生物化学课件—第五章 酶.ppt
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1、生物化学课件第五章 酶 Still waters run deep.流静水深流静水深,人静心深人静心深 Where there is life,there is hope。有生命必有希望。有生命必有希望5.1 5.1 酶的命名及分类酶的命名及分类n(1)(1)习惯命名法习惯命名法:n1,1,根据其催化底物来命名;根据其催化底物来命名;n2,2,根据所催化反应的性质来命名;根据所催化反应的性质来命名;n3,3,结合上述两个原则来命名,结合上述两个原则来命名,n4,4,有时在这些命名基础上加上酶的来源或其它有时在这些命名基础上加上酶的来源或其它特点。特点。1.1.酶的命名酶的命名(2)(2)国际系
2、统命名法国际系统命名法n系统名称包括底物名称、构型、反应性系统名称包括底物名称、构型、反应性质,最后加一个酶字质,最后加一个酶字。n例如:例如:n习惯名称习惯名称:谷丙转氨酶谷丙转氨酶n系统名称系统名称:丙氨酸:丙氨酸:-酮戊二酸氨基转移酶酮戊二酸氨基转移酶n酶催化的反应酶催化的反应:n谷氨酸谷氨酸+丙酮酸丙酮酸 -酮戊二酸酮戊二酸+丙氨酸丙氨酸 2.2.酶的分类酶的分类n水解酶催化底物的加水分解反应。水解酶催化底物的加水分解反应。n主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。n例如,脂肪酶例如,脂肪酶(Lipase)(Lipase)催化的脂的水解反应:催化
3、的脂的水解反应:(1)(1)水解酶水解酶 hydrolase hydrolase2.2.酶的分类酶的分类n氧化氧化-还原酶催化氧化还原酶催化氧化-还原反应。还原反应。n主要包括脱氢酶主要包括脱氢酶(dehydrogenase)(dehydrogenase)和氧化酶和氧化酶(Oxidase)(Oxidase)。n如,乳酸如,乳酸(Lactate)(Lactate)脱氢酶催化乳酸的脱氢反应。脱氢酶催化乳酸的脱氢反应。(2)(2)氧化氧化-还原酶还原酶 Oxidoreductase Oxidoreductase2.2.酶的分类酶的分类n转移酶催化基团转移反应,即将一个底物分子转移酶催化基团转移反应,
4、即将一个底物分子的基团或原子转移到另一个底物的分子上。的基团或原子转移到另一个底物的分子上。例如,例如,谷丙转氨酶催化的氨基转移反应。谷丙转氨酶催化的氨基转移反应。(3)(3)转移酶转移酶 Transferase Transferase2.2.酶的分类酶的分类n裂合酶催化从底物分子中移去一个基团或裂合酶催化从底物分子中移去一个基团或原子形成双键的反应及其逆反应。原子形成双键的反应及其逆反应。n主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。n例如,例如,延胡索酸水合酶催化的反应。延胡索酸水合酶催化的反应。(4)(4)裂合酶裂合酶 Lyase Lyase2.2.酶的分类酶的分
5、类n异构酶催化各种同分异构体的相互转化,异构酶催化各种同分异构体的相互转化,即底物分子内基团或原子的重排过程。即底物分子内基团或原子的重排过程。例如,例如,6-磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。磷酸葡萄糖异构酶催化的反应。(5)(5)异构酶异构酶 Isomerase Isomerase2.2.酶的分类酶的分类n合成酶,又称为连接酶,能够催化合成酶,又称为连接酶,能够催化C-CC-C、C-OC-O、C-N C-N 以及以及C-S C-S 键的形成反应。这类反应必须与键的形成反应。这类反应必须与ATPATP分解反应相互偶联。分解反应相互偶联。nA+B+ATP+H-O-H=A A+B+ATP+H-O-H=
