生物化学-糖酵解、糖异生和戊糖磷酸途径.ppt
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1、糖酵解、糖异生和戊糖磷酸途径糖酵解、糖异生和戊糖磷酸途径 糖酵解糖酵解 糖酵解进入途径糖酵解进入途径 厌氧条件下的丙酮酸去路:发酵厌氧条件下的丙酮酸去路:发酵 糖异生糖异生 葡萄糖氧化的戊糖磷酸途径葡萄糖氧化的戊糖磷酸途径Glucose occupies a central position in metabolism:-relatively rich in potential energy(Go=-2,840 kJ/mol)-remarkably versatile precursor(eg.E.coli)LW-11=3C compoundMajor pathways of glucose
2、utilization(in plants&animals)P28-1部分自由能在糖酵部分自由能在糖酵解途径中以解途径中以ATP&NADH形式被保存形式被保存核糖核糖-5-磷酸磷酸丙酮酸丙酮酸R5P(+NADPH)Although not the only possible fates for Glc,these 3 pathways are the most significant in terms of the amount of Glc that flows through them in most cells.(cf.Fig.11-1)2 糖酵解糖酵解 Glycolysis 概述:糖酵
3、解分为两大阶段概述:糖酵解分为两大阶段 准备阶段消耗准备阶段消耗ATP 收益阶段获得收益阶段获得ATP和和NADH 糖酵解可以严格调控糖酵解可以严格调控(cf.courseware 12)(糖糖)酵解酵解 细胞质中通过一系列细胞质中通过一系列 酶促反应将葡萄糖最酶促反应将葡萄糖最 终降解为丙酮酸并伴终降解为丙酮酸并伴 有有ATP生成的全过程生成的全过程发酵发酵 无氧条件下无氧条件下由葡萄糖由葡萄糖 等降解而生成乳酸或等降解而生成乳酸或 乙醇乙醇(GlcPyr similar as in Glycolysis)LW-2Otto F.Meyerhof 1884-1951(shared 1922 N
4、P in Phys./Med.)(Embden-Meyerhof-Parnas Pathway)3G19.1 两阶段十步反应两阶段十步反应 -前五步准备前五步准备 -后五步收益后五步收益(oxidative/non-oxidative)三种重要转化类型三种重要转化类型 -Glc碳链降解产生碳链降解产生 丙酮酸丙酮酸(6C3C)-释能形成高能磷酸释能形成高能磷酸 化合物化合物(ADPATP)-电子电子/:H转移转移 (NAD+NADH)1.概述:糖酵解概述:糖酵解 可分为两大阶段可分为两大阶段(cf.Fig.11-2)414-2a The two phases of glycolysis己己糖糖
5、阶阶段段消耗消耗2 ATPContinue for 2nd phase514-2b丙糖阶段丙糖阶段生成生成4 ATP&2 NADH发酵发酵还包还包括在无氧括在无氧条件下由条件下由丙酮酸继丙酮酸继续反应并续反应并最终生成最终生成乳酸乳酸/乙醇乙醇等等6Overall equation for glycolysisGlc+2NAD+2ADP+2Pi 2 pyruvate+2NADH+2H+2ATP+2H2O 糖酵解的能量变化糖酵解的能量变化可分为可分为两段进程两段进程:-Glc+2NAD+2 pyruvate+2NADH+2H+G=-146 kJ/mol -2ADP+2Pi 2ATP+2H2O G
