生物化学课件13讲解学习.ppt
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1、生物化学课件1313.1.1基本概念基本概念n基因(基因(gene)是指一段编码蛋白质多肽)是指一段编码蛋白质多肽链和功能链和功能RNA的的DNA。n基因表达(基因表达(geneexpression)是指在某)是指在某一基因指导下蛋白质的合成过程。一基因指导下蛋白质的合成过程。n对这个过程的调节即为基因表达调节对这个过程的调节即为基因表达调节(regulationofgeneexpression)。)。13.1.2基因表达的规律基因表达的规律n一种生物含有大量的基因,这些基因在一种生物含有大量的基因,这些基因在生命活动过程中并不都是一齐开放表达,生命活动过程中并不都是一齐开放表达,而是在有些时
2、候,一些基因进行表达,而是在有些时候,一些基因进行表达,另一些基因则关闭。另一些基因则关闭。n基因表达表现为严格的规律性,即时间基因表达表现为严格的规律性,即时间特异性、空间特异性。特异性、空间特异性。按功能需要,某一特定基因的表达严格按照特定按功能需要,某一特定基因的表达严格按照特定的时间顺序发生,这就是基因表达的时间特异性。在的时间顺序发生,这就是基因表达的时间特异性。在个体生长全过程某种基因产物在个体内按不同组织空个体生长全过程某种基因产物在个体内按不同组织空间顺序地出现,这就是基因表达的空间特异性。间顺序地出现,这就是基因表达的空间特异性。n例如:母牛只有在分娩小牛后才开始泌例如:母牛
3、只有在分娩小牛后才开始泌乳时,乳腺中的各种蛋白质基因也只有乳时,乳腺中的各种蛋白质基因也只有在这时才开始表达产生各种乳蛋白。在这时才开始表达产生各种乳蛋白。n生长发育过程中更为明显,许多基因只生长发育过程中更为明显,许多基因只有在特定的时间和空间才进行表达,其有在特定的时间和空间才进行表达,其余时间或空间这些基因则关闭。余时间或空间这些基因则关闭。13.1.3基因表达的方式基因表达的方式n13.1.3.1组成性表达组成性表达n13.1.3.2诱导和阻遏表达诱导和阻遏表达13.1.3.1组成性表达组成性表达n有有些些基基因因产产物物在在生生命命全全过过程程都都是是必必需需的的,通通常常把把在在一
4、一个个生生物物个个体体的的几几乎乎所所有有细细胞胞中中持持续续表表达达的基因称为的基因称为管家基因管家基因(housekeepinggene)。)。n管管家家基基因因很很少少受受环环境境变变化化影影响响,在在个个体体各各个个生生长长阶阶段段的的几几乎乎全全部部组组织织中中持持续续表表达达或或变变化化很很小小,这这类类基基因因的的表表达达方方式式称称为为组组成成性性基基因因表表达达(constitutivegeneexpression)。)。n这这类类基基因因表表达达只只受受启启动动子子序序列列或或启启动动子子与与RNA聚聚合合酶酶相相互互作作用用的的影影响响,而而不不受受其其他他机机制制调调节
5、节。组组成成性性基基因因表达水平的表达水平的“不变不变”是相对的。是相对的。13.1.3.2诱导和阻遏表达诱导和阻遏表达n有有一一些些基基因因表表达达极极易易受受环环境境变变化化的的影影响响,在在特特定定环环境境信信号号刺刺激激下下,这这类类基基因因表表达达水水平平可可呈呈现现升高或降低的现象。升高或降低的现象。n在在特特定定环环境境信信号号刺刺激激下下,相相应应的的基基因因被被激激活活,基基因因表表达达产产物物增增加加,这这种种表表达达方方式式称称为为诱诱导导表表达达(inductionexpression)。反反之之,有有些些基基因因的的表表 达达 表表 现现 为为 关关 闭闭 或或 下下
