RNA的生物合成精选课件.ppt
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1、目目 录录关于RNA的生物合成第一页,本课件共有103页目目 录录转录转录 (transcription)生物体以生物体以DNA为模板合成为模板合成RNA的过程的过程 。转转录录RNADNA 第二页,本课件共有103页目目 录录复制和转录的区别复制和转录的区别 第三页,本课件共有103页目目 录录参与转录的物质参与转录的物质原料原料:NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)模板模板:DNA酶酶:RNA聚合酶聚合酶(RNA polymerase,RNA-pol)其他蛋白质因子其他蛋白质因子第四页,本课件共有103页目目 录录模板和酶模板和酶Templates and Enzymes第一节第一节第
2、五页,本课件共有103页目目 录录一、转录模板一、转录模板 lDNA分分子子上上转转录录出出RNA的的区区段段,称称为为结结构构基基因因(structural gene)。lDNA双双链链中中按按碱碱基基配配对对规规律律能能指指引引转转录录生生成成RNA的的一一股股单单链链,称称为为模模板板链链(template strand),相相对对的的另另一股单链是一股单链是编码链编码链(coding strand)。第六页,本课件共有103页目目 录录5GCAGTACATGTC 33 c g t g a t g t a c a g 55GCAGUACAUGUC 3NAla Val His Val C编
3、码链编码链模板链模板链mRNA蛋白质蛋白质转录转录翻译翻译第七页,本课件共有103页目目 录录5 5 3 3 3 3 5 5 模板链模板链编码链编码链编码链编码链模板链模板链结构基因结构基因转录方向转录方向转录方向转录方向第八页,本课件共有103页目目 录录不对称转录不对称转录(asymmetric transcription)在在DNA分子双链上某一区段,一股链用作模板分子双链上某一区段,一股链用作模板指引转录,另一股链不转录指引转录,另一股链不转录;模板链并非永远在同一条单链上。模板链并非永远在同一条单链上。第九页,本课件共有103页目目 录录二、二、RNA聚合酶聚合酶(一)原核生物的(一
4、)原核生物的RNA聚合酶聚合酶第十页,本课件共有103页目目 录录核心酶核心酶(core enzyme)全酶全酶(holoenzyme)第十一页,本课件共有103页目目 录录RNA聚合酶全酶在转录起始区的结合聚合酶全酶在转录起始区的结合 第十二页,本课件共有103页目目 录录(二)真核生物的(二)真核生物的RNA聚合酶聚合酶 第十三页,本课件共有103页目目 录录三、模板上酶的辨认、结合三、模板上酶的辨认、结合原原核核生生物物一一个个转转录录区区段段可可视视为为一一个个转转录录单单位位,称称为为操操纵纵子子(operon),包包括括若若干干个个结结构构基基因因及及其上游其上游(upstream
5、)的的调控序列调控序列。5 3 3 5 结构基因结构基因调控序列调控序列RNA-polRNA聚合酶结合模板聚合酶结合模板DNA的部位,称为的部位,称为启动启动子子(promoter)。第十四页,本课件共有103页RNA聚合酶聚合酶保护法保护法目目 录录第十五页,本课件共有103页目目 录录开始转录开始转录T T G A C AA A C T G T-35 区区(Pribnow box)T A T A A T Pu A T A T T A Py-10 区区1-30-5010-10-40-205 3 3 5 原核生物启动子保守序列原核生物启动子保守序列RNA-pol辨认位点辨认位点(recogni
