蛋白质不稳定性.ppt
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1、第二章第二章 蛋白质的不稳定性及对策蛋白质的不稳定性及对策 刘耀玺刘耀玺河南科技大学林业职业学院河南科技大学林业职业学院河南科技大学林业职业学院河南科技大学林业职业学院生物技术教研室生物技术教研室生物技术教研室生物技术教研室一、蛋白质失活的机制一、蛋白质失活的机制 根根据据蛋蛋白白质质的的结结构构层层次次不不同同,经经常常将将蛋蛋白白质质的的结结构构分分为为一一级级结结构构、二二级级结结构构、三三级级结结构构和和四四级结构。级结构。蛋蛋白白质质的的一一级级结结构构就就是是共共价价主主链链的的氨氨基基酸酸序序列列,有有时时也也称称化化学学结结构构。二二、三三、四四级级结结构构又又称称空间结构(即
2、三维结构)或高级结构。空间结构(即三维结构)或高级结构。蛋蛋白白质质的的生生物物功功能能决决定定于于它它的的高高级级结结构构,高高级级结结构构是是由由一一级级结结构构即即氨氨基基酸酸序序列列决决定定的的。而而氨氨基基酸酸序序列列是是由由遗遗传传物物质质DNADNA的的核核苷苷酸酸序序列列决决定定的的。肽肽键键(CO-NHCO-NH)是是连连接接多多肽肽链链主主链链中中氨氨基基酸酸残残基基的的共共价价键键,二二硫硫键键(-S-S-S-S-)是是使使多多肽肽链链之之间间交交联或使多肽链内成环的共价键。联或使多肽链内成环的共价键。一、蛋白质失活的机制一、蛋白质失活的机制p蛋白质不稳定(失活)的表现分
3、为两种,蛋白质不稳定(失活)的表现分为两种,即化学不即化学不稳定和物理不稳定。稳定和物理不稳定。p化学不稳定化学不稳定是指蛋白质分子通过共价键的形成和断是指蛋白质分子通过共价键的形成和断裂形成新的化学实体;裂形成新的化学实体;p物理不稳定物理不稳定指蛋白质分子的高级结构的物理转变,指蛋白质分子的高级结构的物理转变,无共价键改变。无共价键改变。物理不稳定包括变性、聚集、沉淀物理不稳定包括变性、聚集、沉淀和表面吸附。和表面吸附。p蛋白质一旦发生了化学不稳定,就会完全丧失其原蛋白质一旦发生了化学不稳定,就会完全丧失其原有生理活性,产生新的功能活性或完全丧失生物活有生理活性,产生新的功能活性或完全丧失
4、生物活性。但性。但物理不稳定现象一般可以通过特定的途径恢物理不稳定现象一般可以通过特定的途径恢复其空间结构,而恢复原有的活性,复其空间结构,而恢复原有的活性,我们称这一过我们称这一过程为蛋白质的复性。程为蛋白质的复性。二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素 p蛋白质的天然折叠结构决定于蛋白质的天然折叠结构决定于3 3个因素:个因素:1 1、与溶剂分子(一般为水)的相互作用;、与溶剂分子(一般为水)的相互作用;2 2、溶剂的、溶剂的pHpH和离子组成;和离子组成;3 3、蛋白质的氨基酸序列。、蛋白质的氨基酸序列。前两个因素的影响明确、易理解,而氨基酸序前两个因素
5、的影响明确、易理解,而氨基酸序列的作用则不那么直觉。实际上列的作用则不那么直觉。实际上,一级结构便于序一级结构便于序列上相邻部分之间短程相互作用的形成,也便于相列上相邻部分之间短程相互作用的形成,也便于相隔部分之间长程相互作用的出现,隔部分之间长程相互作用的出现,虽然蛋白质分子虽然蛋白质分子的整个结构出看起来像是无组织的随机排列,然而的整个结构出看起来像是无组织的随机排列,然而其结构中无例外地其结构中无例外地有多种力处于精细的平衡之中有多种力处于精细的平衡之中,正是它决定了蛋白质的独特构象。正是它决定了蛋白质的独特构象。二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素p
