蛋白质与氨基酸.ppt.ppt
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1、蛋白质与氨基酸主要介绍氨基酸、肽和蛋白质的结构、性质、功能以及蛋白质的结构与功能的关系。还介绍了一些基本技术如氨基酸的分离、纯化,多肽的人工合成,蛋白质的分离、纯化、鉴定等。一、蛋白质的重要性和一般组成一、蛋白质的重要性和一般组成(一)重要性(一)重要性 有些蛋白质是生物体的结构物质,有些蛋白质是生物体的结构物质,有些蛋白质是生物体的功能物质。有些蛋白质是生物体的功能物质。近年来的研究还指出蛋白质在遗传信息的控制,细胞膜的通透性以近年来的研究还指出蛋白质在遗传信息的控制,细胞膜的通透性以及高等动物的记忆等方面起了重要作用。及高等动物的记忆等方面起了重要作用。总而言之,一切重要的生理活动都离不开
2、蛋白质,蛋白质是生命总而言之,一切重要的生理活动都离不开蛋白质,蛋白质是生命现象的最基本的物质基础。现象的最基本的物质基础。几年前,在欧洲乃至全世界引起恐慌的疯牛病,其致病元凶就是几年前,在欧洲乃至全世界引起恐慌的疯牛病,其致病元凶就是蛋白粒子(蛋白粒子(prion),),这种只有蛋白质而没有核酸的病原体,可引起这种只有蛋白质而没有核酸的病原体,可引起人或动物的疯牛病,这一发现又一次说明了蛋白质是生命的物质基人或动物的疯牛病,这一发现又一次说明了蛋白质是生命的物质基础。础。(二)一般组成(二)一般组成 元素组成:所有蛋白质都含有元素组成:所有蛋白质都含有 C、H、O、N 四种四种元素,大多数蛋
3、白质还含有少量的元素,大多数蛋白质还含有少量的 S,有些蛋白质有些蛋白质还含有一些其它元素,如还含有一些其它元素,如 P、Fe、Cu、Mo、I等。等。各种蛋白质的含氮量都很接近,都在各种蛋白质的含氮量都很接近,都在16%左右,左右,因此可通过测定生物样品中的含氮量计算出样品中因此可通过测定生物样品中的含氮量计算出样品中蛋白质的含量,蛋白质的含量,1克氮就相当于克氮就相当于6.25克蛋白质。克蛋白质。蛋白质水解:用蛋白质水解:用H H+,OHOH-或酶将蛋白质彻底水或酶将蛋白质彻底水解,可以得到许多种氨基酸的混合物,说明解,可以得到许多种氨基酸的混合物,说明氨基氨基酸酸是蛋白质的基本结构单位。是
4、蛋白质的基本结构单位。二、蛋白质的基本结构单位二、蛋白质的基本结构单位氨基酸(氨基酸(amino amino acid,acid,aaaa或或AAAA)(一)氨基酸的通式、分类、结构和代号(一)氨基酸的通式、分类、结构和代号 1 1、氨基酸的通式、氨基酸的通式 或或2 2、氨基酸的分类、结构、代号、氨基酸的分类、结构、代号 氨基酸有两种分类方法氨基酸有两种分类方法(1)(1)按按侧链侧链R R基的结构基的结构(2)(2)按按侧链侧链R R基的极性基的极性中性氨基酸中性氨基酸氨基酸的结构、代号氨基酸的结构、代号:(二)氨基酸的构型、旋光性和光吸收(二)氨基酸的构型、旋光性和光吸收 构型:构型:组
5、成蛋白质的氨基酸除组成蛋白质的氨基酸除GlyGly以外都有手性碳原子,在三维以外都有手性碳原子,在三维空间上就有两种不同的排列方式,它们互为镜影,这两种不同的构空间上就有两种不同的排列方式,它们互为镜影,这两种不同的构型分别称为型分别称为D-D-型和型和L-L-型。型。以丙氨酸为例:以丙氨酸为例:如含两个手性碳原子,则有种立体异构体,分别称为如含两个手性碳原子,则有种立体异构体,分别称为-,-,-,别,别-和别和别-氨基酸。氨基酸。L-苏氨酸苏氨酸(L-threonine)D-苏氨酸苏氨酸(D-threonine)L-别别-苏氨酸苏氨酸(L-allo-threonine)D-别别-苏氨酸苏氨酸
