药物化学复习.ppt
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1、药物筛选复习课选择药物作用靶标的考虑因素选择药物作用靶标的考虑因素1靶标的有效性,即靶标与疾病确实相关,靶标的有效性,即靶标与疾病确实相关,并且通过调节靶标的生理活性能有效地改并且通过调节靶标的生理活性能有效地改善疾病症状。善疾病症状。2靶标的副作用,如果对靶标的生理活性靶标的副作用,如果对靶标的生理活性的调节不可避免地产生严重的副作用,那的调节不可避免地产生严重的副作用,那么将其选作药物作用靶标是不合适的。么将其选作药物作用靶标是不合适的。从天然资源中寻找微生物先导药从天然资源中寻找微生物先导药的一般流程的一般流程1.采集采集各种来源的样品各种来源的样品2.根据不同的分离要求进行根据不同的分
2、离要求进行处理处理3.对各类微生物对各类微生物分离分离纯化纯化4.分离菌株的分离菌株的培养、发酵培养、发酵5.应用各种模型对发酵产品进行高通量应用各种模型对发酵产品进行高通量筛选筛选6.对对活性物质活性物质进行化学进行化学分离纯化及结构测定分离纯化及结构测定7.活性物质体内外活性物质体内外活性评价活性评价8.先导化合物的先导化合物的结构优化及深入研发结构优化及深入研发9.放大放大发酵积累量进行发酵积累量进行临床研究临床研究影响微生物合成的主要因素影响微生物合成的主要因素影响其合成效率的主要因素有:所用微生物的种类、底物、影响其合成效率的主要因素有:所用微生物的种类、底物、酶、培养基类型、温度等
3、。酶、培养基类型、温度等。(一)(一)微生物微生物微生物种类不同,其代谢以及合成的产物的结构类型乃至微生物种类不同,其代谢以及合成的产物的结构类型乃至生物活性多不相同,扩大微生物的来源是寻找新的微生物生物活性多不相同,扩大微生物的来源是寻找新的微生物产物的有效途径之一产物的有效途径之一(二)(二)酶及底物酶及底物由于生物合成酶的底物专一性较低,在其野生型菌株或阻由于生物合成酶的底物专一性较低,在其野生型菌株或阻断突变株的发酵过程中添加一些结构类似物可作为前体产断突变株的发酵过程中添加一些结构类似物可作为前体产生新的微生物产品生新的微生物产品(三)其他(三)其他培养条件培养条件微生物体具有的合成
4、能力在适宜其生长的条件下会增强,微生物体具有的合成能力在适宜其生长的条件下会增强,也会因改变培养基成分而随之也会因改变培养基成分而随之变化,当环境不利时则会抑变化,当环境不利时则会抑制其合成。制其合成。微生物发酵法微生物发酵法发酵是利用未固定的微生物在发酵罐中生长来获发酵是利用未固定的微生物在发酵罐中生长来获得所需产品,能够进行批次性的生产;得所需产品,能够进行批次性的生产;发酵罐通常为含微生物营养基的大槽或大桶。发发酵罐通常为含微生物营养基的大槽或大桶。发酵罐常配有能够调节培养基温度、酵罐常配有能够调节培养基温度、pH和氧气含量和氧气含量的调节器;的调节器;典型的培养基含碳源如葡萄糖、水合淀
5、粉或果糖;典型的培养基含碳源如葡萄糖、水合淀粉或果糖;蛋白质或氮源如大豆粉、玉米汤或棉籽粉;蛋白质或氮源如大豆粉、玉米汤或棉籽粉;维生素源如酵母提取物;矿物质和其他混合性营维生素源如酵母提取物;矿物质和其他混合性营养物。养物。初级代谢与次级代谢初级代谢与次级代谢一般将微生物通过一般将微生物通过代谢活动代谢活动所产生的所产生的自身繁殖所必需自身繁殖所必需的物质的物质和能量的过程,称为初级代谢,该过程所产生的产物即为初和能量的过程,称为初级代谢,该过程所产生的产物即为初级代谢产物,如氨基酸、核苷类,以及酶或辅酶等。级代谢产物,如氨基酸、核苷类,以及酶或辅酶等。微生物的初级代谢是指微生物从外界吸收各