6、稳定蛋白质三维结构的作用力主要是一些稳定蛋白质三维结构的作用力主要是一些所谓的所谓的弱的相互作用弱的相互作用或称或称非共价键非共价键或或次级次级键键,包括:,包括:氢键、范德华力、疏水作用和氢键、范德华力、疏水作用和盐键(离子键)。盐键(离子键)。此外,此外,共价二硫键共价二硫键在稳在稳定某些蛋白质的构象方面也起着重要作用。定某些蛋白质的构象方面也起着重要作用。p这几种作用力的键能(断裂该键所需的能这几种作用力的键能(断裂该键所需的能量)都是较低的。量)都是较低的。二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素p氢键氢键 13-30KJ/mol13-30KJ/mol-
7、1-1p范德华力范德华力 4-8 KJ/mol4-8 KJ/mol-1-1 p疏水作用疏水作用 12-20 KJ/mol12-20 KJ/mol-1-1 (注意:疏水作用的(注意:疏水作用的数值表示在数值表示在2525非极性侧链能够从蛋白质内部转非极性侧链能够从蛋白质内部转移到水介质中所需的自由能,它与其他键的键能移到水介质中所需的自由能,它与其他键的键能不同,此数值在一定范围内随温度的升高而增加。不同,此数值在一定范围内随温度的升高而增加。实际上它并不是键能,此能量的大部分并不用于实际上它并不是键能,此能量的大部分并不用于伸展过程中键的断裂。)伸展过程中键的断裂。)p盐键盐键 12-30 K
8、J/mol-112-30 KJ/mol-1p二硫键二硫键 210 KJ/mol-1210 KJ/mol-1二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素p(一)氢键:(一)氢键:氢键在稳定蛋白质的结构中起着极其重要的氢键在稳定蛋白质的结构中起着极其重要的作用,作用,多肽主链上的羰基和酰胺基之间多肽主链上的羰基和酰胺基之间形成的氢形成的氢键是稳定蛋白质二级结构的主要作用力,另外,键是稳定蛋白质二级结构的主要作用力,另外,氢键还可以在氢键还可以在侧链与侧链侧链与侧链、侧链与介质水侧链与介质水、主链主链肽基与侧链肽基与侧链或或主链肽基与水主链肽基与水之间形成。之间形成。大多
9、数蛋白质分子所采取的折叠策略是使主大多数蛋白质分子所采取的折叠策略是使主链肽基之间形成最大数目的分子内氢键(如链肽基之间形成最大数目的分子内氢键(如螺螺旋、旋、折叠),与此同时保持大多数能成氢键的折叠),与此同时保持大多数能成氢键的侧链处于蛋白质分子的表面将与水结合。侧链处于蛋白质分子的表面将与水结合。二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素p(二)范德华力(范德华相互作用):(二)范德华力(范德华相互作用):p广义的范德华力包括广义的范德华力包括3 3种较弱的作用力,即:种较弱的作用力,即:定向效应:定向效应:发生在极性分子或极性基团之间,它是永发生在极性分子
10、或极性基团之间,它是永久偶极间的静电相互作用,氢键可被认为属于这种范久偶极间的静电相互作用,氢键可被认为属于这种范德华力;德华力;诱导效应:诱导效应:发生在极性物质与非极性物质之间,这是发生在极性物质与非极性物质之间,这是永久性偶极与由它诱导而来的诱导偶极之间的静电相永久性偶极与由它诱导而来的诱导偶极之间的静电相互作用;互作用;分散效应:分散效应:是在多数情况下起主要作用的范德华力,是在多数情况下起主要作用的范德华力,它是非极性分子或基团间仅有的一种范德华力,即狭它是非极性分子或基团间仅有的一种范德华力,即狭义的范德华力,通常所说的范德华力指的就是这种作义的范德华力,通常所说的范德华力指的就是
