第二章第二节基因工程四要素优秀PPT.ppt
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1、第二章第二节基因工程四要素第一页,本课件共有67页四大要素解决四大要素解决5 5大操作元件的几大操作元件的几个问题个问题1、用什么来、用什么来”切切“?”切切“什么?什么?2、用什么来、用什么来”接接“?”接接“什么?什么?3、”转转“入哪里?入哪里?4、怎样、怎样“增增”?5、怎样、怎样“检检”?第二页,本课件共有67页人工合成、酶切、人工合成、酶切、PCRPCR、文库、文库、cRNAcRNA重组产物重组产物目的基因目的基因克隆载体克隆载体连接连接重组重组DNADNA分子分子细菌中原核表达细菌中原核表达在植物中表达在植物中表达(转基因植物)(转基因植物)在酵母中在酵母中表达表达病毒中表达病毒
2、中表达分离纯化分离纯化上上游游技技术术下下游游技技术术酶切酶切酶酶切切转化转化感受态感受态宿主细胞宿主细胞目的基因被克隆目的基因被克隆增殖增殖构建其构建其表达载体表达载体转化感受态宿转化感受态宿主细胞主细胞PCRPCR和酶和酶切鉴定切鉴定SouthernSouthernNorthernNorthernWesternWestern 筛选筛选检测检测鉴定鉴定第三页,本课件共有67页操作单操作单元元操作对象操作对象所用工具或方所用工具或方法法切切载体载体目的基因目的基因工具酶工具酶接接载体载体目的基因目的基因工具酶工具酶转转转转目的基因目的基因入入受体细胞受体细胞(宿主细胞)(宿主细胞)物理或化学方
3、物理或化学方法法增增体内体体内体外外受体细胞受体细胞中的目的基因中的目的基因受体细胞的培受体细胞的培养养检检受体细胞受体细胞中的目的基因中的目的基因Southern工具酶工具酶载体载体目的基因目的基因受体受体四大四大要素要素第四页,本课件共有67页一、工具酶一、工具酶(一)(一)限制性限制性内切内切核酸酶核酸酶 P211、概念、概念 一类能识别双链一类能识别双链DNADNA中中特殊核苷酸特殊核苷酸序列,并在合适的反序列,并在合适的反应条件下使每条链应条件下使每条链一定位点一定位点上的磷酸二酯键断开,产生上的磷酸二酯键断开,产生具有具有3-OH3-OH和和5-P5-P基团的基团的DNADNA片段
4、的内切脱氧核糖核酸酶。片段的内切脱氧核糖核酸酶。限制与修饰系统:限制与修饰系统:限制(限制(Restriction)将侵入细菌体内的外源将侵入细菌体内的外源DNA切成小片断切成小片断;修饰修饰(Modification)细菌自身的细菌自身的DNA碱基被甲基化酶甲基化修饰所保护,不能被自碱基被甲基化酶甲基化修饰所保护,不能被自身的限制性内切酶识别切割身的限制性内切酶识别切割第五页,本课件共有67页第六页,本课件共有67页由由19731973年年H.O SmithH.O Smith和和D.NathansD.Nathans提议的命名系统提议的命名系统由三部分构成,即由三部分构成,即菌种名、菌系编号、
5、分离顺序菌种名、菌系编号、分离顺序。1 1、用酶源生物属名的第一个字母和种名的头两个字母组成、用酶源生物属名的第一个字母和种名的头两个字母组成3 3个字母的略语表示寄主菌的物种名,斜体书写。个字母的略语表示寄主菌的物种名,斜体书写。大肠杆菌(大肠杆菌(Escherichia coliEscherichia coli)用)用EcoEco表示;表示;流感嗜血菌(流感嗜血菌(Haemophilus influenzaeHaemophilus influenzae)用)用HinHin表示。表示。2、用一个大写字母表示菌株或型。如Ecok,EcoR3.如果一种特殊的寄主菌内有几种不同的限制与修复系统,用
6、罗马字母表示分离到的第几个,正体书写。如EcoR I,EcoR V。命名原则?命名原则?P21第七页,本课件共有67页第八页,本课件共有67页目前鉴定出三种不同类型的限制性内切酶I 类限制性内切酶II 类限制性内切酶 III类限制性内切酶 限制与修饰系统的种类?限制与修饰系统的种类?P21第九页,本课件共有67页识别的长度切割的位点P22识别的结构2、限制性内切核酸酶识别序列、限制性内切核酸酶识别序列P21书写:以书写:以5 3”5 3”走向的单链走向的单链DNADNA核苷酸表示核苷酸表示左右互补第十页,本课件共有67页同裂酶:P22来源不同,来源不同,识别序列相同,识别序列相同,酶切位点相同
