生物反应器备课讲稿.ppt
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1、生物反应器第二节第二节 细胞生长代谢动力学细胞生长代谢动力学 生物反应过程目前最常见的是利用发酵罐培养工程菌,生产目的产目前最常见的是利用发酵罐培养工程菌,生产目的产物。物。动、植物生物反应器发展迅速动、植物生物反应器发展迅速由生物工程所引出的生产过程一一般般生生物物反反应应过过程程细胞或酶等生物催化剂(游离或固定化)生生 物物 反反 应应 器器空气CO2等冷却水原材料培养基灭菌底物产物废物除菌检测和控制产物预处理产品提取或液化副产物 由图可见,利用生物催化剂进行反应由图可见,利用生物催化剂进行反应的生物反应器在生物过程中,具有中心的的生物反应器在生物过程中,具有中心的作用,是实现生物技术产品
2、产业化的关键作用,是实现生物技术产品产业化的关键设备,是连接原料和产物的桥梁。在反应设备,是连接原料和产物的桥梁。在反应器中,通过产物的合成,廉价的原料被升器中,通过产物的合成,廉价的原料被升值了。因此,生物反应器的设计和操作,值了。因此,生物反应器的设计和操作,是生物工程中一个及其重要的问题,它对是生物工程中一个及其重要的问题,它对产品的成本和质量有很大影响。产品的成本和质量有很大影响。一、细胞生长的特点、描述方法和分类一、细胞生长的特点、描述方法和分类细胞生长代谢动力学:定量描述细胞生长代谢过程之速细胞生长代谢动力学:定量描述细胞生长代谢过程之速率及其影响因素的科学。率及其影响因素的科学。
3、重要的概念重要的概念 反应速率:单位时间物质浓度的变化量反应速率:单位时间物质浓度的变化量 dx/dt 得率系数:得率系数:2种物质得失之间的计量比种物质得失之间的计量比 YP/Sdp/ds 比速率:单位浓度菌体单位时间内引起物质浓度的变比速率:单位浓度菌体单位时间内引起物质浓度的变化化 代表菌体活力和能力的大小。代表菌体活力和能力的大小。菌体菌体比比生长生长速率速率:1dx/Xdt 基质利用:基质利用:qs-1 ds/Xdt ds/Xdt 基质比消耗速率基质比消耗速率产物形成:产物形成:qp1dp/Xdt 产物比生成速率产物比生成速率如果细胞物质或细胞数增长一倍的时间间隔是常数,则微生物是以
4、指数速度增长,可用数学模型来描述。:比生长速率 :比生产速率 X:细胞浓度(g/L)N:每升细胞数讨论反应动力学常假设生物反应在理想状讨论反应动力学常假设生物反应在理想状态下进行,按流动特点,分两种理想流动态下进行,按流动特点,分两种理想流动模式:模式:全混式全混式 反应器内各点浓度、条件完全一反应器内各点浓度、条件完全一致致 活塞流式活塞流式 反应器内物质沿一定方向流动,反应器内物质沿一定方向流动,全无反向混合。全无反向混合。实际反应器流动特点界于实际反应器流动特点界于这两者之间。这两者之间。细胞生长的特点与群体描述 多相 体系气、液、固相混合存在 多组分 细胞外和细胞内各种营养成分,代谢产
5、物 非线性 不能用线性方程准确描述 群体性 细胞培养和代谢表现为群体性活动,细胞之间互相影响。104-8个/ml,遵循普遍的生命活动规律。基于细胞培养体系的复杂性,几乎无法对其进行描基于细胞培养体系的复杂性,几乎无法对其进行描述。从工程化角度描述细胞群体,首先进行简化,述。从工程化角度描述细胞群体,首先进行简化,然后建立物理模型,最后建立数学模型。然后建立物理模型,最后建立数学模型。对细胞群体的简化,必须考虑如下2方面的因素:细胞内部复杂的结构 细胞之间的差别因此,工程上应用最多的是非结构非离散模型均衡生长模型。该模型不考虑细胞内部的(组分)结构和细胞间的差异,把细胞看成一种溶质(质点),便于
