遗传代谢性疾病的基因诊断精选课件.ppt
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1、关于遗传代谢性疾病的基因诊断第一页,本课件共有77页 主要内容 前言 一、基因诊断技术 二、遗传代谢性疾病的基因诊断 第二页,本课件共有77页l细胞、组织、器官和机体的生存与功能维持都必须依赖不断细胞、组织、器官和机体的生存与功能维持都必须依赖不断进行的物质代谢过程。进行的物质代谢过程。l物质代谢包括合成代谢及分解代谢两个过程。物质代谢包括合成代谢及分解代谢两个过程。l代谢性疾病是物质代谢过程的紊乱,多为酶或蛋白异常所代谢性疾病是物质代谢过程的紊乱,多为酶或蛋白异常所致。致。l根据代谢性疾病的病因,可将其分为原发性和继发性。根据代谢性疾病的病因,可将其分为原发性和继发性。前前 言言 返回章 二
2、、代谢性疾病的诊断手段二、代谢性疾病的诊断手段二、代谢性疾病的诊断手段二、代谢性疾病的诊断手段二、代谢性疾病的诊断手段二、代谢性疾病的诊断手段 一、代谢性疾病的分类一、代谢性疾病的分类一、代谢性疾病的分类一、代谢性疾病的分类 第三页,本课件共有77页一、代谢性疾病的分类一、代谢性疾病的分类一、代谢性疾病的分类一、代谢性疾病的分类 原发性代谢性疾病:原发性代谢性疾病:又叫先天性代谢性疾病。是指当编码物质代谢所需酶又叫先天性代谢性疾病。是指当编码物质代谢所需酶或蛋白的基因发生突变、不能合成或合成了无活性的产物时,或蛋白的基因发生突变、不能合成或合成了无活性的产物时,就会导致有关代谢途径不能正常运转
3、,造成具有不同临床表就会导致有关代谢途径不能正常运转,造成具有不同临床表型的各种代谢缺陷病。型的各种代谢缺陷病。继发性代谢性疾病:继发性代谢性疾病:继发性代谢性疾病是由其它原发性疾病导致的代继发性代谢性疾病是由其它原发性疾病导致的代谢性疾病,如糖尿病导致的继发性高脂血症。谢性疾病,如糖尿病导致的继发性高脂血症。返回节 第四页,本课件共有77页二、代谢性疾病的诊断手段二、代谢性疾病的诊断手段二、代谢性疾病的诊断手段二、代谢性疾病的诊断手段 l过去:过去:主要依靠与物质代谢相关的各种酶的生物主要依靠与物质代谢相关的各种酶的生物化学方面的诊断化学方面的诊断l现在:现在:生化诊断生化诊断+基因诊断基因
4、诊断 返回节 第五页,本课件共有77页基因诊断的概念基因诊断的概念基因诊断的概念基因诊断的概念 基因诊断就是利用现代基因诊断就是利用现代分子生物学和分子遗传学的分子生物学和分子遗传学的技术方法技术方法,直接检测基因结构直接检测基因结构及其表达水平是否正常及其表达水平是否正常,从而对从而对疾病作出诊断的方法。疾病作出诊断的方法。返回节 第六页,本课件共有77页基因诊断的特点基因诊断的特点基因诊断的特点基因诊断的特点 针对性强针对性强特异性高特异性高灵敏度高灵敏度高适用性强适用性强诊断范围广诊断范围广 返回节 第七页,本课件共有77页 第一节第一节 基因诊断技术基因诊断技术 二二.聚合酶链反应技术
5、聚合酶链反应技术 三三.毛细管电泳技术毛细管电泳技术 四四.基因芯片技术基因芯片技术 一一一一.DNA.DNA.DNA.DNA测序技术测序技术测序技术测序技术 返回章 第八页,本课件共有77页一、一、一、一、DNADNADNADNA测序技术测序技术测序技术测序技术 所有生物基因组序列的数所有生物基因组序列的数 据均来自据均来自 DNA DNA 测序测序 特点特点:l稳定简便稳定简便l自动化程度高自动化程度高l数据准确可靠数据准确可靠l公认为国际金标准公认为国际金标准 返回节 第九页,本课件共有77页双脱氧链终止法双脱氧链终止法双脱氧链终止法双脱氧链终止法 原理原理:测序基础是以测序基础是以dd
