SDSPAGE凝胶电泳2.ppt
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1、SDS-PAGE凝胶电泳凝胶电泳SDS-PAGE凝胶电泳凝胶电泳实验原理实验原理实验步骤实验步骤注意事项注意事项SDS-PAGE的优点的优点SDS-PAGE的缺点的缺点实验常见问题及处理实验常见问题及处理小技巧小技巧实验步骤实验步骤试剂配制试剂配制(1)30%丙烯酰胺(丙烯酰胺(Acr):):称称Acr30g,甲叉甲叉双丙烯酰胺(双丙烯酰胺(Bis)0.8g,加蒸馏水至加蒸馏水至100ml,过滤后置棕色瓶中。过滤后置棕色瓶中。4,12月月(2)10%SDS(十二烷基磺酸钠)十二烷基磺酸钠)(3)1.5mol/L Tris-HCl缓冲液缓冲液(pH8.8):称取称取Tris 18.2g,加入加入
2、50ml水水,用用1mol/L盐盐酸调酸调pH8.8,最后用蒸馏水定容至最后用蒸馏水定容至100ml。(4)1.0mol/LTris-HCl缓冲液缓冲液(pH6.8):称取称取Tris12.1g,加入加入50ml水,用水,用1mol/L盐酸调盐酸调pH6.8,最后用蒸馏水定容最后用蒸馏水定容至至100ml(5)0.05mol/LTris-HCl缓冲液缓冲液(pH8.0):称取称取Tris0.6g,加入加入50ml水,用水,用1mol/L盐酸调盐酸调pH8.0,最后用蒸馏水定容最后用蒸馏水定容至至100ml()()TEMED(四甲基乙二胺)(四甲基乙二胺)()样品溶解液()样品溶解液:SDS(1
3、00mg)+巯基乙醇(巯基乙醇(0.1ml)+溴溴酚蓝(酚蓝(2mg)+甘油(甘油(2g)+0.05mol/L pH8.0Tris-HCl(2ml),),最后定容至最后定容至10ml()固定液:()固定液:50%甲醇甲醇454ml,冰乙酸冰乙酸46ml混匀混匀()染色液:()染色液:称取考马斯亮蓝称取考马斯亮蓝R250 0.125g,加上述固定液加上述固定液250ml,过滤后备过滤后备用用(1)脱色液:)脱色液:冰乙酸冰乙酸75ml,甲醇,甲醇50ml,加蒸馏水,加蒸馏水定容至定容至1000ml(1)电极缓冲液)电极缓冲液 (内含(内含0.1%SDS,0.05mol/LTris-0.384mo
4、l/L甘氨酸缓冲液甘氨酸缓冲液pH8.3):称):称Tris6.0g,甘氨酸,甘氨酸28.8g,加入,加入SDS1g,加蒸馏水使其溶解后定容至加蒸馏水使其溶解后定容至1000ml.聚胶前准备聚胶前准备 (1)配制配制10过硫酸铵溶液过硫酸铵溶液(需每天需每天新鲜配制新鲜配制)。(2)将单体储存液、缓冲液、水按照将单体储存液、缓冲液、水按照一定比例配制成凝胶溶液。一定比例配制成凝胶溶液。(3)将灌胶装置准备好。将灌胶装置准备好。(4)待凝胶溶液平衡至室温待凝胶溶液平衡至室温(2325)后,真空脱气后,真空脱气15 min。不连续系统下层分离胶的聚合不连续系统下层分离胶的聚合 在在10 ml凝胶溶
5、液中加入凝胶溶液中加入10过硫酸铵过硫酸铵50 l(最终浓度为最终浓度为0.05),TEMED原液原液5l(最终浓最终浓度为度为0.05)。轻缓地摇动溶液。轻缓地摇动溶液(810下下),使激活,使激活剂混合均匀。剂混合均匀。将凝胶溶液平稳地注入两层玻璃板中将凝胶溶液平稳地注入两层玻璃板中(注意要注意要以连续平稳的液流从中间位置注入以连续平稳的液流从中间位置注入),再在液面上,再在液面上小心注入一层水或正丁醇小心注入一层水或正丁醇(约约23mm高高),以阻止,以阻止氧气进入凝胶溶液中,然后静置至少氧气进入凝胶溶液中,然后静置至少90 min。不连续系统中的上层浓缩胶不连续系统中的上层浓缩胶 和连
