研究发育生物学的模式生物教学文稿.ppt
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1、Developmental Biology研究发育生物学的模式生物Developmental Biology一华美广杆线虫的分类地位一华美广杆线虫的分类地位 华美广杆线虫是一种长为华美广杆线虫是一种长为1 mm,自由生活于土壤,自由生活于土壤中的小线虫,隶属于线形动物门中的小线虫,隶属于线形动物门(Nemathelminthes)线虫线虫纲纲(Nematoda)小杆线虫目小杆线虫目(Rhabditida)广杆线虫属广杆线虫属(Caenorhabditis)。就其与人类的关系来说,华美广杆。就其与人类的关系来说,华美广杆线虫在现已记录的大约线虫在现已记录的大约2万种万种(估计可能有估计可能有4万
2、万1 000万万种种)线虫中,并不是最重要的线虫,所以在我国,即使线虫中,并不是最重要的线虫,所以在我国,即使是从事生命科学研究的学者对其还相当陌生。然而,线是从事生命科学研究的学者对其还相当陌生。然而,线虫的确与人类生活密切相关。一提起寄生于人类肠道中虫的确与人类生活密切相关。一提起寄生于人类肠道中的蛔虫、钩虫和蛲虫及寄生于人的淋巴系统内的丝虫曾的蛔虫、钩虫和蛲虫及寄生于人的淋巴系统内的丝虫曾经给人类带来的危害和痛苦,有谁会不为之惧怕呢经给人类带来的危害和痛苦,有谁会不为之惧怕呢?其其实这些病原寄生虫都属于线虫一类。不同的是,华美广实这些病原寄生虫都属于线虫一类。不同的是,华美广杆线虫不是寄
3、生线虫,而是生活于土壤中、以细菌为食杆线虫不是寄生线虫,而是生活于土壤中、以细菌为食的一种自由线虫。的一种自由线虫。Developmental Biology二作为模式生物的优点二作为模式生物的优点近30年来的研究表明,华美广杆线虫的确是分子发育生物学及细胞生物学、分子生物学和神经生物学研究的极好模型。Developmental Biology作为模式生物,华美广杆线虫的主要优点如下:可在实验室用培养皿培养。由于以细菌为食,在实验室培养时,可在实验室用培养皿培养。由于以细菌为食,在实验室培养时,一般是先让琼脂培养皿长满细菌,再接种线虫。一般是先让琼脂培养皿长满细菌,再接种线虫。生命周期短生命周
4、期短(一般为一般为3.5d),胚胎发育速度快。在培养温度为,胚胎发育速度快。在培养温度为1 6度,胚胎发育期为度,胚胎发育期为1 8h;在培养温度为;在培养温度为25度,胚胎发育期为度,胚胎发育期为1 2 h。Developmental Biology 存在雌雄同体存在雌雄同体(1lermaphrodite)和雄性两类不同生物型,和雄性两类不同生物型,主要是雌雄同体生物型。主要是雌雄同体生物型。在雌雄同体生物型中,每尾线虫既含有卵子又含有精在雌雄同体生物型中,每尾线虫既含有卵子又含有精子,精卵在体内受精,胚胎在生殖腺管内发育,幼虫由子,精卵在体内受精,胚胎在生殖腺管内发育,幼虫由阴门阴门(vu
5、lva)产出。雌雄同体个体自体受精的结果可产生产出。雌雄同体个体自体受精的结果可产生非常纯合的基因型。雌雄同体个体性别决定的染色体机非常纯合的基因型。雌雄同体个体性别决定的染色体机制为制为XX型。在偶然情况下,可产生大约型。在偶然情况下,可产生大约O2的的XO雄性个体。雄性个体。XO雄性个体可与雌雄同体个体交配产生后代,雄性个体可与雌雄同体个体交配产生后代,从而增加了基因重组和新等位基因引入的机会。从而增加了基因重组和新等位基因引入的机会。体细胞数量少,由于透明可见,易于追踪细胞分裂体细胞数量少,由于透明可见,易于追踪细胞分裂谱系。产出的幼虫含有谱系。产出的幼虫含有556个体细胞和个体细胞和2
