第二十八章遗传流行病学geneticepidemiology讲解学习.ppt
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1、第二十八章遗传流行病学geneticepidemiology表表常见的遗传流行病学定义常见的遗传流行病学定义作者定义Mortan(1978)Ward(1979)Cohen(1980)Phillippe(1982)King等等(1984)RaoDC(1984)遗遗传传流流行行病病学学是是研研究究与与亲亲缘缘有有关关疾疾病病的的病病因因、分分布布和和控控制制以以及疾病在人群中遗传原因的科学。及疾病在人群中遗传原因的科学。遗遗传传流流行行病病学学家家的的主主要要任任务务是是确确定定遗遗传传因因素素在在疾疾病病发发生生中中的的病因作用。病因作用。遗遗传传流流行行病病学学定定义义为为确确定定遗遗传传因因
2、素素与与环环境境因因素素的的致致病病作作用用。同同时时,对对于于不不同同遗遗传传背背景景下下的的环环境境因因素素、家家族族性性及及非非家家族族性性因素的影响给予同等的关注。因素的影响给予同等的关注。遗遗传传流流行行病病学学研研究究遗遗传传因因素素和和环环境境因因素素在在疾疾病病发发生生中中的的相相互互作用。作用。遗传流行病学研究疾病为什么和怎么样在家族和种族中聚集。遗传流行病学研究疾病为什么和怎么样在家族和种族中聚集。遗遗传传流流行行病病学学是是不不同同学学科科相相互互融融合合出出现现的的新新学学科科,其其主主要要的的父父辈辈学学科科是是遗遗传传学学和和流流行行病病学学。遗遗传传流流行行病病学
3、学与与流流行行病病学学的的主主要要区区别别是是它它着着重重考考虑虑遗遗传传因因素素和和家家庭庭相相似似性性;与与群群体体遗遗传传学学的的区区别别在在于于它它研研究究人人类类疾疾病病;与与医医学学遗遗传传学学的的区区别别在在于于它它研究的重点是人群。研究的重点是人群。Roberts(1984)Thompson(1986)钱宇平钱宇平(1990)王建华王建华(1994)门伯缓门伯缓(1994)MuinJ.Koury(1998)赵仲堂赵仲堂(1999)遗遗传传流流行行病病学学是是流流行行病病学学的的疾疾病病分分布布研研究究方方法法在在遗遗传传性性疾疾病病研研究究中中的的应应用用,其其目目的的是是阐阐
4、明明包包括括遗遗传传因因素素在在内内的的疾疾病病病因。病因。遗遗传传流流行行病病学学是是用用遗遗传传因因素素的的观观点点,对对遗遗传传性性状状的的家家族族分分布进行分析。布进行分析。遗遗传传流流行行病病学学是是一一门门研研究究与与人人群群亲亲缘缘有有关关疾疾病病的的分分布布、病病因因和和控控制制的的学学科科。它它着着重重解解析析疾疾病病中中遗遗传传因因素素和和环环境境因因素素所起的作用,作用的后果及控制的方法。所起的作用,作用的后果及控制的方法。遗遗传传流流行行病病学学是是一一门门研研究究疾疾病病在在亲亲属属中中的的病病因因、分分布布、控控制以及在人群中遗传的科学。制以及在人群中遗传的科学。遗
5、遗传传流流行行病病学学是是应应用用流流行行病病学学的的原原理理和和方方法法研研究究与与亲亲缘缘有有关关的的疾疾病病在在人人群群中中发发生生、发发展展和和分分布布的的规规律律及及其其遗遗传传背背景景,以及预防和控制方法的一门科学。以及预防和控制方法的一门科学。遗遗传传流流行行病病学学是是一一门门新新学学科科,它它探探讨讨人人群群中中遗遗传传因因素素与与环环境因素在疾病发生中的作用及其相互关系。境因素在疾病发生中的作用及其相互关系。遗遗传传流流行行病病学学是是研研究究与与遗遗传传有有关关的的疾疾病病在在人人群群中中的的分分布布、发生的原因以及制定预防或控制对策的学科。发生的原因以及制定预防或控制对
