人卫8版组学与医学.ppt

《人卫8版组学与医学.ppt》由会员分享，可在线阅读，更多相关《人卫8版组学与医学.ppt（54页珍藏版）》请在淘文阁 - 分享文档赚钱的网站上搜索。

1、目录目录生物化学与分子生物学生物化学与分子生物学目录目录第二十六章第二十六章组学与医学组学与医学-omics and Medicine目录目录目录目录第一节第一节基因组学基因组学 Genomics目录目录基因组基因组(genome)一一个个细细胞胞（或或病病毒毒）所所载载的的全全部部遗遗传传信信息息，它它代代表表了了一一种种生生物物所所具具有有的的全全部部遗遗传传信信息息。对对真真核核生生物物体体而而言言，基基因因组组是是指指一一套套完完整整单单倍倍体体DNA（染染色色体体DNA）及及线线粒粒体体或或叶叶绿绿体体DNA的的全全部部序序列列，既既有有编编码码序序列列，也也有有大大量量存存在在的的

2、非编码序列。非编码序列。目录目录基因组学基因组学(genomics)是阐明整个基因组的结构、结构与功能关系是阐明整个基因组的结构、结构与功能关系以及基因之间相互作用的科学。以及基因之间相互作用的科学。一、基因组学包含结构基因组学、功能一、基因组学包含结构基因组学、功能基因组学和比较基因组学基因组学和比较基因组学 目录目录基因组学包括基因组学包括3个不同的亚领域个不同的亚领域结构基因组学结构基因组学(structural genomics)功能基因组学功能基因组学(functional genomics)比较基因组学比较基因组学(comparative genomics)基因组学概念基因组学概念

3、目录目录二、结构基因组学的主要任务是基因二、结构基因组学的主要任务是基因组作图和大规模测序组作图和大规模测序 结结构构基基因因组组学学(structural genomics)是是通通过过HGP的实施来完成的。的实施来完成的。HGP的的内内容容就就是是制制作作高高分分辨辨率率的的人人类类遗遗传传图图和和物物理理图图，最最终终完完成成人人类类和和其其它它重重要要模模式式生生物物全全部部基基因因组组DNA序序列列测测定定，因因此此HGP属属于于结构基因组学范畴。结构基因组学范畴。目录目录（一）遗传作图和物理作图是绘制人类基（一）遗传作图和物理作图是绘制人类基因组草图的重要策略因组草图的重要策略 1

4、遗传作图就是绘制连锁图遗传作图就是绘制连锁图 遗遗传传图图（genetic map）又又称称连连锁锁图图（linkage map）。遗遗传传作作图图（genetic mapping）就就是是确确定定连连锁锁的的遗遗传传标标志志位位点点在在一一条条染染色色体体上上的的排排列列顺顺序序以以及及它它们们之之间间的的相相对对遗遗传传距距离离，用用厘厘摩摩尔尔根根（centi-Morgan，cM）表表示示，当当两两个个遗遗传传标记之间的重组值为标记之间的重组值为1%时，图距即为时，图距即为1 cM。（1）限制性片段长度多态性（）限制性片段长度多态性（RFLP）（2）可变数目串联重复序列（可变数目串联重复

5、序列（VNTR）（3）单核苷酸多态性（）单核苷酸多态性（SNP）目录目录2物理作图就是描绘杂交图、限制性酶切图物理作图就是描绘杂交图、限制性酶切图及克隆系图及克隆系图 物理作图物理作图包括：包括：荧荧光光原原位位杂杂交交图图（fluorescent in situ hybridization map，FISH map）：将将荧荧光光标标记记的的探探针针与与染染色色体体杂杂交确定分子标记所在的位置；交确定分子标记所在的位置；限限制制性性酶酶切切图图（restriction map）；将将限限制制性性酶酶切切位位点标定在点标定在DNA分子的相对位置；分子的相对位置；克隆相连重叠群图（克隆相连重叠群

6、图（clone contig map）酵母人工染色体酵母人工染色体（yeast artificial chromosome，YAC）细菌人工染色体细菌人工染色体（bacterial artificial chromosome，BAC）目录目录（二）通过（二）通过BAC克隆系、鸟枪法等完成大规克隆系、鸟枪法等完成大规模模DNA测序测序 1BAC克隆系的构建是大规模克隆系的构建是大规模DNA测序的基础测序的基础 BAC是是一一种种装装载载DNA大大片片段段的的克克隆隆载载体体系系统统，用用于于人人、动动物物和和植植物物基基因因组组文文库库构构建建。BAC具具有有插插入入片片段段较较大大（数数kb

