生物物理课1-2.ppt
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1、生物物理课1-2 Still waters run deep.流静水深流静水深,人静心深人静心深 Where there is life,there is hope。有生命必有希望。有生命必有希望什么是生物物理学?什么是生物物理学?生物物理学的定义是生物物理学领域几乎每一本教科书都难以回答的问题!要从物理科学与生物科学之间的关系来认识生物物理学!生物物理学的核心是生物学生物学!生物物理学的基本思路是相互作用(interactions)!G蛋白偶联受体对蛋白偶联受体对腺苷酸环化酶的腺苷酸环化酶的激活途径示意图激活途径示意图G蛋白介导的跨膜信号传导蛋白介导的跨膜信号传导Epinephrine bi
2、nds to a specific receptor.The occupied receptor causes the replacement of the GDP bound to Gs by GTP,activating Gs.GTPGDPGs(subunit)moves to adenylate cyclase and activates it.ATPcAMPAdenylate cyclase catalyzes the formation of 3,5-cyclic AMP.项目切入点生物物理学生物物理学(二二)的研究对象的研究对象生物膜的基本结构特征生物膜的基本结构特征膜主要是由脂类
3、膜主要是由脂类(lipid)(lipid)和蛋白质以和蛋白质以非共价非共价键相互作用键相互作用结合而成的二维流动体系。结合而成的二维流动体系。脂类分子呈连续的脂类分子呈连续的双分子层双分子层(bilayer)(bilayer)排列排列。膜具有膜具有双亲性双亲性(amphipathic nature(amphipathic nature)。蛋白质相对于脂双层的蛋白质相对于脂双层的不同镶嵌方式不同镶嵌方式。生物膜中各种组分的生物膜中各种组分的分布是高度不对称的分布是高度不对称的。生物膜的主要功能生物膜的主要功能它们是把细胞分割成一个个它们是把细胞分割成一个个“小室小室”(compartment)(
4、compartment)的物理屏障。的物理屏障。它们具有选择通透性。它们具有选择通透性。它们是它们是“小室小室”间传递化学信息和能量间传递化学信息和能量的介面。的介面。它们为蛋白质的合成、加工与修饰、分它们为蛋白质的合成、加工与修饰、分选与定位,提供了工作平台和输运载体。选与定位,提供了工作平台和输运载体。1.对生物膜结构的认识对生物膜结构的认识对生物膜结构的认识对生物膜结构的认识1765年年,Benjamin Franklinl将橄榄油倒入将橄榄油倒入CommenCommen池塘中,注意到由风所吹起的池塘中,注意到由风所吹起的水面微波被平息了。水面微波被平息了。l注意到同样数量的油永远覆盖同
5、样大小的面积。注意到同样数量的油永远覆盖同样大小的面积。lFranklinFranklin还计算到(根据油量和面积)油层的厚度还计算到(根据油量和面积)油层的厚度是是2525,而且,而且“它不可能扩展得更薄了。事实证明,它不可能扩展得更薄了。事实证明,用现代方法测定的橄榄油的单分子层的厚度几乎与用现代方法测定的橄榄油的单分子层的厚度几乎与FranklinFranklin当时估算的一样!当时估算的一样!对生物膜结构的认识对生物膜结构的认识1902年,年,E.Overtonl发现分子的极性越大,进入细胞的速度越小;发现分子的极性越大,进入细胞的速度越小;l增加分子的非极性基团,分子进入细胞的速增加
6、分子的非极性基团,分子进入细胞的速度增加;度增加;l基于脂溶性物质容易透过质膜,基于脂溶性物质容易透过质膜,OvertonOverton提提出质膜是由一层薄的类脂所组成。出质膜是由一层薄的类脂所组成。l-Vjschr.Naturforsch Ges.Zurich 44(1899)88-98.对生物膜结构的认识对生物膜结构的认识1917年,年,Langmuir 发现脂肪酸放在水和发现脂肪酸放在水和空气界面上形成单分空气界面上形成单分子膜子膜 -Langmuir film.Langmuir film.对生物膜结构的认识对生物膜结构的认识1925年,年,E.Gorter and F.Grendel
