/202217比色法葡萄糖O2 H2O 葡萄糖酸H2O2葡萄糖氧化酶H2O2酚4AAP 醌亚胺H2O浊度法:测定悬浮液在不被吸收的波长下表观的消光值。电化学法:测定反应过程中H的浓度变化从而计算出有效成分含量。生物活性检测免疫分析法11/14/202218纯化方案的设
8、计与评价纯化方案:在纯化某一物质过程中,根据被分离物质的理化性质、分离方法的优劣,将几种分离方法有机地结合并灵活应用,实现提取被分离物质的技术路线,称纯化方案。11/14/202219初分离精细分离盐析法有机溶剂沉淀法电泳法层析法离心法离子交换层析排阻层析亲和层析 纯化方案的设计与评价11/14/202220纯化方案的设计与评价纯化方案的评价:是对组成纯化方案的每一种分离方法的评价。有效成分的含量测定比活力测定()活力单位数毫克蛋白纯化倍数()每步的比活力粗提液比活力收得率(100)每步的总活力粗提液总活力评价指标11/14/202221蛋白质纯度和性质的分析纯度分析性质分析比活性电泳分析高压
9、液相或气相色谱免疫分析分子质量测定分子结构测定11/14/202222几种常用的蛋白质纯化方法:几种常用的蛋白质纯化方法:根据蛋白质在溶液中的性质分离纯化蛋白质的方法:分子大小;溶解度;电荷;吸附性质;对配体分子的生物学亲和力等。11/14/202223根据分子大小不同的纯化方法根据分子大小不同的纯化方法 1透析和超过滤透析和超过滤透析(dialysis)是利用蛋白质分子不能通过半透膜的性质,使蛋白质和其他小分子物质如无机盐、单糖等分开。常用的半透膜是玻璃纸和其他改型的纤维素材料。11/14/202224超滤是利用压力或离心力,强行使水和其他小分子溶质通过半透膜,而蛋白质被截留在膜上,以达到浓
10、缩和脱盐的目的。11/14/2022252密度梯度密度梯度(区带区带)离心离心 蛋白质颗粒在具有密度梯度的介质中离心时,质量和密度大的颗粒比质量和密度小的颗粒沉降得快,并且每种蛋白质颗粒沉降到与自身密度相等的介质密度梯度时,即停止不前,最后各种蛋白质在离心管中被分离成独立的区带,11/14/202226密度梯度常用的密度梯度有蔗糖梯度,聚蔗糖梯度。蔗糖便宜,纯度高,浓溶液(60,WW)密度可达1.28 gcm3。聚蔗糖的商品名是Ficoll,它是由蔗糖和1氯2,3环氧丙烷合成的高聚物,Mr约400 000。密度梯度在离心管内的分布是管底的密度最大,向上逐渐减小 11/14/202227凝胶过滤
11、层析凝胶过滤层析 (分子排阻分子排阻)(1)凝胶过滤的介质)凝胶过滤的介质 凝胶过滤所用的介质是凝胶颗粒,其内部是多孔的网状结构,11/14/202228二、利用溶解度差别的纯化方法二、利用溶解度差别的纯化方法 影响蛋白质溶解度的外部因素很多,其中主要有:溶液的pH,离子强度,介电常数,温度。自身因素:在同一的外部条件下,不同蛋白质具有不同的溶解度,这是因为溶解度归根结底取决于它们本身的分子结构,例如分子所带电荷的性质和数量、亲水基团与疏水基团的比例,它们在蛋白质分子表面的排列以及由此而产生的偶极矩等。11/14/2022291.pH控制蛋白质的沉淀控制蛋白质的沉淀蛋白质处于等电点时,其静电荷
12、为零,由于相邻蛋白质分子之间没有静电斥力而趋于聚集沉淀。不同的蛋白质具有不同的等电点,利用蛋白质在等电点时溶解度最低的原理,可以把蛋白质混合物分开。11/14/2022302.蛋白质的盐溶和盐析蛋白质的盐溶和盐析 盐溶:盐溶:低浓度时,中性盐可以增加蛋白低浓度时,中性盐可以增加蛋白质的溶解度,这种现象称为质的溶解度,这种现象称为盐溶盐溶。由于蛋白质分子吸附某种盐类离子后,由于蛋白质分子吸附某种盐类离子后,带电层使蛋白质分子彼此排斥,而蛋白带电层使蛋白质分子彼此排斥,而蛋白质分子与水分子间的相互作用却加强,质分子与水分子间的相互作用却加强,因而溶解度增高因而溶解度增高盐溶11/14/202231
13、盐析:盐析:当溶液的离子强度增加到一定数值时,蛋白质溶解度开始下降。当离子强度增加到足够高时,例如饱和或半饱和的程度,很多蛋白质可以从水溶液中沉淀出来,这种现象称为盐析(salting out)。大量中性盐的加入使水的活度降低,原来溶液中的大大量中性盐的加入使水的活度降低,原来溶液中的大部分甚至全部的自由水转变为盐离子的水化水。导致部分甚至全部的自由水转变为盐离子的水化水。导致蛋白质表面的疏水基团的暴露蛋白质表面的疏水基团的暴露盐析(NH4)2SO4)11/14/2022323有机溶剂分级分离法有机溶剂分级分离法 与水互溶的有机溶剂(如甲醇、乙醇和丙酮等)能使蛋白质在水中的溶解度显著降低。在室
