最新张忠版食品生物化学第5章蛋白质与核酸1PPT课件.ppt
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1、张忠版食品生物化学第张忠版食品生物化学第5 5章章蛋白质与核酸蛋白质与核酸1 1蛋白质是由天然蛋白质是由天然氨基酸氨基酸(Amino acid)(Amino acid)通过通过肽键肽键(Peptide bond)(Peptide bond)连接而成的生物大分子。连接而成的生物大分子。是一切生物体中普遍存在的生物大分子,是是一切生物体中普遍存在的生物大分子,是生物功能的生物功能的主要载体主要载体。生物遗传形状(存在于信息大分子。生物遗传形状(存在于信息大分子DNADNA中)是中)是通过蛋白质来表现的。通过蛋白质来表现的。酶、调节蛋白、转运蛋白、酶、调节蛋白、转运蛋白、贮存蛋白等贮存蛋白等 蛋白质
2、种类繁多、各具一定的相对分子量(蛋白质种类繁多、各具一定的相对分子量(一般在一万一般在一万到一百万,甚至高达数百万)到一百万,甚至高达数百万)、复杂的分子结构和特定、复杂的分子结构和特定的生物功能。的生物功能。蛋白质蛋白质甘氨酸甘氨酸 (Gly,G)丙氨酸丙氨酸 (Ala,A)缬氨酸缬氨酸 (Val,V)亮氨酸亮氨酸 (Lue,L)异亮氨酸异亮氨酸 (Ile,I)中性脂肪族氨基酸含羟基或硫脂肪族氨基酸含羟基或硫脂肪族氨基酸丝氨酸丝氨酸 (Ser,S)苏氨酸苏氨酸 (Thr,T)半胱氨酸半胱氨酸 (Cys,C)甲硫氨酸甲硫氨酸 (Met,M)酸性氨基酸及酰胺天冬氨酸天冬氨酸 (Asp,D)谷氨酸
3、谷氨酸 (Glu,E)天冬酰胺天冬酰胺 (Asn,N)谷氨酰胺谷氨酰胺 (Gln,Q)碱性氨基酸赖氨酸赖氨酸 (Lys,K)精氨酸精氨酸 (Arg,R)组氨酸组氨酸 (His,H)杂杂 环环氨基酸氨基酸杂环氨基酸组氨酸组氨酸 (His,H)脯氨酸脯氨酸 (Pro,P)芳香族氨基酸苯丙氨酸苯丙氨酸 (Phe,F)酪氨酸酪氨酸 (Tyr,Y)色氨酸色氨酸 (Trg,W)(三)氨基酸的理化性质1、物理性质、物理性质溶解度:溶解度:水中溶解度差别较大,水中溶解度差别较大,不溶于有机溶剂。不溶于有机溶剂。光吸收性:光吸收性:可见光区无,紫外光区可见光区无,紫外光区PheThyTrp有光吸收。有光吸收。旋
4、光性:旋光性:AA的物理常数,与结构、的物理常数,与结构、PH值有关。值有关。味感:味感:不同味道不同味道(与构型有关与构型有关)。两性解离和等电点:两性解离和等电点:AAAA在在结晶形态或在水溶液结晶形态或在水溶液中,并不是以中,并不是以游离的羧基或氨基形式存在,而是离解成两性离子。在两性游离的羧基或氨基形式存在,而是离解成两性离子。在两性离子中,氨基是以质子化离子中,氨基是以质子化(-NH(-NH3 3+)形式存在,羧基是以离解状形式存在,羧基是以离解状态态(-COO(-COO-)存在。存在。2、化学性质、化学性质氨基的化学反应氨基的化学反应:与茚三酮与茚三酮(ninhydrin)的反应的
5、反应 定量反应定量反应 与亚硝酸的反应与亚硝酸的反应 Van Slyke定氮定氮 与与2,4-二硝基氟苯二硝基氟苯(FDNB)的反应的反应 测序测序 与甲醛的反应与甲醛的反应 氨基滴定氨基滴定 与酰化基的反应与酰化基的反应 氨基保护基氨基保护基 与二甲基氨基萘磺酰氯与二甲基氨基萘磺酰氯(DNS-Cl)的反应的反应 测序测序 与荧光胺的反应与荧光胺的反应 微量检测微量检测 与与Edman试剂试剂(苯异硫氢酸苯异硫氢酸)和和 测序测序 有色有色Edman试剂的反应试剂的反应羧基的化学反应羧基的化学反应 Strecker降解降解:弱氧化剂弱氧化剂(次氯酸钠次氯酸钠,N-bromosuccin imi
6、de)作用下生成作用下生成NH3和醛和醛(RCHO)特殊条件下特殊条件下,还原成氨基醇、氨基醛还原成氨基醇、氨基醛 与肼与肼(hydrazine)的反应的反应 C端氨基酸分析端氨基酸分析侧链的化学反应侧链的化学反应 羟基羟基:酯化酯化(生物体内的磷酸化生物体内的磷酸化)巯基巯基:氧化还原氧化还原参考文献:参考文献:Chemistry and Biochemistry of the amino acids,G.C.Barrett,Chapman and Hall,1985(1 1)氨基和羧基共同参与的反应氨基和羧基共同参与的反应成肽反应成肽反应肽键又称酰胺键,肽键又称酰胺键,是多肽及蛋白子分子的