11、这种作用力。它是瞬时偶极间的相互作用,偶极方向是瞬时用力。它是瞬时偶极间的相互作用,偶极方向是瞬时变化的。变化的。二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素 瞬时偶极是由于所在分子或基团中电子电荷密度瞬时偶极是由于所在分子或基团中电子电荷密度的波动,即电子运动的不对称性造成的。瞬时偶极可的波动,即电子运动的不对称性造成的。瞬时偶极可以诱导周围的分子或基团产生诱导偶极,诱导偶极反以诱导周围的分子或基团产生诱导偶极,诱导偶极反过来又稳定了原来的偶极,因此它们之间产生了相互过来又稳定了原来的偶极,因此它们之间产生了相互作用。作用。狭义的范德华力是一种很弱的作用力,而且随
12、狭义的范德华力是一种很弱的作用力,而且随非共价键合原子与分子间距离(非共价键合原子与分子间距离(R R)的)的6 6次方的倒数而次方的倒数而变化。变化。虽然就个别来说,范德华力是很弱的,但是范虽然就个别来说,范德华力是很弱的,但是范德华相互作用数量大,并且具有加和效应和位相效应德华相互作用数量大,并且具有加和效应和位相效应(当分子或集团相同时,其瞬间偶极矩同位相,从而(当分子或集团相同时,其瞬间偶极矩同位相,从而产生最大的相互作用),因此,就成为一种不可忽视产生最大的相互作用),因此,就成为一种不可忽视的作用力。的作用力。二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素
13、(三)疏水作用:(三)疏水作用:p水介质中球状蛋白质的折叠总是趋向于把疏水残基埋藏在水介质中球状蛋白质的折叠总是趋向于把疏水残基埋藏在分子的内部,这一现象称为疏水作用或疏水效应。它在稳分子的内部,这一现象称为疏水作用或疏水效应。它在稳定蛋白质的三级结构方面占有突出地位。定蛋白质的三级结构方面占有突出地位。疏水作用其实并疏水作用其实并不是疏水基团之间有什么吸引力的缘故,而是疏水基团或不是疏水基团之间有什么吸引力的缘故,而是疏水基团或疏水侧链出自避开水的需要而被迫接近。疏水侧链出自避开水的需要而被迫接近。当然,当疏水基当然,当疏水基团接近到等于范德华距离时,相互间将有弱的范德华引力,团接近到等于范
14、德华距离时,相互间将有弱的范德华引力,但这不是主要的。蛋白质溶液中的熵增加是疏水作用的主但这不是主要的。蛋白质溶液中的熵增加是疏水作用的主要动力。要动力。p疏水作用在生理温度范围内随温度升高而加强,疏水作用在生理温度范围内随温度升高而加强,但超过一但超过一定温度后(定温度后(50-6050-60,因侧链而异),又趋减弱,因为超,因侧链而异),又趋减弱,因为超过这个温度,疏水基团周围的水分子有序度降低,因而有过这个温度,疏水基团周围的水分子有序度降低,因而有利于疏水基团进入水中。利于疏水基团进入水中。p非极性溶剂、去污剂是破坏疏水作用的试剂,因此是非极性溶剂、去污剂是破坏疏水作用的试剂,因此是变
15、性变性剂剂。尿素和盐酸胍既能破坏氢键,又能破坏疏水作用,因。尿素和盐酸胍既能破坏氢键,又能破坏疏水作用,因此是此是强变性剂强变性剂。二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素p(四)盐键:(四)盐键:又称盐桥或离子键。它是正电荷与负电荷之间的一种静电又称盐桥或离子键。它是正电荷与负电荷之间的一种静电相互作用。在生理相互作用。在生理pHpH下下,蛋白质中的酸性氨基酸(天冬氨酸蛋白质中的酸性氨基酸(天冬氨酸和谷氨酸)的侧链可离解成负离子,碱性氨基酸(赖氨酸、和谷氨酸)的侧链可离解成负离子,碱性氨基酸(赖氨酸、精氨酸和组氨酸)的侧链可离解成正离子。精氨酸和组氨酸)的侧链