6、(D-allo-threonine)蛋白质中的氨基酸都是蛋白质中的氨基酸都是L-L-型。型。(GlyGly除外除外)旋光性:旋光性:组成蛋白质的氨基酸除组成蛋白质的氨基酸除GlyGly以外,都有手性碳原子,以外,都有手性碳原子,所以所以都有旋光性,能使偏振光的偏振面的向左或向右旋转,向左旋都有旋光性,能使偏振光的偏振面的向左或向右旋转,向左旋转的称左旋,用转的称左旋,用“一一”号表示,向右旋转的称右旋,用号表示,向右旋转的称右旋,用“”号表示。号表示。旋光度,比旋光度旋光度,比旋光度消旋消旋外消旋外消旋内消旋内消旋光吸收:光吸收:组成蛋白质的氨基酸中,组成蛋白质的氨基酸中,TrpTrp、Tyr
7、Tyr和和 PhePhe对紫外光有对紫外光有一定的吸收,这是因为它们分子中含有苯环,是苯环的共一定的吸收,这是因为它们分子中含有苯环,是苯环的共轭双键造成的,这三个氨基酸的光吸收都在轭双键造成的,这三个氨基酸的光吸收都在280280nmnm附近。附近。(三)氨基酸的酸碱性质和等电点(三)氨基酸的酸碱性质和等电点 1 1、氨基酸的两性离子形式、氨基酸的两性离子形式 两性离子两性离子(dipolar ion)dipolar ion)2 2、氨基酸的两性解离和等电点、氨基酸的两性解离和等电点 Brnsted的酸碱理论,即广义酸碱理论。的酸碱理论,即广义酸碱理论。HA A-+H+酸酸碱碱质子质子 氨基
8、酸在水中的两性离子既能像酸一样放出质子,也能像碱一氨基酸在水中的两性离子既能像酸一样放出质子,也能像碱一样接受质子,氨基酸具有样接受质子,氨基酸具有酸碱性质酸碱性质,是一类两性电解质是一类两性电解质。As an acid(proton donor):):As a base(proton acceptor):):不同不同pH时氨基酸以不同的离子化形式存在:时氨基酸以不同的离子化形式存在:正离子正离子两性离子两性离子负离子负离子 氨基酸所带静电荷为氨基酸所带静电荷为“零零”时,溶液的时,溶液的pH值称为该氨基值称为该氨基酸的等电点(酸的等电点(isoelectric point),),以以pI表示
9、。表示。实验证明在等电点时,氨基酸主要以两性离子形式存在,但也有少实验证明在等电点时,氨基酸主要以两性离子形式存在,但也有少量的而且数量相等的正、负离子形式,还有极少量的中性分子。量的而且数量相等的正、负离子形式,还有极少量的中性分子。当溶液的当溶液的pH=pH=pIpI时,氨基酸主要从两性离子形式存在。时,氨基酸主要从两性离子形式存在。pHpHpHpIpI时,氨基酸主要以负离子形式存在。时,氨基酸主要以负离子形式存在。3 3氨基酸的酸碱滴定曲线氨基酸的酸碱滴定曲线 Henderson-Hasselbalch方程方程pH=pKa+lg 质子受体质子受体 质子供体质子供体 酸碱滴定曲线酸碱滴定曲