6、A B+ADP+Pi B+ADP+Pi n例如,丙酮酸羧化酶催化的反应。例如,丙酮酸羧化酶催化的反应。丙酮酸丙酮酸 +COCO2 2 草酰乙酸草酰乙酸(6)(6)合成酶合成酶 Ligase or Synthetase Ligase or Synthetase2.2.酶的分类酶的分类n核酸酶是唯一的非蛋白酶。它是一类特殊的核酸酶是唯一的非蛋白酶。它是一类特殊的RNARNA,能够催化,能够催化RNARNA分子中的磷酸酯键的水解及其逆分子中的磷酸酯键的水解及其逆反应。反应。(7)(7)核酸酶(催化核酸)核酸酶(催化核酸)ribozyme ribozyme5.2 5.2 维生素与辅酶维生素与辅酶n维生
7、素是机体维持正常生命活动所必不维生素是机体维持正常生命活动所必不可少的一类有机物质。可少的一类有机物质。n维生素一般习惯分为脂溶性和水溶性两维生素一般习惯分为脂溶性和水溶性两大类。其中脂溶性维生素在体内可直接大类。其中脂溶性维生素在体内可直接参与代谢的调节作用,而水溶性维生素参与代谢的调节作用,而水溶性维生素是通过转变成辅酶对代谢起调节作用。是通过转变成辅酶对代谢起调节作用。辅酶辅酶coenzymecoenzyme和金属离子和金属离子n根据酶的组成情况,可以将酶分为两大类:根据酶的组成情况,可以将酶分为两大类:n单纯蛋白酶单纯蛋白酶:它们的组成为单一蛋白质:它们的组成为单一蛋白质.n结结合合蛋
8、蛋白白酶酶:某某些些酶酶,例例如如氧氧化化-还还原原酶酶等等,其分子中除了蛋白质外,还含有非蛋白组分其分子中除了蛋白质外,还含有非蛋白组分.n结结合合蛋蛋白白酶酶的的蛋蛋白白质质部部分分称称为为酶酶蛋蛋白白,非非蛋蛋白白质质 部部 分分 包包 括括 辅辅 酶酶 及及 金金 属属 离离 子子(或或 辅辅 因因 子子cofactorcofactor)。n酶酶蛋蛋白白与与辅辅助助成成分分组组成成的的完完整整分分子子称称为为全全酶酶。单纯的酶蛋白无催化功能单纯的酶蛋白无催化功能.5.2.15.2.1水溶性维生素与辅酶水溶性维生素与辅酶n某某些些小小分分子子有有机机化化合合物物与与酶酶蛋蛋白白结结合合在
9、在一一起起并并协协同同实实施施催催化化作作用用,这这类类分分子子被被称称为为辅辅酶酶(或或辅辅基基)。n辅辅酶酶是是一一类类具具有有特特殊殊化化学学结结构构和和功功能能的的化化合合物物。参参与与的的酶酶促促反反应应主主要要为为氧氧化化-还还原原反反应应或或基基团团转转移移反应。反应。n大多数辅酶的前体主要是水溶性大多数辅酶的前体主要是水溶性 B B 族维生素。许族维生素。许多维生素的生理功能与辅酶的作用密切相关。多维生素的生理功能与辅酶的作用密切相关。(1)(1)维生素维生素PPPPn 菸菸酸酸和和菸菸酰酰胺胺,在在体体内内转转变变为为辅辅酶酶I I和和辅酶辅酶IIII。n能能维维持持神神经经
10、组组织织的的健健康康。缺缺乏乏时时表表现现出出神经营养障碍,出现皮炎。神经营养障碍,出现皮炎。(1)(1)维生素维生素PPPP和和NADNAD 和和NADPNADP n NADNAD (烟烟酰酰胺胺-腺腺嘌嘌呤呤二二核核苷苷酸酸,又又称称为为辅辅酶酶I)I)和和NADPNADP(烟烟酰酰胺胺-腺腺嘌嘌呤呤磷磷酸酸二二核核苷苷酸酸,又又称为辅酶称为辅酶II)II)是维生素烟酰胺的衍生物,是维生素烟酰胺的衍生物,功功能能:是是多多种种重重要要脱脱氢氢酶酶的的辅辅酶酶。(2)(2)核黄素(核黄素(VB2)VB2)n核核黄黄素素(维维生生素素B2)B2)由由核核糖糖醇醇和和6 6,7-7-二二甲甲基基
