文献阅读及综述写作.ppt
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1、选题,文献阅读及综述写作选题,文献阅读及综述写作于晓于晓山东大学医学院生理学研究所内分泌生理/细胞生理教学6号楼6326Email:通知通知本课程考核方式:本课程考核方式:一个问题:我是如何进行科研课题选题的一个问题:我是如何进行科研课题选题的?(字数不限)?(字数不限)写一篇综述写一篇综述(3000字字)截止时间截止时间(Deadline):2014年年1月月1日日下一次课下一次课10月月12日日第一部分第一部分科研课题的选题科研课题的选题第二部分第二部分文献阅读文献阅读第三部分第三部分综述写作综述写作大纲大纲通知通知本课程考核方式:本课程考核方式:一个问题:我是如何进行科研课题选题的一个问
2、题:我是如何进行科研课题选题的?(字数不限)?(字数不限)写一篇综述写一篇综述(3000字字)截止时间截止时间(Deadline):2014年年1月月1日日下一次课下一次课10月月12日日第一部分第一部分科研课题的选题科研课题的选题如何进行科研选题1.导师安排的;2.跟着师兄师姐做;3.在导师提供的多个课题中选择的;4.在导师的研究领域中选择的;5.与导师讨论选择的;6.完全自己独立选择的JackSzostak教授因与ElizabethH.Blackburn、CarolW.Greider“发现端粒和端粒酶是如何保护染色体的”。瑞典卡罗林斯卡医学院5日宣布,将2009年诺贝尔生理学或医学奖授予他
3、们,以表彰其在该领域的突出贡献。他们的研究成果揭示,端粒变短,细胞就老化;如果端粒酶活性很高,端粒的长度就能得到保持,细胞的老化就被延缓。吴瑞(RayWoo)JackSzostak吴瑞(RayWoo)教授是国际知名的科学家,他在基因工程和生物技术领域是重要开创人之一。他的引物延伸法进行DNA测序早在1971年前就取得成功。JackSzostak从从1974年到年到1979年,随吴瑞做的研究生,年,随吴瑞做的研究生,并留在吴瑞实验室做了博士后。并留在吴瑞实验室做了博士后。Szostak的科学训练,主要在吴瑞实验的科学训练,主要在吴瑞实验室进行。室进行。2008年吴瑞教授去世后,他曾撰文悼念。年吴
4、瑞教授去世后,他曾撰文悼念。LabRotation中国中国科学院神经科学研究所美国大学生命医学相关系或研究所第二部分第二部分文献阅读文献阅读一、为什么要阅读科技文献一、为什么要阅读科技文献1 1、学习的需要、学习的需要2 2、科学研究、科学研究3 3、更好地从事基础和临床医学工作、更好地从事基础和临床医学工作 学习专业知识,了解专业学术动态,为学习专业知识,了解专业学术动态,为科研项目的选题,研究方法的选择,乃科研项目的选题,研究方法的选择,乃至于论文的书写方法寻找依据。至于论文的书写方法寻找依据。二、什么是科技文献二、什么是科技文献 医学科技文献是医学研究、医疗实践或经医学科技文献是医学研究
5、、医疗实践或经验的验的书面材料。书面材料。科技文献可以是正式刊物上发表的,也可科技文献可以是正式刊物上发表的,也可以是非正式刊物上发表的材料。以是非正式刊物上发表的材料。三、三、文献源的类型文献源的类型1 1、普通文献、普通文献 可供研究者用来查找其他参考资料,主要是索引或者摘要。2 2、主要资料、主要资料 是研究者报告自己研究成果的出版物,主要是各种期刊杂志。3 3、次要资料、次要资料 是指在作品中描述了其他研究者的工作的出版物,最常见的是教材,教育百科全书、研究回顾和年鉴等。医学科技文献的种类医学科技文献的种类论文论文实验(研究)报告实验(研究)报告病例报告病例报告文献综述文献综述调研报告
6、调研报告其他:学术会议汇编、评述、专家笔谈等其他:学术会议汇编、评述、专家笔谈等论文的一般结构论文的一般结构1 1 题目题目2 2 作者作者 作者单位作者单位3 3 摘要(中文,英文)摘要(中文,英文)4 4 正文正文 -前言前言 -材料与方法材料与方法 -结果结果 -讨论讨论 -参考文献参考文献抗原特异性抗原特异性Th17Th17细胞的分化与调节细胞的分化与调节杨静杨静,贾磊贾磊,李丽李丽,吴长有吴长有(中山大学中山医学院免疫学教研室热带病防治研究教中山大学中山医学院免疫学教研室热带病防治研究教育部重点实验室育部重点实验室,广东广州广东广州510080)510080)The differen