10、线4 4等电点的计算等电点的计算 中性氨基酸:以中性氨基酸:以GlyGly为例为例 K1=Gly H+Gly+K2=Gly-H+GlypIpI时,时,Gly+=Gly-Gly H+K1=Gly K2H+H+2=K1K2pH=(pK1+pK2)/2pI=(pK1+pK2)/2pI =(2.34+9.60)/2=5.97Gly酸性氨基酸,以酸性氨基酸,以AspAsp为例:为例:碱性氨基酸,以碱性氨基酸,以Lys为例:为例:(四)氨基酸的化学性质(四)氨基酸的化学性质 1 1-氨基参加的反应氨基参加的反应 (1 1)成盐作用)成盐作用 (2 2)与)与HNOHNO2 2的反应的反应(3 3)与甲醛的
11、反应)与甲醛的反应 甲醛滴定要注意几点甲醛滴定要注意几点 甲醛滴定的优缺点甲醛滴定的优缺点 (4 4)酰基化反应)酰基化反应 酰氯:酰氯:苄氧酰氯(苄氧酰氯(CbzCbz-ClCl):对甲苯磺酰氯对甲苯磺酰氯(TosTos-ClCl):):叔丁氧酰氯叔丁氧酰氯(BocBoc-ClCl):):酸酐:酸酐:邻苯二甲酸酐:邻苯二甲酸酐:(R酰基)酰基)Cbz-ClCbz-氨基酸氨基酸氨基酸与氨基酸与 5 5一二甲氨基萘一二甲氨基萘-1-1-磺酰氯磺酰氯(dansyl chloride,DNS)的反应的反应 (5 5)烃基化反应)烃基化反应 与与2 2、4 4一二硝基氟苯的反应一二硝基氟苯的反应 2,
12、4一二硝基氟苯一二硝基氟苯(R烃基)烃基)DNFBDNP-氨基酸(黄色)氨基酸(黄色)与苯异硫氰酸(酯)的反应与苯异硫氰酸(酯)的反应 PITCPTC-氨基酸氨基酸PTH-氨基酸氨基酸2 2-羧基参加的反应羧基参加的反应 (1 1)成盐和成酯反应)成盐和成酯反应 酰化氨基酸酰化氨基酸对硝基苯酚对硝基苯酚酰化氨基酸对酰化氨基酸对-硝基苯酯硝基苯酯(活化酯)(活化酯)(式中(式中Y酰基)酰基)(2 2)成酰氯反应)成酰氯反应 (3 3)成酰胺反应)成酰胺反应 体外:体外:体内:体内:Asp+NH4ATP酶酶Asn+(4 4)脱羧基反应)脱羧基反应 (5 5)叠氮反应)叠氮反应 3.3.-氨基和氨基
13、和-羧基共同参加的反应羧基共同参加的反应 (1 1)茚三酮反应)茚三酮反应注意几点:注意几点:(2 2)成肽键)成肽键 4 4侧链侧链R R基参加的反应基参加的反应 (1 1)-S-S-S-S-和和-SHSH的氧化还原反应的氧化还原反应 R-SH:HS-CH2CH2OH 巯基乙醇(巯基乙醇(mercaptoethanol)HS-CH2COOH 巯基乙酸(巯基乙酸(mercaptoacetic acid)HS-CH2(CHOH)2-CH2SH二硫苏糖醇(二硫苏糖醇(dithiothreitol,DTT)半胱氨酸的半胱氨酸的-SHSH很活泼,很容易在空气中重新氧化形成二很活泼,很容易在空气中重新氧
14、化形成二硫键,一般可用卤代化物对硫键,一般可用卤代化物对-SHSH进行保护。进行保护。(2 2)苯环的黄色反应)苯环的黄色反应 phephe+少量浓少量浓H H2 2SOSO4 4+浓浓HNOHNO3 3 黄色黄色 TyrorTrp+浓浓HNO3 黄色黄色(3 3)酚基的)酚基的MillonMillon反应(米伦氏反应)反应(米伦氏反应)HgNOHgNO3 3 TyrTyr+Hg(NOHg(NO3 3)2 2 红色红色 HNOHNO3 3 (4 4)paulypauly反应反应 His+His+重氮苯磺酸重氮苯磺酸 红色(棕红色)红色(棕红色)TyrTyr+重氮苯磺酸重氮苯磺酸 橘黄色橘黄色
