作物学河南省高等学校青年骨干教师考核报告.docx
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1、学科名称作物学河南省高等学校青年骨干教师考核报告项目名称: 玉米灌浆速率相关基因Zm/G厂功能验证与分子机理解析起止时间: 2017.01 至 2020.12培养对象姓名:李卫华专业技术职务:副教授ABCKO+/-ehdl+/-图5等位性测验果穗表型A: K0(+/-)与ehd 1(+/-)等位性测验杂交果穗的分离情况;B:等位性测验WT与突变体籽粒性状比较(Bar=0.5 cm) ; C:等位性测验WT与突变籽粒发芽率(Pl并且显著值30.05的条件,利用DEGseq软件鉴定了 4760个基因为差异表 达基因(DEGs),其中包括对或突变体而言,差异基因中有2208个基因上 调表达及2551
2、个基因下调表达。通过利用实时荧光定量PCR来确定RNA-seq的结果。 GRMZM2Go88273、GRMZM2G346897、6口乂2乂26067929 和6112126418119表达水平 与RNA-seq数据一致,在ehdl突变体中的低于野生型(图12)。而突变体ehd1中 GRMZM2G156877和GRMZM2G420988的表达量高于野生型,表明/ RNA-seq数据真实 可靠。涮招联斐典图12 RT-PCR验证IMM来文奥GO分析结果表明,4760个DEGs主要富集于应激反应(GO:. P=1.2e12) integral to membrane (GO:, P=lc-5)、in
3、tracellular membrane-bounded organelle (GO:, P = 0.0002)、液 泡(GO:, P = 0.0007)、淀粉代谢过程(GO:,P= 1.6e 5)和糖类代谢过程(GO:,P= 1.2e12) 等生物学过程(图13)。WEGO outputCellular Component Molecular FunctionBiological Process10014291532s u 6oQ)qEnN图13 GO分析在这些DEGs中与生长素介导信号途径(GO:,P=1.2e25)和生长素刺激响应(GO:,P = 2.1/)有关的基因包括生长素响应因子、
4、AUX/IAA转录因子、生长素上调小RNA(SAUR)、 【引味乙醛氧化的、生长素运输蛋白和输出载体。对其中的4个DEGs基因(GRMZM2Go82943、 GRMZM2G365188、6112N156809195 和61化126019799)进行实时荧光定量分析,发 现它们在ehdl突变体和野生型中均有显著的表达差异(图14)。上述结果表明ZmEHDl可 能影响玉米中生长素平衡。!如梁玄轻!如梁玄轻图14 RT-PCR验证(部分基因)2.2成果特色及创新点候选基因对于玉米生长发育十分重要ehdl突变体在籽粒方面的缺陷主要表现在弱势灌浆造成的籽粒皱缩,进而导致百粒重 严重降低,同时Md/突变体
5、胚的发育滞后。在营养生长阶段也表现出多种缺陷表型,如发 芽率低、初生根长度和侧根数目都显著低于野生型。这种多效性缺陷表型的产生基本都是由 于调控生长发育关键基因发生改变造成的。对&法基因进行Real Time RT-PCR定量分 析,发现该基因在玉米各组织中均有表达,并无明显的组织特异性,说明该基因在玉米各个 组织部位对玉米的生长发育都十分重要,这与突变体在营养生长阶段和籽粒发育过程 中出现多种缺陷表型一致。成功对候选基因进行了图位克隆由于突变籽粒发芽率极低,因此采用的是七分离群体。用群体的构建相对较为容易,但 艮群体存在杂合基因型,对于显性标记,当代无法识别显性纯合基因和显性杂合基因,因此
6、需要自交一代确定表型。直接从籽粒的形态特征鉴定该突变体的表型,但是显性纯合体和显 性杂合体的表型无法利用籽粒特征进行判断,需要对其自交后代的籽粒再次种植并进行自 交确定表型,从而保证其表型鉴定的准确性。目前在MaizeGDB ()中,已经公布了 2000多 对SSR的公共引物信息,因此可以以B73序列为参考,筛选出存在多态性的分子标记,从 而实现目的基因的初步定位和前期的精细定位。SNP属于单个碱基的变异,后期当定位区间 较小而且没有合适的SSR标记时,可以通过对正常亲本和突变体进行测序,寻找二者之间 的SNP位点,并进一步开发基于SNP位点的分子标记。在进行分子标记检测时,由于所涉及 的实验