7、从红细胞膜抽提出磷脂,用表面天平测从红细胞膜抽提出磷脂,用表面天平测出被抽提出的磷脂铺成单层膜时所占有出被抽提出的磷脂铺成单层膜时所占有面积大约是红细胞表面积的面积大约是红细胞表面积的2 2倍。提出双倍。提出双分子类脂层是细胞膜的基本结构。分子类脂层是细胞膜的基本结构。l-J.Exp.Med.41(1925)439-443.对生物膜结构的认识对生物膜结构的认识1935年,年,J.F.Danielli and H.Davsonl胎鱼卵的脂滴实验:胎鱼卵的脂滴实验:l卵脂滴表面张力低,而纯化后的脂滴表面张力大卵脂滴表面张力低,而纯化后的脂滴表面张力大大提高;大提高;l纯化后的脂滴表面吸附蛋白之后,
8、表面张力降低纯化后的脂滴表面吸附蛋白之后,表面张力降低大大提高;大大提高;l提出两层球蛋白层夹着脂双分子层的三夹层结构提出两层球蛋白层夹着脂双分子层的三夹层结构(the unit membrane modelthe unit membrane model).对生物膜结构的认识对生物膜结构的认识1972年,年,S.J.Singer and G.Nicholson,提提出出液体镶嵌模型液体镶嵌模型(The fluid mosaic The fluid mosaic modelmodel):l强调膜结构的流动性强调膜结构的流动性l强调膜组分的不对称性强调膜组分的不对称性l膜蛋白以不同镶嵌方式与膜结合
9、膜蛋白以不同镶嵌方式与膜结合 -Science 175(1972)720-731.对生物膜结构的认识对生物膜结构的认识1977年,年,M.K.Jain and H.B.White,提提出板块模型出板块模型:l在流动的类脂双分子层中存在许多大小不同,在流动的类脂双分子层中存在许多大小不同,刚度较大的彼此独立移动的类脂板块(有序刚度较大的彼此独立移动的类脂板块(有序结构板块)。因此,膜平面实际上是由组织结构板块)。因此,膜平面实际上是由组织结构和物化性质不同的许多板块组成。结构和物化性质不同的许多板块组成。l膜功能的多样性可能与板块的性质和变化有膜功能的多样性可能与板块的性质和变化有关。关。-Ad
10、v.Lipid Res.15(1977)1-60.对生物膜结构的认识对生物膜结构的认识1997年,年,K.Simons,细胞膜中的功能化筏细胞膜中的功能化筏(Functional rafts in cell manbrane):(Functional rafts in cell manbrane):l细胞的质膜上存在一些特殊的畴结构域微区。细胞的质膜上存在一些特殊的畴结构域微区。它们富含糖基鞘磷脂,胆固醇和鞘磷脂,它们富含糖基鞘磷脂,胆固醇和鞘磷脂,4 4o oC C不溶于非离子型去污剂不溶于非离子型去污剂TritonTritonX100X100。l这种特殊的微畴结构域提供了一个可以侧向这种特
11、殊的微畴结构域提供了一个可以侧向移动的平台(筏)。一些蛋白选择性地富集移动的平台(筏)。一些蛋白选择性地富集于筏上,而另一些蛋白质则排挤出筏。于筏上,而另一些蛋白质则排挤出筏。l功能:膜的分选与运输;信号传导等。功能:膜的分选与运输;信号传导等。-Simons&Ikonen,Nature 387(1997)569-572caveolin2.生物膜的基本组成生物膜的基本组成生物膜的基本组成生物膜的基本组成生物膜的基本组成生物膜的基本组成(一一)细胞质膜细胞内膜系统膜与细胞骨架生物膜的基本组成生物膜的基本组成细胞质膜细胞质膜 所有细胞的表面都包围着一层膜,在动物细胞中,我所有细胞的表面都包围着一层
12、膜,在动物细胞中,我们通常将其称为质膜们通常将其称为质膜(plasma membrane)(plasma membrane)。而对于其它。而对于其它生物体,则根据其细胞种类分别称为细胞质膜生物体,则根据其细胞种类分别称为细胞质膜(cytoplasmic membrane)(cytoplasmic membrane)、表面膜、表面膜(surface(surface membrane)membrane)、原生质膜、原生质膜(plasmalemma)(plasmalemma)等。等。这层质膜构成了细胞质与外环境的反应界面,是细胞这层质膜构成了细胞质与外环境的反应界面,是细胞对所有的胞外刺激产生最初反