7、或不同。酶切位点相同或不同。第十一页,本课件共有67页 G A A T T CC T T A A GGC T T A A1 1、黏性末端:、黏性末端:被限制酶切开的被限制酶切开的DNADNA两条单两条单链的切口,带有几个伸出的核苷酸,它们链的切口,带有几个伸出的核苷酸,它们之间碱基正好互补配对。(之间碱基正好互补配对。(55粘性和粘性和33粘性)粘性)A A T T C G3、切切割割方方式式P22第十二页,本课件共有67页第十三页,本课件共有67页第十四页,本课件共有67页同尾酶:同尾酶:P22P22内切酶切割的位点不同,但具有相同的黏性末端,这一组酶成为同尾酶。第十五页,本课件共有67页平
8、末端:平末端:第十六页,本课件共有67页4 4、应用、应用(1 1)限制酶切割位点提供了)限制酶切割位点提供了DNADNA物理图物理图谱的特异性标记谱的特异性标记(2 2)酶切产生的特异性片段可用分子克)酶切产生的特异性片段可用分子克隆的手段加以纯化隆的手段加以纯化(3 3)酶切产生的片段为各种各样的其他)酶切产生的片段为各种各样的其他DNADNA酶学操作提供了基本底物。酶学操作提供了基本底物。第十七页,本课件共有67页5 5、DNADNA末端长度对限制酶切割的影响末端长度对限制酶切割的影响限制酶切割限制酶切割DNA时对识别序列两时对识别序列两端的非识别序列有长度的要求端的非识别序列有长度的要
9、求对引物设计的指导:对引物设计的指导:在在引物末端加上一定数目的引物末端加上一定数目的碱基数目碱基数目体现内切的特征加尾操作第十八页,本课件共有67页(二二)DNA)DNA连接酶连接酶:P25:P25作用:可以把两种来源的作用:可以把两种来源的DNADNA(用同一种限制(用同一种限制 酶切割)的黏性末端黏合起来。(以下酶切割)的黏性末端黏合起来。(以下几种情况)几种情况)同裂酶,行不?P25失去了两种酶的识别序列酶的识别序列仍存在第十九页,本课件共有67页35磷酸二酯键磷酸二酯键第二十页,本课件共有67页两种DNA连接酶(1)大肠杆菌连接酶:只能连接粘性末端(2)T4噬菌体的连接酶:连接粘性末
10、端、齐平末端功用:DNA重组中促使载体与DNA连接第二十一页,本课件共有67页限制性内切酶限制性内切酶主要用于主要用于DNADNA分子的特异分子的特异切割(切割(“分子剪刀分子剪刀”或或“分子手术刀分子手术刀”“基因刀基因刀”之称之称)核酸连接酶核酸连接酶用于用于DNADNA和和RNARNA的连接的连接第二十二页,本课件共有67页(三)其它工具酶:(三)其它工具酶:1 1、甲基化酶:、甲基化酶:-来自细菌防御系统来自细菌防御系统甲基化对限制酶切的影响甲基化对限制酶切的影响(1 1)、修饰酶切位点)、修饰酶切位点-使本可被酶切的不受酶切使本可被酶切的不受酶切(2)2)、产生新的酶切位点使本不能被
11、酶切的、产生新的酶切位点使本不能被酶切的能被酶切能被酶切(3)(3)、对基因组作图的影响、对基因组作图的影响第二十三页,本课件共有67页2 2、DNADNA聚合酶聚合酶(DNA polymerase)(DNA polymerase)来自来自DNADNA复制系统复制系统催化催化DNADNA的合成活性(主要活性):的合成活性(主要活性):把把dNTPsdNTPs连续地加到引物的连续地加到引物的 3OH 3OH端,端,催化核苷酸的聚合作用。(聚合酶的共催化核苷酸的聚合作用。(聚合酶的共同特点)同特点)其他活性(相辅助的活性)其他活性(相辅助的活性)第二十四页,本课件共有67页3、耐热耐热DNADNA
12、聚合酶聚合酶来源:来源:噬高温的细菌。噬高温的细菌。基本特性:基本特性:在高温下具有活性(在高温下具有活性(90-90-100100)用途:用途:主要用于主要用于PCRPCR第二十五页,本课件共有67页4、反转录酶(反转录酶(reverse reverse transcriptasetranscriptase)依赖于依赖于RNARNA的的DNADNA聚合酶(以聚合酶(以RNARNA为模板)为模板)基本特性:基本特性:5 5 33合成合成DNADNA活性,但无活性,但无3 3 55外切酶活性外切酶活性主要用途:主要用途:cDNAcDNA克隆中合成第一条链克隆中合成第一条链/提取提取RNARNA反
13、反转录成转录成DNADNA,再,再PCRPCR(因为内含子的存在)(因为内含子的存在)转录酶-RNA聚合酶(RNA polymerase):以一条DNA链或RNA为模板催化由核苷-5-三磷酸合成RNA的酶。在细胞内与基因DNA的遗传信息转录为RNA有关第二十六页,本课件共有67页5、末端转移酶末端转移酶来源:小牛胸腺来源:小牛胸腺基本特性:不依赖于模板的基本特性:不依赖于模板的DNADNA聚合酶。聚合酶。应用:应用:P26P26平末端平末端粘性末端粘性末端第二十七页,本课件共有67页6 6、核酸外切酶、核酸外切酶exonuclease(与核酸内切酶相对应)一类能从多核苷酸链的一端开始按序催化水
