现代分子生物学(第4版)课后思考题答案.doc
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1、-_第一章第一章绪论绪论1染色体具有哪些作为遗传物质的特征?染色体具有哪些作为遗传物质的特征?答:分子结构相对稳定; 能够自我复制,使亲子代之间保持连续性;能够指导蛋白质的合成,从而控制整个生命过程; 能够产生可遗传的变异。2.什么是核小体?简述其形成过程。什么是核小体?简述其形成过程。答:由 DNA 和组蛋白组成的染色质纤维细丝是许多核小体连成的念珠状结构。核小体是由 H2A,H2B,H3,H4 各两个 分子生成的八聚体和由大约 200bp 的 DNA 组成的。八聚体在中间,DNA 分子盘绕在外,而 H1 则在核小体外面核小体的形成是染色体中 DNA 压缩的第一阶段。在核小体中 DNA 盘绕
2、组蛋白八聚体核心,从而使分子收缩至原尺 寸的 1/7。200bpDNA 完全舒展时长约 68nm,却被压缩在 10nm 的核小体中。核小体只是 DNA 压缩的第一步。核小体长链 200bp核酸酶初步处理核小体单体 200bp核酸酶继续处理核心颗粒 146bp3 简述真核生物染色体的组成及组装过程简述真核生物染色体的组成及组装过程答:组成:蛋白质+核酸。组装过程:1,首先组蛋白组成盘装八聚体,DNA 缠绕其上,成为核小体颗粒,两个颗粒之间经过 DNA 连接,形 成外径 10nm 的纤维状串珠,称为核小体串珠纤维;2,核小体串珠纤维在酶的作用下形成每圈 6 个核小体,外径 30nm 的螺线管结构;
3、3,螺线管结构再次螺旋化,形成超螺旋结构;4,超螺线管,形成绊环,即线性的螺线管形 成的放射状环。绊环在非组蛋白上缠绕即形成了显微镜下可见的染色体结构。4. 简述简述 DNA 的一的一,二二,三级结构的特征三级结构的特征答:DNA 一级结构:4 种核苷酸的的连接及排列顺序,表示了该 DNA 分子的化学结构DNA 二级结构:指两条多核苷酸链反向平行盘绕所生成的双螺旋结构DNA 三级结构:指 DNA 双螺旋进一步扭曲盘绕所形成的特定空间结构6 简述简述 DNA 双螺旋结构及其在现代分子生物学发展中的意义双螺旋结构及其在现代分子生物学发展中的意义(1)DNA 双螺旋是由两条互相平行的脱氧核苷酸长链盘
4、绕而成的,多核苷酸的方向由核苷酸间的磷酸二酯键的走向决 定,一条是 5-3,另一条是 3-5。 (2)DNA 双螺旋中脱氧核糖和磷酸交替连接,排在外侧,构成基本骨架,碱 基排列在内侧(3)其两条链上的碱基通过氢键相结合,形成碱基对 意义:该模型揭示了 DNA 作为遗传物质的稳定性特征,最有价值的是确认了碱基配对原则,这是 DNA 复制、转 录和反转录的分子基础,亦是遗传信息传递和表达的分子基础。该模型的提出是 20 世纪生命科学的重大突破之一, 它奠定了生物化学和分子生物学乃至整个生命科学飞速发展的基石。7DNA 复制通常采取哪些方式?复制通常采取哪些方式?线性 DNA 双链的复制 将线性复制
5、子转变为环状或多聚分子在 DNA 末端形成发夹式结构 使分子没有游离末端-_在某种蛋白质的介入下,在真正的末端启动复制环状 DNA 双链的复制Sita 型滚环型D环型8.简述原核生物简述原核生物 DNA 的复制特点。的复制特点。(1)复制的起始 : 1, DNA 双螺旋的解旋 DNA 在复制时,其双链首先解开,形成复制叉,这是一个有多种蛋 白质和酶参与的复杂过程。(2) DNA 复制的引发: RNA 引物的合成 前导链:DNA 双链解开为单链后,由引发酶(RNA 聚合酶, Primase)在 5 3DNA 模板上合成一段 RNA 引物,再由 DNA 聚合酶从 RNA 引物 3端开始合成新的 D
