生物信息之-基因与疾病知识讲解.ppt
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1、生物信息之-基因与疾病一个人的健康依赖于上千个蛋白质持续共同作用,在正确的地方以正确的数量一起发挥作用。2022/11/212 在最近的10年中,对于人类遗传学的研究得到了长足的发展。而在疾病遗传基础方面,人类基因的理解也飞速发展。目前超过4000种疾病(例如镰刀细胞贫血症和囊性纤维性变病)被认为是具有遗传性的,并且在家族中传递。并且现在已经知道在普通条件下,如心脏病、糖尿病和多种癌症中我们基因发生的变化起到了重要作用。基因与人类健康密切相关基因与人类健康密切相关2022/11/213英国女王英国女王维多利维多利亚。亚。她带有血友病的她带有血友病的基因,并将其传给了基因,并将其传给了她的儿女。
2、血友病在她的儿女。血友病在女性一般表现为隐性女性一般表现为隐性遗传,较少发病,但遗传,较少发病,但会传给后代;在男性会传给后代;在男性则表现为显性遗传。则表现为显性遗传。她的孙女她的孙女亚历山德拉亚历山德拉(21),),她同俄国沙她同俄国沙皇尼古拉二世结婚,皇尼古拉二世结婚,导致他们的儿子患有导致他们的儿子患有血友病。血友病。一、疾病的分子机理一、疾病的分子机理HbA与HbS比较 19491949年波林发现镰刀型细胞贫血症(病人的红血细年波林发现镰刀型细胞贫血症(病人的红血细胞为镰刀形)与血红蛋白结构异常相关,根据杂交原胞为镰刀形)与血红蛋白结构异常相关,根据杂交原理应用限制性酶切图谱分析,其
3、病因是密码子理应用限制性酶切图谱分析,其病因是密码子GAGGAG突变突变为为GTGGTG。1单单单单基基基基因因因因病病病病2多多多多基基基基因因因因病病病病3获获获获得得得得性性性性基基基基因因因因病病病病二、基因病分类二、基因病分类(Classification of genic diseaseClassification of genic disease)疾病的分子机制疾病的分子机制DuchenneDuchenne肌营养不良症肌营养不良症(假性(假性肌肌肥大型)肥大型)白化病患者白化病患者21三体综合症患儿(先天愚型)单基因病染色体病唇裂与腭裂多基因病单基因疾病仅与一个特定的基因密切相关
4、,大多数比较少见的遗传性疾病属于这一类。在这类疾病发生原因中单个基因突变的影响力可以达到80%以上。地中海贫血(MediteraneanAnemia)亨廷顿氏病(HuntingtonsDisease,HD)肌肉营养不良性萎缩(DuchenneMuscularDystrophy,DMD)苯丙酮尿症(Phenylketonuria,简称PKU)2022/11/2191.疾病症状与几个或者更多突变等位基因有关,2.各个基因分别对疾病只产生小的影响,3.基因的表现受到大量外界因素的影响。多基因疾病与多个基因有关,如高血压病与近20个基因有关。癌症、高血压病、糖尿病、老年性痴呆、中风、冠心病等,大多数疾
5、病与基因的关系是:疾病是基因与外界因素相互作用的结果,基因突变并不一定导致疾病。因此通过基因检测了解等位基因的突变,可以调节外界因素(生活环境/生活习惯/饮食)。做到 避免或延缓疾病,或减轻症状,及早治疗。2022/11/21103获得性基因病获得性基因病由病原微生物感染引起的,不会遗传。由病原微生物感染引起的,不会遗传。2多基因病(多基因病(Multifactor gene disorder)由多基因的结构或表达调控的改变引发的疾病。由多基因的结构或表达调控的改变引发的疾病。【ClinicdiseaseClinicdisease】高血压、糖尿病、自身免疫性疾病和恶性肿瘤。高血压、糖尿病、自身