6、用浓度描述,便于数学描述可满足大部分微生物过程及过程控制分析的需要细胞群体模型细胞群体模型非非结结构构模模型型不不考考虑虑细细胞胞内内部部结结构构,每每个个细细胞之间无差别,细胞群体作为一种溶质;胞之间无差别,细胞群体作为一种溶质;结结构构模模型型是是指指每每个个细细胞胞之之间间无无差差别别,细细胞胞内部有多个组分存在;内部有多个组分存在;一一般般的的微微生生物物生生长长动动力力学学模模型型认认为为细细胞胞为为单单一一组组分分,在在这这种种理理想想状状况况下下建建立立的的动动力力学学模模型型称称为为非非结结构构模模型型。由由于于细细胞胞组组成成是是复复杂杂的的,当当微微生生物物细细胞胞内内部部
7、的的蛋蛋白白质质、脂脂肪肪、碳碳水水化化合合物物、核核酸酸、维维生生素素等等含含量量随随环环境境条条件件的的变变化化而而变变化化时时,建建立立起起的的动动力力学模型称为结构模型。学模型称为结构模型。二、细胞浓度及浓度测量细菌细胞浓度常用干菌质量浓度(g/L,kg/m3)描述而不是量浓度(mol/L)。所用测量方法 直接测量法直接测量法 细胞干重法 一定体积培养液中收集菌体,洗净干燥,称重。测出的是细胞浓度,不适用于含不溶性固体成分的培养液。最常用方法。显微记数法 显微镜下用细胞计数器测定单位体积培养液内细胞个数。不能用于多细胞和丝状生物体记数,细菌培养液也难以使用,并且无法区别死和活细胞。平板
8、记数法 含细胞培养液系列稀释,取一定量稀释液涂布于平板固体培养基上培养,计算长出菌落数,在还原成原培养液的细胞浓度。测出的是活细胞数。可用于细菌、酵母等单细胞微生物或微生物孢子悬浮液,不适用丝状微物。浊度法 用比色法测定,A600-700nm,快速简单,也不能区别活/死细胞,实践常用。丝状微生物可先破碎再比色,过高浓度需稀释后再比色。间接测定法间接测定法 测定细胞内结构成分的含量。在培养液内含较多不溶性固体物时采用,细胞成分在细胞中含量基本衡定才适用。如测DNA。RNA,蛋白质,或者代谢产物等。三、均衡生长模型均衡生长模型只用一个量描述细胞含量生物量/浓度,单位体积中细胞个数/干重表示。1、细
9、胞生长模型 细胞生长动力学曲线 测定培养过程中细胞浓度变化得到的细胞生长动力学曲线。细胞生长需经历延迟期1,细胞增加少,培养基浓度对其长短影响不大;指数生长期2,细胞的生长不受限制,细胞浓度随时间呈指数生长,细胞分裂繁殖最为旺盛,生理活性最高,实践中常转接处于指数生长期中期的细胞,以保证转接后细胞能迅速生长,微生物反应能快速进行;静止期3营养物(限制性基质)耗尽,有害物大量积累,细胞浓度达最大值;自溶期4,环境恶化,细胞开始死亡,活细胞浓度下降,细胞生长速率为负值。4个典型生长阶段。如下图。细胞生长动力学描述 用比生长速率表示,比生长速率就是菌体生长速率与培养基中菌体浓度之比,=1dx x/x
10、dt t,单位是时间的倒数h-1,m-1,s-1。表示菌体生长能力大小。描述的是单位体积内单位细胞量细胞单位时间内增加(一倍)的细胞量。培养过程中如果速率不再变化了,上式的菌体浓度变化为 X=X0exp(t)X0为 t=0 时的菌体浓度。在对数生长期,是一个常数,由此计算出一段均衡生长过程中的平均生长速率,=1/t lnx/X X0 0。例5-1 某微生物培养液的0.125 h-1,求菌体浓度增加一倍所需的时间。解:td=ln2/=0.693/0.125=5.544 h比生长速率受菌株和各种理化因素影响,把pH,温度等控制在最佳,则可以定量描述菌体的生长状态。在菌株确定后,最重要的就是限制性底