14、温下,这些有机溶剂不仅能引起蛋白质沉淀,而且伴随着变性。11/14/2022333有机溶剂分级分离的有机溶剂分级分离的机理机理有机溶剂引起蛋白质沉淀的主要原因之一是改变了介质的介电常数。水是高介电常数物质(20时,80),有机溶剂是低介电常数物质(20时,甲醇33,乙醇24,丙酮21.4),因此有机溶剂的加入使水溶液的介电常数降低。这样,蛋白质分子表面可解离基团的离子化程度减弱,水化程度降低,因此促进了蛋白质分子的聚集和沉淀。有机溶剂引起蛋白质沉淀的另一重要方式可能与盐析相似,与蛋白质直接争夺水化水,致使蛋白质聚集而沉淀。11/14/2022344温度对蛋白质溶解度的影响温度对蛋白质溶解度的影
15、响 在一定温度范围内,约040之间,大部分球状蛋白质的溶解度随温度升高而增加,在4050以上,大部分蛋白质变得不稳定并开始变性,一般在中性pH介质中即失去溶解能力。大多数蛋白质在低温下比较稳定,因此蛋白质的分级分离操作一般都在0或更低的温度下进行。11/14/202235电泳 是指带电粒子在电场中向与其自身带相反电荷的电极移动的现象 正极负极带负电粒子带正电粒子蛋白质的电泳分离11/14/202236+-+-蛋白质胶体颗粒的沉淀蛋白质胶体颗粒的沉淀 带正电荷的蛋白质带负电荷的蛋白质在等电点的蛋白质酸酸酸酸碱碱碱碱脱水脱水脱水脱水脱水脱水不稳定的蛋白质颗粒 (沉淀)带正电荷的蛋白质 (疏水胶体)
16、带负电荷的蛋白质 (疏水胶体)碱碱酸酸(亲水胶体)(亲水胶体)(亲水胶体)11/14/202237 带电颗粒在电场中所受到的电场力 F=EQ 根据Stoke定律,球形分子在液体中泳动所受到的阻力 F=6rv电泳原理:11/14/202238 F=F即:EQ=6rv 时,V=EQ6r 当物质在电场中移动时,受到电场力和液体阻力两方面的力的影响,当电场力和阻力平衡时,带电颗粒作匀速运动,11/14/202239 两个带电颗粒能否分开,由两个颗粒在电泳过程中的迁移率所决定,即U=d lVt或d=UVtldU=VEtVl=dlVt 或d1-d2=(U1-U2)Vtld=11/14/202240迁迁移移
17、率率(或或泳泳动动度度)是指带电颗粒在单位电场强度下泳动的速度,可用下列公式计算:=/E=(d/t)/(V/l)=dl/Vt 为迁移率(cm2V-1min-1);为颗粒泳动速度(cms-1);E为电场强度(Vcm-1);d为颗粒泳动的距离(cm);l为滤纸有效长度(cm);V为实际电压(V);t为通电时间(s或min)。通过测量d,l,V,t,即可计算出被分离物质的迁移率。11/14/202241影响电泳的因素1、带电粒子的性质与电泳行为2、电场强度对带电粒子迁移的影响:电场强度也称电位梯度,是指单位长度(每一厘米)支持物体上的电位降,它对泳动速度起着十分重要的作用。一般,电场强度越高,带电颗
18、粒移动速度越快。11/14/2022423、溶液的pH对带电粒子迁移的影响:溶液的pH值决定了带电颗粒解离的程度,也决定了物质所带净电荷的多少。4、电渗对电泳的影响:电渗是在电场中液体对固体的相对移动。11/14/202243电 渗 作 用11/14/2022445、离子强度对电泳的影响:电泳液中的离子增加会使电泳迁移率降低,原因是带电的离子会吸引相反符号的离子聚集在其周围,形成一个与运动粒子符号相反的离子氛,它使该离子向相反的方向运动,从而降低了该粒子的迁移率。11/14/2022456、温度对的电泳的影响:电泳过程中由于通电产生焦耳热,热对电泳有很大的影响。温度每升高1,迁移率约增加2.4
19、%。为降低热效应对电泳的影响,可控制电压或电流,或在电泳系统中安装冷却散热装置。11/14/202246 电 泳 的 分 类 和 特 点电泳的分类自由移动界面电泳区带电泳稳态电泳11/14/202247 自由移动界面电泳(moving boundary electrophoresis),没有支持物,在一个U形管中进行电泳,目前已被区带电泳所取代。区带电泳(zone electrophoresis)在一定的支持物上进行的电泳,电泳结果形成一条条的区带而得名。稳态电泳(steady state electrophoresis)带电颗粒电泳一定时间后达到稳态而停止移动。11/14/20224811/