6、策的学科。二、疾病病因中遗传与环境的相对意义二、疾病病因中遗传与环境的相对意义区区分分遗遗传传因因素素与与环环境境因因素素对对某某一一疾疾病病的的病病因因作作用用是是不不容容易易的的。苯苯丙丙酮酮尿尿症症,过过去去认认为为是是常常染染色色体体隐隐性性遗遗传传的纯遗传病,但可通过食用无苯丙氨酸的食物来控制的纯遗传病,但可通过食用无苯丙氨酸的食物来控制除除极极少少数数疾疾病病之之外外,绝绝大大多多数数疾疾病病都都是是机机体体的的遗遗传传背背景与环境因素相互作用的结果。景与环境因素相互作用的结果。传染性疾病:白喉敏感性基因在传染性疾病:白喉敏感性基因在5号染色体长臂号染色体长臂脊灰敏感性基因在脊灰敏
7、感性基因在19号染色体长臂号染色体长臂乙肝疫苗无应答者的乙肝疫苗无应答者的HLA-DR3和和HLA-DR7携带率较高携带率较高遗遗传传因因素素与与环环境境因因素素在在不不同同疾疾病病发发生生中中的的相相互互作作用用与与相对关系犹如连续的光谱相对关系犹如连续的光谱人类疾病病因分类:人类疾病病因分类:1由由遗遗传传因因素素决决定定的的疾疾病病:单单基基因因遗遗传传病病及及染染色色体体异异常常引引起起的的疾疾病,种类多,发病率低,如血友病、白化病、色盲病,种类多,发病率低,如血友病、白化病、色盲2.基基本本上上由由遗遗传传因因素素决决定定的的疾疾病病:遗遗传传为为决决定定因因素素,但但需需要要环环境
8、境诱因才能发病。如苯丙酮尿症、蚕豆病、半乳糖血病等。诱因才能发病。如苯丙酮尿症、蚕豆病、半乳糖血病等。3多因子遗传病:多因子遗传病:“高遗传度高遗传度”多因子疾病,以遗传因素为主者为,如唇腭裂等。多因子疾病,以遗传因素为主者为,如唇腭裂等。“低遗传度低遗传度”多因子疾病,以环境因素为主者为,如冠心病、消化多因子疾病,以环境因素为主者为,如冠心病、消化 性溃疡及肿瘤等。性溃疡及肿瘤等。4基本上由环境因素决定的疾病:基本上由环境因素决定的疾病:传传染染性性疾疾病病,白白喉喉敏敏感感性性基基因因定定位位于于5 5号号染染色色体体长长臂臂,小小儿儿麻麻痹痹病病毒敏感性基因定位在毒敏感性基因定位在191
9、9号染色体长臂;号染色体长臂;由由明明确确的的环环境境因因素素引引起起的的疾疾病病,化化学学物物质质、放放射射、物物理理作作用用、以以及及外伤所致外伤所致 三、研究内容三、研究内容研究对象:一切与遗传有关的人类疾病研究对象:一切与遗传有关的人类疾病研究范围:有关这些疾病群体水平的问题研究范围:有关这些疾病群体水平的问题传染病的比重减少:烈性传染病、寄生虫病逐渐被控制,传染病的比重减少:烈性传染病、寄生虫病逐渐被控制,有的已被消灭。有的已被消灭。遗传病及与遗传有关的非传染性、慢性疾病对人类的危遗传病及与遗传有关的非传染性、慢性疾病对人类的危害越来越突出害越来越突出单基因遗传病已达单基因遗传病已达
10、65006500种,且以每年约种,且以每年约100100余种的速度增加;余种的速度增加;人类染色体数目异常或结构畸变病约人类染色体数目异常或结构畸变病约500500种;种;多因子遗传病病种较少,但为常见病、多发病,患病率高。多因子遗传病病种较少,但为常见病、多发病,患病率高。我国约有我国约有35%的人受单基因遗传病所累;约的人受单基因遗传病所累;约1520%的的人受多因子遗传病所累;染色体病约人受多因子遗传病所累;染色体病约100种,近种,近1000万万患者。患者。第二节第二节研究方法研究方法一、资料来源与收集一、资料来源与收集1.家系调查家系调查即对先证者(即对先证者(proband)及其亲