7、tiation and regulation of Antigen specific The differentiation and regulation of Antigen specific Th17 cellsTh17 cells Abstract Abstract AIM:AIM:METHODS:METHODS:RESULTS:RESULTS:CONCLUSION:CONCLUSION:Keywords Keywords Th17 cells;T cell subset;flow cytometry;Th17 cells;T cell subset;flow cytometry;cy2
8、cy2摘要摘要 目的目的:方法方法:结果结果:结论结论:关键词关键词 Th17;T细胞亚群;流式细胞术;细胞因子中图分类号中图分类号 R392文献标识码文献标识码 A 正文正文 按照CD4+T细胞分化和功能特征可以将其分为Th1和Th2细胞 1 。为深入研究CD4+T细胞免疫调节效应和探讨自体免疫性疾病等免疫学机制提供实验和1 1、材料和方法、材料和方法 材料材料 方法方法2 2、结果、结果3 3、讨论、讨论参考文献参考文献:四、怎样查找文献四、怎样查找文献1 1 选择关键词,到选择关键词,到NCBINCBI网站查找英文论文,最初网站查找英文论文,最初可以范围大些,如果文献多,就增加关键词,加
9、可以范围大些,如果文献多,就增加关键词,加上时间限制,如近三年,近一年等上时间限制,如近三年,近一年等.2 2选择关键词,到山大图书馆电子期刊选择关键词,到山大图书馆电子期刊1)1)中文期刊全文数据库查中文文献。中文期刊全文数据库查中文文献。中国中国(CNKI)学术文献)学术文献.2)ElsevierScienceDirect,有很多专业杂志,有很多专业杂志,有许多论文可以看到全文(英文)有许多论文可以看到全文(英文),内容涉及内容涉及生命科学,物理,医学,工程技术及社会科生命科学,物理,医学,工程技术及社会科学学Elsevier ScienceElsevier Science学术期刊学术期刊
10、 Elsevier ScienceElsevier Science是世界上公认的高品位学术出是世界上公认的高品位学术出版公司,也是全球最大的出版商,已有版公司,也是全球最大的出版商,已有100100多年的多年的历史。除了出版图书外,还是当今世界最大的学历史。除了出版图书外,还是当今世界最大的学术期刊出版商,内容涉及生命科学,物理,医学,术期刊出版商,内容涉及生命科学,物理,医学,工程技术及社会科学,其中许多为核心期刊。工程技术及社会科学,其中许多为核心期刊。近近年来,年来,ElsevierElsevier公司合并了一些出版社,如公司合并了一些出版社,如Academic PressAcademi
11、c Press、Cell PressCell Press的学术期刊全文数据也的学术期刊全文数据也已加入到已加入到ScienceDirectScienceDirect,目前国际网站的服务器,目前国际网站的服务器上安装有上安装有15001500多种期刊。多种期刊。http:/science/journals/http:/science/journals/五、选择阅读文献的标准五、选择阅读文献的标准1.1.文献的相似性:文献的相似性:与自己的研究与自己的研究2.2.发表的时间发表的时间:近、新:近、新3.3.研究者的学术影响研究者的学术影响:权威:权威4.4.杂志的影响力杂志的影响力第一层次阅读 课
12、题未定不同阶段的文献阅读不同阶段的文献阅读1.1.看几本经典的本专业书籍,掌握基本知识看几本经典的本专业书籍,掌握基本知识 (中英文教材和专著)(中英文教材和专著)阅读文献从教科书开始,目的是对专业知识有一个完整的基本认识,知道哪些知识是已经确定的,哪些尚有争论。通过英文教材和专著的学习,一是学习专业知识,二是学习专业词汇,为下一步阅读英文文献奠定基础。2.2.广泛阅读大量的文献,把握本领域的动态和广泛阅读大量的文献,把握本领域的动态和方向方向。一定要通过广泛阅读了解自己从事研究的方向,目前世界研究现状:做到了何种程度,还有那些关键问题急待解决。在阅读文献追踪专业发展动态时,务须切记要发挥自己