6、个原始生殖细胞,个原始生殖细胞,幼虫经幼虫经4次蜕皮后变为成虫。若成虫为雌雄同体个体,则次蜕皮后变为成虫。若成虫为雌雄同体个体,则含有含有959个体细胞和大约个体细胞和大约2000个生殖细胞;若成虫为雄性个生殖细胞;若成虫为雄性个体,则含有个体,则含有103 1个体细胞和大约个体细胞和大约1 000个生殖细胞。个生殖细胞。Developmental BiologyDevelopmental Biology能观察到生殖细胞的发生及种质颗粒的传递过程。能观察到生殖细胞的发生及种质颗粒的传递过程。胚胎发育的细胞分裂为不对称分裂,种系(germ1ine)细胞中的种质颗粒(germlinegranule
7、)或P颗粒。(Pgranule)在细胞分裂过程中仅分配到形成种系细胞的细胞质中。细胞谱系研究表明,受精卵(又称为P0种系细胞)的第一次卵裂产生AB创建者细胞和种系细胞P1,种系细胞P1再次分裂后形成创建者细胞EMS和种系细胞P2,P2进一步分裂后形成创建者细胞C和P3种系细胞,P3种系细胞再分后形成D创建者细胞和P4种系细胞。到幼虫产出时,AB细胞经分裂和进一步分化产生包括皮下细胞、神经细,胞、咽肌细胞、分泌腺细胞和1个体肌细胞在内的共389个细胞;EMS细胞经分裂为MS和E2个创建者细胞后,MS细胞再经分裂和分化出包括体肌细胞、咽肌细胞、神经细胞和分泌腺细胞在内的80个细胞,E细胞则形成构成
8、肠子的20个细胞;C细胞经分裂和分化出包括皮下细胞、体肌细胞和2个神经细胞在内的47个细胞;D细胞则形成20个体肌细胞;而此时种系细胞P4才开始分裂出2个生殖细胞Z2和Z3。Developmental Biology三基因组大小及其基因组成三基因组大小及其基因组成华美广杆线虫是继病毒、细菌和酿酒酵母之后华美广杆线虫是继病毒、细菌和酿酒酵母之后基因组已经被完整测序了的第一个多细胞动物,基因组已经被完整测序了的第一个多细胞动物,其基因组由其基因组由97兆碱基组成。在这兆碱基组成。在这97兆碱基中,兆碱基中,预计含有预计含有1 9 099个编码蛋白的基因,即平均每个编码蛋白的基因,即平均每5 kb含
9、有含有1个基因。每个基因平均含有个基因。每个基因平均含有5个内含子,个内含子,基因组的基因组的27被预期的外显子占据。被预期的外显子占据。与以前基于部分少量序列所作的估计相比,由完整基因组序列所预测的基因数要多得多。其基因量大约是酿其基因量大约是酿酒酵母的酒酵母的3倍,是人类的倍,是人类的1513。Developmental Biology将华美广杆线虫中的18891个蛋白与酿酒酵母的6217蛋白、大肠杆菌的4289个蛋白及目前可利用的人类的4979个蛋白进行比较分析后发现,人的4979个蛋白中有74可在线虫中找到对应蛋白,线虫有36的蛋白可在现知的人类蛋白中找到相关蛋白。总的比较结果表明,较
10、小的基因组有较多的组分与较大的基因组相匹配,且较大的基因组含有更多可与之对应的蛋白。有趣的是,线虫中没有发现在酿酒酵母和大肠杆菌中都能与之匹配的蛋白。当然,尽管线虫的基因组已全部测序,但已做过遗传分析的蛋白基因还只占其基因总数的1025。因此,有关线虫基因的真正研究可以说是刚刚开始,前面还有很长的路要走。Developmental BiologyDevelopmental Biology黑腹果蝇(Drosophilamelanogaster)果蝇的分类地位归属于节肢动物门、昆虫纲、双翅目、果蝇科、果蝇属,其学名全称为黑腹果蝇,现一般简称果蝇。其名字源于它喜好腐烂的水果以及发酵的果汁,是一种原产