6、 降降,称称 为为 阻阻 遏遏 表表 达达(repressionexpression)。n在生物体内,各种代谢途径有条不紊地进行,则是在一在生物体内,各种代谢途径有条不紊地进行,则是在一定机制控制下,功能相关的一组基因,协调一致,共同定机制控制下,功能相关的一组基因,协调一致,共同表达,称为表达,称为协调表达(协调表达(coordinanceexpression)。13.1.4基因表达调节的基本原理基因表达调节的基本原理n13.1.4.1特异特异DNA序列对基因转录激活序列对基因转录激活的调节的调节n13.1.4.2调节蛋白对转录起始的调节调节蛋白对转录起始的调节n13.1.4.3 影响影响R
7、NARNA聚合酶活性聚合酶活性n对对于于一一个个基基因因编编码码产产物物蛋蛋白白质质来来说说,可可以以在在7 7个个水水平平上上进进行行调调节节:基基因因活活化化、转转录录起起始始、转转录录后后加加工工、mRNAmRNA降降解解、蛋蛋白白质质的的翻翻译译、翻翻译译后后加加工工修修饰饰及及蛋蛋白白质质的降解。的降解。基因的表达最为有效的调控表现在两个层基因的表达最为有效的调控表现在两个层次上:次上:第一:是控制从第一:是控制从DNA模板上转录模板上转录mRNA的的速度。速度。从而免去从从而免去从 mRNA mRNA 合成蛋白所需的各种材料,是合成蛋白所需的各种材料,是十分经济的。这种调控通常称为
8、转录水平(十分经济的。这种调控通常称为转录水平(transcription transcription levellevel)的调控。)的调控。第二:是控制从第二:是控制从mRNA翻译成翻译成多肽链多肽链的速的速度。度。称为称为 翻译水平(翻译水平(translational leveltranslational level)的调控。大多)的调控。大多数生物多采用转录水平的调控,翻译水平调控较少。数生物多采用转录水平的调控,翻译水平调控较少。13.2原核基因转录调节原核基因转录调节n13.2.1原核生物基因转录调节的特点原核生物基因转录调节的特点n13.2.2乳糖操纵子调节机制乳糖操纵子调节机
9、制n13.2.3其他转录调节机制其他转录调节机制13.2.1原核生物基因转录调节的特点原核生物基因转录调节的特点n(1)因子决定因子决定RNA聚合酶识别特异性。聚合酶识别特异性。n(2)操纵子模型的普遍性。)操纵子模型的普遍性。n(3)阻遏蛋白与阻遏机制的普遍性阻遏蛋白与阻遏机制的普遍性。操纵子(操纵子(operon):):是指原核生物基因是指原核生物基因组的一个表达调控序列,它包括参与同一代谢途径组的一个表达调控序列,它包括参与同一代谢途径的几个酶的基因,编码在一起形成一个特殊转录单的几个酶的基因,编码在一起形成一个特殊转录单位(结构基因,位(结构基因,structuralgene),及在结
10、构基因前),及在结构基因前面的调节基因(面的调节基因(regulatorygene,R)、操纵基因)、操纵基因(operator,O)和启动基因()和启动基因(promoter,P)。)。操纵子的作用操纵子的作用:当代谢需要当代谢需要结构基因结构基因表达酶时,操纵子表达酶时,操纵子即开放,结构基因转录生成即开放,结构基因转录生成mRNA并表达为并表达为酶酶参加代谢。如果不需要时,结构基因不被参加代谢。如果不需要时,结构基因不被转录,或以很低的速度进行。这是一个典型转录,或以很低的速度进行。这是一个典型的转录水平的调控模式。的转录水平的调控模式。13.2.2乳糖操纵子调节机制乳糖操纵子调节机制