7、数数百百 kb）、嵌嵌合合率率低低、遗传稳定性好、易于操作等优点。遗传稳定性好、易于操作等优点。目录目录2鸟枪法是大规模鸟枪法是大规模DNA测序的重要方法测序的重要方法 步骤：步骤：建立高度随机、插入片段大小为建立高度随机、插入片段大小为1.6 kb到到4 kb左右的左右的基因组文库；基因组文库；高效、大规模的克隆双向测序；高效、大规模的克隆双向测序；序列组装（序列组装（sequence assembly）：借助软件将所测得）：借助软件将所测得的序列进行组装，产生一定数量的相连重叠群；的序列进行组装，产生一定数量的相连重叠群；缺口填补：利用引物延伸或其他方法对缺口填补：利用引物延伸或其他方法对

8、BAC克隆中还克隆中还存在的缺口进行填补。存在的缺口进行填补。3高通量测序技术大大加快了基因组高通量测序技术大大加快了基因组DNA测序进度测序进度 目录目录鸟枪法测序的原理与策略鸟枪法测序的原理与策略 目录目录（三）生物信息学是预测基因组结构和功能的（三）生物信息学是预测基因组结构和功能的重要手段重要手段 三大生物信息中心：三大生物信息中心：美国国家生物技术信息中心（美国国家生物技术信息中心（NCBI，），）欧洲生物信息研究所（欧洲生物信息研究所（EBI，），）日本日本DNA数据库（数据库（DDBJ，），）GenBank（）是（）是NIH的基因序列数据库，包含所有已的基因序列数据库，包含所有已

9、知的核苷酸及蛋白质序列、以及与之相关的生物学信息和参知的核苷酸及蛋白质序列、以及与之相关的生物学信息和参考文献，是世界上的权威序列数据库。考文献，是世界上的权威序列数据库。目录目录三、功能基因组学系统探讨基因的三、功能基因组学系统探讨基因的活动规律活动规律 功能基因组学的主要研究内容包括基因组的功能基因组学的主要研究内容包括基因组的表达、基因组功能注释、基因组表达调控网络及表达、基因组功能注释、基因组表达调控网络及机制的研究等。它从整体水平上研究一种组织或机制的研究等。它从整体水平上研究一种组织或细胞在同一时间或同一条件下所表达基因的种类、细胞在同一时间或同一条件下所表达基因的种类、数量、功能

10、及在基因组中的定位，或同一细胞在数量、功能及在基因组中的定位，或同一细胞在不同状态下基因表达的差异。不同状态下基因表达的差异。目录目录（一）通过全基因组扫描鉴定（一）通过全基因组扫描鉴定DNA序列中的基因序列中的基因（二）通过（二）通过BLAST等程序搜索同源基因等程序搜索同源基因（三）通过实验设计验证基因功能（三）通过实验设计验证基因功能（四）通过转录组和蛋白质组描述基因表达模式（四）通过转录组和蛋白质组描述基因表达模式 目录目录第二节第二节 转转 录录 组组 学学Transcriptomics 目录目录转录组转录组（transcriptome）指生命单元（通）指生命单元（通常是一种细胞）所

11、能转录出来的可直接参与蛋常是一种细胞）所能转录出来的可直接参与蛋白质翻译的白质翻译的mRNA（编码（编码RNA）总和，而其他）总和，而其他所有非编码所有非编码RNA均可归为均可归为RNA组（组（RNome）。）。转转录录组组学学（transcriptomics）是是在在整整体体水水平平上上研研究究细细胞胞编编码码基基因因转转录录情情况况及及转转录录调调控控规律的科学。规律的科学。目录目录一、转录组学研究全部一、转录组学研究全部mRNA的的表达及功能表达及功能 转转录录组组学学就就是是要要阐阐明明生生物物体体或或细细胞胞在在特特定定生生理理或或病病理理状状态态下下表表达达的的所所有有种种类类的的