11、于热带或亚热带的蝇种。它和人类一样分布于全世界,并且在人类的居室内过冬。第二节果蝇Developmental Biology一果蝇的两个重大贡献一果蝇的两个重大贡献谈起果蝇,已学过遗传学的人大概无人不知。自1910年遗传学泰斗ThomasHuntMorgan发现其第一个突变体白眼果蝇以来,其作为模式生物的历史已有90多年。正是以它为模式生物,Morgan和他的一批弟子们才从有关性连锁、性染色体、多线染色体和伴性遗传等遗传规律的发现中提出了基因论,奠定了现代遗传学的基础,并由此使Morgan获得了获得了1 933年的诺贝尔生理和医学奖年的诺贝尔生理和医学奖。也就是从那时开始,生物学家才普遍认识到
12、模式生物在生命科学研究中的重要作用。Developmental Biology1978年长期在美国加州理工学院从事果蝇遗传和发育研究的EdwardBIewis采用饱和诱变的方法随机破坏近一半的果蝇基因,然后通过显微观察来研究和分析影响体轴形成和分节模式的基因,并由此鉴定出15种不同的由于突变引起体节缺陷的基因。很快,人们在其他高等生物和人类细胞中发现了同样的或类似的基因,并证明这些基因在发育过程中执行了相似的功能。这两位用果蝇作为模式生物开创分子发育生物学研这两位用果蝇作为模式生物开创分子发育生物学研究的学者就是究的学者就是1 995年与年与LewiS一起分享诺贝尔生理和医学一起分享诺贝尔生理
13、和医学奖的奖的Christiane NussleinV01hard和和EricWieschaus.Developmental Biology二、果蝇的生命周期果蝇的生命周期在室温下一般为2周左右。成虫产出的受精卵只经ld的胚胎发育就孵化出幼虫;幼虫经历两次蜕皮,由第一期幼虫经第二期幼虫约3d时间发育成第三期幼虫,第三期幼虫再经23d的化蛹过程形成蛹;在蛹中约经过历时5d的变态,然后孵出成虫。成虫孵出后在1214h内开始交配产卵,产出的受精卵又开始进入下一个生命周期(图43)。果蝇成虫的长度为2mm,大约可存活9d左右。Developmental BiologyDevelopmental Bio
14、logyDevelopmental Biology三果蝇作为模式生物的优点三果蝇作为模式生物的优点(1)果蝇的生命周期短,在实验室条件下,一般)果蝇的生命周期短,在实验室条件下,一般12 d就就可完成一次世代交替。可完成一次世代交替。(2)个体小)个体小(成虫的长度仅为成虫的长度仅为2 mm),给予很少一点适宜,给予很少一点适宜食物在实验室就能饲养一大群。食物在实验室就能饲养一大群。(3)具有几十个易于诱变分析的遗传特征,并保持有大)具有几十个易于诱变分析的遗传特征,并保持有大量的突变体。量的突变体。(4)有比较简单的染色体组成,只有)有比较简单的染色体组成,只有4对染色体,且唾腺对染色体,且
15、唾腺细胞中含有巨大的多线染色细胞中含有巨大的多线染色(p01ytenic chromosome)o ,(5)卵子发生过程中已为早期胚胎发育积累了充分的养料,卵子发生过程中已为早期胚胎发育积累了充分的养料,且产出的卵子大,易于又见察。且产出的卵子大,易于又见察。(6)胚胎发育速度快,前胚胎发育速度快,前13次卵裂每次只间隔次卵裂每次只间隔9min,细胞,细胞核成倍增加成为一个合胞体核成倍增加成为一个合胞体(syncytium),其胚胎发育过程,其胚胎发育过程是观察分析卵裂、早期胚胎发生和躯体模式形成等发育调是观察分析卵裂、早期胚胎发生和躯体模式形成等发育调控机制的绝佳材料。控机制的绝佳材料。,(