6、种营养物质,通微生物的初级代谢是指微生物从外界吸收各种营养物质,通过分解代谢和合成代谢,生成维持生命活动所需要的过分解代谢和合成代谢,生成维持生命活动所需要的物质物质和能量的过程。和能量的过程。次级代谢与初级代谢关系密切,次级代谢与初级代谢关系密切,次级代谢次级代谢是指微生物在一定是指微生物在一定的生长时期,以初级代谢的关键性中间产物为前体物质,合的生长时期,以初级代谢的关键性中间产物为前体物质,合成一些对微生物的生命活动无明确功能的物质的过程,这一成一些对微生物的生命活动无明确功能的物质的过程,这一过程的产物,即为次级代谢产物。过程的产物,即为次级代谢产物。次级代谢产物在微生物生命活动过程中
7、的产生极其微量,对次级代谢产物在微生物生命活动过程中的产生极其微量,对微生物微生物本身的生命活动没有明显作用本身的生命活动没有明显作用,当次级代谢途径被阻,当次级代谢途径被阻断时,菌体生长繁殖仍不会受到影响。断时,菌体生长繁殖仍不会受到影响。微生物固定法微生物固定法细胞固定就是细胞固定就是将微生物种在一个不溶的细胞将微生物种在一个不溶的细胞性或非细胞性模块性或非细胞性模块上,模块可以是合成的聚上,模块可以是合成的聚合物、生物聚合物或微生物体本身。合物、生物聚合物或微生物体本身。微生物固定有微生物固定有种常用的方法,包括在模块中种常用的方法,包括在模块中诱导诱导、模块上、模块上吸附吸附、压缩压缩
8、入模块、与模块以入模块、与模块以共价键结合共价键结合、细胞间的化、细胞间的化学交叉结合学交叉结合以及絮以及絮凝,最常用的是诱导。凝,最常用的是诱导。基因突变的种类基因突变的种类根据遗传信息的改变方式,可分为同义突变、错义突变和无义突变三根据遗传信息的改变方式,可分为同义突变、错义突变和无义突变三种。种。同义突变:改变后的密码子和改变前的密码子是简并密码子,它们编同义突变:改变后的密码子和改变前的密码子是简并密码子,它们编码同一种氨基酸,这种基因突变称为同义突变码同一种氨基酸,这种基因突变称为同义突变错义突变:由于一对或几对碱基对的改变而使决定某一氨基酸的密码错义突变:由于一对或几对碱基对的改变
9、而使决定某一氨基酸的密码子变为决定另一种氨基酸的密码子的基因突变叫错义突变。这种基因子变为决定另一种氨基酸的密码子的基因突变叫错义突变。这种基因突变有可能使它所编码的蛋白质部分或完全失活突变有可能使它所编码的蛋白质部分或完全失活无义突变:由于一对或几对碱基对的改变而使决定某一氨基酸的密码无义突变:由于一对或几对碱基对的改变而使决定某一氨基酸的密码子变成一个终止密码子的基因突变叫无义突变。其中密码子改变为子变成一个终止密码子的基因突变叫无义突变。其中密码子改变为UAG的无义突变又叫琥珀突变,密码子改变成的无义突变又叫琥珀突变,密码子改变成UAA的无义突变又叫的无义突变又叫赭石突变赭石突变基因突变
10、的特点基因突变的特点1、基因突变在生物界中是普遍存在的、基因突变在生物界中是普遍存在的2、基因突变是随机发生的。它可以发生在生物个、基因突变是随机发生的。它可以发生在生物个体发育的任何时期和生物体的任何细胞体发育的任何时期和生物体的任何细胞3、在自然状态下,对一种生物来说,基因突变的、在自然状态下,对一种生物来说,基因突变的频率是很低的频率是很低的4、大多数基因突变对生物体是有害的、大多数基因突变对生物体是有害的5、基因突变是不定向的。一个基因可以向不同的、基因突变是不定向的。一个基因可以向不同的方向发生突变,产生一个以上的等位基因方向发生突变,产生一个以上的等位基因基因突变与药物靶标的发现及