11、异异咯咯嗪嗪两两部部分组成。分组成。n缺缺乏乏时时组组织织呼呼吸吸减减弱弱,代代谢谢强强度度降降低低。主主要要症症状状为为口口腔发炎,舌炎、角膜炎、皮炎等。腔发炎,舌炎、角膜炎、皮炎等。(2)(2)核黄素和核黄素和 FAD FAD和和FMNFMNnFAD(FAD(黄黄素素-腺腺嘌嘌呤呤二二核核苷苷酸酸)和和FMN(FMN(黄黄素素单单核核苷苷酸酸)是核黄素是核黄素(维生素维生素B2)B2)的衍生物,的衍生物,功能:在在脱脱氢氢酶酶催催化化的的氧氧化化-还还原原反反应应中中,起起着着电电子子和和质质子子的的传传递递体体作作用用。(3)(3)泛酸和辅酶泛酸和辅酶A(CoA)A(CoA)n维生素维生
12、素(B3)-(B3)-泛酸是由泛酸是由,-二羟基二羟基-二甲基丁酸二甲基丁酸和一分子和一分子-丙氨酸缩合而成丙氨酸缩合而成。(3)(3)泛酸和辅酶泛酸和辅酶A(CoA)A(CoA)n辅酶辅酶A A是生物体内代谢反应中乙酰化酶的辅酶,是生物体内代谢反应中乙酰化酶的辅酶,它的前体是维生素它的前体是维生素(B3)(B3)泛酸。泛酸。功功能能:是是传传递递酰酰基基,是是形形成成代代谢谢中中间间产产物物的的重重要要辅辅酶酶。(4)(4)叶酸和四氢叶酸叶酸和四氢叶酸(FH(FH4 4或或THFA)THFA)n四四氢氢叶叶酸酸是是合合成成酶酶的的辅辅酶酶,其其前前体体是是叶叶酸酸(又又称称为为蝶蝶酰酰谷氨酸
13、,维生素谷氨酸,维生素B11)B11)。n四四氢氢叶叶酸酸的的主主要要作作用用是是作作为为一一碳碳基基团团,如如-CH-CH3 3,-CH-CH2 2-,-,-CHO-CHO 等的载体,参与多种生物合成过程。等的载体,参与多种生物合成过程。(5)(5)硫胺素硫胺素n硫硫胺胺素素(维维生生素素B1)B1)在在体体内内以以焦焦磷磷酸酸硫硫胺胺素素(TPP)(TPP)形形式式存存在在。缺缺乏乏时时表表现现出出多多发发性性神神经经炎炎、皮皮肤肤麻麻木木、心力衰竭、四肢无力、下肢水肿。心力衰竭、四肢无力、下肢水肿。(5)(5)硫胺素和焦磷酸硫胺素硫胺素和焦磷酸硫胺素(TPP)(TPP)n焦焦磷磷酸酸硫硫
14、胺胺素素是是脱脱羧羧酶酶的的辅辅酶酶,它它的的前前体体是是硫硫胺胺素素(维生素维生素B1)B1)。功功能能:是是催催化化酮酮酸酸的的脱脱羧羧反反应应(6)(6)吡哆素吡哆素n吡多素吡多素(维生素维生素B6B6,包括吡哆醇、吡哆醛和吡哆胺包括吡哆醇、吡哆醛和吡哆胺)。(6)(6)吡哆素和磷酸吡哆素吡哆素和磷酸吡哆素n磷酸吡哆素主要包括磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺。磷酸吡哆素主要包括磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺。n磷磷酸酸吡吡多多素素是是转转氨氨酶酶的的辅辅酶酶,转转氨氨酶酶通通过过磷磷酸酸吡吡多多醛醛和磷酸吡多胺的相互转换,起转移氨基的作用。和磷酸吡多胺的相互转换,起转移氨基的作用。(7)(7)生物素生物素
15、n生物素是羧化酶的辅酶,它本身就是一种生物素是羧化酶的辅酶,它本身就是一种B B族维生素族维生素B7B7。生物素的功能是作为生物素的功能是作为COCO2 2的递体,在生物合成中起传递和的递体,在生物合成中起传递和固定固定COCO2 2的作用。的作用。(8)(8)维生素维生素B B1212辅酶辅酶 n维生素维生素B B1212又称为钴胺素。又称为钴胺素。维生素维生素B B1212分子中与分子中与Co+Co+相连的相连的CNCN基被基被5 5-脱氧脱氧腺苷所取代,形成维生腺苷所取代,形成维生素素B B1212辅酶。辅酶。n维生素维生素B B1212辅酶的主要功辅酶的主要功能是作为变位酶的辅酶,能是