6、tion site)5 5 RNA聚合酶保护区聚合酶保护区结构基因结构基因3 3 第十六页,本课件共有103页目目 录录 TATA盒盒 CAAT盒盒 GC盒盒 增强子增强子 顺式作用元件顺式作用元件 结构基因结构基因-GCGC-CAAT-TATA转录起始转录起始真核生物启动子保守序列真核生物启动子保守序列第十七页,本课件共有103页目目 录录转录过程转录过程The Process of Transcription 第二节第二节 第十八页,本课件共有103页目目 录录(一)转录起始(一)转录起始转录起始需解决两个问题:转录起始需解决两个问题:1.RNA聚合酶必须准确地结合在转录模板的起聚合酶必须
7、准确地结合在转录模板的起始区域。始区域。2.DNA双链解开,使其中的一条链作为转录双链解开,使其中的一条链作为转录的模板。的模板。一、原核生物的转录过程一、原核生物的转录过程第十九页,本课件共有103页2.DNA双链解开双链解开1.RNA聚合酶全酶聚合酶全酶(2)与模板结合与模板结合 3.在在RNA聚合酶作用下发生第一次聚合反应,形成聚合酶作用下发生第一次聚合反应,形成转录起始复合物转录起始复合物RNApol(2)-DNA-pppGpN-OH 3 转录起始复合物转录起始复合物:5-pppG-OH +NTP 5-pppGpN-OH 3 +ppi转录起始过程转录起始过程第二十页,本课件共有103页
8、目目 录录(二)转录延长(二)转录延长1.亚基脱落,亚基脱落,RNApol聚合酶核心酶变构,与聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着模板结合松弛,沿着DNA模板前移;模板前移;2.在在核心酶核心酶作用下,作用下,NTP不断聚合,不断聚合,RNA链不链不断延长。断延长。(NMP)n +NTP (NMP)n+1 +PPi第二十一页,本课件共有103页转录空泡转录空泡(transcription bubble):RNA-pol(核心酶)(核心酶)DNA RNA目目 录录第二十二页,本课件共有103页目目 录录第二十三页,本课件共有103页目目 录录5 3 DNA原核生物转录过程中的羽毛状现象原核生物
9、转录过程中的羽毛状现象核糖体核糖体RNARNA聚合酶聚合酶第二十四页,本课件共有103页目目 录录依赖依赖Rho()因子的转录终止因子的转录终止非依赖非依赖Rho因子的转录终止因子的转录终止(三)转录终止(三)转录终止指指RNA聚聚合合酶酶在在DNA模模板板上上停停顿顿下下来来不不再再前前进,转录产物进,转录产物RNA链从转录复合物上脱落下来。链从转录复合物上脱落下来。分类分类第二十五页,本课件共有103页目目 录录A T P1.依赖依赖 Rho因子的转录终止因子的转录终止第二十六页,本课件共有103页目目 录录2.非依赖非依赖 Rho因子的转录终止因子的转录终止DNADNA模模板板上上靠靠近
10、近终终止止处处,有有些些特特殊殊的的碱碱基基序序列列,转转录录出出RNARNA后后,RNARNA产产物物形形成成特特殊殊的的结结构构来来终终止止转录。转录。第二十七页,本课件共有103页目目 录录5UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU.3 5UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU.3 RNA 5 TTGCAGCCTGACAAATCAGGCTGATGGCTGGTGACTTTTTAGTCACCAGCCTTTTT.3 DNA UUUU.UUUU.5UU
11、GCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAGUCACCAGCCUUUUU.3茎环茎环(stem-loop)/发夹发夹(hairpin)结构结构第二十八页,本课件共有103页目目 录录茎环结构使转录终止的机理茎环结构使转录终止的机理 使使RNA聚合酶变构,转录停顿;聚合酶变构,转录停顿;使转录复合物趋于解离,使转录复合物趋于解离,RNA产物释放。产物释放。5pppG5 3 3 5 RNA-pol第二十九页,本课件共有103页目目 录录二、真核生物的转录起始二、真核生物的转录起始(一)转录起始(一)转录起始真真核核生生物物的的转转录录起起始始上上游游区区段段比比
