进化的机制优秀课件.ppt
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1、进化的机制第1页,本讲稿共66页1 1 什么是分子进化什么是分子进化2 2 生物大分子与生物进化生物大分子与生物进化3 3分子进化的机制分子进化的机制第一节第一节 分子进化分子进化第2页,本讲稿共66页一、分子进化一、分子进化(molecular evolutionmolecular evolution)现全世界分子生物学文章中有现全世界分子生物学文章中有1/31/3以上涉及到生物进化的内容。以上涉及到生物进化的内容。1.1.分子进化的一般概念分子进化的一般概念原始生命产生之前,生命起源的化学演化;原始生命产生之前,生命起源的化学演化;原始生命产生之后,生物在进化过程中,原始生命产生之后,生物
2、在进化过程中,生物大分子结构和功能的变化生物大分子结构和功能的变化以及以及这些变化与生物进化的关系这些变化与生物进化的关系。是进化论与分子生物学相互交融。是进化论与分子生物学相互交融形成的边缘学科,是达尔文进化论在分子水平上的延伸。形成的边缘学科,是达尔文进化论在分子水平上的延伸。主要研究对象是主要研究对象是蛋白质蛋白质和和核酸核酸等生物大分子。等生物大分子。第3页,本讲稿共66页2.2.分子进化的产生与发展分子进化的产生与发展蛋白质阶段:蛋白质阶段:20世纪世纪60年代,年代,蛋白质序列分析蛋白质序列分析和和电泳技术电泳技术的发展,的发展,对不同生物的蛋白质结构进行比较,对不同生物的蛋白质结
3、构进行比较,分析它们间的差别分析它们间的差别。基因阶段:基因阶段:20世纪世纪80年代后,分子生物学发展,限制性片段长度多年代后,分子生物学发展,限制性片段长度多态性(态性(RFLP)分析及)分析及PCR技术出现,技术出现,对基因中的对基因中的DNA序列进行比较序列进行比较分析,找出它们的差异,分析,找出它们的差异,以探究不同物种在进化上的联系。以探究不同物种在进化上的联系。第4页,本讲稿共66页 意义:意义:分子进化为进化论研究注入了新的活力,使生物进化论实现分子进化为进化论研究注入了新的活力,使生物进化论实现了宏观和微观水平上的统一。了宏观和微观水平上的统一。通过定量比较各类生物有关生物大
4、分子结构和功能的异同,借以通过定量比较各类生物有关生物大分子结构和功能的异同,借以探讨各类生物间的亲缘关系和生物进化在分子层面上的机制。探讨各类生物间的亲缘关系和生物进化在分子层面上的机制。有望解有望解决系统发育或分类学中某些长期未解决的问题,有助于揭示新的进化决系统发育或分类学中某些长期未解决的问题,有助于揭示新的进化途径。途径。第5页,本讲稿共66页3 分子进化的研究方法分子进化的研究方法 分子技术具有简便、快捷、精确等优点,特别是种系发分子技术具有简便、快捷、精确等优点,特别是种系发生、进化年代、发育在进化中的作用等。生、进化年代、发育在进化中的作用等。蛋白质氨基酸序列的测定;蛋白质氨基
5、酸序列的测定;比较比较同源蛋白质中氨基酸序列的差异同源蛋白质中氨基酸序列的差异,可获得分子进化方面的资料。第一可获得分子进化方面的资料。第一个被阐明氨基酸序列的蛋白质是胰岛素,由个被阐明氨基酸序列的蛋白质是胰岛素,由5151个氨基酸组成。个氨基酸组成。核酸中核苷酸序列的测定;核酸中核苷酸序列的测定;比较比较核酸中核苷酸序列的异同核酸中核苷酸序列的异同,是当前研究分子进化的重点。,是当前研究分子进化的重点。第6页,本讲稿共66页蛋白质电泳分析;蛋白质电泳分析;纸上电泳;醋酸纤维电泳;纸上电泳;醋酸纤维电泳;聚丙烯酰胺电泳聚丙烯酰胺电泳 蛋白质分子为两性电介质,其化学结构的改变能产生电荷变化,蛋白
