绪论蛋白质的结构和功能09级.ppt
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1、目目 录录 延安大学医学院延安大学医学院 生物化学教研室生物化学教研室 主讲 许静洪教授目目 录录 生物化学生命的化学,应用化学的理论、技术及生命的化学,应用化学的理论、技术及物理学、免疫学等原理和方法研究生物物理学、免疫学等原理和方法研究生物体(植物、动物、微生物、人体等)的体(植物、动物、微生物、人体等)的化学组成和生命过程中化学变化规律的化学组成和生命过程中化学变化规律的一门基础生命科学。一门基础生命科学。目目 录录分子生物学分子生物学 是从生物化学、生物物理学、是从生物化学、生物物理学、遗传学、微生物学等多种学科经过相互杂遗传学、微生物学等多种学科经过相互杂交、相互渗透而形成的,主要研
2、究核酸和交、相互渗透而形成的,主要研究核酸和蛋白质等生物大分子的结构及其在遗传信蛋白质等生物大分子的结构及其在遗传信息传递和细胞信息转导过程中的作用。息传递和细胞信息转导过程中的作用。目目 录录生物化学发展史:生物化学发展史:叙述生物化学阶段叙述生物化学阶段(2020世纪世纪2020年代以前)年代以前)以分析和研究组成生物体的成分及生物以分析和研究组成生物体的成分及生物体的分泌物和排泄物为主。体的分泌物和排泄物为主。动态生物化学阶段动态生物化学阶段(2020世纪世纪2020年代至年代至5050年代)年代)主要研究体内各种物质的合成和分解途主要研究体内各种物质的合成和分解途径及动态平衡。径及动态
3、平衡。机能生物化学阶段机能生物化学阶段(近(近5050多年)多年)探讨生物大分子的结构和机能的关系。探讨生物大分子的结构和机能的关系。目目 录录第第 一一 篇篇 生物大分子的结构与功能生物大分子的结构与功能 构件分子构件分子 生物大分子生物大分子 细胞器细胞器 细胞细胞 组织器官组织器官 生物体生物体 目目 录录蛋白质的结构与功能蛋白质的结构与功能第第 一一 章章Structure and Function of Protein目目 录录一、什么是蛋白质一、什么是蛋白质?蛋蛋白白质质(protein)(protein)是是由由许许多多氨氨基基酸酸(amino(amino acids)acids
4、)通通过过肽肽键键(peptide(peptide bond)bond)相相连形成的高分子含氮化合物。连形成的高分子含氮化合物。目目 录录二、蛋白质的生物学重要性二、蛋白质的生物学重要性1.1.蛋白质是生物体重要组成成分蛋白质是生物体重要组成成分分分布布广广:所所有有器器官官、组组织织都都含含有有蛋蛋白白质质;细胞的各个部分都含有蛋白质。细胞的各个部分都含有蛋白质。含含量量高高:是是细细胞胞内内最最丰丰富富的的有有机机分分子子,占占人人体体干干重重的的4545,某某些些组组织织含含量量更更高高,例如脾、肺及横纹肌等高达例如脾、肺及横纹肌等高达8080。目目 录录1 1)作为生物催化剂(酶)作为
5、生物催化剂(酶)2 2)代谢调节作用)代谢调节作用3 3)免疫保护作用)免疫保护作用4 4)物质的转运和存储)物质的转运和存储5 5)运动与支持作用)运动与支持作用6 6)参与细胞间信息传递)参与细胞间信息传递2.2.蛋白质重要的蛋白质重要的生物学功能生物学功能3.3.氧化供能氧化供能目目 录录蛋蛋 白白 质质 的的 分分 子子 组组 成成The Molecular Component of Protein第第 一一 节节目目 录录 组成蛋白质的元素组成蛋白质的元素 主要有主要有C C、H H、O O、N N和和S S。有些蛋白质含有少量有些蛋白质含有少量磷磷或金属元素或金属元素铁、铜、锌、锰
6、、钴铁、铜、锌、锰、钴、钼钼,个别蛋白质,个别蛋白质还含有还含有碘碘 。目目 录录 各种蛋白质的含氮量很接近,平均为各种蛋白质的含氮量很接近,平均为1616 由由于于体体内内的的含含氮氮物物质质以以蛋蛋白白质质为为主主,因因此此,只只要要测测定定生生物物样样品品中中的的含含氮氮量量,就就可可以以根据以下公式推算出蛋白质的大致含量:根据以下公式推算出蛋白质的大致含量:100克样品中蛋白质的含量克样品中蛋白质的含量(g%)=每克样品含氮克数每克样品含氮克数 6.251001/16%蛋白质元素组成的特点蛋白质元素组成的特点目目 录录一、氨基酸一、氨基酸 组成蛋白质的基本单位组成蛋白质的基本单位存存在
7、在自自然然界界中中的的氨氨基基酸酸有有300300余余种种,但但组组成成人人体体蛋蛋白白质质的的氨氨基基酸酸仅仅有有2020种种,且均属且均属 L-L-氨基酸氨基酸(甘氨酸除外)。(甘氨酸除外)。目目 录录H甘氨酸甘氨酸CH3丙氨酸丙氨酸L-L-氨基酸的通式氨基酸的通式R目目 录录极性中性氨基酸极性中性氨基酸非极性疏水性氨基酸非极性疏水性氨基酸酸性氨基酸酸性氨基酸碱性氨基酸碱性氨基酸(一)氨基酸的分类(一)氨基酸的分类目目 录录甘氨酸甘氨酸 glycine Gly G 5.97丙氨酸丙氨酸 alanine Ala A 6.00缬氨酸缬氨酸 valine Val V 5.96亮氨酸亮氨酸 leu