13、判断力,不可盲从,即使是知名科学家和教科书有时也会有错误。MITMIT麻省理工学院人工智能(麻省理工学院人工智能(AIAI)实验室将阅读)实验室将阅读论文分为三个阶段论文分为三个阶段:第一阶段是看论文中是否有感兴趣的东西。论文含有摘要,其中可能有内容的介绍,但是也有可能没有或者总结得不好,因此需要你跳读,了解作者究竟做了些什么。内容目录(thetableofcontents)、结论部分(conclusion)简介(introduction)是三个重点。顺序快速浏览,一旦搞清楚论文的大概和创新点,就可以决定是否需要进行第二阶段阅读了。在第二阶段,要找出论文真正具有内容的部分。很多15页的论文可以
14、重写为一页左右的篇幅;因此需要你寻找那些真正激动人心的地方。论文作者从其工作中所发现的感兴趣的地方,未必是你感兴趣的,反之亦然。最后,如果觉得该论文确实有价值,返回去通篇精读。读论文时要牢记一个问题,“我应该如何利用该论文?”“真的像作者宣称的那样么?”“如果会发生什么?”。理解论文得到了什么结论并不等同于理解了该论文。理解论文,就要了解论文的目的,假设和形式化是否可行,论文指出了怎样的方向,论文所涉及领域都有哪些问题,作者的研究中持续出现的难点是什么,论文所表达的观点是什么,诸如此类。G经常上网看看最新的文献可能会激发你一时的经常上网看看最新的文献可能会激发你一时的灵感。因此定期读几篇灵感。
15、因此定期读几篇cell cell,nature,sciencenature,science上的上的文章还是很重要的,不要认为和自己专业无关的文章还是很重要的,不要认为和自己专业无关的 就不关就不关 心,其实目前生物医学界的许多方法和思心,其实目前生物医学界的许多方法和思路是相通的,将路是相通的,将nature,sciencenature,science上论文中的最新的上论文中的最新的方法用到自己的领域上完全可能。方法用到自己的领域上完全可能。对于你从事的领域的重点杂志,不论中文对于你从事的领域的重点杂志,不论中文还是外文都有都有许多可读的综述,注意自还是外文都有都有许多可读的综述,注意自己专业
16、的核心刊很重要,应该是每一期的每己专业的核心刊很重要,应该是每一期的每一篇文章都阅读一下,然后是重点阅读和精一篇文章都阅读一下,然后是重点阅读和精读。读。要想有成绩别无他法只有读,读,大量的要想有成绩别无他法只有读,读,大量的读文献,尤其国外的,阅读文献的来源:中读文献,尤其国外的,阅读文献的来源:中文,英文的数据库,对于文献数据库和专业文,英文的数据库,对于文献数据库和专业数据库应该深入研究。数据库应该深入研究。第二层次,选题时的文献阅读第二层次,选题时的文献阅读 目的是寻找研究方向,找出热点,找出研究目的是寻找研究方向,找出热点,找出研究手段,最后写出开题报告手段,最后写出开题报告 根据导
17、师制定的大方向,大量查阅近根据导师制定的大方向,大量查阅近3 3年相年相关文献,精读几篇权威杂志上发表的研究论文关文献,精读几篇权威杂志上发表的研究论文和综述和综述 对于本研究领域的国际领袖人物和实验室,应该对于本研究领域的国际领袖人物和实验室,应该多花一点时间去研究他们论文和主页,追踪他们多花一点时间去研究他们论文和主页,追踪他们的研究过程。的研究过程。n=Q8qz 读文献一定要注意文章后面列出的参考文献读文献一定要注意文章后面列出的参考文献,按图索骥按图索骥,就很易找到更多文献就很易找到更多文献,而且被引而且被引 次数次数越多的越重要,通过搜索参考文献的作者越多的越重要,通过搜索参考文献的
18、作者,期刊期刊目次找到更多该领域的文章。目次找到更多该领域的文章。特别要注意中文综述文章后的英文参考文献,可特别要注意中文综述文章后的英文参考文献,可以用回顾性的方法查找该问题的最初起源及奠基性以用回顾性的方法查找该问题的最初起源及奠基性文章。文章。n0?Mb#+n0?Mb#+查阅大量外文文献,然后从文献的文献再去查找,查阅大量外文文献,然后从文献的文献再去查找,如此往复循环,你的如此往复循环,你的ideaidea不知不觉中就被启发开来。不知不觉中就被启发开来。4 4 查找综述引用的文献,在展开的过程中,查查找综述引用的文献,在展开的过程中,查文献作者、文献的引用和被引用情况是交织在文献作者、
19、文献的引用和被引用情况是交织在一起的。但并不是所有的文献都需要这样查,一起的。但并不是所有的文献都需要这样查,这主要是针对那些这主要是针对那些cited timecited time高的文献。高的文献。第三个层次第三个层次 课题已定课题已定:1 1 首先要做的是寻找权威杂志上相关研究领域权首先要做的是寻找权威杂志上相关研究领域权威人士撰写的综述类文章威人士撰写的综述类文章。这类文章信息量大,论述精辟,读后不但有助于掌握相关研究的重点和焦点内容,而且能帮助我们掌握研究领域的大方向和框架,哪些人、哪个大学或研究所、在哪个方向比较强等等1).1).找一篇本研究领域的文献综述找一篇本研究领域的文献综述