7、数据较多,难以避免地会出现错误,为了提高实验结果的准确性,应该果断去除没有 把握的数据或者进行重新验证。在本研究中,对所有不确定的数据都进行了多次重到检测, 直至得到完全确信的数据。在数据处理过程中,对每个分子标记的各种基因型的数目进行考 察,结果都符合典型的孟德尔遗传分离比。本研究通过图位克隆的方法,最终将候选基因定 位在6Kb的区间内,这个区间包含两个ORFo经过序列分析发现,WT和突变体 GRMZM2G052740在编码区有8个SNP差异,其中三个造成氨基酸的变异,而区间内 GRIZ12(;032720的序列无差异。因此,将GRUZM2Go52740做为候选基因进行研究。成功阐明候选基因
8、功能网络蛋白介导的内吞作用是一个高度动态的过程,在此过程中,细胞表面蛋白和质膜成 分被内化到细胞质中在CUE过程中,从网络蛋白的募集和货物蛋白的分拣到膜弯曲和囊 泡分裂需要60多个功能不同的适配器和辅助蛋白。在这些蛋白质中,AP2复合物是第一个 被表征的CCV (clathrin-coatcd vesicle)适配器。在拟南芥中,AP2。广泛表达,主要分 布在质膜上,AP2。功能的缺失明显抑制网络蛋白介导的内吞作用,即2。突变体在胚胎发 育、子叶器官发生、营养生长和长角果发育过程中均受到损伤。突变体内吞作用受损,营养生长和籽粒发育均出现缺陷的表型与拟南芥叩2。突 变体表型相似,因此我们猜测Zm
9、EHDl是否通过与ZmAP2。亚基互作参与网络蛋白介导的 内吞作用过程。已有研究表明,在玉米发育过程中AP2。亚基广泛表达于各种组织中“峋, 为两者之间可能存在的互作提供物理基础。首先将玉米AP2。亚基通过农杆菌侵染花絮的 方法转到拟南芥ap2a突变体植株中,发现能够回补拟南芥ap2o突变体植株的表型,该 结果表明玉米AP2。亚基与拟南芥AP2。亚基具有相似的功能。随后,用荧光双分子互补 实验在烟草表皮细胞和玉米原生质体中证实ZmEHDl与ZmAP2。亚基互作,且ZmEHDl与 ZmAP2。亚基的互作主要发生在质膜上,而ZmEHDl,.,与ZmAP2。亚基的互作不仅发生在质学 校: 河南农业大
10、学填表日期: 2020. 11.27河南省教育厅制一、基本情况研姓名李卫华性别 女民族汉出生日期1979.08所在单位河南农业大学行政职务专业职务副教授研究专长玉米遗传育种学历研究生学位博士电子信箱电话项目名称玉米灌浆速率相关基因Zm/G尸的功能验证与分子机理解析膜,而是分布在整个细胞中。DUAL膜蛋白酵母双杂和pulldown实验进一步证实两者之间的 互作。该结果表明ZmEHDl通过与ZmAP2。亚基互作参与网络蛋白介导的内吞作用过程。CME过程可以在活细胞中使用FM4-64来追踪,FM染料被广泛应用于真核细胞内吞、囊 泡转运和细胞器组织的研究。用FM4-64标记野生型和突变体的根10分钟之
11、后,每隔 30分钟检测FM4-64的吸收情况发现野生型在标记30分钟后就可观察到荧光斑点,而ehdl 突变体则在标记60分钟后才可观察到荧光斑点,在转基因敲除植株中同样出现FM4-64吸 收延迟的现象,表明EHD1的突变,使玉米内吞作用受损。已有报道,拟南芥中含有两个EHD 蛋白,AtEHDl和AtEHD2。这两种蛋白都包含有两个EF钙结合的EH结构域,一个P环,一 个预测的ATP/GTP结合位点,一个双边NLS和一个卷曲螺旋结构域(coiled-coil domain), 以及一个N端发动蛋白基序。AtEHD 2的过表达对细胞内吞有抑制作用,而AtEHDl的下调 则导致内源性物质进入植物细胞
12、的阻滞。过表达AtEHD2或下调AtEHDl的转基因植株没有 可检测到的发育表型,其与CME连锁的机制也未被研究。本研究克隆到的玉米EHD1经过序 列比对,发现具有典型的EHi)家族结构特征,但其在玉米中发挥功能的作用方式与拟南芥 EHD蛋白并不相同。初步阐明候选基因作用机制当前的转录组研究结果显示助力突变体和WT中ARFs、37弹朵-乙酸氧化酶、生长素转 运蛋白和运输载体等于生长素相关的基因均有不同水平的表达;用UPLC-MS/MS方法测定籽 粒生长素含量发现ehdl突变体中【AA浓度低于WT;并且ehdl突变体和转基因敲除植株重 力响应均比其对照野生型延缓;WT中DR5的信号主要集中在根冠
13、,而在助力突变体中,DR5 的信号明显减弱。PINla-YFP信号在WT中主要集中在中心柱,与之相比,在突变体中,PINla- YFP的信号更加扩散;同时,外源施加1-NAA可以补救Md/突变体表型。这些结果表明ehdl 突变体生长缺陷表型是由生长素体内平衡丧失引起的。2. 3主要学术价值和应用价值玉米是世界上重要的食量之一,种植范围广泛。深入研究玉米产量形成的遗传机制,促 使玉米产量持续提高是玉米遗传育种的重大课题。籽粒性状是影响玉米产量的重要因素之 一,由多个基因控制,受环境,基因与环境互作的影响。研究玉米籽粒发育相关基因,能促使人们深入了解玉米籽粒发育的调控机制。课题组前期研究在育种材料