11、乳糖操纵子的实验现象乳糖操纵子的实验现象:当大肠杆菌在葡萄糖培当大肠杆菌在葡萄糖培养基中生长时,它不能代谢乳糖。因为缺少所必养基中生长时,它不能代谢乳糖。因为缺少所必需的酶。当生长在没有葡萄糖而只有乳糖的培养需的酶。当生长在没有葡萄糖而只有乳糖的培养基中时,代谢乳糖的酶量增加近基中时,代谢乳糖的酶量增加近1000倍,可代谢倍,可代谢乳糖。乳糖。如果此时在培养基中又加入一些葡萄糖,培如果此时在培养基中又加入一些葡萄糖,培养基中既有乳糖又有葡萄糖,则乳糖的代谢又停养基中既有乳糖又有葡萄糖,则乳糖的代谢又停止,大肠杆菌又转向利用葡萄糖而不利用乳糖。止,大肠杆菌又转向利用葡萄糖而不利用乳糖。只有葡萄糖
12、消耗殆尽,大肠杆菌才能又利用乳糖。只有葡萄糖消耗殆尽,大肠杆菌才能又利用乳糖。(1 1)乳糖)乳糖操纵子操纵子的结构的结构和阻遏和阻遏蛋白的蛋白的负性调负性调节节(2)CAP的正性调节的正性调节n在乳糖操纵子中,其启动子是弱启动子,在乳糖操纵子中,其启动子是弱启动子,RNA聚合酶与之结合的能力很弱,只有聚合酶与之结合的能力很弱,只有降解物基因活化蛋白(降解物基因活化蛋白(catabolitegeneactivatorprotein,CAP)结合到启动子)结合到启动子上游的上游的CAP结合位点,促进结合位点,促进RNA聚合酶聚合酶与启动子结合后,才能有效转录。与启动子结合后,才能有效转录。n但游
13、离的但游离的 CAP是不能与启动子上游的是不能与启动子上游的 CAP结结合位点结合的,在细胞内有足够的合位点结合的,在细胞内有足够的cAMP时,时,CAP首先与首先与 cAMP形成复合物,此复合物才能形成复合物,此复合物才能与启动子结合。因此与启动子结合。因此CAP也称做也称做cAMP受体蛋白。受体蛋白。n葡萄糖的降解产物能降低细胞内葡萄糖的降解产物能降低细胞内cAMP的含量,的含量,因而当向乳糖培养基中加入葡萄糖时,造成因而当向乳糖培养基中加入葡萄糖时,造成cAMP浓度降低,浓度降低,CAP便不能结合在便不能结合在CAP结合位结合位点上。此时即使有乳糖存在,已解除了对操纵基点上。此时即使有乳
14、糖存在,已解除了对操纵基因的阻遏,也不能进行转录,所以仍不能利用乳因的阻遏,也不能进行转录,所以仍不能利用乳糖。糖。n这就是在含葡萄糖的培养基中大肠杆菌不能利用这就是在含葡萄糖的培养基中大肠杆菌不能利用乳糖,只有改用乳糖时才能利用乳糖的调节机理乳糖,只有改用乳糖时才能利用乳糖的调节机理。(3)协调调节协调调节阻阻遏遏蛋蛋白白的的负负性性调调节节与与CAP的的正正性性调调节节两两种种机机制制协协调调合合作作,相相辅辅相相成成、互互相相协协调调、相相互互制约。制约。协调调节后的协调调节后的4种不同的情况:种不同的情况:n(1)葡葡萄萄糖糖存存在在而而乳乳糖糖不不存存在在时时,无无诱诱导导剂剂存存在