8、cine Leu L 5.98 异亮氨酸异亮氨酸 isoleucine Ile I 6.02 苯丙氨酸苯丙氨酸 phenylalanine Phe F 5.48脯氨酸脯氨酸 proline Pro P 6.301.非极性疏水性氨基酸非极性疏水性氨基酸目目 录录目目 录录色氨酸色氨酸 tryptophan Try W 5.89丝氨酸丝氨酸 serine Ser S 5.68酪氨酸酪氨酸 tyrosine Tyr Y 5.66 半胱氨酸半胱氨酸 cysteine Cys C 5.07 蛋氨酸蛋氨酸 methionine Met M 5.74天冬酰胺天冬酰胺 asparagine Asn N 5.4
9、1 谷氨酰胺谷氨酰胺 glutamine Gln Q 5.65 苏氨酸苏氨酸 threonine Thr T 5.602.2.极性中性氨基酸极性中性氨基酸目目 录录目目 录录天冬氨酸天冬氨酸 aspartic acid Asp D 2.97谷氨酸谷氨酸 glutamic acid Glu E 3.22赖氨酸赖氨酸 lysine Lys K 9.74精氨酸精氨酸 arginine Arg R 10.76组氨酸组氨酸 histidine His H 7.593.3.酸性氨基酸酸性氨基酸4.4.碱性氨基酸碱性氨基酸目目 录录目目 录录几种特殊氨基酸几种特殊氨基酸 脯氨酸脯氨酸(亚氨基酸)(亚氨基酸)
10、目目 录录 半胱氨酸半胱氨酸 +胱氨酸胱氨酸二硫键二硫键-HH目目 录录(二)氨基酸的理化性质(二)氨基酸的理化性质1.1.两性解离及等电点两性解离及等电点氨基酸是两性电解质,其解离程度氨基酸是两性电解质,其解离程度和带电性质取决于其所处溶液的酸碱度。和带电性质取决于其所处溶液的酸碱度。等电点等电点(isoelectricisoelectric point,pI)point,pI)在在某某一一pHpH的的溶溶液液中中,氨氨基基酸酸解解离离成成阳阳离离子子和和阴阴离离子子的的趋趋势势及及程程度度相相等等,成成为为兼兼性性离离子子,呈呈电电中中性性。此此时时溶溶液液的的pHpH值值称为该氨基酸的称
11、为该氨基酸的等电点等电点。目目 录录pH=pI+OH-pHpI+H+OH-+H+pHpI氨基酸兼性离子氨基酸兼性离子 阳离子阳离子阴离子阴离子目目 录录2.2.紫外吸收紫外吸收 色氨酸、酪氨酸色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰分别的最大吸收峰分别280nm280nm和和275nm275nm 附近附近。大大多多数数蛋蛋白白质质含含有有这这两两种种氨氨基基酸酸残残基基,所所以以测测定定蛋蛋白白质质溶溶液液280nm280nm的的光光吸吸收收值值是是分分析析溶溶液液中中蛋蛋白白质质含含量的快速简便的方法。量的快速简便的方法。目目 录录3.3.茚三酮反应茚三酮反应 氨氨基基酸酸与与茚茚三三酮酮水水合合物物共共
12、热热,可可生生成成蓝蓝紫紫色色化化合合物物,其其最最大大吸吸收收峰峰在在570nm570nm处处。由由于于此此吸吸收收峰峰值值与与氨氨基基酸酸的的含含量量存存在在正正比比关关系系,因因此此可可作作为为氨氨基基酸酸定量分析方法。定量分析方法。目目 录录二、二、肽肽 肽肽键键(peptide(peptide bond)bond)是是由由一一个个氨氨基基酸酸的的-羧羧基基与与另另一一个个氨氨基基酸酸的的-氨氨基基脱水缩合而形成的化学键。脱水缩合而形成的化学键。(一)肽(一)肽(peptide)(peptide)目目 录录+-HOH甘氨酰甘氨酸甘氨酰甘氨酸肽键目目 录录 肽肽是由氨基酸通过肽键缩合而形
13、成的是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物。化合物。两分子氨基酸缩合形成两分子氨基酸缩合形成二肽二肽,三分子,三分子氨基酸缩合则形成氨基酸缩合则形成三肽三肽 肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团不全,被称为团不全,被称为氨基酸残基氨基酸残基(residue)(residue)。由十个以内氨基酸相连而成的肽称为由十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡肽寡肽(oligopeptideoligopeptide),由更多的氨基由更多的氨基酸相连形成的肽称酸相连形成的肽称多肽多肽(polypeptide)(polypeptide)。目目 录录N N 末端:有末端:有自由氨基自由
14、氨基的一端的一端C C 末端:有末端:有自由羧基自由羧基的一端的一端多肽链有两端多肽链有两端 多多肽肽链链(polypeptide(polypeptide chain)chain)是是指指许许多多氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。目目 录录N末端末端C末端末端牛核糖核酸酶牛核糖核酸酶目目 录录(二)(二)几种生物活性肽几种生物活性肽 1.1.谷胱甘肽谷胱甘肽(glutathione,GSH)(glutathione,GSH)目目 录录GSH过氧过氧化物酶化物酶H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSH还原酶还原酶NADPH+H+NADP+目目 录录体内