6、免疫性疾病和恶性肿瘤。疾病的分子机制疾病的分子机制三、基因突变(一)基因突变 基因组基因组DNADNA分子在结构上发生核酸序列或数目的改变分子在结构上发生核酸序列或数目的改变。突变频率明显高于平均数突变频率明显高于平均数 突变热点(突变热点(Hot spots of mutationHot spots of mutation)突变频率明显低于平均数突变频率明显低于平均数 保守区保守区 基因突变的方式:基因上单个碱基的突变,基因的片段的丢失和增加 拷贝数增加 染色体异常2022/11/2114体细胞的基因DNA序列的突变2022/11/2115基因突变可能产生三种后果:1.不影响编码蛋白的结构和
7、功能2.蛋白质仍有功能,但有缺陷3.蛋白质会完全失去作用2022/11/2116基因的变异是如何发生的?遗传性突变(生殖性突变)从父母亲那里继承的获得性突变(体细胞突变)体细胞突变在个别细胞DNA中出现 2022/11/21171 1.自发性损伤自发性损伤 指指DNADNA复制时自发错配。复制时自发错配。2.2.突变剂突变剂 指能引起基因错配、缺失、损伤的各种化学、物理、指能引起基因错配、缺失、损伤的各种化学、物理、生物的因素。生物的因素。疾病的分子机制疾病的分子机制(二)、基因突变的原因 基因突变原因分类基因突变原因分类 自发突变自发突变诱发突变诱发突变1.1.碱基置换突变碱基置换突变 概念
8、概念一个碱基被另一碱基取代而造成的突变。一个碱基被另一碱基取代而造成的突变。(三)、基因突变的类型疾病的分子机制疾病的分子机制基因突变类型染色体错误配和不等交换染色体错误配和不等交换碱基置换突变碱基置换突变移码突变和整码突变移码突变和整码突变 转换转换(Transition)Transition):嘌呤与嘌呤或嘧啶与嘧啶之间的置换。:嘌呤与嘌呤或嘧啶与嘧啶之间的置换。颠换颠换(Transversion)(Transversion):嘌呤与嘧啶之间的置换。嘌呤与嘧啶之间的置换。疾病的分子机制疾病的分子机制 同义突变(同义突变(Same-sense or synonymous mutationSa
9、me-sense or synonymous mutation)单个碱基置换后,改变前后密码子所编码的氨基酸一样。单个碱基置换后,改变前后密码子所编码的氨基酸一样。DNA DNA G GC CA A GCGCGG GC GCC C 转录转录 转录转录 mRNA mRNA CGU CGU CGC CGC CGG CGG 翻译翻译 翻译翻译 翻译翻译 多肽链多肽链 精氨酸精氨酸 精氨酸精氨酸 精氨酸精氨酸 TransitionTransitionAGAGTransversionTransversionGCGC【For exampleFor example】【For exampleFor examp
10、le】DNA DNA A AC CGG A AT TG G A AA AG G 转录转录 转录转录 转录转录 mRNA mRNA UGC UGC UAC UAC UUC UUC 翻译翻译 翻译翻译 翻译翻译 多肽链多肽链 半胱半胱氨酸氨酸 酪酪氨酸氨酸 苯丙苯丙氨酸氨酸 TransitionTransitionCTCTTransversionTransversionT AT A 如错义突变不影响蛋白质或酶的生物活性,不出现明显的表型改变如错义突变不影响蛋白质或酶的生物活性,不出现明显的表型改变(效应),称为中性突变(效应),称为中性突变(Neutral mutationNeutral muta
11、tion)。)。错义突变(错义突变(Missense mutationMissense mutation)DNADNA分子中的核苷酸置换导致合成的多肽链中一个氨基酸分子中的核苷酸置换导致合成的多肽链中一个氨基酸 被另一氨基酸所取代。被另一氨基酸所取代。疾病的分子机制疾病的分子机制 无义突变(无义突变(nonsense mutationnonsense mutation)单个碱基置换导致终止密码子(单个碱基置换导致终止密码子(UAGUAG、UAAUAA、UGAUGA)提前出)提前出 现。现。疾的分子机制疾的分子机制 终止密码突变终止密码突变 DNADNA分子中一个终止密码子发生突变形成延长的异常