12、mRNA及及其其功功能能。目目前前，转转录录组组学学研研究究的的侧侧重重点点涉涉及及基基因因转转录录的的区区域域、转转录录因因子子结结合合位位点点、染色质修饰点、染色质修饰点、DNA甲基化位点等。甲基化位点等。转录组研究的主要技术：转录组研究的主要技术：微阵列（微阵列（microarray）基因表达系列分析（基因表达系列分析（SAGE）大规模平行信号测序系统（大规模平行信号测序系统（MPSS）目录目录二、二、RNA组学研究非编码组学研究非编码RNA的集合的集合 除除了了mRNA以以外外，细细胞胞内内还还存存在在着着许许多多其其他他种种类类的的小小分分子子RNA，研研究究它它们们的的种种类类、时

13、时空空表表达达情情况况及及其其生生物物学学意意义义便便是是RNA组组学学的的范范畴畴。这这些些小小分分子子RNA包包括括snRNA、snoRNA、scRNA、催催化化性性小小RNA、siRNA、miRNA等等。这这些些调调控控型型小小分分子子非非编编码码RNA，在在基基因因的的转转录录和和翻翻译译、细细胞胞分分化化和和个个体体发发育育、遗遗传传和和表表观观遗遗传传等等生生命命活活动动中中发发挥挥重重要要的的组组织织和和调调控控作作用用,从从而而形形成成了了细细胞胞中中高高度度复杂的复杂的RNA网络。网络。目录目录第三节第三节蛋蛋 白白 质质 组组 学学 Proteomics 目录目录蛋蛋白白质

14、质组组学学（proteomics）以以细细胞胞、组组织织或或机机体体在在特特定定时时间间和和空空间间上上表表达达的的所所有有蛋蛋白白质质即即蛋蛋白白质质组组（proteome）为为研研究究对对象象，分分析析细细胞胞内内动动态态变变化化的的蛋蛋白白质质组组成成、表表达达水水平平与与修修饰饰状状态态，了了解解蛋蛋白白质质之之间间的的相相互互作作用用与与联联系系，并并在在整整体体水水平平上上研研究究蛋蛋白白质质调调控控的的活活动动规规律律，故故又又称称为为全全景景式式蛋蛋 白白 质质 表表 达达 谱谱（global protein expression profile）分析分析。目录目录蛋白质组研究

15、相关的数据库蛋白质组研究相关的数据库 蛋白序列数据库（蛋白序列数据库（SWISS-PROT/TrEMBL；）、；）、基因序列数据库（基因序列数据库（GenBank，EMBL；，）、；，）、蛋白质模式数据库（蛋白质模式数据库（Prosite；）、；）、蛋白质二维凝胶电泳数据库、蛋白质三维结构数据库蛋白质二维凝胶电泳数据库、蛋白质三维结构数据库（PDB，；，；FSSP，），），蛋白翻译后修饰数据库（蛋白翻译后修饰数据库（O-GLYCBASE，），）目录目录一、蛋白质组学研究细胞内所有蛋白质一、蛋白质组学研究细胞内所有蛋白质的组成及其活动规律的组成及其活动规律 蛋蛋白白质质组组学学的的研研究究主主要

16、要涉涉及及两两个个方方面面：一一是是蛋蛋白白质质组组表表 达达 模模 式式 的的 研研 究究，即即 结结 构构 蛋蛋 白白 质质 组组 学学（structural proteomics）；二二是是蛋蛋白白质质组组功功能能模模式式的的研研究究，即即功功能能蛋蛋白白质组学（质组学（functional proteomics）。）。（一）蛋白质鉴定是蛋白质组学的基本任务（一）蛋白质鉴定是蛋白质组学的基本任务（二）翻译后修饰的鉴定有助于蛋白质功能的阐明（二）翻译后修饰的鉴定有助于蛋白质功能的阐明（三）蛋白质功能确定是蛋白质组学的根本目的（三）蛋白质功能确定是蛋白质组学的根本目的 目录目录二、二维电泳和