16、7)幼虫存在变态过程,是分析器官芽幼虫存在变态过程,是分析器官芽(imaginal disc)细胞细胞增殖机制的理想模型。增殖机制的理想模型。Developmental Biology主要优点主要优点1.体积小,易于繁体积小,易于繁 殖;殖;2.产卵力强;产卵力强;3.性成熟短;性成熟短;4.易于遗传操作:易于遗传操作:如诱变;如诱变;5.基因组序列已全基因组序列已全 部测出部测出(Science,Mar.24,2000)。(120Mb encodes 13,601 proteins)Developmental Biology由于果蝇具有以上优点,近年来仍然被广泛用做分子发育生物学研究的模型。
17、在其胚胎发育的梯度假说被证实后,已鉴定出了几个在卵子中形成梯度、调节细胞定位和分化并决定胚胎发育方式的成形因子;在位于卵子后极和种质(germplasm)中发现了为种系细胞导向的蛋白因子有趣的是,在1997和1998连续两年被科学杂志称为当年十大重要突破成就之一。关于调控生物昼夜节律生物钟基因的研究也多半是在果蝇中完成的(Bloom1998)。果蝇的基因组大约为180Mb,其常染色质部分约为120Mb。到2000年3月,常染色质部分的全部碱基序列已基本确定,其基因组大约编码13600个基因,在数量上比线虫还要少,但这些基因具有明显的功能多样性(Adamseta12000)。Developmen
18、tal Biology第三节第三节 爪爪 蟾蟾一、爪蟾的分类地位及其作为模式生物的意义一、爪蟾的分类地位及其作为模式生物的意义爪蟾的全称为光滑爪蟾爪蟾的全称为光滑爪蟾(Xenopus laevis),它属于脊椎动物,它属于脊椎动物两栖纲两栖纲(Amphibia)、无尾目、无尾目(Anura)、负子蟾科、负子蟾科(Pipidae)、爪蟾属爪蟾属(Xenopus)。因产于非洲,又名非洲爪蟾,现一般。因产于非洲,又名非洲爪蟾,现一般简称为爪蟾。简称为爪蟾。Developmental Biology负子蟾科学名:Xenopuslaevis属名:Xenopus食性:由于没有舌头只能利用其前肢搅食水中的无
19、脊椎动物。人工饲养条件下,可以喂饲植物性饲料和动物性饲料,如动物肝脏和植物类的水藻。分布:由南非的热带草原起,北至肯尼亚,乌干达西至喀麦隆。人工饲养方面。Developmental Biology由于爪蟾是脊椎动物,与人类及其他经济动物具有更为密切的关系,其发育模型及调控机制与人类及其他高等动物更相似,且与其他两栖动物一样,具有较大的、易于观察分析的卵子,因而有关脊椎动物的卵子发生、体轴决定、受精激活、卵裂与中囊胚转换(midblastulatransition)、原肠形成、神经胚形成、器官发生、核移植及体细胞克隆等有关发育生物学原理和知识基本上都是来自于爪蟾这一模式动物和其他相关两栖动物的研
20、究成果。正是在这些研究成果基础上的演绎、推断和扩展;构成了脊椎动物发育生物学的基本原型。因而,爪蟾是脊椎动物发育生物学研究中一爪蟾是脊椎动物发育生物学研究中一个最重要而又最典型的代表,是脊椎动物胚胎学和发个最重要而又最典型的代表,是脊椎动物胚胎学和发育生物学的奠基者。下育生物学的奠基者。下图是光滑爪蟾的生命周期示意图。Developmental BiologyDevelopmental Biology二、爪蟾及两栖动物作为模式生物的优点二、爪蟾及两栖动物作为模式生物的优点爪蟾作为模式动物除了其显著的科学意义外,同时也具有明显爪蟾作为模式动物除了其显著的科学意义外,同时也具有明显的优点。的优点。
