生物化学课件-蛋白质.ppt
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1、第二章第二章蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能一、概述一、概述 二、蛋白质的基本组成单位二、蛋白质的基本组成单位氨基酸解氨基酸解)三、蛋白质的结构三、蛋白质的结构四、蛋白质结构与功能的关系四、蛋白质结构与功能的关系五、蛋白质的重要性质、分离纯化与鉴定五、蛋白质的重要性质、分离纯化与鉴定了解蛋白质的元素组成;掌握蛋白质的基本结构单位氨基酸的基本结构;了解氨基酸的分类;了解稀有氨基酸和非蛋白质氨基酸;掌握氨基酸的各种理化性质;掌握肽键、肽链和蛋白质一级结构的概念,同时了解蛋白质一级结构的表示方法;掌握二肽及多肽的形成过程;了解蛋白质一级结构的测定方法。思考题思考题 1.蛋白质分为哪些类型?各行使
2、何种功能?蛋白质分为哪些类型?各行使何种功能?2.自然界存在的氨基酸种类、结构、性质?自然界存在的氨基酸种类、结构、性质?3.肽键有何特点?对蛋白质构象的形成有何肽键有何特点?对蛋白质构象的形成有何影响?影响?4.何谓蛋白质的一、二、三、四级结构?维何谓蛋白质的一、二、三、四级结构?维系蛋白质构象的作用力有哪些?系蛋白质构象的作用力有哪些?5.何谓蛋白质的超二级结构和结构域?何谓蛋白质的超二级结构和结构域?6.试述蛋白质一级结构和高级结构与功能的试述蛋白质一级结构和高级结构与功能的关系。关系。7.何谓蛋白质的变性作用与复性作用?何谓蛋白质的变性作用与复性作用?一、概述一、概述(一)蛋白质的生物
3、学意义和元素组成(一)蛋白质的生物学意义和元素组成(二)蛋白质的分类(二)蛋白质的分类(一)蛋白质的生物学意义和元素组成(一)蛋白质的生物学意义和元素组成1.蛋白质的生物学意义蛋白质的生物学意义(1)蛋白质生物学功能的)蛋白质生物学功能的多样性多样性 酶酶的的催催化化功功能能、控控制制生生长长和和分分化化、代代谢谢调调节节功功能能、运运动动功功能能、运运输输作作用用、免免疫疫保保护护作作用用、接接受和传递信息、贮存营养功能、结构支持作用受和传递信息、贮存营养功能、结构支持作用。(2)蛋白质生物学功能的)蛋白质生物学功能的复杂性复杂性某某一一功功能能的的发发挥挥往往往往受受到到多多种种因因素素的
4、的影影响响与与调节。调节。2.蛋白质的元素组成蛋白质的元素组成一般含有:一般含有:碳碳(5055)、氮氮(1518)、)、氧氧(2023)、)、氢氢(68)、)、硫硫(04)。)。在某些蛋白质中,还含有一些在某些蛋白质中,还含有一些微量元素微量元素如:磷、铁、铜、钼、碘、锌等。如:磷、铁、铜、钼、碘、锌等。蛋白质元素组成的一个特点:蛋白质元素组成的一个特点:各种蛋白各种蛋白质的氮含量比较恒定,平均值为质的氮含量比较恒定,平均值为16左右左右。用用凯氏定氮法凯氏定氮法测定氮的含量,计算蛋白质测定氮的含量,计算蛋白质的含量(由氮的含量乘以的含量(由氮的含量乘以6.256.25)出来。)出来。(二)
5、蛋白质的分类(二)蛋白质的分类1.1.按蛋白质的构象分类按蛋白质的构象分类 2.2.按蛋白质的功能分类按蛋白质的功能分类 3.3.按蛋白质的组成和溶解性分类按蛋白质的组成和溶解性分类1.1.按蛋白质的构象分类按蛋白质的构象分类分为分为球状蛋白质球状蛋白质和和纤维状蛋白质纤维状蛋白质。球状蛋白质球状蛋白质(globular globular protein protein)血红蛋白、肌红血红蛋白、肌红蛋白等。蛋白等。纤维状蛋白质纤维状蛋白质(fibroue fibroue proteinprotein)胶原蛋白、弹性胶原蛋白、弹性蛋白、角蛋白、蛋白、角蛋白、丝心蛋白等。丝心蛋白等。催化蛋白(酶)