11、属进行调查)及其亲属进行调查先证者:家庭成员中第一个被确定为患遗传性疾病者先证者:家庭成员中第一个被确定为患遗传性疾病者2.一一般般群群体体调调查查如如对对一一个个地地区区、一一个个民民族族或或一一个个种种族族进进行行调查。调查。3.特特殊殊群群体体调调查查如如暴暴露露于于某某种种公公害害或或有有害害环环境境的的人人群群、双双生子、同胞对等。生子、同胞对等。4.常常规规记记录录资资料料包包括括临临床床诊诊疗疗记记录录、疾疾病病报报告告、死死亡亡报报告告以及疾病监测、出生缺陷监测、环境监测等资料。以及疾病监测、出生缺陷监测、环境监测等资料。(二)资料收集(二)资料收集注意以下二点:注意以下二点:
12、1.关关于于频频率率指指标标要要用用到到遗遗传传学学特特有有的的各各种种参参数数。如如关关于于疾疾病病的的分分布布遗遗传传流流行行病病学学重重视视以以出出生生数数为基数的各种频率。为基数的各种频率。2.进进行行家家系系调调查查时时要要尽尽量量取取得得调调查查对对象象的的密密切切合合作作,特特别别是是当当涉涉及及个个人人或或家家族族的的隐隐私私时时,应应注注意采取适当的方法,以获取可靠的资料。意采取适当的方法,以获取可靠的资料。二、分析方法二、分析方法(一)分布特征的描述与分析(一)分布特征的描述与分析以描述流行病学研究方法,如普查、抽样调查、筛检以描述流行病学研究方法,如普查、抽样调查、筛检等
13、,对所研究疾病的地区分布、时间分布以及人群不等,对所研究疾病的地区分布、时间分布以及人群不同特征的分布特点、规律予以描述,并对影响分布的同特征的分布特点、规律予以描述,并对影响分布的因素予以分析。因素予以分析。围绕围绕“家系家系”或或“亲缘亲缘”关系关系(二)家族聚集性分析(二)家族聚集性分析1、原理:某病的发生若与遗传有关,则可表现为家族、原理:某病的发生若与遗传有关,则可表现为家族(或种族)高发现象;反之,若无家族聚集现象,则(或种族)高发现象;反之,若无家族聚集现象,则可能与遗传无关。可能与遗传无关。2、资料:现况研究、病例对照研究或队列研究设计资料、资料:现况研究、病例对照研究或队列研
14、究设计资料3、方法、方法(1)比比较较患患者者亲亲属属与与一一般般群群体体所所研研究究疾疾病病的的患患病病率率或或发发病率,若前者高于后者,则提示该病有家族聚集性。病率,若前者高于后者,则提示该病有家族聚集性。(2)比比较较患患者者亲亲属属与与对对照照亲亲属属中中研研究究疾疾病病的的患患病病率率或或发发病率,若前者高于后者,则存在家族聚集性。病率,若前者高于后者,则存在家族聚集性。(3)患患者者亲亲属属所所研研究究疾疾病病的的患患病病率率或或发发病病率率若若随随亲亲缘缘级级数数的的降降低低而而降降低低,如如I级级亲亲属属II级级亲亲属属III级级亲亲属属,则则表明该病存在家族聚集性。表明该病存
15、在家族聚集性。(4)某某些些数数量量性性状状如如血血压压水水平平等等,若若亲亲属属对对之之间间的的相相关关大于非亲属对,则提示该性状存在家族聚集性。大于非亲属对,则提示该性状存在家族聚集性。4、注意:家族聚集性的原因:遗传、环境、教养、注意:家族聚集性的原因:遗传、环境、教养(三)双生子分析(三)双生子分析1、原理、原理双生子研究主要用于研究多因子遗传病,通过比较同双生子研究主要用于研究多因子遗传病,通过比较同卵双生子及异卵双生子中所研究疾病或性状发生的一卵双生子及异卵双生子中所研究疾病或性状发生的一致性,来判断遗传与环境因素在疾病发生中的相对作致性,来判断遗传与环境因素在疾病发生中的相对作用