20、14/202249根据电荷不同的纯化方法根据电荷不同的纯化方法 根据蛋白质的电荷不同即酸碱性质不同分离蛋白质混合物的方法有电泳和离子交换层析两类。1.电泳电泳(electrophoresis)在外电场的作用下,带电颗粒,向着与其电性相反的电极移动,这种现象称为电泳。蛋白质蛋白质电泳电泳分离原理分离原理:分子大小不同的蛋白质所带电种类不同,净电荷密度不同,迁移率不同,因此,在电泳时可以分开。11/14/202250电泳的类型 目前电泳的类型很多,最常见的是区带电泳,由于在支持物上电泳时蛋白质混合物被分离成若干区带而得名。11/14/202251区带电泳按其支持物的物理性状不同可以分成4类:滤纸电
21、泳和薄膜电泳(如醋酸纤维薄膜电泳和聚酰胺薄膜电泳);粉末电泳,支持介质是淀粉、纤维素粉或硅胶粉等,粉末与适当的溶剂调和,铺设成平板;11/14/202252 细丝电泳,如尼龙丝和其他人造丝电泳,这是一类微量电泳;凝胶电泳,最常用的支持介质有聚丙烯酰胺和琼脂糖凝胶,前者适于分离蛋白质和多核苷酸,后者适于分离核酸,这两种凝胶电泳的分辨率都很高,-+11/14/20225311/14/202254双向电泳(two-dimensionalelectrophoresis)11/14/2022552.聚丙烯酰胺凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyacrylaminde gel electrophoresi
22、s,简称PAGE)也称圆盘电泳,它是在区带电泳的基础上发展起来的。它以聚丙烯酰胺凝胶为支持物,一般制作成凝胶柱或凝胶板,11/14/202256按其凝胶的组成系统可分成四种:按其凝胶的组成系统可分成四种:(1)连续凝胶电泳:只用一层凝胶,采用相同的pH值和相同的缓冲液。(2)不连续凝胶电泳:采用二层或三层性质不同的凝胶(即:样品胶、浓缩胶和分离胶)重叠起来,使用两种不同的pH值(6.7和8.3)和不同的缓冲液(Tris-HCl和Tris-Gly)(3)梯度凝胶电泳:采用梯度混合装置,使制得的凝胶由上至下孔径逐渐减小(即凝胶浓度由上至下逐渐增高)。梯度凝胶电泳主要适宜于测定球蛋白的相对分子质量。
23、(4)SDS凝胶电泳:在聚丙烯酰胺凝胶中加入 SDS(十二烷基硫酸钠)11/14/2022574等电聚焦等电聚焦(isoelectric focusing,IEF)等电聚焦是60年代建立的一种高分辨率的蛋白质分离和分析技术。它是利用蛋白质分子或其他两性电解质分子具有不同的等电点,从而在一个稳定、连续、线性的pH梯度中得到分离。近年来,等电聚焦电泳技术的分辨率有了很大提高,可以分辨pI只差0.001的生物大分子,这是等电聚焦最突出的优点,11/14/202258凝胶聚合的原理及有关特性凝胶聚合的原理及有关特性1聚合反应聚合反应 凝胶的聚合单体:丙烯酰胺(Acr)和交联剂甲叉双丙烯酰胺(Bis);
24、常用过硫酸铵(AP)为催化剂,四甲基乙二胺(TEMED)为加速剂。TEMED的碱基可催化AP水溶液产生游离氧原子,激活Acr单体,使其聚合成单体长链,在Bis作用下,聚合成网状凝胶。碱性条件下凝胶易聚合,室温下7.5的凝胶在pH8.8时30min聚合,在pH4.3时约需90min。此外,核黄素亦可为催化剂,聚合需光照,故使用不多。11/14/202259丙烯酰胺凝胶聚合原理 11/14/20226011/14/202261凝胶浓度与被分离物相对分子质量的关系凝胶浓度与被分离物相对分子质量的关系11/14/202262PAGE原理原理PAGE根据其有无浓缩效应,分为 连续系统:电泳体系中缓冲液p
25、H值及凝胶浓度相同,带电颗粒在电场作用下,主要靠电荷及分子筛效应;不连续系统:由电极缓冲液、样品胶、浓缩胶及分离胶组成,两层玻璃板中排列顺序依次为上层样品胶、中间浓缩胶、下层分离胶。电泳体系中由于缓冲液离子成分、pH、凝胶浓度及电位梯度的不连续性。11/14/202263不连续PAGE系统:样品胶的T=3,c=2,缓冲液为pH6.7的Tris-HCl,其作用是防止对流,促使样品浓缩以免被电极缓冲溶稀释。目前,一般不用样品胶,直接在样品液中加入等体积40蔗糖,同样具有防止对流及样品被稀释的作用。T=(a+b)/m l00c=b/(a+b)100式中 a:Acr克数;b:Bis克数;m:缓冲液体积
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