14、中发现了一个自然突变体,其穗部明显发生饱满籽粒与皱 缩籽粒为3:1的分离,且皱缩籽粒百粒重明显下降,生长发育受到影响。经遗传分析确定该 性状由隐性单基因控制,通过图位克隆的方法进行定位获得候选基因。通过CRISPR/Cas9技 术构建敲除植株并进行等位验证,确认该基因为EHD1.随后通过定量分析、亚细胞定位、 FM4-64处理、BFA处理、荧光双分子互补实验、酵母双杂、pulldown.转录组分析等一系列 实验从细胞学、分子生物学、转录组学等多方面深入解析了 EHD1基因的作用机理。证明 ZmEHDl通过与ZmAP2。亚基互作,参与网络蛋白介导的内吞过程,通过调控生长素的体内 平衡,ZmEHD
15、l参与的CME对玉米籽粒发育和营养生长起着至关重要的作用。该研究结果有助于深入了解玉米籽粒发育的调控机制,并作为功能基因进行分子标记 辅助育种和优异单倍型筛选,为选育濯浆好产量高的玉米新品种提供基因资源和材料支撑。3、在教学水平、科研能力、团队建设、社会服务等方面的完成情况;3. 1教学水平项目执行期间,担任作物育种学、种子学、作物育种学研究进展等本科专 业核心课程的授课工作,在课堂上注重互动式教学,根据学科前沿随时更新课件和讲课内 容,教学效果良好。自2017年起担任河南农业大学作物育种学课程负责人,负责协调 教学团队建设、课程分配、考试考评等工作,保证了教学工作的正常进行。参编十三五规划
16、教材2部(作物育种学,中国农业大学出版社,2019;作物育种技术,中国农业出版社, 2020),代表学校参加国家精品在线开放课程建设项目1项(作物育种学,华中农业大学, 2019),主持校级在线开放课程建设项目1项(2019),目前已经完成一轮网上教学工作, 并于2020年被评为河南农业大学线上教学优秀课程二等奖。4. 2科研能力项目执行期间,主持河南省自然科学基金面上项目1项,省重大科技专项子课题1项 和重点实验室开放课题1项,完成省科技攻关项目1项。作为第2名承担国家自然基金1 项,郑州市重大专项1项,完成国家自然基金项目1项。协助科研团队负责人完成国家自然 基因基金和省市级重大科技专项等
17、项目的申报和验收工作,指导研究生6名。发表SCI论 文4篇,一级学报5篇(标注资助1篇);申报专利3项,选育新品种3个。获得河南省优 秀科技论文奖4项。5. 3团队建设项目执行期间,担任河南农业大学作物育种学课程负责人,协调新增教学团队成员 9名,将教学团队建设为涵盖6个作物的专业教学团队,实现了科研与教学的一体化,收到 良好的教学效果。作为农业部黄淮海南部玉米生物学与遗传育种重点实验室副主任,承担重 点实验室的年报编报、日常行政、仪器管理以及建设项目申报和验收等工作,积极参加2011 验收、重点实验室考核、一流学科创建等工作,发挥了应有的作用。6. 4社会服务积极参加社会服务工作。作为三区人
18、才项目承担者积极服务联系对象,并在进行玉米新 品种的选育和推广工作中开展技术培训、成果推广等工作,和企业开展产学研联合研究,收 到了良好的效果。4、不足之处及努力方向。主持人在团队建设、社会服务方面参加程度不够,今后将更加主动积极的进行教学、科 研团队的建设工作,更加深入的参加社会服务,实现科研基础工作和玉米生产的结合,为保 障我省玉米生产贡献出更大的力量。培养对象签字:2020年11月27日三、培养期成果一览1、承担主要教学科研项目及获奖、获得专利情况(请注明项目名称、项目来源、项目经费、项目起讫时间、所有项目完成人姓名以及项目完成人排 序等。如成果获得相应科技奖励,请注明授奖单位、奖励名称
19、、级别及日期;如成果获得专利,请 注明获准专利国别、类别及专利号)科研项目:I河南省自然科学基金面上项目,E3泛素连接酶编码基因调控玉米穗粗的遗传机制研究(), 2020-2022, 10万元,主持,在研。2河南省重大科技专项子课题,广适多抗玉米优异种质创制与新品种选育(0-0101), 2016-2019, 135万元,主持,己结题。I3j河南省科技厅技攻关重点项目,高产宜机收玉米新品种选育(2) , 2015-2017, 50万元,主持, 已结题。4省部共建小麦玉米作物作物学国家重点实验室自主课题:玉米穗长主效QTL的精细定位与克 隆,2017-2020, 21万元,主持,在研。5河南省中
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