6、续系统凝胶的聚合和连续系统凝胶的聚合 连续系统只含一种凝胶,它和不连续连续系统只含一种凝胶,它和不连续系统中的浓缩胶具有相同之处,即在其液系统中的浓缩胶具有相同之处,即在其液面处与空气相接触,因此激活剂的含量应面处与空气相接触,因此激活剂的含量应相应地增加,在相应地增加,在10m1凝胶溶液中加入凝胶溶液中加入10过硫酸铵过硫酸铵50 l(最终浓度最终浓度0.05),TEMED原液原液10 l(最终浓度最终浓度0.1)。同前将激活剂混合均匀,但摇动溶液时不要同前将激活剂混合均匀,但摇动溶液时不要摇得过于剧烈以免引入过多的氧气。摇得过于剧烈以免引入过多的氧气。吸去不连吸去不连续系统中下层分离胶上的
7、水分,以连续平稳的液续系统中下层分离胶上的水分,以连续平稳的液流注入凝胶溶液,然后小心插入梳子并注意不得流注入凝胶溶液,然后小心插入梳子并注意不得在齿尖留有气泡。在齿尖留有气泡。静置静置90 min以上以保证完全以上以保证完全聚合。聚合。如果在聚胶过程中发现一道道纹线,即如果在聚胶过程中发现一道道纹线,即凝胶不均匀,可能是聚合速度太快或激活剂未充凝胶不均匀,可能是聚合速度太快或激活剂未充分混合导致局部浓度过高。分混合导致局部浓度过高。凝胶聚合的速度可以通过紫外吸收检测,由凝胶聚合的速度可以通过紫外吸收检测,由于丙烯酰胺中的双键在于丙烯酰胺中的双键在260nm有吸收,聚合后双有吸收,聚合后双键消
8、失,光吸收减低。将凝胶溶液倒入石英比色键消失,光吸收减低。将凝胶溶液倒入石英比色杯中,可观察到杯中,可观察到2030 min后光吸收读数开始下后光吸收读数开始下降,至降,至80 min以后趋于稳定,说明聚合完成。以后趋于稳定,说明聚合完成。电泳电泳 将聚合好的凝胶板安置于电泳槽中,将聚合好的凝胶板安置于电泳槽中,上样,选择适当的电压进行电泳。上样,选择适当的电压进行电泳。垂直板垂直板电泳装置电泳装置加样加样样品迁样品迁移方向移方向水平式电泳装置水平式电泳装置电泳缓冲液电泳缓冲液凝胶凝胶电泳过程中分子迁移的规律,小分子电泳过程中分子迁移的规律,小分子走在前头,大分子滞后。电泳凝胶相走在前头,大分
9、子滞后。电泳凝胶相当于凝胶过滤中的一个带孔胶粒。当于凝胶过滤中的一个带孔胶粒。混合样品混合样品带孔胶带孔胶 按分子按分子大小分离大小分离电泳方向电泳方向 电泳电泳 小分子小分子大分子大分子染色和脱色染色和脱色 电泳完毕需通过染色和脱色评定其结果的优劣,电泳完毕需通过染色和脱色评定其结果的优劣,此外根据不同的研究目的,也可将凝胶直接进行此外根据不同的研究目的,也可将凝胶直接进行放射自显影及电印迹。放射自显影及电印迹。电泳后的凝胶经考马斯亮蓝电泳后的凝胶经考马斯亮蓝染色、脱色后的凝胶照片染色、脱色后的凝胶照片.结果处理结果处理 l测量并计算分子量测量并计算分子量l蛋白质的分子量与它的电泳迁移有一定
10、关系式,经蛋白质的分子量与它的电泳迁移有一定关系式,经37种蛋种蛋白的测定得到以下的关系式白的测定得到以下的关系式 Mw K(10bm)(1)lgMw=lgKbm=K1bm (2)其中其中MW是蛋白质分子量;是蛋白质分子量;K和和K1为常数为常数 b为斜率,为斜率,m是电泳迁移率,实际使用的是相对迁移率是电泳迁移率,实际使用的是相对迁移率mR。mR=dpr/dBPB 夹在两块玻璃夹在两块玻璃板之间的凝胶板之间的凝胶 电泳电泳缓冲液缓冲液 电泳电泳缓冲液缓冲液 加在槽中的经加在槽中的经SDS处理的样品处理的样品分子量小分子量小分子量大分子量大电源电源标准蛋白分子量标准蛋白分子量未未知知蛋蛋白白在