17、质谱是蛋白质组学二、二维电泳和质谱是蛋白质组学研究的常规技术研究的常规技术 二二维维凝凝胶胶电电泳泳（2-DE）技技术术、质质谱谱（MS）技技术术以以及及大规模数据处理仍然是蛋白质组学的三大基本支撑技术。大规模数据处理仍然是蛋白质组学的三大基本支撑技术。蛋白质组学研究的主要技术路线有两条：蛋白质组学研究的主要技术路线有两条：以以2-DE分分离离为为核核心心的的研研究究路路线线：混混合合蛋蛋白白首首先先通通过过2-DE分离，然后进行胶内酶解，再用质谱进行鉴定。分离，然后进行胶内酶解，再用质谱进行鉴定。以以色色谱谱分分离离为为核核心心的的技技术术路路线线：混混合合蛋蛋白白先先进进行行酶酶解解，经经

18、色色谱谱或或多多维维色色谱谱分分离离后后，对对肽肽段段进进行行串串联联质质谱谱分分析析以以实现蛋白的鉴定。实现蛋白的鉴定。目录目录（一）二维电泳是分离蛋白质组的有效方法（一）二维电泳是分离蛋白质组的有效方法 2-DE是是分分离离蛋蛋白白质质组组最最基基本本的的工工具具，其其原原理理是是蛋蛋白白质质在在高高压压电电场场作作用用下下先先进进行行等等电电聚聚焦焦（isoelectric focusing，IEF）电电泳泳，利利用用蛋蛋白白质质分分子子的的等等电电点点不不同同使使蛋蛋白白质质得得以以分分离离；随随后后进进行行SDS-聚聚丙丙烯烯酰酰胺胺凝凝胶胶电电泳泳（SDS-PAGE），按按蛋蛋白质

19、分子量的大小进行分离。白质分子量的大小进行分离。目录目录蛋白质的二维电泳蛋白质的二维电泳 目录目录（二）质谱技术是蛋白质组鉴定的重要工具（二）质谱技术是蛋白质组鉴定的重要工具 1用肽质量指纹图谱鉴定蛋白质用肽质量指纹图谱鉴定蛋白质 2用串联质谱鉴定蛋白质用串联质谱鉴定蛋白质 蛋蛋白白质质经经过过酶酶解解成成肽肽段段后后，获获得得所所有有肽肽段段的的分分子子质质量量，形形成成一一个个特特异异的的肽肽质质量量指指纹纹图图谱谱（PMF），通通过过数数据据库库搜搜索与比对，便可确定待分析蛋白质分子的性质。索与比对，便可确定待分析蛋白质分子的性质。用用PMF方方法法不不能能鉴鉴定定的的蛋蛋白白质质可可通

20、通过过质质谱谱技技术术获获得得该该蛋蛋白白质质一一段段或或数数段段多多肽肽的的串串联联质质谱谱（MS/MS）信信息息并并通通过过数据库检索来鉴定该蛋白质。数据库检索来鉴定该蛋白质。目录目录蛋白质的质谱分析蛋白质的质谱分析 目录目录三、蛋白质相互作用研究是认识蛋白三、蛋白质相互作用研究是认识蛋白质功能的重要内容质功能的重要内容 蛋白质蛋白质-蛋白质相互作用是维持细胞生命活动的蛋白质相互作用是维持细胞生命活动的基本方式。基本方式。研究蛋白质相互作用常用的方法有酵母双杂交、研究蛋白质相互作用常用的方法有酵母双杂交、亲和层析、免疫共沉淀、蛋白质交联、荧光共振能亲和层析、免疫共沉淀、蛋白质交联、荧光共振

21、能量转移（量转移（FRET）等。）等。目录目录第四节第四节代代 谢谢 组组 学学Metabonomics 目录目录代代谢谢组组学学（metabonomics）就就是是测测定定一一个个生生物物/细细胞胞中中所所有有的的小小分分子子（Mr 1 000 d）组组成成，描描绘绘其其动动态态变变化化规规律律，建建立立系系统统代代谢谢图图谱，并确定这些变化与生物过程的联系。谱，并确定这些变化与生物过程的联系。目录目录一、代谢组学的任务是分析生物一、代谢组学的任务是分析生物/细胞细胞代谢产物的全貌代谢产物的全貌 代谢组学分为四个层次：代谢组学分为四个层次：代代谢谢物物靶靶标标分分析析：对对某某个个或或某某几