7、是多肽及蛋白子分子的主要化学键。在蛋白质中主要化学键。在蛋白质中AA通过肽键相连形成寡肽多肽,通过肽键相连形成寡肽多肽,以以AA残基存在。残基存在。茚三酮茚三酮(无色无色)+(2 2)与茚三酮的反应)与茚三酮的反应:ProPro产生黄色物质,其它为蓝紫色。产生黄色物质,其它为蓝紫色。a-AAa-AA和水合茚三酮加热生成有色物质,和水合茚三酮加热生成有色物质,AAAA的定性或定量测定的定性或定量测定加热(弱酸)NH3CO2RCHO+还原性茚三酮还原性茚三酮+2NH3+还原性茚三酮还原性茚三酮还原性茚三酮还原性茚三酮3H20紫色化合物紫色化合物第二节、蛋白质的分子结构构型:指在立体异构体中取代原子
8、或基团在空间构型:指在立体异构体中取代原子或基团在空间的取向。的取向。构象:指这些取代基团在单键旋转时可能形成的构象:指这些取代基团在单键旋转时可能形成的不同的立体异构体。不同的立体异构体。蛋白质的构象:指蛋白质特有的空间结构。蛋白质的构象:指蛋白质特有的空间结构。蛋白质结构有不同的组织层次:1952年丹麦人年丹麦人Linderstrom-Lang最早提出蛋白质的结构可最早提出蛋白质的结构可以分成四个层次以分成四个层次:primary structureprimary structure 一级结构:一级结构:氨基酸序列氨基酸序列氨基酸序列氨基酸序列secondary structureseco
9、ndary structure 二级结构:二级结构:螺旋螺旋螺旋螺旋,折叠折叠折叠折叠tertiary structuretertiary structure 三级结构:三级结构:所有原子空间位置所有原子空间位置所有原子空间位置所有原子空间位置 quanternary structurequanternary structure 四级结构:四级结构:蛋白质多聚体蛋白质多聚体蛋白质多聚体蛋白质多聚体1969年正式将一级结构定义为氨基酸序列和双硫键的位置。年正式将一级结构定义为氨基酸序列和双硫键的位置。介于二级结构和三级结构之间还存在超二级结构介于二级结构和三级结构之间还存在超二级结构(二级结构的
10、组合)和结构域(在空间上相对独立)这两(二级结构的组合)和结构域(在空间上相对独立)这两个层次。个层次。一、一级结构蛋白质分子的基本化学结构(共价结构)一、一级结构蛋白质分子的基本化学结构(共价结构)一级结构专指氨基酸序列一级结构专指氨基酸序列提问:什么是蛋白质的一级结构,维持蛋白质一级提问:什么是蛋白质的一级结构,维持蛋白质一级结构的作用力是什么键?结构的作用力是什么键?肽键和肽键和二硫键二硫键1 1、蛋白质的二级结构、蛋白质的二级结构(Secondary Structure)多肽链骨架多肽链骨架中原子的中原子的局部空间局部空间排列,排列,不涉及侧不涉及侧链链的构象,也就是该肽段主链骨架原子
11、的相对的构象,也就是该肽段主链骨架原子的相对空间位置。空间位置。维持二级结构的力量为:维持二级结构的力量为:氢键氢键二、蛋白质的空间结构二、蛋白质的空间结构肽链的骨干是由(肽链的骨干是由(NHNHCHRCHRCOCO)单位规则)单位规则地、重复排列而成,称之为地、重复排列而成,称之为共价主链共价主链(1)-螺旋结构(螺旋结构(-Helix)(2)-折叠结构(折叠结构(-sheet)(3)-转角(转角(-turn)(4)无规卷曲无规卷曲(random coil)多肽链的二级结构主要有以下几种方式多肽链的二级结构主要有以下几种方式 螺旋螺旋有左右手之分有左右手之分(1 1)-螺旋结构螺旋结构特点特