15、(5 5)FolinFolin一酚反应一酚反应 +磷钼酸磷钼酸 TyrTyr磷钨酸磷钨酸 ororTrpTrp蓝色(钼蓝与钨蓝混合物)蓝色(钼蓝与钨蓝混合物)(6 6)紫外吸收:)紫外吸收:TrpTrp、TyrTyr、(、(phephe)(7 7)荧光:)荧光:TrpTrp、TyrTyr、(、(phephe)氨基酸化学性质总结氨基酸化学性质总结 (五)氨基酸分析(五)氨基酸分析 1 1分配层析法:分配层析法:分配系数分配系数 Kd=CACBCA:一种物质在一种物质在A相(流动相)中的浓度相(流动相)中的浓度 CB:一种物质在一种物质在B相(固定相)中的浓度相(固定相)中的浓度 原理:主要根据被
16、分析的样品(如原理:主要根据被分析的样品(如aaaa混合物)在两种互混合物)在两种互不相溶的溶剂中分配系数的不同而达到分离的目的,不相溶的溶剂中分配系数的不同而达到分离的目的,(1 1)逆流分溶(逆流分配)逆流分溶(逆流分配)(2 2)纸层析)纸层析 单向纸层析图单向纸层析图RfRf值值 双向纸层析图双向纸层析图 (3 3)聚酰胺薄膜层析)聚酰胺薄膜层析 (4 4)薄层层析)薄层层析 2 2离子交换层析法离子交换层析法 原理原理:分离氨基酸时,用离子交换树脂作为支持物,利用:分离氨基酸时,用离子交换树脂作为支持物,利用离离子交换树脂上的活性基团子交换树脂上的活性基团与与溶液中的离子溶液中的离子
17、进行进行交换反应交换反应,由于各,由于各种离子交换能力不同,与树脂结合的牢固程度就不同,在洗脱过种离子交换能力不同,与树脂结合的牢固程度就不同,在洗脱过程中,各种离子以不同的速度移动,从而达到分离的目的。程中,各种离子以不同的速度移动,从而达到分离的目的。这种分离主要与各种离子这种分离主要与各种离子所带电荷所带电荷有关,在电荷相同时,有关,在电荷相同时,与与极性,非极性极性,非极性有关。有关。离子交换树脂:离子交换树脂:化学本质:是一种人工合成的聚苯乙烯一苯二乙烯化学本质:是一种人工合成的聚苯乙烯一苯二乙烯组成的具有网状结构的高分子聚合物。组成的具有网状结构的高分子聚合物。外观:外观:阳离子交
18、换树脂:活性基团是酸性的阳离子交换树脂:活性基团是酸性的,如磺酸基,如磺酸基-SOSO3 3H H (强酸型),羧基强酸型),羧基-COOHCOOH(弱酸型)弱酸型)阴离子交换树脂:阴离子交换树脂:活性基团是碱性的活性基团是碱性的,如季胺基,如季胺基-N N+(CH(CH3 3)3 3OHOH-茚三酮显色:仪器灵敏度茚三酮显色:仪器灵敏度10-9mol OPA(邻苯二甲醛),荧光胺:邻苯二甲醛),荧光胺:灵敏度灵敏度10-12mol。3高效液相层析(高效液相层析(high performance liguid chromatography,HPLC)HPLC的特点的特点:(1 1)反相层析()
19、反相层析(reverse phase chromatographyreverse phase chromatography)(2 2)离子交换层析)离子交换层析 (3 3)凝胶过滤)凝胶过滤 HPLCHPLC可使氨基酸分析的灵敏度达到可使氨基酸分析的灵敏度达到1010-12-12molmol水平。水平。HPLC:(六)氨基酸的制备(六)氨基酸的制备 1 1蛋白质水解蛋白质水解 (1 1)酸水解)酸水解 (2 2)碱水解)碱水解 (3 3)酶水解)酶水解 2 2人工合成人工合成 3 3微生物发酵微生物发酵 三、肽(三、肽(peptidepeptide)(一)肽的结构和命名(一)肽的结构和命名 肽
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