16、可离解成正离子。在多数情况下在多数情况下这些基团都分布在球状蛋白质分子表面,而与介质水分子这些基团都分布在球状蛋白质分子表面,而与介质水分子发生电荷发生电荷-偶极之间的相互作用,偶极之间的相互作用,形成排列有序的形成排列有序的水化层水化层,这对稳定蛋白质的构象有着一定作用。这对稳定蛋白质的构象有着一定作用。p带电荷的侧链也在蛋白质分子内部出现,它们一般与其他带电荷的侧链也在蛋白质分子内部出现,它们一般与其他基团形成强的氢键,但是偶尔也有少数带相反电荷的侧链基团形成强的氢键,但是偶尔也有少数带相反电荷的侧链在分子的疏水作用内部形成盐键。在分子的疏水作用内部形成盐键。在疏水环境中,介电常在疏水环境
17、中,介电常数比在水中低,相反电荷间的吸引力相应增大。当荷电侧数比在水中低,相反电荷间的吸引力相应增大。当荷电侧链从水中转移到分子内部时,它周围有序排列的水分子被链从水中转移到分子内部时,它周围有序排列的水分子被释放到介质水中,因此,盐键的形成不仅是静电吸引而且释放到介质水中,因此,盐键的形成不仅是静电吸引而且也是熵增加的过程。也是熵增加的过程。升高温度,可以增加盐桥的稳定性。升高温度,可以增加盐桥的稳定性。此外,盐键因加入非极性溶剂而加强,加入盐类而减弱。此外,盐键因加入非极性溶剂而加强,加入盐类而减弱。二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素二、蛋白质结构中影响稳定性的重要因素p(五)二硫键:(
18、五)二硫键:二硫键的形成并不规定多肽链的折叠。二硫键的形成并不规定多肽链的折叠。然而一旦蛋白质采取了它的三维结构,则然而一旦蛋白质采取了它的三维结构,则二硫键的形成将对此构象起稳定作用。二硫键的形成将对此构象起稳定作用。同同一个蛋白质中,有些二硫键是生物活性所一个蛋白质中,有些二硫键是生物活性所必需的,另一些二硫键则不是生物活性所必需的,另一些二硫键则不是生物活性所必需的,但与维持蛋白质的稳定有关,必需的,但与维持蛋白质的稳定有关,假假如蛋白质中所有的二硫键相继被还原,将如蛋白质中所有的二硫键相继被还原,将引起蛋白质的天然构象改变和生物活性丢引起蛋白质的天然构象改变和生物活性丢失。失。三、环境
19、因素对蛋白质稳定性的影响三、环境因素对蛋白质稳定性的影响p物理因素物理因素:温度、紫外线照射、高压和表面张:温度、紫外线照射、高压和表面张力等;力等;p化学因素化学因素:有机溶剂、脲、胍、酸、碱等;如:有机溶剂、脲、胍、酸、碱等;如尿素和盐酸胍,一方面能与多肽主链竞争氢键,尿素和盐酸胍,一方面能与多肽主链竞争氢键,破坏蛋白质的二级结构;更重要的是它们可以破坏蛋白质的二级结构;更重要的是它们可以增加非极性侧链在水中的溶解度,因而降低了增加非极性侧链在水中的溶解度,因而降低了维持蛋白质三级结构的疏水相互作用。维持蛋白质三级结构的疏水相互作用。p酶的作用酶的作用:一些蛋白质分解酶类的作用。:一些蛋白
20、质分解酶类的作用。p微生物因素微生物因素:微生物分解利用蛋白质进行生长:微生物分解利用蛋白质进行生长繁殖繁殖 三、环境因素对蛋白质稳定性的影响三、环境因素对蛋白质稳定性的影响p值得注意的是:值得注意的是:蛋白质的变性是一个蛋白质的变性是一个协同协同过程,过程,它是在所加变性剂的很窄浓度范围它是在所加变性剂的很窄浓度范围内或很窄内或很窄pHpH或温度间隔内突然发生的。或温度间隔内突然发生的。四、分离纯化中保持蛋白质稳定的方法四、分离纯化中保持蛋白质稳定的方法 1 1、尽量在相对密封和无菌的环境下、尽量在相对密封和无菌的环境下快速快速进行进行分离纯化操作;分离纯化操作;2 2、在生理温度和压力范围