6、=(2 x 30.5)=61 kJ/mol Gtotal=-146+61=-85 kJ/mol 在在细胞内的实际细胞内的实际ATP,ADP,Pi,Glc和和pyruvate条条件下,件下,糖酵解糖酵解中释出的能量中释出的能量(with pyruvate as the end product)以以ATP形式形式储存的效率储存的效率 60%Note:Glc的大部分能量仍保存在丙酮酸中:的大部分能量仍保存在丙酮酸中:-Glc完完全氧化成全氧化成CO2&H2O:G=-2,840 kJ/mol -经经由糖酵解转化成由糖酵解转化成两两分子丙酮酸时分子丙酮酸时(G=-146 kJ/mol)仅释出其总能量的仅
7、释出其总能量的 5.2%P28-3细胞内条件细胞内条件下酵解过程下酵解过程基本不可逆基本不可逆7 Glc磷酸化成磷酸化成G6P -己己糖激酶糖激酶 -1stATP被消被消耗:耗:不可逆不可逆 -为为后续反应后续反应激活激活Glcp526-keeping some energy from ATPs breakdown-keeping Glc in cell-己糖激酶己糖激酶 IIII广泛分布广泛分布 于肝肾外所有组织中,于肝肾外所有组织中,KmGlc=0.1 mmol,专一性不强且为变构酶:专一性不强且为变构酶:G6P为其变构抑制剂为其变构抑制剂-Glc激酶激酶(glucokinase =hex
8、okinase IV)主要在肝细胞,主要在肝细胞,KmGlc=510 mmol,专一性很强,专一性很强 且不受且不受G6P抑制抑制-通常细胞内的通常细胞内的Glc 仅为仅为 4 mmol,故只有当,故只有当血糖血糖 很高时才能由很高时才能由Glc激酶在激酶在 肝脏活化肝脏活化Glc以合成糖原以合成糖原 (G6P G1P UDP-Glc)亲核攻击亲核攻击2.准备阶段消耗准备阶段消耗ATP(cf.p290)8G15.1 己糖激酶作用时会发生明显的构象变化己糖激酶作用时会发生明显的构象变化(诱导契合诱导契合):与与Glc的结合引发两个结构域相对转动的结合引发两个结构域相对转动17而靠近而靠近(8),
9、使被结合的,使被结合的Glc与待结合的与待结合的Mg2+-ATP更为接近,并相应阻断更为接近,并相应阻断H2O进入活性位点水解进入活性位点水解ATP-己糖激酶活性需要己糖激酶活性需要Mg2+:屏蔽屏蔽ATP磷酰基的负电荷磷酰基的负电荷 而使其末端而使其末端P更容易受到更容易受到 Glc等的等的OH亲核攻击亲核攻击(cf.Fig.11-3)9 G6P异构化为异构化为F6P -磷磷酸己糖异构酶酸己糖异构酶 =醛醛-酮糖酮糖可逆异构可逆异构反应反应 (需要以需要以开链形式开链形式进行进行)p526 C1羰基羰基与与C2羟基羟基的重排是的重排是 后两步反应进行的前提后两步反应进行的前提-磷酸化磷酸化需
10、要需要C1的羰基先转化的羰基先转化 成醇成醇(形成形成OH攻击攻击ATP磷酰基磷酰基)-C3C4的的断裂断裂则需要则需要C2位位 有一羰基有一羰基(利于负碳离子形成利于负碳离子形成)10吡喃葡糖开环吡喃葡糖开环C2的的H+移除促进移除促进顺顺-烯二醇中间物烯二醇中间物的形成的形成C2OH的的H+移除移除导致形成导致形成C=O双键双键呋喃果糖闭环呋喃果糖闭环G19.3 磷酸己糖异构酶反应机制磷酸己糖异构酶反应机制 (重排异构重排异构&E-碱性残基的交替广义酸碱性残基的交替广义酸-碱催化碱催化)酶活性位点酶活性位点碱性残基碱性残基-人的人的磷酸葡糖磷酸葡糖 异构酶异构酶对对G6P 高度专一,且高度