22、几个个特特定定组组分分的的分分析；析；代代谢谢谱谱分分析析：对对一一系系列列预预先先设设定定的的目目标标代代谢谢物物进进行定量分析；行定量分析；代代谢谢组组学学：对对某某一一生生物物或或细细胞胞所所有有代代谢谢物物进进行行定定性和定量分析；性和定量分析；代代谢谢指指纹纹分分析析：不不分分离离鉴鉴定定具具体体单单一一组组分分，而而是是对代谢物整体进行高通量的定性分析。对代谢物整体进行高通量的定性分析。目录目录代谢组学主要以生物体液为研究对象，如代谢组学主要以生物体液为研究对象，如血样、尿样等，另外还可采用完整的组织样品、血样、尿样等，另外还可采用完整的组织样品、组织提取液或细胞培养液等进行研究。

23、组织提取液或细胞培养液等进行研究。目录目录二、核磁共振、色谱及质谱是代谢组学二、核磁共振、色谱及质谱是代谢组学的主要分析工具的主要分析工具 NMR：是当前代谢组学研究中的主要技术。代谢组学：是当前代谢组学研究中的主要技术。代谢组学中常用的中常用的NMR谱是氢谱（谱是氢谱（1H-NMR）、碳谱（）、碳谱（13C-NMR）及磷谱（）及磷谱（31P-NMR）；）；MS：按质荷比（：按质荷比（m/z）进行各种代谢物的定性或定量分）进行各种代谢物的定性或定量分析，可得到相应的代谢产物谱；析，可得到相应的代谢产物谱；色谱色谱-质谱联用技术：这种联用技术使样品的分离、定性、质谱联用技术：这种联用技术使样品的

24、分离、定性、定量一次完成，具有较高的灵敏度和选择性。定量一次完成，具有较高的灵敏度和选择性。目前常用的联用技术包括气相色谱目前常用的联用技术包括气相色谱-质谱联用质谱联用（GC-MS）和液相色谱）和液相色谱-质谱联用（质谱联用（LC-MS）。）。目录目录代谢组学研究的技术系统及手段代谢组学研究的技术系统及手段 目录目录三、代谢组学数据依赖模式识别技术三、代谢组学数据依赖模式识别技术进行分析进行分析 代代谢谢组组学学所所得得信信息息可可利利用用模模式式识识别别技技术术进进行行数数据据分分析析，以以达达到到对对样样本本分分类类或或判判别别的的目目的的，包包括括无监督模式识别无监督模式识别和和有监督

25、模式识别有监督模式识别两类。两类。目录目录无监督方法无监督方法主要用于采用原始谱图信息或预主要用于采用原始谱图信息或预处理后的信息对样本进行归类。应用最广泛的是处理后的信息对样本进行归类。应用最广泛的是主成分分析（主成分分析（PCAPCA）和聚类分析。）和聚类分析。有监督的方法有监督的方法包括人工神经网络包括人工神经网络（ANNs）、）、偏最小二乘（偏最小二乘（PLS）、判别函数分析（）、判别函数分析（DFA）等。）等。主成分分析法是模式识别方法。通过将分散于一主成分分析法是模式识别方法。通过将分散于一组变量上的信息集中于几个综合指标上，利用主组变量上的信息集中于几个综合指标上，利用主成分描述

26、机体代谢的变化情况。成分描述机体代谢的变化情况。目录目录第五节第五节其其 他他 组组 学学 目录目录一、糖组学研究生命体聚糖多样性及其一、糖组学研究生命体聚糖多样性及其生物学功能生物学功能 糖糖组组学学（glycomics）侧侧重重于于糖糖链链组组成成及及其其功功能能的的研研究究，其其主主要要研研究究对对象象为为聚聚糖糖，具具体体内内容容包包括括研研究究糖糖与与糖糖之之间间、糖糖与与蛋蛋白白质质之之间间、糖糖与与核核酸酸之间的联系和相互作用。之间的联系和相互作用。目录目录（一）糖组学分为结构糖组学与功能糖组学（一）糖组学分为结构糖组学与功能糖组学两个分支两个分支 糖糖组组（glycome）指指