6、质分子为两性电介质,其化学结构的改变能产生电荷变化,电场作用下,不同蛋白质呈现不同迁移率。根据电场作用下,不同蛋白质呈现不同迁移率。根据特定蛋白质的特定蛋白质的电泳相似率电泳相似率可算出遗传距离。可算出遗传距离。分子杂交技术;分子杂交技术;确定单链核酸碱基序列的技术。原理是待测单链核酸与已知序列的单确定单链核酸碱基序列的技术。原理是待测单链核酸与已知序列的单链核酸(探针)间通过碱基配对形成可检出的双螺旋片段。链核酸(探针)间通过碱基配对形成可检出的双螺旋片段。原位杂交、原位杂交、SouthernSouthern杂交(杂交(DNADNA印迹转移杂交技术)、印迹转移杂交技术)、NorthernNo
7、rthern杂交杂交(RNARNA印迹转移杂交技术)印迹转移杂交技术)第7页,本讲稿共66页 限制性片段长度多态性分析(限制性片段长度多态性分析(RFLPRFLP););用于研究生物个体间用于研究生物个体间DNADNA结构的差异的分子生物学方法;结构的差异的分子生物学方法;原理:原理:限制性核酸内切酶识别、切开限制性核酸内切酶识别、切开DNADNA分子上特定的核苷酸序列,分子上特定的核苷酸序列,对对DNADNA分子酶促降解,形成不同长度的分子酶促降解,形成不同长度的DNADNA片段。经电泳分离,将其片段。经电泳分离,将其转移、固定到一载体(如硝酸纤维薄膜),以同位素标记的多核转移、固定到一载体
8、(如硝酸纤维薄膜),以同位素标记的多核苷探针与膜上苷探针与膜上DNADNA片段杂交结合,并通过放射自显影方法将杂交片段以片段杂交结合,并通过放射自显影方法将杂交片段以条带的形式显示出来,即可获得反映条带的形式显示出来,即可获得反映DNADNA多态性的酶切图谱。多态性的酶切图谱。利用此方法可准确鉴别个体或品种之间的亲缘关系。利用此方法可准确鉴别个体或品种之间的亲缘关系。第8页,本讲稿共66页 多聚酶链式反应(多聚酶链式反应(PCRPCR)技术)技术体外模拟体外模拟DNADNA复制过程的核酸扩增技术(无细胞分子克隆技术)复制过程的核酸扩增技术(无细胞分子克隆技术)原理:原理:以待扩增的两条以待扩增
9、的两条DNADNA链为模板,由一个人工合成的寡聚链为模板,由一个人工合成的寡聚核苷酸为引物,通过核苷酸为引物,通过DNADNA聚合酶的酶促反应,在体外快速扩聚合酶的酶促反应,在体外快速扩增特异增特异DNADNA序列。序列。DNADNA每扩增一次包括:每扩增一次包括:变性、复性、延伸变性、复性、延伸3 3个步骤。个步骤。特点:特点:简单、快速、特异、灵敏。被认为简单、快速、特异、灵敏。被认为2020世纪分子生物学最重世纪分子生物学最重要的发明之一。要的发明之一。PCR技术广泛应用于古今生物的线粒体技术广泛应用于古今生物的线粒体DNA、核、核DNA、叶绿体、叶绿体DNA等大分等大分子。子。可分离出
10、古可分离出古DNADNA并进行序列分析,恢复部分基因结构的分子信息。并进行序列分析,恢复部分基因结构的分子信息。第9页,本讲稿共66页二、生物大分子与生物进化二、生物大分子与生物进化 生物进化过程中生物大分子的演变现象主要包括:生物进化过程中生物大分子的演变现象主要包括:核酸的进化核酸的进化 DNADNA含量:含量:基因组大小:基因组大小:核酸序列的变化:核酸序列的变化:蛋白质分子的演变蛋白质分子的演变不同物种中同一蛋白质结构的比较不同物种中同一蛋白质结构的比较 同一物种不同蛋白质结构的比较同一物种不同蛋白质结构的比较第10页,本讲稿共66页1 1 核酸的进化核酸的进化DNADNA含量:含量:
11、不同生物细胞内不同生物细胞内DNADNA含量(含量(C C值表示)差别很大,值表示)差别很大,在整个生物进化过程中,从低在整个生物进化过程中,从低等到高等等到高等总趋势总趋势是是C C值逐渐增值逐渐增大。大。但是但是DNADNA含量不一定总含量不一定总是跟生物复杂程度成正比。是跟生物复杂程度成正比。有些生物的有些生物的C C值很大,但在进值很大,但在进化上不一定更高等。化上不一定更高等。第11页,本讲稿共66页基因组大小:基因组大小:不同生物基因组大小不同。在生物进化不同生物基因组大小不同。在生物进化过程中,总趋势是高等生物的基因组比低等生物的大,所过程中,总趋势是高等生物的基因组比低等生物的
12、大,所含基因也更多。含基因也更多。真核生物基因组一般比原核生物大,变化范围也很大,但真核生物基因组一般比原核生物大,变化范围也很大,但所含基因数量却相差不大。因此,所含基因数量却相差不大。因此,真核生物基因组大小的变真核生物基因组大小的变化主要是由非编码的化主要是由非编码的DNADNA含量变化引起的。含量变化引起的。分子中的非编码部分对基因组的扩大有一定的作用,在进化分子中的非编码部分对基因组的扩大有一定的作用,在进化过程中有可能获得新的功能,形成新的基因。过程中有可能获得新的功能,形成新的基因。第12页,本讲稿共66页核酸序列的变化:核酸序列的变化:核酸序列核酸序列是是4 4种核苷酸按不同排
13、列顺序组合而成。在种核苷酸按不同排列顺序组合而成。在DNADNA分子序列中有两分子序列中有两种性质的序列组成:单拷贝序列(结构基因组成部分);多拷贝序种性质的序列组成:单拷贝序列(结构基因组成部分);多拷贝序列(调节基因)。列(调节基因)。核酸序列的变化核酸序列的变化主要是生物进化过程中由核苷酸碱基的替换、插入和主要是生物进化过程中由核苷酸碱基的替换、插入和缺失造成的。对同源基因,生物间亲缘关系越近,序列差异越小,相反则缺失造成的。对同源基因,生物间亲缘关系越近,序列差异越小,相反则差异越大。差异越大。不同生物中,核酸序列的差异能反映它们间亲缘关系的远近。不同生物中,核酸序列的差异能反映它们间
14、亲缘关系的远近。核酸序列包括:核酸序列包括:编码区:编码区:每每3 3个相联的核苷酸构成个相联的核苷酸构成1 1个三联体遗传密码,编码一个氨基酸个三联体遗传密码,编码一个氨基酸 。非编码区:非编码区:包括基因两端的包括基因两端的间隔序列间隔序列和和内含子内含子第13页,本讲稿共66页2 蛋白质分子的演变蛋白质分子的演变不同物种中同一蛋白质结构的比较(如细胞色素不同物种中同一蛋白质结构的比较(如细胞色素c)不同生物,同种蛋白质氨基酸序列差异越小,它们的亲缘关系不同生物,同种蛋白质氨基酸序列差异越小,它们的亲缘关系越近;差异越大,亲缘关系越远。越近;差异越大,亲缘关系越远。如,如,人与黑猩猩的细胞
15、色素人与黑猩猩的细胞色素c c的氨基酸序列完全相同,而与罗猴的氨基酸序列完全相同,而与罗猴的差异为的差异为1 1,与马差异为,与马差异为1212等等第14页,本讲稿共66页第15页,本讲稿共66页同一物种不同蛋白质结构的比较同一物种不同蛋白质结构的比较通过比较种内不同蛋白质的结构,测出氨基酸序列,能发现通过比较种内不同蛋白质的结构,测出氨基酸序列,能发现许多由相似氨基酸分子组成的蛋白质,并由此追溯它们在许多由相似氨基酸分子组成的蛋白质,并由此追溯它们在历史上的联系。历史上的联系。如血红蛋白和肌红蛋白在结构上有明显相似性,这与二者如血红蛋白和肌红蛋白在结构上有明显相似性,这与二者功能类似、来源相