13、应的地方。所有的营养对所有的胞外刺激产生最初反应的地方。所有的营养物质都要经过它进入细胞;所有排泄、分泌的分子也物质都要经过它进入细胞;所有排泄、分泌的分子也要通过它排出细胞。要通过它排出细胞。生物膜的基本组成生物膜的基本组成细胞质膜细胞质膜一些非离子小分子如水、尿素、一些非离子小分子如水、尿素、O O2 2、COCO2 2、甘油等,、甘油等,及许多脂溶性分子可以自由通过细胞的质膜。及许多脂溶性分子可以自由通过细胞的质膜。而葡萄糖而葡萄糖(glucose)(glucose)和氨基酸和氨基酸(amino acid)(amino acid)等分子的跨等分子的跨膜运输则需要一些特定的膜蛋白形成的转运
14、系统。膜运输则需要一些特定的膜蛋白形成的转运系统。离子的跨膜运输也需要专门的转运系统,如,离子的跨膜运输也需要专门的转运系统,如,NaNa+-K-K+-ATPATP酶是利用蛋白水解酶是利用蛋白水解ATPATP的能量把的能量把NaNa+运出细胞,把运出细胞,把 K K+运进细胞;运进细胞;CaCa2 2+ATP+ATP酶则是把酶则是把CaCa2+2+泵到胞外。泵到胞外。胰岛素胰岛素(insulin)(insulin)等多肽类激素可以与质膜外表面的等多肽类激素可以与质膜外表面的受体蛋白结合,引起膜内表面的响应,然后将信号传受体蛋白结合,引起膜内表面的响应,然后将信号传递到细胞内。递到细胞内。生物膜
15、的基本组成生物膜的基本组成细胞内膜系统:细胞内膜系统:与原核细胞不同,与原核细胞不同,真核细胞具有复真核细胞具有复杂的内膜系统,杂的内膜系统,即细胞质中有许即细胞质中有许多膜性细胞器多膜性细胞器(membrane-bound(membrane-bound organelle)organelle)。细胞内膜系统细胞内膜系统:线粒体:线粒体 线粒体线粒体(mitochondria)是真核细胞的能量转换系统。是真核细胞的能量转换系统。线粒体具有高度特异化的两层膜结构,即外膜线粒体具有高度特异化的两层膜结构,即外膜(outer membrane)和内膜和内膜(inner membrane),其直径约,
16、其直径约1 1 m m。线粒体外膜含有大量的孔道蛋白线粒体外膜含有大量的孔道蛋白(porin),),它们穿越磷它们穿越磷脂双分子层形成大的水溶性的通道。这些通道对于分子量脂双分子层形成大的水溶性的通道。这些通道对于分子量小于小于10kd10kd的分子是自由通透的。的分子是自由通透的。线粒体内膜以高度折叠的形式形成嵴线粒体内膜以高度折叠的形式形成嵴(cristae)状结构,状结构,以增加总的内表面积。以增加总的内表面积。线粒体内膜蛋白质的含量很高,按线粒体内膜蛋白质的含量很高,按重量计算,蛋白质约占重量计算,蛋白质约占7070,脂类约占,脂类约占3030。内膜上的内膜上的许多蛋白质是与其能量转换
17、功能相关的,一组是呼吸链电许多蛋白质是与其能量转换功能相关的,一组是呼吸链电子传递酶复合体,其功能是引导电子有序地从一个载体蛋子传递酶复合体,其功能是引导电子有序地从一个载体蛋白传递到另一个载体蛋白;另一组是白传递到另一个载体蛋白;另一组是ATPATP合成酶复合体,合成酶复合体,用于催化用于催化ATPATP的合成。的合成。细胞内膜系统细胞内膜系统:溶酶体:溶酶体溶酶体溶酶体(lysosome)是细胞内主要的消化系统,是细胞内主要的消化系统,内含大量内含大量的酸性水解酶的酸性水解酶(包括磷酸酶、硫酸酶、酯酶、蛋白酶和糖包括磷酸酶、硫酸酶、酯酶、蛋白酶和糖苷酶等苷酶等),用于把多肽、多糖、多聚核苷
18、酸、糖脂等水解,用于把多肽、多糖、多聚核苷酸、糖脂等水解成单体。成单体。溶酶体内水解酶的溶酶体内水解酶的最适最适pHpH值为值为5 5,这个低,这个低pHpH值微环境是值微环境是由溶酶体膜上的质子由溶酶体膜上的质子ATPATP酶维持的。酶维持的。待水解的生物大分子通过内吞小泡待水解的生物大分子通过内吞小泡(endocytic compartent)进入溶酶体。进入溶酶体。溶酶体酶在粗面内质网中合成溶酶体酶在粗面内质网中合成,溶酶体在溶酶体在trans Golgi面面形成形成。细胞内膜系统细胞内膜系统:内质网和高尔基体内质网和高尔基体 内质网和高尔基体内质网和高尔基体(Golgi apparat
19、us)的膜将细胞质的膜将细胞质与其围成的腔隔开。与其围成的腔隔开。粗面内质网粗面内质网(rough endoplasmic reticulum)可能直接可能直接与核膜相连与核膜相连,其细胞质面附着着大量的核糖体,是其细胞质面附着着大量的核糖体,是膜膜蛋白合成的场所蛋白合成的场所。滑面内质网滑面内质网(smooth endoplasmic reticulum)则是合则是合成膜脂的场所成膜脂的场所,包括磷脂和胆固醇包括磷脂和胆固醇。滑面内质网与高。滑面内质网与高尔基体的膜上都可以进行尔基体的膜上都可以进行蛋白和脂的糖基化蛋白和脂的糖基化。高尔基体参与蛋白质和脂类的分选与定向运输。高尔基体参与蛋白质
