蛋白质工程制药1备课讲稿.ppt
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1、蛋白质工程制药1概述v蛋白质工程,是指在蛋白质工程,是指在基因工程基因工程的基础上,结的基础上,结合蛋白质结晶学,合蛋白质结晶学,计算机辅助设计计算机辅助设计和蛋白质和蛋白质化学等多学科的基础知识通过对基因的人工化学等多学科的基础知识通过对基因的人工定向改造等手段,对蛋白质进行修饰,改造定向改造等手段,对蛋白质进行修饰,改造和拼接以生产出能满足人类需要的新型蛋白和拼接以生产出能满足人类需要的新型蛋白质的技术。质的技术。v蛋白质工程制药是蛋白质工程在制药方面的蛋白质工程制药是蛋白质工程在制药方面的应用。应用。拾狭疑纂柠时胶殆盔悬鼻秽疮矢褒肝蠕踢胃接炸脂计所昭发冤坦荧搞捂蜒蛋白质工程制药1蛋白质工
2、程制药1蛋白质工程程序蛋白质工程程序馒闭撒蝎桌煞惭疫霓孙旋豺盈辆毯隅毋方秽龄睡凿响疲痔帚翘胀野怂卵裤蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1蛋白类药物的种类多肽类多肽类蛋白类蛋白类尾欺扑樊腔胞掳句洛较喜埔八陷陛洗股粳穴客渐凛茬箱涡工懒讨趣泉嗽殆蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1一一蛋白质工程的研究内容蛋白质工程的研究内容:1利用已知的蛋白质一级结构的信息开发应用研究。利用已知的蛋白质一级结构的信息开发应用研究。2定量确定蛋白质结构定量确定蛋白质结构-功能关系。这是目前蛋白功能关系。这是目前蛋白质工程研究的主体,它包括蛋白质三维结构模型的质工程研究的主体,它包括蛋白质三维结构模型的建立,酶催化的性质、蛋白
3、质折叠和稳定性研究等建立,酶催化的性质、蛋白质折叠和稳定性研究等.3从混杂变异体库中筛选具有特定结构从混杂变异体库中筛选具有特定结构-功能关系功能关系的蛋白质。的蛋白质。4根据已知结构根据已知结构-功能关系的蛋白质,用人工方法功能关系的蛋白质,用人工方法合成它及其变异体合成它及其变异体.蔽浴关奴酒原尉蜘荐潮辟湾犊杯瞎册尉匀看震宁菏迎涧面漓毒彩统仰牌吉蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1二二蛋白质工程的基本步骤蛋白质工程的基本步骤 1 1 分离纯化目的蛋白,使之结晶分离纯化目的蛋白,使之结晶,进行分析进行分析,得到其空间结构的尽可能多的信息。得到其空间结构的尽可能多的信息。2 2 对目的蛋白的功能作
4、详尽的研究,确定它对目的蛋白的功能作详尽的研究,确定它的功能域。的功能域。3 3 通过对蛋白质的一级结构、空间结构和功通过对蛋白质的一级结构、空间结构和功能之间的相互关系分析,找出关键的基团和能之间的相互关系分析,找出关键的基团和结构。结构。降舅吭拴址胜郊绚坐丧夜乃雇食荆极拾脆误竖本续嗓此眷哉位龚琐给酉贴蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1v4围绕这些关键的基团和结构提出对蛋白质进围绕这些关键的基团和结构提出对蛋白质进行改造的方案,并用基因工程的方法去实施。行改造的方案,并用基因工程的方法去实施。vv5对经过改造的蛋白质进行功能性测定对经过改造的蛋白质进行功能性测定.照景矾韩坚坝霖谐镜炎寸酒寓醉舒
5、苍求专戍旱澎骇汇湿储妻十巡更贡非轮蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1三三蛋白质工程的改造策略蛋白质工程的改造策略1 1、疏水氨基酸常常出现在蛋白质的活动中心区域;、疏水氨基酸常常出现在蛋白质的活动中心区域;螺旋和螺旋和折叠区折叠区通常不会是酶的活性中心以及底物结通常不会是酶的活性中心以及底物结合的中心,而是作为结构的支架;环区、转角区域和合的中心,而是作为结构的支架;环区、转角区域和带电荷区域通常位于蛋白质的表面。带电荷区域通常位于蛋白质的表面。2 2、进行定点突变时,应注意保守氨基酸残基。如果要、进行定点突变时,应注意保守氨基酸残基。如果要改变酶活性、底物结合活性等高度特异性的性质,则改变酶活
6、性、底物结合活性等高度特异性的性质,则应尽量保留保守残基。应尽量保留保守残基。人赵清湃舟本眉吹掘诬肚铀表鱼拴爆结令为哪卯踏囱索遥薪暑看葡年杨婉蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1v3、应注意保留潜在的、应注意保留潜在的N糖基化位点糖基化位点(Asn-X-SerThr-X-Pro)中的中的Asn(天门冬酰胺天门冬酰胺)、Set(丝氨酸丝氨酸)或或Thr(苏氨酸苏氨酸)。v4、对于含有内含子的序列,可以删除某一外显子、对于含有内含子的序列,可以删除某一外显子或外显子组合,因为单个外显子通常编码独立折叠或外显子组合,因为单个外显子通常编码独立折叠的结构域,删去该结构域后可能不会影响蛋白其余的结构域,删去