6、NTPddNTP为测为测序反应的链终止剂序反应的链终止剂掺入到延伸链中的掺入到延伸链中的ddNTPddNTP可阻止后续可阻止后续ddNTPddNTP或或dNTPdNTP的掺入的掺入 返回节 第十页,本课件共有77页 返回节 第十一页,本课件共有77页示例:示例:BigDye TerminatorsBigDye Terminators循环测序反应扩增到未端为循环测序反应扩增到未端为BigDye TerminatorsBigDye Terminators的一系的一系列的核苷酸链。列的核苷酸链。循环测序反应产物经沉淀、洗涤和纯化,从而去除多循环测序反应产物经沉淀、洗涤和纯化,从而去除多余的未反应的余
7、的未反应的BigDye TerminatorsBigDye Terminators。电泳与结果分析。电泳与结果分析。返回节 第十二页,本课件共有77页 返回节 第十三页,本课件共有77页焦磷酸测序技术焦磷酸测序技术焦磷酸测序技术焦磷酸测序技术 原理原理:引物与模板引物与模板DNADNA退火后,在退火后,在DNADNA聚合酶、聚合酶、ATPATP硫酸硫酸化酶、荧光素酶和三磷酸腺苷双磷酸酶等化酶、荧光素酶和三磷酸腺苷双磷酸酶等4 4种酶的协种酶的协同作用下,将每一个同作用下,将每一个dNTPdNTP的聚合与一次荧光信号的释放的聚合与一次荧光信号的释放偶联起来,通过检测荧光的释放和强度,以荧光信号的
8、形偶联起来,通过检测荧光的释放和强度,以荧光信号的形式实时记录模板式实时记录模板DNADNA的核苷酸序列。的核苷酸序列。返回节 第十四页,本课件共有77页 返回节 ABDNA PolymeraseACCTTGAATTCGTCCTAGGAGGATCTTdNTPApyrase(d)NMPPPiATPATP-sulphurylaseLuciferaseLightCTGCTTAAAGTCAGTCAGTC AGTC第十五页,本课件共有77页基本流程:基本流程:第第1 1步步一个特异性的测序引物和单链一个特异性的测序引物和单链DNADNA模板结合,然后加入酶混模板结合,然后加入酶混合物合物(包括包括DNA
9、 PolymeraseDNA Polymerase、ATP SulfurylaseATP Sulfurylase、LuciferaseLuciferase和三磷酸腺苷双磷酸酶和三磷酸腺苷双磷酸酶Apyrase)Apyrase)和底物混合物和底物混合物(包括腺苷酰硫包括腺苷酰硫酸酸APSAPS和和Luciferin)Luciferin)。返回节 第十六页,本课件共有77页基本流程:基本流程:第第2 2步步向反应体系中加入向反应体系中加入1 1种种dNTPdNTP,如果它刚好能和,如果它刚好能和DNADNA模板的下一个模板的下一个碱基配对,则会在碱基配对,则会在DNA DNA 聚合酶的作用下,添加
10、到测序引物的聚合酶的作用下,添加到测序引物的33末端,同时释放出一个分子的焦磷酸末端,同时释放出一个分子的焦磷酸(PPi)(PPi)。返回节 (DNA)n+dNTP(DNA)n+1+PPi聚合酶聚合酶第十七页,本课件共有77页基本流程:基本流程:第第3 3步步在在ATPATP硫酸化酶的作用下,生成的硫酸化酶的作用下,生成的PPiPPi可以和可以和APSAPS结合形成结合形成ATPATP;在荧光素酶的催化下,生成的;在荧光素酶的催化下,生成的ATPATP又可以和荧光素结合形又可以和荧光素结合形成氧化荧光素,同时产生可见光。通过成氧化荧光素,同时产生可见光。通过CCDCCD光学系统即可获得光学系统