16、。同卵双生(用。同卵双生(monozygotictwin,MZ)也称单卵双)也称单卵双生,是由同一个受精卵分裂而来,其所带基因生,是由同一个受精卵分裂而来,其所带基因100%相相同。异卵双生(同。异卵双生(dizygotictwin,DZ)也称双卵双生,)也称双卵双生,是由两个卵接受不同精子受精发育而成,在遗传特点是由两个卵接受不同精子受精发育而成,在遗传特点方面相当于两次妊娠,仅有方面相当于两次妊娠,仅有50%的基因相同。因此,的基因相同。因此,同卵双生子疾病或性状的差别可认为是由环境因素造同卵双生子疾病或性状的差别可认为是由环境因素造成的;而异卵双生子疾病或性状的差别可认为是遗传成的;而异
17、卵双生子疾病或性状的差别可认为是遗传与环境因素共同作用的结果。可通过计算遗传度来确与环境因素共同作用的结果。可通过计算遗传度来确定遗传因素在疾病发病中所占的比重。定遗传因素在疾病发病中所占的比重。2、分析方法、分析方法具有质量性状的疾病具有质量性状的疾病可计算同病率进而推算遗传度。可计算同病率进而推算遗传度。同同病病率率(concordencerate,C):双双生生子子中中出出现现某某疾疾病病或或性性状状一一致致的的对对子子数数占占所所有有被被调调查查的的双双生生子子对对子子数数的的百百分分比比称称为为同同病病率率或或一一致致率率(concordencerate,C)。所所谓谓的的“一一致致
18、”,是是指指双双生生子子中中一一个个具具有有某某种种性性状状或或发发生生某某种种疾疾病病时时,另另一一个个也也具具有有相相同同的的性性状状或或发发生生相相同同的的疾疾病病。同同病病率率的的计计算算有有成成对对同同病病率率和和先先证证者者同病率。同病率。成对同病率(成对同病率(pairwiseconcordancerate,Cw)计算公式:计算公式:式式中中:C指指共共同同罹罹患患所所研研究究疾疾病病或或性性状状的的双双生生子子对对子子数数;D指双方研究疾病或性状表现不一致的双生子对子数。指双方研究疾病或性状表现不一致的双生子对子数。3、双生子研究的局限性、双生子研究的局限性1、双生子是一个特殊
19、群体,同卵双生子的出生率全世界、双生子是一个特殊群体,同卵双生子的出生率全世界约为约为3-4;异卵双生子在西欧为;异卵双生子在西欧为6-9,而东方仅为西,而东方仅为西欧的一半,因此双生子研究很难应用于罕见疾病。例欧的一半,因此双生子研究很难应用于罕见疾病。例如,如,Draper等收集了等收集了1953年至年至1974年间全英国的儿童年间全英国的儿童肿瘤患病资料,其中约一半患者是白血病,但其双生肿瘤患病资料,其中约一半患者是白血病,但其双生子资料仍不足以计算同病率。子资料仍不足以计算同病率。2、双生子研究的一个重要问题是卵性判断,即判断一对、双生子研究的一个重要问题是卵性判断,即判断一对双生子是
20、同卵双生还是异卵双生。无论采取什么方法,双生子是同卵双生还是异卵双生。无论采取什么方法,除皮肤移植外,任何方法都不能绝对地确定一对双生除皮肤移植外,任何方法都不能绝对地确定一对双生子是单卵双生,只能说他们是单卵双生的概率较大。子是单卵双生,只能说他们是单卵双生的概率较大。少数单卵双生子也可能由于受精卵畸变、在子宫内的少数单卵双生子也可能由于受精卵畸变、在子宫内的位置或胎盘血循环的差别而造成某些性状的差异,使位置或胎盘血循环的差别而造成某些性状的差异,使卵性判断出现偏倚。卵性判断出现偏倚。3、双生子研究在计算上尚有一定问题和争议,因此最好、双生子研究在计算上尚有一定问题和争议,因此最好结合其它研