6、催化蛋白(酶)调节蛋白调节蛋白结构蛋白结构蛋白运输蛋白运输蛋白贮藏蛋白贮藏蛋白运动蛋白运动蛋白防御蛋白防御蛋白电子传递蛋白电子传递蛋白2.2.按蛋白质的功能分类按蛋白质的功能分类3.3.按蛋白质的组成和溶解性分类按蛋白质的组成和溶解性分类单纯蛋白质单纯蛋白质(simple proteinsimple protein)结合蛋白质结合蛋白质(complex proteincomplex protein)二、蛋白质的基本组成单位二、蛋白质的基本组成单位氨基酸氨基酸(一)氨基酸的结构(一)氨基酸的结构(二)氨基酸的分类(二)氨基酸的分类(三)氨基酸的性质(三)氨基酸的性质(一)(一)氨基酸的结构氨基酸
7、的结构蛋白质的基本结构单位蛋白质的基本结构单位-氨基酸的结构通式氨基酸的结构通式侧链侧链脯氨酸脯氨酸亚氨基亚氨基(二)氨基酸的分类(二)氨基酸的分类1 1.编码氨基酸编码氨基酸 2.2.非编码氨基酸非编码氨基酸 3.3.非蛋白质氨基酸非蛋白质氨基酸 氨基酸名称符号R 基化学结构等电点分类H3CH3CAla(alanine)CHCH3H3CCHCH3CH2H3CCHCH3CH2H3CCH2NCH2CH2CH2SCH2H2CH2CCHNCOOHH缬氨酸缬氨酸亮氨酸亮氨酸苯丙氨酸苯丙氨酸色氨酸色氨酸蛋氨酸蛋氨酸脯氨酸脯氨酸ValProTrpMetLeuIlePhe异亮氨酸异亮氨酸(valine)(l
8、eucine)(phenylalanine)(tryptophan)(methionine)(proline)(isoleucine)6.025.975.986.025.485.895.756.30非非极极性性氨氨基基酸酸(8种)种)丙氨酸丙氨酸1.1.编码氨基酸编码氨基酸第21种氨基酸硒代半胱氨酸2.2.非编码氨基酸非编码氨基酸没有相应的三联体遗传密码。没有相应的三联体遗传密码。由由编码氨基酸编码氨基酸经羟基化、甲基化、磷酸经羟基化、甲基化、磷酸化等修饰形成的衍生物。化等修饰形成的衍生物。例如:胶原蛋白和弹性蛋白中的例如:胶原蛋白和弹性蛋白中的4-羟脯氨酸羟脯氨酸、5-羟赖氨酸等羟赖氨酸等。
9、3.3.非蛋白质氨基酸非蛋白质氨基酸 在在生生物物体体内内,还还发发现现150150多多种种不不参参与与蛋蛋白质组成的氨基酸。白质组成的氨基酸。这这些些非非蛋蛋白白质质氨氨基基酸酸多多是是重重要要的的代代谢谢物前体或代谢中间产物物前体或代谢中间产物。1.1.氨基酸的两性解离及等电点氨基酸的两性解离及等电点 氨基酸是氨基酸是两性电解质两性电解质(ampholyteampholyte)CHCOOHRNH2(三)氨基酸的性质(三)氨基酸的性质氨基酸两性解离氨基酸两性解离RCOOHCHNH2RCOOCHNH3+-中性分子形式中性分子形式 两性离子形式两性离子形式RCOOHCHNH3RCOO-CHNH3
10、+RCOO-CHNH2+OH-H+对某种氨基酸来讲,当溶液在某一对某种氨基酸来讲,当溶液在某一特定的特定的 pH pH 时,氨基酸所带净电荷为时,氨基酸所带净电荷为零(即正电荷数与负电荷数相等)零(即正电荷数与负电荷数相等),在电场中,既不向正极移动,也不,在电场中,既不向正极移动,也不向负极移动。这时,溶液的向负极移动。这时,溶液的pH pH 称为称为该氨基酸的等电点该氨基酸的等电点(isoelectric(isoelectric point)point),用,用pIpI表示。表示。两性解离物质所带静电荷为零时溶液的两性解离物质所带静电荷为零时溶液的pHpH。氨基酸的等电点氨基酸的等电点 (
