《药物组学前沿进展》教学大纲（本科）.docx

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1、药物组学前沿进展一、课程简介在国际现代生物医学和药学开展的推动下，整合分析现代生物医药海量多组学大数据进行创新 药物研发是生物医药产业迅速开展的必然趋势。伴随生物医药组学信息学的开展，生物医药科学 研究已从传统实验、经验科学向理论科学迈进。药物组学信息学已成为目前最热门、最有前景的 研究领域之一。鉴于现代生物信息学与生物大数据的快速开展及与临床，科研应用的密切关系，为便于 学生了解专业最新前沿进展，本课程精选局部生物信息学热点研究课题，由多位资深教师、专家以专 题形式进行讲解。本门课程通过概览药物组学前沿进展、识别表观遗传标记物、癌基因组遗传互作相关研究及 耐药机制新发现、基于ncRNA-ce

2、RNA互作模式的研究药靶识别、肿瘤耐药相关非编码RNA多 态的系统识别、利用非编码RNA预测药物敏感性在临床的前沿应用等专题，使学生掌握基因组 学的前沿研究领域的基本理论知识，并掌握生物信息学在药物组学领域的应用及解决的问题，同 时培养学生应用所学知识观察、分析、综合和独立解决问题的能力，为学生在未来工作中打下坚 实的理论基础。二、理论教学内容1 .药物组学前沿进展概览掌握内容：药物组学相关的前沿技术进展；药物组学相关的前沿理论进展；药物组学相关的 前沿研究方向及相应的理论开展。了解内容：药物组学的特点及开展历程；药物组学相关的成功案例。2 .表观遗传标记物的识别以及表观遗传调控网络的构建与分

3、析掌握内容：CpG岛的特点，DNA甲基化对转录的调控，高通量数据挖掘DNA甲基化标记； 组蛋白修饰的基因组定位，组蛋白修饰的调控基因表达，组蛋白修饰标记物的识别。利用构建 DNA甲基化网络的策略识别疾病标记，DNA甲基化网络对基因表达的调控作用；表观遗传网络 对基因表达调控的特点，组蛋白修饰与DNA甲基化对基因表达的联合调控。了解内容：CpG岛及DNA甲基化的生物学意义；DNA甲基化在基因组的分布；组蛋白密码； 组蛋白修饰与DNA甲基化的相互作用。疾病基因组中DNA甲基化的特征；癌症DNA甲基化网络的 拓扑特征；表观遗传网络的拓扑特征。3 .癌基因组遗传互作相关研究及耐药机制新发现掌握内容：遗

4、传互作的定义，识别遗传互作的方法，以及遗传互作与耐药模型的关系。了解内容：癌基因组耐药机制研究进展。4 .基于ncRNA-ceRNA互作模式的研究药靶识别掌握内容：ceRNA的概念；ncRNA-ceRNA互作的类型及机理；识别ncRNA-ceRNA互作的常 用特征标准；预测ncRNA-ceRNA互作的计算方法进展；基于ncRNA-ceRNA互作模式的优化药靶。了解内容：ncRNA-ceRNA互作的生物学意义；ncRNA-ceRNA互作与复杂疾病的研究进展。5 .肿瘤耐药相关非编码RNA多态的系统识别掌握内容：肿瘤耐药相关miRNA和IncRNA遗传多态的定义和功能机制，常用肿瘤耐药相关 miR

5、NA和IncRNA多态数据库，基于高通量测序数据系统识别肿瘤耐药相关非编码RNA多态的案 例分析。了解内容：肿瘤耐药相关突变的研究历史，非编码RNA遗传多态导致恶性肿瘤发生开展和 耐药产生的主要机制。6 .利用非编码RNA预测药物敏感性在临床的前沿应用掌握内容：了解TCGA数据库中癌症药物敏感性的信息内容，下载及应用。IncARSR作为118CERNA在肾癌中的作用。了解内容：药物敏感性研究相关动物及细胞模型的制备和应用。7 .基于多组学数据的复杂疾病风险通路识别与药物筛选掌握内容：通路识别分析中多组学数据的整合方法，基于复杂疾病多组学的风险通路识别及 药物筛选策略。了解内容：融合非编码RNA

6、的通路识别，非编码RNA对于药物作用的影响。三、参考资料L参考书表观遗传学原理、技术与实践第1版.薛京伦主编.上海科学技术出版社.2006年12月出版 生物信息学第2版.李霞主编.人民卫生出版社.2015年6月出版.网络资源计算表观遗传学-计算表观遗传学微信公众号( s： =home&biz=MzIyOTg5OTI2Nw=#wechat_redirect)James M.Paul, Shaina D.Templeton, Akanksha Baharani, Andrew Freywald and Franco J.Vizeacoumar.Building high-resolution sy

7、nthetic lethal networks ： a Google map* of the cancer cell.Trends in molecular medicine.2014; 20 (12) ： p.704-715Yunyan Gu, Ruiping Wang, Yue Han, Wenbin Zhou, Zhangxiang Zhao, Tingling Chen, Yuanyuan Zhang, Fuduan Peng, Haihai Liang, Lishuang Qi, Wenyuan Zhao, Da Yang, Zheng Guo (*) . A landscape o

8、f synthetic viable interactions in cancer.Briefing in Bioinformatics.2017 Jan 17.pii： bbw 142.doi： 10.1093/bib/bbw 142四、学时分配序号教学内容参考学时总学时理论学时实验学时1药物组学前沿进展概览3302表观遗传标记物的识别以及表观遗传调控网络的 构建与分析6603癌基因组遗传互作相关研究及耐药机制新发现3304基于ncRNA-ceRNA互作模式的研究药靶识别3305肿瘤耐药相关非编码RNA多态的系统识别3306利用非编码RNA预测药物敏感性在临床的前沿 应用3307基于多组学数据的复杂疾病风险通路识别与药物 筛选330合计24240119