12、点 1)1)主链绕中心轴按右主链绕中心轴按右手螺旋方向盘旋,侧链伸手螺旋方向盘旋,侧链伸向螺旋外侧。每向螺旋外侧。每3.6 3.6 个氨个氨基酸残基前进一圈,每圈基酸残基前进一圈,每圈前进距离是前进距离是0.54nm(0.54nm(螺距),螺距),每个氨基酸残基占每个氨基酸残基占0.15nm0.15nm。2)2)每个氨基酸残基的每个氨基酸残基的亚氨基与它前面第四个氨亚氨基与它前面第四个氨基酸残基的羰基氧原子形基酸残基的羰基氧原子形成氢键,氢键与螺旋轴近成氢键,氢键与螺旋轴近似平行。似平行。(2 2)、)、-折叠结构折叠结构(-(-片层结构片层结构)(3 3)、)、-转角转角蛋白质分子的主链在盘
13、蛋白质分子的主链在盘曲折叠运行中,往往发曲折叠运行中,往往发生生180180度的急转弯,这种度的急转弯,这种回折部位的构象,即所回折部位的构象,即所谓的谓的-转角。转角。-转角是由转角是由4 4个连续的个连续的氨基酸残基组成的,第氨基酸残基组成的,第一个氨基酸残基的羰基一个氨基酸残基的羰基氧原子与第四个氨基酸氧原子与第四个氨基酸残基的亚氨基连接来稳残基的亚氨基连接来稳定构象。定构象。螺旋螺旋折叠片折叠片转角转角无规卷曲无规卷曲(4)、)、无规卷无规卷曲曲 它是多肽主链不规则、多向性地随机盘曲所形成的构象。球蛋白分子中常见的一种主链构象。(1)(1)、球状蛋白质分子的三级结构、球状蛋白质分子的三
14、级结构 球状蛋白质分子的球状蛋白质分子的二级结构不是活性分子的结构形式二级结构不是活性分子的结构形式,需要在二级结构的基础上再盘曲折叠形成需要在二级结构的基础上再盘曲折叠形成三级结构三级结构。蛋白质分子的三级结构是指蛋白质分子在一、二级结构蛋白质分子的三级结构是指蛋白质分子在一、二级结构的基础上,借助于各种非共价键在的基础上,借助于各种非共价键在三维空间三维空间盘曲、折叠成盘曲、折叠成具有特定走向的紧密、近似球状的构象。具有特定走向的紧密、近似球状的构象。蛋白质分子的三级结构蛋白质分子的三级结构包括全部主链、侧链在内的所有包括全部主链、侧链在内的所有原子的空间排部原子的空间排部,但不包括肽链间
15、的相互关系,但不包括肽链间的相互关系 球状构象给出最低的表面积和体积比,因而使蛋白质与球状构象给出最低的表面积和体积比,因而使蛋白质与环境的相互作用降到最小,最稳定。环境的相互作用降到最小,最稳定。2 2、蛋白质的三级结构、蛋白质的三级结构(Tertiary structure)3.3.蛋白质的三级结构蛋白质的三级结构u 一条多肽链内二级结构单元的彼此组合后的固定结构一条多肽链内二级结构单元的彼此组合后的固定结构u 作用力作用力来自侧链基团来自侧链基团 球状蛋白质分子三级结构的构象特征球状蛋白质分子三级结构的构象特征u (1)(1)三级结构的构象近似球形。三级结构的构象近似球形。u (2)(2
16、)分子中的亲水基团大多相对集中在球形分子中的亲水基团大多相对集中在球形分子的表面,疏水基团相对集中在分子内部。分子的表面,疏水基团相对集中在分子内部。u (3)(3)三级结构构象的稳定性主要靠疏水的相三级结构构象的稳定性主要靠疏水的相互作用来维系。互作用来维系。u (4)(4)三级结构形成后,蛋白质分子的生物活三级结构形成后,蛋白质分子的生物活性中心就形成了。在球形分子的表面往往有一性中心就形成了。在球形分子的表面往往有一个很深的裂隙,活性部位就在其中。个很深的裂隙,活性部位就在其中。三级结构的典型例子是三级结构的典型例子是肌红蛋白肌红蛋白肌红蛋白的三级结构肌红蛋白的三级结构维系蛋白质空间结构
17、的化学键维系蛋白质空间结构的化学键1.1.氢键氢键(hydrogen bond)(hydrogen bond)2.2.离子键离子键(盐键盐键)(electrostatic)(electrostatic interactions)interactions)3.3.疏水相互作用疏水相互作用(hydrophobic(hydrophobic interaction)interaction)4.4.范德华力范德华力(van der waals force)(van der waals force)5.5.二硫键二硫键(disulfide bond)(disulfide bond)A.三级结构中的作用力三
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