15、在,阻阻遏遏蛋蛋白白与与DNA结结合合。而而且且由由于于葡葡萄萄糖糖的的存存在在,CAP也也不不能能发发挥挥正正调调节节作作用用,基基因处于关闭状态。因处于关闭状态。n(2)葡葡萄萄糖糖和和乳乳糖糖都都不不存存在在时时,没没有有葡葡萄萄糖糖存存在在的的情情况况下下,CAP可可以以发发挥挥正正调调节节作作用用。但但由由于于没没有有诱诱导导剂剂,阻阻遏遏蛋蛋白白的的负负调调节节作作用用使使基因仍然处于关闭状态。基因仍然处于关闭状态。n(3)葡葡萄萄糖糖和和乳乳糖糖都都存存在在时时,乳乳糖糖的的存存在在对对基基因因的的转转录录产产生生诱诱导导作作用用。但但由由于于葡葡萄萄糖糖 的的 存存 在在 使使
16、 细细 胞胞 内内 cAMP水水 平平 降降 低低,cAMPCAP复复合合物物不不能能形形成成,CAP不不能能结结合合到到CAP结结合合位位点点上上,转转录录仍仍不不能能启启动动,基因处于关闭状态。基因处于关闭状态。n(4)葡萄糖不存在而乳糖存在时,)葡萄糖不存在而乳糖存在时,CAP可可以发挥正调节作用,阻遏蛋白由于诱导剂以发挥正调节作用,阻遏蛋白由于诱导剂的存在而失去负调节作用,基因被打开,的存在而失去负调节作用,基因被打开,转录启动转录启动。13.2.3其他转录调节机制其他转录调节机制n(1)阿拉伯糖操纵子)阿拉伯糖操纵子n(2)色氨酸操纵子)色氨酸操纵子(1)阿拉伯糖操纵子)阿拉伯糖操纵
17、子(araoperon)n这这是是一一个个利利用用同同一一调调节节蛋蛋白白的的不不同同结结构构形式,活化或抑制操纵子的调节方式。形式,活化或抑制操纵子的调节方式。n阿阿拉拉伯伯糖糖操操纵纵子子含含有有3个个结结构构基基因因:B、A、D基基因因,分分别别编编码码异异构构酶酶、激激酶酶、表表位位酶酶,催催化化阿阿拉拉伯伯糖糖转转变变为为5-磷磷酸酸木木酮酮糖糖,后后者者进进入入磷磷酸酸戊戊糖糖途途径径。也也包包括括调调节节基基因因(araC)、操操纵纵基基因因(araO)、启启动动子子(araI)。)。n操纵基因被操纵基因被araC的产物所调节,它是一个的产物所调节,它是一个具有具有2种不同功能构
18、象(种不同功能构象(P1和和P2)的蛋白质。)的蛋白质。n无阿拉伯糖存在时,它以无阿拉伯糖存在时,它以P1型存在,型存在,P1型型为阻遏物,为阻遏物,P1与操纵基因结合而阻止操纵与操纵基因结合而阻止操纵子的转录(负性调节)。子的转录(负性调节)。n在有阿拉伯糖存在时,阿拉伯糖可将在有阿拉伯糖存在时,阿拉伯糖可将P1从从操纵基因移开,并使构象间的平衡移向操纵基因移开,并使构象间的平衡移向P2。P2是激活物,能与是激活物,能与CAPcAMP复合物一起复合物一起结合到启动子上,促进结合到启动子上,促进RNA聚合酶开始转聚合酶开始转录(正性调节)。录(正性调节)。(2)色氨酸操纵子)色氨酸操纵子ntr
19、p操纵子的阻遏物是由距操纵子的阻遏物是由距trp操纵子较操纵子较远的远的R基因合成的一个基因合成的一个58KD的蛋白质。的蛋白质。n当机体色氨酸不足时,阻遏物游离存在,当机体色氨酸不足时,阻遏物游离存在,不能与操纵基因结合,结构基因得以转录不能与操纵基因结合,结构基因得以转录和表达,生成色氨酸。和表达,生成色氨酸。n当机体生成的色氨酸过量时,色氨酸与阻当机体生成的色氨酸过量时,色氨酸与阻遏物形成复合物,此复合物可结合操纵基遏物形成复合物,此复合物可结合操纵基因,阻止结构基因的转录。因,阻止结构基因的转录。n反馈阻遏:反馈阻遏:这种以终产物阻止该产物基这种以终产物阻止该产物基因转录的机理称为反馈
