分子生物学复习题总结.pdf
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1、一、简述一、简述 DNADNA 二级结构的特点二级结构的特点双螺旋:双螺旋:DNADNA 两条核苷酸链反向平行,以一定平行距离绕一两条核苷酸链反向平行,以一定平行距离绕一个轴盘旋,形成一个右旋的双螺旋体。个轴盘旋,形成一个右旋的双螺旋体。主链:主链:磷酸和核苷酸排列在双螺旋外侧,磷酸和核苷酸排列在双螺旋外侧,彼此通过彼此通过 3-53-5 磷酸二磷酸二脂键相连接,形成主链。脂键相连接,形成主链。碱基配对:两条主链相对应的碱基按照碱基配对:两条主链相对应的碱基按照 ATAT 和和 GCGC 的配对原则的配对原则由氢键相连,其中由氢键相连,其中 ATAT 之间由两个氢键相连,之间由两个氢键相连,G
2、CGC 之间由三个氢键之间由三个氢键相连。主链上碱基排列顺序储藏了遗传密码信息。相连。主链上碱基排列顺序储藏了遗传密码信息。结构尺寸和大小沟:结构尺寸和大小沟:DNADNA 双螺旋分子直径为双螺旋分子直径为 2nm2nm,螺距为,螺距为3.4nm3.4nm,其中包括,其中包括 1010 个碱基对,碱基与碱基之间距离为个碱基对,碱基与碱基之间距离为 0.34nm0.34nm。螺旋外部有两个凹槽,根据大小分为大小沟,都能使蛋白质分子螺旋外部有两个凹槽,根据大小分为大小沟,都能使蛋白质分子进入而与碱基相接触。进入而与碱基相接触。二、核酸的变性二、核酸的变性DNADNA 二级结构和三级结构受到物理化学
3、因素的破坏而解体,二级结构和三级结构受到物理化学因素的破坏而解体,但其一级结构核苷酸间共价键并不断裂。但其一级结构核苷酸间共价键并不断裂。DNADNA 分子由稳定的双螺旋结构松解为无规则线性结构的现分子由稳定的双螺旋结构松解为无规则线性结构的现象。变性时维持双螺旋稳定性的氢键断裂,碱基间的堆积力遭到象。变性时维持双螺旋稳定性的氢键断裂,碱基间的堆积力遭到破坏,但不涉及到其一级结构的改变。凡能破坏双螺旋稳定性的破坏,但不涉及到其一级结构的改变。凡能破坏双螺旋稳定性的因素,如加热、极端的因素,如加热、极端的 pHpH、有机试剂甲醇、乙醇、尿素及甲酰胺、有机试剂甲醇、乙醇、尿素及甲酰胺等,均可引起核
4、酸分子变性。等,均可引起核酸分子变性。三、核酸的复性三、核酸的复性变性变性 DNADNA 在适合的条件下,又可使两条彼此分开的链重新缔在适合的条件下,又可使两条彼此分开的链重新缔合,按原来的碱基对配对形成双螺旋结构的过程。合,按原来的碱基对配对形成双螺旋结构的过程。影响因素:影响因素:DNADNA 长度、序列、浓度长度、序列、浓度四、核酸杂交四、核酸杂交不同来源但具有同源性的两条不同来源但具有同源性的两条 DNADNA或或RNARNA单链按照碱基配对单链按照碱基配对原则结合在一起,这一过程就是杂交。原则结合在一起,这一过程就是杂交。杂交充分利用了核酸的变性和复性的特性,杂交充分利用了核酸的变性
5、和复性的特性,在在 DNADNA 之间,之间,DNADNA和和 RNARNA 之间以及之间以及 RNARNA 之间均可进行,之间均可进行,已成为分子生物学中重要的已成为分子生物学中重要的技术。技术。五、五、DNADNA 损伤、修复与基因突变三者的关系。损伤、修复与基因突变三者的关系。由体内因素和环境因素原因导致由体内因素和环境因素原因导致 DNADNA 分子结构的任何异常改分子结构的任何异常改变都可看作是变都可看作是 DNADNA 损伤。损伤。细胞内还存在着长期进化中建立和发展起来的细胞内还存在着长期进化中建立和发展起来的 DNADNA 修复保障修复保障系统,可针对系统,可针对 DNADNA
6、的损伤及时进行清除和修复。的损伤及时进行清除和修复。突变是指突变生物体内突变是指突变生物体内 DNADNA 结构的任何改变,结构的任何改变,主要指主要指 DNADNA 分分子中核苷酸序列的改变,包括替换、插入、重排、缺失等。这些子中核苷酸序列的改变,包括替换、插入、重排、缺失等。这些改变能够引起生物体基因组结构及功能的改变。改变能够引起生物体基因组结构及功能的改变。DNADNA 损伤又称前突变,如果细胞不能将损伤完全修复,损伤又称前突变,如果细胞不能将损伤完全修复,DNADNA不能恢复损伤前的结果形态,就形成不可逆的永久性、可遗传的不能恢复损伤前的结果形态,就形成不可逆的永久性、可遗传的改变,