16、同密切相关功能类似、来源相同密切相关第16页,本讲稿共66页3.3.生物大分子进化的特点生物大分子进化的特点生物大分子进化速率相对恒定生物大分子进化速率相对恒定 生物大分子进化过程中一定数量氨基酸或核苷酸的生物大分子进化过程中一定数量氨基酸或核苷酸的替换所需的时间为替换所需的时间为分子进化速率分子进化速率。分子进化速率取决于分子进化速率取决于蛋白质或核酸等大分子中的氨蛋白质或核酸等大分子中的氨基酸或核苷酸在一定时间内的替换率基酸或核苷酸在一定时间内的替换率。研究发现,。研究发现,特定特定蛋白质的氨基酸替换速度是基本恒定的蛋白质的氨基酸替换速度是基本恒定的。所以,。所以,每一种每一种大分子在不同
17、生物中的进化速度都是一样的。大分子在不同生物中的进化速度都是一样的。第17页,本讲稿共66页生物大分子进化保守性生物大分子进化保守性 保守性,保守性,是指功能上重要的大分子在进化速率上明是指功能上重要的大分子在进化速率上明显低于功能上相对不重要的大分子。显低于功能上相对不重要的大分子。同一蛋白质分子不同部位的氨基酸在结构和功能上的重要同一蛋白质分子不同部位的氨基酸在结构和功能上的重要性不同。任何蛋白质,对维持它的功能极其重要的那些氨基性不同。任何蛋白质,对维持它的功能极其重要的那些氨基酸比较保守,不能轻易发生变化。酸比较保守,不能轻易发生变化。第18页,本讲稿共66页三、分子进化的机制三、分子
18、进化的机制 DNA是细胞内最重要的遗传物质,生物性状的变异通过基因突变造成,是细胞内最重要的遗传物质,生物性状的变异通过基因突变造成,基因突变基因突变是生物进化第一原因。是生物进化第一原因。点突变与调节突变点突变与调节突变 点突变指点突变指DNA分子中单个核苷酸碱基的变化,影响蛋白质氨基酸分子中单个核苷酸碱基的变化,影响蛋白质氨基酸序列变化,从而引发生物性状改变。序列变化,从而引发生物性状改变。4种基本变化类型:种基本变化类型:替代替代:一个核苷酸碱基被另一个不同核苷酸碱基所替代;:一个核苷酸碱基被另一个不同核苷酸碱基所替代;缺失缺失:核苷酸从序列中缺失;:核苷酸从序列中缺失;插入插入:在序列
19、中插入新核苷酸;:在序列中插入新核苷酸;倒位倒位:核苷酸在序列中位置发生颠倒。:核苷酸在序列中位置发生颠倒。点突变影响蛋白质氨基酸序列,引发生物性状的改变。点突变影响蛋白质氨基酸序列,引发生物性状的改变。第19页,本讲稿共66页 调节突变:调节突变:是指某一基因内部或其附近决定该基因活化是指某一基因内部或其附近决定该基因活化与否的部位变化。以影响发育过程中某些特定基因的开启与否的部位变化。以影响发育过程中某些特定基因的开启和关闭。和关闭。如反刍动物胃内含有高浓度的溶菌酶,其它动物溶菌酶浓度很低,如反刍动物胃内含有高浓度的溶菌酶,其它动物溶菌酶浓度很低,引起这种酶含量的差别原因在于调节突变,而不
20、是结构突变。引起这种酶含量的差别原因在于调节突变,而不是结构突变。研究表明,分子进化和机体进化之间的联系很可能是通过调节突变研究表明,分子进化和机体进化之间的联系很可能是通过调节突变建立起来的;调节突变在适应变化中可能起着主要作用。建立起来的;调节突变在适应变化中可能起着主要作用。第20页,本讲稿共66页中性突变与随机漂变中性突变与随机漂变 中性学说认为分子进化不同于生物的表型进化,它是通中性学说认为分子进化不同于生物的表型进化,它是通过选择呈中性的突变型和随机遗传漂变造成的。过选择呈中性的突变型和随机遗传漂变造成的。中性突变是一种不影响蛋白质功能的突变。在分子水平上突变类型是以中性突变是一种