11、1 1)不同氨基酸,由于)不同氨基酸,由于R R 基团结构的基团结构的不同,有不同的等电点。在一定实验条不同,有不同的等电点。在一定实验条件下,等电点是件下,等电点是氨基酸的特征常数氨基酸的特征常数。(2 2)当氨基酸处于等电点状态时,其)当氨基酸处于等电点状态时,其溶解度最小溶解度最小,容易发生沉淀。,容易发生沉淀。利用这一特性,可以从各种氨基酸的利用这一特性,可以从各种氨基酸的混合物溶液中,分离制取某种氨基酸混合物溶液中,分离制取某种氨基酸。氨基酸等电点的作用氨基酸等电点的作用 (1 1)氨基酸的构型)氨基酸的构型 除除甘甘氨氨酸酸以以外外,其其余余 20 20 种种氨氨基基酸酸的的 CC
12、都是不对称碳原子(手性)。都是不对称碳原子(手性)。2.2.氨基酸的光学活性与吸收光谱氨基酸的光学活性与吸收光谱甘氨酸的结构式甘氨酸的结构式参与蛋白质组成的氨基酸在参与蛋白质组成的氨基酸在可见光区都没可见光区都没有光吸收有光吸收;在在紫外光区紫外光区只只有色氨酸、酪氨酸有色氨酸、酪氨酸和和苯丙氨苯丙氨酸酸有吸收光的能力。其最大吸收波长有吸收光的能力。其最大吸收波长()分别为分别为280280nmnm、275275nmnm、257257nmnm;是是利用紫外分光光度计,利用紫外分光光度计,在在280280nmnm波长处,波长处,测定蛋白质浓度的基础。测定蛋白质浓度的基础。(2 2)吸收光谱)吸收
13、光谱三、蛋白质的结构三、蛋白质的结构(一)蛋白质的一级结构(一)蛋白质的一级结构(二)蛋白质的三维结构(二)蛋白质的三维结构 蛋白质结构层次蛋白质结构层次 一级结构(一级结构(primary structureprimary structure););二级结构(二级结构(secondary structuresecondary structure););超二级结构(超二级结构(supersecondary supersecondary structure structure););结构域(结构域(structural domainstructural domain););三级结构(三级结构(t
14、ertiary structuretertiary structure););四级结构(四级结构(quarternary structurequarternary structure)蛋白质结构层次蛋白质结构层次 (一)蛋白质的一级结构(一)蛋白质的一级结构概念:概念:多肽链上各种多肽链上各种氨基酸残基氨基酸残基的排列的排列顺序,即氨基酸序列称为蛋白质的一级顺序,即氨基酸序列称为蛋白质的一级结构(结构(primary structureprimary structure)。)。(51Aa,5733 u)1.1.肽和肽键肽和肽键 肽肽 由由氨基酸构成的线形聚合物氨基酸构成的线形聚合物称为肽称为肽
15、(peptidepeptide)。)。二个氨基酸分子缩合二个氨基酸分子缩合而成的肽,称为二肽(而成的肽,称为二肽(dipeptidedipeptide)。NHCOCNHCOCOHHHR1R2H肽键肽键(peptide bonepeptide bone)多肽链多肽链(polypeptide chainpolypeptide chain)肽键氮氧原子共振产生:肽键氮氧原子共振产生:(1 1)部分双键性质;(部分双键性质;(2 2)多肽主链酰)多肽主链酰胺平面;(胺平面;(3 3)CC处于顺式或反处于顺式或反式构型;(式构型;(4 4)二面角;()二面角;(5 5)偶)偶极性(极性(N N末端,末端