6、NA 链。然后 以此为起点,进入 DNA 复制的延伸。后随链:后随链的引发过程由引发体(Primosome)来完成。引发体由 6 种 蛋白组成的引发前体(Preprimosome)和引发酶(Primase)组成。引发体催化生成滞后链的 RNA 引物短链, 再 由 DNA 聚合酶 III 作用合成后续 DNA,直至遇到下一个引物或冈崎片段为止。在滞后链上所合成的 RNA 引物非常 短,一般只有 3-5 个核苷酸。而且,在同一种生物体细胞中这些引物都具有相似的序列。(3) 复制的延伸: 冈崎片段与半不连续复制 在原核生物中,DNA 新生链的合成主要由 DNA 聚合酶 III 所催 化。当冈崎片段形
7、成后,DNA 聚合酶 I 通过其 53外切酶活性切除冈崎片段上的 RNA 引物,同时,利用后一个 冈 崎片段作为引物由 53合成 DNA。最后两个冈崎片段由 DNA 连接酶将其接起来,形成完整的 DNA 滞后链。(4) 复制的终止: DNA 复制的终止依赖与 Tus 蛋白(Terminus utilization substance,36kD)和 DNA 链上特殊的 重复序列 Ter(约 22bp) 。Tus-ter 复合体将阻止 DNA 解链,等反方向的复制叉到达后停止复制,然后两条链解开。 最后,释放子链 DNA,依靠拓扑酶将超螺旋结构引入 DNA 分子。9真核生物真核生物 DNA 的复制
8、在哪些水平上受到调控的复制在哪些水平上受到调控答:细胞生活周期水平调控(限制点调控)即决定细胞停留在 G1 期还是进入 S 期;染色体水平调控即决定不同染色体或同一染色体不同部位的复制子按一定顺序在 S 期起始复制;复制子水平调控即决定复制的起始与否。10 细胞通过哪几种修复系统对细胞通过哪几种修复系统对 DNA 损伤进行修复损伤进行修复错配修复、切除修复、重组修复、DNA 直接修复、SOS 系统 。11.什么是转座子?可分为哪些种类?什么是转座子?可分为哪些种类?答:DNA 的转座,或称移位,是由可移位因子介导的遗传物质重排现象。转座子(transposon,Tn)是存在于染色体 DNA 上
9、可自主复制和移位的基本单位。转座子分为两大类:插入序列(IS)和复合型转座子。(1) 插入序列 :插入序列是最简单的转座子,它不含有任何宿主基因。它们是细菌染色体或质粒 DNA 的正常 组成部分。一个细菌细胞常带有少于 10 个序列。转座子常常被定为到特定的基因中,造成该基因突变。(2) 复合型转座子: 复合型转座子是一类带有某些抗药性基因(或其他宿主基因)的转座子,其两翼往往是两 个相同或高度同源的 IS 序列,表明 IS 序列插入到某个功能基因两端时就可能产生复合转座子。一旦形成复合转座 子,IS 序列就不能再单独移动,因为它们的功能被修饰了,只能作为复合体移动。大部分情况下,这些转座子的
10、 转座能力是由 IS 序列决定和调节的。 除了末端带有 IS 序列的复合转座子外,还存在一些没有 IS 序列的,体积-_庞大的转座子(5000bp 以上)TnA 家族。12 请说说插入序列与复合型转座子之间异同。请说说插入序列与复合型转座子之间异同。答:转座子是存在于染色体 DNA 上的可自主复制和位移的基本单位。最简单的转座子不含有任何宿主基因而被称 为插入序列(IS) ,他们是细菌染色体或质粒 DNA 的正常组成部分。她常常被定位到特定的基团中,造成基因突变。 、复合式转座子是一类带有某些抗药性基因的转座子,其两翼是相同的或高度同源的 IS 序列,且 IS 序列是不能单独 移动的只能作为复
11、合体移动而且 IS 序列也决定和调节转座子的转座能力。也是有没有 IS 序列的转座子 Tna 家族, 其两翼带有 38bp 的倒置重复序列13. 组蛋白上都存在哪些修饰?其作用是什么?组蛋白上都存在哪些修饰?其作用是什么?(P27)答:甲基化、乙酰化、磷酸化、泛素化及 ADP 核糖基化等。以甲基化(基因激活与沉默) 、乙酰化(转录激活,转录延伸,DNA 修复拼接复制,染色体组装,基因沉默,信号 转导)为主。影响染色体的结构和功能、基因的表达和沉默。第三章第三章 生物信息的传递(上)生物信息的传递(上)-从从 DNA 到到 RNA1 1,什么是编码链?什么是模版链?,什么是编码链?什么是模版链?