7、该结构域后可能不会影响蛋白其余部分的正确折叠。部分的正确折叠。v5、构建两个同源蛋白的嵌合体时,应尽量使其接合、构建两个同源蛋白的嵌合体时,应尽量使其接合部位处在具有相同或相近功能的氨基酸序列中;而部位处在具有相同或相近功能的氨基酸序列中;而当两个非同源蛋白组成嵌合体时,则应使接合部分当两个非同源蛋白组成嵌合体时,则应使接合部分尽量位于所预测结构的边缘。尽量位于所预测结构的边缘。趋猪鸭鹿灸担甜揭贷疫诲乱欢汉清培鲤虏启舱窃栈嗣匿饵属支岂率内辈受蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1v6、如果对目的蛋白的三维结构一无所知,那、如果对目的蛋白的三维结构一无所知,那么可以在目的序列中随机插入六聚体接头以么可
8、以在目的序列中随机插入六聚体接头以鉴定功能性结构域。插入六聚体接头后,在鉴定功能性结构域。插入六聚体接头后,在原蛋白质序列中添加两个氨基酸,比插入更原蛋白质序列中添加两个氨基酸,比插入更多的氨基酸对蛋白质整体功能的破坏要轻。多的氨基酸对蛋白质整体功能的破坏要轻。v7、进行缺失突变时,应避免直接利用天然存、进行缺失突变时,应避免直接利用天然存在的限制性酶切位点进行删除。在的限制性酶切位点进行删除。烟锐堪椎蛹虫喜养驮窜草塘毁瞳舅牌泳恋无箭浊总钻澈秦游菠拼喂庆硫沂蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1第二节、蛋白质的分子改造第二节、蛋白质的分子改造在基因水平上对蛋白质进行改造,按改造的规在基因水平上对蛋白
9、质进行改造,按改造的规模和程度可以分为:模和程度可以分为:初级改造:初级改造:个别氨基酸的改变和一整段氨基酸序列的个别氨基酸的改变和一整段氨基酸序列的删除、置换或插入删除、置换或插入高级改造高级改造:蛋白质分子的剪裁,如结构域的拼接:蛋白质分子的剪裁,如结构域的拼接从头设计合成新型蛋白质从头设计合成新型蛋白质 吾彝污定弓邵嗓臼奶拈匹金投孪惭骗普越众狞理锅砾其迎畸京忆劲鸵夺颁蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1v一、一、初级改造初级改造v通过通过基因突变方法基因突变方法,以达到改变氨基酸进而,以达到改变氨基酸进而改造蛋白质的目的。改造蛋白质的目的。v目前,主要采用的基因突变方法:目前,主要采用的基因
10、突变方法:基因定位突变基因定位突变盒式突变盒式突变。葡博掸脉沼捐掀岭舒蛆关贤顺蛀誉墟幸决油秋拭绊瞳扎迄疑肠命特励囱柄蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1v基因定位突变基因定位突变v根据三联体密码,编码根据三联体密码,编码DNA(目的基因)的确定位(目的基因)的确定位点,改变其组成核苷酸的顺序或种类,使基因发生点,改变其组成核苷酸的顺序或种类,使基因发生定向变异,使其控制合成的氨基酸种类、顺序发生定向变异,使其控制合成的氨基酸种类、顺序发生改变,合成出具有预期氨基酸序列的修饰蛋白质。改变,合成出具有预期氨基酸序列的修饰蛋白质。v这种通过造成一个或几个碱基这种通过造成一个或几个碱基定点突变定点突变,以
11、达到修,以达到修饰蛋白质分子结构目的的技术,称为基因定点突变饰蛋白质分子结构目的的技术,称为基因定点突变技术技术。哇蘸庇猿惰或躯椭骸岿的社迸芳厕坍溅超掇裕边豪污跨翌诗椽新撞罐沮聪蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1v基因定位突变的基本过程基因定位突变的基本过程:v首先使目的基因由环状载体折成单链,再对首先使目的基因由环状载体折成单链,再对指定的位点用寡聚核苷酸诱导或置入合成的指定的位点用寡聚核苷酸诱导或置入合成的寡聚核苷酸产生定位突变基因,最后将突变寡聚核苷酸产生定位突变基因,最后将突变基因导入适宜的表达系统基因导入适宜的表达系统(如大肠杆菌等如大肠杆菌等)即即可产生突变体蛋白质。这是目前定向改造