20、阻遏。此终产物因转录的机理称为反馈阻遏。此终产物(色氨酸)称为辅阻遏物(色氨酸)称为辅阻遏物(Corepressor)。)。n反馈阻遏的优点:反馈阻遏的优点:造成在色氨酸充足造成在色氨酸充足时,完全阻断转录;在色氨酸水平下降很时,完全阻断转录;在色氨酸水平下降很低时,阻遏消除,转录开放,合成色氨酸。低时,阻遏消除,转录开放,合成色氨酸。这样易于保持细菌细胞中色氨酸水平的衡这样易于保持细菌细胞中色氨酸水平的衡定。定。衰减子:衰减子:n另外,色氨酸操纵子中还存在一个辅助另外,色氨酸操纵子中还存在一个辅助调控结构,可用以终止调控结构,可用以终止和减弱转录,这和减弱转录,这个调控结构称为衰减子(个调控
21、结构称为衰减子(attenuator,a)。n结构基因结构基因 起始密码子前,有长起始密码子前,有长 162 个核苷酸个核苷酸的前导序列(的前导序列(leader Sequence,L)。该前)。该前导序列编码一小段导序列编码一小段 14 肽(前导肽)。在肽(前导肽)。在 14 肽里有肽里有两个色氨酸(两个色氨酸(UGG)密码子)密码子,它们在,它们在调节中起着重要的作用。调节中起着重要的作用。n衰减子起作用的方式:衰减子起作用的方式:前导序列的终止区与一般转录终止点前导序列的终止区与一般转录终止点的特征相同,具有潜在的二重对称结构能的特征相同,具有潜在的二重对称结构能形成茎环,具有成串的形成
22、茎环,具有成串的 U。完整的前导序。完整的前导序列分为列分为1、2、3、4个区域,这个区域,这 4 个区可个区可根据需要彼此互补,形成奇特的二级结构,根据需要彼此互补,形成奇特的二级结构,达到调节基因表达的目的。达到调节基因表达的目的。当色氨酸充足时,完整的前导肽(当色氨酸充足时,完整的前导肽(14肽)可被合成,这时在核糖肽)可被合成,这时在核糖体参与下,前导序列形成终止信号,体参与下,前导序列形成终止信号,RNA聚合酶不能通过,阻止转录聚合酶不能通过,阻止转录进行,减少结构基因的表达。进行,减少结构基因的表达。当色氨酸不足时,由于色氨酸当色氨酸不足时,由于色氨酸-tRNA不能形成,前导肽翻译
23、不能形成,前导肽翻译至至色色氨酸密码子(氨酸密码子(UGG)处即终止,在核糖体参与下,前导序列不能形成)处即终止,在核糖体参与下,前导序列不能形成终止信号,终止信号,RNA聚合酶可以超越衰减子而继续转录,结构基因得到表聚合酶可以超越衰减子而继续转录,结构基因得到表达,产生色氨酸达,产生色氨酸。衰减子调控的意义:衰减子调控的意义:衰减子调控,是一种翻译与转录相偶联衰减子调控,是一种翻译与转录相偶联的调控机制。在这里可以看到核酸分子和蛋的调控机制。在这里可以看到核酸分子和蛋白质分子一样,能以构象的改变起到调节作白质分子一样,能以构象的改变起到调节作用。用。衰减子调节在大肠杆菌的其它氨基酸合衰减子调
24、节在大肠杆菌的其它氨基酸合成操纵子中也普遍存在。成操纵子中也普遍存在。翻译水平调节翻译水平调节反义反义RNAn反义反义 RNA:就是一种与就是一种与mRNA互互补的补的RNA分子,它是分子,它是反义基因或基因反义基因或基因的反义链转录的产物。它与的反义链转录的产物。它与mRNA结合结合后即阻断后即阻断mRNA的翻译,从而调节基因的翻译,从而调节基因的表达。的表达。反义的反义的RNA的应用:的应用:基因治疗基因治疗反义反义RNA调控的特点是高度的特异性,一种调控的特点是高度的特异性,一种反义反义RNA抑制一种抑制一种mRNA。现在根据原理可人工。现在根据原理可人工设计合成反义设计合成反义RNA,
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