21、爪蟾生活在水中,成体约长爪蟾生活在水中,成体约长7 cm,易于在实验室人工养殖。,易于在实验室人工养殖。易于进行人工繁育,特别是通过注射促性腺激素,可以诱导易于进行人工繁育,特别是通过注射促性腺激素,可以诱导其在任何时候产卵。其在任何时候产卵。爪蟾的卵子较大,直径约为爪蟾的卵子较大,直径约为12 mm,且在体外受精、体,且在体外受精、体外发育,因而无需复杂昂贵的仪器,就可在实验室进行显微操外发育,因而无需复杂昂贵的仪器,就可在实验室进行显微操作等各种实验。作等各种实验。发育早期通过辐射状完全卵裂产生囊胚。其透明的卵壳可以发育早期通过辐射状完全卵裂产生囊胚。其透明的卵壳可以采用手术或化学方法脱去
22、,从胚胎上切下来的细胞团可以依靠采用手术或化学方法脱去,从胚胎上切下来的细胞团可以依靠细胞中的卵黄提供营养,在无菌的生理盐水中继续发育。因而,细胞中的卵黄提供营养,在无菌的生理盐水中继续发育。因而,许多早期有关发育生物学的重大突破,如以胚胎学大师许多早期有关发育生物学的重大突破,如以胚胎学大师Hans Spemann为首的一批发育生物学开创者在为首的一批发育生物学开创者在20世纪世纪2030年代所年代所进行的胚胎分割实验和胚胎诱导实验,以及进行的胚胎分割实验和胚胎诱导实验,以及20世纪世纪5060年代年代Robert Brigg Thomas King和和John Gurdon等关于细胞核的多
23、等关于细胞核的多能性能性(pluripotency)与体细胞克隆等著名实验,都是以爪蟾等两与体细胞克隆等著名实验,都是以爪蟾等两栖动物为研究材料完成的。我国的胚胎学及发育生物学研究也栖动物为研究材料完成的。我国的胚胎学及发育生物学研究也主要是以朱冼教授为首的一批学者以两栖动物中华大蟾蜍为实主要是以朱冼教授为首的一批学者以两栖动物中华大蟾蜍为实验材料开创起来的。验材料开创起来的。Developmental Biology三、热带爪蟾三、热带爪蟾光滑爪蟾的理想替身光滑爪蟾的理想替身由大量的染色体和核型分析工作证明,具有36个染色体的光滑爪蟾的基因组已发生了重复加倍,是古老的四倍体物种。在每个个体的
24、基因组中,大多数基因不像二倍体动物那样只有2个拷贝,而具有4个拷贝,因而在这一模式动物中不可能进行类似于在果蝇、线虫和小鼠中进行的通过干扰一个基因功能或者剔除一个基因而观察到什么错误的遗传分析研究。近年来,一种源于西非雨林湿地的热带爪蟾热带爪蟾(Xenopus tropicalis)作为爪蟾属中惟一作为爪蟾属中惟一的二倍体物种,已受到发育生物学家和细胞生物学家的的二倍体物种,已受到发育生物学家和细胞生物学家的关注,已成为替代光滑爪蟾的理想模型。关注,已成为替代光滑爪蟾的理想模型。热带爪蟾除具有前述光滑爪蟾作为模式动物的优势外,与光滑爪蟾相比,热带爪蟾还具有几个独特的优势有几个独特的优势:Dev
25、elopmental Biology热带爪蟾为爪蟾属中惟一的二倍体物种,其单倍体基因热带爪蟾为爪蟾属中惟一的二倍体物种,其单倍体基因组只有组只有1.78pg或或1.71 09bp,近于光滑爪蟾,近于光滑爪蟾(3.2 pg或或3.11 09 bp)的一半,是基因组最小的两栖动物。与其他的一半,是基因组最小的两栖动物。与其他模式动物相比,他也具有明显的优势。其基因组近小鼠模式动物相比,他也具有明显的优势。其基因组近小鼠的一半,与斑马鱼的一半,与斑马鱼_(1.8109 bp)大小相近。大小相近。成熟的热带爪蟾比光滑爪蟾的个体要小得多,因而用成熟的热带爪蟾比光滑爪蟾的个体要小得多,因而用同等空间养殖的
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