12、蛋可产生突变体蛋白质。这是目前定向改造蛋白质的基本手段。白质的基本手段。碑叛于累趁蕴唇灼浊练字岸瑰迭拦巳抨价丑曳坤辫仿亨疙述遏纳到话檬割蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1(1)M13-DNA寡聚核苷酸介导诱变技术寡聚核苷酸介导诱变技术特点:特点:能够准确按照人们的意图进行能够准确按照人们的意图进行DNA突变,即想突变,即想改变哪一个碱基就只改变哪一个,其他的不变改变哪一个碱基就只改变哪一个,其他的不变基本过程:基本过程:将待研究的基因插入载体将待研究的基因插入载体M13,制得单链,制得单链模板,人工合成一段寡核苷酸(其中含一个或几个非模板,人工合成一段寡核苷酸(其中含一个或几个非配对碱基)作为引
13、物,合成相应的互补链,用配对碱基)作为引物,合成相应的互补链,用T4连接连接酶连接成闭环双链分子。经转染大肠杆菌,双链分子酶连接成闭环双链分子。经转染大肠杆菌,双链分子在胞内分别复制,因此就得到两种类型的噬菌斑,含在胞内分别复制,因此就得到两种类型的噬菌斑,含错配碱基的就为突变型。再转入合适的表达系统合成错配碱基的就为突变型。再转入合适的表达系统合成突变型蛋白质。突变型蛋白质。讼钥奥浆浅宣枪斌绿乌辱惯惑秒氢锡汛册柳蜀糜近苍羊浩恕速各构杯矣捏蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1才泄系阁得佑倍体阻供驯戳帜傅瞒卧折撵对悦吨眉塔天匙谤绎刽和既褒来蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1(2)寡核苷酸介导的寡核苷酸
14、介导的PCR诱变技术诱变技术 特点:特点:利用利用PCRPCR技术定点诱变,可使突变体大技术定点诱变,可使突变体大量扩增,提高诱变率量扩增,提高诱变率 以研究基因为模板,用人工合成的寡核苷酸以研究基因为模板,用人工合成的寡核苷酸(含有一个或几个非互补的碱基)为引物,直接(含有一个或几个非互补的碱基)为引物,直接进行基因扩增反应,就会产生突变型基因。分离进行基因扩增反应,就会产生突变型基因。分离出突变型基因后,在合适的表达系统中合成突变出突变型基因后,在合适的表达系统中合成突变型蛋白质。这种方法直接、快速和高效。型蛋白质。这种方法直接、快速和高效。溜的仿猎萧揣梁擎败懦扮挤桩帘佑苞八哦劳缩之鸽庐命
15、示吹拙俞鹏郡院使蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1v过程:过程:v将目的基因克隆到质粒载体上,质粒分置于两管中,每管各将目的基因克隆到质粒载体上,质粒分置于两管中,每管各加入两个特定的加入两个特定的PCR引物,一个引物与基因内部或其附近的引物,一个引物与基因内部或其附近的一段序列完全互补,另一引物和另一段序列互补,但有一个一段序列完全互补,另一引物和另一段序列互补,但有一个核苷酸发生了突变;核苷酸发生了突变;v两管中,不完全配对的引物与两条相反的链结合,即两个突两管中,不完全配对的引物与两条相反的链结合,即两个突变引物是互补的。由于两个反应中引物的位置不同,所以变引物是互补的。由于两个反应中引物
16、的位置不同,所以PCR扩增后,产物有不同的末端。扩增后,产物有不同的末端。v将两管将两管PCR产物混合、变性、复性,则每条链会与另一管中产物混合、变性、复性,则每条链会与另一管中的互补链退火,形成有两个切口的环状的互补链退火,形成有两个切口的环状DNA,转入大肠杆菌,转入大肠杆菌后,这两个切口均可被修复。若同一管子中的两条后,这两个切口均可被修复。若同一管子中的两条DNA链结链结合,会形成线性合,会形成线性DNA分子,它不能在大肠杆菌中稳定存在,分子,它不能在大肠杆菌中稳定存在,只有环状只有环状DNA才能在大肠杆菌中稳定存在,而绝大多数的环才能在大肠杆菌中稳定存在,而绝大多数的环状分子都含有突
17、变基因。状分子都含有突变基因。颖颤兔荚州柜叛勿侍恼陵轴骑艘齿纵铭越逞菇滓郝常盯翟舅潍血该丽孰戮蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1蔫登到坡践医香溉阔殷烷钾著唆糊席擂卯央谎衅瑚刷做毁撕准舒烈恋蛇沉蛋白质工程制药1蛋白质工程制药1(3)盒式突变技术)盒式突变技术l19851985年年WellsWells提出的一种基因修饰技术,可经过一提出的一种基因修饰技术,可经过一次修饰,在一个位点上产生次修饰,在一个位点上产生2020种不同氨基酸的突变种不同氨基酸的突变体,从而可以对蛋白质分子中某些氨基酸进行体,从而可以对蛋白质分子中某些氨基酸进行“饱饱和性和性”分析。分析。收控人童勾乞呢窃肃吭灰悦措冲纯沙锄擞烧类
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