11、专一,且 活性需要活性需要Mg2+C1-OH可攻击可攻击ATP的磷酰基的磷酰基(cf.Fig.11-4)11p526 F6P磷酸化成磷酸化成F-1,6-BP -磷酸磷酸果糖激酶果糖激酶-1(PFK-1)-2ndATP被消被消耗:耗:不不可逆可逆&调调节点节点 PFK-1是变构酶,为酵解途径是变构酶,为酵解途径 调节的关键反应:调节的关键反应:细胞能荷低细胞能荷低 可激活,能荷高则抑制可激活,能荷高则抑制-ATP抑制而抑制而AMP解除抑制解除抑制-柠檬酸柠檬酸和和F-2,6-BP分别为分别为 变构抑制剂和激活剂变构抑制剂和激活剂1st调拨点调拨点F-1,6-BP只能只能进入酵解进入酵解亲核攻击亲
12、核攻击12 F-1,6-BP裂解成二羟丙酮磷酸和甘油醛裂解成二羟丙酮磷酸和甘油醛-3-P -醛缩酶醛缩酶 =可可逆羟逆羟-醛缩合反应醛缩合反应 -C3C4断断开开p527C3C4连键裂解连键裂解尽管尽管Go意味着反应意味着反应倾向于逆行,但由于倾向于逆行,但由于磷酸丙糖在后续反应磷酸丙糖在后续反应中不断被消耗而促使中不断被消耗而促使F-1,6-BP裂解裂解(DHAP)(G3P)1314-5class I aldolase reaction(animal&plant)中中C2羰羰基与基与E-Lys形形成带正电的亚成带正电的亚胺胺(-C=N-键键),以稳定以稳定C3C4断裂时暂时形断裂时暂时形成的
13、负碳离子成的负碳离子释出释出1st产物产物后形成烯胺后形成烯胺中间物中间物以以和和的的逆过程水解逆过程水解亚胺并释出亚胺并释出2nd产物产物自学自学1414-6磷酸丙糖互变异构磷酸丙糖互变异构 -丙糖磷酸异构酶丙糖磷酸异构酶 -只有只有G3P直直接进入酵解后续反应接进入酵解后续反应 -有效移除有效移除G3P可确保反应平衡可确保反应平衡 有有利于正向进行利于正向进行最复杂的功能团最复杂的功能团(羰基羰基)规定为规定为C1Review for 1st phase反应机制类似于反应机制类似于磷酸己糖异构酶磷酸己糖异构酶oxidizedreduced提高代谢效率提高代谢效率(cf.Fig.11-5)化
14、学意义化学意义无区分无区分15 G3P氧化生成氧化生成1,3-BPG以以:H形式移除形式移除并加载于并加载于NAD+以以H+形式游形式游离于溶液中离于溶液中-醛基氧化产生的自由能以醛基氧化产生的自由能以混合混合 酸酐酸酐(Go=-49.3 kJ/mol)形式形式 储存在储存在C1上,可以转移至上,可以转移至ADP 生成生成ATPp529G3P氧化氧化放能放能:G=-43 kJ/mol磷酸酐键形成磷酸酐键形成吸能吸能:G=49.3 kJ/mol-G3P脱脱氢酶氢酶(as homotetramer)-1st步步储能反应储能反应=醛醛脱氢成脱氢成 混合酸酐混合酸酐3.收益阶段产生收益阶段产生ATP和
15、和NADH(cf.p294)1614-7G3P dehydrogenase reaction硫半缩醛硫半缩醛硫酯硫酯SH对底物的亲核攻对底物的亲核攻击得到击得到His的广义酸的广义酸-碱催化促进碱催化促进必须取代必须取代NADH以避免酵解终止以避免酵解终止(:B)(cf.Fig.11-6)磷酸解磷酸解(as OH from H2O)(e sink)17-碘乙酸碘乙酸(烷化剂烷化剂)可抑制可抑制G3P脱氢酶:与酶活性脱氢酶:与酶活性部位的部位的Cys-SH形成共价衍生物而使酶失活形成共价衍生物而使酶失活(as DIPFP for Ser-OH)p536(3rd)H11.2(Box)-砷砷酸酸能替