12、答:与 mRNA 序列相同的那条 DNA 链称为编码链(或有意义链) ;另一条根据碱基互补原则指导 mRNA 合成 DNA 链称 为模版链(或反义链) 。2 2,简述,简述 RNARNA 转录的概念及其基本过程。转录的概念及其基本过程。答:RNA 转录:以 DNA 中的一条单链为模板,游离碱基为原料,在 DNA 依赖的 RNA 聚合酶催化下合成 RNA 链的过程。 基本过程:模版识别转录开始转录延伸转录终止。3 3,大肠杆菌的,大肠杆菌的 RNARNA 聚合酶有哪些组成成分?各个亚基的作用如何?聚合酶有哪些组成成分?各个亚基的作用如何?答:大肠杆菌的 RNA 聚合酶由 2 个 亚基、一个 亚基
13、、一个 亚基和一个 亚基组成的核心酶,加上一个 亚基后则成为聚合酶全酶。 亚基肯能与核心酶的组装及启动子的识别有关,并参与 RNA 聚合酶和部分调节因 子的相互作用; 亚基和 亚基组成了聚合酶的催化中心, 亚基能与模版 DNA、新生 RNA 链及核苷酸底物相结合。4 4,什么是封闭复合物、开放复合物以及三元复合物?,什么是封闭复合物、开放复合物以及三元复合物?答:模版的识别阶段,聚合酶与启动子可逆性结合形成封闭性复合物;封闭性复合物形成后,此时,DNA 链仍然处 于双链状态,伴随着 DNA 构象的重大变化,封闭性复合物转化为开放复合物;开放复合物与最初的两个 NTP 相结 合并在这两个核苷酸之
14、间形成磷酸二脂键后即转变成包括 RNA 聚合酶、DNA 和新生 RNA 的三元复合物。5 5,简述,简述 因子的作用。因子的作用。答:1, 因子的作用是负责模版链的选择和转录的起始,它是酶的别构效应物,使酶专一性识别模版上的启动子; 2, 因子可以极大的提高 RNA 聚合酶对启动子区 DNA 序列的亲和力;3, 因子还能使 RNA 聚合酶与模版 DNA 上 非特异性位点结合常数降低。6 6,什么是,什么是 PribnowPribnow boxbox?它的保守序列是什么?它的保守序列是什么?答:pribnow box 是原核生物中中央大约位于转录起始位点上游 10bp 处的 TATA 区,所以又
15、称作-10 区。它的保守 序列是 TATAAT。7 7,什么是上升突变?什么是下降突变?,什么是上升突变?什么是下降突变?-_答:上升突变:细菌中常见的启动自突变之一,突变导致 Pribnow 区共同序列的同一性增加;下降突变:细菌中 常见的启动子突变之一,突变导致结构基因的转录水平大大降低,如 Pribnow 区从 TATAAT 变成 AATAAT。9 9,大肠杆菌的终止子有哪两大类?请分别介绍一下它们的结构特点。,大肠杆菌的终止子有哪两大类?请分别介绍一下它们的结构特点。答:大肠杆菌的终止子可以分为不依赖于 p 因子和依赖于 p 因子两大类。不依赖于 p 因子的终止子结构特点:1, 位于位