11、应用基因突变与药物靶标的发现及应用在基因水平上寻找药物靶标过程:在基因水平上寻找药物靶标过程:1寻找疾病相关生物分子线索:利用基因突变技寻找疾病相关生物分子线索:利用基因突变技术获取疾病相关的生物分子信息,并进行生物信术获取疾病相关的生物分子信息,并进行生物信息学分析,获取线索。息学分析,获取线索。2对相关的生物分子进行功能研究,以确定候选对相关的生物分子进行功能研究,以确定候选药物作用靶标。药物作用靶标。3候选药物作用靶标,设计基因突变的候选药物作用靶标,设计基因突变的DNA及其及其多肽在分子、细胞和整体动物水平上进行药理学多肽在分子、细胞和整体动物水平上进行药理学研究。研究。4验证靶标的有
12、效性。验证靶标的有效性。What is a microarray?Microarray或或Biochip(生物芯片)是一种微型多参数生(生物芯片)是一种微型多参数生物传感器。它通过在一微小的基片表面固定大量的分子识物传感器。它通过在一微小的基片表面固定大量的分子识别探针,或构建微分析单元和系统,实现对化合物、蛋白别探针,或构建微分析单元和系统,实现对化合物、蛋白质、核酸、细胞或其它生物组分准确、快速、大信息量的质、核酸、细胞或其它生物组分准确、快速、大信息量的筛选或检测。筛选或检测。Amicroarrayisanorderedarrayofmicroscopicelementsonaplana
13、rsubstratethatallowsthespecificbindingofgenesorgeneproducts.蛋白质芯片蛋白质芯片蛋白质芯片是将各种蛋白质有序地固定在玻片、凝胶、微蛋白质芯片是将各种蛋白质有序地固定在玻片、凝胶、微孔板等各种载体上形成密集蛋白质芯片,用来高通量地测孔板等各种载体上形成密集蛋白质芯片,用来高通量地测定蛋白质的生物活性,如酶活性、蛋白质一蛋白质问及蛋定蛋白质的生物活性,如酶活性、蛋白质一蛋白质问及蛋白质一其它分子,如蛋白质一白质一其它分子,如蛋白质一DNA、蛋白质一配基问的相、蛋白质一配基问的相互作用。互作用。免疫共沉淀免疫共沉淀(Co-Immunopre
14、cipitation)免疫共沉淀(免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)是以抗体)是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白和抗原之间的专一性作用为基础的用于研究蛋白质相互作用的经典方法。是确定两种蛋白质在完质相互作用的经典方法。是确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用的有效方法。整细胞内生理性相互作用的有效方法。其基本原理是其基本原理是:细胞裂解液中加入抗体,与抗原形细胞裂解液中加入抗体,与抗原形成特异免疫复合物,经过洗脱,收集免疫复合物,成特异免疫复合物,经过洗脱,收集免疫复合物,然后进行然后进行SDS-PAGE及及Westernblotting分析。分析。特
15、点特点优点:优点:(1)相互作用的蛋白质都是经翻译后修饰的,处于天然状态;)相互作用的蛋白质都是经翻译后修饰的,处于天然状态;(2)蛋白的相互作用是在自然状态下进行的,可以避免人为的影)蛋白的相互作用是在自然状态下进行的,可以避免人为的影响;响;(3)可以分离得到天然状态的相互作用蛋白复合物。缺点为:)可以分离得到天然状态的相互作用蛋白复合物。缺点为:缺点:缺点:(1)可能检测不到低亲和力和瞬间的蛋白质蛋白质相互作用;)可能检测不到低亲和力和瞬间的蛋白质蛋白质相互作用;(2)两种蛋白质的结合可能不是直接结合,而可能有第三者在中)两种蛋白质的结合可能不是直接结合,而可能有第三者在中间起桥梁作用;