11、物。现代细胞生长动力学的奠基人Monod在1942年便指出,在培养基中无抑制剂存在的情况下,细胞的比生长速率与限制性基质浓度的关系可用下式表示:该方程中 为比生长速率(s-1);为最大比生长速率(s-1,min-1,h-1),S为限制性基质浓度(g/L);Ks为饱和常数(g/L),其值等于比生长速率为最大比生长速率一半时的限制性基质浓度。Monod方程是典型的均衡生长模型,其基本假设如下:细胞的生长为均衡式生长,因此描述细胞生长的唯一变量是细胞的浓度;培养基中只有一种基质是生长限制性基质,而其它组分为过量不影响细胞的生长;细胞的生长视为简单的单一反应,细胞得率为一常数。Ks的意义:Ks越小,则
12、S增加少许,增加很大,所以Ks越小,就越敏感。Ks可以表示菌体细胞与基质亲和力的关系。细胞的比生长速率与限制性基质浓度的关系细胞的比生长速率与限制性基质浓度的关系细胞的比生长速率与限制性基质浓度的关系细胞的比生长速率与限制性基质浓度的关系当限制性基质浓度很低时,S Ks时,=m,若继续提高基质浓度,细胞生长速率基本不变。此时细胞的比生长速率与基质浓度无关,为零级动力学特点。将Monod方程式变为为直线方程。不同的菌种,不同的培养基,Ks和 是不同的。例:采用合成培养基,在1m3生物反应器中进行大肠杆菌分批培养,菌体的生长变化可利用Monod方程描述,已知=0.935h-1,Ks=0.71kg/
13、m3,基 质 初 始 浓 度 为50kg/m3,菌体初始浓度X0=0.1kg/m3,YX/S=0.6kg/kg(以细胞/基质计),求当80%的基质已反应时所需的时间。两种或两种以上的底物同时用于生长时,则可考虑用Monod式的形式表示各种底物与比生长速率的关系:微生物微生物限制生长基质限制生长基质Ksm(hr)大肠杆菌大肠杆菌葡萄糖葡萄糖0.22/大肠杆菌大肠杆菌乳糖乳糖0.58/啤酒酵母啤酒酵母乳糖乳糖2.63.00.18啤酒酵母啤酒酵母葡萄糖葡萄糖0.56/纤维素分解菌纤维素分解菌葡萄糖葡萄糖0.860.125固氮菌固氮菌葡萄糖葡萄糖0.160.330.13青霉菌青霉菌氧气氧气0.0070
14、.35KsKs和和m值随菌种、限制性基质种类的变化值随菌种、限制性基质种类的变化对粘稠,高密度培养,特别是丝状菌发酵液,由于菌体对基质的扩散阻力,不太适合Monod方程,可采用Contois(1959)方程:=mS/Kxx+S Kx为菌体与基质的比例系数。其他的关联式可以阅读教材P5,2、基质消耗模型基质消耗主要用于 细胞生长,合成新的细胞 细胞维持生命消耗的能源物质(基础代谢)合成次级代谢产物 用方程表示为 ds/dt -1dx/Yx/sdt mxX1dp/Yp/sdt Yx/s 表示菌量对基质的得率系数Yp/s 表示产物对基质的得率系数mx 表示菌体的维持系数,即单位量菌体在单位时间内消耗
15、的基质量。3、产物生成的动力学模型产物指细胞培养过程中代谢生成的除细胞量以外的物质。据其特点分为:1)、生长藕联型 产物只在细胞生长时才能生成。2)、非生长藕联型 产物与细胞同时存在。如抗生素和毒素。3)混合生长藕联型 既与生长有关也与菌量有关。4、均衡生长动力学模型培养过程中基质的消耗、细菌生长及产物的增加互相影响,交织在一起。故细胞培养整体的动力学模型是他们的微分方程的联立的结果,已知初始条件即可用合适的数学方程组求解与分析。一般尽量采用简化的数学模型。通过代谢曲线分析与菌体形态观察,提出一些假设,建立数学模型,采集实验数据求解模型中个参数值,最后用初始条件、参数值和限制性条件等计算出过程
16、曲线。判断曲线与实验点的符合程度或可靠性。如P7青霉素的发酵动力学模型计算。四、其他模型在分析胞内诱生,描述工程菌生长动力学及形态功能差距较大的细胞的生长动力学时,前面的均衡生长模型不能满足其要求。必须采用离散型和结构型生长模型。工程菌要考虑质粒的稳定性、质粒拷贝数的控制、转录的效率的提高与控制、翻译效率的提高以及菌体向外分泌产物等因素。工程菌株的质粒不稳定过程分为两个阶段:1.工程菌株细胞分裂时,某一子细胞未能得到质粒或质粒缺失等。2.由于质粒保持菌株与第一阶段得到的失去质粒菌株生长速率的差异,特别是后者生长速率更快些,致使后者所占总菌数的比率越来越大。工程菌放大生产过程中,要检查菌体质粒稳