12、原原核核生生物物多多样样化化,转转录录起起始始时时,RNA-polRNA-pol不不直直接接结结合合模模板板,其其起起始过程比原核生物复杂。始过程比原核生物复杂。第三十页,本课件共有103页目目 录录转录起始点转录起始点TATA盒盒CAAT盒盒GC盒盒 增强子增强子顺式作用元件顺式作用元件(cis-acting element)1.转录起始前的上游区段转录起始前的上游区段 AATAAA切离加尾切离加尾 转录终止点转录终止点 修饰点修饰点 外显子外显子 翻译起始点翻译起始点内内含含子子 OCT-1 OCT-1:ATTTGCAT八聚体八聚体第三十一页,本课件共有103页目目 录录2.转录因子转录因
13、子 能能直直接接、间间接接辨辨认认和和结结合合转转录录上上游游区区段段DNADNA的的蛋蛋白白质质,现现已已发发现现数数百百种种,统统称称为为反反式式作作用用因子因子(trans-acting factors)(trans-acting factors)。反式作用因子中,直接或间接结合反式作用因子中,直接或间接结合RNARNA聚合聚合酶的,则称为酶的,则称为转录因子转录因子(transcriptional(transcriptional factors,TF)factors,TF)。第三十二页,本课件共有103页目目 录录参与参与RNA-pol转录的转录的TF 第三十三页,本课件共有103页目
14、目 录录3.转录起始前复合物转录起始前复合物(pre-initiation complex,PIC)真核生物真核生物RNA-polRNA-pol不与不与DNADNA分子直接结合,分子直接结合,而需依靠众多的转录因子。而需依靠众多的转录因子。第三十四页,本课件共有103页目目 录录POL-TFFAB由由RNA-Pol 催化转录的催化转录的PIC POL-TFFHETBPTAFTFD-A-B-DNA复合物复合物TATAABTBPTAFTATAHECTD-PPIC组装完成,组装完成,TFH使使CTD磷酸化磷酸化第三十五页,本课件共有103页目目 录录4.4.模板理论模板理论(piecing theo
15、ry)(piecing theory)一一个个真真核核生生物物基基因因的的转转录录需需要要3 3至至5 5个个转转录录因因子子。转转录录因因子子之之间间互互相相结结合合,生生成成有有活活性性,有有专专一一性性的的复复合合物物,再再与与RNARNA聚聚合合酶酶搭搭配配而而有有针对性地结合、转录相应的基因。针对性地结合、转录相应的基因。第三十六页,本课件共有103页目目 录录(二)转录延长(二)转录延长真核生物转录延长过程与原核生物大致相真核生物转录延长过程与原核生物大致相似,但因有核膜相隔,没有转录与翻译同步的似,但因有核膜相隔,没有转录与翻译同步的现象。现象。RNA-polRNA-pol前移处
16、处都遇上核小体。前移处处都遇上核小体。转录延长过程中可以观察到核小体移位和解聚转录延长过程中可以观察到核小体移位和解聚现象。现象。第三十七页,本课件共有103页目目 录录RNA-PolRNA-PolRNA-Pol核小体核小体转转录录延延长长中中的的核核小小体体移移位位转录方向转录方向第三十八页,本课件共有103页目目 录录5-AAUAAA-5 -AAUAAA-核酸酶核酸酶-GUGUGUGRNA-polAATAAA GTGTGTG转录终止的修饰点转录终止的修饰点5 5 3 3 3 3 加尾加尾AAAAAAA 3 mRNA(三)转录终止(三)转录终止 和转录后修饰密切相关。和转录后修饰密切相关。第
17、三十九页,本课件共有103页目目 录录真核生物的转录后修饰真核生物的转录后修饰Post-transcriptional Modification第三节第三节第四十页,本课件共有103页目目 录录几种主要的修饰方式几种主要的修饰方式1.剪接剪接(splicing)2.剪切剪切(cleavage)3.修饰修饰(modification)4.添加添加(addition)第四十一页,本课件共有103页目目 录录一、真核生物一、真核生物mRNA的转录后加工的转录后加工(一)首、尾的修饰(一)首、尾的修饰 5 端形成端形成 帽子结构帽子结构(m7GpppGp)3 3 端加上端加上多聚腺苷酸尾巴多聚腺苷酸尾