7、即发生了基因突变。改变,即发生了基因突变。因此三者之间的关系是,因此三者之间的关系是,DNADNA 损伤是突变的基础,而修复时损伤是突变的基础,而修复时阻止损伤变成突变的手段,突变时损伤无法修复造成的后果。阻止损伤变成突变的手段,突变时损伤无法修复造成的后果。六、六、DNADNA 损伤主要的修复方式损伤主要的修复方式DNADNA 修复可以在三个水平上进行:修复可以在三个水平上进行:1 1、DNADNA 复制前水平或非复制复制前水平或非复制 DNADNA 的修复:如回复修复和切的修复:如回复修复和切除修复。除修复。回复修复包括:酶学光修复(修复嘧啶二聚体)回复修复包括:酶学光修复(修复嘧啶二聚体
8、),单链断裂重,单链断裂重组(连接缺口组(连接缺口 5 5 磷酸根和磷酸根和 3 3 羟基形成磷酸二酯键)羟基形成磷酸二酯键),嘌呤直接插入,嘌呤直接插入(修复无嘌呤位点)(修复无嘌呤位点)。切除修复包括:碱基切除修复和核苷酸切除。切除修复包括:碱基切除修复和核苷酸切除修复。步骤为识别、切除、修补、连接。修复。步骤为识别、切除、修补、连接。DNADNA 复制水平的修复,如错配修复。复制水平的修复,如错配修复。错配修复:将错配修复:将 DNADNA 复制过程中未得到校正的错配碱基进行二复制过程中未得到校正的错配碱基进行二次校正。次校正。DNADNA 复制水平后的修复,如重组修复及复制水平后的修复
9、,如重组修复及 SOSSOS 修复。修复。重组修复:利用含有正常遗传信息的同源姐妹重组修复:利用含有正常遗传信息的同源姐妹 DNADNA 分子进行分子进行重组修复。这种修复常发生在修复后,可以对发生在重组修复。这种修复常发生在修复后,可以对发生在 DNADNA 两条链两条链同一部位的损伤或者是复制时双链分开没有互补链可利用时的损同一部位的损伤或者是复制时双链分开没有互补链可利用时的损伤进行修复。伤进行修复。SOSSOS 修复:修复:SOSSOS 修复是指修复是指 DNADNA 受到严重损伤、细胞处于危急受到严重损伤、细胞处于危急状态时所诱导的一种状态时所诱导的一种 DNADNA 修复方式,修复
10、结果只是能维持基因组修复方式,修复结果只是能维持基因组的完整性,提高细胞的生成率,但留下的错误较多,故又称为错的完整性,提高细胞的生成率,但留下的错误较多,故又称为错误倾向修复,使细胞有较高的突变率。误倾向修复,使细胞有较高的突变率。七、基因突变的分子机制七、基因突变的分子机制碱基替换(碱基替换(substitutionsubstitution)即)即 DNADNA 分子中原有的一个碱基对被分子中原有的一个碱基对被另一个碱基对取代,其中嘌呤与嘌呤、嘧啶与嘧啶之间的互变称另一个碱基对取代,其中嘌呤与嘌呤、嘧啶与嘧啶之间的互变称为为 转转 换换(transitiontransition),嘌嘌 呤
11、呤 与与 嘧嘧 啶啶 之之 间间 的的 互互 变变 称称 为为 颠颠 换换(transversiontransversion)。碱基插入(碱基插入(insertioninsertion)在)在 DNADNA 序列中插入一个或几个额外的序列中插入一个或几个额外的碱基对。碱基对。碱基缺失碱基缺失(deletiondeletion)DNADNA 分子中丢失一个碱基对或一段序列。分子中丢失一个碱基对或一段序列。重排(重排(rearrangementrearrangement)DNADNA 位点的跨距离连接或指基因内部位点的跨距离连接或指基因内部不同区域之间的跨越连接。不同区域之间的跨越连接。八、依据受
12、到影响的氨基酸顺序方面的变化,可将基因突变八、依据受到影响的氨基酸顺序方面的变化,可将基因突变分为几类:分为几类:如果碱基的改变并未改变其编码的氨基酸及其序列,如果碱基的改变并未改变其编码的氨基酸及其序列,称为同称为同义突变(义突变(synonymous mutationsynonymous mutation),这类突变是沉默突变,因为突变,这类突变是沉默突变,因为突变基因与未突变基因编码完全相同的蛋白,对基因组功能没有影响。基因与未突变基因编码完全相同的蛋白,对基因组功能没有影响。如果碱基的改变引起了产物氨基酸顺序的改变,如果碱基的改变引起了产物氨基酸顺序的改变,则称之为错则称之为错义突变义
