朱玉贤 第三版 现代分子生物学 重点hxzj.docx
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1、分子生物物学课程程教学讲讲义 朱朱玉贤第一讲 序论二、现代代分子生生物学中中的主要要里程碑碑分子生物物学是研研究核酸酸、蛋白白质等所所有生物物大分子子的形态态、结构构特征及及其重要要性、规规律性和和相互关关系的科科学,是是人类从从分子水水平上真真正揭开开生物世世界的奥奥秘,由由被动地地适应自自然界转转向主动动地改造造和重组组自然界界的基础础学科。当当人们意意识到同同一生物物不同世世代之间间的连续续性是由由生物体体自身所所携带的的遗传物物质所决决定的,科科学家为为揭示这这些遗传传密码所所进行的的努力就就成为人人类征服服自然的的一部分分,而以以生物大大分子为为研究对对像的分分子生物物学就迅迅速成为
2、为现代社社会中最最具活力力的科学学。从18447年SSchlleidden和和Schhwannn提出出细胞胞学说,证明明动、植植物都是是由细胞胞组成的的到今天天,虽然然不过短短短一百百多年时时间,我我们对生生物大分分子-细胞的的化学组组成却有有了深刻刻的认识识。孟德德尔的遗遗传学规规律最先先使人们们对性状状遗传产产生了理理性认识识,而MMorggan的的基因学学说则进进一步将将性状状与基因相耦联联,成为为分子遗遗传学的的奠基石石。Waatsoon和CCricck所提提出的脱脱氧核糖糖酸双螺螺旋模型型,为充充分揭示示遗传信信息的传传递规律律铺平了了道路。在在蛋白质质化学方方面,继继Summner
3、r在19936年年证实酶酶是蛋白白质之后后,Saangeer利用用纸电泳泳及层析析技术于于19553年首首次阐明明胰岛素素的一级级结构,开开创了蛋蛋白质序序列分析析的先河河。而KKenddreww和Peeruttz利用用X射线线衍射技技术解析析了肌红红蛋白(mmyogglobbin)及及血红蛋蛋白(hhemoogloobinn)的三三维结构构,论证证了这些些蛋白质质在输送送分子氧氧过程中中的特殊殊作用,成成为研究究生物大大分子空空间立体体构型的的先驱。19100年,德德国科学学家Koosseel第一一个分离离了腺嘌嘌呤,胸胸腺嘧啶啶和组氨氨酸。19599年,美美国科学学家Ucchoaa第一次次
4、合成了了核糖核核酸,实实现了将将基因内内的遗传传信息通通过RNNA翻译译成蛋白白质的过过程。同同年,KKornnberrg实现现了试管管内细菌菌细胞中中DNAA的复制制。19622年,WWatsson(美美)和CCricck(英英)因为为在19953年年提出DDNA的的反向平平行双螺螺旋模型型而与WWilkkinss共获NNoblle生理理医学奖奖,后者者通过XX射线衍衍射证实实了Waatsoon-CCricck模型型。19655年,法法国科学学家Jaacobb和Moonodd提出并并证实了了操纵子子(opperoon)作作为调节节细菌细细胞代谢谢的分子子机制。此此外,他他们还首首次推测测存在
5、一一种与DDNA序序列相互互补、能能将它所所编码的的遗传信信息带到到蛋白质质合成场场所(细细胞质)并并翻译产产生蛋白白质的mmRNAA(信使使核糖核核酸)。 19722年,PPaull Beerg(美美)第一一次进行行了DNNA重组组。 19777年,SSangger和和Gillberrt(英英)第一一次进行行了DNNA序列列分析。19888年,MMcCllinttockk由于在在50年年代提出出并发现现了可移移动遗传传因子(jjumppingg geene或或称moobille eelemmentt)而获获得Noobell奖。 19933年,美美国科学学家Rooberrts和和Shaarp因
6、因发现断断裂基因因(inntroons)而而获得NNobeel奖。MMulllis由由于发明明PCRR仪而与与加拿大大学者SSmitth(第第一个设设计基因因定点突突变)共共享Noobell化学奖奖。 此外,GGrifffitth(119288)及AAverry(119444)等人人关于致致病力强强的光滑滑型(SS型)肺肺炎链球球菌DNNA导致致致病力力弱的粗粗糙型(RR型)细细菌发生生遗传转转化的实实验;HHerssheyy和Chhasee(19952)关关于DNNA是遗遗传物质质的实验验;Crrickk于19954年年所提出出的遗传传信息传传递规律律(即中中心法则则):MMeseelsoo