16、代磷酸参与能替代磷酸参与 反应而生成反应而生成1-砷酸砷酸-3-磷酸甘油酸磷酸甘油酸,后者很,后者很 不稳定而迅速水解,不稳定而迅速水解,使使G3P的氧化与的氧化与ADP 的磷酸化解偶联的磷酸化解偶联 (潜在的致死反应潜在的致死反应)(as with heavy metal ions eg.Hg2+)18-磷酸磷酸甘油酸激酶甘油酸激酶 (以逆反应命名以逆反应命名)=1st步步底物水平磷酸化底物水平磷酸化底物分子的底物分子的高能磷酰基高能磷酰基直接转移直接转移到到ADP/GDP而生成而生成ATP/GTP,反应仅,反应仅涉及可溶性酶和化学中间物涉及可溶性酶和化学中间物 和和为能量偶联过程为能量偶联
17、过程 (共同中间物为共同中间物为1,3-BPG)-G3P(醛醛)氧化为氧化为3-PG(酸酸)-NAD+还原成还原成NADH -ADP磷酸化为磷酸化为ATP即:即:G3P+ADP+Pi+NAD+3-PG+ATP+NADH+H+Go=-12.2 kJ/molp531 磷酰基从磷酰基从1,3-BPG转移给转移给ADP3-PG19 3-磷酸甘油酸磷酸甘油酸(3-PG)转化成转化成2-磷酸甘油酸磷酸甘油酸(2-PG)-磷酸磷酸甘油酸变位酶甘油酸变位酶 =磷磷酰基在酰基在C3&C2 之间可逆换位之间可逆换位p531单磷酸甘油单磷酸甘油(酸酸)的标准水解自由能变化的标准水解自由能变化(Go)均不足以生成核苷
18、三磷酸均不足以生成核苷三磷酸2014-8phosphoglycerate mutase reaction(animal&yeast)-在大多数细胞中,在大多数细胞中,该酶该酶活性部位的活性部位的His 残基在反应前均需残基在反应前均需 先被少量先被少量2,3-BPG (引物引物)磷酸化磷酸化-红细胞红细胞的的2,3-BPG 高达高达5 mM,可调节,可调节 Hb对对O2的亲和性的亲和性-该酶在该酶在植物植物中无需中无需 2,3-BPG中继:由中继:由 3-PG直接将磷酰基直接将磷酰基 转移到酶上,后者转移到酶上,后者 再将其转回再将其转回C2生成生成 2-PG(cf.Fig.11-7)21 2
19、-PG脱水变位成磷酸烯醇式丙酮酸脱水变位成磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)-烯醇化酶烯醇化酶 -2-PG的的脱水脱水导导致致分子内能量分子内能量重新分布重新分布 2-PG和和PEP的磷酰基水解的磷酰基水解Go具具有很大差值:有很大差值:2-PG:-17.6 kJ/mol(glycerate,as for 3-PG)PEP:-61.9 kJ/mol足以在下步反应足以在下步反应中合成中合成ATPp532C2 oxidizedC3 reduced22Two-step reaction catalyzed by enolaseLys345碱催化移除碱催化移除H+烯醇化中间物由烯醇化中间物由Mg2+稳定稳定G
20、lu211酸催化促进移除酸催化促进移除OHF为烯醇化酶的强抑制剂:为烯醇化酶的强抑制剂:可在活性位点形成可在活性位点形成FPO32Mg2+复合物而使酶失活复合物而使酶失活6-2323 磷酰基从磷酰基从PEP转移给转移给ADP -丙酮酸丙酮酸激酶激酶 =2nd步步底底物水平磷酸化物水平磷酸化 -丙丙酮酸先形成酮酸先形成烯醇式烯醇式,随即快速,随即快速 互变异构成更为稳定的互变异构成更为稳定的酮式酮式 -不不可逆可逆 调节点调节点PEP磷酰基转移磷酰基转移放能放能:Go=-61.9 kJ/mol ATP生成生成吸能吸能:Go=30.5 kJ/mol非酶促异构非酶促异构 G=-41.8 kJ/mol
