第四章生物信息的传递下优秀PPT.ppt
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1、第四章生物信息的传递下第一页,本课件共有49页表核糖体的活性位点活性位点功能组分mRNA结合位点结合mRNA和IF因子S1、S18、S21;及S3、S4、S5、S12 16SrRNA3末端区域P位点结合fMet-tRNA和肽基-tRNAL2、L27及L14、L18、L24、L3316S和23SrRNA3附近区域A位点结合氨酰基-tRNAL1、L5、L7/L12、L20、L30、L3316S和23SrRNA(16S的1400区)E位点结合脱酰tRNA23SrRNA是重要的L5、L18、L25复合体肽酰基转移酶将肽链转移到氨基酰-tRNA上L2、L3、L4、L15、L16 23SrRNA是重要的E
2、F-Tu结合位点氨基酰-tRNA的进入EF-G结合位点移位L7/L12GTP酶需要L7、L12第二页,本课件共有49页4.4 蛋白质合成的生物学机制l已证明核酸是生命体内最基本的物质,因为蛋白质已证明核酸是生命体内最基本的物质,因为蛋白质的合成和结构最终都取决于核酸,但蛋白质仍是生的合成和结构最终都取决于核酸,但蛋白质仍是生物活性物质中最重要的大分子组分,生物有机体的物活性物质中最重要的大分子组分,生物有机体的遗传学特性仍然要通过蛋白质来得到表达。遗传学特性仍然要通过蛋白质来得到表达。l蛋白质的生物合成包括氨基酸活化、肽链的起始、伸长、蛋白质的生物合成包括氨基酸活化、肽链的起始、伸长、终止。终
3、止。第三页,本课件共有49页表表4-12蛋白质合成个阶段的主要成分简表蛋白质合成个阶段的主要成分简表阶段阶段必需组分必需组分1氨基酸的活化氨基酸的活化20种氨基酸种氨基酸20种氨基酰种氨基酰-tRNA合成酶合成酶20种或更多的种或更多的tRNAATP,Mg2+2.肽链的起始肽链的起始mRNAN-甲酰甲硫氨酰甲酰甲硫氨酰-tRNAmRNA上的起始密码子(上的起始密码子(AUG)核糖体小亚基核糖体小亚基核糖体大亚基核糖体大亚基GTP,Mg2+起始因子(起始因子(IF-1,IF-2,IF-3)3肽链的延伸肽链的延伸功能核糖体(起始复合物)功能核糖体(起始复合物)AA-tRNA伸长因子伸长因子GTP,
4、Mg2+肽基转移酶肽基转移酶4肽链的终止肽链的终止ATPmRNA上的终止密码子上的终止密码子释放因子(释放因子(RF-1,RF-2,RF-3)5折叠和加工折叠和加工参与起始氨基酸的切除、修饰等加工过程的酶参与起始氨基酸的切除、修饰等加工过程的酶第四页,本课件共有49页4.4.1 4.4.1 氨基酸的活化氨基酸的活化l氨基酸在进行合成多肽链之前氨基酸在进行合成多肽链之前,必须在氨酰必须在氨酰-tRNA合成酶的作用下生成活化氨基酸合成酶的作用下生成活化氨基酸AA-tRNA。氨基酸氨基酸+tRNA氨基酰氨基酰-tRNAATP AMPPPi氨基酰氨基酰-tRNA合成酶合成酶第五页,本课件共有49页原核
5、生物中,起始氨基酸是:起始AA-tRNA是:真核生物中,起始氨基酸是:起始AA-tRNA是:甲酰甲硫氨酸fMet-tRNAfMet甲硫氨酸Met-tRNAMetMet+tRNAfMet+ATPMet-tRNAfMet+AMP+PPiN10-甲酰四氢叶酸甲酰四氢叶酸+Met-tRNAfMet四氢叶酸四氢叶酸+fMet-tRNAfMet存在存在tRNAMet和和tRNAfMet存在存在tRNAiMet和和tRNAeMet第六页,本课件共有49页4.4.2 4.4.2 翻译的起始翻译的起始l蛋白质合成的起始是指在模板蛋白质合成的起始是指在模板mRNA编码编码区区5端形成核糖体端形成核糖体-mRNA-
6、起始起始tRNA复合复合物并将甲酰甲硫氨酸放入核糖体物并将甲酰甲硫氨酸放入核糖体P位点。位点。l原核生物中原核生物中30S小亚基首先与小亚基首先与mRNA模板相模板相结合,再与结合,再与fMet-tRNAfMet结合,最后与结合,最后与50S大亚基结合大亚基结合第七页,本课件共有49页l真核生物中,真核生物中,40S小亚基首先与小亚基首先与Met-tRNAMet相结合,再与模板相结合,再与模板mRNA结合,最后与结合,最后与60S大亚基结合生成大亚基结合生成80SmRNAMet-tRNAMet起起始复合物。始复合物。l起始复合物的生成除了起始复合物的生成除了GTP外,还需要外,还需要Mg2+、