7、n和SStahhl(119588)关于于DNAA半保留留复制的的实验以以及Yaanoffskyy和Brreneer(119611)年关关于遗传传密码三三联子的的设想都都为分子子生物学学的发展展做出了了重大贡贡献。我国生物物科学家家吴宪220世纪纪20年年代初回回国后在在协和医医科大学学生化系系与汪猷猷、张昌昌颖等人人一道完完成了蛋蛋白质变变性理论论、血液液生化检检测和免免疫化学学等一系系列有重重大影响响的研究究,成为为我国生生物化学学界的先先驱。220世纪纪60年年代、770年代代和800年代,我我国科学学家相继继实现了了人工全全合成有有生物学学活性的的结晶牛牛胰岛素素,解出出了三方方二锌猪猪
8、胰岛素素的晶体体结构,采采用有机机合成与与酶促相相结合的的方法完完成了酵酵母丙氨氨酸转移移核糖核核酸的人人工全合合成,在在酶学研研究、蛋蛋白质结结构及生生物膜结结构与功功能等方方面都有有世所瞩瞩目的建建树。 三、分子子生物学学的主要要研究内内容所有生物物体中的的有机大大分子都都是以碳碳原子为为核心,并并以共价价键的形形式与氢氢、氧、氮氮及磷以以不同方方式构成成的。不不仅如此此,一切切生物体体中的各各类有机机大分子子都是由由完全相相同的单单体,如如蛋白质质分子中中的200种氨基基酸、DDNA及及RNAA中的88种碱基基所组合合而成的的,由此此产生了了分子生生物学的的3条基基本原理理:1 构构成生
9、物物体有机机大分子子的单体体在不同同生物中中都是相相同的;2 生生物体内内一切有有机大分分子的建建成都遵遵循着各各自特定定的规则则;3 某某一特定定生物体体所拥有有的核酸酸及蛋白白质分子子决定了了它的属属性。分子生物物学研究究内容:DNA重重组技术术-基因工工程基因表达达调控-核酸生生物学 生物大分分子结构构功能-结构分分子生物物学DNA重重组技术术(又称称基因工工程)这是200世纪770年代代初兴起起的技术术科学,目目的是将将不同DDNA片片段(如如某个基基因或基基因的一一部分)按按照人们们的设计计定向连连接起来来,在特特定的受受体细胞胞中与载载体同时时复制并并得到表表达,产产生影响响受体细
10、细胞的新新的遗传传性状。严严格地说说,DNNA重组组技术并并不完全全等于基基因工程程,因为为后者还还包括其其他可能能使生物物细胞基基因组结结构得到到改造的的体系。DDNA重重组技术术是核酸酸化学、蛋蛋白质化化学、酶酶工程及及微生物物学、遗遗传学、细细胞学长长期深入入研究的的结晶,而而限制性性内切酶酶DNAA连接酶酶及其他他工具酶酶的发现现与应用用则是这这一技术术得以建建立的关关键。DNA重重组技术术有着广广阔的应应用前景景:DNNA重组组技术可可用于定定向改造造某些生生物基因因组结构构,使它它们所具具备的特特殊经济济价值或或功能得得以成百百 上千千倍的地地提高。DDNA重重组技术术还被用用来进
11、行行基础研研究。如如果说,分分子生物物学研究究的核心心是遗传传信息的的传递和和控制,那那么根据据中心法法则,我我们要研研究的就就是从DDNA到到RNAA,再到到蛋白质质的全过过程,也也即基因因的表达达与调控控。在这这里,无无论是对对启动子子的研究究(包括括调控元元件或称称顺式作作用元件件),还还是对转转录因子子的克隆隆及分析析,都离离不开重重组DNNA技术术的应用用。基因表达达调控研研究 因为蛋白白质分子子参与并并控制了了细胞的的一切代代谢活动动,而决决定蛋白白质结构构和合成成时序的的信息都都由核酸酸(主要要是脱氧氧核糖核核酸)分分子编码码,表现现为特定定的核苷苷酸序列列,所以以基因表表达实质