13、突变(missense mutationmissense mutation)。错义突变可以是致死性的,错义突变可以是致死性的,即致死即致死突变(突变(lethallethal mutationmutation);也可能不影响蛋白质的活性,不表现出;也可能不影响蛋白质的活性,不表现出明显的性状变化,即中性突变(明显的性状变化,即中性突变(neutral mutationneutral mutation)。如果碱基的改变使一个编码氨基酸的密码子转变为一个终如果碱基的改变使一个编码氨基酸的密码子转变为一个终止密码子,使蛋白质的合成提前终止,称为无义突变(止密码子,使蛋白质的合成提前终止,称为无义突变
14、(nonsensenonsensemutationmutation)或链终止突变(或链终止突变(chain termination mutationchain termination mutation)。如果终止密码子转变为一个编码氨基酸的密码子,如果终止密码子转变为一个编码氨基酸的密码子,造成终止造成终止信号的通读信号的通读(read throughread through),结果会产生过长的肽链,结果会产生过长的肽链,称之延长突称之延长突变(变(elongation mutationelongation mutation)或通读突变()或通读突变(read through mutation
15、read through mutation)。对多数蛋白,短的延长片段不会影响其功能,但长的延长片段则对多数蛋白,短的延长片段不会影响其功能,但长的延长片段则有可能影响蛋白的折叠,造成活性的下降。有可能影响蛋白的折叠,造成活性的下降。有些基因突变的表型会通过第二次基因的突变得以恢复,有些基因突变的表型会通过第二次基因的突变得以恢复,这这种第二次突变称为回复突变种第二次突变称为回复突变(back mutationback mutation 或或 reverse mutationreverse mutation);如果第二次突变不是通过“校正”第一次突变,而是通过抑制第如果第二次突变不是通过“校正
16、”第一次突变,而是通过抑制第一一次次突突变变效效应应的的表表现现来来恢恢复复其其表表现现型型,则则称称之之为为抑抑制制突突变变(suppression mutationsuppression mutation)。九、基因突变:突变是指突变生物体内九、基因突变:突变是指突变生物体内 DNADNA 结构的任何改结构的任何改变,主要指变,主要指 DNADNA 分子中核苷酸序列的改变,包括替换、插入、重分子中核苷酸序列的改变,包括替换、插入、重排、缺失等。而这种改变没有被修复,就形成不可逆的永久性、排、缺失等。而这种改变没有被修复,就形成不可逆的永久性、可遗传的改变,即发生了基因突变。这些改变能够引起
17、生物体基可遗传的改变,即发生了基因突变。这些改变能够引起生物体基因组结构及功能的改变。因组结构及功能的改变。基因突变热点:无论是自发突变还是诱发突变,生物体特定基因突变热点:无论是自发突变还是诱发突变,生物体特定基因中发生的突变并不是随机分布的,而是常常局限于一定的位基因中发生的突变并不是随机分布的,而是常常局限于一定的位点,这些位点发生突变的频率远远高于其它位点,称为突变热点点,这些位点发生突变的频率远远高于其它位点,称为突变热点(hot spothot spot)。转座子:转座子:(transposontransposon)是指能将自身插入基因组中一个在序是指能将自身插入基因组中一个在序列
18、上无关的新位点的列上无关的新位点的 DNADNA 序列。序列。十、基因转录的基本特征十、基因转录的基本特征1 1 对于一个基因组,转录指发生于一部分基因,而且每个基对于一个基因组,转录指发生于一部分基因,而且每个基因的转录都受到相对独立的控制。因的转录都受到相对独立的控制。2 2 转录是不对称的,基因转录只能以双链转录是不对称的,基因转录只能以双链 DNADNA 分子中的一分子中的一条链作为模板,而另一条链不能作模板。与条链作为模板,而另一条链不能作模板。与 mRNAmRNA 有相同序列的有相同序列的成为有义链,另一条作为转录模板的称为模板链,也成为反义链。成为有义链,另一条作为转录模板的称为
19、模板链,也成为反义链。3 3 基因转录的前体是基因转录的前体是 4 4 种核糖核酸三磷酸:种核糖核酸三磷酸:ATPATP、GTPGTP、CTPCTP、UTPUTP。4 4 RNARNA 的核苷酸序列是由的核苷酸序列是由 DNADNA 模板的核苷酸序列决定,即模板的核苷酸序列决定,即RNARNA 的碱基与的碱基与 DNADNA 碱基相互配对。碱基相互配对。5 RNA5 RNA 以以 5-35-3 方向延伸,新加入的核苷酸分子以方向延伸,新加入的核苷酸分子以 5-5-三磷酸基三磷酸基团与团与 RNARNA 链的游离链的游离 3-OH3-OH 反应,反应,RNARNA 链与模板链方向相反。链与模板链