20、和脂类的分选与定向运输。高尔基体还参与蛋白聚糖高尔基体还参与蛋白聚糖(proteoglycans)的合成的合成,参与这些反应的酶也主要集中于参与这些反应的酶也主要集中于trans高尔基体的膜上。高尔基体的膜上。细胞内膜系统细胞内膜系统:膜囊泡膜囊泡细胞内有许许多多的膜囊泡细胞内有许许多多的膜囊泡(membrane(membrane vesicle)vesicle),它们主要参与各种各样的运输,它们主要参与各种各样的运输过程。这些过程。这些膜囊泡将蛋白和脂类运向细胞膜囊泡将蛋白和脂类运向细胞内的特定地点内的特定地点,同时,它们还是胞吐作用,同时,它们还是胞吐作用(exocytosis)(exoc
21、ytosis)和胞吞作用和胞吞作用(endocytosis)(endocytosis)的的载体。载体。细胞内膜系统细胞内膜系统:核膜:核膜 真核生物的遗传物质被核膜真核生物的遗传物质被核膜(nuclear membrane)所所包围包围(细胞处于分裂时除外细胞处于分裂时除外)。核膜由内膜与外膜组成。核膜由内膜与外膜组成。核膜的内外膜是连续的,核膜的内外膜是连续的,这一点与线粒体的内外膜分离是不同的。内核膜上连接这一点与线粒体的内外膜分离是不同的。内核膜上连接着染色质着染色质(chromatin);外核膜表面结合着核糖体外核膜表面结合着核糖体(ribosome),而且其某些区域与内质网,而且其某
22、些区域与内质网(endoplasmic reticulum)膜相连膜相连。核膜上面有核孔。核孔参与调节生物大分子在核基核膜上面有核孔。核孔参与调节生物大分子在核基质与细胞质之间的运输。蛋白进入核内是质与细胞质之间的运输。蛋白进入核内是ATPATP依赖性过依赖性过程,而且还需要特定的氨基酸定位序列。核孔直径约程,而且还需要特定的氨基酸定位序列。核孔直径约nmnm,允许直径,允许直径9nm9nm以下的分子自由通过以下的分子自由通过,说明核孔是有说明核孔是有一定柔性的。一定柔性的。生物膜的基本组成生物膜的基本组成膜与细胞骨架:膜与细胞骨架:细胞骨架可以稳定细胞膜细胞骨架可以稳定细胞膜,维持维持细胞形
23、状。细胞形状。Membrane-attached cytoskeletal networks provide mechanical support to plasma membrane.是维是维持红细胞耐性及变形性的主要组分。持红细胞耐性及变形性的主要组分。SDS polyacrylamide-gel electrophoresisthe proteins in the human red blood cell membrane红细胞膜骨架蛋白:红细胞膜骨架蛋白:血影蛋白血影蛋白(spectrin)锚蛋白(锚蛋白(ankyrin 膜整合带膜整合带3蛋白蛋白(Band 3)血型糖蛋白血型糖蛋白(
24、glycophorin)带带4.1蛋白蛋白(band4.1)肌动蛋白肌动蛋白(actin)Spectrin molecules from human red blood cellsEach spectrin heterodimer consists of two antiparallel polypeptide chains.Spectrin-based cytoskeleton on the cytoplasmic side of the human red blood cell membrane 血影蛋白血影蛋白(spectrin)(spectrin)是红细胞中一种主要的是红细胞中一种主要
25、的膜连接蛋白膜连接蛋白(membrane-associated protein)(membrane-associated protein)。已经有证据表明,血影蛋白可能通过三种方式已经有证据表明,血影蛋白可能通过三种方式非价键的与质膜结合。非价键的与质膜结合。血影蛋白可以通过锚蛋白(血影蛋白可以通过锚蛋白(ankyrinankyrin)与膜)与膜整合蛋白带整合蛋白带3 3蛋白蛋白(Band 3)(Band 3)连接,从而桥连到膜连接,从而桥连到膜上。带上。带3 3蛋白是镶嵌在质膜上的内在蛋白。锚蛋蛋白是镶嵌在质膜上的内在蛋白。锚蛋白的白的N N端与带端与带3 3蛋白结合,其另一端与血影蛋白蛋白
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