18、巴(poly A tail)(poly A tail)第四十二页,本课件共有103页目目 录录帽子结构帽子结构第四十三页,本课件共有103页目目 录录5 pppGp5 GpppGppppG ppi鸟苷酸鸟苷酸转移酶转移酶5 m7GpppGp甲基转移酶甲基转移酶SAM帽帽子子结结构构的的生生成成5 ppGp磷酸酶磷酸酶 Pi第四十四页,本课件共有103页目目 录录(二)(二)mRNA的剪接的剪接1.hnRNA 和和 snRNA 核内的初级核内的初级mRNA称为称为核不均一核不均一RNA(hetero-nuclear RNA,hnRNA)snRNA(small nuclear RNA)核内的蛋白质
19、核内的蛋白质小分子核糖核酸蛋白体小分子核糖核酸蛋白体(并接体(并接体,splicesome)snRNA第四十五页,本课件共有103页目目 录录真核生物结构基因,由若干个编码区和非编真核生物结构基因,由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成,去除非编码码区互相间隔开但又连续镶嵌而成,去除非编码区再连接后,可翻译出由连续氨基酸组成的完整区再连接后,可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质,这些基因称为断裂基因。蛋白质,这些基因称为断裂基因。断裂基因断裂基因(splite gene)CABD编码区编码区 A、B、C、D非编码区非编码区第四十六页,本课件共有103页目目 录录2.外显子外显子(e
20、xon)和内含子和内含子(intron)外显子外显子在断裂基因及其初级转录产物上出现,并在断裂基因及其初级转录产物上出现,并表达为成熟表达为成熟RNA的核酸序列。的核酸序列。内含子内含子隔断基因的线性表达而在剪接过程中被隔断基因的线性表达而在剪接过程中被除去的核酸序列。除去的核酸序列。第四十七页,本课件共有103页鸡卵清蛋白基鸡卵清蛋白基因因hnRNA首、尾修饰首、尾修饰hnRNA剪接剪接成熟的成熟的mRNA鸡鸡卵卵清清蛋蛋白白基基因因及及其其转转录、录、转转录录后后修修饰饰目目 录录第四十八页,本课件共有103页鸡卵清蛋白成熟鸡卵清蛋白成熟mRNA与与DNA杂交电镜图杂交电镜图DNAmRNA
21、目目 录录第四十九页,本课件共有103页目目 录录3.内含子的分类内含子的分类 根据基因的类型和剪接的方式,通常把内含子分根据基因的类型和剪接的方式,通常把内含子分为为4 4类。类。I I:主主要要存存在在于于线线粒粒体体、叶叶绿绿体体及及某某些些低低等等真真核生物的核生物的 rRNArRNA基因;基因;IIII:也也发发现现于于线线粒粒体体、叶叶绿绿体体,转转录录产产物物是是mRNAmRNA;IIIIII:是是常常见见的的形形成成套套索索结结构构后后剪剪接接,大大多多数数mRNAmRNA基因有此类内含子;基因有此类内含子;IVIV:是是tRNAtRNA基基因因及及其其初初级级转转录录产产物物
22、中中的的内内含含子子,剪接过程需酶及剪接过程需酶及ATPATP。第五十页,本课件共有103页4.mRNA的剪接的剪接 除去除去hnRNA中的内含子,将外显子连接。中的内含子,将外显子连接。snRNP与与hnRNA结合成为并接体结合成为并接体目目 录录第五十一页,本课件共有103页目目 录录UACUACA-AGUGU4U5U6E1E2U1U2UACUACA-AGUGU6E1E2U1、U4、U5第五十二页,本课件共有103页目目 录录pG-OH(ppG-OH,pppG-OH)U-OHGpUpGpA第一次转酯反应第一次转酯反应第二次转酯反应第二次转酯反应UpAGpU外显子外显子1内含子内含子外显子外
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