14、解一类能从多核苷酸链的一端开始按序催化水解3 3、5-5-磷酸二酯键,降解核苷酸的酶。其水解的最终磷酸二酯键,降解核苷酸的酶。其水解的最终产物是单个的核苷酸(产物是单个的核苷酸(DNADNA为为dNTPdNTP,RNARNA为为NTPNTP)。)。(作用于(作用于DNADNA或或RNARNA)第二十八页,本课件共有67页单链的核酸外切酶和双链的核酸外切酶单链的核酸外切酶和双链的核酸外切酶能够从能够从5-5-末端或末端或3-3-末端呈单链状态的末端呈单链状态的DNADNA分子上降解分子上降解DNADNA,产生出,产生出寡核苷酸寡核苷酸短短片段,而且是唯一不需要片段,而且是唯一不需要Mg2+Mg2
15、+离子的离子的活性活性酶酶,是一种耐受性很强的,是一种耐受性很强的核酸酶核酸酶。可以用来测定基因组可以用来测定基因组DNA中一些特中一些特殊的间隔序列和编码序列的位置。它殊的间隔序列和编码序列的位置。它只切割末端有单链突出的只切割末端有单链突出的DNA分子。分子。主要的催化活性是催化双链主要的催化活性是催化双链DNADNA按按3535的方向从的方向从3-OH3-OH末端末端释放释放5-5-单核苷酸。单核苷酸。第二十九页,本课件共有67页基因工程应用:基因工程应用:P26P26粘性末端粘性末端平末端平末端第三十页,本课件共有67页7 7、碱性磷酸酯酶:、碱性磷酸酯酶:alkaline phosp
16、hatasealkaline phosphatase最适最适pHpH在在7.07.0以上,催化各种磷酸单酯键以上,催化各种磷酸单酯键水解反应,产生无机磷酸和相应的醇、水解反应,产生无机磷酸和相应的醇、酚或糖的酶,也可以催化磷酸基团的转酚或糖的酶,也可以催化磷酸基团的转移反应,但不能水解磷酸二酯键。移反应,但不能水解磷酸二酯键。应用:应用:P26 P26 第三十一页,本课件共有67页8 8、RNARNA酶酶RNaseRNase:RNaseRNase的特点:的特点:抗酸抗碱抗酸抗碱,具很广具很广pHpH作用范围作用范围抗高温严寒抗高温严寒(065(065均具活性,均具活性,100100也不能使之完
17、全失活)也不能使之完全失活)抗变性剂(变性剂只能使之暂时失活,去除变性剂后抗变性剂(变性剂只能使之暂时失活,去除变性剂后又可恢复活性)又可恢复活性)酶活性不需要辅助因子酶活性不需要辅助因子存在范围广存在范围广 第三十二页,本课件共有67页总之总之限制性内切酶限制性内切酶主要用于主要用于DNADNA分子的特异切割分子的特异切割 DNADNA甲基化酶甲基化酶用于用于DNADNA分子的甲基化分子的甲基化 核酸外切酶核酸外切酶用于用于DNADNA和和RNARNA的非特异性切割的非特异性切割 核酸聚合酶核酸聚合酶用于用于DNADNA和和RNARNA的合成的合成 核酸连接酶核酸连接酶用于用于DNADNA和
18、和RNARNA的连接的连接 核酸末端修饰酶核酸末端修饰酶用于用于DNADNA和和RNARNA的末端修饰的末端修饰 RNA RNA酶酶-分解分解RNARNA其其它它酶酶类类-用用于于生生物物细细胞胞的的破破壁壁,转转化化,核核酸酸纯纯化化,检测等检测等第三十三页,本课件共有67页1 1、载体:、载体:将将外源外源DNADNA或基因或基因携带入携带入适当适当宿宿主细胞(主细胞(host cellhost cell)的工具。)的工具。二、基因克隆载体二、基因克隆载体P27P27第三十四页,本课件共有67页2、载体的种类、载体的种类克隆载体:克隆载体:携带重组携带重组DNADNA进入在宿主细胞内进行大
19、量复制进入在宿主细胞内进行大量复制 形成大量形成大量的基因克隆。的基因克隆。被克隆的基因不一定会表达被克隆的基因不一定会表达 但一定被大量复制但一定被大量复制 质粒载体质粒载体复制起点来自一些天然质粒。复制起点来自一些天然质粒。噬菌体载体噬菌体载体,P1P1和和M13M13、fdfd载体,复制起点来自噬菌体。载体,复制起点来自噬菌体。人工染色体载体人工染色体载体P33P33:大大DNADNA片段克隆载体片段克隆载体 表达载体:表达载体:使目的基因表达,生产出我们需要的产物。使目的基因表达,生产出我们需要的产物。第三十五页,本课件共有67页2 2、载体具备的条件载体具备的条件l 具有较高的拷贝数
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