16、,C C末端)末端)。氨基酸残基氨基酸残基(amino acid residueamino acid residue)HOH蛋白质一级结构的表示法蛋白质一级结构的表示法肽键肽键H2NCOHCH3SCOOHNHCCOHNHCCOHNHCCOHNHCHHCH2CHCH2OHCH2CH2中文氨基酸残基命名法:中文氨基酸残基命名法:酪氨酰甘氨酰甘氨酰苯丙酪氨酰甘氨酰甘氨酰苯丙 氨酰甲硫氨酸氨酰甲硫氨酸三字母符号表示法三字母符号表示法:TyrGlyGlyPheMetTyrGlyGlyPheMet单字母单字母符号表示法符号表示法:YGGFMYGGFM 谷胱甘肽谷胱甘肽 脑啡肽(脑啡肽(5 5肽肽)短杆菌肽
17、短杆菌肽S S(1010肽肽)肽类激素肽类激素3.天然活性肽天然活性肽(二)蛋白质的三维结构(二)蛋白质的三维结构 蛋白蛋白 质的三维结构质的三维结构指的是指的是蛋白质分子蛋白质分子中全部原子和基团相互间的立体关系,中全部原子和基团相互间的立体关系,包括全部原子和基团的排列、分布及肽包括全部原子和基团的排列、分布及肽链的走向。链的走向。又称为蛋白质的高级结构、又称为蛋白质的高级结构、空间结构或构象,可分为空间结构或构象,可分为二级二级、超二级超二级、结构域结构域、三级三级和和四级结构四级结构。1 1.蛋白质的二级结构蛋白质的二级结构2.2.蛋白质的超二级结构和结构域蛋白质的超二级结构和结构域3
18、.3.蛋白质的三级结构蛋白质的三级结构4 4.蛋白质的四级结构蛋白质的四级结构5 5.稳定蛋白质构象的作用力稳定蛋白质构象的作用力蛋白质结构层次蛋白质结构层次 1.1.基本知识基本知识 (1 1)构型与构象)构型与构象 构型(构型(configurationconfiguration)构象(构象(conformationconformation)19691969年,年,IUPACIUPAC (2 2)蛋白质的立体结构原理蛋白质的立体结构原理 肽单位与二面角肽单位与二面角 将多肽链的基本结构中,将多肽链的基本结构中,-C C-CO-NH-C-CO-NH-C-这一主链骨架的重复单位叫这一主链骨架的
19、重复单位叫肽单位肽单位(PaulingPauling和和CoreyCorey在在19511951年根据年根据X-X-射线衍射结果,提出射线衍射结果,提出蛋白质蛋白质肽单位平面原则肽单位平面原则 3 3)。肽单位平面结构肽单位平面结构NHCOCNHCOC OHHHR1R2H肽单位立体结构肽单位立体结构二面角(二面角(dihedral angledihedral angle)肽平面肽平面1 1 围绕围绕 CC2 2NN1 1 单键旋转,单键旋转,其旋转的角度用其旋转的角度用表示;表示;肽平面肽平面2 2 也可也可以围绕以围绕 CC2 2CC2 2 单键旋转,其旋转单键旋转,其旋转的角度用的角度用表
20、示。表示。(右为正右为正,左为负左为负)N1C 2C2 多肽链主链骨架的构象是由每个多肽链主链骨架的构象是由每个C C的成对的成对二面角二面角(,)所决定的。所决定的。非键合原子间的最小接触距离非键合原子间的最小接触距离 在相邻的两个肽单位的构象中,非键合原在相邻的两个肽单位的构象中,非键合原子间的接近有无障碍,是否符合子间的接近有无障碍,是否符合标准接触距标准接触距离离,即能量是否达到最低即能量是否达到最低,也是肽链构象能也是肽链构象能否稳定存在的重要否稳定存在的重要立体化学原则立体化学原则。2.二级结构二级结构 概概 念念 指指多多肽肽链链主主链链在在一一级级结结构构的的基基础础上上,某某
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- 生物化学 课件 蛋白质
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