21、究方法或其它指标进行综合分析。结合其它研究方法或其它指标进行综合分析。4、养子和半同胞分析、养子和半同胞分析1、原理:养子(、原理:养子(adoptedchildren)是一些夫妇)是一些夫妇因婚后不育等原因领养的子女。养子研究因婚后不育等原因领养的子女。养子研究(adoptionstudies)是通过比较分析养子与其)是通过比较分析养子与其同胞及生身父母的相似性和与其寄养同胞或父同胞及生身父母的相似性和与其寄养同胞或父母的相似性,研究遗传与环境因素在某种疾病母的相似性,研究遗传与环境因素在某种疾病或性状发生中的作用。因为养子与其领养父母或性状发生中的作用。因为养子与其领养父母及领养父母的亲子
22、之间不存在血缘关系,但由及领养父母的亲子之间不存在血缘关系,但由于他们共同生活在一起,形成了生活环境相同于他们共同生活在一起,形成了生活环境相同而遗传背景不同的特殊情况,而遗传背景不同的特殊情况,2、方法:常用的研究设计有队列研究、病例对、方法:常用的研究设计有队列研究、病例对照研究和交叉分析。照研究和交叉分析。表表15-2精神分裂症母亲寄养子女与对照组精神疾患发病情况精神分裂症母亲寄养子女与对照组精神疾患发病情况半半同同胞胞(halfsibling)是是指指同同父父异异母母或或同同母母异异父父的的兄兄弟弟姐姐妹妹,根根据据研研究究疾疾病病的的患患病病情情况况,可可分分析析疾疾病病或或遗遗传传
23、性性状状来来自自父父方方或或母母方方。历历史史上上马马丁丁家家系系便便是是一一个个典典型型的的例例子子。在在美美国国南南北北战战争争时时期期,马马丁丁与与一一名名低低能能女女子子生生下下一一子子,随随后后其其子子孙孙繁繁衍衍480人人,其其中中在在调调查查到到的的189人人中中,143人人为为低低能能或或犯犯罪罪者者,正正常常者者仅仅46人人。战战后后马马丁丁又又与与一一正正常常女女子子婚婚配配,该该系系子子孙达孙达496人,均正常。人,均正常。精神分裂症母亲组正常母亲组子女人数4750子女平均年龄(岁)35.836.3精神分裂症50智能发育不全(智商0.05子女子女正常正常患病患病合计合计观
24、察值观察值(O)108127235理论值理论值(E)117.5117.5235(O-E)290.2590.25(O-E)2/E0.7680.7681.536(3)常常染染色色体体隐隐性性遗遗传传:常常染染色色体体隐隐性性遗遗传传的的遗遗传传性性状状或或致致病病基基因因位位于于常常染染色色体体上上,在在杂杂合合状状态态下下不不表表现现出出相相应应的的性性状状或或疾疾病病,只只有有隐隐性性基基因因纯纯合合体体性性状状才才表表现现出出来来,同同胞胞中中约约有有1/4的个体发病。的个体发病。常常染染色色体体隐隐性性遗遗传传方方式式比比显显性性遗遗传传方方式式复复杂杂,显显性性遗遗传传病病人人不不易易被
25、被遗遗漏漏。隐隐性性遗遗传传不不同同,有有时时即即使使双双亲亲均均为为携携带带者者,但但因因家家庭庭较较小小,子子女女数数少少,子子女女中中可可能能无无发发病病者者,这这样样的的家家庭庭往往往往被被遗遗漏漏。若若可可将将每每个个家家庭庭都都确确认认时时称称为为完完完完全全全全确确确确认认认认,不不能能都都确确认认时时称称为为不不不不完完完完全全全全确确确确认认认认,一一般般调调查查研究中多属后者。研究中多属后者。1)完全确认()完全确认(completeascertainment):采用采用Li-Mantel-Gart法进行分析,其公式法进行分析,其公式为:为:式式中中,P为为观观察察的的分分
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