27、单单个个个个体体的的全全部部聚聚糖糖，糖糖组组学学则则对对糖糖组组（主主要要针针对对糖糖蛋蛋白白）进进行行全全面面的的分分析析研研究究，包包括括结结构构和和功功能能两两方方面面内内容容，可可为为结结构构糖糖组组学学（structural glycomics）和和功功能能糖糖组组学学（functional glycomics）两两个个分支。分支。糖组学主要要回答糖组学主要要回答4个方面的问题：个方面的问题：什么基因编码糖蛋白，即基因信息；什么基因编码糖蛋白，即基因信息；可能糖基化位点中实际被糖基化的位点；可能糖基化位点中实际被糖基化的位点；聚糖结构，即结构信息；聚糖结构，即结构信息；糖基化功能，

28、即功能信息。糖基化功能，即功能信息。目录目录（二）色谱分离（二）色谱分离/质谱鉴定和糖微阵列技术质谱鉴定和糖微阵列技术是糖组学研究的主要技术是糖组学研究的主要技术 1色谱分离与质谱鉴定技术色谱分离与质谱鉴定技术 2糖微阵列技术糖微阵列技术 3生物信息学生物信息学 糖糖微微阵阵列列技技术术是是生生物物芯芯片片中中的的一一种种，是是将将带带有有氨氨基基的的各各种种聚聚糖糖共共价价连连接接在在包包被被有有化化学学反反应应活活性性表表面面的的玻玻璃璃芯芯片片上上，一一块块芯芯片片上上可可排排列列200种种以以上上的的不不同同糖糖结结构构，几几乎乎涵盖了全部末端糖的主要类型。涵盖了全部末端糖的主要类型。

29、目录目录（三）糖组学与肿瘤的关系密切（三）糖组学与肿瘤的关系密切 已已报报道道有有多多种种血血清清糖糖蛋蛋白白可可作作为为肾肾细细胞胞癌癌、乳乳腺腺癌癌、结结直直肠肠癌癌等等的的标标记记物物；糖糖基基化化改改变变普普遍遍存存在在于于肿肿瘤瘤的的发发生生、发发展展过过程程中中，分分析析糖糖基基化化修修饰饰对对于于深深入入研研究究肿肿瘤瘤的的发发生生机机制制及及诊诊断断治治疗疗有有着着重重要要的的价价值值；糖糖基基化化差差异异也也可可用用于于构构建建特特异异的的多多糖糖类类癌癌症症疫疫苗苗，以以发发展展新新的的免免疫疫治治疗疗策略。策略。目录目录二、脂组学揭示生命体脂质多样性及二、脂组学揭示生命体

30、脂质多样性及其代谢调控其代谢调控 脂脂组组学学（lipidomics）就就是是对对生生物物样样本本中中脂脂质质进进行行全全面面系系统统的的分分析析，从从而而揭揭示示其其在在生生命活动和疾病中发挥的作用。命活动和疾病中发挥的作用。目录目录（一）脂组学是代谢组学的一个分支（一）脂组学是代谢组学的一个分支 脂脂组组学学的的研研究究内内容容为为生生物物体体内内的的所所有有脂脂质质分分子子，并并以以此此为为依依据据推推测测与与脂脂质质作作用用的的生生物物分分子子的的变变化化，揭揭示示脂脂质质在在各各种种生生命命活活动动中中的的重重要要作作用用机机制制。通通过过研研究究脂脂质质提提取取物物，可可获获得得脂

31、脂质质组组（lipidome）的的信信息，了解在特定生理和病理状态下脂质的整体变化。息，了解在特定生理和病理状态下脂质的整体变化。目录目录（二）脂组学研究的三大步骤（二）脂组学研究的三大步骤分离、分离、鉴定和数据库检索鉴定和数据库检索1样品分离样品分离 2脂质鉴定脂质鉴定 3数据库检索数据库检索 脂质主要从细胞、血浆、组织等样品中提取。脂质主要从细胞、血浆、组织等样品中提取。常常规规的的技技术术有有薄薄层层色色谱谱、气气相相色色谱谱-质质谱谱联联用用、电电喷喷雾雾质质谱谱、液液相相色色谱谱-质质谱谱联联用用、高高效效液液相相色色谱谱-芯芯片片-质质谱谱联联用用、超超高高效效液液相相色色谱谱-质