7、NH4+及及3个起始因子(个起始因子(IF-1、IF-2、IF-3)。)。第八页,本课件共有49页图图4-12翻译起始复合物的形成。翻译起始复合物的形成。第一步,第一步,30S小亚基与翻译起始因小亚基与翻译起始因子子IF-1,IF-3结合,通过结合,通过SD序列与序列与mRNA模板相结合。模板相结合。第二步,第二步,fMet-tRNAfMet在在IF-2的协同的协同下进入小亚基的下进入小亚基的P位,位,tRNA上的反密上的反密码子与码子与mRNA上的起始密码子配对。上的起始密码子配对。第三步,带有第三步,带有tRNA、mRNA、三个、三个翻译起始因子的小亚基复合物与翻译起始因子的小亚基复合物与
8、50S大亚基结合,释放翻译起始因大亚基结合,释放翻译起始因子。子。1.原原核核生生物物翻翻译译的的起起始始第九页,本课件共有49页l30S亚基具有专一性的识别和选择亚基具有专一性的识别和选择mRNA起起始位点的性质,始位点的性质,IF-3协助该亚基完成这种选协助该亚基完成这种选择。择。lShine及及Dalgarno等证明几乎所有原核生物等证明几乎所有原核生物mRNA上都有一个上都有一个5-AGGAGGU-3序列,序列,这个富嘌呤区与这个富嘌呤区与30S亚基上亚基上16SrRNA3末端末端的富嘧啶区的富嘧啶区5-GAUCACCUCCUUA-3相互相互补。补。第十页,本课件共有49页SD序列(S
9、hine-Dalgarno sequence)l l存在于原核生物起始密码子存在于原核生物起始密码子AUG上游上游712个核苷酸处的一种个核苷酸处的一种47个核苷酸的保个核苷酸的保守片段,它与守片段,它与16SrRNA3端反向互补,端反向互补,所以可将所以可将mRNA的的AUG起始密码子置于起始密码子置于核糖体的适当位置以便起始翻译作用。核糖体的适当位置以便起始翻译作用。根据首次识别其功能意义的科学家命名。根据首次识别其功能意义的科学家命名。第十一页,本课件共有49页图图4-14细菌细菌mRNA分子上往往存在一个与分子上往往存在一个与16SrRNA3末端相互补的末端相互补的SD序列。序列。第十
10、二页,本课件共有49页l细菌核糖体上一般存在三个与氨基酰细菌核糖体上一般存在三个与氨基酰-tRNA结合的位点,即结合的位点,即A位点(位点(aminoacylsite),),P位点(位点(peptidylsit)和)和E位点位点(Exitsite)。只有)。只有fMet-tRNAfMet能与第能与第一个一个P位点相结合,其它所有位点相结合,其它所有tRNA都必都必须通过须通过A位点到达位点到达P位点,再由位点,再由E位点离位点离开核糖体。开核糖体。第十三页,本课件共有49页三种起始因子三种起始因子 IF-1IF-1 IF-2 IF-2 IF-3IF-3l l辅助辅助辅助辅助IF-3IF-3IF
11、-3IF-3l l70S70S70S70S起始复合物生成后促进起始复合物生成后促进起始复合物生成后促进起始复合物生成后促进IF-2IF-2IF-2IF-2释放释放释放释放l l有有有有GTPGTPGTPGTP酶活性酶活性酶活性酶活性l l特异识别特异识别特异识别特异识别fmet-tRNAfmet-tRNAfmet-tRNAfmet-tRNAfmetfmetfmetfmetl l形成形成形成形成fmet-tRNAfmet-tRNAfmet-tRNAfmet-tRNAfmetfmetfmetfmet-IF-2-GTP-IF-2-GTP-IF-2-GTP-IF-2-GTPl l是是是是30S30S3
12、0S30S起始复合物与起始复合物与起始复合物与起始复合物与50S50S50S50S亚基连接所必须亚基连接所必须亚基连接所必须亚基连接所必须l l促进促进促进促进30S30S30S30S小亚基结合小亚基结合小亚基结合小亚基结合mRNAmRNAmRNAmRNAl l终止时:促使核糖体解离终止时:促使核糖体解离终止时:促使核糖体解离终止时:促使核糖体解离第十四页,本课件共有49页2.真核生物翻译的起始l真核生物蛋白质生物合成的起始基本与原核生物相同,只不过其核糖体较大,有较多的起始因子,mRNA具有m7GpppNp帽子结构,Met-tRNAMet不甲酰化,mRNA分子5端的“帽子”和3端的多聚A都参