16、作为变位酶的辅酶,催化底物分子内基团催化底物分子内基团(主主要为甲基要为甲基)的变位反应。的变位反应。结构结构(9 9)硫辛酸)硫辛酸n硫辛酸是少数不属于维生素的辅酶。硫辛酸是硫辛酸是少数不属于维生素的辅酶。硫辛酸是6,8-6,8-二硫辛酸,有两种形式,即硫辛酸(氧化二硫辛酸,有两种形式,即硫辛酸(氧化型)和二氢硫辛酸(还原型)型)和二氢硫辛酸(还原型).(10)(10)辅酶辅酶Q(CoQ)Q(CoQ)n辅酶辅酶Q Q又称为泛醌,广泛存在与动物和细菌的又称为泛醌,广泛存在与动物和细菌的线粒体中,其结构为:线粒体中,其结构为:n辅酶辅酶Q Q的活性部分是它的醌环结构,主要功能是的活性部分是它的醌
17、环结构,主要功能是作为线粒体呼吸链氧化作为线粒体呼吸链氧化-还原酶的辅酶,在酶与还原酶的辅酶,在酶与底物分子之间传递电子。底物分子之间传递电子。维生素维生素C Cn在体内参在体内参与氧化还与氧化还原反应,原反应,羟化反应。羟化反应。人体不能人体不能合成合成。5.2.2脂溶性维生素脂溶性维生素n维生素维生素A,D,E,KA,D,E,K均溶于脂类溶剂,不溶于均溶于脂类溶剂,不溶于水,在食物中通常与脂肪一起存在,吸水,在食物中通常与脂肪一起存在,吸收它们,需要脂肪和胆汁酸。收它们,需要脂肪和胆汁酸。1 1,维生素,维生素A An维生素维生素A A分分A1,A2A1,A2两种,是不饱和一元醇两种,是不
18、饱和一元醇类。维生素类。维生素A1A1又称为视黄醇,又称为视黄醇,A2A2称为脱称为脱氢视黄醇。氢视黄醇。2,2,维生素维生素D Dn维生素维生素D D是固醇类化合物,主要有是固醇类化合物,主要有D2,D3,D2,D3,D4,D5D4,D5。其中。其中D2,D3D2,D3活性最高。活性最高。维生素维生素D D的结构的结构n在生物体内,在生物体内,D2D2和和D3D3本身不具有生物本身不具有生物活性。它们在肝脏活性。它们在肝脏和肾脏中进行羟化和肾脏中进行羟化后,形成后,形成1 1,25-25-二二羟基维生素羟基维生素D D。其中。其中1 1,25-25-二羟基维生二羟基维生素素D3D3是生物活性
19、最是生物活性最强的。强的。3 3,维生素,维生素E En又叫做生育酚,目前发现的有又叫做生育酚,目前发现的有6 6种,其中种,其中,四种有生理活性。四种有生理活性。4 4,维生素,维生素K Kn维生素维生素K K有有3 3种,种,K1,K2,K3K1,K2,K3。其中其中K3K3是人工合成的。维生是人工合成的。维生素素K K是是2-2-甲基萘醌的衍生物。甲基萘醌的衍生物。5.2.25.2.2、辅酶在酶促反应中的、辅酶在酶促反应中的作用特点作用特点n辅酶在催化反应过程中,直接参加了反应。辅酶在催化反应过程中,直接参加了反应。n每每一一种种辅辅酶酶都都具具有有特特殊殊的的功功能能,可可以以特特定定
20、地地催催化某一类型的反应。化某一类型的反应。n同同一一种种辅辅酶酶可可以以和和多多种种不不同同的的酶酶蛋蛋白白结结合合形形成成不同的全酶。不同的全酶。n一一般般来来说说,全全酶酶中中的的辅辅酶酶决决定定了了酶酶所所催催化化的的类类型型(反反应应专专一一性性),而而酶酶蛋蛋白白则则决决定定了了所所催催化化的底物类型(底物专一性)。的底物类型(底物专一性)。5.2.4 5.2.4 酶分子中的金属离子酶分子中的金属离子n根据金属离子与酶蛋白结合程度,可分为两类:根据金属离子与酶蛋白结合程度,可分为两类:金属酶和金属激酶。金属酶和金属激酶。n在金属酶中在金属酶中,酶蛋白与金属离子结合紧密。如酶蛋白与金