11、即可获得一个特异的检测峰,峰值高低则和相匹配的碱基数成正一个特异的检测峰,峰值高低则和相匹配的碱基数成正比。比。返回节 第十八页,本课件共有77页基本流程:基本流程:第第4 4步步反应体系中剩余的反应体系中剩余的dNTPdNTP和残留的少量和残留的少量ATPATP在在ApyraseApyrase的作用下的作用下发生降解。发生降解。返回节 dNTPdNDP+dNMP+PiATPADP+AMP+PiATPATP双磷酸酶双磷酸酶ATPATP双磷酸酶双磷酸酶第十九页,本课件共有77页基本流程:基本流程:第第5 5步步加入另一种加入另一种dNTPdNTP,使,使 第第2 24 4步反应重复进步反应重复进
12、 行,根据获得的峰值行,根据获得的峰值 图即可读取准确的图即可读取准确的DNADNA 序列信息序列信息 返回节 DNA序列GGCC-TAAGGGCCCTT核苷酸递增第二十页,本课件共有77页 返回节 焦磷酸盐测序法步骤焦磷酸盐测序法步骤第二十一页,本课件共有77页二、聚合酶链反应技术二、聚合酶链反应技术二、聚合酶链反应技术二、聚合酶链反应技术 PCRPCR是体外酶促合成特异是体外酶促合成特异DNADNA片段的方法。片段的方法。四种主要成分:四种主要成分:DNADNA模板、引物、模板、引物、DNA DNA 聚聚合酶和合酶和dNTPdNTP。三个反复步骤:三个反复步骤:高温变性、低温退火和高温变性
13、、低温退火和适温延伸。适温延伸。返回节 第二十二页,本课件共有77页三、毛细管电泳技术三、毛细管电泳技术三、毛细管电泳技术三、毛细管电泳技术 毛细管电泳统指以高压电场为驱动力,以毛细管电泳统指以高压电场为驱动力,以毛细管为分离通道,依据试样中各组分间毛细管为分离通道,依据试样中各组分间淌度和分配行为上的差异来实现分离的一淌度和分配行为上的差异来实现分离的一类分离技术。类分离技术。基本原理是根据在电场作用下离子迁移的基本原理是根据在电场作用下离子迁移的速度不同而对组分进行分离和分析。速度不同而对组分进行分离和分析。返回节 第二十三页,本课件共有77页 返回节 变性高效液相色谱变性高效液相色谱(D
14、HPLC)是一种新的高通是一种新的高通量筛选量筛选DNA序列变异的技术,其原理是利序列变异的技术,其原理是利用离子对反向高效液相色谱原理用离子对反向高效液相色谱原理,通过一个通过一个DNA分离柱,进行核苷酸片段的分离和分离柱,进行核苷酸片段的分离和分析。分析。第二十四页,本课件共有77页四、基因芯片技术四、基因芯片技术四、基因芯片技术四、基因芯片技术 基因芯片技术基因芯片技术就是指将大量特定的靶基因片段或就是指将大量特定的靶基因片段或寡核苷酸片段作为探针有序和高密度地排列固定寡核苷酸片段作为探针有序和高密度地排列固定于玻璃和硅等固相载体上,然后检测与待测的不于玻璃和硅等固相载体上,然后检测与待
15、测的不同荧光标记样品基因按碱基配对的原理进行杂交,同荧光标记样品基因按碱基配对的原理进行杂交,通过激光共聚焦系统检测探针分子的杂交信号强通过激光共聚焦系统检测探针分子的杂交信号强度,经计算机分析处理数据资料,获取不同样品度,经计算机分析处理数据资料,获取不同样品分子的数量和大量生物信息,从而可对基因序列分子的数量和大量生物信息,从而可对基因序列及功能进行大规模和高通量的研究。及功能进行大规模和高通量的研究。返回节 第二十五页,本课件共有77页 第二节第二节 遗传代谢性疾病的基因诊断遗传代谢性疾病的基因诊断 遗传代谢性疾病是指由于基因突变导致酶的质和量的遗传代谢性疾病是指由于基因突变导致酶的质和