16、点上游一般存在一个富含 GC 碱基的二重对称区,由这段 DNA 转录产生的 RNA 容易形成发卡式结构。2,在 终止位点前面有一端由 48 个 A 组成的序列,所以转录产物的 3端为寡聚 U。依赖于 p 因子的终止子的结构特 点:1010,真核生物的原始转录产物必须经过哪些加工才能成为成熟的,真核生物的原始转录产物必须经过哪些加工才能成为成熟的 mRNAmRNA,以用作蛋白质合成的模版。,以用作蛋白质合成的模版。答:1,装上 5端帽子;2,装上 3端多聚 A 尾巴;3,剪接:将 mRNA 前体上的居间顺序切除,再将被隔开的蛋 白质编码区连接起来。剪接过程是由细胞核小分子 RNA 参与完成的,被
17、切除的居间顺序形成套索形;4,修饰: mRNA 分子内的某些部位常存在 N6-甲基腺苷,它是由甲基化酶催化产生的,也是在转录后加工时修饰的。1212,什么是,什么是 RNARNA 编辑?其生物学意义是什么?编辑?其生物学意义是什么?答:RNA 编辑是指某些 RNA 特别是 mRNA 前体经过插入、删除或取代一些核苷酸残疾等操作,导致 DNA 所编码的遗 传信息的改变,使得经过 RNA 编辑的 mRNA 序列发生了不同于模版的 DAN 的变化。生物学意义:1,校正作用,有 些基因在突变的途中丢失的遗传信息可能通过 RNA 的编辑得以恢复;2,调控翻译,通过编辑可以构建或去除其实 密码子和终止密码
18、子,是基因表达调控的一种方式;3,扩充遗传信息,能使基因产物获得心得结构核功能,有利 于生物的进化。1313,核酶具有哪些结构特点?其生物学意义是什么?,核酶具有哪些结构特点?其生物学意义是什么?答:核酶的结构特点:核酶的锤头结构特点是:三个茎区形成局部的双链结构;其中含 13 个保守的核苷酸,N 代 表任何核苷酸; 生物学意义:1,核酶是继反转录现象之后对中心法则的有一个重要的修正,说明 RNA 既是遗传 物质又是酶;2,核酶的发现为生命起源的研究提供了新思路-也许曾经存在以 RNA 为基础的原始生命。第四章 生物信息的传递(下)-从 mRNA 到蛋白质1 1,遗传密码有哪些特征?,遗传密码
19、有哪些特征?答:1,密码的连续性,密码之间无间断也没有重叠;2,密码的简并性,许多氨基酸都有多个密码子;3,密码的 通用性和特殊性,遗传密码无论在体内还是在体外,无论是对病毒、细菌、动物还是植物而言都是通用的,但是 也有少数例外;4,密码子和反密码子的相互作用。2 2,有几种终止密码子?它们的序列和别名分别是什么?,有几种终止密码子?它们的序列和别名分别是什么?答:3 种,UAA、UAG 和 UGA,别名是无意义密码。3 3,简述摆动学说。,简述摆动学说。答:1966 年,Crick 根据立体化学原理提出摆动学说,解释了反密码子中某些稀有成分的配对。摆动学说认为, 在密码子与反密码子的配对中,
20、前两对严格遵守碱基配对原则,第三对碱基有一定的自由度,可以“摆动” ,因而 使某些 tRNA 可以识别 1 个以上的密码子。认为除 A-U、G-C 配对外,还有非标准配对,I-A、I-C、I-U,并强调密 码子的 5端第 1、2 个碱基严格遵循标准配对,而第 3 个碱基可以非标准配对,具有一定程度的摆动灵活性。4 4,tRNAtRNA 在组成和结构上有哪些特点?在组成和结构上有哪些特点?答:1.tRNA 中含有稀有碱基,除 ACGU 外还含有双氢尿嘧啶、假尿嘧啶等;2.tRNA 分子形成茎环节构;3.tRNA 分 子末端有氨基酸接纳茎;4.tRNA 分子序列中很有反密码子。6 6,什么是,什么