12、质上就是是遗传信信息的转转录和翻翻译。在在个体生生长发育育过程中中生物遗遗传信息息的表达达按一定定的时序序发生变变化(时时序调节节),并并随着内内外环境境的变化化而不断断加以修修正(环环境调控控)。原核生物物的基因因组和染染色体结结构都比比真核生生物简单单,转录录和翻译译在同一一时间和和空间内内发生,基基因表达达的调控控主要发发生在转转录水平平。真核核生物有有细胞核核结构,转转录和翻翻译过程程在时间间和空间间上都被被分隔开开,且在在转录和和翻译后后都有复复杂的信信息加工工过程,其其基因表表达的调调控可以以发生在在各种不不同的水水平上。基基因表达达调控主主要表现现在信号号传导研研究、转转录因子子
13、研究及及RNAA剪辑33个方面面。转录因子子是一群群能与基基因5端上游游特定序序列专一一结合,从从而保证证目的基基因以特特定的强强度在特特定的时时间与空空间表达达的蛋白白质分子子。 真核基因因在结构构上的不不连续性性是近110年来来生物学学上的重重大发现现之一。当当基因转转录成ppre-mRNNA后,除除了在55端加加帽及33端加加多聚AApoolyAA之外外,还要要将隔开开各个相相邻编码码区的内内含子剪剪去,使使外显子子(编码码区)相相连后成成为成熟熟mRNNA。研研究发现现,有许许多基因因不是将将它们的的内含子子全部剪剪去,而而是在不不同的细细胞或不不同的发发育阶段段有选择择地剪接接其中部
14、部分内含含子,因因此生成成不同的的mRNNA及蛋蛋白质分分子。 结构分子子生物学学 生物大分分子的结结构功能能研究(又又称结构构分子生生物学) 一个生生物大分分子,无无论是核核酸、蛋蛋白质或或多糖,在在发挥生生物学功功能时,必必须具备备两个前前提:首首先,它它拥有特特定的空空间结构构(三维维结构);其次,在在它发挥挥生物学学功能的的过程中中必定存存在着结结构和构构象的变变化。结构分子子生物学学就是研研究生物物大分子子特定的的空间结结构及结结构的运运动变化化与其生生物学功功能关系系的科学学。它包包括结构构的测定定、结构构运动变变化规律律的探索索及结构构与功能能相互关关系的建建立3个个主要研研究方
15、向向。最常常见的研研究三维维结构及及其运动动规律的的手段是是X射线线衍射的的晶体学学(又称称蛋白质质晶体学学),其其次是用用二维核核磁共振振和多维维核磁研研究液相相结构,也也有人用用电镜三三维重组组、电子子衍射、中中子衍射射和各种种频谱学学方法研研究生物物高分子子的空间间结构。 -第二讲 染色体体与DNNA一、 DDNA的的组成与与结构 Averry在119444年的研研究报告告中写道道:当当溶液中中酒精的的体积达达到9/10时时,有纤纤维状物物质析出出。如稍稍加搅拌拌,它就就会象棉棉线在线线轴上一一样绕在在硬棒上上,溶液液中的其其它成份份则呈颗颗粒状沉沉淀。溶溶解纤维维状物质质并重复复数次,
16、可可提高其其纯度。这这一物质质具有很很强的生生物学活活性,初初步实验验证实,它它很可能能就是DDNA(谁谁能想到到!)。对DDNA分分子的物物理化学学研究导导致了现现代生物物学翻天天覆地的的革命,这这更是AAverry所没没有想到到。所谓DNNA的一一级结构构,就是是指4种种核苷酸酸的连接接及其排排列顺序序,表示示了该DDNA分分子的化化学构成成。核苷苷酸序列列对DNNA高级级结构的的形成有有很大影影响,如如B-DDNA中中多聚(GG-C)区区易出现现左手螺螺旋DNNA(ZZ-DNNA),而而反向重重复的DDNA片片段易出出现发卡卡式结构构等。DDNA不不仅具有有严格的的化学组组成,还还具有特
17、特殊的高高级结构构,它主主要以有有规则的的双螺旋旋形式存存在,其其基本特特点是: 1、DNNA分子子是由两两条互相相平行的的脱氧核核苷酸长长链盘绕绕而成的的。2、DNNA分子子中的脱脱氧核糖糖和磷酸酸交替连连接,排排在外侧侧,构成成基本骨骨架,碱碱基排列列在内侧侧。3、两条条链上的的碱基通通过氢键键相结合合,形成成碱基对对,它的的组成有有一定的的规律。这这就是嘌嘌呤与嘧嘧啶配对对,而且且腺嘌呤呤(A)只只能与胸胸腺嘧啶啶(T)配配对,鸟鸟嘌呤(GG)只能能与胞嘧嘧啶(CC)配对对。如一一条链上上某一碱碱基是CC,另一一条链上上与它配配对的碱碱基必定定是G。碱碱基之间间的这种种一一对对应的关关系