11、在一定的凝胶浓度下,一定的凝胶浓度下,多肽链分子量的对数与多肽链分子量的对数与多肽链的相对迁移率成多肽链的相对迁移率成线性关系,所以可以通线性关系,所以可以通过标准曲线求未知多肽过标准曲线求未知多肽链分子量链分子量。相对迁移率相对迁移率实验注意事项实验注意事项 1.形成凝胶的试剂要有足够的形成凝胶的试剂要有足够的纯度纯度:丙烯酰胺是形:丙烯酰胺是形成凝胶溶液中的最主要成份,其纯度的好坏将直接成凝胶溶液中的最主要成份,其纯度的好坏将直接影响凝胶的质量,丙烯酰胺可能混有的影响凝胶形影响凝胶的质量,丙烯酰胺可能混有的影响凝胶形成的杂质有:丙烯酰胺、线性多聚丙烯酰胺、金属成的杂质有:丙烯酰胺、线性多聚
12、丙烯酰胺、金属离子等。离子等。2.注意不能随便倾倒注意不能随便倾倒单体溶液单体溶液,应加入过量的催化,应加入过量的催化剂使其完全聚合成无毒性的聚丙烯酰胺后再弃置。剂使其完全聚合成无毒性的聚丙烯酰胺后再弃置。l3.TEMED中混有氧化试剂后其自身极易中混有氧化试剂后其自身极易被氧化而失去催化能力,另外被氧化而失去催化能力,另外TEMED的氧的氧化产物化产物呈黄色呈黄色,以此可以鉴定,以此可以鉴定TEMED的质的质量。如果无法获得无色透明的量。如果无法获得无色透明的TEMED,只,只能适当增加用量以保证聚胶速度。能适当增加用量以保证聚胶速度。l4.过硫酸铵过硫酸铵容易吸潮,由于它溶解于水容易吸潮,
13、由于它溶解于水后很快降解失去催化能力,因此潮解后的过后很快降解失去催化能力,因此潮解后的过硫酸铵会渐渐失去活性。保存固体过硫酸铵硫酸铵会渐渐失去活性。保存固体过硫酸铵应密闭干燥。过硫酸铵溶液宜制胶当天配制。应密闭干燥。过硫酸铵溶液宜制胶当天配制。另外在配制凝胶溶液时过硫酸铵不易过量,另外在配制凝胶溶液时过硫酸铵不易过量,否则会使蛋白质在电泳过程中被氧化否则会使蛋白质在电泳过程中被氧化(主要主要指天然无变性剂凝胶指天然无变性剂凝胶)。l5.激活剂的用量激活剂的用量:激活剂的浓度适当与否不激活剂的浓度适当与否不仅可以决定凝胶聚合的速度,也将影响凝胶的质量。仅可以决定凝胶聚合的速度,也将影响凝胶的质
14、量。增加过硫酸铵或增加过硫酸铵或TEMED的用量,将使丙烯酰胺聚的用量,将使丙烯酰胺聚合链长度缩短,凝胶会变得脆弱而失去应有的柔性。合链长度缩短,凝胶会变得脆弱而失去应有的柔性。二者多至一定程度时,聚合链长度过短,将不会形二者多至一定程度时,聚合链长度过短,将不会形成肉眼可见的凝胶,这些短链多聚物呈溶液状,只成肉眼可见的凝胶,这些短链多聚物呈溶液状,只是其粘度较聚合前高一些。是其粘度较聚合前高一些。6.温度的影响温度的影响聚胶的最佳温度为聚胶的最佳温度为2325 ,需要注意灌胶前单体溶液需要注意灌胶前单体溶液(通常置于通常置于4冰箱冰箱)及玻及玻璃板或管璃板或管(有时从烘箱取出有时从烘箱取出)
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- SDSPAGE 凝胶电泳
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