21、是 SDSD 序列?其功能是什么?序列?其功能是什么?答:SD 序列是指信使核糖核酸(mRNA)翻译起点上游与原核 16S 核糖体 RNA 或真核 18S rRNA 3端富含嘧啶的 7 核 苷酸序列互补的富含嘌呤的 37 个核苷酸序列(AGGAGG),是核糖体小亚基与 mRNA 结合并形成正确的前起始复合-_体的一段序列。功能:SD 序列对 mRNA 的翻译起重要作用。7 7,核糖体有哪些活性中心?,核糖体有哪些活性中心?答:核糖体包括多个活性中心,即 mRNA 结合部位、结合或接受 AA-tRNA 部位,结合或接受肽酰-tRNA 部位,肽基 转移部位及形成肽键的部位,此外还有负责肽链延伸的各
22、种延伸因子的结合位点。9 9,链霉素为什么能够抑制蛋白质的合成?,链霉素为什么能够抑制蛋白质的合成?答:链霉素是是一种氨基葡萄糖型抗生素,分子式 C21H39N7O12,可以多种方式抑制原核生物核糖体,能干扰 fMet-tRNA 与核糖体的结合,从而阻止蛋白质合成的正确起始,也会导致 mRNA 的错读。1010,什么是信号肽?它在序列组成上有什么特点?有什么功能?,什么是信号肽?它在序列组成上有什么特点?有什么功能?答:绝大部分被运入内质网腔的蛋白质都带有一个信号肽,该序列常常位于蛋白质的氨基端,长度一般都在 13-16 个残基,有如下三个特征:1,一般带有 10-15 个疏水残基;2,在靠近
23、该序列 N 端常常带有一个或者数个带正电 荷的氨基酸;3,在其 C 端靠近蛋白酶切割位点处常常带有数个极性氨基酸。功能:完整的信号肽是保证蛋白质转 运的必要条件。1111,简述叶绿体蛋白质的跨膜运输机制。,简述叶绿体蛋白质的跨膜运输机制。答:1,活性蛋白水解酶位于叶绿体基质内;2,叶绿体膜能够特异性的与叶绿体蛋白的前体结合;3,叶绿体蛋白 质前体内可降解序列因植物和蛋白质种类不同而表现出明显的差异;1212,蛋白质有哪些翻译后的加工修饰?,蛋白质有哪些翻译后的加工修饰?答:1、氨基端和羧基端的修饰;2.共价修饰:磷酸化、糖基化、羟基化、二硫键的形成;3.亚基的聚合;4.水解 断链,切除新生肽中
24、非功能片段。1313,什么是核定位序列?其主要功能是什么?,什么是核定位序列?其主要功能是什么?答:核定位序列:蛋白质的一个结构域,通常为一短的氨基酸序列,它能与入核载体相互作用,使蛋白能被运进 细胞核。在绝大多数多细胞真核生物中,每当细胞发生分裂时,核膜被破坏,等到细胞分类完成后,核膜被重新 建成,分散在细胞内的核蛋白必须被重新运入核内,为了核蛋白的重复定位,这些蛋白质中的信号肽-被称为 核定位序列。14.14.什么是核信号序列,其序列组成有哪些特点?主要功能是什么?什么是核信号序列,其序列组成有哪些特点?主要功能是什么?存在于核蛋白中,引导核蛋白出核的序列,称为出核信号序列(NES)。经典
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