16、间起桥梁作用;(3)必须在实验前预测目的蛋白是什么,以选择最后检测的抗体,)必须在实验前预测目的蛋白是什么,以选择最后检测的抗体,所以,若预测不正确,实验就得不到结果,方法本身具有冒险性所以,若预测不正确,实验就得不到结果,方法本身具有冒险性。放射免疫性检测放射免疫性检测(RIA,Radioimmunoassay)放射免疫性检测放射免疫性检测(RIA,Radioimmunoassay)的基本的基本原理是原理是利用标记抗原利用标记抗原(Ag*)和非标记抗原和非标记抗原(Ag)对特异性抗对特异性抗体体(Ab)发生竞争性结合,用已知不同浓度的标准物发生竞争性结合,用已知不同浓度的标准物和一定量的和一
17、定量的Ag*及限量的及限量的Ab反应,采取一定方法将反应,采取一定方法将Ag*-Ab与与Ag*分开,即可算出该标准物在各浓度下分开,即可算出该标准物在各浓度下Ag*-Ab复合物的结合百分率。复合物的结合百分率。然后,加入要筛选的目标物在标准曲线上即可查出然后,加入要筛选的目标物在标准曲线上即可查出样品中是否含有要筛选的目标物及其浓度。样品中是否含有要筛选的目标物及其浓度。亲和闪烁检测法亲和闪烁检测法ScintillationProximityAssay,SPA该技术使用能产生冷光的特制平板或圆球微粒,其底该技术使用能产生冷光的特制平板或圆球微粒,其底部或外层包被着连接分子,通过化学处理可使抗体
18、、部或外层包被着连接分子,通过化学处理可使抗体、受体蛋白质和酶偶联到含闪烁的微球体(荧光微球体受体蛋白质和酶偶联到含闪烁的微球体(荧光微球体或或SPA)的表面上,当其和同位素标记的配体特异性)的表面上,当其和同位素标记的配体特异性结合,近距离释放射线能量激发产生冷光,继而被探结合,近距离释放射线能量激发产生冷光,继而被探测器所监测;不能特异性结合的小分子,其标记同位测器所监测;不能特异性结合的小分子,其标记同位素所发出的射线能量大部分被水溶液散射,而不足以素所发出的射线能量大部分被水溶液散射,而不足以激发产生冷光。可使用闪烁计数器方便地测定。激发产生冷光。可使用闪烁计数器方便地测定。Homog
19、eneous AssaysOne-pot assays with no transfer or wash steps All the reagents are added in one step or in multisteps The signal is read in a plate readerHeterogeneous Assays多步筛选:多步筛选:multiple additions/incubations/washings/transfers/filtrations/readings of the signalLabor intensive,complicated step,ha
20、rd to automateSPR基本原理基本原理它它利利用用P P偏偏振振光光在在玻玻璃璃与与金金属属薄薄膜膜界界面面处处发发生生全全内内反反射射时时渗渗透透到到金金属属薄薄膜膜内内的的消消失失波波,引引发发金金属属中中的的自自由由电电子子产产生生表表面面等等离离子子体体,当当表表面面等等离离子子体体与与消消失失波波的的频频率率相相等等时时,二二者者将将发发生生共共振振,界界面面处处的的全全反反射射条条件件将将被被破破坏坏,呈呈现现衰衰减减全全反反射射现现象象,入入射射光光被被金金属属表表面面电电子子吸吸收收,使使反反射射光光能能量量急剧下降急剧下降SPR的优点的优点1.待测物无需标记待测物