12、肽链。分子中一个终止密码子发生突变形成延长的异常肽链。疾病的分子机制疾病的分子机制疾病的分子机制疾病的分子机制 抑制基因突变(抑制基因突变(Suppressor gene mutationSuppressor gene mutation)在基因内部不同位置上的不同碱基发生了两次突变,其在基因内部不同位置上的不同碱基发生了两次突变,其中一次抑制了另一次突变的遗传效应。中一次抑制了另一次突变的遗传效应。【For exampleFor example】单纯单纯 6 6 谷谷缬,产生缬,产生HbSHbS病,造成死亡。病,造成死亡。第第6 6位谷位谷缬,缬,第第7373位天冬氨酸位天冬氨酸天冬酰胺;天冬
13、酰胺;Hb HarlemHb Harlem临床症状较轻,其原因是临床症状较轻,其原因是 7373突变抑制了突变抑制了 6 6 突变的有害效应。突变的有害效应。Hb HarlemHb Harlem是是 链链 2.2.移码突变和整码突变(移码突变和整码突变(Frame-shift&codon mutationFrame-shift&codon mutation)移码突变(移码突变(Frame-shift mutationFrame-shift mutation)DNADNA链上插入或丢失链上插入或丢失1 1个、个、2 2个甚至多个(但不包括三个或个甚至多个(但不包括三个或其倍数)碱基,导致在插入或
14、丢失碱基部位以后的编码都发生其倍数)碱基,导致在插入或丢失碱基部位以后的编码都发生了相应改变。了相应改变。疾病的分子机制疾病的分子机制 3.3.染色体错误配和不等交换(染色体错误配和不等交换(Mispaired synapsis andMispaired synapsis and unequal crossing-over unequal crossing-over)整码突变(整码突变(Codon mutationCodon mutation)如插入或丢失部位的前后氨基酸顺序不变。如插入或丢失部位的前后氨基酸顺序不变。单核苷酸多态性(单核苷酸多态性(SNP)是最常见的基因变异是最常见的基因变异
15、至少至少1%1%的人群的人群绝大多数人群绝大多数人群共有序列共有序列G to CSNP 位点位点变异的序列变异的序列(四).最常见的基因变异 SNP2022/11/2125单核苷酸多态性(SNP)2022/11/2126编码区的编码区的SNPs 不造成蛋白质分子改变不造成蛋白质分子改变DNA SNP C to GRNA CodonCUG to CUCProtein Leucine to LeucineNo change in shapeLeucineLeucinemRNAG A CC U GC U CCUGCUCG A G2022/11/2127DNA SNP A to CRNA CodonG
16、AU to GAGProtein Aspartic acid to Glutamic acidSlight change in shapeAspartic acidGlutamic acidmRNAC T AG A UG A GGAUGAGC T C编码区的编码区的SNPs 造成蛋白质分子造成蛋白质分子微细无害微细无害改变改变2022/11/2128DNA SNP T to ARNA CodonGAU to GUUProtein Aspartic acid to ValineChange in shapeAspartic acidValinemRNAC T G A UG U UGAUGUUC
17、AAA编码区的编码区的SNPs 造成蛋白质分子造成蛋白质分子有害有害改变突变改变突变天(门)冬氨酸2022/11/2129 四、疾病的基因诊断四、疾病的基因诊断 从从广广义义上上讲讲,大大多多数数疾疾病病都都可可以以从从遗遗遗遗传传传传物物物物质质质质的的的的变变变变化化化化中中寻寻找找出出原原因因。而而从从技技术术上上看看,只只要要找找到到了了与与疾疾病病相相关关的的基基因因,基基因因诊诊断断便便立立即即可可以以实实现现。随随着着“人人类类基基因因组组计计划划”的的进进程程,将将大大大大加加快快疾疾疾疾病病病病相相相相关关关关基基基基因因因因的的发发现现与与克克隆隆,基基因因诊诊断断将将成成