21、p53224mechanism for pyruvate kinase reaction(cf.Fig.11-8&Fig.11-9)25总总输入:输入:Glc+2ATP+2NAD+4ADP+2Pi总总输出:输出:2 pyruvate+2ADP+2NADH+2H+4ATP+2H2O总总反应:反应:Glc+2NAD+2ADP+2Pi 2 pyruvate+2NADH+2H+2ATP+2H2O-碳骨碳骨架转化:架转化:1 Glc 2 pyruvate-磷磷酰基转移:酰基转移:2 ADP+2Pi 2 ATP-e转移转移:4e(as 2:H)从从 2 G3P转移至转移至 2 NAD+净净ATP生成生成来
22、自来自-底物水平磷酸化底物水平磷酸化 (-NADH在在有氧条件下可经由呼吸链再氧化而获能有氧条件下可经由呼吸链再氧化而获能)P28-17 Pasteur effect:Glc消耗率消耗率/总量在无氧条件下均要总量在无氧条件下均要 明显高于有氧时的明显高于有氧时的(氧对发酵作用的抑制氧对发酵作用的抑制)(cf.p303)4.酵解反应总平衡有酵解反应总平衡有ATP净盈利净盈利 (cf.p298)26小结:糖酵解小结:糖酵解-糖酵解是一种广泛存在于生物界的糖酵解是一种广泛存在于生物界的Glc降解途径降解途径,可以将可以将Glc氧化成两分子丙酮酸,并将释出的能量氧化成两分子丙酮酸,并将释出的能量 储存
23、在储存在ATP和和NADH中中-10种酵解酶全都分布在种酵解酶全都分布在胞液中胞液中,所有中间物均为,所有中间物均为 3C/6C的磷酸盐化合物的磷酸盐化合物LW-327-准备阶段准备阶段消耗消耗 2 ATP将将 Glc转化成转化成F-1,6-BP,随后随后C3C4连键被断裂而连键被断裂而 生成两分子磷酸丙糖生成两分子磷酸丙糖-收益阶段收益阶段两分子两分子G3P于于C1 位氧化,释出的能量被储存位氧化,释出的能量被储存 在在 2 NADH和和 2 ATP中中-催化大而负标准自由能变化催化大而负标准自由能变化 的的三种激酶三种激酶可经由别构调节可经由别构调节 控制该途径的碳流量、保证控制该途径的碳
24、流量、保证 适宜的适宜的ATP供应以及维持各供应以及维持各 中间代谢物浓度的稳定中间代谢物浓度的稳定2814-9 糖糖酵酵解解进进入入途途径径海藻糖海藻糖Glc(11)乳糖乳糖半乳糖半乳糖蔗糖蔗糖甘露糖甘露糖-其他单糖其他单糖可通过若干位点可通过若干位点 进入糖酵解进入糖酵解-寡糖寡糖/二糖二糖被水解成单糖被水解成单糖-糖元糖元/淀粉淀粉主要主要经由磷酸解经由磷酸解肝肝脏脏糖糖元元/淀粉淀粉Amylase均为均为-糖苷酶糖苷酶-型型为为内切,内切,-型型为外切为外切(cf.p302)2914-10 糖元糖元/淀粉淀粉磷酸化酶磷酸化酶催化的磷酸解反应催化的磷酸解反应-催化催化Pi对连接对连接 非
25、还原端非还原端最后最后 两个两个Glc残基的残基的 (14)糖苷键糖苷键 进行亲核攻击进行亲核攻击-通过通过磷酸解磷酸解将将 糖苷键中的部分糖苷键中的部分 能量保存在能量保存在G1P 的的磷酸酯键磷酸酯键中中-磷酸化酶磷酸化酶可反复可反复 作用至接近某个作用至接近某个 (16)分支点分支点 而停止催化,再而停止催化,再 由由脱支酶脱支酶移除其移除其 分支分支(cf.Fig.14-10)(+PLP)C1+30Catabolic fates of pyruvate formed in glycolysis14-3 厌氧厌氧条件下的丙酮酸去路:条件下的丙酮酸去路:发酵发酵再生出继续酵解所再生出继续酵
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