16、量的改变,从而所催化的酶促反应发生变化而引起的一系列疾改变,从而所催化的酶促反应发生变化而引起的一系列疾 病。病。一、代谢性疾病的特征及基因诊断策略一、代谢性疾病的特征及基因诊断策略一、代谢性疾病的特征及基因诊断策略一、代谢性疾病的特征及基因诊断策略一、代谢性疾病的特征及基因诊断策略一、代谢性疾病的特征及基因诊断策略 二、苯丙酮酸尿症(二、苯丙酮酸尿症(二、苯丙酮酸尿症(二、苯丙酮酸尿症(二、苯丙酮酸尿症(二、苯丙酮酸尿症(PKU)PKU)PKU)PKU)PKU)PKU)三、三、三、三、三、三、同型胱氨酸尿症同型胱氨酸尿症同型胱氨酸尿症同型胱氨酸尿症同型胱氨酸尿症同型胱氨酸尿症(HCU)(HC
17、U)(HCU)(HCU)(HCU)(HCU)四、四、四、四、四、四、酪氨酸血症酪氨酸血症酪氨酸血症酪氨酸血症酪氨酸血症酪氨酸血症 五、五、五、五、五、五、半乳糖血症半乳糖血症半乳糖血症半乳糖血症半乳糖血症半乳糖血症 六、六、六、六、六、六、糖原累积症糖原累积症糖原累积症糖原累积症糖原累积症糖原累积症 七、七、七、七、七、七、果糖不耐症果糖不耐症果糖不耐症果糖不耐症果糖不耐症果糖不耐症 八、八、八、八、八、八、家族性高脂蛋白血症家族性高脂蛋白血症家族性高脂蛋白血症家族性高脂蛋白血症家族性高脂蛋白血症家族性高脂蛋白血症 九、九、九、九、九、九、肝豆状核变性肝豆状核变性肝豆状核变性肝豆状核变性肝豆状
18、核变性肝豆状核变性 十、十、十、十、十、十、先天性甲状腺功能低下先天性甲状腺功能低下先天性甲状腺功能低下先天性甲状腺功能低下先天性甲状腺功能低下先天性甲状腺功能低下 十一、十一、十一、十一、十一、十一、溶酶体病溶酶体病溶酶体病溶酶体病溶酶体病溶酶体病 十二、十二、十二、十二、十二、十二、线粒体病线粒体病线粒体病线粒体病线粒体病线粒体病 返回章 第二十六页,本课件共有77页遗传代谢性疾病的病理生理改变特征遗传代谢性疾病的病理生理改变特征遗传代谢性疾病的病理生理改变特征遗传代谢性疾病的病理生理改变特征 代谢途径的某些终末产物缺乏代谢途径的某些终末产物缺乏受累代谢途径中间和或旁路代谢产物大量蓄积受累
19、代谢途径中间和或旁路代谢产物大量蓄积由于代谢连径受阻而导致对肝、脑、肌肉等蛆织能量供由于代谢连径受阻而导致对肝、脑、肌肉等蛆织能量供应不足应不足一、代谢性疾病的特征及基因诊断策略一、代谢性疾病的特征及基因诊断策略一、代谢性疾病的特征及基因诊断策略一、代谢性疾病的特征及基因诊断策略 返回节 第二十七页,本课件共有77页遗传代谢性疾病的发病特点遗传代谢性疾病的发病特点遗传代谢性疾病的发病特点遗传代谢性疾病的发病特点 父母双方或者某一方携带着致病基因。父母双方或者某一方携带着致病基因。多在新生儿期、幼儿或儿童期发病,有些虽然在成人期多在新生儿期、幼儿或儿童期发病,有些虽然在成人期发病,但在儿童期已有
20、潜在病变。发病,但在儿童期已有潜在病变。临床表现无特异性,多为胃肠道、呼吸系统、神经系统临床表现无特异性,多为胃肠道、呼吸系统、神经系统症状、代谢性酸中毒。症状、代谢性酸中毒。家族史中往往有同样病情的先证者存在,而且往往因家族史中往往有同样病情的先证者存在,而且往往因为饮食和应激等因素而发病。为饮食和应激等因素而发病。返回节 第二十八页,本课件共有77页代谢性疾病的基因诊断策略代谢性疾病的基因诊断策略代谢性疾病的基因诊断策略代谢性疾病的基因诊断策略 检测已知的能产生某种特定功能蛋白的基因检测已知的能产生某种特定功能蛋白的基因检测与某种遗传标志连锁的致病基因检测与某种遗传标志连锁的致病基因检测表