17、定性。模型建立,首先,也必须提出假设,然后,建立数学模型,采集实验数据求解模型中个参数值,最后用初始条件、参数值和限制性条件等计算出过程曲线。判断曲线与实验点的符合程度或可靠性。第三节 生物反应器的基本类型与设计一、生物反应器的特点和分类生物反应与一般的化学反应器相似,对生物反应器也要求能维持一定的温度、pH、反应物(营养物质,包括溶解氧)浓度,并具有良好的传质、传热和混合性能,以提供合适的环境条件,确保生物反应的顺利进行。与一般的化学反应明显不同的是,细胞生物反应器在运行中要杜绝外界各种微生物的进入,避免杂菌污染造成的损失。最简单的反应器是没有机械搅拌和通气系统的反应罐,适合液相、厌氧催熟型
18、操作,如酿造。2、生物反应器、生物反应器生物反应器的分类1、按所用的生物催化剂的不同分酶催化反应器细胞生物反应器 2、按反应器的操作方式分 批式生物反应器 连续式生物反应器 有恒化器和管式反应器2种半连续式生物反应器 介于上2者之间3 3、按反应器结构特征分、按反应器结构特征分釜式、管式、塔式、膜式等类型4 4、按能量的输入方式分、按能量的输入方式分机械搅拌式机械搅拌式 通过机械搅拌输入能量通过机械搅拌输入能量 最常用最常用气升式气升式 利用从下部通入的气体喷射动能利用从下部通入的气体喷射动能 有多种形式有多种形式使液体循环的生物反应器使液体循环的生物反应器 利用泵对液体的喷射作用利用泵对液体
19、的喷射作用 间歇式生物反应器:间歇式生物反应器:在反应开始到结束的整个反应过程中,没有底物和产物的加入和取出,但底物和产物的浓度是随反应时间的变化而变化。间歇式生物反应器的基本特征:间歇式生物反应器的基本特征:反应物料一次性加入和取出,反应器内物系的组成仅随时间而变化。在该类反应器内进行的反应过程是一非稳态过程。连续式生物反应器连续式生物反应器:以一定的流量不断加人新的培养基,同时以相同的流量不断取出反应液。这样就可以不断地补充细胞需要的营养物质,而代谢产物则不断被稀释而排出,使生化反应连续稳定地进行下去。连续式生物反应器基本牲:连续式生物反应器基本牲:反应大多属于稳态过程,反应器内任何部位的
20、物系组成均不随时间而变化。半间歇式生物反应器半间歇式生物反应器 采用将原料与部分产物连续输人或输出,其余则分批加人或输出的半连续操作的反应器称为半连续生物反应器。半连续生物反应器同时具有间歇式生物反应器和连续式生物反应器的一些特点。生物反应器生物反应器壳体固定床固定床反应器反应器流化床流化床反应器反应器机机械械搅搅拌拌反反应应器器生物反应器的结构组成生物反应器的结构组成1、壳体 密封,要耐热耐压 0.3 MPa以上 2、温控器 3、搅拌器 4、通气孔 底部输入灭菌空气,顶部出气。5、进料口 发酵原料、发酵液、营养物补充,pH调节6、测量系统 pH,氧溶7、附属系统 视镜用于观察,挡板加强混合。
21、生物反应器设计需考虑的要点生物反应器设计需考虑的要点1 1、避免、避免/减少机械搅拌产生的剪切力对细胞的伤减少机械搅拌产生的剪切力对细胞的伤害。害。2 2、通气中防止气泡与细胞接触,避免气泡表面张、通气中防止气泡与细胞接触,避免气泡表面张力对细胞的伤害。力对细胞的伤害。3 3、补料与、补料与pHpH调节要防止化学环境急剧变化对细胞调节要防止化学环境急剧变化对细胞的伤害。一般不用酸碱直接调节的伤害。一般不用酸碱直接调节pHpH。生物反应器选型与设计的原则生物反应器选型与设计的原则1、选择适宜的生物催化剂。这包括要了解产物在生物反、选择适宜的生物催化剂。这包括要了解产物在生物反应的哪一阶段大量生成
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