13、与形成翻译起始复合物(图4-14)。第十五页,本课件共有49页图图4-14真核生物翻译起始复合物的形成。真核生物翻译起始复合物的形成。第十六页,本课件共有49页 除了帽子结构以外,除了帽子结构以外,除了帽子结构以外,除了帽子结构以外,40S40S40S40S小亚基还能识别小亚基还能识别mRNAmRNAmRNAmRNA上的上的起始密码子起始密码子AUGAUG。KozakKozak等提出了一个等提出了一个“扫描模型扫描模型扫描模型扫描模型”来来解释解释40S40S亚基对亚基对mRNAmRNA起始密码子的识别作用。按照这个起始密码子的识别作用。按照这个模型,模型,40S40S40S40S小亚基先结合
14、在小亚基先结合在小亚基先结合在小亚基先结合在mRNA5mRNA5 端的任何序列上,端的任何序列上,然后沿然后沿mRNAmRNAmRNAmRNA移动直至遇到移动直至遇到AUGAUG发生较为稳定的相互作用,发生较为稳定的相互作用,最后与最后与60S60S60S60S亚基一道生成亚基一道生成80S80S80S80S起始复合物。起始复合物。起始复合物。起始复合物。40S40S小亚基之所以能在小亚基之所以能在AUGAUG处停下,可能是由于处停下,可能是由于Met-tRNAiMet-tRNAiMet-tRNAiMet-tRNAiMetMetMetMet的反密码子与的反密码子与的反密码子与的反密码子与AUG
15、AUG配对的结果。配对的结果。第十七页,本课件共有49页真核生物与原核生物翻译起始的差异真核生物与原核生物翻译起始的差异:起始起始Met-tRNAiMet不需甲酰化;不需甲酰化;起始因子为起始因子为eIF,且种类多;,且种类多;小亚基先与小亚基先与Met-tRNAiMet结合,再与结合,再与mRNA结合;结合;核糖体不同核糖体不同mRNA与与40s亚基的结合依靠亚基的结合依靠帽子结合蛋白帽子结合蛋白(eIF-4E)与)与mRNA帽子结构的识别结合。帽子结构的识别结合。(6)模板不同,模板不同,5端有帽子,端有帽子,3端有端有poly(A)第十八页,本课件共有49页4.4.3肽链的延伸肽链的延伸
16、l生成起始复合物,第一个氨基酸(生成起始复合物,第一个氨基酸(fMet/Met-tRNA)与核糖体结合以后,肽链开始伸长。按照)与核糖体结合以后,肽链开始伸长。按照mRNA模板密码子的排列,氨基酸通过新生肽键模板密码子的排列,氨基酸通过新生肽键的方式(图的方式(图4-16)被有序地结合上去。)被有序地结合上去。l肽链延伸中的每个循环都包括肽链延伸中的每个循环都包括lAA-tRNA与核糖体结合与核糖体结合l肽键的生成肽键的生成l移位移位第十九页,本课件共有49页图图图图4-164-16多肽链上肽键的形成多肽链上肽键的形成多肽链上肽键的形成多肽链上肽键的形成缩合反应。缩合反应。缩合反应。缩合反应。
17、第二十页,本课件共有49页 4.4.3.1 4.4.3.1后续后续AA-tRNAAA-tRNA与核糖体结合(与核糖体结合(进位进位)第二十一页,本课件共有49页l图4-17细菌中肽链延伸的第一步反应:第二个氨基酰-tRNA的结合。该氨基酰-tRNA首先与EF-TuGTP形成复合物,进入核糖体的A位,水解产生GDP并在EF-Ts的作用下释放GDP并使EF-Tu结合另一分子GTP,进入新一轮循环。第二十二页,本课件共有49页l l由于由于EF-Tu只能与只能与fMet-tRNA以外的其他以外的其他AA-tRNA起反应,所以起始起反应,所以起始tRNA不会被不会被结合到结合到A位上,位上,mRNA内
18、部的内部的AUG不会不会被起始被起始tRNA读出,肽链中间不会出现甲读出,肽链中间不会出现甲酰甲硫氨酸。酰甲硫氨酸。第二十三页,本课件共有49页4.4.3.24.4.3.2肽肽键的生成键的生成(转肽转肽)l l图图4-18细菌中肽链细菌中肽链延伸的第二步反应:延伸的第二步反应:肽键的生成。肽键的生成。第二十四页,本课件共有49页l l在核糖体在核糖体mRNAAA-tRNA复合物中,复合物中,AA-tRNA占据占据A位,位,fMet-tRNAfMet占据占据P位。位。l l在在50S亚基上肽基转移酶(亚基上肽基转移酶(peptidyltransferase)的催化下,)的催化下,P位的肽(氨)位
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