32、质谱谱联联用用、超超高高效效液液相相色色谱谱-傅傅立立叶变换质谱联用等。叶变换质谱联用等。目录目录（三）脂组学促进脂质生物标志物的发现和疾（三）脂组学促进脂质生物标志物的发现和疾病诊断病诊断 发现疾病相关的诊断标志物是进行疾病诊断发现疾病相关的诊断标志物是进行疾病诊断的关键。脂组学所提供的方法能够监测患者与正的关键。脂组学所提供的方法能够监测患者与正常人之间的脂质变化，从中找到差异较大的脂质常人之间的脂质变化，从中找到差异较大的脂质化合物，作为疾病早期诊断的指标。化合物，作为疾病早期诊断的指标。溶血磷脂酸在卵巢癌的诊断中表现出高度的溶血磷脂酸在卵巢癌的诊断中表现出高度的敏感性和特异性，能够作为

33、早期诊断卵巢癌及术敏感性和特异性，能够作为早期诊断卵巢癌及术后随访的生物学标志物。后随访的生物学标志物。目录目录第六节第六节组学在医学上的应用组学在医学上的应用目录目录一、疾病基因组学阐明疾病发病机制一、疾病基因组学阐明疾病发病机制 （一）定位克隆技术是发现和鉴定疾病基因的（一）定位克隆技术是发现和鉴定疾病基因的重要手段重要手段 定定位位候候选选克克隆隆是是将将疾疾病病相相关关位位点点定定位位于于某某一一染染色色体体区区域域后后，根根据据该该区区域域的的基基因因、EST或或模模式式生生物物所所对对应应的的同同源源区区的的已已知知基基因因等等有有关关信信息息，直直接接进进行行基基因因突突变变筛筛

34、查查，经经过过多多次次重重复复，可可最最终终确确定定疾疾病病相相关基因。关基因。目录目录疾疾病病基基因因组组学学的的研研究究将将在在全全基基因因组组SNPs制制图图基基础础上上，通通过过比比较较病病人人和和对对照照人人群群之之间间SNPs的的差差异异，鉴鉴定定与与疾疾病病相相关关的的SNPs，从从而而彻彻底底阐阐明明各各种种疾疾病病易易感感人人群群的的遗遗传传学学背背景景，为疾病的诊断和治疗提供新的理论基础。为疾病的诊断和治疗提供新的理论基础。（二）（二）SNPs是疾病易感性的重要遗传学基础是疾病易感性的重要遗传学基础 目录目录二、药物基因组学揭示遗传变异对药二、药物基因组学揭示遗传变异对药物

35、效能和毒性的影响物效能和毒性的影响 药物基因组学药物基因组学（pharmacogenomics）是功能基）是功能基因组学与分子药理学的有机结合。药物基因组学不因组学与分子药理学的有机结合。药物基因组学不是以发现人体基因组基因为主要目的，而是运用已是以发现人体基因组基因为主要目的，而是运用已知的基因组学知识改善病人的治疗。药物基因组学知的基因组学知识改善病人的治疗。药物基因组学以药物效应及安全性为目标，研究各种基因突变与以药物效应及安全性为目标，研究各种基因突变与药效及安全性的关系。药效及安全性的关系。目录目录（一）药物基因组学预测药物反应性并指导个（一）药物基因组学预测药物反应性并指导个体化用

36、药体化用药 （二）基因多态性是药物基因组学的基础和重（二）基因多态性是药物基因组学的基础和重要研究内容要研究内容 （三）鉴定基因序列的变异是药物基因组学的（三）鉴定基因序列的变异是药物基因组学的主要研究策略主要研究策略 目录目录三、蛋白质组学发现和鉴别药物新靶点三、蛋白质组学发现和鉴别药物新靶点（一）疾病相关蛋白质组学的研究是发现和验（一）疾病相关蛋白质组学的研究是发现和验证药物新靶点的有效途径证药物新靶点的有效途径 （二）耐药病原体的蛋白质组学研究将为新一（二）耐药病原体的蛋白质组学研究将为新一代抗生素的发现提供新的契机代抗生素的发现提供新的契机 （三）信号传导分子和途径是药物设计的合理（三）信号传导分子和途径是药物设计的合理靶点靶点 目录目录四、代谢组学是开展预测医学和个体四、代谢组学是开展预测医学和个体化医学的重要手段化医学的重要手段 （一）代谢组学丰富了预测医学的内涵（一）代谢组学丰富了预测医学的内涵 （二）代谢组学促进了个体化医学的发展（二）代谢组学促进了个体化医学的发展