21、无需标记2.适用于混浊、不透明或者有色溶液适用于混浊、不透明或者有色溶液3.能实时、连续监测反应动态过程能实时、连续监测反应动态过程4.检测方便、快捷检测方便、快捷5.应用范围广,检测灵敏度高应用范围广,检测灵敏度高6.始终保持生物分子的活性始终保持生物分子的活性SPR缺点缺点1.难以区分非特异性吸附难以区分非特异性吸附2.对温度、样品组成等干扰因素敏感对温度、样品组成等干扰因素敏感3.多步结合和多价结合的干扰多步结合和多价结合的干扰4.空间位阻效应空间位阻效应5.配体或者分析物的不均一配体或者分析物的不均一6.扩散速度的限制扩散速度的限制7.重结合现象重结合现象SPR的应用的应用对生物分子进
22、行识别及定量检测对生物分子进行识别及定量检测研究生物分子间的相互作用研究生物分子间的相互作用用用SPR可获得的信息:可获得的信息:1.两个分子之间结合的特异性两个分子之间结合的特异性2.目标分子的浓度目标分子的浓度3.结合以及解离过程的动力学参数结合以及解离过程的动力学参数4.结合的强度结合的强度报告基因检测报告基因检测报告基因检测(报告基因检测(reportgeneassay)报告基因报告基因(reportergene)是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因,也就是一种编码可被检测的蛋白质或酶的基因,也就是说,是一个其表达产物非常容易被鉴定的基因。是说,是一个其表达产物非常容易被鉴定的基因。把
23、它的编码序列和基因表达调节序列相融合形成把它的编码序列和基因表达调节序列相融合形成嵌合基因,或与其它目的基因相融合,在调控序嵌合基因,或与其它目的基因相融合,在调控序列控制下进行表达,从而利用它的表达产物来标列控制下进行表达,从而利用它的表达产物来标定目的基因的表达调控,筛选得到转化体。定目的基因的表达调控,筛选得到转化体。报告基因的特点:报告基因的特点:(1)已被克隆和全序列已测定;已被克隆和全序列已测定;(2)表达产物在受体细胞中不存在,即无背表达产物在受体细胞中不存在,即无背景,在被转染的细胞中无相似的内源性表景,在被转染的细胞中无相似的内源性表达产物;达产物;(3)其表达产物能进行定量
24、测定。其表达产物能进行定量测定。报告基因的种类报告基因的种类1、氯霉素乙酰转移酶、氯霉素乙酰转移酶2、半乳糖苷酶、半乳糖苷酶3、人生长激素、人生长激素4、荧光素酶、荧光素酶5、荧光蛋白、荧光蛋白荧光产生的原因荧光产生的原因原子荧光光谱原子荧光光谱的产生的产生气态自由气态自由原子吸收原子吸收光源的特征辐射后,光源的特征辐射后,原子的外层电子跃迁到较高能级,然后又原子的外层电子跃迁到较高能级,然后又跃迁返回基态或较低能级,同时发射出与跃迁返回基态或较低能级,同时发射出与原激发波长相同或不同的发射即为原子荧原激发波长相同或不同的发射即为原子荧光。原子荧光是光致发光,也是二次发光。光。原子荧光是光致发
25、光,也是二次发光。当激发光源停止照射之后,再发射过程立当激发光源停止照射之后,再发射过程立即停止。即停止。时间分辨荧光(时间分辨荧光(HTRF)一般荧光技术的缺点是荧一般荧光技术的缺点是荧RF光寿命短,光寿命短,背景荧光高,激发光和发射光容易相互背景荧光高,激发光和发射光容易相互干扰干扰HTRF主要是利用碱土金属寿命长的特点,主要是利用碱土金属寿命长的特点,可以在激发和检测之间延缓一段时间,可以在激发和检测之间延缓一段时间,使具有不同荧光寿命的物质达到分别检使具有不同荧光寿命的物质达到分别检测的目的。同时通过荧光谐振能量传递测的目的。同时通过荧光谐振能量传递原理,区分开激发光和发射光原理,区分
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- 药物 化学 复习
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