20、(reviewreview)。)。找一篇有影响的找一篇有影响的综述综述(主要是看引用次数(主要是看引用次数cited cited timetime的高低)的高低)2).2).精读此文献综述。精读此文献综述。这一步主要是了解研究领域的框架,熟悉各个这一步主要是了解研究领域的框架,熟悉各个问题的问题的key wordskey words,并进行总结归类。,并进行总结归类。3).3).根据综述的作者、所引用的文献以及被引用的情根据综述的作者、所引用的文献以及被引用的情况进行展开搜索。况进行展开搜索。写此综述的作者一般都是此研究领域的领军人物,写此综述的作者一般都是此研究领域的领军人物,所以他的文献一
21、般都有很高的参考价值。可以直接所以他的文献一般都有很高的参考价值。可以直接搜索此作者的相关文献,再用问题关键词进行二次搜索此作者的相关文献,再用问题关键词进行二次检索。查找引用此综述的文章,再用问题关键词进检索。查找引用此综述的文章,再用问题关键词进行二次检索。这一步找到的文章往往都比较新,能行二次检索。这一步找到的文章往往都比较新,能够代表最新的研究动态。够代表最新的研究动态。2 2 其次是泛读摘要,挑选最相关的进行精读。其次是泛读摘要,挑选最相关的进行精读。精读文章同时做笔记和标记是非常关键的,因为好精读文章同时做笔记和标记是非常关键的,因为好文章可能每读一遍就有不同的收获,每次的笔记加上
22、文章可能每读一遍就有不同的收获,每次的笔记加上心得最后总结起来就会对自己大有帮助;再次是针对心得最后总结起来就会对自己大有帮助;再次是针对不同的需要对论文进行泛读和跳读。要涉足一些和专不同的需要对论文进行泛读和跳读。要涉足一些和专业有点瓜葛但有相当距离的领域业有点瓜葛但有相当距离的领域 研读相关文献的程序是研读相关文献的程序是 1)1)、对该领域有较多介绍的中文成书(资料一般对该领域有较多介绍的中文成书(资料一般是比较老,如果是新书通常汇集了最近是比较老,如果是新书通常汇集了最近5 5到到1010年年 的的主要研究内容和结果主要研究内容和结果.读后可以对这个领域发展历读后可以对这个领域发展历史
23、和近期状况有个全面的了解,对一些专门的术史和近期状况有个全面的了解,对一些专门的术语和英文单词也有了概念。语和英文单词也有了概念。2)2)、根据研究内容通查、根据研究内容通查 最近最近3 3年的中文期刊,主要年的中文期刊,主要是通过看综述了解最近进展和一些国外发表文章是通过看综述了解最近进展和一些国外发表文章的人名和期刊名,还有国内做到什么程度了,的人名和期刊名,还有国内做到什么程度了,为为研究该类项目打基础。你可以知道国内那些同行研究该类项目打基础。你可以知道国内那些同行在做这工作在做这工作.如果实验中碰到一些具体的细节问题如果实验中碰到一些具体的细节问题的话的话,你可以联系他们你可以联系他
24、们,这便可以使你避免走不必要这便可以使你避免走不必要的弯路的弯路.3)3)、根据上面的学习掌握的专业词汇,人名,期、根据上面的学习掌握的专业词汇,人名,期刊名以方便查国外文献。刊名以方便查国外文献。对于自己要研究的不熟悉的内容:对于自己要研究的不熟悉的内容:1)1)首先翻翻中文教科书,有一个大概的了解,这样首先翻翻中文教科书,有一个大概的了解,这样对阅读文献很有帮助。对阅读文献很有帮助。2)2)上网查一些自己想要做的题目的相关方面的中文上网查一些自己想要做的题目的相关方面的中文综述,也算是对教科书内容的补充。同时也让你有综述,也算是对教科书内容的补充。同时也让你有可能触及到国内目前的此方面的前
25、沿。此时你可以可能触及到国内目前的此方面的前沿。此时你可以开始阅读一些外文的综述,看一看国外的研究情况开始阅读一些外文的综述,看一看国外的研究情况和进展。如果对你想要研究什么有更进一步的了解。和进展。如果对你想要研究什么有更进一步的了解。就可以阅读一些国外的原始论著。等到文献量积累就可以阅读一些国外的原始论著。等到文献量积累到一定程度就可以开始你的课题了到一定程度就可以开始你的课题了。X21%3)3)在课题进展过程中,时刻关注你正在研究的相在课题进展过程中,时刻关注你正在研究的相关内容研究进展,它可能会给你的课题新的补充。关内容研究进展,它可能会给你的课题新的补充。4)4)看文献,编号,做好笔
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