21、不影响蛋白质功能的突变。在分子水平上突变类型是以对机体影响不好不坏的中性突变为主。对机体影响不好不坏的中性突变为主。随机遗传漂变随机遗传漂变是指等位基因的频率随机变化的过程。这是指等位基因的频率随机变化的过程。这一过程最终导致等位基因固定或丢失。一过程最终导致等位基因固定或丢失。随机遗传漂变随机遗传漂变在有限小群体中都会发生,群体越小,该过程在有限小群体中都会发生,群体越小,该过程就越快。就越快。第21页,本讲稿共66页第第2 2节节 小进化(遗传变异与自然选择)小进化(遗传变异与自然选择)1 1 小进化小进化2 2 遗传变异与自然选择遗传变异与自然选择3 3 随机过程与适应随机过程与适应第2
22、2页,本讲稿共66页 小进化小进化 (一一)种内进化种内进化 1.1.小进化的概念及基本单位小进化的概念及基本单位 概念概念:小进:小进化化(microevolution)又又称微观进化,指物种以下称微观进化,指物种以下层次上的进化。是短时间内的进化改变,最终可导致物种层次上的进化。是短时间内的进化改变,最终可导致物种形成。形成。一个个体如果在遗传上发生有利变异,相关基因一个个体如果在遗传上发生有利变异,相关基因在群体逐渐扩散在群体逐渐扩散,取代原有的基因,这样新生物类型才能形成。取代原有的基因,这样新生物类型才能形成。无性繁殖、有性繁殖,个体都不是进化单位无性繁殖、有性繁殖,个体都不是进化单
23、位。第23页,本讲稿共66页2.2.小进化的基本单位小进化的基本单位 对于对于无性生殖的生物无性生殖的生物,同一克隆的个体之间无遗传差异,同一克隆的个体之间无遗传差异(假设不发生突变),不同克隆之间才存在差异。所以无性(假设不发生突变),不同克隆之间才存在差异。所以无性繁殖生物的进化单位是繁殖生物的进化单位是无性繁殖系。无性繁殖系。对于对于有性生殖的生物有性生殖的生物,一个个体的基因型不能世代相传,一个个体的基因型不能世代相传,但但种群种群的基因总和在一定条件下却相对恒定。的基因总和在一定条件下却相对恒定。一个一个种群种群在一定时间内,其成员全部基因的总和就是该种在一定时间内,其成员全部基因的
24、总和就是该种群的基群的基因库(因库(gene pool)。)。第24页,本讲稿共66页3.3.遗传变异在种群中的产生遗传变异在种群中的产生变异:变异:同种生物世代之间或同代不同个体间的差异。同种生物世代之间或同代不同个体间的差异。遗传变异:遗传变异:由于遗传物质的变化(如由于遗传物质的变化(如基因突变、染色体畸变、基因重组基因突变、染色体畸变、基因重组等)等)所造成的变异,一般是可遗传的,称为遗传变异。所造成的变异,一般是可遗传的,称为遗传变异。基因突变(点突变):基因突变(点突变):核酸上仅有一个核苷酸改变的突变,尤其核酸上仅有一个核苷酸改变的突变,尤其是编码蛋白质的基因发生突变。发生突变的
25、个体称为突变体。是编码蛋白质的基因发生突变。发生突变的个体称为突变体。突变突变自发突变:自发突变:自然发生的突变,如自然发生的突变,如DNA复制过程中偶尔发生的差错复制过程中偶尔发生的差错诱发突变:诱发突变:指人工诱发下的变异指人工诱发下的变异(物理诱变、化学诱变和生物诱变物理诱变、化学诱变和生物诱变)太空椒、太空番茄、辐照花卉,太空白莲,太空大豆太空椒、太空番茄、辐照花卉,太空白莲,太空大豆“黑农五号黑农五号”第25页,本讲稿共66页点突变引起的表型变化点突变引起的表型变化镰刀形红细胞贫血症:(镰刀形红细胞贫血症:(Sickle Cell Anemia)隐性基因遗传病。患病者的血液红细胞表现
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