15、许多激素属寡肽或多肽体内许多激素属寡肽或多肽 神经肽神经肽(neuropeptideneuropeptide)2.2.多肽类激素及神经肽多肽类激素及神经肽目目 录录蛋蛋 白白 质质 的的 分分 子子 结结 构构The Molecular Structure of Protein 第第 二二 节节目目 录录蛋白质的分子结构包括蛋白质的分子结构包括 一级结构一级结构(primary structure)(primary structure)二级结构二级结构(secondary structure)(secondary structure)三级结构三级结构(tertiary structure)(t
16、ertiary structure)四级结构四级结构(quaternary structure)(quaternary structure)高高 级级 结结 构构目目 录录定义定义 指多肽链中氨基酸的排列顺序。指多肽链中氨基酸的排列顺序。一、蛋白质的一级结构一、蛋白质的一级结构主要的化学键主要的化学键 肽键肽键,有些蛋白质还包括二硫键。,有些蛋白质还包括二硫键。一级结构是蛋白质空间构象和特异生一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础。物学功能的基础。目目 录录目目 录录二、蛋白质的二级结构二、蛋白质的二级结构 蛋蛋白白质质分分子子中中某某一一段段肽肽链链的的局局部部空空间间结结构构,即即
17、该该段段肽肽链链主主链链骨骨架架原原子子的的相相对对空空间间位位置置,并并不不涉涉及及氨氨基基酸酸残残基侧链的构象基侧链的构象。定义定义 主要的化学键:主要的化学键:氢键氢键 目目 录录(一)肽单元(一)肽单元参参与与肽肽键键的的6 6个个原原子子C C 1 1、C C、O O、N N、H H、C C 2 2位位于于同同一一平平面面,C C 1 1和和C C 2 2在在平平面面上上所所处处的的位位置置为为反反式式(trans)(trans)构构型型,此此同同一一平平面面上上的的6 6个个原原子子构构成成了了所所谓谓的的肽肽单单元元 (peptide unit)peptide unit)。目目
18、录录 蛋白质二级结构的主要形式蛋白质二级结构的主要形式 -螺旋螺旋 (-helix)-helix)-折叠折叠 (-pleated sheet)-pleated sheet)-转角转角 (-turn)-turn)无规卷曲无规卷曲 (random coil)(random coil)(二)(二)-螺旋螺旋目目 录录目目 录录(三)(三)-折叠折叠目目 录录(四)(四)-转角和无规卷曲转角和无规卷曲-转角转角无规卷曲是指没有规律性的那部分肽无规卷曲是指没有规律性的那部分肽链结构。链结构。目目 录录(五)模体(五)模体在许多蛋白质分子中,可发现二个在许多蛋白质分子中,可发现二个或三个具有二级结构的肽段
19、,在空间上或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个具有特殊功能的空相互接近,形成一个具有特殊功能的空间构象,被称为模体间构象,被称为模体(motif)(motif)。目目 录录钙结合蛋白中结钙结合蛋白中结合钙离子的模体合钙离子的模体 锌指结构锌指结构 目目 录录三、蛋白质的三级结构三、蛋白质的三级结构疏水键、离子键、氢键等。疏水键、离子键、氢键等。主要的化学键主要的化学键整条肽链中全部氨基酸残基的相对空整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置间位置,即肽链中所有原子在三维空间的即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。排布位置。(一)(一)定义定义 目目 录录目目 录录肌红蛋白肌红蛋白
20、(Mb)(Mb)N 端端 C端端目目 录录纤连蛋白分子的结构域纤连蛋白分子的结构域 (二)结构域(二)结构域大分子蛋白质的三级结构常可分割成一大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区域,折叠得较个或数个球状或纤维状的区域,折叠得较为紧密,各行使其功能,称为结构域为紧密,各行使其功能,称为结构域(domain)(domain)。目目 录录(三)(三)分子伴侣分子伴侣通过提供一个保护环境而加速蛋白质折通过提供一个保护环境而加速蛋白质折叠成天然构象或形成四级结构。叠成天然构象或形成四级结构。可逆地与未折叠肽段的疏水部分结合随后可逆地与未折叠肽段的疏水部分结合随后松开,如此重复进行可
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- 绪论 蛋白质 结构 功能 09
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