18、叫碱碱基互补补配对原原则。组组成DNNA分子子的碱基基虽然只只有4种种,它们们的配对对方式也也只有AA与T,CC与G两两种,但但是,由由于碱基基可以任任何顺序序排列,构构成了DDNA分分子的多多样性。例例如,某某DNAA分子的的一条多多核苷酸酸链有1100个个不同的的碱基组组成,它它们的可可能排列列方式就就是41100。 二、 DDNA聚聚合酶与与DNAA的合成成The acccuraacy of traansllatiion relliess onn thhe sspeccifiicitty oof bbasee paairiing. Thhe aactuual ratte iin bbac
19、tteriia sseemms tto bbe -100-8-10-10. Thhis corrressponnds to -1 errror perr geenomme pper 10000 bbactteriial reppliccatiion cyccless, oor -10-6 pper genne pper genneraatioon.DNA pollymeerasse mmighht iimprrovee thhe sspeccifiicitty oof ccompplemmenttaryy baase sellecttionn att eiitheer (or botth) o
20、f twoo sttagees:1,Itt coouldd sccruttiniize thee inncommingg baase forr thhe ppropper commpleemenntarrityy wiith thee teempllatee baase; foor eexammplee, bby sspeccifiicallly recconggnizzingg maatchhingg chhemiicall feeatuuress. TThiss woouldd bee a preesynntheeticc errrorr coontrrol. 2,Orr itt coou
21、ldd sccruttiniize thee baase paiir aafteer tthe neww baase hass beeen addded to thee chhainn, aand, inn thhosee caasess inn whhichh a misstakke hhas beeen mmadee, rremoove thee moost reccenttly addded basse. Thiis wwoulld bbe aa prrooffreaadinng cconttroll. 三、DNNA的生生理意义义及成分分分析早在19928年年英国科科学家GGrifffi
22、tth等人人就发现现肺炎链链球菌使使小鼠残残废的原原因是引引起肺炎炎。细菌菌的毒性性(致病病力)是是由细胞胞表面荚荚膜中的的多糖所所决定的的。具有有光滑外外表的SS型肺炎炎链球菌菌因为带带有荚膜膜多糖而而都能使使小鼠发发病,而而具有粗粗糙外表表的R型型因为没没有荚膜膜多糖而而失去致致病力(荚荚膜多糖糖能保护护细菌免免受运动动白细胞胞攻击)。首先用实实验证明明基因就就是DNNA分子子的是美美国著名名的微生生物学家家Aveery。AAverry等人人将光滑滑型致病病菌(SS型)烧烧煮杀灭灭活性以以后再侵侵染小鼠鼠,发现现这些死死细菌自自然丧失失了致病病能力。再再用活的的粗糙型型细菌(RR型)来来侵
23、染小小鼠,也也不能使使之发病病,因为为粗糙型型细菌天天然无致致病力。当当他们将将经烧煮煮杀死的的S型细细菌和活活的R型型细菌混混合再感感染小鼠鼠时,实实验小鼠鼠每次都都死了。解解剖死鼠鼠,发现现有大量量活的SS型(而而不是RR型)细细菌。他他们推测测,死细细菌中的的某一成成分棗转转化源(ttrannsfoormiing priinciiplee)将无无致病力力的细菌菌转化成成病原细细菌。美国冷泉泉港卡内内基遗传传学实验验室科学学家Heershhey和和他的学学生Chhasee在19952年年从事噬噬菌体侵侵染细菌菌的实验验。噬菌菌体专门门寄生在在细菌体体内。它它的头、尾尾外部都都有由蛋蛋白质组
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