18、为为疾疾病病诊诊断断的的常规方法。常规方法。单单基基因因疾疾病病的的诊诊断断:一一般般可可在在临临床床症症状状出出现现之之前前作作出出诊诊断断,不依赖临床表型;不依赖临床表型;有有遗遗传传倾倾向向的的疾疾病病:易易感感基基因因的的筛筛查查,如如高高血血压压,冠冠心心病病,肥胖等。肥胖等。外源性病源体外源性病源体:如病毒、细菌、寄生虫等引起的传染病:如病毒、细菌、寄生虫等引起的传染病,(一)、基因鉴定技术(一)、基因鉴定技术 人体细胞有总数约为人体细胞有总数约为3030亿个碱基对的亿个碱基对的DNADNA,每个人的,每个人的DNADNA都都不完全相同,人与人之间不同的碱基对数目达几百万之多。不完
19、全相同,人与人之间不同的碱基对数目达几百万之多。所谓所谓“DNA指纹指纹”,就是把,就是把DNADNA作为像指纹那样的独特特征来作为像指纹那样的独特特征来识别不同的人。由于识别不同的人。由于DNADNA是遗传物质,因此通过对是遗传物质,因此通过对DNADNA鉴定还可鉴定还可以判断两个人之间的亲缘关系。以判断两个人之间的亲缘关系。DNADNA鉴定技术是英国遗传学家鉴定技术是英国遗传学家A A J J 杰弗里斯(杰弗里斯(19501950)在)在19841984年发明的。由于人体各部位的细胞都有相同的年发明的。由于人体各部位的细胞都有相同的DNADNA,因此可,因此可以通过检查血迹、毛发、唾液等判
20、明身分。以通过检查血迹、毛发、唾液等判明身分。DNADNA指纹指纹 只要罪犯在案只要罪犯在案发现场发现场留下任何与留下任何与身体有关的身体有关的东东西,例如西,例如血迹和毛血迹和毛血迹和毛血迹和毛发发发发,警方就可以根据警方就可以根据这这些蛛些蛛丝马丝马迹将其迹将其擒擒获获,准确率非常高。,准确率非常高。DNADNA鉴鉴定技定技术术在破在破获获强强奸和暴力犯罪奸和暴力犯罪时时特特别别有有效,因效,因为为在此在此类类案件中,罪犯很容案件中,罪犯很容易留下包含易留下包含DNADNA信息的罪信息的罪证证。根据根据DNADNA指指纹纹破案破案虽虽然准确率然准确率高,但也有出高,但也有出错错的可能,因的
21、可能,因为为两个两个人的人的DNADNA指指纹纹在在测试测试的区域内有完的区域内有完全吻合的可能。因此在全吻合的可能。因此在20002000年英国年英国将将DNADNA指指纹测试扩纹测试扩展到展到1010个区域,个区域,使偶然吻合的危使偶然吻合的危险险几率降到十几率降到十亿亿分分之一。之一。核酸标记:核酸标记:同位素标记同位素标记 非同位素标记非同位素标记核酸探针:核酸探针:探针探针是一段人工合成的碱基序列,连接上一些可检测的物质,根据碱基互补的原理,利用探针到基因混合物中识别特定基因核酸杂交:核酸杂交:探测基因所依据的最基本的理论就是核酸碱基互补原则核酸碱基互补原则,最常用的方法就是核酸分子
22、杂交,它应用一段与目标基因碱基互补的核酸作为探针去探测待测样品(二)、基因芯片(二)、基因芯片(Genechip)基因芯片又称DNA芯片或DNA微阵列。它高度集成成千上万的网格状密集排列的核酸分子(也叫分子探针)。它的出现给分子生物学、细胞生物学及医学领域带来新的革命,成为后基因时代最重要的基因功能分析技术之一。DNA微点阵已广泛和流行的用于疾病诊断、基因组比较、以及新型癌症的分类。(三)、时钟基因与抗衰老(三)、时钟基因与抗衰老 人类从公元人类从公元35003500年前就开始寻找长生不老药。老化的年前就开始寻找长生不老药。老化的原因有多种因素,如蛋白质损伤、原因有多种因素,如蛋白质损伤、DN
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