20、方向相反。6 6 与与 DNADNA 聚合酶不同,聚合酶不同,RNARNA 聚合酶在聚合酶在 RNARNA 合成的起始阶段合成的起始阶段不需要引物参与。不需要引物参与。7 RNA7 RNA 参与合成起始的第一个核苷酸以其参与合成起始的第一个核苷酸以其 3-OH3-OH 供延伸反应,供延伸反应,因此新合成因此新合成 RNARNA 的的 5 5 端具有三磷酸结构,第一个参与的一半都是端具有三磷酸结构,第一个参与的一半都是嘌呤核苷酸。嘌呤核苷酸。8 8 RNARNA 的生物合成包括的生物合成包括 3 3 个阶段:个阶段:RNARNA 聚合酶与聚合酶与 DNADNA 模板模板特殊区域的结合与起始;特殊
21、区域的结合与起始;RNARNA 链延伸;合成终止与新生链延伸;合成终止与新生 RNARNA 链释链释出。出。十一、转录的过程:十一、转录的过程:1 1 转录起始:转录起始:RNARNA 聚合酶识别结合启动子(亚基)聚合酶识别结合启动子(亚基);形成;形成闭链复合物;闭链复合物;形成开链复合物形成开链复合物(1717 个碱基长度)个碱基长度);RNARNA 合成的起始。合成的起始。2 2 转录的延长阶段:转录的延长阶段:RNARNA 合成方向沿合成方向沿 5-35-3 方向进行;方向进行;RNARNA 延延伸过程中,伸过程中,要求在要求在 RNARNA 合成位点处的模板合成位点处的模板 DNAD
22、NA 解链,解链,产生一个长产生一个长度为度为 17+/-117+/-1 碱基对的转录泡,合成的碱基对的转录泡,合成的 RNARNA 暂时与暂时与 DNADNA 有义链形有义链形成约成约 12bp12bp 的杂交链。随着的杂交链。随着 RNARNA 的延长,核心酶前面的的延长,核心酶前面的 DNADNA 双螺双螺旋不断解开,旋不断解开,而后面的而后面的 DNADNA 重新回到解螺旋结果,重新回到解螺旋结果,同时同时 RNARNA 链也链也不断从不断从 RNARNA、DNADNA 杂交体中分离出来;杂交体中分离出来;转录的忠实性要比复制低,转录的忠实性要比复制低,但由于体内大多数基因是重复转录,
23、再加上遗传密码子的简并性但由于体内大多数基因是重复转录,再加上遗传密码子的简并性和错误合成不影响子代的性状,这样的错误率可以耐受。和错误合成不影响子代的性状,这样的错误率可以耐受。3 3 转录的终止阶段:转录的终止阶段:有两种形式,有两种形式,一种是因子不依赖终止,一种是因子不依赖终止,一种是因子依赖终止。一种是因子依赖终止。因子不依赖终止:新合成的因子不依赖终止:新合成的 RNARNA 链一旦出现发夹样的茎链一旦出现发夹样的茎环局部二级结构,环局部二级结构,RNARNA 聚合停止作用,聚合停止作用,磷酸二酯酶停止形成,磷酸二酯酶停止形成,RNARNA合成终止。合成终止。因子依赖终止:因子附着
24、在新生因子依赖终止:因子附着在新生 RNARNA 上,然后沿上,然后沿 5-35-3方向朝方向朝 RNARNA 聚合酶移动,直到因子接触到依赖因子的终止位聚合酶移动,直到因子接触到依赖因子的终止位点暂停的点暂停的 RNARNA 聚合酶,并与之反应,使新生的聚合酶,并与之反应,使新生的 RNARNA 链释放出来。链释放出来。十二、十二、transcriptiontranscription:转录;是以:转录;是以DNADNA 为模板,在为模板,在 RNARNA 聚合聚合酶作用下合成酶作用下合成 RNARNA 的过程,是遗传信息从的过程,是遗传信息从 DNADNA 向向 RNARNA 传递的过传递的
25、过程。是生物合成程。是生物合成 RNARNA 的主要方式。转录子;由的主要方式。转录子;由 2 2 个和个和 2 2 个以上紧个以上紧密连锁密连锁,并共同转录在一种并共同转录在一种 mRNAmRNA 分子中的结构基因组成的复合单分子中的结构基因组成的复合单位。位。(只存在于原核生物)(只存在于原核生物)。以转录子为模板转录生成的以转录子为模板转录生成的 mRNAmRNA,可可以同时编码以同时编码 2 2 种或种或 2 2 种以上的蛋白质,并参与同一代谢途径中的种以上的蛋白质,并参与同一代谢途径中的反应。反应。promoterpromoter:启动子;:启动子;DNADNA 分子上可与分子上可与
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