21、型克隆基因检测表型克隆基因 返回节 第二十九页,本课件共有77页二、苯丙酮酸尿症二、苯丙酮酸尿症二、苯丙酮酸尿症二、苯丙酮酸尿症(PKU)(PKU)(PKU)(PKU)氨基酸代谢障碍氨基酸代谢障碍属常染色体隐性遗传属常染色体隐性遗传我国发病率约为我国发病率约为1/16,5001/16,500 返回节 第三十页,本课件共有77页病因病因病因病因是由于人类肝细胞内苯丙氨酸羟化酶是由于人类肝细胞内苯丙氨酸羟化酶(PAH)(PAH)缺乏或活性降缺乏或活性降低所致。低所致。上述酶的缺乏或活性降低直接导致体内来源于食物的苯上述酶的缺乏或活性降低直接导致体内来源于食物的苯丙氨酸不能正常转化为酪氨酸,从而使苯
22、丙氨酸在体内丙氨酸不能正常转化为酪氨酸,从而使苯丙氨酸在体内异常蓄积,并打破大脑氨基酸的平衡而导致异常蓄积,并打破大脑氨基酸的平衡而导致PKUPKU。返回节 第三十一页,本课件共有77页临床表现临床表现临床表现临床表现神经系统症状:神经系统症状:以智力发育落后为主的障碍。以智力发育落后为主的障碍。外貌:外貌:患儿在出生数月后因黑色素合成不足,毛发、皮肤和虹膜患儿在出生数月后因黑色素合成不足,毛发、皮肤和虹膜色泽变浅。色泽变浅。其他:其他:呕吐和皮肤湿疹常见;尿和汗液有鼠尿臭味。呕吐和皮肤湿疹常见;尿和汗液有鼠尿臭味。返回节 第三十二页,本课件共有77页 基因诊断基因诊断基因诊断基因诊断PAH
23、PAH 基因定位于基因定位于1212号染色体的长臂上,即号染色体的长臂上,即12q24.112q24.1,包括包括1313个外显子和个外显子和1212个内含子,编码个内含子,编码451451个氨基酸的酶单个氨基酸的酶单体。体。PAH PAH 基因除了缺失突变外,大多是点突变。基因除了缺失突变外,大多是点突变。由于由于PKU PKU 是第一个可以用饮食控制治疗的遗传病,是第一个可以用饮食控制治疗的遗传病,因此,因此,对对PKU PKU 产前诊断的研究是非常有意义的。产前诊断的研究是非常有意义的。返回节 第三十三页,本课件共有77页第三十四页,本课件共有77页三、三、三、三、同型胱氨酸尿症同型胱氨
24、酸尿症同型胱氨酸尿症同型胱氨酸尿症(HCU)(HCU)(HCU)(HCU)是蛋氨酸先天代谢障碍所致的氨基酸代谢缺陷是蛋氨酸先天代谢障碍所致的氨基酸代谢缺陷性疾病。性疾病。常染色体隐性遗传病。常染色体隐性遗传病。基本病因是胱硫醚合成酶基本病因是胱硫醚合成酶(CBS)(CBS)缺乏或活性降低导缺乏或活性降低导致尿中的同型胱氨酸和蛋氨酸增高。致尿中的同型胱氨酸和蛋氨酸增高。返回节 第三十五页,本课件共有77页病病病病 因因因因 胱硫醚合成酶缺乏型胱硫醚合成酶缺乏型(简称简称“合成酶型合成酶型”),是由同,是由同型胱氨酸变为胱硫醚的代谢途径发生阻滞型胱氨酸变为胱硫醚的代谢途径发生阻滞,本型最本型最为多
25、见。为多见。甲基四氨叶酸甲基四氨叶酸-同型半胱氨酸甲基转移酶缺乏型同型半胱氨酸甲基转移酶缺乏型(简简称称“甲基转移酶型甲基转移酶型”),是同型半胱氨酸变为蛋氨酸,是同型半胱氨酸变为蛋氨酸的代谢途径发生紊乱。的代谢途径发生紊乱。5,10-N-5,10-N-甲烯四氢叶酸还原酶缺乏型甲烯四氢叶酸还原酶缺乏型(简称简称“还原酶型还原酶型”)。返回节 第三十六页,本课件共有77页临床表现临床表现临床表现临床表现典型的症状见于胱硫醚合成酶缺乏型的病例典型的症状见于胱硫醚合成酶缺乏型的病例,患儿初患儿初生时正常,生时正常,5 59 9个月间起病个月间起病,主要症状是骨骼异常、主要症状是骨骼异常、晶体脱位、血
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