21、属离子结合紧密。如 FeFe2+2+/Fe/Fe3+3+、CuCu+/Cu/Cu3 3、ZnZn2+2+、MnMn2+2+、CoCo2 2 等。等。n金属酶中的金属离子作为酶的辅助因子,在酶金属酶中的金属离子作为酶的辅助因子,在酶促反应中传递电子,原子或功能团促反应中传递电子,原子或功能团。金属酶中的金属离子与配体金属酶中的金属离子与配体n金属离子金属离子 配体配体 酶或蛋白酶或蛋白nMnMn2 2 咪唑咪唑 丙酮酸脱氢酶丙酮酸脱氢酶nFeFe2+2+/Fe/Fe3+3+卟啉环,咪唑,卟啉环,咪唑,血红素,血红素,含硫配体含硫配体 氧化氧化-还原酶,还原酶,过氧化氢酶过氧化氢酶nCuCu+/C
22、u/Cu2+2+咪唑,酰胺咪唑,酰胺 细胞色素氧化酶细胞色素氧化酶nCoCo2+2+卟啉环卟啉环 变位酶变位酶nZnZn2+2+-NH -NH3 3,咪唑,(,咪唑,(-RS-RS)2 2 碳酸酐酶,醇脱氢酶碳酸酐酶,醇脱氢酶nPbPb2 2 -SH d-SH d-氨基氨基-g-g-酮戊二酸脱水酶酮戊二酸脱水酶nNiNi2 2 -SH -SH 尿酶尿酶金属激酶中的金属离子金属激酶中的金属离子n激酶是一种磷酸化酶类,在激酶是一种磷酸化酶类,在ATPATP存在下催化葡存在下催化葡萄糖,甘油等磷酸化。萄糖,甘油等磷酸化。n其中的金属离子与酶的结合一般较松散。在溶其中的金属离子与酶的结合一般较松散。在
23、溶液中,酶与这类离子结合而被激活。液中,酶与这类离子结合而被激活。n如如NaNa+、K K+、Mg Mg2+2+、Ca Ca2+2+等。金属离子对酶有等。金属离子对酶有一定的选择性一定的选择性,某种金属只对某一种或几种酶某种金属只对某一种或几种酶有激活作用。有激活作用。5.3 5.3 酶的结构及酶的结构及催化作用机制催化作用机制 n1 1结合部位结合部位 Binding siteBinding siten酶分子中与底物结合酶分子中与底物结合的部位或区域一般称的部位或区域一般称为结合部位。为结合部位。(一)(一)酶分子的结构特点酶分子的结构特点n酶分子中促使底物发生化学酶分子中促使底物发生化学变
24、化的部位称为催化部位变化的部位称为催化部位。n通常将酶的结合部位和催化通常将酶的结合部位和催化部位总称为酶的活性部位或部位总称为酶的活性部位或活性中心。活性中心。n结合部位决定酶的专一性,结合部位决定酶的专一性,n催化部位决定酶所催化反应催化部位决定酶所催化反应的性质。的性质。2 2催化部位催化部位 catalytic sitecatalytic siten酶分子中存在着一些可以与其他分子发生某种酶分子中存在着一些可以与其他分子发生某种程度的结合的部位,从而引起酶分子空间构象程度的结合的部位,从而引起酶分子空间构象的变化,对酶起激活或抑制作用。的变化,对酶起激活或抑制作用。3 3调控部位调控部
25、位 Regulatory site Regulatory siten主要包括:主要包括:n亲核性基团:丝氨酸亲核性基团:丝氨酸的羟基,半胱氨酸的的羟基,半胱氨酸的巯基和组氨酸的咪唑巯基和组氨酸的咪唑基。基。酶活性中心的必需基团酶活性中心的必需基团n酸碱性基团:门酸碱性基团:门冬氨酸和谷氨酸冬氨酸和谷氨酸的羧基,赖氨酸的羧基,赖氨酸的氨基,酪氨酸的氨基,酪氨酸的酚羟基,组氨的酚羟基,组氨酸的咪唑基和半酸的咪唑基和半胱氨酸的巯基等。胱氨酸的巯基等。(二二)酶作用专一性的机制酶作用专一性的机制 n酶分子活性中心部位,一般都含有多个具有酶分子活性中心部位,一般都含有多个具有催化活性的手性中心,这些手性
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