21、内完成分离纯化操、在生理温度和压力范围内完成分离纯化操作;作;3 3、慎用溶剂和酸、碱、盐类,使用前要进行、慎用溶剂和酸、碱、盐类,使用前要进行详细的试验,详细的试验,确定最佳添加量和条件确定最佳添加量和条件;4 4、钝化或抑制蛋白质分解酶类的活性;、钝化或抑制蛋白质分解酶类的活性;5 5、选择合适分离方法。如:凝胶过滤、离子、选择合适分离方法。如:凝胶过滤、离子交换、吸附层析、亲和层析、电泳、结晶等。交换、吸附层析、亲和层析、电泳、结晶等。五、包含体的形成与性质五、包含体的形成与性质 p重组蛋白质的过量表达常常导致其在胞内发生错重组蛋白质的过量表达常常导致其在胞内发生错误折叠和聚集,误折叠和
22、聚集,形成被称为包含体的集聚体。形成被称为包含体的集聚体。p包含体主要是由蛋白质构成,其中大部分是基因包含体主要是由蛋白质构成,其中大部分是基因表达产物。这些基因表达产物的一级结构是正确表达产物。这些基因表达产物的一级结构是正确的,但的,但立体结构是错误的,所以没有生理活性立体结构是错误的,所以没有生理活性。p对于以包含体形式表达的蛋白质,需要在分离回对于以包含体形式表达的蛋白质,需要在分离回收包含体后,溶解包含体使其肽链伸展,然后在收包含体后,溶解包含体使其肽链伸展,然后在合适的溶液环境下使目标蛋白质恢复天然构型和合适的溶液环境下使目标蛋白质恢复天然构型和生物活性,这一过程称为生物活性,这一
23、过程称为蛋白质的体外再折叠或蛋白质的体外再折叠或复性复性。五、包含体的形成与性质五、包含体的形成与性质(一一)包含体的形成包含体的形成 目前,关于包含体的形成机理尚不完全目前,关于包含体的形成机理尚不完全清楚,一般认为包含体的形成是清楚,一般认为包含体的形成是部分折叠的部分折叠的中间态之间疏水性相互作用的结果。中间态之间疏水性相互作用的结果。主要原因是蛋白质本身具有易于聚集沉主要原因是蛋白质本身具有易于聚集沉淀的性质,或表达产物周围的物理环境(如淀的性质,或表达产物周围的物理环境(如温度、离子组成)不适或某些折叠辅助因子温度、离子组成)不适或某些折叠辅助因子(分子伴侣)的作用。(分子伴侣)的作
24、用。五、包含体的形成与性质五、包含体的形成与性质p现代研究表明:在大多数情况下,现代研究表明:在大多数情况下,包含体包含体的形成是的形成是蛋白质过量表达蛋白质过量表达的结果,而与蛋的结果,而与蛋白质的种类和表达系统无关,白质的种类和表达系统无关,即包含体的即包含体的形成与其相对分子质量、疏水性以及折叠形成与其相对分子质量、疏水性以及折叠途径等内在性质没有必然的联系。换句话途径等内在性质没有必然的联系。换句话说,对于任何蛋白质和任何表达系统,在说,对于任何蛋白质和任何表达系统,在过量表达的情况下都可能形成包含体。过量表达的情况下都可能形成包含体。p蛋白质的折叠复性和包含体的形成为蛋白质的折叠复性
25、和包含体的形成为动力动力学竞争学竞争的结果。的结果。五、包含体的形成与性质五、包含体的形成与性质 U ki I kr NU ki I kr N ka ka A A其中:其中:U U为伸展肽链;为伸展肽链;I I为折叠过程的中间态;为折叠过程的中间态;N N为天为天然活性态;然活性态;A A为聚集体(包含体),为聚集体(包含体),kiki、krkr、kaka分分别为中间体生成速率常数、折叠速率常数和聚集体别为中间体生成速率常数、折叠速率常数和聚集体生成速率常数。生成速率常数。活性产物活性产物N N的形成为分子内折叠反应,折叠速的形成为分子内折叠反应,折叠速率与浓度成正比;聚集体率与浓度成正比;聚
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